Документ рассматривает концепцию открытых данных и их применение в биологической сфере, с акцентом на значимость машиночитаемых форматов и лицензий. Приведены примеры ресурсов и платформ, таких как облако связанных открытых данных и каталоги открытых данных, которые поддерживают открытую науку и биоинформатику. Также упоминаются стартапы и мероприятия, способствующие развитию открытых данных в биологии.

1. Открытые данные
и их применение
в биологии
Радченко Ирина Алексеевна
доцент, кандидат технических наук
@iradche
http://iradche.ru
http://DataDrivenJournalism.ru
http://about.me/Irina.Radchenko
Конференция "Big Data for Biology and Medicine"
Москва, 30.06.2014

2. Что такое открытые данные?
Источник:
http://opendefinition.org/

3. Определение открытых данных:
открытые лицензии
и машиночитаемые форматы

4. Мировое движение
за открытые данные

5. Эволюционирование веба

6. Модель открытости данных
по Тиму Бернерсу-Ли
Источники: http://5stardata.info/, http://www.w3.org/DesignIssues/LinkedData.html

7. Облако связанных открытых данных
(Linked Open Data)

8. Единый хаб открытых данных
Источник: http://datahub.io/

9. Каталог открытых данных на
портале открытых данных США
Источник: http://www.data.gov/

10. Каталог открытых данных
Источник: http://datos.fundacionctic.org/sandbox/catalog/faceted/

11. Хаб открытых данных
Источник: http://hubofdata.ru

12. Облако связанных открытых данных
(Linked Open Data)

13. Linked Open Drug Data
Источник: http://www.w3.org/wiki/images/c/c5/HCLSIG
$2009_Triplification_Challenge_-_LODD.pdf

14. Портал связанных открытых данных
по химической биологии
Источник: http://bio2rdf.org/

15. Биоинформатическая платформа
для визуализации данных Cytoscape
Источник: http://www.cytoscape.org/

16. Biophenome Linked Open Databases
Источник: http://biolod.org/

17. Semantic Web Health Care and Life
interest group
Источник: http://www.w3.org/blog/hcls/

18. Стартапы на открытых
биологических данных
Источник: http://www.betakit.com/dna-data-startup-cofounded-by-montrealers-
raises-2-million-from-a16z-others/

19. Semantic Web Applications and Tools
for Life Sciences Hackathon
Источник: http://www.ukoln.ac.uk/events/devcsi/life-sciences-hackdays/
index.html

20. Рабочая группа
по Открытой науке
(Open Science Working group)
Источник: http://ru.okfn.org/wg/openscience/

21. h8p://www.slideshare.net/iRadche
h8p://iRadche.livejournal.com/
h8ps://www.facebook.com/iRadche
@iRadche
Вопросы?
h8p://iRadche.ru
h8p://about.me/Irina.Radchenko
h8p://DataDrivenJournalism.ru