1. USA:
Livingston, NJ
Europe:
Barcelona, Spain
Oxford, UK
Hamburg, Germany
Asia:
Kobe, Japan
South America:
Lima, Peru
Preimplantation Genetic
Diagnosis
SSaannttiiaaggoo MMuunnnnéé

2. RReepprrooggeenneettiiccss sseerrvviicceess
• CCLLIIAA aanndd NNYYDDHH aapppprroovveedd llaabboorraattoorryy..
• AApppprrooxxiimmaatteellyy 11//33 ((115500 cceenntteerrss)) ooff UUSS PPGGDD ccaasseess
• >>2200,,000000 PPGGDD ccyycclleess ppeerrffoorrmmeedd
• PPGGDD SSeerrvviicceess::
-- 2244--cchhrroommoossoommee aannaallyyssiiss bbyy aarrrraayy CCGGHH
-- ttrraannssllooccaattiioonnss bbyy FFIISSHH oorr aarrrraayy CCGGHH
-- ggeennee ddeeffeeccttss bbyy PPCCRR oorr SSNNPP aarrrraayy
-- BBllaassoottccyysstt bbiiooppssyy aanndd vviittrriiffiiccaattiioonn tteeaacchhiinngg
• PPGGDD ppoorrttaall ffoorr tthhee eelleeccttrroonniicc mmeeddiiccaall rreeccoorrddss ooff eeIIVVFF

3. HHiigghh rraatteess ooff
CChhrroommoossoommee aabbnnoorrmmaalliittiieess

4. TThhee mmaajjoorriittyy ooff eemmbbrryyooss wwiitthh ‘‘ggoooodd’’
mmoorrpphhoollooggyy aarree cchhrroommoossoommaallllyy aabbnnoorrmmaall
% chromosomally
abnormal embryos
56%
Maternal age
Morphology:
embryos analyzed: 6054. Morphologically normal embryos: 33775511.. SSoouurrccee:: MMuunnnnéé eett aall.. 22000077..
SSiimmiillaarr rreessuullttss aallssoo ffoouunndd bbyy MMuunnnnee eett aall 11999955,, MMaarrqquueezz eett aall.. 22000000,, MMaaggllii eett aall.. 22000077..

5. PPGGDD
HHyyppootthheessiiss
PPGGDD mmaayy iimmpprroovvee AARRTT oouuttccoommee iinn wwoommeenn ooff aaddvvaanncceedd mmaatteerrnnaall aaggee
Munné et al. (1993)

6. Despite llaarrggee ssttuuddiieess iinnddiiccaattiinngg tthhee
aaddvvaannttaaggeess ooff aanneeuuppllooiiddyy ssccrreeeenniinngg,, tthhee
nnoottiioonn tthhaatt PPGGSS ffoorr iinnffeerrttiilliittyy iiss bbeenneeffiicciiaall iiss
nnoott yyeett sshhaarreedd uunniiffoorrmmllyy..

7. CCoonnttrraaddiiccttiinngg PPGGDD rreessuullttss
uussiinngg ddaayy 33 bbiiooppssyy aanndd FFIISSHH
Positive effect
Gianaroli et al. 1999
Munne et al 1999
Gianaroli et al 2001a
Gianaroli et al. 2001b
Munne et al. 2003
Gianaroli et al. 2004
Munne et al. 2005
Munne et al 2006
Verlinsky et al. 2005
Colls et al. 2007
Garrisi et al. 2009
Rubio et al. 2009
No effect (small)
Werlin et al. 2003
Jansen et al. 2008
Mersereau et al. 2008
Scholcraft et al. 2009
No effect (Large)
Staessen et al. 2004
Platteau et al. 2005
Negative effect
Mastenbroek et al. 2007
Hardarson et al. 2008

8. CCoonnttrraaddiiccttiinngg PPGGDD rreessuullttss
uussiinngg ddaayy 33 bbiiooppssyy aanndd FFIISSHH
Proposed explanations:
1)Mosaicism
2)Self-correction of abnormal embryos
3)Sub-optimal PGD and biopsy methods

9. MMoossaaiicciissmm

10. MMoossaaiicciissmm pprroodduucceess <<77%% mmiissddiiaaggnnoossiiss
592 embryos found abnormal by PGD were rreeaannaallyyzzeedd aanndd ffoouunndd ttoo bbee::
nnoorrmmaall 1133
mmoossaaiicc <<4499%% aabbnnoorrmmaall 2277
mmoossaaiicc 5500--9999%% aabbnnoorrmmaall 112244
mmoossaaiicc 110000%% aabbnnoorrmmaall 229977
hhoommooggeenneeoouussllyy aabbnnoorrmmaall 113311
CCoollllss eett aall.. ((22000077))
3[13]1[16]2[18]1[21]3[22] 1[13]1[16]1[18]1[21]1[22]
1[13]1[16]2[18]2[21]1[22]
2[13]1[16]2[18]2[21]2[22]
1[13]1[16]2[18]2[21]1[22]
3[13]1[16]2[18]1[21]3[22]
2[13]1[16]2[18]1[21]1[22]
1[16] 2[13]2[16]2[18]2[21]2[22]
2[13]3[18]1[21]1[22]
66..88%%

11. CClliinniiccaall mmiissddiiaaggnnoossiiss
The FISH eerrrroorr ooff tthhee aassssaayy ttrraannssllaatteess iinnttoo aa
cclliinniiccaall mmiissddiiaaggnnoossiiss rraattee ooff 00..55%%
NNEEGGAATTIIVVEE PPRREEDDIICCTTIIVVEE VVAALLUUEE:: 9999..55%%
- DDaattaa ffrroomm >>15500 IIVVFF cceenntteerrss rreeffeerrrriinngg ttoo RReepprrooggeenneettiiccss
- 100 aanneeuuppllooiidd aabboorrttiioonnss ooff 214488 iimmppllaanntteedd ffeettuusseess
-- AAvveerraaggee mmaatteerrnnaall aaggee == 337 yyeeaarrss

12. sseellff--ccoorrrreeccttiioonn mmyytthhss

13. TTrriissoommyy ccoorrrreeccttiioonn iiss rraarree:: UUPPDD eevviiddeennccee
UUNNIIPPAARREENNTTAALL DDIISSOOMMYY::
aa ttrriissoommyy ccoorrrreeccttiioonn ccrreeaatteess aa zzyyggoottee wwiitthh 22 cchhrroommoossoommeess ooff oonnee ppaarreenntt,,
nnoonnee ooff tthhee ootthheerr ((ttrriissoommyy rreessccuuee)).. TThheeoorreettiiccaall cchhaannccee :: 11//33
EEXXAAMMPPLLEE TTRRIISSOOMMYY 1155::
PPrrooggnnoossiiss iiss eetthhaall bbeeccaauussee ooff iimmpprriinnttiinngg
TTrriissoommyy 1155 iinn cclleeaavvaaggee ssttaaggee eemmbbrryyooss:: 11..887744%% aa
UUPPDD--1155 iinn nneewwbboorrnnss:: 00..000011%% bb
EEssttiimmaatteedd ccoorrrreeccttiioonn ooff ttrriissoommyy 1155 ttoo UUDDPP:: 11//33 cc
TTrriissoommyy 1155 ddaayy 33 eemmbbrryyooss tthhaatt sseellff--ccoorrrreecctteedd:: 11..887744 xx 00..000011 // 33 == 00..5566%%
aa:: MMuunnnnee eett aall.. ((22000044)),, bb:: FFrroomm:: OOMMIIMM,, cc:: 33 XX UUPPDD

14. FFeettuuss sseellddoomm sseellff ccoorrrreecctt::
iitt’’ss tthhee ppllaacceennttaa tthhaatt bbeeccoommeess aabbnnoorrmmaall
This work questions the assumption that placental confined mosaicism
is the result of fetal self-correction. At the contrary, it suggests that
normal fetuses may develop abnormal placenta.

15. SSuubb--ooppttiimmiizzaall mmeetthhooddss
((FFIISSHH ssttuuddiieess,, ddaayy 33 bbiiooppssyy))

16. OOppttiimmaall PPGGSS mmeetthhooddss
OOppttiimmaall PPGGSS QQuueessttiioonnaabbllee PPGGSS
BBiiooppssyy mmeeddiiaa wwiitthh aammiinnooaacciiddss ssiimmppllee mmeeddiiaa
BBiiooppssyy ttiimmee // eemmbbrryyoo 1 mmiinn >> 55 mmiinn
## cceellllss bbiiooppssiieedd oonnee ttwwoo
FFiixxaattiioonn mmeetthhoodd CCaarrnnooyy’’ss TTwweeeenn 200
## cchhrroommoossoommeess tteesstteedd ≥≥88 £66
## aannaallyyssttss // ccaassee 2 1
UUssee ooff NNRRRR** yyeess nnoo
LLaarrggee eexxppeerriieennccee yyeess nnoo
EErrrroorr rraattee <<100%% 100--5500%%
NNuummbbeerr ooff zzyyggootteess >>55 £ 55
*NRR: No result rescue, or re-testing of dubious chromosome with different probes.

17. PPGGDD ffoorr AAMMAA:: rraannddoommiizzeedd ssttuuddiieess
11.5%
17.1%
CONTROL 2-CELLS
BIOPSIED
Staessen et al (2004)
Implantation
Staessen et al. (2004):
- No significant differences
- But 2 cells biopsied

18. “ The data presented here clearly indicates that two cell
biopsy significantly impacts clinical outcome. Our
previous report providing no arguments in favor of PGS
(Staessen et al., 2004) was criticized by others arguing
that PGS might have been beneficial if only one cell had
been removed (Cohen et al., 2007). In respect to the
present findings, this criticism seems justified”.
P < 0.001
TTwwoo cceellll bbiiooppssyy iiss ddeettrriimmeennttaall

19. PPGGDD ffoorr AAMMAA:: rraannddoommiizzeedd ssttuuddiieess
MMaasstteennbbrrooeekk eett aall.. ((22000077))
11)) 2200%% ooff ccyycclleess uunnddiiaaggnnoosseedd ((lliitteerraattuurree:: 11--33%% ooff eemmbbrryyooss **))
22)) 5599%% iimmppllaannttaattiioonn rreedduuccttiioonn dduuee ttoo bbiiooppssyy::
iimmppllaannttaattiioonn
5599%% rreedduuccttiioonn
CCoonnttrrooll 1144..77%%
BBiiooppssiieedd,, nnoo PPGGDD 66..00%%
BBiiooppssiieedd aanndd PPGGDD 1166..88%%
33)) AAvveerraaggee nnuummbbeerr ooff eemmbbrryyooss aannaallyyzzeedd wwaass oonnllyy 55
44)) CChhrroommoossoommeess 1155 aanndd 2222 ((2211%% aabbnnoorrmmaalliittiieess)) nnoott aannaallyyzzeedd
* 1% Gianaroli et al. (2004), 3.1% Colls et al. (2007)

20. EErrrroorr rraattee sshhoouulldd bbee <<1100%%
Analysis of remaining cceellllss ooff eemmbbrryyooss pprreevviioouussllyy aannaallyyzzeedd bbyy PPGGDD::
ssttuuddyy tteecchhnniiqquuee eerrrroorr rraattee
BBaaaarrtt eett aall 22000044 FFIISSHH 5500..00%%
LLii eett aall.. 22000055 FFIISSHH 4400..00%%
GGlleeiicchheerr eett aall.. 22000099 FFIISSHH 1155--2200%%
MMuunnnnee eett aall.. 22000022 FFIISSHH--99 77..22%%
CCoollllss eett aall..,, 22000077 FFIISSHH--99 44..77%%
MMaaggllii eett aall.. 22000077 FFIISSHH--99 33..77%%
MMuunnnnee eett aall.. 22001100 aarrrraayy CCGGHH 11..88%%

21. NNeeww aapppprrooaacchh ttoo PPGGDD::
• 2244 cchhrroommoossoommee aannaallyyssiiss bbyy
aarrrraayyss
• BBllaassttooccyysstt bbiiooppssyy aanndd
vviittrriiffiiccaattiioonn

22. DDiiffffeerreenntt ssttrraatteeggiieess ffoorr
AAnnaallyyzziinngg aallll cchhrroommoossoommeess
• G Comparative Geennoommee HHyybbrriiddiizzaattiioonn ((CCGGHH))
• SSiinnggllee NNuucclleeoottiiddee PPoollyymmoorrpphhiissmm ((SSNNPP)) aarrrraayy
• AArrrraayy CCGGHH ((aaCCGGHH))

23. CCGGHH aanndd aarrrraayy CCGGHH

24. CCoommppaarraattiivvee GGeennoommee
HHyybbrriiddiizzaattiioonn ((CCGGHH))
TTeesstt DDNNAA NNoorrmmaall DDNNAA
NNoorrmmaall TTrriissoommyy MMoonnoossoommyy
Kallioniemi et al. (1992), applied to single cells by Wells et al. (1999)

25. AArrrraayy CCGGHH
Test
DNA
Normal
DNA
2700 probes
Same band resolution as karyotype

26. 46,XY

27. 47,XY+2

28. 44,XY-9-17

29. aaCCGGHH aaddvvaannttaaggeess
• AAllll 2244 cchhrroommoossoommee ttyyppee ooff aanneeuuppllooiiddiieess ddeetteecctteedd
• RReessuullttss iinn 2244 hhoouurrss;; aalllloowwss ffoorr PPBB oorr ddaayy 33 bbiiooppssyy
• PPaarreennttaall DDNNAA nnoott rreeqquuiirreedd:: aadd hhoocc ddeecciissiioonnss ppoossssiibbllee
• DDeetteeccttss ttrriissoommyy oorriiggiinnaattiinngg ffrroomm mmiittoottiicc eerrrroorrss oorr MMIIII
mmeeiioottiicc eerrrroorrss wwiitthhoouutt ccrroossssiinngg--oovveerr ((SSNNPP aarrrraayy mmaayy nnoott))
• UUsseedd iinn >>1155,,000000 ppaattiieennttss wwiitthh mmeennttaall rreettaarrddaattiioonn

30. DDeetteeccttiioonn ooff aabbnnoorrmmaalliittiieess::
aaCCGGHH ddeetteecctteedd 5500%% mmoorree aabbnnoorrmmaalliittiieess tthhaann FFIISSHH--1122 aanndd 2200%%
mmoorree aabbnnoorrmmaall eemmbbrryyooss ((CCoollllss eett aall.. 22000099))
46,XY-10 +16
aaCCGGHH vvss FFIISSHH--1122
Detectable by FISH

31. aaCCGGHH vvaalliiddaattiioonn:: nnoo rreessuullttss
EEmmbbrryyooss uunnddiiaaggnnoosseedd::
bbiiooppssyy oonn ddaayy 33:: 22%% ((1166//772244))
bbiiooppssyy oonn ddaayy 55:: >>22%% ((00//5544))
MMeetthhoodd:: BBlluueeggnnoommee aarrrraayy,, SSuurreepplleexx aammpplliiffiiccaattiioonn..

32. aaCCGGHH vvaalliiddaattiioonn:: eerrrroorr rraattee
• VVaalliiddaattiioonn mmeetthhoodd 11:: ssiinnggllee cceellllss ffrroomm cceellll lliinneess aannaallyyzzeedd**
EErrrroorr rraattee iinn eeuuppllooiidd cceellll lliinneess:: 00//99
EErrrroorr rraattee iinn aanneeuuppllooiidd cceellll lliinneess:: 00//4422
• VVaalliiddaattiioonn mmeetthhoodd 22:: RReeaannaallyyssiiss ooff tthhee rreesstt ooff tthhee eemmbbrryyoo
bbyy FFIISSHH wwiitthh 1199 cchhrroommoossoommeess pprroobbeess****
EErrrroorr rraattee ffrroomm ddaayy 33 bbiiooppssiieess:: 11..88%% ((11//5566))
** MMaammaass eett aall ((ssuubbmmiitttteedd)),, **** GGuuttiieerrrreezz eett aall.. ((ssuubbmmiitttteedd))

33. aaCCGGHH rreessuullttss oonn ddaayy 33:: vvaalliiddaattiioonn ddaattaa
CCeellllss ffrroomm tthhee ssaammee eemmbbrryyoo::
XXOO,, ++22,, --44pp,, ++1111,, --1133,, --1188,, --2222
XXXX,, --22,, --44pp,, ++44qq3311,, --1133,, --1188,, --2222
XXXXXX,, ++22,, --44pp,, --44qq3311,, ++1111,, --1133,, --1188,, --2222
XXOO,, ++22,, ++44pp,, --44qq3311,, --1111,, --1133,, --1188,, --2222
Who said
mosaicism
was a FISH
artifact?

34. DDaayy 33 bbiiooppssyy,, ddaayy 55 ttrraannssffeerr
aanndd aarrrraayy CCGGHH
CCyycclleess ppeerrffoorrmmeedd:: 115511
MMaatteerrnnaall aaggee ((aavv..)) 3377..22
PPrreeggnnaannccyy RRaattee OOnnggooiinngg PPrreeggnnaannccyy RRaattee
PPeerr CCyyccllee PPeerr EETT PPeerr CCyyccllee PPeerr EETT
CCoonnttrrooll 3388%% 3388%% 3311%% 3311%%
PPGGDD 4466%% 5599%% 4422%% 5544%%
NNSS << 00..000011 NNSS << 00..000011
** EExxppeecctteedd ffrroomm eeaacchh cceenntteerr SSAARRTT ddaattaa,, ccoonnttrroolllleedd bbyy aaggee
DDaattaa ffrroomm 2244 cceenntteerrss.. MMuunnnnéé eett aall.. ((22001100)) PPGGDDIISS,, aanndd uunnppuubblliisshheedd ddaattaa

35. CCGGHH oonn bbllaassttooccyysstt bbiiooppssiieess::
WWhhyy??
Advantages:
1) More DNA: More robust diagnosis
2) Eliminates some mosaic embryos
3) Reduces error rate
4) Reduced impact of embryo biopsy
5) Less embryos to process
6) Facilitates single embryo transfer
7) Uterine environment optimized after thaw

36. EEffffeecctt ooff eemmbbrryyoo vviittrriiffiiccaattiioonn aanndd
RReeppllaacceemmeenntt oonn nneexxtt ccyyccllee

37. CCGGHH oonn bbllaassttooccyysstt bbiiooppssiieess::
CClliinniiccaall rreessuullttss ((22))
• AAvveerraaggee aaggee 3377..77
• AAvv.. PPrreevviioouuss ffaaiilleedd ccyycclleess:: 22..44
• AAvveerraaggee ## bbllaassttooccyyssttss:: 66..44
• NNoorrmmaall bbllaassttooccyyssttss:: 5522%%
• 9999..33%% ssuurrvviivvaall aafftteerr ffrreeeezzee//tthhaaww
SScchhoooollccrraafftt eett aall.. ((iinn pprreessss))

38. CCGGHH oonn bbllaassttooccyysstt bbiiooppssiieess::
PPrreelliimmiinnaarryy cclliinniiccaall rreessuullttss
CCyycclleess MMaatt.. PPrreevv.. eemmbbrryyooss iimmppllaanntt.. oonnggooiinngg
aaggee ffaaiilleedd rreeppllaacceedd ((++ ssaacc)) pprreegg..
ccyycclleess
CCGGHH :: 4455 3377..77 22..44 22..00 6677%% 7799%%
ccoonnttrrooll :: 111133 3377..11 11..22 22..77 2288%% 6600%%
pp==00..00000033
SScchhoooollccrraafftt eett aall.. ((iinn pprreessss))

39. CCGGHH oonn bbllaassttooccyysstt bbiiooppssiieess::
IImmppllaannttaattiioonn iiss iinnddeeppeennddeenntt ooff aaggee
90
80
70
60
50
40
30
20
10
0
30-34 35-38 39-42 43-45
implantation rate
per replaced
embryo
aneuploidy rate
cycles with all
embryos abnormal
Patients <43 who are eligible for blastocyst transfer have a
>95% change of having normal embryos available for transfer

40. CCGGHH oonn bbllaassttooccyysstt bbiiooppssiieess::
CCoonncclluussiioonnss oonn ppiilloott ssttuuddyy
• Pregnancy rates were above those for controls ffoorr aallll aaggee ggrroouuppss
•HHoowweevveerr,, pprreeggnnaannccyy rraatteess wweerree lloowweerr ffoorr oollddeerr ppaattiieennttss dduuee ttoo
tthhee iinnccrreeaasseedd ffrreeqquueennccyy ooff ccyycclleess wwiitthh nnoo eeuuppllooiidd eemmbbrryyooss..
• CChhrroommoossoommaallllyy nnoorrmmaall eemmbbrryyooss ffrroomm oollddeerr ppaattiieennttss hhaavvee aa
ssiimmiillaarr cchhaannccee ooff pprroodduucciinngg aa cchhiilldd aass tthhoossee ddeerriivveedd ffrroomm
yyoouunngg ppaattiieennttss..
• SSppoonnttaanneeoouuss aabboorrttiioonn rraatteess wweerree rreedduucceedd ffoorr aallll ppaattiieennttss,,
iinncclluuddiinngg tthhoossee wwiitthh aa hhiissttoorryy ooff mmuullttiippllee mmiissccaarrrriiaaggee

41. CCGGHH oonn bbllaassttooccyysstt bbiiooppssiieess::
RReemmaaiinniinngg qquueessttiioonnss
• CCaann tthhee rreessuullttss oobbttaaiinneedd iinn tthhee ccuurrrreenntt ssttuuddyy bbee rreepplliiccaatteedd iinn aa rraannddoommiizzeedd
ccoonnttrroolllleedd ttrriiaall??
• HHooww mmuucchh ooff tthhee oobbsseerrvveedd bbeenneeffiitt iiss dduuee ttoo ttrraannssffeerr iinn aa ssuubbsseeqquueenntt ccyyccllee??
AAnn RRCCTT iiss ccuurrrreennttllyy bbeeiinngg ccoonntteemmppllaatteedd iinn tthhee UUKK
• AAnneeuuppllooiiddyy eexxppllaaiinnss ‘‘ssoommee’’ ooff tthhee ddeecclliinnee iinn IIVVFF ssuucccceessss wwiitthh aaddvvaanncciinngg
mmaatteerrnnaall aaggee.. WWhhaatt eexxppllaaiinnss tthhee rreemmaaiinnddeerr??
UUtteerriinnee rreecceeppttiivviittyy ffaaccttoorr mmaayy bbee iinnvvoollvveedd
• What patient groups will benefit tthhee mmoosstt ffrroomm tthhiiss ttyyppee ooff ssccrreeeenniinngg??
YYoouunngg ppaattiieennttss mmaayy bbeenneeffiitt,, ppaarrttiiccuullaarrllyy iinn ccoouunnttrriieess wwhheerree ssiinnggllee eemmbbrryyoo
ttrraannssffeerr iiss mmaannddaattoorryy

42. PPGGDD ffoorr ttrraannssllooccaattiioonnss
aanndd 2244 cchhrroommoossoommee
aabbnnoorrmmaalliittiieess

43. aaCCGGHH ffoorr ttrraannssllooccaattiioonnss aanndd
2244 cchhrroommoossoommee aanneeuuppllooiiddyy
Patient: 46,XY,t(3;11)(q22.2;q23.3)

44. CCoommppaarriissoonn ooff
ddiiffffeerreenntt aapppprrooaacchheess

45. aaCCGGHH vvss.. SSNNPP aarrrraayyss:: GGeennoommee ccoovveerraaggee
# of probe genome
probes size covered
aCGH 4,000 x 150,000 kb = 600.0 Mb (25%)
SNPs 300,000 x 50 kb = 1.5 Mb (>0.1%)

46. aaCCGGHH vvss.. SSNNPP aarrrraayyss:: RReessoolluuttiioonn
More resolution, more counseling nightmares:
In pre-natal diagnosis the minimum resolution reported
is 20 MB: Smaller abnormalities are not well
understood and difficult to council
At 1.5 Kb resolution there are >300,000 CNPs described:
Difficult to differentiate a new polymorphism from an
abnormality

47. aaCCGGHH vvss SSNNPPss:: ppoollyyppllooiiddyy
• Embryos aannaallyyzzeedd wwiitthh 99--1122 pprroobbeess:: 9911,,447733
• PPoollyyppllooiidd oorr hhaappllooiidd:: 66,,660099 ((88%%))
• AAbbnnoorrmmaall eemmbbrryyooss ffuullllyy rreeaannaallyyzzeedd:: 11,,441166
• ppoollyyppllooiidd oorr hhaappllooiidd bbyy PPGGDD aanndd
ppoollyyppllooiidd oorr hhaappllooiidd aafftteerr rreeaannaallyyssiiss:: 114400
• OOff tthhee aabboovvee,, tthhaatt hhaadd oonnllyy ttrriissoommiieess:: 2277 ((2244%%))
• NNoott ddiiaaggnnoosseedd bbyy aaCCGGHH oorr CCGGHH:: 11..88%%

48. aaCCGGHH vvss SSNNPPss:: mmiittoottiicc aabbnnoorrmmaalliittiieess
• EEmmbbrryyooss aannaallyyzzeedd wwiitthh 99--1122 pprroobbeess:: 9911,,447733
• CCoommpplleexx aabbnnoorrmmaall:: 2266,,660099 ((2299%%))
• AAbbnnoorrmmaall eemmbbrryyooss ffuullllyy rreeaannaallyyzzeedd:: 11,,441166
• CCoommpplleexx aabbnnoorrmmaall bbyy PPGGDD aanndd mmoossaaiicc aanndd
nnoott aanneeuuppllooiidd aafftteerr rreeaannaallyyssiiss:: 333300 ((5522%%))
• OOff tthhee aabboovvee,, tthhaatt hhaadd oonnllyy ttrriissoommiieess:: 5533 ((1166%%))
• NNoott ddiiaaggnnoosseedd bbyy qquuaalliittaattiivvee SSNNPP aarrrraayy:: 33%%

49. aaCCGGHH vvss SSNNPPss
OOtthheerr SSNNPP aaddvvaannttaaggeess:: UUsseeffuullnneessss??
- OOrriiggiinn ooff aanneeuuppllooiiddyy ddeetteecctteedd 9955%% aarree mmaatteerrnnaall aannyywwaayy
- EEmmbbrryyoo ffiinnggeerrpprriinnttiinngg NNoonnee iinn SSEETT.. aaCCGGHH aallssoo ddooaabbllee
- DDiiffffeerreennttiiaatteess nnoorrmmaall // bbaallaanncceedd bbaallaanncceedd aarree ffiinnee..
>>8800%% aabbnnoorrmmaalliittiieess
OOtthheerr SSNNPP ddiissaaddvvaannttaaggeess:: PPrroobblleemm::
-RReeqquuiirreess ppaarreennttaall tteessttiinngg AAddddss ccoossttss,, ccaanncceellllaattiioonn ffeeeess,,
ppllaannnniinngg iinn aaddvvaannccee,, pprreevveennttss
aadddd oocc pprreessccrriippttiioonn,, 2200%%
ppaattiieennttss ccaanncceell

50. CCoommppaarriissoonn ooff ppllaattffoorrmmss
FFIISSHH--1122 CCGGHH aa aarrrraayy SSNNPP
pprroobbeess aa CCGGHH aa aarrrraayyss
DDaayy 33 bbiiooppssyy// ddaayy 55 rreessuullttss yyeess nnoo yyeess yyeess
PPaarreennttaall DDNNAA nneeeeddeedd nnoo nnoo nnoo yyeess
AAnneeuuppllooiidd eemmbbrryyooss ddeetteecctteedd 8899%% 110000%% 110000%% 9977%%
DDeetteecctt ggeennee ddeeffeeccttss nnoo nnoo nnoo yyeess
DDeetteecctt ppoollyyppllooiiddyy ((eerrrroorrss)) yyeess ((11..88%%)) ((11..88%% )) yyeess
DDeetteecctt MMIIII ttrriissoommiieess ww//oo ccrroossssoovveerr yyeess yyeess yyeess nnoo iiff qquuaall..
DDeetteecctt mmiittoottiicc ttrriissoommiieess ((eerrrroorrss)) yyeess yyeess yyeess ((33%%))
EErrrroorr rraattee ((cceellll lliinneess aannaallyyssiiss)) 22%% 11%% 00%% dd 44%% bb
EErrrroorr rraattee ((eemmbbrryyoo rreeaannaallyyssiiss)) 77%% 88%% 22%% uunnkk
EEmmbbrryyooss wwiitthh nnoo rreessuullttss 33%% 66%% 22%% 88%% bb
IInnccrreeaasseedd iimmppllaannttaattiioonn rraattee ((ddaayy 33)) ++ nn//aa ++++ uunnkk
IInnccrreeaasseedd iimmppllaannttaattiioonn rraattee ((ddaayy 55)) uunnkk ++++++ ++++++ ++++++ cc
aaRReepprrooggeenneettiiccss ddaattaa,, bb JJoonnhhssoonn eett aall.. ((22001100)),, c Scott et al. (2010, PCRS), d Mamas et al (submitted)

51. PPGGDD ffoorr ggeennee ddeeffeeccttss
aanndd 2244 cchhrroommoossoommee
aabbnnoorrmmaalliittiieess

52. PPGGDD ffoorr ggeennee ddiissoorrddeerrss
We can do PGD for any disease with known mutation
Disease tested: Acetil Co Oxidase type I defficiency, Adrenoleucodistrophy, Alpha-thalassemia, Alport syndrome,
Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease (ADPKD), Autosomal Recesive Polycystic Kidney Disease (ARPKD),
Beta-thalassemia, Branchio-Oto-Renal syndrome (BOR), BRCA1 breast cancer predisposition, BRCA2 breast cancer
predisposition, CanavanCharcot-Marie-Tooth type IA (CMT1a), Choroideremia, Congenital adrenal hyperplasia (CAH),
Congenital neutropenia, Connexin 26 hearing loss, Cystic fibrosis, Duchenne/Becker Muscular Dystrophy (DMD),
Ectrodactyly, Ectodermal dysplasia, and Cleft lip/palate syndrome (EEC1), Fabry Disease, Familial adenomatous poliposis
coli (FAP), Familial dysautonomia, Familial intrahepatic cholestasis 2, Fanconi anemia, Fragile site mental retardation ,
Gangliosidosis type 1 (GM1), Gaucher disease, Glomuvenous malformations (GVM), Glycogen-storage disease type I
(GSD1), Glycosylation type 1C, Hemoglobin SC disease, Hemophilia A, Hemophilia B, Hereditary nonpolyposis colon
cancer (HNPCC), Hereditary pancreatitis, HLA matching Huntington disease, Hurler syndrome, Hypophosphatasia,
Incontinential pigmenti, Krabbe disease (Globoid cell leukodystrophy), Long QT syndrome, Marfan syndrome, Meckle
gruber, Metachromatic leukodystrophy (MLD), Methylmalonic aciduria cblC type (MMACHC), Myotonic Dystrophy 1,
Myotubular myopathy, Neurofibromatosis 1, Neurofibromatosis 2, Niemann-Pick Disease, Noonan syndrome,
Oculocutaneous albinism 1 (OCA1), Ornithine carbamoyltransferase deficiency (OTC), Osteogenesis Imperfecta 1, Rapp
Hodgkin ectodermal dysplasia, Retinitis pigmentosa, Retinoblastoma, Sickle Cell Anemia, Smith-Lemli-Opitz syndrome
(SLOS), Spinal bulbar muscular atrophy (SBMA), Spinal Muscular Atrophy Type 1 (SMA1), Tay Sachs, Tuberous
sclerosis 1 (TSC1), Tuberous sclerosis 2 (TSC2), Von Hippel-Lindau Syndrome (vHL), X-linked dominant Charcot–Marie–
Tooth (CMTX), etc…… (see review Gutierrez et al. (2008))

53. CCoonnvveennttiioonnaall aapppprrooaacchh ttoo PPGGDD ooff ggeennee
ddeeffeeccttss ttoo aavvooiidd AAlllleellee DDrroopp OOuutt ((AADDOO))
aaccccuurraattee
aammpplliiffiiccaattiioonn ooff
bbootthh llooccii
AADDOO aaffffeeccttiinngg
nnoorrmmaall aalllleellee
AADDOO aaffffeeccttiinngg
mmuuttaattiioonn ssiittee
MMuuttaattiioonn ssiittee
PPoollyymmoorrpphhiicc
ssiittee

54. PGD of ggeennee ddeeffeeccttss uussiinngg SSNNPP aarrrraayy KKaarryyoommaappppiinngg
Δ508
Father:
Δ508
Mother:
Slide adapted from A.Handyside
Carrier Δ508
Monosomy 11
Trisomy 21

55. EExxaammppllee:: First Clinical Application of Karyomapping for PGD
of Gaucher Disease Combined with 24 Chromosome Screening
Embryo # Gene defects Chromosome defects
5 Affected normal
7 Affected monosomy 22
8 Carrier monosomy 10, 21,22
9 Affected monosomy 22
2 unaffected Monosomy 22
10 Affected Monosomy 9,17,19,22, trisomy 14
Results confirmed by a-CGH and by PCR
Handyside A, Grifo, J, Gabriel A, Thornhill A, Griffin D, Ketterson K, Prates R,
Tormasi S, Fischer J, Munné S (2010) PGDIS

56. CCoonncclluussiioonnss

57. CCoonncclluussiioonnss:: cchhrroommoossoommee aabbnnoorrmmaalliittiieess
-- AAggee aanndd mmoorrpphhoollooggyy aarree ppoooorr iinnddiiccaattoorrss ooff
aanneeuuppllooiiddyy
- LLeessss tthhaann 5500%% ooff ggoooodd mmoorrpphhoollooggyy ddaayy 33 eemmbbrryyooss
aanndd lleessss tthhaann 6600%% ooff bbllaassttooccyyssttss aarree nnoorrmmaall iinn
ppaattiieennttss >>3355
- SSeelleeccttiinngg ffoorr eeuuppllooiidd eemmbbrryyooss sshhoouulldd iimmpprroovvee AARRTT
oouuttccoommee

58. CCoonncclluussiioonnss:: FFIISSHH ssttuuddiieess
impro Studies with improvveedd rreessuullttss ddiiffffeerr ffrroomm tthhoossee tthhaatt sshhooww
nnoo iimmpprroovveemmeenntt iinn tthhaatt::
11)) RReedduuccee bbiiooppssyy ddaammaaggee ((11 cceellll,, eexxppeerriieennccee,, bbllaasstt?))
22)) LLooww eerrrroorr rraattee ((ffiixxaattiioonn,, NNRRRR,, 22 aannaallyyzzeerrss))
33)) AAnnaallyyzzee 1166,,1155,,2211,,2222 cchhrroommoossoommeess ++ ≥≥44 mmoorree
44)) EExxtteennssiivvee eexxppeerriieennccee
55)) AApppprroopprriiaattee ppooppuullaattiioonn ((≥≥55 eemmbbrryyooss,, ≥≥ 3355 yy.. oolldd))

59. CCoonncclluussiioonnss:: aarrrraayy CCGGHH
- BBllaassttooccyysstt bbiiooppssyy ++ CCGGHH ++ vviittrriiffiiccaattiioonn sshhoowwss vveerryy hhiigghh
iimmppllaannttaattiioonn rraatteess ((7722%%,, aavv.. AAggee 3388))..
- AArrrraayy CCGGHH aanndd ddaayy 55 bbiiooppssyy wwiillll pprroodduuccee ssaammee rreessuullttss
- AArrrraayy CCGGHH aanndd ddaayy 33 bbiiooppssyy iimmpprroovveess rreessuullttss wwhheenn
nnoorrmmaall eemmbbrryyooss aarree aavvaaiillaabbllee..
- AAddddiittiioonnaall vviittiirriiffccaattiioonn sstteepp mmaayy ssttiillll bbee aaddvvaannttaaggeeoouuss

60. CCoonncclluussiioonnss:: ggeennee ddeeffeeccttss aanndd
2244 cchhrroommoossoommee aannaallyyssiiss
- SSiinnggllee ggeennee ddeeffeeccttss aanndd 2244 cchhrroommoossoommee aannaallyyssiiss ccaann
bbee ddeetteecctteedd ssiimmuullttaanneeoouussllyy ffoorr ccoouupplleess ccaarrrriieerrss ooff ggeennee
ddeeffeeccttss..
- IItt rreeqquuiirreess ppaarreennttaall tteessttiinngg..

61. IInntteeggrraattiioonn wwiitthh eIVF

62. AAddvvaannttaaggeess ((11)) eIVF
- RReedduuccee ttiimmee ooff ffoorrmm--ffiilllliinngg ttoo aa ffeeww cclliicckkss::
ppaattiieenntt ddeemmooggrraapphhiiccss,, ccyyccllee pprrooggrreessss,, PPGGDD rreessuullttss,,
ffoollllooww uupp,, aauuttoommaattiiccaallllyy aacccceesssseedd bbyy IIVVFF cceenntteerr aanndd
RReepprrooggeenneettiiccss

63. AAddvvaannttaaggeess ((22)) eIVF
- MMiinniimmiizzee tthhee rriisskk ooff mmiissmmaannaaggiinngg ppaattiieennttss::
TTrraannssllooccaattiioonnss aanndd ggeennee ddeeffeeccttss pprreeppaarraattiioonnss,, bbiilllliinngg,, ……

64. AAddvvaannttaaggeess ((33)) eIVF
- Access ttoo tthhee aaggggrreeggaattee ddaattaa ooff RReepprrooggeenneettiiccss,, ddee--
iiddeennttiiffiieedd bbyy ppaattiieenntt aanndd cceenntteerr,, wwiitthh ssttaannddaarrdd qquueerriieess
aanndd aacccceessss ttoo tthhee rraaww ddaattaa..
EExxaammppllee:: OOuutt ooff tthhee 2200,,000000 PPGGDD ccyycclleess ppeerrffoorrmmeedd bbyy
RReepprrooggeenneettiiccss,, wwhhaatt iiss tthhee pprrooppoorrttiioonn ooff nnoorrmmaall
eemmbbrryyooss iinn aa ppaattiieenntt 4433 yyeeaarrss oolldd?? 1177%% ((nn == 334455))
……wwiitthh aann EE22 bbeettwweeeenn 88 aanndd 1100…….. eettcc

65. FFiieellddss ttoo cchhoooossee::
- AAggee bbyy 11 yyeeaarr oorr bbyy SSAARRTT ggrroouuppss ((ddrroopp lliisstt))
- ssttiimm pprroottooccooll ((ddrroopp lliisstt))
- IICCSSII oorr IIVVFF
- ppiicckk EE22 lleevveell ((cchhoossee rraannggee))
- nnuummbbeerr ooff eeggggss ((cchhoossee rraannggee))
- nnuummbbeerr ooff zzyyggootteess ((cchhoossee rraannggee))
- zzyyggoottee ppmm ssttaaggee ((cchhoossee rraannggee))
- nnuummbbeerr ooff bbllaassttooccyyssttss((cchhoossee rraannggee))
- mmoottpphhoollooggyy ggrraaddee oonn ddaayy 33 ((cchhoossee rraannggee))
- mmoottpphhoollooggyy ggrraaddee oonn ddaayy 55 ((cchhoossee rraannggee))
- nnuummbbeerr ooff ddaayy 33 eemmbbrryyooss ooff ggrraaddee XX ((cchhoossee rraannggee))
- nnuummbbeerr ooff ddaayy 55 eemmbbrryyooss ooff ggrraaddee XX ((cchhoossee rraannggee))
- IICCMM ggrraaddee ((cchhoossee rraannggee))
- ttrroopphheeccttooddeerrmm ggrraaddee ((cchhoossee rraannggee))
- ## ooff pprreevviioouuss mmiissccaarrrriiaaggeess ((cchhoossee rraannggee))
- ## ooff pprreevviioouuss ffaaiilleedd ccyycclleess ((cchhoossee rraannggee))
- ## ooff pprreevviioouuss ccoonncceeppttiioonnss tthhaatt wweerree cchhrroommoossoommaallllyy aabbnnoorrmmaall ((00,, >>00))
- PPGGDD iinnddiiccaattiioonn ((ddrroopp lliisstt))
- PPGGDD tteesstt ((ddrroopp lliisstt))
- pprreeggnnaannccyy rraattee ooff cceenntteerrss iinncclluuddeedd iinn tthhee qquueerryy ((cchhoossee rraannggee))
eIVF
OOuuttccoommee::
- %% ooff ccyycclleess wwiitthh tthheessee cchhaarraacctteerriissttiiccss oouutt ooff tthhee ttoottaall
- %% nnoorrmmaall eemmbbrryyooss
- %% aanneeuuppllooiidd eemmbbrryyooss
- %% ootthheerr aabbnnoorrmmaall eemmbbrryyooss
- iimmppllaannttaattiioonn rraattee ppeerr ppiicckk uupp
- iimmppllaannttaattiioonn rraattee ppeerr ttrraannssffeerr
- pprreeggnnaannccyy rraattee ppeerr ppiicckk uupp
- pprreeggnnaaccyy rraattee ppeerr ttrraannssffeerr
- mmiissccaarrrriiaaggee rraattee
- %% mmiissccaarrrraaiiggeess cchhrroommoossoommaallllyy aabbnnoorrmmaall
- ttaakkee hhoommee bbaabbyy rraattee
- cceenntteerr rraannkkiinngg ccoommppaarreedd ttoo ootthheerr nnoonn iiddeennttiiffiieedd cceenntteerrss

66. SSaannttiiaaggoo MMuunnnnéé,, PPhhDD,, DDiirreeccttoorr
JJaaccqquueess CCoohheenn,, PPhhDD,, DDiirreeccttoorr
UUSSAA
PPeerree CCoollllss,, PPhh..DD
DDaaggaann WWeellllss,, PPhh..DD
GGeeoorrggee PPiieecczzeenniikk,, PPhh..DD
CCrriissttiinnaa GGuuttiiéérrrreezz,, PPhh..DD
JJoorrggee SSaanncchheezz,, PPhhDD
JJoohhnn ZZhheenngg,, MMDD
TToommaass EEssccuuddeerroo,, MMSS
KKeellllyy KKeetttteerrssoonn,, MMSS
JJiillll FFiisscchheerr,, MMSS
JJeessssiiccaa VVeeggaa,, MMSS
TTiimm SScchhiimmmmeell
SSaasshhaa SSaaddoowwyy
SSoopphhiiaa TToorrmmaassii
NN--nneekkaa GGooooddaallll
RReennaattaa PPrraatteess
PPiieeddaadd GGaarrzzoonn
LLaauurriiee FFeerrrraarraa
BBeekkkkaa SSeelllloonn--WWrriigghhtt
MMaarriiaa FFeellddhhaauuss
mmuunnnnee@@rreepprrooggeenneettiiccss..ccoomm
wwwwww..rreepprrooggeenneettiiccss..ccoomm
SSppaaiinn
MMiirreeiiaa SSaannddaalliinnaass,, MMSS
CCaarrlleess GGiimméénneezz,, PPhhDD
CCééssaarr AArrjjoonnaa,, MMSS
AAnnaa JJiimméénneezz,, PPhhDD
EElleennaa GGaarrcciiaa,, MMSS
JJaappaann
TTeettssuuoo OOttaannii,, MMDD
MMuurriieell RRoocchhee
MMiihhoo MMiizzuuiikkee
UUKK
DDaaggaann WWeellllss,, PPhhDD
EEllppiiddaa FFrraaggoouullii,, PPhhDD
SSaammeerr AAllffaarraawwaattii,, MMSS
MMiicchhaalliiss KKoonnssttaannttiinniiddiiss
SSoouutthh AAmmeerriiccaa
PPaauull LLooppeezz
LLuuiiss AAllbbeerrttoo GGuuzzmmaann
GGeerrmmaannyy
KKaarrsstteenn HHeelldd,, MMDD