Eξελίξεις στη Γονιδιωματική και Βιοπληροφορική
και οι Εφαρμογές τους
Αθανάσιος Τσαυτάρης
ΓΕΝΕΤΙΚΗ
Οι Ολυμπιακοί ήταν οι παλαιότεροι και πιο σημαντικοί από όλους τους ελληνικούς
αγώνες. Ήταν η μεγαλύτερη θρησκευτική γιορτή, ανάμεσα στις γιορτές τις
αφιερωμένες στο Δία, τον ανώτατο θεό. Το ιερό της Ολυμπίας επέβαλλε το κύρος
του σε ολόκληρο τον ελληνικό κόσμο, ενώ σύντομα οι Ολυμπιακοί Αγώνες έγιναν
το σύμβολο της πανελλήνιας ενότητας. Οι Ολυμπιακοί Αγώνες τελούνταν κάθε
τέσσερα χρόνια τις πιο ζεστές ημέρες του καλοκαιριού. Μια σειρά αθλητικών
αγώνων γίνονταν στο Στάδιο, το Ιπποδρόμιο και άλλους χώρους της θέσης,
μπροστά σε χιλιάδες θεατές από όλες τις πόλεις του γνωστού ελληνικού κόσμου.
Οι νικητές στεφανώνονταν με ένα στεφάνι αγριελιάς και απολάμβαναν ιδιαίτερες
τιμές από την πατρίδα τους.
Γενετική Γονιδιωματική
Αναγνώριση βάσης
Ποιότητα αλληλουχίας
Απομάκρυνση φορέα
Σύνδεση αλληλουχιών
Αυτόματη
αλληλούχιση λογισμικό
>Gene
ACCTGTCAGTGTCAACTGCTTCAA
TAGCTAATGCTAGGCTCGATAATC
GCTGGCCTCAGCTCAGTCT
ΤΟ ΑΝΘΡΩΠΙΝΟ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑ
NGS
ΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗ
Αλληλουχημένα Γονιδιώματα Φυτών
Γενετική Επιγενετική
Κληρονομήσιμη αλλαγή χαρακτήρων που
δεν περιλαμβάνει αλλαγή στην αλληλουχία
του DNA
Κληρονομήσιμη αλλαγή χαρακτήρων που
περιλαμβάνει αλλαγή στην αλληλουχία του
DNA
M M M
M M M
M
M
M
M
M
M
M
ΚΑΛΟΣ
ΚΑΚΟΣ
ΠΑΝΩΡΑΙΑ
ΩΡΑΙΑ
Καλός
Κάλος
Μικρός καρπόςΜικρός καρπός
Μεγάλος καρπόςΜεγάλος καρπός
Γονική αποτύπωση
Small Seed
Large Seed
CH3
Φολικό οξύ
CH3
Φολικό οξύ σε τρόφιμα ζωϊκής προέλευσης
CH3
Φολικό οξύ σε τρόφιμα φυτικής προέλευσης
Principle Nutrient Value Percentage of RDA
Energy 573 Kcal 29%
Carbohydrates 23.45 g 18%
Protein 17.73 g 32%
Total Fat 49.67 g 166%
Cholesterol 0 mg 0%
Dietary Fiber 11.8 g 31%
Vitamins
Folates 97 µg 25%
Niacin 4.515 mg 28%
Pantothenic acid 0.050 mg 1%
Pyridoxine 0.790 mg 61%
Riboflavin 0.247 mg 19%
Thiamin 0.791 mg 66%
Vitamin A 9 IU <1%
Vitamin C 0 0%
Vitamin E 0.25 mg 2%
Electrolytes
Sodium 11 mg 1%
Potassium 468 mg 10%
Minerals
Calcium 975 mg 98%
Copper 4.082 mg 453%
Iron 14.55 mg 182%
Magnesium 351 mg 88%
Manganese 2.460 mg 107%
Phosphorus 629 mg 90%
Selenium 34.4 µg 62.5%
Zinc 7.75 mg 70%
Phyto-nutrients
Carotene-ß 5 µg --
Crypto-xanthin-ß 0 µg --
Lutein-zeaxanthin 0 µg --
Nutritional value per 100 g.
(Source: USDA National Nutrient data base)
ΣΟΥΣΑΜΙ ΩΣ SUPER FOOD
Yellow
Mouse
Agouti
Mouse
Cooney et al. J Nutr 132:2393S (2002)
Maternal Supplements with zinc methionine
betaine choline, folate B12
High risk cancer, diabetes,
obesity & reduced lifespan
Lower risk of cancer,
diabetes, obesity and
prolonged life
LTR Hypomethylated LTR HypermethylatedWhen to Intervene??
Epigenetic Mechanisms
ΒΡΟΥΒΕΣ
ΜΟΥΣΤΑΡΔΑ
ΡΑΔΙΚΙΑ
ΡΕΠΑΝΑΚΙΑ
ΖΩΧΟΙ
ΡΟΚΑ
ΣΤΑΜΝΑΓΚΑΘΙ
ΞΥΔΙ
Epigenetic Bioactive compounds in
plants
ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΗ ΜΕΤΑΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΗ
ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΗ ΜΕΤΑΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΗ
ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΗ ΜΕΤΑΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΗ
ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΗ ΜΕΤΑΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΗ
Αθανάσιος Τσαυτάρης_ Η Ελλάδα Μετά

Αθανάσιος Τσαυτάρης_ Η Ελλάδα Μετά