Lin t. brandal, bredscreening pcr, smitteverndagene 2018
•
0 likes•127 views
Foredrag
Recommended
Recommended
More Related Content
More from Folkehelseinstituttet
More from Folkehelseinstituttet (20)
Lin t. brandal, bredscreening pcr, smitteverndagene 2018
- 1. Lin Thorstensen Brandal, lin.thorstensen.brandal@fhi.no Seniorforsker Avdeling for smitte fra mat, vann og dyr Bredscreening PCR Hva fanger vi opp og hva mister vi?
- 2. Disposisjon • Bredscreening PCR – Hva er det og hvem gjør det? – Hva fanger vi opp? – Hva mister vi? • Hvordan påvirker dette overvåkingen og smittevernet? – EHEC-tilfeller – Yersiniose • Bredscreening PCR – Fordeler – Utfordringer
- 3. Bredscreening PCR • Hver fecesprøver undersøkes for en rekke ulike smittestoff i én og samme polymerase kjede reaksjon (PCR) https://www.cdc.gov/
- 4. Medisinske mikrobiologisk laboratorier • 21 primærlaboratorier i Norge • 5-7 av disse benytter bredscreening PCR for deteksjon av de enteropatogene bakteriene
- 5. Mikrobiologisk fecesundersøkelse Salmonella Campylobacter Shigella Yersinia Vibrio E. coli Virus Parasitter Alltid Ved indikasjoner Bredscreening PCR: Undersøkes alle fecesprøver for «alt» G. Kapperud Tradisjonelt:
- 6. Meldingskriterier MSIS • Endret 1. april 2017 – Campylobakteriose – Yersiniose – Salmonellose – Shigellose – Tarmpatogene E. coli MSIS Åpner for å melde på nukleinsyre-/ PCR-positivt funn https://www.fhi.no/publ/2017/meldingskriterier-for-sykdommer-i-msis/
- 7. Hva fanger vi opp? • PCR mer sensitiv enn dyrkning • Alle fecesprøver screenes for «alt» • Målgen i PCR avgjørende – ail fanger opp både patogene og apatogene Yersinia enterocolitica • Stamme innsendt til Referanselaboratoriet, karakterisert som patogen eller apatogen • MSIS.no vises kun tilfellene med patogene Yersinia – ipaH skiller ikke Shigella og enteroinvasiv E. coli (EIEC) • Stamme innsendt til Referanselaboratoriet for å skille disse • MSIS.no vises kun tilfeller med verifiserte Shigella • PCR-positivt, men dyrkningsnegativt funn – hvordan tolke dette klinisk og smittevernmessig? – shiga toksin (stx) positiv PCR (EHEC) – ail positiv PCR (Yersinia enterocolitica) • Flere tilfeller med mer enn ett smittestoff påvist Bredscreening PCR Flere tilfeller påvises
- 8. Hva mister vi? • Patogener som ikke fanges opp av aktuelt målgen i PCR – ail fanger ikke opp Y. pseudotuberculosis • Færre isolater sendes inn til Referanselaboratoriet – Får ikke verifisert eller detalj karakterisert funnet – Redusert overvåking og utbruddsdeteksjon Bredscreening PCR
- 9. Disposisjon • Bredscreening PCR – Hva er det og hvem gjør det? – Hva fanger vi opp? – Hva mister vi? • Hvordan påvirker dette overvåkingen og smittevernet? – EHEC-tilfeller – Yersiniose • Bredscreening PCR – Fordeler – Utfordringer
- 10. EHEC-tilfeller meldt til MSIS 0 50 100 150 200 250 300 350 400 450 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017 Norge Ukjent Utlandet Insidens i 2017: 7,7/100.000 Antalltilfeller
- 11. Antall HUS-tilfeller stabilt 0 50 100 150 200 250 300 350 400 450 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017 Norge Ukjent Utlandet HUS 5 HUS-tilfeller i 2017 Antalltilfeller
- 12. Bredscreening PCR - EHEC 0 50 100 150 200 250 300 350 400 450 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017 Antallmeldtetilfeller År Norge Ukjent Utlandet 6 1
- 13. EHEC kontrollprøver og oppfølging • Råd om smitteverntiltak differensierer mellom høyvirulente (HUS-assosierte) og lavvirulente EHEC – Høyvirulent EHEC: 3 negative kontrollprøver – Lavvirulente EHEC: ingen kontrollprøver https://www.fhi.no/nettpub/smittevernveilederen/ Tilhører en smitterisikogruppe
- 14. Dyrkningsnegative EHEC • Mistenkt høyvirulente EHEC (stx2 og/eller stx1, BD og ≤5 år): Barn i barnehage som eksempel: – Barnet tas ut av barnehage – Tre kontrollprøver med 24 timers mellomrom – Dersom alle tre prøvene fortsatt er PCR positive, men dyrkningsnegative kan barnet returnere til barnehage. Råd om skjerpet håndhygiene gis – Ved eventuelle dyrkningsfunn, klassifiseres bakterien og følges opp på vanlig måte Forslag fra FHI
- 15. Yersiniose 0 50 100 150 200 250 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017 Antallmeldtetilfeller År Norge Ukjent Utlandet Insidens 1,3/100.000 (2017) ca 80 tilfeller kun PCR-positive (ail) Ikke inkludert 2017 MSIS åpnet for å melde på PCR-pos funn
- 16. Disposisjon • Bredscreening PCR – Hva er det og hvem gjør det? – Hva fanger vi opp? – Hva mister vi? • Hvordan påvirker dette overvåkingen? – EHEC-tilfeller – Yersiniose • Bredscreening PCR – Fordeler – Utfordringer
- 17. Bredscreening PCR • Fordeler – Raskt svar til rekvirerende lege – Høyere sensitivitet • Får et mer korrekt bilde av antall sykdomstilfeller (spesielt for agens som er vanskelig å dyrke) – Målrettet isolering av smittestoff i etterkant • Utfordringer – Påviser kun de smittestoffene metoden er designet for å detektere – PCR-positivt funn uten isolat – ingen typing – utfordring: • Overvåking • Utbruddsdeteksjon • Smittevern • Klinisk tolkning