4. 4
Phosphat ñöôïc söû duïng trôû laïi cho quaù trình phosphoryl
hoùa hay ñöôïc thaûi ra trong nöôùc tieåu döôùi daïng phosphat
voâ cô.
Pentose töø thöùc aên tham gia ñaùng keå vaøo quaù trình toång
hôïp acid nucleic cho cô theå.
Base purin vaø pyrimidin ñöôïc phoùng thích trong quaù trình
tieâu hoùa cuûa acid nucleic phaàn lôùn ñöôïc thoaùi hoùa vaø ñaøo
thaûi, moät phaàn ñöôïc söû duïng laïi ñeå toång hôïp acid nucleic.
5. 5
Thoaùi hoùa caùc base Purin
Ôû ngöôøi vaø ñoäng vaät
coù vuù thoaùi hoùa base
vôùi hai loaïi phaûn öùng
chöû yeáu laø khöû amin
thuûy phaân vaø oxy hoùa
Ôû ngöôøi, linh tröôûng,
chim vaø moät soá boø saùt
saûn phaåm thoaùi hoùa
cuoái cuøng cuûa base
purin laø acid uric vaø
ñöôïc ñaøo thaûi ra nöôùc
tieåu.
GMP
AMP
Guanosin
Adenosin
Guanin
O
N
N
N
NH
H2N
Xanthin
N
N
N
N
OH
HO
Hypoxanthin
N
N
N
N
OH
Inosin
N
N
N
N
OH
Ribose
H2O
Pi
H2O
Pi
H2O
NH3
H2O
Ribose
H2O
Ribose
H2O O2 H2O2
H2O
NH3
H2O2
H2O O2
NUCLEOSIDASE
ADENOSIN
DEAMINASE
XANTHIN
OXIDASE
GUANIN
DEAMINASE
_NUCLEOTIDASE
5'
_NUCLEOTIDASE
5'
NUCLEOSIDASE
XANTHIN
OXIDASE
Acid Uric
N
N
N
N
OH
HO
OH
6. 6
Noàng ñoä acid uric trong maùu ngöôøi bình thöôøng laø 3-
5mg/100ml.
Löôïng acid uric trong nöôùc tieåu 0,3-0,8g/24h. Löôïng acid
uric trong nöôùc tieåu thay ñoåi theo cheá ñoä aên, ñaëc bieät taêng
vôùi cheá ñoä aên giaøu purin (gan, thaän, thòt, cua).
Trong beänh Gout, beänh taêng baïch caàu acid uric trong
maùu coù theå taêng ñeán 7-8g/100ml.
7. 7
Ôû moät soá ñoäng vaät coù xöông soáng khaùc, acid uric bò thoaùi hoùa tieáp
tuïc thaønh allantoin nhôø urat oxydase.
Ôû caùc loaøi caù coù xöông saûn phaåm cuoái cuøng laø allantoat. Ôû loaøi caù
coù suïn vaø ñoäng vaät löôõng cö saûn phaåm cuoái cuøng laø ureâ. Nhöõng
ñoäng vaät bieån khoâng coù xöông soáng saûn phaåm cuoái cuøng laø NH4
N
N
N
N
OH
HO
OH
C
N
NH2
O
H
C
C
N
C
N
H
O
H
O
H
C
N
NH2
O
H
H O
H
C
N C
NH2
COO
_
O
H2N C NH2
2
NH4
+
4
Uricase Allantoinase
Allantoicase
Urease
Acid Uric Allantoin
Allantoat
Urea
8. 8
Thoaùi hoùa caùc base pyrimidin
Söï thoaùi hoùa base
pyrimidin xaûy ra chuû
yeáu ôû gan
Saûn phaåm thoaùi hoùa
cuoái cuøng cuûa
pyrimidin laø ureâ vaø –
alanin (töø uracil) vaø –
aminoisobutyrat (töø
thymin)
O
N
NH
NH2
Cytosin
H
O
O
NH
N
Dihydrouracil
N
NH
H
O
O
Uracyl
NH2 CO NH CH2CH2COOH
_Ureidopropionic
b
NH2 CO NH CH2CH2COOH
CH3
CH3
N
NH
H
O
O
Dihydrothymin
CH3
N
NH
H
O
O
Thymin
_Ureidoisobutyric
b
NH2CH2CH2COOH
b_Alanin
CH3
NH2CH2CH2COOH
b_Aminoisobutyric
NH3
Ure
9. 9
TOÅNG HÔÏP
TOÅNG HÔÏP NUCLEOTID
Trong cô theå nucleotid ñöôïc toång hôïp theo nhu caàu phaùt
trieån cuûa teá baøo vaø moâ, ñaëc bieät khi teá baøo phaân chia.
Coù hai con ñöôøng toång hôïp nucleotid laø: (1) con ñöôøng
toång hôïp môùi, (2) con ñöôøng “taän duïng laïi” baèng quaù
trình phosphoribosyl hoùa base hay nucleosid
10. 10
PRPP (5’-phosphoribosyl-1’-pyrophosphat)
laø chaát trung gian coù vai troø quan troïng trong toång hôïp nucleotid
PRPP ñöôïc taïo thaønh töø ribose-5-phosphat vaø adenosin triphosphat
(ATP).
Ribose-5-phosphat + ATP PRPP + AMP
Nguoàn ribose-5-phosphat ñöôïc cung caáp töø quaù trình chuyeån hoùa
glucose hay töø quaù trình thoaùi hoùa nucleosid.
PRPP ñöôïc söû duïng cho caû quaù trình toång hôïp môùi vaø quaù trình taän
duïng laïi.
Noàng ñoä PRPP trong teá baøo luoân ñöôïc ñieàu hoøa vaø thöôøng ôû möùc
thaáp, quaù trình toång hôïp PRPP ñöôïc xuùc taùc bôûi PRPP synthetase vaø
caàn Pi. Bình thuôøng noàng ñoä Pi trong teá baøo ôû möùc thaáp neân hoaït
ñoäng PRPP synthetase thaáp, nhöng khi Pi taêng thì hoaït ñoäng enzym
taêng ñaùng keå. Ngöôïc laïi ADP öùc cheá hoaït ñoäng PRPP synthetase.
11. 11
Toång hôïp môùi nucleotid nhaân purin
Nguoàn cacbon vaø nitô ñeå toång hôïp nhaân purin. Nguoàn naøy laø
glutamin, glycin, aspartat, cacbon dioxid, vaø cacbon cuûa folat.
Nhaân purin ñöôïc toång hôïp treân moät phaân töû PRPP
1
2
3
4
5
6
7
8
9
N
C
NH
C
N
C
N
Glycin
Aspartat
Amin cuûa glutamin
CO2 (töø heä hoâ haáp)
_Methenyl_
tetrahydrofolat
N ,N
5 10
_Formyl
tetrahydrofolat
N
10
12. 12
Toång hôïp inosin 5’-monophosphat (IMP). Qua 11 böôùc vaø söû duïng 6
lieân keát phosphat giaøu naêng löôïng. Ñaây laø quaù trình toán nhieàu naêng
löôïng.
PRPP GLUTAMYL
AMIDOTRANSFERASE
FORMYL
TRANSFERASE
VII SYNTHETASE
VII CARBOXYLASE
Glutamin Glutamat
H2O PPi
Glycin
O C
H2C
NH3
+
4
5
7
O
_
ATP ADP
Mg
2+
PRPP SYNTHASE
ATP AMP
Mg
2+
PRPP
o
O
OH
CH2
OH
O
O
P
OH
O
P O
P
O
OH OH
H
NH3
+
9
O
P
o
O CH2 O
o
OH OH
H
O
CH2 NH
C
H2C
NH3
+
4
5
7
O
P
H4 folat
Methyl H4 folat
N
5
,N
10
Formyl glycinamid
ribosyl _phosphat
5
O
Glycinamid ribosyl
_phosphat
5 (IV)
(II)
_phosphat
5
a_D_Ribose
o
O
OH
CH2
OH
O
P
(I) (III)
_phospho
5
_D_Ribosylamin
(V)
R_ O
P
C
C
NH
CH
N
O
H2
H
9
4
5
7
8
5
3 4
5
6
N
CH
N
C
H2N
O
O
_
R_ O
P
5
HC
C
N
CH
N
H2N
R_ O
P
5
HC
CH2
NH3
+
OOC
_
OOC
_
HC
CH2
OOC
_
OOC
_
3 4
5
6
N
CH
N
C
H2N
O
R_ O
P
5
N
H
1
3 4
5
6
N
CH
N
C
H2N
O
R_ O
P
5
H2N
O
3 4
5
6
N
CH
N
C
N
R_ O
P
5
H2N
C
O
H
H
O
H
P
N
CH
N
C
N
R_ O
5
HN
C
HN
3
C
C
NH
CH
N
O
H2
H
9
4
5
7
8
R_ O
P
5
VI SYNTHETASE
Glutamin
Glutamat
Mg
2+
ATP
H2O
CO2
H2O
Aspartat
IX
SYNTHETASE
ADENYLO
SUCCINASE
IMP
CYCLOHYDROLASE
FORMYL
TRANSFERASE
Formyl
H4 folat
N
10
H4 folat H2O
(VI)
Formyl glycinamidin
ribosyl _phosphat
5
Aminoimidazol
ribosyl
(VII)
_phosphat
5
_phosphat
5 (VIII)
Aminoimidazol carboxylat
ribosyl
_phosphat
5
(XI)
Formyl- amino-imidazol carboxamid
ribosyl
(X)
Aminoimidazol carboxamid
ribosyl _phosphat
5
_phosphat
5
(IX)
Aminoimidazol succinyl
carboxamid ribosyl
Fumarat
Inosin 5’
monophosphat (IMP)
(XII)
O
O
1 2
O 3
O
4
O
5
O
6
O
7
O
8
O
9
O 10
O 11
O
ATP Mg
2+
13. 13
Toång hôïp AMP vaø GMP töø IMP. Töø IMP qua quaù trình gaén theâm
nhoùm amin cuûa aspartat cho AMP. Cuõng töø IMP qua quaù trình
oxy hoùa vaø gaén theâm nhoùm amin cuûa glutamin cho GMP.
Veà maët naêng löôïng thì GTP ñöôïc söû duïng cho quaù trình
IMPAMP vaø ATP ñöôïc söû duïng cho quaù trình IMPGMP.
Cô cheá naøy giuùp caân baèng löôïng adenin vaø guanin
OOC C C
H
COO
_
_ H
O
H
P
N
CH
N
C
N
R_ O
5
HN
C H
P
N
CH
N
C
N
R_ O
5
HN
C
NH
OOC C
H2
C
H
COO
_
_
H
P
N
CH
N
C
N
R_ O
5
C
NH2
N
O
P
N
CH
N
C
N
R_ O
5
HN
C
O
OOC C
H2
C
H
NH3
COO
+
_
_
O
P
N
CH
N
C
N
R_ O
5
HN
C
H2N
ATP
GTP
H2O
H2O
NAD
+
NADH H
+
Glutamin Glutamat
Aspartat
Mg2
+
(IMP)
Inosin monophosphat
(AMPS)
Adenylosuccinat
(AMP)
Adenosin monophosphat
(XMP)
Xanthosin monophosphat
(GMP)
Guanosin monophosphat
12
O
15
O
14
O
13
O
ADENYLOSUCCINAT
SYNTHASE
ADENYLOSUCCINASE
IMP DEHYDROGENASE
TRANSAMIDINASE
14. 14
Ñieàu hoøa quaù trình toång hôïp môùi nucleotid baèng cô cheá öùc
cheá ngöôïc (feedback).
Hai enzym xuùc taùc cuûa hai
phaûn öùng ñaàu tieân trong quaù
trình toång hôïp IMP laø PRPP
synthetase vaø PRPP
amidotransferase bò öùc cheá
ngöôïc bôûi IMP, GMP vaø
AMP
Giai ñoaïn toång hôïp
adenylosuccinat töø IMP bò öùc
cheá bôûi AMP vaø giai ñoaïn
toång hôïp XMP bò öùc cheá bôûi
GMP
AMP O
_ GMP
O
_
IMP
GMP
O
_
AMP
O
_
O
_
PRPP
5_Phosphoribosylamin
Ribose_ _phosphat
5
IMP
XMP
GMP
Adenylosuccinat
AMP
IMP
GMP
O
_
AMP
O
_
O
_
RIBOSE PHOSPHAT
PYROPHOSPHOKINASE
(PRPP SYNTHASE)
PRPP GLUTAMYL
AMIDOTRANSFERASE
ADENYLOSUCCINAT
SYNTHASE IMP DEHYDROGENASE
ADENYLOSUCCINASE TRANSAMIDINASE
15. 15
Con ñöôøng “taän duïng laïi” nguoàn nucleosid hay
base nitô ñeå toång hôïp nucleotid nhaân purin
Töø nguoàn base purin cuûa quaù
trình thoaùi hoùa nucleotid
Coù hai enzym chuyeân bieät xuùc taùc quaù
trình vaän chuyeån ribose phosphat töø
PRPP sang base purin töï do.
Hypoxanthin-guanin
phosphoribosyltransferase xuùc taùc
quaù trình taïo nucleotid töø base guanin
hay hypoxanthin, vaø enzym bò öùc cheá
bôûi IMP hay GMP.
Adenin phosphoribosyl transferase
xuùc taùc giai ñoaïn taïo AMP töø adenin
Adenin
N
N
N
NH
NH2
O
N
N
N
NH
Hypoxanthin
Guanin
O
N
N
N
NH
H2N
AMP
O
O
OH
OH
N
N
N
N
NH2
H2C
P
O
O
N
N
N
N
O
O
OH
OH
H2C
P
O
IMP
O
O
OH
OH
H2C
P
O
O
N
N
N
N
H2N
GMP
PRPP PPi
PPi
PRPP
PPi
PRPP
ADENIN
PHOSPHORIBOSYL
TRANSFERASE
HYPOXANTIN_GUANIN
PHOSPHORIBOSYL
TRANSFERASE
HYPOXANTIN_GUANIN
PHOSPHORIBOSYL
TRANSFERASE
16. 16
Con đường “ tận dụng lại” nguồn nucleosid hay
base nitơ để tổng hợp nucleotid nhân purin
Töø nucleosid.
Nucleosid ñöôïc phosphoryl hoùa bôûi nucleosid kinase thaønh
nucleosid 5’-monophosphat. Tuy nhieân con ñöôøng naøy khoâng
quan troïng ôû ñoäng vaät coù vuù. Nucleosid kinase ôû ñoäng vaät coù
vuù chæ coù adenosin kinase
Gan laø nôi toång hôïp vaø cung caáp chính base nhaân purin vaø
nucleosid nhaân purin cho quaù trình phosphoribosyl hoùa ôû caùc
toå chöùc khoâng coù khaû naêng toång hôïp môùi nucleotid. Ví duï nhö
naõo, hoàng caàu vaø baïch caàu ña nhaân söû duïng nguoàn base
purin ñeå taïo nucleotid purin chöù khoâng toång hôïp nhaân purin.
18. 18
Tổng hợp mới nhân pyrimidin
Toång hôïp uridin 5’-monophosphat (UMP). Giai ñoaïn ñaàu tieân laø toång
hôïp carbamoyl phosphat trong teá baøo chaát töø glutamin vaø cacbon
dioxid, ngoaøi ra carbamoyl phosphat coøn ñöôïc toång hôïp ôû ty theå teá baøo
gan (chaát trung gian cuûa quaù trình toång hôïp ure)
1
2
3 4 5
6
_
O
O
CH2
C
H
COO
C
_
N
H
C
O
H2N
HN
N
O
O COO
H
O
O
CH2
C
H
COO
C
H3N
_
_
+
H3N
C
O
O O
P
+
O
P
R 5
HN
N
O
O COO
CO2 + Glutamin + ATP
Carbamoylphosphat
synthase II
Aspartat
transcar
bamoylase
Dihydro
orotase
Dihydroorotat
dehydrogenase
Orotat
phosphoribosyl
transferase
Orotidylic acid
decarboxylase
O
CH2
C
H
COO
C
N
H
C
O
HN
O
P
R 5
HN
N
O
O
1
2
3
4
5
6
Carbamoyl
phosphat
(CAP)
Aspartic
acid
Carbamoyl
aspartic acid
(CAA)
Dihydroorotic
acid (DHOA)
Orotic acid
(OA)
OMP
UMP
Pi
PPi PRPP
CO2
NAD
+
NADH H
+
H2O
6
O 5
O
4
O
3
O
2
O
O
1
19. 19
Tổng hợp mới nhân pyrimidin
Töø UMP toång hôïp CTP vaø
dTMP
Töø UMP ñeán CTP qua hai giai
ñoaïn: (1) chuyeån UMP thaønh
UTP nhôø phosphat kinase, (2)
nhoùm amino cuûa glutamin keát
hôïp UTP cho CTP (hình 9).
Toång hôïp dTMP nhôø enzym
ribonucleotid reductase khöû
dUDP thaønh dUDP, tieáp theo
enzym thimidylat synthase xuùc
taùc chuyeån nhoùm methyl cuûa
N5,N10 methyltetrahydrofolat ñeå
taïo TMP
ATP
7
O
Ribonucleotid
reductase
Thymidylat
synthase
CTP
synthase
UDP
UTP
CTP
dUDP
dUMP
TMP
CH3
O
P
R 5
HN
N
O
O
R 5 O
P O
P O
P
NH2
N
N
O
Glutamin
NADPH H
+
NADP
+
H2O
Pi
ADP
ADP
ATP
ATP Methyl H4 folat
N
5
,N
10
H2 folat
11
O
10
O
9
O
8
O
12
O
UMP
20. 20
Tổng hợp mới nhân pyrimidin
Ñieàu hoøa sinh toång hôïp nucleotid pyrimidin
Nucleotid pyrimidin öùc cheá ngöôïc enzym aspartat
transcarbamoylase vaø dihydro orotase
21. 21
Con ñöôøng “taän duïng laïi” nguoàn base nitô ñeå
toång hôïp nucleotid nhaân pyrimidin
Caùc base nitô nhaân pyrimidin töø quaù trình thoaùi hoùa nucleotid laø
uracil vaø thymin.
Uracil coù theå ñöôïc chuyeån thaønh UMP qua 2 phaûn öùng:
uridin phosphorylase.
Uracil + Ribose 1-phosphat Uridin + Pi
uridin kinase
Uridin + ATP UMP + ADP
Cytidin cuõng ñöôïc phosphoryl hoùa bôûi uridin kinase.
Thymin ñöôïc chuyeån thaønh dTMP qua hai giai ñoaïn:
Thymin phosphorylase
Thymin + deoxyribose 1-phosphat thymidin + Pi
Thymidin kinase
Thymidin + ATP dTMP + ADP
29. 29
Söûa chöõa theo caùch caét base
Söûa chöõa caùc thöông toån nhö khöû
purin, caùc base khoâng bình
thöôøng, caùc base bò alkyl hoùa, söï
taïo dime….. caùc enzym tham gia
heä thoáng söûa chöûa naøy laø DNA
glycosylase, nuclease, DNA
polymerase vaø DNA ligase
DNA polymerase DNA ligase
+
A T C G G C T C A T C C G A T
T A G C C G A G T A G G C T A
3' 5'
3'
5'
A T C G G C T U A T C C G A T
T A G C C G A G T A G G C T A
3' 5'
3'
5'
A T C G G C T * A T C C G A T
T A G C C G A G T A G G C T A
3' 5'
3'
5'
A T C G G C T C A T C C G A T
T A G C C G A G T A G G C T A
3' 5'
3'
5'
A T C G G C T C C G A T
T A G C C G A G T A G G C T A
3'
5'
Nhieät ñoä
Uracil DNA glycosylase
Nuclease
U
30. 30
Heä thoáng söûa chöõa theo caùch
caét chuoãi ñoâi
Hai protein caàn cho heä thoáng
söûa chöõa naøy laø Ku vaø DNA-
PK (DNA protein kinase) seõ
gaén vaøo hai ñaàu cuûa ñoaïn
DNA giuùp taùch rôøi hai ñaàu,
tieáp theo hai ñaàu naøy ñöôïc
thaùo xoaén. Caùc nucleotid sai seõ
ñöôïc caét boû bôûi exonuclease,
sau ñoù DNA ligase seõ gaén hai
ñoaïn laïi
0
0
0 0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
Keát hôïp hai protein
Ku vaø DNA PK
Thaùo xoaén
Gaén laïi
Taïo lieân keát
Ñöa hai ñoaïn gaàn nhau
32. 32
Giai ñoaïn khôûi ñaàu
RNA lieân keát vôùi promoter DNA taïi vò trí –35 taïo thaønh phöùc hôïp ñoùng. Sau ñoù
RNA polymerase di chuyeån ñeán vò trí –10 taïo thaønh phöùc hôïp môû. Moät vuøng cuûa
chuoåi xoaén keùp ñöôïc thaùo xoaén. RNA polymerase tieán haønh toång hôïp RNA
5'
3'
T
T
T
TT T
T
T
AAAAAAAA
3'
5'
TTTTTTTT
AAAAAAAA
3'
5' 3'
5'
GCGGGCT
CGCCCGA
AGCCCGC
TCGGGCG
DNA
DNA
_
G
C
C
C
C
G
UUUUUU
U
U
U
C
G
G
G
G
C
A
5'
3'
RNA
33. 33
Giai ñoaïn keùo daøi
RNA di chuyeån daàn doïc chieàu daøi cuûa ñoaïn DNA theo chieàu 3’-5’,ø RNA ñöôïc
toång hôïp coù chieàu 5’-3’. Giai ñoaïn keùo daøi chuoãi ñöôïc tieáp tuïc ñeán khi
polymerase gaëp ñoaïn keát thuùc
5'
3'
T
T
T
TT T
T
T
AAAAAAAA
3'
5'
TTTTTTTT
AAAAAAAA
3'
5' 3'
5'
GCGGGCT
CGCCCGA
AGCCCGC
TCGGGCG
DNA
DNA
_
G
C
C
C
C
G
UUUUUU
U
U
U
C
G
G
G
G
C
A
5'
3'
RNA
34. 34
Giai ñoaïn keát thuùc
Daáu hieäu keát thuùc laø moät ñoaïn caùc nucleotid A vaø ñoaïn coù chöùa caùc
nucleotid coù tính chaát boå sung taïo thaønh keïp ñoâi xoaén keùp treân DNA
khuoân. Sau khi RNA toång hôïp moät loaït caùc U, ñoaïn RNA tröôùc ñoù coù theå
töï boå sung thaønh ñoaïn keïp ñoâi gaáp khuùc thì RNA ngöøng toång hôïp vaø ñöôï
giaûi phoùng khoûi DNA
5'
3'
T
T
T
TT T
T
T
AAAAAAAA
3'
5'
TTTTTTTT
AAAAAAAA
3'
5' 3'
5'
GCGGGCT
CGCCCGA
AGCCCGC
TCGGGCG
DNA
DNA
_
G
C
C
C
C
G
UUUUUU
U
U
U
C
G
G
G
G
C
A
5'
3'
RNA
35. 35
Söï hoaøn thieän caùc RNA sau quaù trình sao cheùp
Söï hoaøn thieän RNA thoâng tin (RNAm)
- Caét caùc ñoaïn itron (ñoaïn khoâng maõ hoùa)
- Taïo muõ 7-methylguanosin ôû ñaàu 5’.
- Gaén theâm ñuoâi poly A
Exon 1 2
Exon
G
_
G
Muõ
G
_
G
Muõ
OH
_
G
Muõ
OH
_
G
Muõ
G
A _ An
G
A _ An
G
A _ An
_G An
G
Muõ An
G
_
Intron
.
G
.A
G
.A
G
5' 3'