RA協議会テーマ別勉強会（R言語）の＃４です

1. R言語勉強会 ハンズオン
横浜国立大学 研究推進機構
URA 久保琢也
2022年7月20日

2. Motivation
分析
集計/可視化
報告
資料作成
• ソフトの移行は純粋に面倒くさい
• Rで作った集計表やグラフをそのまま使いたい
• 紙媒体を意識すると、どうしても情報量が減る

3. Motivation
分析
集計/可視化
報告
資料作成
Rだけで分析作業だけでなく
報告資料の作成まで行いたい

4. Motivation
分析
集計/可視化
報告
資料作成
今日はRからHTMLを出力する
方法をご紹介します。

5. 使用するデータ
❖ KAKEN より採択課題情報ダウンロード
− 抽出条件
• 期間：2022年∼2022年
• 種目：何でもいい
• 分野：何でもいい
• 形式：CSVファイル
− 保存方法
• 名前：kaken_2022.csv
• 場所：デスクトップ
https://kaken.nii.ac.jp
5

6. 元となるスクリプト
❖ handsOn_win.R / handsOn_mac.R
旧帝大の科研費の採択件数を種目別に積み上げた棒グラフ

7. HTMLファイルに出力するだけなら
①このアイコンをクリックすると
下のウィンドウが表示される
②アウトプットのフォーマット
がHTMLになっていることを
確認して「Compile」

8. HTMLファイルに出力するだけなら
• 余計な情報が入っていて報
告資料としては駄目
• 自分の分析メモにとってお
くのには使える

9. Rmarkdown
Markdownの概要
Markdown（マークダウン）は、文章の書き方です。デジタ
ル文書を活用する方法として考案されました。特徴は、
• 手軽に文章構造を明示できること
• 簡単で、覚えやすいこと
• 読み書きに特別なアプリを必要としないこと
• それでいて、対応アプリを使えば快適に読み書きできること
日本語Markdownユーザー会
（https://www.markdown.jp/what-is-markdown/）
👉 R MarkdownではRで書いたコードや表・グラフ等を含め
た各種のレポートをMarkdown形式で出力

10. Rmdファイルの作成
① このアイコンをクリック
② R Markdownをクリック

11. Rmdファイルの作成
❖ とりあえず何も手を加えずに「OK」
「1 + 1」と書く

12. Rmdファイルの作成
❖ Rmdファイルを保存する
Rmdファイルが開いたら、名前はなん
でもいいので保存しておく（保存すると
「.Rmd」がファイル名につく）

13. Rmdファイルの見方
YAMLヘッダー：
文書の設定を行う
（※今回は扱わない）
Rのコードチャンク：
・Rのコードはこの領域に書く
・実行するか否か・表示するか否か等の
指定が可能
文章、画像等
Rのコードチャンク

14. Rmdファイルの変換
❖ knit document
①このアイコンをクリックすると
下のウィンドウが表示される
このアイコン（knit）を
クリック

15. R コードチャンク
Rのコードは以下の構成
```{ r }
ここにRのコードを書く
```

16. オプション
メッセージを表示させない

17. オプション
コードを表示させない

18. オプション一覧
https://www.rstudio.com/wp-content/uploads/2015/02/rmarkdown-cheatsheet.pdf

19. R Markdownの記法

20. R Markdownの記法