חומרים רבים בארכיונים אינם מגובים. בארכיון הרדיו מגובים רק 50% מהחומרים האנלוגיים, כותב המבקר ומזכיר כי "בשנת 2008 אירעה תקלה בדיסק הקשיח שבו נשמרו ההקלטות של שידורי הרדיו באותה שנה, ובגינה נמחקו חומרים ששודרו במשך תשעה חודשים בשנה זו בלא שניתן לשחזרם".
לפי הדו"ח, כ-20 ארגזים ובהם תסכיתי רדיו של התוכנית "לאם ולילד" נעלמו ולא הצליחו לאתרם. הארגזים הועברו לאחסון מחוץ לרשות בשל מחסור בשטח אחסון בארכיון הרדיו, ומאז נעלמו עקבותיהם.