Standar ISO 9001, HACCP, dan ISO 22000 memiliki perbedaan dalam model sistem, lingkup, dan penerapannya. ISO 22000 merupakan standar terintegrasi yang mencakup persyaratan ISO 9001 dan HACCP sehingga memiliki biaya sertifikasi dan pemeliharaan yang lebih rendah dibandingkan dengan sertifikasi terpisah antara ISO 9001 dan HACCP.