this slide describes biomedical informatics and usage of it. fields of biomedical informatics and some softwares were explained here that you can get general information about this science. In the future the research will be unmanned so all health care staff should know what biomedical informatics is.

1. Subject : biomedical informatics
Author : soheil farajollahi
Professor : morteza zaker

2. ‫بیوانفورماتیک‬ ‫تعریف‬
‫رشته‬ ‫چند‬ ‫دانشی‬ ‫پزشکی‬ ‫انفورماتیک‬ ‫دانش‬‫ایست‬‫که‬‫تمام‬ ‫ترکیب‬ ‫از‬
،‫نگهداری‬ ،‫آوری‬ ‫جمع‬ ‫آنها‬ ‫اولیه‬ ‫هدف‬ ‫که‬ ‫است‬ ‫شده‬ ‫تشکیل‬ ‫علومی‬
‫است‬ ‫وسالمت‬ ‫پزشکی‬ ‫علوم‬ ‫حوزه‬ ‫در‬ ‫اطالعات‬ ‫پردازش‬ ‫و‬ ،‫تحلیل‬.‫این‬
‫وطراحی‬ ‫کامپیوتر‬ ‫علوم‬ ‫مانند‬ ‫دانش‬ ‫از‬ ‫مختلفی‬ ‫های‬ ‫رشته‬ ‫شامل‬ ‫علوم‬
‫اطالعات‬ ‫دانش‬ ،‫افزار‬ ‫نرم‬‫شناخت‬‫شناسی‬‫،مهندسی‬‫مهندسی‬ ،‫نیاز‬
‫و‬ ‫کامپیوتر‬ ‫و‬ ‫انسان‬ ‫ارتباطات‬....‫گردد‬ ‫می‬".

3. ‫بیوانفورماتیک‬ ‫مهم‬ ‫های‬ ‫زمینه‬
1)‫تحلیل‬‫های‬ ‫توالی‬‫ژنوم‬:
‫در‬‫برای‬ ‫آمده‬ ‫دست‬ ‫به‬ ‫توالی‬ ‫یک‬ ‫آیا‬ ‫که‬ ‫شود‬ ‫می‬ ‫بررسی‬ ‫زمینه‬ ‫این‬
‫یک‬DNA‫در‬‫خیر‬ ‫یا‬ ‫هست‬ ‫ژن‬ ‫یک‬ ‫ی‬ ‫برگیرنده‬.‫دارد‬ ‫وجود‬ ‫اگر‬
‫ی‬ ‫زنجیره‬ ‫کجای‬ ‫در‬DNA‫قرار‬‫و‬ ‫دارد‬‫آنزیم‬‫یا‬‫پروتئنی‬‫می‬ ‫کد‬ ‫که‬
‫می‬ ‫ایفا‬ ‫حیاتی‬ ‫فرآیندهای‬ ‫یا‬ ‫سلول‬ ‫در‬ ‫نقشی‬ ‫چه‬ ‫کند‬‫کند‬
2)‫بعدی‬ ‫سه‬ ‫ساختار‬ ‫بینی‬ ‫پیش‬‫پروتئین‬:
‫و‬ ‫فضایی‬ ‫شکل‬ ‫به‬ ‫زیادی‬ ‫بستگی‬ ‫پروتئین‬ ‫بزرگ‬ ‫های‬ ‫مولکول‬ ‫کاربرد‬
‫دارد‬ ‫ها‬ ‫آن‬ ‫بعدی‬ ‫سه‬ ‫ساختار‬.‫می‬ ‫که‬ ‫هایی‬ ‫پروتئین‬ ‫عملکرد‬ ‫با‬ ‫ها‬ ‫ژن‬
‫کنند‬ ‫می‬ ‫اعمال‬ ‫را‬ ‫خود‬ ‫نقش‬ ‫سازند‬.‫کامل‬ ‫شناخت‬ ‫ی‬ ‫الزمه‬ ‫بنابراین‬
‫ها‬ ‫پروتئین‬ ‫کامل‬ ‫شناخت‬ ، ‫ها‬ ‫ژن‬‫است‬
‫توالی‬ ‫روی‬ ‫از‬ ‫پروتئین‬ ‫بعدی‬ ‫سه‬ ‫ساختار‬ ‫تعیین‬ ‫برای‬ ‫مهم‬ ‫اصل‬ ‫دو‬
‫دهند‬ ‫می‬ ‫ارائه‬ ‫ای‬ ‫جداگانه‬ ‫روش‬ ‫کدام‬ ‫هر‬ ‫که‬ ‫دارد‬ ‫وجود‬ ‫آن‬:
•‫پروتئین‬‫پیدا‬ ‫هم‬ ‫به‬ ‫شبیه‬ ‫فضایی‬ ‫شکل‬ ، ‫مشابه‬ ً‫ا‬‫نسبت‬ ‫توالی‬ ‫با‬ ‫ها‬
‫کنند‬ ‫می‬(.‫های‬ ‫توالی‬ ‫یافتن‬ ‫برای‬ ‫جو‬ ‫و‬ ‫جست‬‫مشابه‬)
•‫شکل‬‫انرژی‬ ‫سطح‬ ‫حداقل‬ ‫به‬ ‫که‬ ‫است‬ ‫ای‬ ‫گونه‬ ‫به‬ ‫مولکول‬ ‫فضایی‬
‫برسد‬(‫و‬ ‫فیزیک‬ ،‫شیمی‬ ‫قوانین‬ ‫از‬ ‫استفاده‬‫ترمودینامیک‬)

4. 3)‫ژنوم‬ ‫سطح‬ ‫در‬ ‫کارکردی‬ ‫تحلیل‬:
‫با‬‫چون‬ ‫مسائلی‬ ،‫کالستربندی‬ ‫و‬ ‫پیشرفته‬ ‫آماری‬ ‫های‬ ‫روش‬ ‫کارگیری‬ ‫به‬
‫تعامل‬ ‫نحوه‬ ‫تحلیل‬ ، ‫سلول‬ ‫در‬ ‫ژن‬ ‫هزاران‬ ‫فعالیت‬ ‫میزان‬ ‫همزمان‬ ‫بررسی‬
‫در‬ ‫یافته‬ ‫جهش‬ ‫سلول‬ ‫هزاران‬ ‫خصوصیات‬ ‫تحلیل‬ ‫و‬ ‫پروتئین‬ ‫زیادی‬ ‫تعداد‬
‫اند‬ ‫شده‬ ‫حل‬ ‫واحد‬ ‫آن‬.‫کارکردی‬ ‫شناسی‬ ‫ژنوم‬ ‫بخش‬ ‫این‬ ‫به‬ ‫مربوط‬ ‫دانش‬
‫و‬ ‫نقش‬ ‫بینی‬ ‫پیش‬ ‫توان‬ ‫می‬ ‫زمینه‬ ‫این‬ ‫در‬ ‫مهم‬ ‫دستاوردهای‬ ‫از‬ ‫و‬ ‫دارد‬ ‫نام‬
‫نام‬ ‫را‬ ‫پروتئینی‬ ‫های‬ ‫داده‬ ‫آنالیز‬ ‫به‬ ‫نیاز‬ ‫بدون‬ ‫سلول‬ ‫در‬ ‫ها‬ ‫ژن‬ ‫کارکرد‬
‫برد‬.
4)‫داده‬ ‫های‬ ‫پایگاه‬ ‫مدیریت‬ ‫و‬ ‫ایجاد‬‫ای‬:
‫در‬ ‫پایگاه‬ ‫طریق‬ ‫از‬ ‫باید‬ ‫مولکولی‬ ‫شناسی‬ ‫زیست‬ ‫در‬ ‫شده‬ ‫تولید‬ ‫های‬ ‫داده‬
‫گیرد‬ ‫قرار‬ ‫پژوهشگران‬ ‫اختیار‬.‫داده‬ ‫صحت‬ ‫از‬ ‫اطمینان‬ ‫حصول‬ ‫ی‬ ‫نحوه‬
‫های‬ ‫پایگاه‬ ‫کنندگان‬ ‫اداره‬ ‫مشکالت‬ ‫از‬ ‫ها‬ ‫داده‬ ‫مفید‬ ‫نمایش‬ ‫چگونگی‬ ‫و‬ ‫ها‬
‫هستند‬ ‫بیوانفورماتیکی‬ ‫بزرگ‬.
5)‫فرآیندهای‬ ‫و‬ ‫ریاضی‬ ‫سازی‬ ‫مدل‬‫حیات‬
‫های‬ ‫ارگانیسم‬ ‫سازوکار‬ ‫کامل‬ ‫درک‬ ‫بیوانفورماتیک‬ ‫مهم‬ ‫اهداف‬ ‫از‬ ‫یکی‬
‫است‬ ‫مولکولی‬ ‫سطح‬ ‫در‬ ‫زنده‬.‫کنند‬ ‫می‬ ‫تالش‬ ،‫هدف‬ ‫این‬ ‫تحقق‬ ‫برای‬
‫آن‬ ‫سازی‬ ‫پارچه‬ ‫یک‬ ‫با‬ ‫و‬ ‫کرده‬ ‫سازی‬ ‫شبیه‬ ‫را‬ ‫سلولی‬ ‫خاص‬ ‫فرآیندهای‬
‫برسند‬ ‫کامل‬ ‫سلول‬ ‫یک‬ ‫به‬ ‫ها‬.

5. ‫استفاده‬ ‫مورد‬ ‫های‬ ‫افزار‬ ‫نرم‬
(1Gene Runner
(2Primo
(3Modeller
(4Snap Gene
(5RNAhybrid
(6MicroMeasure
(7AutoDock

6. ‫بیوانفورماتیک‬ ‫های‬ ‫کاربرد‬
‫سلولي‬ ‫و‬ ‫مولکولي‬ ‫شناسي‬ ‫زیست‬
‫ژنتیک‬
‫تکامل‬ ‫و‬ ‫تکاملي‬ ‫علوم‬‫نژادي‬
‫نظیر‬ ‫بیوتکنولوژي‬ ‫مختلف‬ ‫هاي‬ ‫حوزه‬:‫داروسازي‬ ‫صنایع‬
‫نانو‬ ،‫،میکروبیولوژي‬‫بیوتکنولوژي‬
‫کشاورزي‬
‫و‬ ‫زیست‬ ‫مدیریت‬‫اکولوژي‬
‫پزشکي‬
‫دارو‬ ‫کشف‬
‫طراحي‬‫و‬ ‫پروتئین‬ ‫سازي‬ ‫مدل‬ ‫کمک‬ ‫با‬ ‫مناسب‬ ‫داروهاي‬
‫آن‬ ‫واکنش‬
‫تشخیص‬‫ها‬ ‫بیماري‬
‫شناسایي‬‫بیماري‬ ‫ژنتیک‬ ‫علل‬‫ها‬
‫بیماري‬ ‫مدیریت‬‫ها‬
‫شناسي‬ ‫جنین‬

7. ‫بیوانفورماتیک‬ ‫رشته‬ ‫انداز‬ ‫چشم‬
‫احتماالت‬ ‫و‬ ‫آمار‬ ،‫ریاضی‬ ،‫اطالعات‬ ،‫کامپیوتر‬ ‫علوم‬ ‫بکارگیری‬
‫زیست‬ ‫مسائل‬ ‫درک‬ ‫و‬ ‫حل‬ ‫در‬‫مولکولی‬
‫مولکولی‬ ‫دانش‬ ‫در‬ ‫عظیم‬ ‫خال‬ ‫نمودن‬ ‫پر‬

8. ‫منابع‬
1)‫کتاب‬:Introduction to bioinformatics
‫نویسنده‬:Teresa Attwood, David Parry-
Smith
2)‫سایت‬:‫علوم‬ ‫دانشگاه‬ ‫نوین‬ ‫های‬ ‫فناوری‬ ‫دانشکده‬
‫اصفهان‬ ‫پزشکی‬
3)‫سایت‬:‫دانشگاه‬ ‫پزشکی‬ ‫انفورماتیک‬ ‫گروه‬‫علوم‬
‫پزشکی‬‫مشهد‬
4)‫دانشگاه‬ ‫پزشکی‬ ‫زیست‬ ‫و‬ ‫سالمت‬ ‫انفورماتیک‬ ‫مجالت‬
‫کرمان‬ ‫پزشکی‬ ‫علوم‬

9. ‫تشکر‬ ‫با‬