1. INCANTER
の紹介

2. INCANTER
の紹介
Twitter : @Mozk_
生物情報科学科 4年

3. は Clojure の上で動く
っぽい何か

4. Clojure
は Java VM の上で動く
LISPっぽい何か

5. LISPとは???
(defun local-similarity (a b) ;; a, b : sequence
(declare (optimize (speed 3) (safety 0) (debug 0)))
(let ((memo (make-hash-table :test 'equal)))
(labels ((dp (x y)
(declare (fixnum x y))
(or #1=(gethash `(,x ,y) memo)
(setf #1#
(cond ((< x 0) 0)
((< y 0) 0)
(:else (let ((diagonal-local-distance
(if (eql (elt a x)
(elt b y))
1
-1)))
(max (+ diagonal-local-distance
(dp (1- x) (1- y)))
(1- (dp (1- x) y))
(1- (dp x (1- y)))
0))))))))
(iter outer (for x from 0 below (length a))
(iter inner (for y from 0 below (length b))
(in outer (maximizing (dp x y))))))))

6. Lispははるか昔に作られた
Javaよりも昔
Cよりも昔
Fortranよりも昔
コンピュータよりも昔
人類よりも昔
地球ができるよりも昔
宇宙自体がLispプログラムであり
本物のLisperがわざわざ実装
しようとしないのも当然だ
『Lispの真実』(http://www.aoky.net/articles/leon_bambrick/lisp_truth.htm)

7. 熱狂的信者と括弧が多い言語
(defun fact (n)
(if (= n 0)
1
(* n (fact (1- n)))))

8. 前置きは終わりにして
Incanter.org からダウンロード

9. 立ち上げると

10. 立ち上げると
なんか、しょぼい・・・
おまじない：
(use '(incanter core stats charts))

11. 簡単なことから
(def r (sample-normal 1000))
(view (histogram r))
r ← rnorm(1000)
hist(r)

12. 見比べ！

13. どんどん比較
● (doc 'histogram)
● (find-doc “histogram”)
● ?hist
● ??hist

14. どんどん比較
● (dataset [“x1” “x2”]
[[1 2 3]
[4 5 6]])
● data.frame(x1 = c(1,2,3),
x2 = c(4,5,6))

15. どんどん比較
● (read-dataset “http://hoge.jp/a.csv”
:header true)
● read.table(“http://hoge.jp/a.csv”,
header = T)

16. 基本的な部分では
だいたいRと対応する
書き方がある！

17. Incanter
の利点

18. Javaとの親和性が高い！
(def output-stream
(java.io.ByteArrayOutputStream.))
(save (function-plot sin -1 1)
output-stream)

19. Javaとの親和性が高い！
(view (function-plot
#(java.lang.Math/sqrt %)
0 2))

20. 柔軟
(with-data iris
(view $data)
(view ($ [:Sepal.Length :Sepal.Width]))
(view ($ [:not :Petal.Width])))
(view ($data iris))
(view ($[:Sepal.Length :Sepal.Width] iris))
(view ($[:not :Petal.Width] iris)))

21. Clojureの純粋な拡張である
● Incanterを使ってウェブアプリ
● http://data-sorcery.org/
2009/11/29/incanter-webapp/

22. 欠点
ユーザ/パッケージが少ない

23. おわり

24. バイトでRのチュートリアル動画を作りました。
http://togotv.dbcls.jp/20111107.html