Kerajaan Mataram Islam bermula di Kotagede, Yogyakarta pada abad ke-16. Kerajaan ini dipimpin oleh beberapa raja terkenal seperti Panembahan Senopati, Panembahan Seda Krapyak, dan Sultan Agung Hanyokrokusumo. Masyarakat Mataram menganut sistem feodal dan bergantung pada sektor pertanian, serta memiliki budaya yang dipengaruhi Islam dan Jawa.