SlideShare a Scribd company logo
1 of 1
Download to read offline
Generation Pre-stained Molecular Weight Marker
                                                         長榮大學生物科技系
                               實習單位:國立成功大學醫學院生物化學暨分子生物學研究所
                                                       指導老師:鄭宏祺 老師
                                                             實習學生:洪昆瑨
      Abstract
 思考是否有什麼方法 Lab 可以自己製造。經過文獻的搜尋之後我們找到了一篇就是製造pre-stained 的相關文獻,於是我們可以遵循相似步驟來試試看。在實際應用中
 至少需要loading多少protein才可看得清楚,而將各個marker混在一起後在gel中是否很正常的分開。就是染劑的這些官能基會與蛋白質的氨基接合上,而在SDS-
 PAGE產生出用肉眼可以看見的band。我們在『Generation of multicolored, pre-stained molecular weight markers for gel electrophoresis』這篇文獻中找到了一些方法,
 我們將遵循這篇文獻的實驗方法去進行嘗試,但是會依據我們得到的結果去進行修改與嘗試。Paper裡面提到有對溫度、pH值、染劑含量、時間等因素進行實驗以及
 討論,我們也將著手從這些因素中尋找適合我們Lab製造protein Marker的製造的最佳條件。因為普遍Marker的顏色是藍色,所以一開始我原本也是要挑選藍色的染
 劑來進行測試,但是我看了paper之後發覺其實紅色也是非常明顯而且搶眼,似乎非常容易辨別,因此我挑選了紅色來進行測試,溫度部分參考了paper中的60℃還有
 染劑部分則是與蛋白質呈現1:1的比例,至於pH值則從8.0~8.5開始著手,蛋白質則是選擇Lab裡存量比較多的BSA來進行測試。LEVAFIX BRILLIANT RED E-BA
 GRAN在與BSA進行反應的時候溫度約80℃會與60℃的Bane有所差別存在。進行pre-stained過後的protein在要進行loading之前最好不要再進行95℃的加熱,不然效果
 會減弱許多。LEVAFIX BRILLIANT RED E-BA GRAN相較於其他顏色還說比較穩定(例如:LEVAFIX BLUE CAGRAN、Levafix Navy CA Gran…)所以之後的
 pre-stained將考慮用LEVAFIX BRILLIANT RED E-BA GRAN來進行。


       protocol                                                       Result
LEVAFIX BRILLIANT RED E-BA GRAN染色測試:
藥品配置:
1.  LEVAFIX BRILLIANT RED E-BA GRAN配置:
         藥品名稱                    體積(mg/ml)
 LEVAFIX BRILLIANT RED E-           6 mg
         BA GRAN
         10% SDS                    50 ml                     Figure 2 SDS-PAGE A).99 ml的1X+ Sample Buffer + 1 ml的10%BSA。B).99 ml的1X+
2.  10%BSA稀釋配置:                                               Sample Buffer + 1 ml的Marker BSA。C).99 ml的1X+ Sample Buffer + 1 ml的Marker BSA(不
                                                              進行95℃煮沸),X=沒東西
            藥品名稱                     體積(mg/ml)
             10% BSA                    5 mg
     0.1M Na2Co3(pH:8.35)              250 ml
3.   將1、2的Solution加在一起,要Mix均勻,後面稱為Marker BSA。
4.   封一層PALAFILM,夾個防爆夾。60℃加熱大約30min – 1hr。
5.   拿起來,加入Ethanolamine(乙醇胺)1 ml再加熱10min,進行
     blocking。

                                                                                  Figure 3 SDS-PAGE by Coomassie blue
                                                                                  Land 1). Solution A(99 ml的1X+ Sample Buffer + 1 ml的10%BSA) 2 mg
                                                                                  Land 2). Solution B(99 ml的1X+ Sample Buffer + 1 ml的Marker BSA) 2 mg




Figure 1 step1~step5的圖示表示

6.   On ice,再將6X+ Sample Buffer稀釋成1X+ Sample Buffer。
7.   將要loading的Sample稀釋100X。
8.   分成3管1.5ml tube,各加入99 ml的1X+ Sample Buffer。
           A. 99 ml的1X+ Sample Buffer + 1 ml的10%BSA
           B. 99 ml的1X+ Sample Buffer + 1 ml的Marker BSA。
           C. 99 ml的1X+ Sample Buffer + 1 ml的Marker BSA(不進
              行95℃煮沸)
9.   將A、B拿去95℃加熱10min,之後開始load Sample。
                                                                 Conclusion
下表格是SDS-PAGE示意圖,A、B、C為Step8中的溶液代號。
                                                               LEVAFIX BRILLIANT RED E-BA GRAN在與BSA進行反應的時
                                                                候溫度約80℃會與60℃的Bane有所差別存在。

                                                               進行pre-stained過後的protein在要進行loading之前最好不要再進
                                                                行95℃的加熱,不然效果會減弱許多。

                                                               LEVAFIX BRILLIANT RED E-BA GRAN相較於其他顏色還說比
                                                                較穩定(例如:LEVAFIX BLUE CAGRAN、Levafix Navy CA
                                                                Gran…)所以之後的pre-stained將考慮用LEVAFIX BRILLIANT
                                                                RED E-BA GRAN來進行。
      誌     謝
  很謝謝這兩個月來鄭老師對我不厭其煩的敦敦教誨,謝謝這lab的所有學長姐很有耐心的教我們怎麼進行實驗、怎麼避免錯誤,其是宥全學長冒著我可能
把她Data弄錯的風險還讓我跟在他旁邊學習、幫忙,真的很謝謝這2個月來老師以及學長姐對我的照顧。讓我不僅僅學到科學真正的涵義,也讓我學習到怎麼
看待科學這塊領域。

More Related Content

Viewers also liked (7)

Qar tulis 3 testi
Qar tulis 3 testiQar tulis 3 testi
Qar tulis 3 testi
 
Quero saber mais...
Quero saber mais...Quero saber mais...
Quero saber mais...
 
Saowakhon01
Saowakhon01Saowakhon01
Saowakhon01
 
Karnchanaphon30
Karnchanaphon30Karnchanaphon30
Karnchanaphon30
 
Empréstimo de fundo documental
Empréstimo de fundo documentalEmpréstimo de fundo documental
Empréstimo de fundo documental
 
Nutthamon m.3 4 no.38
Nutthamon  m.3 4  no.38Nutthamon  m.3 4  no.38
Nutthamon m.3 4 no.38
 
ESKULANAK
ESKULANAKESKULANAK
ESKULANAK
 

More from 乙玄 黃 (20)

李伊婷
李伊婷李伊婷
李伊婷
 
吳譽茱
吳譽茱吳譽茱
吳譽茱
 
李欣頻
李欣頻李欣頻
李欣頻
 
吳岱穎
吳岱穎吳岱穎
吳岱穎
 
吳宗洋
吳宗洋吳宗洋
吳宗洋
 
吳存敬
吳存敬吳存敬
吳存敬
 
林亞錡
林亞錡林亞錡
林亞錡
 
賴筱芸
賴筱芸賴筱芸
賴筱芸
 
蕭煜獻
蕭煜獻蕭煜獻
蕭煜獻
 
盧星翰
盧星翰盧星翰
盧星翰
 
鄭建致
鄭建致鄭建致
鄭建致
 
鄭竹君
鄭竹君鄭竹君
鄭竹君
 
劉佩禎
劉佩禎劉佩禎
劉佩禎
 
廖建泓
廖建泓廖建泓
廖建泓
 
楊惟珶
楊惟珶楊惟珶
楊惟珶
 
黃姿瑜
黃姿瑜黃姿瑜
黃姿瑜
 
黃乙玄
黃乙玄黃乙玄
黃乙玄
 
曾律萍
曾律萍曾律萍
曾律萍
 
麥瑞浩
麥瑞浩麥瑞浩
麥瑞浩
 
陳麗如
陳麗如陳麗如
陳麗如
 

洪昆瑨

  • 1. Generation Pre-stained Molecular Weight Marker 長榮大學生物科技系 實習單位:國立成功大學醫學院生物化學暨分子生物學研究所 指導老師:鄭宏祺 老師 實習學生:洪昆瑨 Abstract 思考是否有什麼方法 Lab 可以自己製造。經過文獻的搜尋之後我們找到了一篇就是製造pre-stained 的相關文獻,於是我們可以遵循相似步驟來試試看。在實際應用中 至少需要loading多少protein才可看得清楚,而將各個marker混在一起後在gel中是否很正常的分開。就是染劑的這些官能基會與蛋白質的氨基接合上,而在SDS- PAGE產生出用肉眼可以看見的band。我們在『Generation of multicolored, pre-stained molecular weight markers for gel electrophoresis』這篇文獻中找到了一些方法, 我們將遵循這篇文獻的實驗方法去進行嘗試,但是會依據我們得到的結果去進行修改與嘗試。Paper裡面提到有對溫度、pH值、染劑含量、時間等因素進行實驗以及 討論,我們也將著手從這些因素中尋找適合我們Lab製造protein Marker的製造的最佳條件。因為普遍Marker的顏色是藍色,所以一開始我原本也是要挑選藍色的染 劑來進行測試,但是我看了paper之後發覺其實紅色也是非常明顯而且搶眼,似乎非常容易辨別,因此我挑選了紅色來進行測試,溫度部分參考了paper中的60℃還有 染劑部分則是與蛋白質呈現1:1的比例,至於pH值則從8.0~8.5開始著手,蛋白質則是選擇Lab裡存量比較多的BSA來進行測試。LEVAFIX BRILLIANT RED E-BA GRAN在與BSA進行反應的時候溫度約80℃會與60℃的Bane有所差別存在。進行pre-stained過後的protein在要進行loading之前最好不要再進行95℃的加熱,不然效果 會減弱許多。LEVAFIX BRILLIANT RED E-BA GRAN相較於其他顏色還說比較穩定(例如:LEVAFIX BLUE CAGRAN、Levafix Navy CA Gran…)所以之後的 pre-stained將考慮用LEVAFIX BRILLIANT RED E-BA GRAN來進行。 protocol Result LEVAFIX BRILLIANT RED E-BA GRAN染色測試: 藥品配置: 1. LEVAFIX BRILLIANT RED E-BA GRAN配置: 藥品名稱 體積(mg/ml) LEVAFIX BRILLIANT RED E- 6 mg BA GRAN 10% SDS 50 ml Figure 2 SDS-PAGE A).99 ml的1X+ Sample Buffer + 1 ml的10%BSA。B).99 ml的1X+ 2. 10%BSA稀釋配置: Sample Buffer + 1 ml的Marker BSA。C).99 ml的1X+ Sample Buffer + 1 ml的Marker BSA(不 進行95℃煮沸),X=沒東西 藥品名稱 體積(mg/ml) 10% BSA 5 mg 0.1M Na2Co3(pH:8.35) 250 ml 3. 將1、2的Solution加在一起,要Mix均勻,後面稱為Marker BSA。 4. 封一層PALAFILM,夾個防爆夾。60℃加熱大約30min – 1hr。 5. 拿起來,加入Ethanolamine(乙醇胺)1 ml再加熱10min,進行 blocking。 Figure 3 SDS-PAGE by Coomassie blue Land 1). Solution A(99 ml的1X+ Sample Buffer + 1 ml的10%BSA) 2 mg Land 2). Solution B(99 ml的1X+ Sample Buffer + 1 ml的Marker BSA) 2 mg Figure 1 step1~step5的圖示表示 6. On ice,再將6X+ Sample Buffer稀釋成1X+ Sample Buffer。 7. 將要loading的Sample稀釋100X。 8. 分成3管1.5ml tube,各加入99 ml的1X+ Sample Buffer。 A. 99 ml的1X+ Sample Buffer + 1 ml的10%BSA B. 99 ml的1X+ Sample Buffer + 1 ml的Marker BSA。 C. 99 ml的1X+ Sample Buffer + 1 ml的Marker BSA(不進 行95℃煮沸) 9. 將A、B拿去95℃加熱10min,之後開始load Sample。 Conclusion 下表格是SDS-PAGE示意圖,A、B、C為Step8中的溶液代號。  LEVAFIX BRILLIANT RED E-BA GRAN在與BSA進行反應的時 候溫度約80℃會與60℃的Bane有所差別存在。  進行pre-stained過後的protein在要進行loading之前最好不要再進 行95℃的加熱,不然效果會減弱許多。  LEVAFIX BRILLIANT RED E-BA GRAN相較於其他顏色還說比 較穩定(例如:LEVAFIX BLUE CAGRAN、Levafix Navy CA Gran…)所以之後的pre-stained將考慮用LEVAFIX BRILLIANT RED E-BA GRAN來進行。 誌 謝 很謝謝這兩個月來鄭老師對我不厭其煩的敦敦教誨,謝謝這lab的所有學長姐很有耐心的教我們怎麼進行實驗、怎麼避免錯誤,其是宥全學長冒著我可能 把她Data弄錯的風險還讓我跟在他旁邊學習、幫忙,真的很謝謝這2個月來老師以及學長姐對我的照顧。讓我不僅僅學到科學真正的涵義,也讓我學習到怎麼 看待科學這塊領域。