Mata kuliah Rekayasa Tanaman II membahas metode pemuliaan tanaman dan sistem dalam memuliakan suatu tanaman dengan tujuan membantu mahasiswa menerapkan metode pemuliaan untuk menghasilkan kultivar unggul. Mata kuliah ini diampu oleh 12 dosen dan meliputi berbagai topik seperti sumber variasi genetik, sistem reproduksi tanaman, seleksi, dan metode pemuliaan berbagai jenis tanaman.