5. สมบัติของกรดอะมิโน
- Amino acids are compounds that have both an
amine group and a carboxylic acid group, it can act
as both a base and an acid.
1. สมบัติในการเป็นกรด-เบส และบัฟเฟอร์
– Zwitterion
– Isoelectric point
2. สมบัติเชิงแสง
3. สมบัติทางเคมี
7. pKa1 = 2.34
pKa2 = 9.6
Net charge +1 Net charge 0 Net charge -1
Zwitterion
pI = pKa1 + pKa2
2
Glycine
2.34 9.6
Isoelectric point Calculation
8. Glycine
The buffer regions for glycine are pH 1.3 to pH 3.3 and from pH 8.6 to pH 10.6
A mixture of a weak acid and its
conjugate base is a buffer.
• In both regions, we can add small
amounts of acid or base, and the
pH will not change much.
9. Lysine
pKa1 = 2.18
pKa2 = 8.95
Net charge +2 Net charge 0 Net charge -1
Zwitterion
pI = pKa1 + pKa2
2
Net charge +1
pKa3 = 10.5
= 2.18 = 8.95 = 10.5
Isoelectric point Calculation
R group
15. • Unstructured proteins
• Globular protein
• fibrous protein
–Collagen
–Elastin
–Keratin / tropomyosin
–Plasma lipoprotein
• Conjugated protein
Classification of Proteins
Based on Structure Based on composition
17. Protein separation and purification
สิ่งที่ต้องคานึงเพื่อที่จะรักษาโครงรูปและสมบัติของโปรตีน
1. pH
2. Temperature
3. Degradative enzyme
4. Adsorption to surfaces
5. Long-term storage
เทคนิคการแยกโปรตีนและทาให้โปรตีนบริสุทธิ์
1. Salting in and salting out
2. Chromatography technique
3. Electrophoresis
18. Protein sequencing
1. Subunits separation
2. การย่อยกรดอะมิโนแต่ละตัวออก
จากสายpeptide
3. Edman degradation
4. Mass spectroscopy
32. OVERVIEW OF AMINO ACID METABOLISM
ENVIRONMENT ORGANISM
AMINO
ACIDS
Degradation
(required)
1
2 3
a
b
Purines
Pyrimidines
Porphyrins
c c
Used for
energy
pyruvate
α-ketoglutarate
succinyl-CoA
fumarate
oxaloacetate
acetoacetate
acetyl CoA
(glucogenic)
(ketogenic)
*
Nitrogen
Bio-
synthesis
Ingested
protein Protein
Urea
Carbon
skeletons
37. Protein and amino acid metabolism, chayanon P. http://www.si.mahidol.ac.th/department/biochemistry/home/md/lecture/Protein%20and%20amino%20acid%20metabolismMed2009.pdf
1. วิถีโครงคาร์บอนของกรดอะมิโน (Carbon skeletal breakdown )
38. Protein and amino acid metabolism, chayanon P. http://www.si.mahidol.ac.th/department/biochemistry/home/md/lecture/Protein%20and%20amino%20acid%20metabolismMed2009.pdf
46. b. ปฏิกิริยาการขจัดอะมิโนชนิดไม่มีออกซิเดชัน (non-oxidative deamination)
• Oxidative deamination is the most active mechanism by which animal
cells remove nitrogen from their amino acids
• เป็นปฏิกิริยาขจัดหมู่อะมิโนโดยตรงใช้เอนไซม์จาเพาะและไม่สามารถผ่านกระบวนการ
ออกซิเดชัน ดังนี้
(1) amino lyases เป็นเอนไซม์ที่สลายหมู่อะมิโนจาก กรดอะมิโนบางชนิด คือ
แอสพาร์ติก อิสทิดีน ฟีนิลอะลานีน และไทโรซีน
Biochemistry II - ชีวเคมี กาแพงแสน Biochemistry KU KPS (biochem.flas.kps.ku.ac.th/01402313/01402313_157_Amino-met_20141029.ppt)
Amino nitrogen pathway (วิถีไนโตรเจน)
•J. Reilly, Kyle A Troester, +2 authors Tiffiany R Risher
•Published 2010
•Medicine, Chemistry
•Photochemistry and Photobiology Ammonia lyases catalyze the reversible addition of ammonia to cinnamic acid and derivatives.
From: Comprehensive Chirality, 2012
47. (2) Specific deaminase เอนไซม์กลุ่มนี้ทาหน้าที่ดึงหมู่อะมิโนออกมาในรูป
แอมโมเนีย มี ไพริดอกซอลฟอสเฟตเป็นโคเอนไซม์ ตัวอย่างเอนไซม์ เช่น เซรีนไฮดรา
เทส ทรีโอนีนไฮดราเทส และ ซีสเทอีนดีซัลไฮเดรส
Biochemistry II - ชีวเคมี กาแพงแสน Biochemistry KU KPS (biochem.flas.kps.ku.ac.th/01402313/01402313_157_Amino-met_20141029.ppt)
b. ปฏิกิริยาการขจัดอะมิโนชนิดไม่มีออกซิเดชัน (non-oxidative deamination)
Amino nitrogen pathway (วิถีไนโตรเจน)
(3) Deaminase เป็นกลุ่มเอนไซม์ที่สลายแอมโมเนียจากหมู่เอไมด์ของกลูทามีนและ แอสพาราจีน
62. Conditionally essential AA
Conditionally essential
(i) ARG:can be made, but not enough
(ii) HIS: controversial (essential for growth in
children)
(iii) PHE essential, TYR can be made from
PHE but when enzyme is missing (phenyl-
ketonuria) then PHE ≠> TYR; Therefore TYR
is essential
(iv) MET & CYS; Similarly, if MET ≠> CYS
then CYS essential
Even with excess, important in excretion NH4
+
therefore continue to be made
*
63. Figure 1. Pathways involved in the synthesis of non-essential amino acids glycine, alanine, serine
cysteine, aspartic acid, asparagine, glutamic acid, glutamine, proline and ornithine
69. อาหารและอาหารเสริมที่มี Serotonin
• tryptophan เป็นส่วนประกอบสาคัญของการ
สร้าง serotonin บางงานวิจัยเสนอว่าการ
รับประทานอาหารที่มี tryptophan มาก
อาจจะช่วยเพิ่มระดับของ serotonin ในสมอง
และช่วยรักษาอาการของโรคซึมเศร้า
• อาหารที่อุดมไปด้วย tryptophan เช่น ถั่ว,
อาหารจากถั่วเหลือง ไข่ เนื้อสัตว์ สัตว์ปีก
หน่อไม้ฝรั่ง ชอกโกแลตเป็นต้น
• Research has also shown that when
you follow a low-tryptophan diet, brain
serotonin levels drop. However,
research is ongoing to determine how
much tryptophan-containing foods can
affect serotonin levels in the brain.
https://www.honestdocs.co/what-is-seratonin
https://www.healthline.com/health/healthy-sleep/foods-that-could-boost-your-serotonin#eggs
71. การสังเคราะห์สารชีวโมเลกุลที่สาคัญจากกรดอะมิโน :
การสังเคราะห์ Histamine
• ปฏิกิริยาการขจัดหมู่คาร์บอกซิลของ histidine ได้เป็นสาร Histamine
• Histamines start the process that hustles those allergens out
of your body or off your skin. They can make you sneeze, tear
up, or itch -- whatever it takes to get the job done. They are
part of your body's defense system
ฮิสตามี และยาต้านฮิสตามี บทที่ 12, CM 473, http://e-book.ram.edu/e-book/c/CM473(48)/CM473-12.pdf
https://www.webmd.com/allergies/what-are-histamines#1
http://www.diagnosisdiet.com/histamine-intolerance-science/
72. การสังเคราะห์สารชีวโมเลกุลที่สาคัญจากกรดอะมิโน :
การสังเคราะห์ γ-อะมิโนบิวทาเรต (GABA)
• ปฏิกิริยาการขจัดหมู่คาร์บอกซิลของกลูตาเมตได้เป็นสาร γ-
aminobutyrate (GABA) ทาหน้าที่เป็นสารสื่อในระบบประสาทส่วนกลาง
γ-aminobutyrate
จันทรพร ทองเอกแก ว , A Greatly Useful of GABA for Health, KKU Science Journal Volume 43 Number 2
73. • GABA is a neurotransmitter that acts to reduce communication
between nerve cells in the brain, producing a calming effect
(Promotes Sleep).
• GABA powder might make it easier to fall asleep by lowering the
activity of neurons in the brain. GABA powder might also increase the
amount of human growth hormone in the body, which might improve
sleep cycles and decrease disruptions in sleep.
• Improves Chronic Pain: GABA inhibits the transmission of pain
impulses throughout the body, as reported in January 2008.
What is γ-aminobutyrate (GABA)
75. • Creatine is a compound formed from several amino acids that is found
naturally in our body.
• About 95% of the body's creatine is stored in muscles, in the form of
phosphocreatine. The other 5% are stored in the brain, kidneys and liver
(9).
• Phosphocreatine is a form of stored energy in the cells, as it helps your
body produce more of a high-energy molecule called ATP.
• It helps your muscles produce energy during heavy lifting or high-intensity
exercise.
https://fitwhey.com/product/creatine1/
What is creatine?
Rudy Mawer, MSc, sports nutritionist from the International Society of Sports Nutrition (ISSN), https://www.healthline.com/nutrition/what-is-creatine#section1
76. • Glutathione (กลูตาไทโอน) เป็นสารต้านอนุมูลอิสระที่เซลล์ในร่างกายมนุษย์
สามารถสังเคราะห์ได้เอง เป็นสารประเภท Tripeptide ที่ประกอบด้วย AA 3
ชนิดได้แก่ Cysteine, Glycine และ Glutamic acid และต้องการพลังงาน
ATP เพื่อการสังเคราะห์
Protein and amino acid metabolism, chayanon P. http://www.si.mahidol.ac.th/department/biochemistry/home/md/lecture/Protein%20and%20amino%20acid%20metabolismMed2009.pdf
การสังเคราะห์สารชีวโมเลกุลที่สาคัญจากกรดอะมิโน :
การสังเคราะห์ Glutathione
77. Glutathione level
•Glutathione levels in the body may be reduced by a number
of factors, including poor nutrition, environmental toxins, and
stress. Its levels also decline with age.’
•It’s also available as an oral supplement in capsule and
liquid form.
•However, oral ingestion of glutathione may not be as
effective as intravenous delivery for some conditions.
• Side effects and risks
–A diet rich in glutathione-boosting foods does not pose any risks. However, taking
supplements may not be advisable for everyone. Talk to your doctor about glutathione
to determine if it’s right for you. Possible side effects may include:
–abdominal cramps
–bloating
–trouble breathing due to bronchial constriction
–allergic reactions, such as rash
https://www.healthline.com/health/glutathione-benefits