Sistem operasi lain dapat terhapus selama instalasi Ubuntu jika pengguna tidak hati-hati dalam membuat partisi baru dan memilih untuk menghapus sistem operasi sebelumnya. Data juga dapat hilang jika disimpan pada partisi yang dihapus selama proses instalasi. Lemahnya proses instalasi dapat terjadi jika pengguna memilih untuk mengunduh pembaruan saat instalasi dilakukan secara online.