Ekstraksi DNA buah naga dilakukan untuk memisahkan DNA dari komponen sel lainnya melalui tahap lisis, pemisahan, dan pemurnian. Prosesnya melibatkan menghancurkan sel buah naga, membuat larutan buffer, mencampurkan larutan buah naga dan buffer, menambahkan alkohol untuk memisahkan DNA, dan menghasilkan endapan DNA.