SlideShare a Scribd company logo
1 of 1
Download to read offline
高雄醫學大學生物暨環境學系暑期實習成果之心得報告
                               長榮大學生物科技系
                          指導老師: 李瑞年 老師  余俊杰 學長
                           學生:吳俊宏       系級:生科4A                                                       學號:I44711421
                     Association of single nucleotide polymorphism of LIPC
                      Predict to development the type II diabetes mellitus
                              LIPC基因多型性的第二型糖尿病發展預測
Abstract
糖尿病(Diabetes mellitus)病患共同擁有的特徵就是高血
                                                             (圖三)經PCR跑完膠後確認無汙染,再用Dra1限制酶切割後跑
糖 ,近幾年來糖尿病一直是國人的十大死因之一,據估計,
                                                             電泳完照UV光後產物可比照(圖二)判斷哪一種band的位置是哪
糖尿病人中,約90-95%是屬於非胰島素依賴型或稱為第二型糖
                                                             一個基因型。
尿病。根據文獻的探討我們可知人體有好幾個基因跟第二型糖
                                                                                                          50                                                                          45
尿病有關。由於SNP的產生可能會造成蛋白質表現的改變,所                                                                              40
                                                                                                                                                                  32
以SNP也成為影響人類體質的關鍵,使人可能特別容易或特別




                                                                         counts
                                                                                                          30

不容易患上某些疾病,在現代科技中SNP廣泛被應用於(1)尋找                                                                            20
                                                                                                                          13

致病基因(2)診斷及預測致病風險(3)藥物基因體學及新藥的發                                                                            10


現(4)生物晶片快速檢測(5)研究族群演化。所以針對不同的基                                                                                0
                                                                                                                          AA                                      GG                  GA
因做分析,來評估高風險,中度風險,和低風險群做個區別藉
                                                             (圖四)每一種基因型空腹血糖值≧100在該基因所占人數,將此
此來達到個人身體健康預警。
                                                             空腹血糖值≧100視為Pre-DM。
Subject and Method                                                                                                                                                                    29




                                                                  Counts of fasting plasma
                                                                  glucose of over the levels
                                                                                                      30

                                                                                                                    24.1
                                                                                                      25
試驗大致程序                                                                                                20
                                                                                                                                                                21.2


(1)抽血液DNA:                                                                                            15


將血液依序加入所需的藥品及容量即可將血液DNA抽取出來。                                                                   (%)    10


(2)測定DNA濃度及OD值:                                                                                           5

                                                                                                          0
將抽取的DNA測OD值,方可知道DNA純度及濃度好方便稀釋。                                                                                       AA                                          GG                   GA


(3)PCR:                                                      (圖五)將(圖四)各基因型統計出Pre-DM在個基因型所佔比例。
稀釋好的DNA濃度依序加入PCR所需的藥品。跑膠完,測UV確                               30                                                                                            40
定有無產物。




                                                                                                                                             血糖超標所佔比例(%)
                                              BMI(體重/身高平方)




                                                                                                              實際值   標準值    實際值

(4)Dra1限制酶切割(restriction enzyme):                                                              標準值
                                                                                                                                                           30
                                                             20
確定PCR無汙染和確定有產物時方可加入限制梅和所需的藥
品。                                                                                                                                                         20


(5)電泳分析基因型:                                                  10

將限制酶切割完的膠拿去照UV確定有無切割,方可判斷                                                                                                                                  10


Sample的基因型。                                                   0
                                                                                                                                                            0
                                                                                                     女生              男生
                                                                                                                                                                           男生              女生


Result                                        (圖六)男女生平均BMI,經所 (圖七)所有受試者依性別判斷血糖
                                              有受試者平均的身高與體重去 ≧100超標值所佔比例。
                                              計算BMI所得為實際值。標準
                                              值為平均受試者年齡去判斷該
                                              標準值為多少。          40

                                                                                                                                                 35
                                                                                                                                 Counts(%)




                                                                                                                                                 30

                                                                                                                                                 25

                                              (圖八)依性判斷超標血                                                                                        20
(圖一)DNA萃取完經過稀釋定量後跑PCR,PCR完照UV光的
                                              糖≧100在各類型基因統                                                                                       15

產物膠圖,約為700 bp。                                                                                                                                   10
                                              計出在男生(左)與女生                                                                                           5

                                              (右)間所佔比例為多少。                                                                                          0
                                                                                                                                                           GA         GG    AA   GA        GG   AA

                                                                                                                                                                 男生                   女生
(圖二)依此圖可看出利用Dra1限制酶切割PCR產物後大小, Conclution
                                           從圖(六)中發現女生的BMI是超標的可是男生卻是正常的,但是從圖
可利用此圖判斷(圖三)膠圖。(來源:余俊杰學長)
                                           (七)中看出男生Pre-DM的比例遠高於女生,初步判斷可能與BMI圖
                                           (六)和身高(NO SHOW)無直接相關。再來是看基因型從圖(四)中看出
                                           血糖超標攜帶GA基因型的人比較多,接著從圖(八)中看出男生攜帶
                                           GA型的人較多雖然女生是攜帶AA型的人較多但GA型的人也是位居第
                                           二,從以上判斷我們一開始推論可能與性別無直接相關性,那麼剔
                                           除性別之分的話可以找出GA型基因的人Pre-DM的機率是比其他兩型
                                           的人還要高的。所以結論就是GA型的人羅患糖尿病的機率是比較高
                                           的。
                                           誌謝
                                            感謝這兩個月待在高醫的日子,謝謝李老師和學長還有同學的教導,
 GG        MARKER    GA    AA               每當我有很多問題時他們總會不厭其煩和有耐心的為我講解,這時才
                                            體會互相學習的那種感覺,謝謝他們這段期間讓我學習這麼多東西。

More Related Content

More from 乙玄 黃 (20)

李欣頻
李欣頻李欣頻
李欣頻
 
吳岱穎
吳岱穎吳岱穎
吳岱穎
 
吳存敬
吳存敬吳存敬
吳存敬
 
林亞錡
林亞錡林亞錡
林亞錡
 
賴筱芸
賴筱芸賴筱芸
賴筱芸
 
蕭煜獻
蕭煜獻蕭煜獻
蕭煜獻
 
盧星翰
盧星翰盧星翰
盧星翰
 
鄭建致
鄭建致鄭建致
鄭建致
 
劉佩禎
劉佩禎劉佩禎
劉佩禎
 
趙朝欽
趙朝欽趙朝欽
趙朝欽
 
廖建泓
廖建泓廖建泓
廖建泓
 
葉家豪
葉家豪葉家豪
葉家豪
 
楊惟珶
楊惟珶楊惟珶
楊惟珶
 
黃姿瑜
黃姿瑜黃姿瑜
黃姿瑜
 
黃乙玄
黃乙玄黃乙玄
黃乙玄
 
曾律萍
曾律萍曾律萍
曾律萍
 
麥瑞浩
麥瑞浩麥瑞浩
麥瑞浩
 
陳麗如
陳麗如陳麗如
陳麗如
 
陳柏蓁
陳柏蓁陳柏蓁
陳柏蓁
 
陳宥安
陳宥安陳宥安
陳宥安
 

吳俊宏

  • 1. 高雄醫學大學生物暨環境學系暑期實習成果之心得報告 長榮大學生物科技系 指導老師: 李瑞年 老師 余俊杰 學長 學生:吳俊宏 系級:生科4A 學號:I44711421 Association of single nucleotide polymorphism of LIPC Predict to development the type II diabetes mellitus LIPC基因多型性的第二型糖尿病發展預測 Abstract 糖尿病(Diabetes mellitus)病患共同擁有的特徵就是高血 (圖三)經PCR跑完膠後確認無汙染,再用Dra1限制酶切割後跑 糖 ,近幾年來糖尿病一直是國人的十大死因之一,據估計, 電泳完照UV光後產物可比照(圖二)判斷哪一種band的位置是哪 糖尿病人中,約90-95%是屬於非胰島素依賴型或稱為第二型糖 一個基因型。 尿病。根據文獻的探討我們可知人體有好幾個基因跟第二型糖 50 45 尿病有關。由於SNP的產生可能會造成蛋白質表現的改變,所 40 32 以SNP也成為影響人類體質的關鍵,使人可能特別容易或特別 counts 30 不容易患上某些疾病,在現代科技中SNP廣泛被應用於(1)尋找 20 13 致病基因(2)診斷及預測致病風險(3)藥物基因體學及新藥的發 10 現(4)生物晶片快速檢測(5)研究族群演化。所以針對不同的基 0 AA GG GA 因做分析,來評估高風險,中度風險,和低風險群做個區別藉 (圖四)每一種基因型空腹血糖值≧100在該基因所占人數,將此 此來達到個人身體健康預警。 空腹血糖值≧100視為Pre-DM。 Subject and Method 29 Counts of fasting plasma glucose of over the levels 30 24.1 25 試驗大致程序 20 21.2 (1)抽血液DNA: 15 將血液依序加入所需的藥品及容量即可將血液DNA抽取出來。 (%) 10 (2)測定DNA濃度及OD值: 5 0 將抽取的DNA測OD值,方可知道DNA純度及濃度好方便稀釋。 AA GG GA (3)PCR: (圖五)將(圖四)各基因型統計出Pre-DM在個基因型所佔比例。 稀釋好的DNA濃度依序加入PCR所需的藥品。跑膠完,測UV確 30 40 定有無產物。 血糖超標所佔比例(%) BMI(體重/身高平方) 實際值 標準值 實際值 (4)Dra1限制酶切割(restriction enzyme): 標準值 30 20 確定PCR無汙染和確定有產物時方可加入限制梅和所需的藥 品。 20 (5)電泳分析基因型: 10 將限制酶切割完的膠拿去照UV確定有無切割,方可判斷 10 Sample的基因型。 0 0 女生 男生 男生 女生 Result (圖六)男女生平均BMI,經所 (圖七)所有受試者依性別判斷血糖 有受試者平均的身高與體重去 ≧100超標值所佔比例。 計算BMI所得為實際值。標準 值為平均受試者年齡去判斷該 標準值為多少。 40 35 Counts(%) 30 25 (圖八)依性判斷超標血 20 (圖一)DNA萃取完經過稀釋定量後跑PCR,PCR完照UV光的 糖≧100在各類型基因統 15 產物膠圖,約為700 bp。 10 計出在男生(左)與女生 5 (右)間所佔比例為多少。 0 GA GG AA GA GG AA 男生 女生 (圖二)依此圖可看出利用Dra1限制酶切割PCR產物後大小, Conclution 從圖(六)中發現女生的BMI是超標的可是男生卻是正常的,但是從圖 可利用此圖判斷(圖三)膠圖。(來源:余俊杰學長) (七)中看出男生Pre-DM的比例遠高於女生,初步判斷可能與BMI圖 (六)和身高(NO SHOW)無直接相關。再來是看基因型從圖(四)中看出 血糖超標攜帶GA基因型的人比較多,接著從圖(八)中看出男生攜帶 GA型的人較多雖然女生是攜帶AA型的人較多但GA型的人也是位居第 二,從以上判斷我們一開始推論可能與性別無直接相關性,那麼剔 除性別之分的話可以找出GA型基因的人Pre-DM的機率是比其他兩型 的人還要高的。所以結論就是GA型的人羅患糖尿病的機率是比較高 的。 誌謝 感謝這兩個月待在高醫的日子,謝謝李老師和學長還有同學的教導, GG MARKER GA AA 每當我有很多問題時他們總會不厭其煩和有耐心的為我講解,這時才 體會互相學習的那種感覺,謝謝他們這段期間讓我學習這麼多東西。