JapanR 2013での発表資料です。Shiny-Serverに関することとか

1. Shiny-Severあれこれ
2013/12/07
Japan.R 2013＠ヤフー株式会社
和田 計也
サイバー系

2. サイバー系
はじめに
※この発表は個人の見
解であり、所属する組
織の公式見解ではあり
ません。
2013/12/07
2

3. サイバー系
自己紹介
u 和田 計也（@wdkz）
u 静岡県袋井市出身
u サイバー系企業でデータマイニングエンジニア職
u 最近はPCオーディオのベストソリューションを模索しています
u 長いことバイオ業界にいた
u バイオマーカ探索してたり
u 枯草菌の研究してたり
2013/12/07
3

4. サイバー系
いきなりですが
u皆さん、Shiny使ってますか？？
u プチBIツールとして
u BIツールで描画できないものとか
2013/12/07
4

5. サイバー系
Shinyとは？
u
Rのコーディングだけでブラウザ上で動く、まるで
javascriptで作ったような動的なアプリ(webページ)が
作れます！
u
実際に分析してる人ならこれがいかにキラーアプリかわか
ると思います。
詳細はここら辺
参考にして下さい
2013/12/07
5

6. サイバー系
Shinyアプリの配布について
u
(後述する)Shiny-Serverを利用してサーバーにデプロイ
u
@hoxo_mさん作成のOpenShinyを利用してユーザに上手
いことShinyアプリを配布
u.Netで作られてるのでWindowsマシン限定→弊社は断念
u(Mono使ってMacOSXでも動くといいなぁ)
2013/12/07
6

7. サイバー系
Shiny-Server
uShiny-Server使ってますか？？
u拠点が離れてたり
uユーザ多かったり
すると配布が困りますよね...
2013/12/07
7

8. サイバー系
Shiny-Serverとは？
u
Shinyのサーバ版(ほぼnode.js)
u
Shinyアプリをサーバにデプロイしておけば、ユーザは
ブラウザから該当のurlにアクセスすれば使える
u
アプリ配布の問題解消したね！！
2013/12/07
8

9. サイバー系
Shiny-Serverの憂鬱
uところが、複数ユーザ
の同時接続にめっちゃ
弱いという致命的な何
かがある
今やるの？
バカでしょ！！
2013/12/07
9

10. サイバー系
作者もわかってる
(Shiny-Mailing Listより)
テキスト
↓ここは大丈夫
Node.js
(Shiny-server)
R
↑ここがネック
2013/12/07
10

11. サイバー系
作者もわかってる・和訳
①Shiny-Server+Rを(複数のサーバで)プロセス起動
させて、その前にロードバランサーを立てて負荷分散する
Node.js
R
(Shiny-server)
Node.js
R
(Shiny-server)
ロードバランサー
Node.js
R
(Shiny-server)
②Shiny-Serverの後ろに複数Rプロセス起動させる
R
Node.js
(Shiny-server)
R
R
2013/12/07
11

12. サイバー系
孫さん風
やりま
しょう
2013/12/07
12

13. サイバー系
②node.jsの後ろに複数Rプロセスの場合
u
Shiny-Serverのコード(Node.js)に手を入れる必要あり
u
近いうちに@mtknnktmさんがどこかできっと発表してくれます！
R
Node.js
(Shiny-server)
R
R
この人
2013/12/07
13

14. サイバー系
①ロードバランサー的なの使う場合
u
nginxのリバースプロキシを使う
u
version1.3.13からwebsocketのリバースプロキシ対応
になったのでShiny-Serverでも使える
Node.js
(Shiny-server)
Node.js
(Shiny-server)
Node.js
(Shiny-server)
R
R
R
・処理性能
・高い並行性
・メモリ使用量の小ささ
が特長のオープンソースのWebサーバ
(Apache HTTP Serverみたいなの)
2013/12/07
14

15. サイバー系
①ロードバランサー的な
u
Shiny-ServerとRのサーバを用意(Ubuntuの場合)
#Rのインストール
これ
sudo apt-get update
sudo apt-get install r-base
Node.js
(Shiny-server)
#shinyライブラリのインストール
R
sudo su -
-c "R -e "install.packages('shiny', repos='http://cran.rstudio.com/')""
#shiny-serverのインストール
sudo apt-get install gdebi-core
wget http://download3.rstudio.org/ubuntu-12.04/x86_64/shiny-server-0.4.0.8amd64.deb
sudo gdebi shiny-server-0.4.0.8-amd64.deb
#ここに好きな名前でフォルダ作成してファイル(server.R, ui.R)を入れる
/srv/shiny-server/
今回の例だと、このShiny-Server+Rサーバを３台
用意する。AWSだったら環境構築後にAMIを保存
#confファイルはデフォルトのまま
して、そのイメージを指定してインスタンス起動
すれば良いから楽
2013/12/07
15

16. サイバー系
①ロードバランサー的な
u
nginxのリバースプロキシ用のサーバを用意(Ubuntuの場合)
これ
設定ファイルの中身
upstream app {
server aaa.aaa.aaa.aaa:3838;
server bbb.bbb.bbb.bbb:3838;
server ccc.ccc.ccc.ccc:3838;
}
#nginxのインストール
server{
listen 80;
sudo apt-get install nginx
server_name yyy.yyy.yyy.yyy;
#設定
location / {
sudo vi /etc/nginx/conf.d/
virtual.conf
proxy_pass http://app;
proxy_http_version 1.1;
proxy_set_header Upgrade $http_upgrade;
#起動
proxy_set_header Connection "upgrade";
}
sudo start nginx &
}
2013/12/07
16

17. サイバー系
できた
Shiny-Server+Rを(複数のサーバで)プロセス起動さ
せて、その前にロードバランサーを立てて負荷分散する
Node.js
(Shiny-server)
Node.js
(Shiny-server)
Node.js
(Shiny-server)
R
http://aaa.aaa.aaa.aaa:3838/your_app_name
R
http://bbb.bbb.bbb.bbb:3838/your_app_name
R
http://ccc.ccc.ccc.ccc:3838/your_app_name
http://yyy.yyy.yyy.yyy/your_app_name
2013/12/07
17

18. サイバー系
ついでに(Basic)認証も
nginxのサーバに認証機能を持たせる
これ
設定ファイルの中身
upstream app {
server aaa.aaa.aaa.aaa:3838;
server bbb.bbb.bbb.bbb:3838;
server ccc.ccc.ccc.ccc:3838;
}
#設定
sudo vi /etc/nginx/conf.d/
virtual.conf
server{
listen 80;
server_name yyy.yyy.yyy.yyy;
#Apache付属のhtpasswdコマンドで
location / {
#パスワードファイル作成
auth_basic "Restricted";
htpasswd -c /etc/nginx/.htpasswd wdkz
New password:入力(不可視)
auth_basic_user_file "/etc/nginx/.htpasswd";
Re-type new password:再入力(不可視)
proxy_http_version 1.1;
proxy_pass http://app;
proxy_set_header Upgrade $http_upgrade;
#起動
proxy_set_header Connection "upgrade";
}
sudo start nginx &
}
2013/12/07
18

19. サイバー系
ついでに(Basic)認証も_Shiny-Server側
Shiny-Server+Rのサーバは認証を通ったnginxから
のみアクセスを受け付けるようにする
これ
#Shiny-Serverの設定
sudo vi /etc/shiny-server/shiny-server.conf
Node.js
(Shiny-server)
#起動
R
sudo shiny-server &
run_as shiny;
nginxのIP
server {
listen 3838 yyy.yyy.yyy.yyy;
設定ファイルの中身
2013/12/07
location / {
site_dir /srv/shiny-server;
log_dir /var/log/shiny-server;
directory_index on;
}
}
19

20. サイバー系
その後
u
commercial versionだってー！！
node.jsの後ろに複数Rプロセス的な
2013/12/07
20

21. サイバー系
その後のその後
2013/11中旬にProのBetaサイトオープン
で、いくらなの？
なお、RStudio Server Proは1サーバ
あと数週間で価格出るって！！
2013/12/07
$9,995/yearの模様
21

22. サイバー系
その後のその後のその後(2013/12/04)
価格ｷﾀｰ
同時接続10で $9,995/server/year
100で$24,995/server/year
2013/12/07
22

23. サイバー系
その後のその後のその後(2013/12/04)
認証
スケーリング
モニタリング
2013/12/07
23

24. サイバー系
最後にスケーリングの設定を紹介(Pro)
u
フリーのは1アプリ1Rプロセスなんだけど、
Proは1アプリ複数Rプロセス使える
1アプリあた
り利用するR
プロセス数の
MAX
1Rプロセスあたり接続する数
1RプロセスのCPU使用率がこ
れ(x100)以上になったら、新
規にRプロセス起動するよ
2013/12/07
24