SlideShare a Scribd company logo
1 of 35
Download to read offline
Diagnos
Jonas Ludvigsson




                   2009
Nytta av ett test


Bekräfta - att en patient har en viss diagnos
Förkast - att en patient har en viss diagnos
Förhållande: test-sjukdom
                       Sjukdom
                Sjuk             Frisk


             Sant positiv Falskt positiv
       Pos

Test

             Falskt neg     Sant neg
       Neg
Förhållande: test-celiaki 1
                   Celiaki
            Sjuk             Frisk
                                     PPV = 13/17= 76%
            13                4
      Pos
                                     NPV = 443/446=
                                          99.3%
Ema

             3               443
      Neg
                                         Hadithi
Förhållande: test-celiaki 2
                   Celiaki
            Sjuk             Frisk
                                     PPV = 4/8= 50%
             4                4
      Pos
                                     NPV = 443/444=
                                          99.8%
Ema

             1               443
      Neg
                                         Hadithi
Förhållande: test-celiaki 3
                      Celiaki
               Sjuk             Frisk
                                        PPV = 16/208= 8%
               16               192
         Pos
                                         NPV = 255/255=
                                              100%
HLA DQ2 or 8
                                        “Celiakitest förenligt
                0               255
         Neg                                med celiaki”
                                              (journal)
No Caption Found




                                         Benitz, W. E. et al. Pediatrics 1998;102:e41

Copyright ©1998 American Academy of Pediatrics
Gold standard 1
                            Enkla: halsodling

                      Komplicerad: Biopsi (lungcancer)
Criterion standard
                     Komplicerad: Biopsi (kardiomyopati)
Reference standard

                      Alternativ: Follow-up: rätt längd...
Gold standard 2


Föredra enklare test: Rtg

                            Varför inte lungbiopsi?
                                 -Omständligt
 Men acceptera viss
                                    -Farligt
 felklassificering...
                                     -Dyrt
Problem - diagnostiska tester
                                “Driver inte utredningen vidare om
                                        celiakitest är neg...
                                 (kostnad, risker, etiska aspekter)
   Innebörd av negativa test?




Alltså vet vi ganska litet
 om neg testresultat...
Värdera negativa test



Ett sätt att värdera nyttan av ett negativt test: Prostata-Ca
Analysera tidigare sera
Vad visar testet hos friska



Vad visar MR ryggmärg hos patienter utan ryggsmärta?
Objektiva sjukdomskriterier saknas




Angina Pectoris - anamnes
Colon irritabile

                            Jonas kompis
Dålig gold standard...

   Problem när man prövar ett nytt test:

•Hittar nya fall
•Hittar inte vissa gamla fall..
Sensitivitet - Specificitet


Sensitivitet: Andel av de sjuka som hittas (pos. test)
Specificitet: Andel av de friska som friskförklaras (neg. test)
Val av test
Måste hitta alla: PKU-test, Tb, HIV inför att ge blod
                           NYTTA: testet är negativt
Sensitivitet: Andel av de sjuka som hittas (pos. test)
Specificitet: Andel av de friska som friskförklaras (neg. test)
Val av test


         Sensitivitet: Andel av de sjuka som hittas (pos. test)
         Specificitet: Andel av de friska som friskförklaras (neg. test)
Bekräfta att någon är sjuk: Benmärgsbiopsi inför cytostatikabehandl.

                            NYTTA: testet är positivt
Trade-off (myntets baksida)
                                          2
             ROC-kurva


                                     15
Cut-off var???
Lågt gränsvärde 2 = “få med friska”
Högt gränsvärde 15 = “missa sjuka”
Varför nya tester framstår som så bra!



Entusiastisk testare (vill publicera i bra tidskrift)
I vilken patientgrupp man kört testet
Bias när man tolkar testet
Patientgrupper


Testas bland tydliga patientfall: uttalad sjukdom, långdragen
sjukdom
Annorlunda i den vanliga befolkningen...
Bias när sensitiv/spec. mäts 1
                                        fler sant positiva


Om testet positivt: Leta vidare efter sjukdom: “du hittar den!”
Om testet negativt: Ej leta vidare efter sjukdom: “hittas inte”



                                        fler falskt negativa
Bias när sensitiv/spec. mäts 2


Testet som utvärderas, ej påverka risken för diagnos.
Alltså: Diagnosen ställas oberoende av testet!


                      “Eftergranska bilderna” = fördel/nackdel
Slump när sensitiv/spec. mäts

Sensitivitet och specificitet utvärderas på bas av små material
Publication bias: Ett test med hög spec/sens - lättare publiceras


         Men hur får vi en sensitivitet på 75% av 10 pat..:-)
Prediktivt värde

Före test: Hur stor andel av de sjuka hittar testet?
Före test: Hur stor andel av de friska friskförklaras?
Efter test: Hur stor andel av de EMA+ har celiaki?
Efter test: Hur stor andel av de EMA- har inte celiaki
Prediktivt värde 2

Prediktivt värde = posterior/posttest probability
Accuracy = andel sanna (sant pos + sant neg)
Prevalens = prior / pretest probability*
                                Befolkningen: 1%
                            Inremitt. för endoskopi: 4%
Prediktivt värde 3
Hög sensitivitet = Bättre negativt prediktivt värde
Hög specificitet = Bättre positivt prediktivt värde
                                          låg specificitet (90%):
                                         många falskt positiva:
                                         lägre andel av de med
                                       pos test är verkligen sjuka!
Prediktivt värde 4


Malaria snabbtest: bara testa bland infödda svenskar i Sverige
Extremt låg prevalens
Alla positiva = falskt positiva.
Positivt prediktiva värdet närmar sig “0”!
Prediktivt värde: Testa vem?

HIV-test: OK att screena riskgrupper
HIV-test: screena alla?


      Vad händer om vi screenar hela Sveriges befolkning för
                             celiaki?
            Prevalens avgörande för pos pred värde!
Uppskatta prevalensen


Kliniker överskattar prevalensen...”jag hade en Kawasaki förra
veckan”...
Stora databaser
Att öka prevalensen
Inremitterade patienter     fler diagnost. test
Vissa demografiska grupper   65årig man: angina...
Symptom/tecken/anamnes      rökare m. anginasmärta
Likelihood ratio
  Probability = sensitivitet, specificitet, prediktivt värde (andelar)
  Odds = kvot = sannolikhet av event / (1-sannolikhet)
  Likelihood ratios: Hur många gånger mer sannolikt att positivt
  hos sjuka än hos friska.

                  Celiaki: EMA: LR+ = 91
(91 ggr mer sannolikt att pos test hos celiakipat än hos frisk)
Likelihood ratio
                            Sensit.   1-spec.

Röd=befolkn.
Grön=Hadithi
                         (13/16) / (4/447) = 91

                               13      4

                               3      443
Lieklihood ratio 2
Sensitivitet = andel av alla med sjukdom
Likelihood = hur bra ett test är på att hitta en sjuk
                    •Rule o thumb:
                    •LR+ 1 = ingen ökad risk för sjd
                    •LR+ 10 = 50% ökad risk för sjd
Parallel vs. serial testing

Många tester samtidigt: Öka sensitivitet (inremitt. patienter /
provsvep)
Ett test i taget: Öka specificiteten eftersom bara den som är
upprepat positiv går vidare. Ökat PPV: högre andel av de med
tre efterföljande test är positiva har verkligen sjukdom!

                          Dyra, riskabla test: ex. amniocentes
SLUT


the end

More Related Content

Viewers also liked (12)

Skl ludvigsson 20150326
Skl ludvigsson 20150326Skl ludvigsson 20150326
Skl ludvigsson 20150326
 
Sinnena: Smak, lukt och känsel
Sinnena: Smak, lukt och känselSinnena: Smak, lukt och känsel
Sinnena: Smak, lukt och känsel
 
Kroppen
KroppenKroppen
Kroppen
 
Thyroidea2015
Thyroidea2015Thyroidea2015
Thyroidea2015
 
Chap04 basic probability
Chap04 basic probabilityChap04 basic probability
Chap04 basic probability
 
Vch_enkat_swibreg_2016
Vch_enkat_swibreg_2016Vch_enkat_swibreg_2016
Vch_enkat_swibreg_2016
 
Berättande texter att skriva
Berättande texter  att skrivaBerättande texter  att skriva
Berättande texter att skriva
 
Theorems And Conditional Probability
Theorems And Conditional ProbabilityTheorems And Conditional Probability
Theorems And Conditional Probability
 
Baye’s Theorem
Baye’s TheoremBaye’s Theorem
Baye’s Theorem
 
Bayes Theorem
Bayes TheoremBayes Theorem
Bayes Theorem
 
Probability basics and bayes' theorem
Probability basics and bayes' theoremProbability basics and bayes' theorem
Probability basics and bayes' theorem
 
Basic Concept Of Probability
Basic Concept Of ProbabilityBasic Concept Of Probability
Basic Concept Of Probability
 

More from Jonas Ludvigsson

Barnmedicin AT-föreläsning i Örebro 2014
Barnmedicin AT-föreläsning i  Örebro 2014Barnmedicin AT-föreläsning i  Örebro 2014
Barnmedicin AT-föreläsning i Örebro 2014
Jonas Ludvigsson
 
Ludvigsson register 28maj_2013
Ludvigsson register 28maj_2013Ludvigsson register 28maj_2013
Ludvigsson register 28maj_2013
Jonas Ludvigsson
 
Barnmed at lakare_usö_march13_2013
Barnmed at lakare_usö_march13_2013Barnmed at lakare_usö_march13_2013
Barnmed at lakare_usö_march13_2013
Jonas Ludvigsson
 
Internationellt_ludvigsson_110908
Internationellt_ludvigsson_110908Internationellt_ludvigsson_110908
Internationellt_ludvigsson_110908
Jonas Ludvigsson
 
Gastrodagarna ludvigsson 110518
Gastrodagarna ludvigsson 110518Gastrodagarna ludvigsson 110518
Gastrodagarna ludvigsson 110518
Jonas Ludvigsson
 

More from Jonas Ludvigsson (20)

Akutpediatrik_211020.pdf
Akutpediatrik_211020.pdfAkutpediatrik_211020.pdf
Akutpediatrik_211020.pdf
 
Akutpediatrik 211020 utan patientfall
Akutpediatrik 211020 utan patientfallAkutpediatrik 211020 utan patientfall
Akutpediatrik 211020 utan patientfall
 
Sammanfattning arbetsmiljoenkat 2006_2010_2012_2014_16_19_20_21
Sammanfattning arbetsmiljoenkat 2006_2010_2012_2014_16_19_20_21Sammanfattning arbetsmiljoenkat 2006_2010_2012_2014_16_19_20_21
Sammanfattning arbetsmiljoenkat 2006_2010_2012_2014_16_19_20_21
 
Leonardo da Vinci
Leonardo da VinciLeonardo da Vinci
Leonardo da Vinci
 
Quiz frankrike 180727
Quiz frankrike 180727Quiz frankrike 180727
Quiz frankrike 180727
 
Sammanfattning arbetsmiljoenkat 2006_2010_2012_2014_2016
Sammanfattning arbetsmiljoenkat 2006_2010_2012_2014_2016Sammanfattning arbetsmiljoenkat 2006_2010_2012_2014_2016
Sammanfattning arbetsmiljoenkat 2006_2010_2012_2014_2016
 
Ludvigsson registries oslo 2016
Ludvigsson registries oslo 2016Ludvigsson registries oslo 2016
Ludvigsson registries oslo 2016
 
Rota
RotaRota
Rota
 
Columbia march 2015
Columbia march 2015Columbia march 2015
Columbia march 2015
 
Barnmed at lakare_usö_2014
Barnmed at lakare_usö_2014Barnmed at lakare_usö_2014
Barnmed at lakare_usö_2014
 
Barnmedicin AT-föreläsning i Örebro 2014
Barnmedicin AT-föreläsning i  Örebro 2014Barnmedicin AT-föreläsning i  Örebro 2014
Barnmedicin AT-föreläsning i Örebro 2014
 
Ludvigsson register 28maj_2013
Ludvigsson register 28maj_2013Ludvigsson register 28maj_2013
Ludvigsson register 28maj_2013
 
Barnmed at lakare_usö_march13_2013
Barnmed at lakare_usö_march13_2013Barnmed at lakare_usö_march13_2013
Barnmed at lakare_usö_march13_2013
 
Summary histopathology BSG-Oslo Sept17 2012
Summary histopathology BSG-Oslo Sept17 2012Summary histopathology BSG-Oslo Sept17 2012
Summary histopathology BSG-Oslo Sept17 2012
 
Forskande läkare 100927
Forskande läkare 100927Forskande läkare 100927
Forskande läkare 100927
 
Anslag jonas
Anslag jonasAnslag jonas
Anslag jonas
 
Internationellt_ludvigsson_110908
Internationellt_ludvigsson_110908Internationellt_ludvigsson_110908
Internationellt_ludvigsson_110908
 
Gastrodagarna ludvigsson 110518
Gastrodagarna ludvigsson 110518Gastrodagarna ludvigsson 110518
Gastrodagarna ludvigsson 110518
 
Internetsokning 110216
Internetsokning 110216Internetsokning 110216
Internetsokning 110216
 
Tintins halsa
Tintins halsaTintins halsa
Tintins halsa
 

Test Ludvigsson

  • 2. Nytta av ett test Bekräfta - att en patient har en viss diagnos Förkast - att en patient har en viss diagnos
  • 3. Förhållande: test-sjukdom Sjukdom Sjuk Frisk Sant positiv Falskt positiv Pos Test Falskt neg Sant neg Neg
  • 4. Förhållande: test-celiaki 1 Celiaki Sjuk Frisk PPV = 13/17= 76% 13 4 Pos NPV = 443/446= 99.3% Ema 3 443 Neg Hadithi
  • 5. Förhållande: test-celiaki 2 Celiaki Sjuk Frisk PPV = 4/8= 50% 4 4 Pos NPV = 443/444= 99.8% Ema 1 443 Neg Hadithi
  • 6. Förhållande: test-celiaki 3 Celiaki Sjuk Frisk PPV = 16/208= 8% 16 192 Pos NPV = 255/255= 100% HLA DQ2 or 8 “Celiakitest förenligt 0 255 Neg med celiaki” (journal)
  • 7. No Caption Found Benitz, W. E. et al. Pediatrics 1998;102:e41 Copyright ©1998 American Academy of Pediatrics
  • 8. Gold standard 1 Enkla: halsodling Komplicerad: Biopsi (lungcancer) Criterion standard Komplicerad: Biopsi (kardiomyopati) Reference standard Alternativ: Follow-up: rätt längd...
  • 9. Gold standard 2 Föredra enklare test: Rtg Varför inte lungbiopsi? -Omständligt Men acceptera viss -Farligt felklassificering... -Dyrt
  • 10. Problem - diagnostiska tester “Driver inte utredningen vidare om celiakitest är neg... (kostnad, risker, etiska aspekter) Innebörd av negativa test? Alltså vet vi ganska litet om neg testresultat...
  • 11. Värdera negativa test Ett sätt att värdera nyttan av ett negativt test: Prostata-Ca Analysera tidigare sera
  • 12. Vad visar testet hos friska Vad visar MR ryggmärg hos patienter utan ryggsmärta?
  • 13. Objektiva sjukdomskriterier saknas Angina Pectoris - anamnes Colon irritabile Jonas kompis
  • 14. Dålig gold standard... Problem när man prövar ett nytt test: •Hittar nya fall •Hittar inte vissa gamla fall..
  • 15. Sensitivitet - Specificitet Sensitivitet: Andel av de sjuka som hittas (pos. test) Specificitet: Andel av de friska som friskförklaras (neg. test)
  • 16. Val av test Måste hitta alla: PKU-test, Tb, HIV inför att ge blod NYTTA: testet är negativt Sensitivitet: Andel av de sjuka som hittas (pos. test) Specificitet: Andel av de friska som friskförklaras (neg. test)
  • 17. Val av test Sensitivitet: Andel av de sjuka som hittas (pos. test) Specificitet: Andel av de friska som friskförklaras (neg. test) Bekräfta att någon är sjuk: Benmärgsbiopsi inför cytostatikabehandl. NYTTA: testet är positivt
  • 18. Trade-off (myntets baksida) 2 ROC-kurva 15 Cut-off var??? Lågt gränsvärde 2 = “få med friska” Högt gränsvärde 15 = “missa sjuka”
  • 19. Varför nya tester framstår som så bra! Entusiastisk testare (vill publicera i bra tidskrift) I vilken patientgrupp man kört testet Bias när man tolkar testet
  • 20. Patientgrupper Testas bland tydliga patientfall: uttalad sjukdom, långdragen sjukdom Annorlunda i den vanliga befolkningen...
  • 21. Bias när sensitiv/spec. mäts 1 fler sant positiva Om testet positivt: Leta vidare efter sjukdom: “du hittar den!” Om testet negativt: Ej leta vidare efter sjukdom: “hittas inte” fler falskt negativa
  • 22. Bias när sensitiv/spec. mäts 2 Testet som utvärderas, ej påverka risken för diagnos. Alltså: Diagnosen ställas oberoende av testet! “Eftergranska bilderna” = fördel/nackdel
  • 23. Slump när sensitiv/spec. mäts Sensitivitet och specificitet utvärderas på bas av små material Publication bias: Ett test med hög spec/sens - lättare publiceras Men hur får vi en sensitivitet på 75% av 10 pat..:-)
  • 24. Prediktivt värde Före test: Hur stor andel av de sjuka hittar testet? Före test: Hur stor andel av de friska friskförklaras? Efter test: Hur stor andel av de EMA+ har celiaki? Efter test: Hur stor andel av de EMA- har inte celiaki
  • 25. Prediktivt värde 2 Prediktivt värde = posterior/posttest probability Accuracy = andel sanna (sant pos + sant neg) Prevalens = prior / pretest probability* Befolkningen: 1% Inremitt. för endoskopi: 4%
  • 26. Prediktivt värde 3 Hög sensitivitet = Bättre negativt prediktivt värde Hög specificitet = Bättre positivt prediktivt värde låg specificitet (90%): många falskt positiva: lägre andel av de med pos test är verkligen sjuka!
  • 27. Prediktivt värde 4 Malaria snabbtest: bara testa bland infödda svenskar i Sverige Extremt låg prevalens Alla positiva = falskt positiva. Positivt prediktiva värdet närmar sig “0”!
  • 28. Prediktivt värde: Testa vem? HIV-test: OK att screena riskgrupper HIV-test: screena alla? Vad händer om vi screenar hela Sveriges befolkning för celiaki? Prevalens avgörande för pos pred värde!
  • 29. Uppskatta prevalensen Kliniker överskattar prevalensen...”jag hade en Kawasaki förra veckan”... Stora databaser
  • 30. Att öka prevalensen Inremitterade patienter fler diagnost. test Vissa demografiska grupper 65årig man: angina... Symptom/tecken/anamnes rökare m. anginasmärta
  • 31. Likelihood ratio Probability = sensitivitet, specificitet, prediktivt värde (andelar) Odds = kvot = sannolikhet av event / (1-sannolikhet) Likelihood ratios: Hur många gånger mer sannolikt att positivt hos sjuka än hos friska. Celiaki: EMA: LR+ = 91 (91 ggr mer sannolikt att pos test hos celiakipat än hos frisk)
  • 32. Likelihood ratio Sensit. 1-spec. Röd=befolkn. Grön=Hadithi (13/16) / (4/447) = 91 13 4 3 443
  • 33. Lieklihood ratio 2 Sensitivitet = andel av alla med sjukdom Likelihood = hur bra ett test är på att hitta en sjuk •Rule o thumb: •LR+ 1 = ingen ökad risk för sjd •LR+ 10 = 50% ökad risk för sjd
  • 34. Parallel vs. serial testing Många tester samtidigt: Öka sensitivitet (inremitt. patienter / provsvep) Ett test i taget: Öka specificiteten eftersom bara den som är upprepat positiv går vidare. Ökat PPV: högre andel av de med tre efterföljande test är positiva har verkligen sjukdom! Dyra, riskabla test: ex. amniocentes