The document analyzes the tumor transcriptomics profile of a patient with stage IV gallbladder cancer. It identifies the top 200 most significantly activated expression regulators in the patient's tumor using sub-network enrichment analysis software. Key regulators identified include histone deacetylases and DNA methyltransferases. The analysis suggests treatment with the HDAC inhibitor vorinostat and discusses how activated regulators like HDACs, PDCD1, and CTLA4 may be contributing to tumor proliferation and immune evasion. Graphical summaries show pathways enriched with active regulators in the tumor related to cancer hallmarks like histone modification and immune response evasion.

1. Analysis of tumor transcriptomics profile for the
Patient with stage IV gallbladder cancer
Contents
1. NGS data normalization..................................................................................................................................................1
2. Identification of regulators responsible for differential gene expression in patient tumor................1
3. Graphical summaries of findings from analysis tumor transcriptomics profile.......................................2
HDACs activation causes NFkB inhibition, activation of cell cycle and inhibition of apotosis................2
PDCD1 protein is activated in patient tumor .............................................................................................................2
CTLA4 protein is activated in patient tumor..............................................................................................................3
Cancer Hallmarks pathways enriched with active expression regulators in patient tumor ........................3
Deacetylases Activation in Histone Deacetylation in Cancer ...............................................................................4
Methylases in Histone Methylation Cancer.................................................................................................................5
Table 1. List of top 200 statistically significant activated expression regulators identified by sub-
network enrichment analysis (SNEA) in Pathway Studio..........................................................................................6
1. NGS data normalization
NGS RNAseq tumor transcriptomics profile was generated by Genoanalytica, Moscow Russia. RPKM
values for every gene measured in tumor sample were normalized on transcriptomics profile from
three samples of normal gallbladder from publicly available GSE132223 data from National Cancer
Institute (NCBI): M3-741_tpm, M3-760_tpm, M3-817_tpm
2. Identification of regulators responsible for differential gene
expression in patient tumor
Normalized NGS RNAseq tumor transcriptomics profile was imported into Pathway Studio software
from Elsevier to determine expression regulators upstream of the differentially expressed genes
using sub-network enrichment analysis option “What proteins regulate expression of entities
enriched in the input data?”. The list of identified top 200 significant most active regulators is shown
in Table 1. Among top most active regulators 5 were found to be histone deacetylases (HDACs).
Overexpression of histone deacetylase 2 predicts unfavorable prognosis in human gallbladder

2. carcinoma (Du, 2013), HDAC1 promoted migration and invasion binding with TCF12 by promoting
EMT progress in gallbladder cancer (He, 2016). Because it was shown that Zolinza inhibits
proliferation of galdbladder carcinoma cells (Yamaguchi, 2010) we suggest using HDAC inhibitors for
treatment. Zolinza from Merck USA is the most studied and safe HDAC inhibitor on the market.
HDAC activation enables tumor proliferation through suppression of cell cycle inhibitors CDKNs and
through evasion of immune response by down-regulation of NFkB. Other proteins found active in the
tumor is PDCD1 and CTLA4 (Table 1). Activation of these proteins provides additional mechanism
for suppression of immune response. PDCD1 is the target of immunotherapy drugs Opdivo, Keytruda.
CTLA4 is the target of immunotherapy drugs Tremelimumab and Yervoy.
3. Graphical summaries of findings from analysis tumor
transcriptomics profile.
Red proteins – activated expression regulators in tumor according to SNEA in Pathway Studio. Blue
proteins - inhibited expression regulators in tumor according to SNEA in Pathway Studio. Tumor
transcriptomics analysis has revealed profound down-regulation of inflammatory cytokines and their
receptors in the tumor, which is likely due to down-regulation of NFkB family of transcription factors.
HDACs activation causes NFkB inhibition, activation of cell cycle and inhibition of apoptosis.
Suberoylanilide hydroxamic acid is a chemical name of Zolinza.

3. PDCD1 protein is activated in patient tumor
CTLA4 protein is activated in patient tumor
Cancer Hallmarks pathways enriched with active expression
regulators in patient tumor
Collection of Cancer Hallmarks pathways is readily available in Pathway Studio. It provides
foundation for building personalized cancer mechanistic model from patient molecular profiling data.

4. Pathways below were found enriched with active expression regulators identified by sub-network
enrichment of patient tumor transcriptomics data. Red proteins – activated expression regulators in
tumor according to SNEA in Pathway Studio. Blue proteins - inhibited expression regulators in tumor
according to SNEA in Pathway Studio.
Deacetylases Activation in Histone Deacetylation in Cancer
Cancer Hallmark: Hallmarks of Cancer (9) Genome Instability
Notes: Headnote: The epigenetic changes including histone acetylation/deacetylation are thought to participate in
the onset of genomic instability and progression of cancer in numerous tumor types.
Signaling description: The acetylation status of histones H3 and H4 largely determines the status of chromatin
condensation, and, consequently, gene expression. Histone acetylation is regulated by the opposing activities
of histone acetyltransferases (HATs) and histone deacetylases (HDACs). Histone acetylation conducted by HATs
removes the positive charge of the histone molecule, thus diminishing the interaction of the histone N termini
with the negatively charged DNA phosphate groups. This relaxes chromatin condensation allowing for a
greater level of gene transcription (highly condensed heterochromatin becomes transcriptionally active
euchromatin). The reverse process of chromatin condensation is conducted by HDACs. There exist four classes
of HDACs: class I consists of HDAC 1, 2, 3, and 8; class II consists of HDAC 4, 5, 6, 7, 9, and 10; class III consists
of sirtuins (SIRT 1-7); and class IV consists of HDAC 11, which have features of both class I and II HDACs. HDAC
2, 4, SIRT 1, 6, 7 may be mutated in cancer. HDAC 1, 2, 3, 6, 7, 8, SIRT 1 and 7 may be overexpressed in cancer,
SIRT 4 and 6 may be down-regulated.
Outcome effects: Deregulation of HDACs creates an impairment of histone acetylation and chromatin
remodeling leading to oncogenic progression. An extensive number of HDAC inhibitors are developed and
explored in clinical trials showing anti-tumor activities. The most extensively studied HDAC inhibitors target
class I and or II, and a separate set of inhibitors target class III HDACs (sirtuins).

5. Methylases in Histone Methylation Cancer
Cancer Hallmark: Hallmarks of Cancer (9) Genome Instability
Notes: Headnote: Epigenetic changes including histone methylation are now thought to participate in the onset and
progression of cancer in numerous tumor types. Methylation of specific residues in the core histones H3 and
H4 have been identified as a marker of tumor cells.
Signaling description: Histone methyltransferases (HMT) are histone-modifying enzymes, that catalyze the
transfer of one, two, or three methyl groups to lysine and arginine residues of histone proteins. The attachment
of methyl groups occurs predominantly at specific lysine or arginine residues on histones H3 and H4. According
to modern data, histone methylation can either repress or activate transcription. In general, methylation at
H3K4, H3K36, and H3K79 is associated with transcriptional activation, whereas H3K9, H3K27, and H3K20
methylation is associated with transcriptional repression. Monomethylations at H3K27, H3K9, H4K20, H3K79,
and H2BK5 are all linked to gene activation, whereas trimethylations at H3K27, H3K9, and H3K79 are linked to
repression. A number of HMTs can be mutated in cancer, including KMT2A/C/D, NSD1, WHSC1, WHSC1L1,
EZH2, PRDM1/2/12/16, MECOM. DOT1L may be activated by fusion proteins MLL-AF10, MLL-AF4, MLL-ELL.
Outcome effects: Deregulation of HMT leads to the impairment of chromatin remodeling and makes impact to
oncogenic progression.

6. Table 1. List of top 200 statistically significant activated expression
regulators identified by sub-network enrichment analysis (SNEA) in
Pathway Studio.
Regulator Activation
Score
p-
value
Total # of
targets
# of
Measured
targets
Measured Targets
NFKBI 9.9868766
35
2.4016
1E-15
400 341
SOX2;ALB;FOXD1;LIN28B;ABCC2;NOX1;BMP2;FAM3B;AGT;GCLM;MYOG;POMC;TFPI2;SLC7A2;HOXB7;D
PP4;EGLN3;ELF3;MUC4;CCNE1;ZBTB7A;DDIT3;SLC1A1;UBE2C;GCLC;METAP2;NR3C2;F11R;SDC4;S100
A9;XIAP;CYP1A1;BIRC5;CTH;ITGB8;CASR;POLDIP2;DNMT3B;ALOX15;MARVELD2;CCNA2;NFKBIB;CASP
3;BCL2L1;CCNB2;KCNIP2;PLA2G4A;CCL20;CAV2;EFNA1;RNLS;BPIFA1;EDN1;CCNB1;PDCD4;SUCNR1;C
DH2;IFNL1;SLC22A5;KL;THRA;YY1;AGER;TNFRSF11B;CD44;PIM1;TET1;FCAMR;MICA;LCN2;SLC2A1;CL
DN7;TAGLN2;MUC5AC;NFE2L2;MAP1LC3A;HPSE;MMP1;IL23A;SIRT3;MAPK8;GDF5;CDX2;BIRC2;BACE
1;LRG1;PLK1;WWTR1;CXCL1;PPP1R13L;NSD1;SETD2;WDR5;GSPT1;ERBB2;IL13;MAT2A;LGALS3;CDK
N1A;CASP9;CDKN1B;BCL2L11;F3;NGF;ITGAV;CREB1;TGFA;SP1;COQ7;MTA1;EFHD2;TJP1;BBC3;CDK2;
MIR29B1;CYP1B1;ELAVL1;JUN;KMT5C;SLC1A2;CREB3;MGMT;PARP1;ZC3H12A;GLI1;BCL3;HMOX1;ED
NRB;ADAM17;EEF2K;CDX1;CYP19A1;PTEN;MDC1;CHL1;SMAD4;SCARB1;CD40;SREBF1;PON1;NFKBIA;
CD83;ABCG2;STEAP4;CCND1;AIFM1;ABCB5;WDR35;PRDM1;CASP12;HLA-
E;MCL1;GATA3;TRPC1;VEGFA;RELA;NOD1;MMP3;AGTR1;ATF3;EPHX2;DEFB1;ABCC1;STIM2;IER3;CRP;
CAV1;PLIN2;CDC25B;PDK4;PTK2;STC1;P2RY2;SELP;SPP1;GCH1;NFKB1;CXCL8;NFAT5;ALOX15B;STIM1
;CTNNB1;MYC;PYCARD;PTX3;MADCAM1;PRDX2;HIF1A;GRM2;ATG7;YWHAZ;BECN1;LRP1;TNFRSF13C;
BAX;IRAK2;NDRG4;PLAUR;HERPUD1;CXCR4;OLR1;OPTN;WNT10B;MECP2;FBXO32;CXCL3;TGM2;BIRC
3;IL34;ABCB1;GAP43;LDLR;POU3F1;BCL2A1;LECT2;KDR;FOS;CXCR2;CD36;MMP12;CXCL2;LTA;NOD2;S
OX18;TP53;PRNP;TNF;ADAMTS1;CCL22;CTSK;CYBA;LY96;PNOC;BDNF;CSF1;KCNJ8;SNAI1;IL1RN;IL33;
GDNF;CYR61;TGFB1;ADORA2A;S100A6;PLA2G2A;ITGB1;CDH11;IL12B;TRAF1;MMP9;PTGES;IL15;TGFB
R1;TLR10;IRF1;FLT4;EGR1;AXIN2;MMP14;FAS;FGF2;AR;FOXP3;CYBB;PRF1;NOS3;NOS2;FN1;ELN;TLR4
;ASS1;GPR68;CASP1;IL10;PECAM1;PTGS2;MIR155HG;AIM2;IL1B;DIABLO;SOD2;CCL2;ABCC9;CD86;ITG
A5;CD4;CCL5;S100A4;SELE;VEGFC;CTGF;GPR84;SLC2A3;FASLG;SCN9A;ICAM1;OPRM1;HAS1;WNT5A;T
LR2;VIM;ZEB2;NANOG;TBX21;CD274;NOX4;CX3CL1;TREM1;C3;TYMP;CCR2;BDKRB2;IL6;CCL3;MIAT;C
XCL10;NFATC1;MYLK;GZMA;ACTA2;KIT;CXCL13;NR4A1;WISP1;PLAU;CXCL5;BCL2;CD69;RARRES2;HGF
;SERPINE1;PDGFRA;MMP2;MUC5B;ACTG2;IL32;VCAM1;CCL4;CD38;CFB;MIF
DNA
methyltran
sferases
7.1955042
14
7.088E
-15
287 238
CLDN6;CDHR5;AGR2;SLC44A4;HLA-
G;PRSS3;MUC13;SHH;MIR137;PRAME;GJB1;DSP;CDH1;EGLN3;MUC4;IGF2BP3;MAOA;KRT19;HES1;PPA
RG;EPHB2;FXYD3;NEUROG3;MGAT3;ACTA1;TRIM24;DUOX1;MMP10;NNAT;ABCC3;GSTP1;CYP1A1;HK2
;KLF3;BASP1;GNAQ;RARB;AGGF1;DNMT3B;CCNA2;KLF4;PHLPP1;MTUS1;NDRG1;PDCD4;HTATIP2;GSD
ME;STAT6;BCL6;KL;TRIM25;TFF3;NFE2L2;SOCS1;SOX9;PRDM2;MMP1;SPOP;CASP8;CNTFR;EGFR;PTGE
R3;CYP2D6;GAD1;PRKCE;TNFRSF12A;AIRE;KLF11;LACTB;CDKN1A;PMAIP1;NDN;PTCH1;AREG;DAPK1;
NGF;EPAS1;CHD5;NEAT1;PAWR;MAGEA11;PPP1CA;BBC3;CEP131;NFYB;TNFSF10;LEP;CYP1B1;CLU;ES
R2;FOXF2;ERRFI1;MGMT;EPHB4;CDX1;CYP19A1;HIGD1A;PTEN;ADAR;STAT3;OPCML;SYK;FMR1;ABCG
2;JAK1;ATXN2;STAT2;MLH1;MMP3;TGFBR2;ADIPOQ;PTPN6;ADARB1;DNMT1;PPP1CC;CAV1;STAT1;SU
N2;CA9;KEAP1;PRKD1;APCDD1;APP;SLCO2A1;PYCARD;TIMP2;ABCB4;RASGRF1;TNFSF11;EFEMP1;WR
N;MAGEA4;WWOX;CDKN2A;STC2;ADAMTS18;ZNF471;RASSF1;HSPA1A;PGF;DLEC1;CFTR;GABARAPL1;
FRZB;SFRP4;ACE;TNFSF4;SPN;PCDH10;EPHA3;RPRM;AKAP12;RRAD;BDNF;CD1D;AIF1;UCHL1;TAP1;IG
FBP3;TSPYL5;GUCY1A1;DLC1;STAT4;NR1I2;SLC2A4;TP73;STAT5A;RASSF2;TRAF1;MMP9;FHL1;SOCS3;
TPM1;FOXP3;LEPR;THBD;PMEPA1;SLC9A3;PRF1;NOS3;FYN;NOS2;HLA-
A;TLR4;RECK;RARRES1;PECAM1;VWF;PTGS2;EPHB3;IGFBP7;IRF8;SOD2;SPARC;CCL2;CD6;PTGER4;CD
4;FLI1;RGS10;SHFM1;TNFSF9;HAVCR2;RUNX3;S100A4;SELE;FMO3;RASSF4;IL12RB2;CTGF;RELN;ICAM
1;VIM;UGT1A1;SOD3;ITGA1;DKK3;ROBO4;CCND2;CD80;ESR1;PRDM5;PDCD1;VDR;PDLIM2;IL6;ACTA2;
COL1A1;THBS1;CIITA;PLAU;BCL2;TAGLN;SULF1;MMP2;VCAM1;CXCL12;SNRPN
histone
deacetylas
e
5.4366182
67
5.2424
7E-20
757 630
HTR2C;SOX2;CCL26;CLDN6;FOXA2;AFP;WIF1;POU4F1;FOXD1;CHST4;FGFR3;TMEFF2;HOXA11;CYP2A1
3;PRSS8;NPY;ABCC2;HLA-
G;HOXA13;KISS1;GATA4;HNF4A;ERBB3;NOX1;ALPI;TERT;PDX1;ALOX12;KLF5;BMP2;CLDN1;CEBPA;AG
T;KITLG;PRAME;GJB1;GCLM;CLDN4;MYOG;HMGA2;TH;KRT10;PRL;BCL11A;SCGB3A2;CDH1;IL22RA1;M
AGEA1;SLC7A11;BEX2;SIX3;MUC4;HPGD;NEUROD1;STX1A;HOXB13;NPPB;CCNE1;HES1;EZR;PVR;PPAR
G;EPHB2;ALDH1A1;LHB;SKP2;RAP1GAP;SEMA3A;DDIT3;ATP2B1;MMP10;SLC9A3R1;CXADR;PAX4;CDK
N2B;GSTP1;S100A9;MYBL2;G6PD;XIAP;CDC20B;TTR;IL6R;POU5F1;CYP1A1;HOXA9;ASCL1;BIRC5;CITE
D2;PIGM;HK2;CDK6;MAT1A;CTH;IGFBP1;GNAQ;ITGB8;CASR;ID1;GDF15;EZH2;RARB;SYP;ID2;ALOX15;
MEST;JUP;CCNA2;SLC6A4;CDKN1C;MICB;SRGAP1;KLF4;CASP3;BCL2L1;GLP1R;EP300;CCL20;PLA2G16;
PHLPP1;NQO1;BNIP3;ROCK1;CCNG2;NDRG1;LHX9;ATP2B4;TGFB2;BRCA1;PDGFD;EDN1;CCNB1;MUC3
A;NOX5;BRCA2;NR1H3;TFF1;LIFR;COMT;PEBP1;MIR17;NR3C1;ATF4;GAST;TXNIP;MIR25;UBE2H;RAD5
1;KRT8;MIR200A;KL;PER2;IGF1R;NR5A1;PLAGL1;CAMP;CD44;KIF2C;ABCC11;RNF148;NAT1;MICA;SLC
5A5;DIO2;REST;SFRP1;ARRDC3;LCN2;CLDN7;TBP;RAD23B;FBP1;NFE2L2;SOCS1;MAP1LC3A;DICER1;Z
MPSTE24;HPSE;HACD3;MMP1;E2F2;CASP8;CDKN2D;DPYD;CDX2;BIRC2;BID;EPHA2;CHD4;WNT4;PLK1;
EGFR;DSG1;UVRAG;MAP3K14;CXCL1;CYP2D6;GAD1;AURKB;CISH;BGLAP;ERBB2;GNRH1;E2F6;FXN;CN
OT2;BARD1;RGS2;PARK7;HPRT1;PRKCD;REN;YTHDC2;LPL;CDKN1A;PCNA;LDHB;CDKN1B;GCK;BAMBI;
ISYNA1;BCL2L11;SIRT5;F3;TLE4;AREG;DAPK1;HSP90AA1;DBP;ITGAV;KDM5B;RXRA;EPAS1;OCLN;HDA
C1;ARG2;KCNA2;CASP14;WT1;ANXA1;NPC1;MEF2A;TGFA;HCN4;FOXO4;TJP1;ZNF518B;ZFP36;BBC3;H
AMP;SIAH1;TNFSF10;MIR29B1;SDC1;GNAS;BRD8;TGIF2;CYP1B1;IFNLR1;CLU;JUN;TUBB;MYD88;SLC1A
2;SMPD3;PSIP1;SLIT2;CLDN2;HSD11B2;ERRFI1;MGMT;SMAD7;HMOX1;EPHB4;ZNF267;KMT2D;SLC12
A5;FIS1;TNFRSF10A;BMP4;GADD45A;CDX1;CYP19A1;MDM2;BAG1;PTEN;SCD;ADAR;TG;SIRT2;GJA1;RA
D52;CD40;AKT1;KDM6B;COL2A1;PTGIS;FOXO3;PGK1;NFKBIA;TP63;FMR1;APAF1;CRADD;ABCG2;CDK4
;CCND1;AIFM1;CADM1;PDGFB;KDM5C;VCL;PARP2;MCL1;GATA3;VEGFA;MLH1;LOX;MMP3;TGFBR2;MM
E;GRN;ABCG1;RPS6KA5;NDRG2;ADIPOQ;AGTR1;ATF3;PRMT1;LSS;DAB2IP;DEFB1;PTPN6;ADARB1;DHF
R;KLF2;DNMT1;SHC1;PKD1;OPRD1;TRPM8;CAV1;NME4;SLC9A6;TNFRSF10B;CLGN;RHOB;ADAMTS17;
NPTN-
IT1;UXT;UBE2I;TYMS;SCN5A;CD207;WNT7A;NR4A2;KEAP1;STC1;ABL1;APP;FPGS;SPP1;TRPM2;CXCL8;
ALPL;CTNNB1;MIR200B;MYC;FGF1;TIMP2;TSC22D3;SLC5A1;ID3;ABCA1;IFIT2;HIF1A;GRM2;AKAP5;AL
OX5;TNFRSF1A;BAK1;WWOX;CASP4;GABARAPL2;CYLD;OXTR;CDKN2A;IL24;BMP7;BAX;NDRG4;PLAUR
;TRPC6;CXCR4;WNT9B;PER1;MAP4;RASSF1;HSPA1A;GDF11;TGM2;GSN;BIRC3;EYA1;RUNX2;PAX6;ABC
B1;GAP43;LDLR;TIMP3;KDR;HBB;FOS;COLQ;HDAC7;CSF2RA;CFTR;FOSL1;GABARAPL1;CD36;NPR1;IL1
1;ERG;JAK2;IKBKB;PHB;CXCL2;TCF3;NRP1;BCL6B;GAPDH;PAX5;TP53;ANO1;TAL1;CHST11;ARNTL;ACE
;TNF;TNFSF4;RIPOR2;MS4A1;DUSP5;ADAMTS1;CD9;SPN;PAX8;SOCS2;HBA1;TAF9;SPI1;AQP1;SEMA3F;
NEDD9;AKAP12;BDNF;CD1D;HLA-
DRB1;CSF1;TAP2;SNAI1;NRP2;ABI3;UCHL1;NFIC;NOTCH1;ARC;HDC;IGFBP3;NCF2;SMARCA2;CTSB;DLC
1;STAT4;RELB;GDNF;GNAI2;TGFB1;SLC2A4;TP73;CKS1B;CFLAR;SLC6A1;SOX11;FLT1;MMP28;IL12B;M
MP9;PTGES;COL11A2;SMN1;SOCS3;SLC1A3;TGFBR1;IRF1;MEF2C;EGR1;TPM1;AQP3;MMP14;FAS;JUNB;
FGF2;LAT;AR;SOX17;MR1;COMP;FOXP3;SLC6A2;MIXL1;PREX1;ADH1B;SMN2;SFRP2;CYP46A1;CYBB;DA
B2;PRF1;NOS3;SESN3;NOS2;FN1;ANGPT1;HLA-
A;MITF;SYN1;ELN;TLR4;ATP2A3;CREM;IL10;RECK;LGALS1;VWF;SLC8A1;CD79B;PTGS2;CDH5;MT2A;E

7. PHB3;PGR;IRF8;IL1B;SOD2;CCL2;TEK;CCR5;PTGS1;CD86;PTGER4;CD4;CCL5;RGS10;KCND3;ADAM12;B
4GALNT1;CDH13;TNFSF9;CCR7;RUNX3;SPHK1;INHBA;LIF;TWIST1;CXCL9;HLA-
DRA;CTGF;G6PC;ITGAM;MX1;RELN;ICAM1;OPRM1;TIMP1;WNT5A;VIM;NCAM1;NANOG;SOD3;MSR1;BT
K;CCND2;CD80;ENPP2;TRIM22;ESR1;ZAP70;CD274;CYP7B1;NOX4;IGFBP2;RORC;CX3CL1;PTGER2;NUD
T6;THY1;PDCD1;IL6;PLAT;CXCL10;IRF9;ACTA2;COL1A1;KIT;HLA-
DQA1;THBS1;CXCL13;IGF1;CIITA;FABP5;NTRK3;NR4A1;NR4A3;CD14;WISP1;PLAU;BCL2;TAGLN;ITGB3
;COL3A1;SERPINE1;PDGFRA;MMP2;ACTG2;VCAM1;CCL4;CXCL12;ALDH1A3;MIF
ACE2 5.3970046
85
2.2419
E-14
78 66
ALB;AGT;NPHS1;CDH1;NPPB;SLC2A2;PPARG;CASP3;BCL2L1;NQO1;PRKCA;PCNA;SMAD7;HMOX1;ADA
M17;EGF;RPS3;VEGFA;AGTR1;PFN1;CAV1;TIMP2;BECN1;BAX;OLR1;LDLR;TIMP3;RCAN1;ACE;TNF;DUS
P1;CYBA;IRS2;TGFB1;SLC2A4;MMP9;SOCS3;CYBB;NOS3;NOS2;FN1;IL10;CDH5;CD81;IL1B;CCL2;KCND2
;SELE;PRKCB;G6PC;ICAM1;TIMP1;VIM;PTPRC;NOX4;IL6;COL1A1;CACNA1C;NCF1;CXCL5;BCL2;COL3A1;
MMP2;ACTG2;VCAM1;MIF
DNMT1 4.9303560
94
2.2109
2E-08
346 270
SOX2;CLDN6;WIF1;IGF2;PI3;HLA-
G;GATA4;GRM3;ATP6V1B1;PROM1;RASEF;TERT;PDX1;HOXA7;CEBPA;RAB25;PRAME;CLDN3;DDX53;N
PHS1;HOXA10;CDH1;THRB;MUC4;HPGD;DLX5;E2F1;NEUROD1;MAOA;HES1;PPARG;BIK;MET;WNT1;DU
OX1;SLC9A3R1;PAK6;CDC25C;CDKN2B;H2AFX;MYBL2;CNR1;CYP1A1;AURKA;BIRC5;BASP1;CTH;RARB;
TET3;DNMT3B;ALOX15;EPCAM;KLF4;BCL2L1;MFN2;RAC1;CCL20;OLFM4;TNFRSF10D;BNIP3;MTUS1;B
RCA1;ERO1A;PDCD4;ULK1;CDH2;BRMS1;MIR17;NR3C1;MEN1;MIR25;DNMT3A;EGFL7;KL;IGF1R;TET1;
CDKN3;SFRP1;GDF9;FBP1;PSEN1;NFE2L2;SOCS1;SOX9;PRDM2;CASP8;DPYD;DDAH2;GAD1;IL13;ACHE;
CDKN1A;DPPA2;PMAIP1;HDAC6;BCL2L11;DDX20;PTCH1;DAPK1;NGF;GINS4;EPAS1;CREB1;KCNA2;MA
GEA11;MUC1;CACNA2D2;CBY1;LEP;JUN;HDAC3;RB1;SLC1A2;FOXF2;HSD11B2;ERRFI1;CEBPD;MGMT;S
MAD7;YBX1;IL6ST;SFRP5;STARD3;GADD45A;CDX1;MDM2;BAG1;PTEN;SCD;ADAR;LATS2;SREBF1;LRIG
1;RARA;FOXO3;FHIT;NFKBIA;FMR1;CCND1;TET2;CADM1;CYP27B1;VEGFA;OGG1;MLH1;MMP3;SMARC
A4;SPRY2;DOK1;ADIPOQ;C9orf72;LEFTY2;DMRT1;RIPK3;PTPN6;ADARB1;KLF2;KCNJ10;SHC1;SERPINB
2;CDC25B;MT1F;SUN2;HAT1;HLA-
C;WNT7A;ASCL2;APP;RUNX1;ALPL;MIR200B;SLC12A2;MYC;TIMP2;ABCA1;GRM2;KCNQ1;BAK1;NTF3;C
ASP4;CDKN2A;BMP7;SLC5A8;BAX;CXCR4;TGFB3;RASSF1;TIMP3;FABP4;CHFR;CFTR;GAPDH;TMEM173;
CH25H;TP53;SFRP4;SPI1;BDNF;UCHL1;NOTCH1;DLC1;LRP8;MYOCD;SLC2A4;TP73;BTG2;CFLAR;FBLN5
;MMP9;SOCS3;TGFBR1;GPIHBP1;MIR142;FAS;AR;SOX17;FOXP3;THBD;SFRP2;SOX7;SLC9A3;NOS3;FN1;I
TGAL;WNT2;RECK;IL2RG;PTGS2;PGR;IGFBP7;IRF8;SOD2;CCL2;CD70;CD4;RGS10;TNFSF9;RUNX3;VAV1;
AXL;RELN;SCUBE2;ICAM1;WNT5A;VIM;ZEB2;NANOG;LOXL1;DKK3;CCND2;HIST1H3H;ESR1;COL5A2;T
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A2;CXCL12
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AV;OCLN;REL;SP1;NAPRT;JUN;TUBB;CCND1;VEGFA;ANGPT2;CXCL8;CTNNB1;TIMP2;HIF1A;TNFSF11;T
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3A5;TNFRSF11A;S100A9;TTR;IL6R;CYP1A1;SYP;SLC6A4;NFKBIB;BCL2L1;CP;IBSP;IFNL1;NFKBIZ;TNFR
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R;FOS;KMO;PTHLH;HMGB1;CXCL2;LTA;GLRX;CCR1;TNF;NR0B2;BDNF;CSF1;HP;PLA2G2A;FLT1;IL12B;I
TGAX;MMP9;IL15;SLC1A3;ADAMTS5;CLDN5;FOXP3;CD34;NOS2;CASP1;PTGS2;IGFBP4;IRF8;IL1B;CCL2;
CD86;TRPV1;CCL5;CCR7;SELE;LIF;VEGFC;NTRK2;ICAM1;OPRM1;TIMP1;WNT5A;TLR2;HSD11B1;FGF7;
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4
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6421);BAX;PTK2B;GAP43;LDLR;TNFRSF1B;FOS;MMP12;JAK2;CXCL2;NOD2;TNF;NR0B2;SPI1;IRS2;LY96
;SIGLEC7;NES;IL1RN;NFIC;S100B;OAS1;PTK6;TGFB1;ITGB1;MMP9;IRF1;FAS;JUNB;FOXP3;IRAK3;PRF1;
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;IL13;FXN;XRCC6;LGALS3;CDKN1A;PCNA;ADM;EPHX1;CDKN1B;F3;SLC9A1;KCNA2;TGFA;TJP1;CDK2;CY
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03
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B;SOD2;SPARC;CCL2;VEGFC;CTGF;FASLG;LOXL2;ICAM1;VIM;NCAM1;LOXL1;COL4A2;MAP2;ESR1;NOX4;
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A;CDKN1B;GCK;BAMBI;ISYNA1;ZMYND8;TADA2A;KDM5B;EPAS1;OCLN;ARG2;STMN1;SP1;CCNC;MTA1;
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R1;MBP;SLC1A2;PSIP1;CEBPD;MGMT;PARP1;SMAD7;USP7;KMT2D;RHOA;ADAM10;SLC12A5;KLF6;TNF
RSF10A;BMP4;CDX1;PTEN;STAT3;VANGL2;CDK8;SIRT2;GJA1;SMAD4;RAD52;SCARB1;SREBF1;AKT1;CO
L2A1;FOXO3;NFKBIA;LTBP1;APAF1;CRADD;ABCG2;CDK4;CCND1;AIFM1;SIN3A;MSX1;SMAD2;MCL1;GA
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FKB1;SRSF5;CXCL8;CTNNB1;MIR200B;ACTB;MYC;TSC22D3;RASGRF1;ABCA1;HIF1A;ALOX5;BAK1;STA
R;EHMT1;BMP7;BAX;GATA2;PLAUR;FBXO32;RASSF1;HSPA1A;TGM2;BIRC3;RUNX2;PAX6;ABCB1;LDLR;
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A;MITF;SYN1;TLR4;ITGAL;IL10;RECK;LGALS1;SLC8A1;PTGS2;CDH5;EPHB3;PGR;NKILA;IL1B;SOD2;CCL
2;CD70;HEPH;CD4;CCL5;RGS10;RSAD2;TLR9;RUNX3;HLA-
DRA;G6PC;PDGFRB;FGFR1;OPRM1;EEF1A1;VIM;NCAM1;NANOG;SOD3;GBP4;TBX21;CCND2;INPP5D;ES
R1;NOX4;VDR;IL6;NFATC1;KIT;HLA-
DQA1;CIITA;NR4A1;NR4A3;PLAU;BCL2;SERPINE1;PDGFRA;XAF1;VCAM1;COL1A2
SERPINA4 3.5919965
23
2.1968
9E-10
54 50
ARG1;PPARG;KLF4;TNFAIP1;ATG5;SIRT1;FOXO1;CAT;BCL2L11;F3;CCND1;VEGFA;ADIPOQ;TRADD;MYC
;HIF1A;BECN1;CDKN2A;BAX;HMGB1;TP53;TNF;CYBA;SNAI1;TGFB1;MMP9;SOCS3;FLT4;NOS3;NOS2;FN
1;TLR4;IL10;PECAM1;IL1B;SOD2;CCL2;VEGFC;ICAM1;SOD3;NOX4;BDKRB2;IL6;ACTA2;PLAU;BCL2;MRC
1;SERPINE1;MMP2;VCAM1
MIR155 3.5496478
7
4.8994
E-06
283 239
GATA4;DHCR24;RAB27B;PROM1;PLAG1;MYOG;F2;PPL;IL18;CDH1;TXNRD1;ARG1;E2F1;SOS1;METTL7
A;BRPF3;DSG2;TACSTD2;PKN2;GSTP1;POU5F1;BIRC5;RCOR1;IGFBP1;DNMT3B;GPT;VAMP3;LDOC1;SN
AP29;ROCK2;PAK1;SNX27;TXNDC12;MCM8;UFL1;TRIP13;FAR1;ULK1;PROS1;CDH2;TFAM;SYPL1;DMTF
1;CHAF1A;SH3BP4;RTKN2;DEPTOR;ILF2;NARS;SP7;PIAS1;CD44;ARFIP2;SLC30A1;DPP7;BET1;MUC5AC
;NFE2L2;DCAF7;MAP1LC3A;TRAM1;FMNL2;SCAMP1;MMP1;CASP8;MOSPD2;ATG5;CNTF;BID;KLF13;N
DFIP1;PDE3A;C1GALT1C1;UBA2;MIR99B;BGLAP;ERBB2;MARC1;DCSTAMP;LPL;LCLAT1;CDKN1A;CASP
9;RAI14;BCL2L11;NGF;FASN;REL;ARFIP1;STMN2;TJP1;BBC3;ATP6V1C1;GNA13;UBE2J1;MYO1E;WDFY
1;PHC2;PARP1;MPZL1;SYNE2;TNFRSF10A;CUL4B;DNAJC19;AMIGO2;SNCA;HSDL1;CBFB;CD40;SREBF1;
COL2A1;CD83;TBCA;NKX3-
1;RCN2;PDLIM5;ABCG2;POLD1;CCL18;SRSF2;PRDM1;NUMB;GATA3;PPP5C;SMARCA4;MME;POLE4;HBE
GF;ABCC1;DNMT1;OGN;NKRF;STK3;MSI2;XBP1;SQSTM1;CX3CR1;IFIT1;NT5E;MAP1LC3B;SPP1;STK11;
CD63;ABCA1;RAB5C;HSD17B12;BAX;CXCR4;TNNT2;OLR1;ISG15;PHF19;ACAT1;APOE;ANKFY1;KDR;GA
BARAPL1;CD36;RAB23;PLXND1;IKBKB;ZEB1;HMGB1;PAX5;GFI1;CD1D;SNAI1;IL1RN;CD200;CCL19;PR
AF2;ARL10;ABHD16A;FLT1;CYP51A1;MMP9;MED12L;PODXL;IRF1;MIR142;MEF2C;HSPE1;MMP14;FGF
2;FSCN1;PRF1;NOS2;FN1;FADS1;HLA-
A;CASP1;PECAM1;PTGS2;CD81;CXCR3;DIABLO;SPARC;CCL2;CD86;CCL5;HAVCR2;CCR7;SELE;TWIST1;V
EGFC;CXCL9;CTGF;NTRK2;CCL21;ICAM1;TIMP1;VIM;MSR1;CDK5RAP3;TBX21;CCND2;PTPRC;IFI44L;CD
80;NOX4;RORC;CX3CL1;THY1;IL6;TM6SF1;FCGR2B;CXCL10;NFATC1;ACTA2;NCF1;COL3A1;MYH11;SER
PINE1;MMP2;ACTG2;IFITM1;ICAM3;MATR3;CD68
NPPA 3.5355339
06
1.0938
8E-11
124 104
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U5F1;GPT;EDN1;PPARD;CXCL1;RGS2;REN;PCNA;CDKN1B;GCK;F3;SLC9A1;KCNA2;DUSP6;STMN1;TXN;L
EP;ACO1;HMOX1;PDCD5;TG;UCP2;CCND1;ATP2A2;MCL1;GATA3;VEGFA;ADIPOQ;KLF2;CRP;DRD1;BATF
;CACNA1B;SELP;SPP1;CTNNB1;MYC;TIMP2;HIF1A;KCNQ1;BECN1;STAR;BAX;TNNT2;CFTR;NPR1;RCAN
1;TP53;TNF;DUSP1;IL1RN;SLC27A1;NPR2;GNAI2;AQP7;TGFB1;SGK1;EGR1;AQP3;MMP14;FGF2;PDE3B;
NOS3;NOS2;IL10;PTGS2;IL1B;CCL2;SELE;PYGO1;POSTN;ITGB2;ITGAM;ICAM1;TIMP1;NANOG;TBX21;CC
ND2;ESR1;TNC;ACTA2;CACNA1C;FXYD2;BCL2;COL3A1;SERPINE1;ACTG2;VCAM1;COL1A2
MIR146A 3.4444444
44
1.0043
6E-08
144 117
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L20;PAK1;CDH2;NEFL;RAD51;NF2;GPR17;COPS2;SLC5A5;APC;MUC5AC;SOX9;SRC;IL23A;MPZ;KLF13;IL
13;PCNA;PLK2;CAT;S100A8;DMD;SOHLH2;RHEB;CHEK2;JUN;MBP;GJA1;CD40;COL2A1;EGF;FOXO3;NFK
BIA;IRF7;SMAD2;RELA;MMP3;NKRF;SPP1;CTNNB1;MMP16;BAX;HSPA1A;RUNX2;ABCB1;ZSCAN22;TIM
P3;IKBKB;ZEB1;ADAMTS1;CCL22;ATM;TLR6;CSF1;NES;SNAI1;GDNF;TGFB1;MMP9;PTGES;ADAMTS5;R
GS13;HSPE1;EGR2;FSCN1;MITF;IL10;CXCR3;CCL2;CD86;TRPV1;CD4;CCR7;SELE;ICOS;CXCL9;SLAMF1;I
TGAM;ICAM1;TIMP1;VIM;ALOX5AP;ROBO4;PTPRC;IFI44L;CD274;TLR7;CXCL10;NFATC1;ACTA2;COL1A
1;COL10A1;BCL2;MRC1;PDGFRA;ACTG2;VCAM1;CCL4;CFB;ADAMTS4;IFI27;ICOSLG
PRDM1 3.2071349 1.1264 140 106
SOX2;FOXA2;GRM3;DKK1;SHH;KRT10;NR5A2;IL18;CER1;FGF10;SIX3;CCNE1;TBX1;MYH7B;SOX6;TFAP
2C;IL6R;KLF4;GCSAM;CDC25A;SLC3A2;IL23R;STAT6;IFNL1;MAP3K5;IVL;BCL6;TFRC;ELL2;CDC6;BCAM;
SOCS1;ISL2;E2F3;CXCL1;XRCC6;CDKN1A;PMAIP1;POLD2;KDM5B;REL;BBC3;SDC1;XRCC5;PRKDC;TAPB
P;CCND1;S1PR1;SET;HNRNPLL;EOMES;XBP1;CXCL8;CTNNB1;MYC;PYCARD;IL24;F10;TCF7;FOS;CDH3;Z

9. 03 7E-07
EB1;CXCL2;CTSS;PAX5;TP53;IFIT3;UHRF1;SNAI1;MSC;NLRP12;LMO2;MAFB;SOX17;CHRD;PRF1;IL10;L
GALS1;IL7R;MIR155HG;IRF8;CCR5;CD86;CD4;CD93;RSAD2;SMAD1;CCR7;NANOG;IKZF1;TNFSF8;SPIB;T
BX21;ESR1;SLAMF7;PDCD1;IL6;ITGA4;NFATC1;SELL;CXCL13;CIITA;CXCL5;CD69;CD27;JCHAIN
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49
1.9776
2E-05
53 40
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A;RELA;MMP3;CRP;PTPN2;CXCL8;HIF1A;TNNT2;CXCL2;TP53;TNF;IL1RN;FOXP3;TLR4;IL10;IL1B;CCL2;
CD86;CCR7;XCR1;ICAM1;VIM;CD80;IL6;CXCL10;BCL2;MRC1
SIRT1 3.1304951
68
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3E-08
501 426
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ERT;PDX1;BMP2;CLDN1;MYCN;MYOG;PCSK9;TH;NPHS1;IL12A;POMC;HNF1A;BCL11A;NR1H4;IL18;CD
H1;ACE2;MSTN;IDH1;CYP8B1;MAOA;NPPB;SLC2A2;CCNE1;HES1;PPARG;ALDH1A1;NEUROG3;AGRP;SK
P2;DDIT3;MNX1;MET;HIPK2;UCP3;SREBF2;MKI67;CDKN2B;TNFRSF11A;SDC4;CIDEC;S100A9;GADD45
G;POU5F1;HOXA9;ASCL1;BIRC5;CITED2;CYCS;HK2;CDK6;IGFBP1;DGAT2;EPOR;ALOX15;KLF4;CASP3;B
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HGAP5;SERPINB1;ROCK1;CCNG2;EGLN1;MAFA;NDRG1;UBE2D4;FNDC5;EDN1;ERO1A;HYOU1;TFF1;CR
Y2;CDH2;TFAM;NPAS2;JTB;IFNL1;PPARA;ATF4;PLCB1;FOXM1;BTRC;HEY1;IVL;CCND3;KCNIP4;UNC5CL
;LPAR1;NKX6-
1;PER2;IGF1R;INSR;IMMT;TNFRSF11B;ESRRA;CPT1A;ATAT1;RICTOR;REST;SLC2A1;HSPA5;FBP1;PSEN
1;NFE2L2;NRF1;RAB7A;SOCS1;MAP1LC3A;SOX9;MMP1;IL23A;SIRT3;FZD7;PAPPA;HOMER1;BACE1;EG
FR;GLS;ACACA;DDAH2;NQO2;MTOR;BGLAP;HDAC2;TDG;EPHA6;CS;MAT2A;LPL;CDKN1A;CASP9;PCNA;
FOXO1;HDAC6;CAT;CDKN1B;ACADM;GCK;DNM1L;BCL2L11;F3;BCLAF1;OCLN;DUSP6;FASN;SP1;MTA1;
SUV39H1;ZBTB16;BBC3;TRAF2;CDK2;SLC10A2;TXN;HAMP;TNFSF10;TRA2B;CYP1B1;XPC;IDE;SIRT6;ES
R2;OXT;UTRN;CEBPD;PRDX3;PARP1;SMAD7;GLI1;HMOX1;ADAM10;ADAM17;GADD45A;CYP19A1;PTE
N;SCD;STAT3;PTPN1;UCP2;CD40;SREBF1;COL2A1;FOXO3;ADIPOR2;ABCG2;CDK4;CCND1;SIN3A;KAT5;
TPP1;ATP2A2;AHSG;RPTOR;CASP12;KAT8;DDX58;MCL1;GATA3;VEGFA;RELA;MLH1;MMP3;ABCG1;ADI
POQ;AGTR1;IGF2R;MMP7;NMNAT3;HSPB1;KLF2;DNMT1;SHC1;MDH1;CRP;NME4;TNFRSF10B;LRR1;PD
K4;SDHA;LDHA;PTK2;SQSTM1;HSPD1;CX3CR1;SCN5A;CA9;AKT2;KEAP1;IFIT1;APP;IFIH1;HDAC8;MAT
2B;SPP1;GCH1;CXCL8;NFAT5;CTNNB1;MYC;PYCARD;CRY1;EED;ABCA1;HIF1A;TNFSF11;SOD1;BECN1;C
PT2;WRN;IDH2;CDKN2A;BAX;CXCR4;OLR1;NLRC4;FBXO32;PDK1;ACAT1;HSPA1A;BIRC3;EYA1;RUNX2;
ABCB1;LDLR;TIMP3;BCL2A1;FABP4;ACACB;KDR;HEY2;MLYCD;FOSL1;CD36;MAPT;CUBN;ZEB1;HMGB1
;CSF3R;H2AFZ;LTA;COX4I1;TP53;TAL1;ARNTL;PRNP;HIVEP3;TNF;RFX5;SOCS2;DLL4;CTSK;NR0B2;CYB
A;CMD1F;IL1RL1;NAMPT;BDNF;NES;NOTCH1;IGFBP3;CCL19;RELB;CYR61;TGFB1;SLC2A4;CHI3L1;TIA
M1;CFLAR;IFITM3;PTAFR;FLT1;IL12B;ITGAX;MMP9;COL11A2;ADAMTS5;CLDN5;FOXC2;EGR1;AQP3;M
MP14;FAS;CFH;FGF2;AR;MSRA;FOXP3;THBD;CYBB;LEF1;TRPV4;NOS3;PSMB9;NOS2;FN1;ANGPT1;SYN1
;QKI;TLR4;CASP1;PTGS2;CDH5;PML;AIM2;IL1B;DIABLO;SOD2;CCL2;CD86;SELE;PRKCB;LIF;CXCL9;G6P
C;ITGAM;NTRK2;FASLG;ICAM1;TLR2;VIM;NANOG;GLI2;DLG4;TBX21;ESR1;SELPLG;NOX4;IGFBP2;RORC
;CX3CL1;TLR7;THY1;SAA1;IL6;NFATC1;GZMA;ACTA2;COL1A1;THBS1;NCF1;IGF1;NDUFA13;FGF19;NR4
A1;CD14;BCL2;MRC1;COL3A1;HGF;SERPINE1;PDGFRA;MMP2;ACTG2;VCAM1;COL1A2;CXCL12;MIF;ADA
MTS4
EZH2 3.0929011
84
1.3611
E-11
428 344
SOX2;MSMB;FOXA2;WIF1;LIN28B;SSTR1;IHH;HS6ST3;HOXA1;GATA4;DKK1;MYT1;PROM1;PDX1;HOXA
7;BMP2;CEBPA;PLAG1;MYOG;HMGA2;PITX3;CD24;SMAD9;HOXA10;PRL;CDH1;HOXB7;PTENP1;EGLN3;
NEUROD1;KRT19;HOXB13;CCNE1;HES1;PPARG;BMPR1B;STAG3;ALDH1A1;NEUROG3;HOXA5;RAP1GAP
;MET;WNT1;MSX2;HOXA2;PAK6;MKI67;CDKN2B;F11R;GATA6;CENPA;KMT2A;XIAP;POU5F1;HOXA9;CY
CS;CDK6;GDF15;RARB;ID2;EPCAM;ULBP1;CCNA2;CDKN1C;KLF4;CASP3;CCNB2;ROCK2;XPA;KRT13;MA
FA;NDRG1;GSK3A;IBSP;BRCA1;EDN1;PDCD4;SIX1;PEBP1;CDH2;PHLDA2;TXNIP;FOXM1;HEY1;RAD51;B
CL6;PER2;IGF1R;DEPTOR;SP7;CD44;TET1;OPRK1;TBX15;SFRP1;LCN2;EIF4EBP1;FBP1;APC;NFE2L2;CP
EB3;MAP1LC3A;SOX9;DICER1;PCAT1;NDC1;VAMP7;CASP8;CXXC4;MAPK3;DPYD;CDX2;ATG5;HOTAIR;K
PNB1;MTOR;ZNF804A;SATB2;BGLAP;IL13;FOXK2;RACGAP1;FRMD4B;CDKN1A;CASP9;MSH2;FOXO1;CD
KN1B;RPS6KB1;BCL2L11;AREG;PIK3CA;WT1;CDK5RAP1;TJP1;ZBTB16;TRAF2;TNFSF10;MICU1;CUL4A;
TSC2;PSMA7;SLIT2;MTA2;HSD11B2;CEBPD;CLDN23;SESN1;CYP19A1;MDM2;DCAF1;PTEN;LATS2;EAF2
;FOXO3;IFNGR1;FHIT;PSMD4;PKMYT1;NSD2;NKX3-
1;FMR1;STK4;GABPA;ABCG2;CDK4;CCND1;CADM1;VCL;TBX5;CAMKK2;CENPT;GATA3;VEGFA;MLH1;AD
CY6;ADIPOQ;ATF3;MMP7;DAB2IP;PIK3IP1;ABCC1;KLF2;DNMT1;ERN1;BMI1;SPRY4;TNFRSF10B;PDK4;
EOMES;MEIS1;BMP8B;NR4A2;CYP11A1;ATOH8;RUNX1;SPP1;CXCL8;ALPL;SORBS2;CDK20;CTNNB1;MI
R200B;MYC;TIMP2;PIP5K1C;GABPB1;ABCA1;RBM5;ATG7;BECN1;NOV;BAK1;EPB41L4A-
DT;PTPRB;STAR;CDKN2A;BAX;CXCR4;PER1;KRT81;TRAF5;FBXO32;DACT3;APOE;RUNX2;CENPC;PAX6;
ABCB1;TIMP3;FABP4;POLR3D;TBX2;HEY2;CFTR;ZNF423;IL11;MUC6;ZEB1;ENO2;DHRS4L2;NGFR;TME
M173;FOXC1;TP53;CHUK;TNF;DUSP5;ADAMTS1;PAX8;IFI16;PTH1R;KRT7;BDNF;SNAI1;NOTCH1;IGFBP
3;HDAC9;SMARCA2;NKX3-
2;SMYD3;DLC1;STAT4;LGALS9;MYOCD;TGFB1;MIR221;VASH1;RBPMS;CFLAR;TBX18;MMP9;SOCS3;IL1
5;ADAMTS5;CLDN5;MEF2C;EGR1;AXIN2;CRIP2;MMP14;FAS;AR;SOX17;EGR2;FOXP3;SFRP2;SOX7;NOS3;
FN1;NRROS;VWF;PTGS2;MAP4K1;EPHB3;PGR;IL1B;CCL2;SLFN11;CD4;TLR9;RUNX3;GLI3;IL2RB;CPEB1
;CXCL9;HLA-
DRA;AXL;RELN;WNT5A;VIM;ZEB2;OSBPL5;NANOG;ABI3BP;DLG4;DKK3;CNN1;TBX21;CCND2;CD274;F
MOD;CX3CL1;WNT10A;VDR;IL6;KLRK1;CXCL10;NFATC1;ACTA2;COL1A1;CACNA1C;THBS1;IGF1;CIITA;
BCL2;MEG3;TAGLN;COL3A1;MMP2;IRF4;CXCL12;RPS3A;ITGA2
superoxide
dismutase
3.0769355
64
1.1608
9E-07
137 118
GSTA2;NOX1;NPHS1;IL18;CDH1;CCNE1;TXN2;MET;GCLC;PROC;GDF15;ITGA3;PRKAA1;HMGCR;EDN1;P
RKAA2;CDH2;NR3C1;SLC40A1;GGT7;IGF1R;TFRC;TNFAIP1;MUC5AC;KATNB1;AHR;HPSE;MMP1;MAPK
8;CNTF;PCNA;F3;GRK2;REL;UGP2;TJP1;GRK4;CDK2;GNAS;JAG1;PRDX3;PARP1;HMOX1;CYP19A1;SLC38
A1;UCP2;VEGFA;MME;ABCG1;PDE5A;AGTR1;DRD1;GPX1;KEAP1;SELP;SPP1;CXCL8;CTNNB1;MYC;ABCA
1;HIF1A;BECN1;GPX3;NTF3;BAX;PLAUR;TRPC6;HSPA1A;ABCB1;KCNN4;KDR;FOS;CD36;TP53;TNF;MS4
A1;CYBA;F2R;NOTCH1;NCF2;TGFB1;S100A6;MMP9;FAS;AR;CYBB;NOS3;NOS2;FN1;TLR4;IL10;DEPP1;P
ECAM1;PTGS2;IL1B;SOD2;CCL2;PTGER4;KCND3;SELE;ITGB2;ITGAM;FASLG;PDGFRB;ICAM1;TIMP1;WN
T5A;TLR2;VIM;PTGER2;CCR2;IL6;PLAT;COL1A1;NCF1;BCL2;SERPINE1;VCAM1
angiotensi
n-(1-7)
3.0508510
79
3.7890
3E-06
80 72
VEGFD;TH;CDH1;ACE2;BIRC5;CASP3;NQO1;PRKCA;SMAD3;NR1H3;ATRX;KL;MAPK14;TBC1D4;EGFR;SI
RT1;REN;PCNA;F3;NGF;MEF2A;LEP;HMOX1;ADAM17;PTEN;PTPN1;MMP8;NFKBIA;VEGFA;ABCG1;ADIP
OQ;AGTR1;HSPB1;CXCL8;ABCA1;HIF1A;TNFSF11;BAX;OLR1;HSPA1A;ACE;TNF;CYBA;TGFB1;SLC2A4;N
LRP12;MMP9;FAS;SLC6A2;CYBB;NOS3;NOS2;FN1;TLR4;CASP1;IL10;IL1B;CCL2;PRKCB;SLIT3;ICAM1;TI
MP1;SOD3;ESR1;NOX4;IL6;ACTA2;NCF1;BCL2;SERPINE1;ACTG2;VCAM1
PTEN 2.9719115
17
2.2659
2E-05
325 285
MSMB;IGF2;HOXA11;APOB;GATA4;VEGFD;HNF4A;PROM1;ALPI;TERT;NEFH;CEBPA;MYCN;CLDN4;CA3;
CLDN3;HMGA2;SOX4;TH;NPHS1;HOXA10;SI;KRT10;POMC;CDH1;FGF10;BEX2;ATOH1;ARG1;ELF3;DLX5
;E2F1;CCNE1;TRIB3;ALDH1A1;FOXN1;ZBTB7A;SKP2;PRLR;SLC1A1;MET;CD2AP;MKI67;RAP1A;TOP2A;
H2AFX;AKAP1;GOLM1;G6PD;IL6R;AURKA;BIRC5;CYCS;HK2;CDK6;VPS54;RARB;LRP2;CCNA2;ARID1A;C
ASP3;BCL2L1;MFN2;PLA2G4A;GRIA3;NQO1;CDC25A;EIF5A2;NFIL3;CCNG2;EGLN1;MRE11;NDRG1;PDG
FD;EDN1;GRB10;BRCA2;CDC20;LIFR;CDH2;VAPA;MTF1;BIRC7;RAD51;CCND3;RCC1;IGF1R;DEPTOR;IN
SR;CRYGS;YY1;DGCR8;CD44;ESRRA;SLC5A5;SLC30A1;MAPK1;LCN2;SLC2A1;TIRAP;EIF4EBP1;MAF1;RH
OT1;CDX2;ATG5;FOXP1;UVRAG;ITGA6;MTOR;WWTR1;CXCL1;BGLAP;ARF4;NCOA3;VTN;PRKCZ;CDKN1
A;PCNA;ADM;CAT;CDKN1B;BCL2L11;F3;PTCH1;MFN1;EPAS1;FASN;PDGFC;STMN1;PDGFA;LPCAT1;ZBT
B16;BBC3;USP8;TNFSF10;PPP2CA;XPC;MOB1A;MBP;CEBPB;SMAD7;GLI1;HMOX1;EDNRB;EPHB4;ADAM
17;CDX1;CYP19A1;MDM2;CBL;LATS2;SMAD4;SCARB1;SREBF1;COL2A1;WEE1;NKX3-
1;ABCG2;CDK4;CCND1;BSG;MCL1;VEGFA;MLH1;TARDBP;PXN;PKM;INPP5F;SYNPO;HBEGF;ABCC1;KLF2
;TRPM8;CAV1;DRD1;GPX1;PTK2;WNT7A;FKBP5;RUNX1;SPP1;ING4;CXCL8;CTNNB1;MYC;TIMP2;ABCA1
;HIF1A;S1PR5;NOTCH3;ATG7;BECN1;CDKN2A;BAX;ACADL;CXCR4;FBXO32;G3BP1;RASSF1;RUNX2;FAB
P4;KDR;FOS;CDH3;PGF;CXCR2;KDM4B;COX4I1;NGFR;COL18A1;TP53;TNF;NPM1;CMD1F;IRS2;UBE2S;IL
1RN;NRP2;EFHD1;IGFBP3;TSPYL5;BTG2;PFKFB3;FLT1;MMP9;SERPINE2;MMP14;AR;FOXP3;CD34;CYB
B;IRAK3;NOS2;FN1;IL10;GJA5;PTGS2;IL7R;PTN;PGR;IL1B;SOD2;SPARC;CCL2;ITGA5;CCL5;CCR7;S100A4
;TWIST1;AXL;CTGF;G6PC;RGS4;FASLG;ICAM1;TIMP1;VIM;NANOG;IKZF1;MSR1;ITGA1;CCND2;ESR1;CD
274;IGFBP2;PTGER2;IL6;ACTA2;SELL;COL1A1;THBS1;CXCL13;IGF1;COL10A1;WISP1;PLAU;CXCL5;BCL
2;SERPINE1;VCAN;MMP2;ACTG2;FAP;HAS2;VCAM1
ADORA2A 2.9636350
2
2.5641
6E-17
160 129
SCNN1A;AQP4;HNF4A;NTS;TH;NPHS1;POMC;IL18;CDH1;SLC2A2;PPARG;SEMA3A;DDIT3;KCNJ1;CASP3;
BCL2L1;CCL20;KCNJ2;ROCK1;ACTN4;NR3C1;PPARA;TXNIP;TNFRSF11B;TFRC;SLC2A1;BID;NT5C3A;IL1
3;RGS2;FOXO1;F3;GLUL;NPC1;LEP;SLC1A2;EEF2K;GNAL;ABCG2;VEGFA;LAMP2;EPHX2;KCNJ10;ADORA
2B;IL1R2;SLC7A1;SELP;ANXA5;SPP1;CXCL8;DRD4;ABCA1;HIF1A;TNFSF11;ALOX5;HNRNPM;BAX;CXCR
4;GJB2;SEMA4D;TGM2;ABCB1;COX7C;FOS;CXCL2;ADORA3;TNF;DUSP1;CYP27A1;CCL22;CTSK;BDNF;IL1

10. RN;NOTCH1;GDNF;TGFB1;CD28;FLT1;IL12B;MMP9;COL11A2;SOCS3;SLC1A3;EGR1;FAS;ENTPD1;FOXP
3;KCNK3;NOS3;NOS2;IL10;PTGS2;IL7R;CXCR3;IL1B;CCL2;FLI1;CCL5;CCR7;SELE;CXCL9;ITGB2;CTGF;RG
S4;NTRK2;FASLG;ICAM1;OPRM1;TIMP1;CST7;TBX21;CX3CL1;PDCD1;IL6;ITGA4;CCL3;CXCL10;ACTA2;C
OL1A1;THBS1;NR4A1;COL10A1;BCL2;CD69;COL3A1;MMP2;VCAM1;CCL4;CXCL12
KHSRP 2.9593201
51
5.2462
2E-07
76 52
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PRY4;IL13RA1;IFIT1;RUNX1;CXCL8;CTNNB1;ACTB;MYC;IFIT2;ISG15;CXCL3;GAP43;LDLR;TIMP3;CXCL2
;TNF;NPM1;NES;IL12B;MMP9;SOCS3;IKBKE;FSTL1;SLC9A3;NOS2;IFI44;IL10;PTGS2;IL1B;CCL5;ITGAM;
MAP2;CX3CL1;IL6;CXCL10;CD14;MMP2
MIR27A 2.8685486
62
4.3280
8E-06
121 109
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NPF;GSR;PNPLA2;ROCK2;SLC26A8;FABP3;NQO1;SCAF1;EDN1;CBFA2T2;SP3;FOXM1;MAP1LC3A;SOX9;
ATP5PB;TAB2;MMP1;ZBTB34;LIN28A;CXCL16;CDKN1A;CASP9;HSP90AA1;FASN;CTNNA1;CEBPB;TRIM
27;RHOA;SCD;TOP2B;SREBF1;AKT1;CCND1;CTSD;ADIPOQ;POLE4;CDC42;PLIN2;STAT1;HSPH1;LAMP1;
CXCL8;SERPINI1;TNFRSF1A;BECN1;MMP17;IGFBP5;OLR1;FBXO32;APOE;RUNX2;KDR;FOS;ZEB1;TMEM
173;TP53;FRZB;TNF;CXCR1;ADAMTS1;NOTCH1;MYOCD;TGFB1;SLC2A4;MMP9;COL11A2;SIGLEC1;NOS
2;HLA-
A;TLR4;SNAI2;PECAM1;VWF;PTGS2;IL1B;CCL2;HIC1;CTGF;FASLG;NREP;VIM;ZEB2;ESR1;IGFBP2;IL6;KL
RK1;KIT;THBS1;COL10A1;COL3A1;SULF1;MMP2;COL1A2;CXCL12;RPS3A
SERPINB1 2.8577380
33
4.2117
1E-09
28 26
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CCL2;CCL5;ITGAM;SERPINA1;ICAM1;IL6;CCL3;CXCL10;MMP2;CCL4
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73
6.6859
5E-06
25 25
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B1;TNF;FLT1;NOS3;PTGS2;IL1B;CCL2;DKK3;CCND2;IL6;ACTA2
MIR212 2.8368325
73
2.6035
9E-05
41 32
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;PPP3CC;CD36;RCAN1;TNF;BDNF;NOTCH1;PRRX2;NOS2;IL10;OLFM1;IL1B;CCL2;NTRK2;VIM;CD80;IL6;
NFATC1
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02
6.2670
3E-06
122 105
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OU5F1;BIRC5;HK2;CTH;IGFBP1;KLF4;CASP3;PNPLA2;EP300;NQO1;CDC25A;TGFB2;TXNIP;IGF1R;SLC2
A1;MAP1LC3A;MMP1;CASP8;MAPK3;ACACA;CDKN1A;FOXO1;HDAC6;CAT;CDKN1B;CHEK2;HMOX1;PTE
N;SREBF1;AKT1;TERF2;CCND1;MZF1;VEGFA;CDS2;PFKL;ABCG1;MAFK;PDPK1;PDK4;SQSTM1;HDAC8;S
ELP;CXCL8;CTNNB1;ABCA1;NOTCH3;BECN1;CDKN2A;BAX;PLAUR;PDK1;NOTCH4;ABCB1;PCBP2;LDLR;
ACACB;JAK2;ENO2;TSPYL2;TNF;TNFSF4;MAP1A;NOTCH1;NFATC4;CYR61;SLC2A4;MMP9;FAS;FGF2;NO
S3;TLR4;PTGS2;IL1B;SOD2;CCL2;TWIST1;CTGF;ICAM1;NANOG;GFPT2;ESR1;IGFBP2;CX3CL1;IL6;NFAT
C1;ACTA2;COL1A1;BCL2;COL3A1;VCAM1
MGP 2.6726124
19
9.0698
3E-06
22 21
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L6;NFATC1;ACTA2;TAGLN;ITGB3
SOD1 2.5819888
97
8.1965
8E-06
128 110
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NB1;SNAP25;SLC31A1;REV1;IGF1R;AKT1S1;TFRC;CPT1A;HSPA5;APEX1;MAP1LC3A;AHR;SLC16A1;ACA
CA;IL13;SIRT1;CDKN1A;CAT;ASL;CDKN1B;HSP90AA1;CDK2;NPEPPS;HSF1;SLC1A2;MKL2;TMOD2;CALR
;NEFM;STAT3;AGPAT1;KDM6B;CDK4;CCND1;TRAF3;VEGFA;TARDBP;IL4R;NSF;TBC1D1;HSPB1;KCNJ10
;MDH1;GPX1;MAP1LC3B;CXCL8;PSMB8;MADCAM1;FMO1;HIF1A;STXBP1;DDX3X;PLAUR;HERPUD1;TGF
B3;PRDX4;HSPA1A;ABCB1;SRR;FOS;SERPINH1;RCAN1;TP53;CYBA;F2R;AIF1;S100B;TGFB1;MMP9;MEF
2C;FAS;NOS2;FN1;ASS1;LGALS1;SNAI2;PTGS2;DPYSL3;CCL2;CTGF;FASLG;ICAM1;TIMP1;DNM1;TNC;TH
Y1;IL6;CCL3;COL1A1;PLAU;CD163;SERPINE1;VCAM1;CD68
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6E-10
114 102
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1;IRS1;MESD;APOM;LRPAP1;CAT;LIPE;ANXA1;FASN;APOA4;MYD88;LPIN1;HMOX1;UCP2;SREBF1;NFK
BIA;VEGFA;MMP3;TGFBR2;ABCG1;AGTR1;ATF3;CDC42;FADD;CAV1;PLIN2;CX3CR1;CLPP;SELP;SPP1;CX
CL8;CTNNB1;ABCB4;ABCG5;ABCA1;HIF1A;SOD1;APOE;CEACAM1;LDLR;FOS;CD36;ESAM;TNF;DUSP1;IR
S2;AIF1;IL33;IL18BP;ADCY1;IL12B;ITGAX;SOCS3;TGFBR1;OSBPL6;FAS;CYBB;NOS2;TLR4;ITGAL;IL10;P
ECAM1;PTGS2;IL1B;SOD2;CCL2;CD86;CCL5;CCR7;SELE;G6PC;ITGAM;HPX;ICAM1;TLR2;CD80;CX3CL1;C
CR2;IL6;ITGA4;ACTA2;CD14;PLAU;MMP2;VCAM1;APOC2;CD68
SERPINA1
2
2.5560386
02
1.1461
6E-05
38 36
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;ABCG1;ADIPOQ;ABCA1;BAX;TNF;ADAMTS1;SLC2A4;MMP9;ADAMTS5;TLR4;CCL2;SELE;PDGFRB;ICAM
1;NOX4;IL6;NFATC1;BCL2;COL3A1;MMP2;VCAM1;ADAMTS4
HMOX1 2.4019223
07
2.2344
2E-13
274 233
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PX2;SLC7A2;NPPB;CCNE1;AKR1C1;HES1;DDIT3;DUOX1;MYL2;PROC;MKI67;IL6R;CYCS;SYP;VEGFB;ALO
X15;GSR;CASP3;BCL2L1;EDN1;ALAS1;CDH2;TFAM;STAT6;TXNIP;SLC40A1;IGF1R;TRAF6;AGER;DGCR8;
TNFRSF11B;CD44;ATF6;ESRRA;TFRC;HSPA5;NRF1;CD55;MAP1LC3A;SOX9;MMP1;CASP8;IL23A;ATG5;C
DK5;MTOR;IRS1;IRAK4;BGLAP;CS;CDKN1A;CASP9;VDAC1;CAT;F3;RXRA;OCLN;MEF2A;FASN;TGFA;ABC
C4;SLC25A28;BRAF;TJP1;ZFP36;CDK2;HAMP;MAPK11;ABCC5;CEBPD;IREB2;FIS1;TF;BAG1;PTEN;GJA1;
SNCA;COL2A1;CD83;CDK4;CCND1;EIF2AK3;PRDM1;BSG;CASP12;VEGFA;RELA;STAT2;MMP3;ABCG1;AD
IPOQ;PRMT1;MMP7;CDC42;RIPK3;PTPN6;ABCC1;DNMT1;GUCY1B1;OPRD1;CAV1;HNRNPK;STAT1;FTH
1;GPX1;CD200R1;PROCR;MAP1LC3B;SELP;SLCO2A1;LAMP1;CXCL8;CCRL2;ALOX15B;CTNNB1;ACTB;MY
C;TIMP2;CD63;ABCA1;TNFSF11;SOD1;BECN1;SLC11A1;BAK1;GPX3;CDKN2A;IL24;CXCL3;RUNX2;KDR;C
D36;MAPT;SERPINH1;HMGB1;TP53;CCL22;AQP1;CYBA;LY96;BDNF;IL1RN;IL33;IGFBP3;GDNF;SLC2A4;
ADORA2A;FLT1;IL12B;MMP9;PTGES;FAS;FGF2;AR;FOXP3;CD34;THBD;ENG;CYBB;NOS3;NOS2;FN1;MIT
F;SYN1;TLR4;IL10;LRRC32;VWF;PTGS2;IRF8;IL1B;SOD2;CRYAB;SPARC;CCL2;PTGS1;NLRP1;CCL5;TLR9
;CCR7;SELE;VEGFC;CTGF;FASLG;ICAM1;OPRM1;VIM;UGT1A1;SOD3;DLG4;MSR1;CCND2;MAP2;CD80;CD
274;NOX4;RORC;CCR2;IL6;CCL3;CLEC7A;CXCL10;ACTA2;SELL;COL1A1;CXCL13;IGF1;CIITA;CD14;CXCL
5;BCL2;MRC1;SERPINE1;MMP2;VCAM1;CCL4;IRF4;CXCL12
GSK3B 2.3877961
97
1.3051
6E-05
450 392
SOX2;FOXA2;PEG10;GRIN1;GATA4;VEGFD;HNF4A;NOX1;TERT;PDX1;KLF5;CLDN1;CEBPA;MYCN;GCLM;
CD24;NPHS1;IL12A;GSTA4;CDH1;IL22RA1;SLC7A11;ATOH1;TCF7L1;E2F1;NEUROD1;STX1A;NPPB;GYS
2;SLC2A2;CCNE1;HES1;PPARG;FOXN1;SKP2;RAP1GAP;DDIT3;PRLR;UCA1;MNX1;MMP10;MSX2;GCLC;C
XADR;RAP1A;ZSCAN4;ZNF281;F11R;XIAP;POU5F1;BIRC5;ATP1A1;AJUBA;ZNRF3;GRIN2A;CDK6;IGFBP1
;CTNND1;GDF15;EZH2;MAG;JUP;FGF18;CCNA2;SLC6A4;MICB;GSR;KLF4;CASP3;BCL2L1;CLOCK;KIF3A;
MECOM;OLFM4;NQO1;CDC25A;STARD7;TGS1;MAFA;IBSP;SLC29A1;BRCA1;EDN1;CCNB1;PDCD4;SMAD
3;SNX3;CUL1;TFF1;RAET1G;CDH2;PPARA;ATF4;MAP3K5;FOXM1;BTRC;SH3GLB1;IVL;HHEX;CCND3;RB
PJ;PER2;FANCL;IGF1R;ACSL3;SP7;PLAGL1;CD44;STRN3;ESRRA;MICA;RICTOR;CDC6;SFRP1;SLC2A1;HS
PA5;MUC5AC;NFE2L2;NRF1;SOCS1;MAP1LC3A;SOX9;GYS1;SLC16A1;PGM1;MPZ;ATG5;BID;KLF13;BAC
E1;PLK1;FZD2;KLF15;ACACA;LETMD1;WWTR1;PPP1R13L;IRS1;TNNI3;BGLAP;IL13;NCOA3;GAB1;SIRT
1;ACHE;TRPC4AP;NFE2L1;LGALS3;CDKN1A;THRAP3;FOXO1;CDKN1B;GCK;DNM1L;EDIL3;BCL2L11;F3;
GLUL;PTCH1;PMS2;DBP;OCLN;IL17RA;ULBP2;CREB1;CTSH;ANXA1;FASN;USP9X;RHEB;SP1;HCN4;BBC3
;TNFSF10;TYRP1;SDC1;ATF2;LAMB1;JUN;PPP2CA;MOB1A;PTTG1;HSF1;ATG9A;HECA;NR2C2;CLDN2;M
GMT;LPIN1;GLI1;HMOX1;KLF6;SFRP5;BMP4;PER3;MDM2;EIF2S1;PTPN1;GJA1;SMAD4;SNCA;SCARB1;F
GD1;CERS5;CD40;SREBF1;COL2A1;NFKBIA;WEE1;PPME1;TP63;CDK4;CCND1;INPP5K;ABCB5;ATP2A2;
BSG;KDM1A;CASP12;MCL1;TRPC1;VEGFA;RELA;RNF220;ADIPOQ;ATF3;MMP7;LEFTY2;RBM38;TRIM11
;ABCC1;DNMT1;SET;ARHGAP31;NCL;ARHGEF7;SLC14A2;CNP;STC1;HDAC8;SELP;SPP1;CXCL8;ALPL;NF
E2L3;CTNNB1;MYC;TSC22D3;ABCA1;HIF1A;GRIN2C;SOD1;NOG;BECN1;STAR;BAX;GATA2;PLAUR;CXCR
4;DOCK4;PER1;PDE4D;FBXO32;RASSF1;HSPA1A;NPTX1;BIRC3;RUNX2;GAP43;BCL2A1;KDR;DLG2;TP53
INP1;TRIM17;MAPT;MMP12;IKBKB;ZEB1;ZNF322;GPSM3;CXCL2;CSF3R;TP53;FRZB;ARNTL;TNF;DLL4;
MYB;CYBA;IRS2;IL1RL1;NAMPT;BDNF;NES;SNAI1;IL1RN;KCNJ5;NOTCH1;CTSB;RELB;FBXW7;SLC2A4;
MGP;CFLAR;PMP22;PLA2G2A;GPNMB;CDH11;IL12B;TRAF1;MMP9;PTGES;IRF1;EGR1;FAS;JUNB;AR;SOX
17;EGR2;FOXP3;LGR5;THBD;LEF1;PDE3B;CHRD;PRF1;NOS3;NOS2;FN1;MITF;SYN1;TLR4;IL10;NUPR1;S

11. NAI2;PTGS2;PGR;IL1B;CCL2;PTGS1;CD86;FOSB;CD4;CCL5;SMAD1;CCR7;GLI3;SELE;TWIST1;CTGF;G6PC
;SLC14A1;ITGAM;RGS4;SLC2A3;FASLG;EEF1A1;VIM;NCAM1;NANOG;GLI2;CNN1;TBX21;CCND2;PTPRC;I
NPP5D;ESR1;CD274;NOX4;CX3CL1;ANTXR1;PDCD1;VDR;CD74;IL6;ITGA4;TBX3;CEMIP;CXCL10;NFATC
1;MYLK;ACTA2;COL1A1;BCL2;TAGLN;MYH11;SERPINE1;VCAN;MMP2;ACTG2;VCAM1;COL1A2
LDLR 2.3590712
98
1.6904
3E-09
70 65
APOB;NPHS1;HCAR2;MSX2;VLDLR;SNAP25;SP7;ATP6V0E2;SOAT2;APOD;IDE;LCAT;HMOX1;ADAM17;S
NCA;SCARB1;MSX1;ATP2A2;MYDGF;VEGFA;MMP3;ABCG1;AGTR1;APP;SPP1;CCRL2;MYC;ABCG5;ABCA1
;TNFRSF1A;LRP1;STAR;PLAUR;CXCR4;OLR1;APOE;CD36;ACE;NR0B2;LRP8;MMP9;FOXP3;NOS3;NOS2;F
N1;TLR4;IL10;PECAM1;CD81;CXCR3;CCL2;CD4;SELE;ITGAM;SERPINA1;TLR2;MSR1;CCR2;SELL;NR4A1;
CD14;SERPINE1;MMP2;ACTG2;VCAM1
THBD 2.3533936
22
1.9564
4E-07
47 44
CEBPA;F2;CDH1;PROC;CCNA2;C5;CEBPE;CDH2;ATG5;EGFR;F3;CCND1;MCL1;VEGFA;ADIPOQ;ANXA2;BE
CN1;SERPINC1;GAS6;BAX;HMGB1;FLT1;IL12B;MMP9;F8;NOS2;FN1;TLR4;PTGS2;CCL2;CD86;SELE;ITGA
M;ICAM1;VIM;CD80;IL6;PLAT;CCL3;CD14;BCL2;SERPINE1;VCAM1;CD68
FOXP1 2.3426064
28
9.8206
1E-06
90 68
SOX2;AGR2;DAB1;PITX3;NR5A2;CDH1;CNTNAP2;RASSF6;PPARG;SKP2;POU5F1;HOXA9;CITED2;AGGF1;
FGF18;CDKN1C;BCL2L1;KRAS;HIP1R;EDN1;PLOD2;MUC5AC;ISL2;FGF16;ERBB2;CDKN1A;JUN;PTEN;GJ
A1;EAF2;TP63;ABCG2;PRDM1;CCNE2;EBF1;NT5E;CDKN2A;RAG1;TP53INP1;FGF20;SOX18;RCAN1;TGF
B1;CD19;ENTPD1;SOX17;SATB1;FBXL7;FOXP3;GPR34;ENG;FN1;IL7R;ICOS;CSF1R;CTGF;G6PC;ITGAM;R
ELN;NANOG;GPR132;IL6;COL1A1;TGFBI;SERPINE1;MUC5B;ACTG2;PDPN
ATF3 2.3249527
75
4.3621
7E-05
189 160
CCNA1;APOB;CEBPG;HNF4A;PDX1;CEBPA;SLC27A2;IL18;CDH1;NPPB;PPARG;AGRP;DDIT3;PPP1R15A;T
HEM4;GCLC;CHGB;CIDEC;S100A9;XIAP;CNR1;ID1;GDF15;GPT;CCNA2;BCL2L1;SORT1;BNIP3;HDAC5;CD
C25A;TGFB2;EDN1;EPHA1;CDH2;CHAC1;SKIV2L;PPBP;ADIPOR1;BCL6;KL;SLC5A5;MUC5AC;NFE2L2;NR
F1;MMP1;IL23A;SLC16A1;CDK1;BIRC2;RIPK1;CXCL1;IRS1;WDR5;BGLAP;IL13;SIRT1;ACHE;CDKN1A;PC
NA;PMAIP1;GCK;S100A8;SCG2;EPAS1;SLC38A2;CREB1;MEF2A;FASN;BBC3;JUN;CEBPD;HMOX1;GADD4
5A;SCD;SREBF1;ADIPOR2;CCND1;MAP2K3;VEGFA;MMP3;ADIPOQ;DHFR;HSPB1;CRP;ECEL1;STAT1;TNF
RSF10B;CXCL8;ACSL1;CTNNB1;ACTB;TIMP2;BECN1;SLC11A1;BAK1;APLN;BAX;WNT10B;CXCL3;GSN;BI
RC3;RUNX2;GAP43;LDLR;TIMP3;NFKB2;CD36;CH25H;TP53;TNF;DUSP1;IRS2;PINK1;CSF1;NFATC4;SLC
2A4;TP73;TYROBP;FLT1;DNM3;IL12B;MMP9;IRF1;EGR1;MMP14;ENG;CYBB;FYN;FN1;TLR4;CD82;PTGS
2;CXCR3;IL1B;CCL2;TRPV1;CD4;ASNS;SELE;LIF;TWIST1;CTGF;ICAM1;TIMP1;VIM;DCN;TREM1;BHLHA1
5;TNC;IL6;NFATC1;ACTA2;NCF1;BCL2;COL3A1;SERPINE1;MMP2;VCAM1;CCL4;CXCL12
LILRB4 2.3094010
77
2.3805
9E-05
23 16
ARG1;CASP3;TRAF6;PLAUR;LTA;TNF;TGFB1;NOS2;IL1B;CD86;CTGF;CD80;IL6;BCL2;COL3A1;MMP2
LYZ 2.2677868
38
1.7232
E-09
48 40
IL18;SFTPD;AGER;MAP1LC3A;IL13;BCL2L11;JUN;STAT3;CD40;PDGFB;GRN;SHC1;STAT1;CXCL8;SOD1;T
NF;CCL19;TGFB1;SOCS3;LEF1;TLR4;CASP1;IL10;IL1B;CCL2;CCR5;CD86;TIMP1;VIM;COL4A1;CD8B;TNC;
IL6;CCL3;ACTA2;COL1A1;IGF1;CD8A;BCL2;MPEG1
TNFAIP8L
2
2.2677868
38
1.5545
6E-06
46 42
CDH1;ARG1;DDIT3;NRAS;CASP3;BCL2L1;CCNB1;CDH2;HSPA5;CDK1;EIF2S1;VEGFA;MMP3;TNFRSF10B;
CTNNB1;MYC;BAX;TGFB3;ABCB1;FOS;TP53;TNF;MMP9;FAS;FOXP3;PRF1;NOS2;TLR4;IL10;IL1B;CCL2;C
D86;TLR3;FASLG;VIM;CD80;IL6;ACTA2;PLAU;BCL2;CD69;IRF4
OPRK1 2.1828206
25
1.8765
7E-06
35 28
AQP4;GATA4;PRL;SLC1A1;SLC6A4;PRKCA;OXT;GJA1;ATP2A2;BECN1;CXCR4;KDR;FOS;JAK2;NRP1;TNF;
BDNF;GNAI2;IRF1;TLR4;CCL2;CCR5;CD4;RGS4;NCAM1;CCR2;IL6;CXCL10
GATA3 2.1566554
64
3.7237
5E-08
274 205
SOX2;CHST4;HLA-
G;NOX1;GNRHR;PTGDR2;MYCN;GJB1;ALDH1A2;NECTIN4;FOXA1;TH;POMC;NR5A2;PRL;CDH1;FGF10;A
RG1;SALL4;TGFBR3;NEUROD1;DLX3;NPPB;SLC47A2;TFAP2A;PPARG;MIR30C1;HSD3B1;GATA5;SLC9A3
R1;MKI67;F11R;TFAP2C;IL13RA2;IL6R;POU5F1;ASCL1;AURKA;BIRC5;RBBP8;SERTAD2;CASR;EPOR;EP
CAM;CCNA2;KLF4;CASP3;BCL2L1;KRT13;ZBTB7B;BRCA1;WDR77;EDN1;CLCF1;HESX1;LY6E;IL1RAP;CD
H2;MAF;ZNF613;ATF1;CDKN2C;PLOD2;LRP6;TNFRSF11B;MICA;ZNF217;TBP;EIF4EBP1;SOX9;MMP1;C
DX2;GLS;MTOR;GAD1;SOCS5;DBH;TNNI3;ATP2B2;IL13;CDKN1A;PCNA;GLUL;PIK3CA;CASP14;ANXA1;M
UC1;STMN2;MIR29B1;KLK1;HSD17B1;BMP4;CYP19A1;KIF12;PTEN;DSCAM-
AS1;STAT3;GJA1;IMPG2;NKX3-
1;CCND1;CERS6;VEGFA;PLOD3;LOX;PTRH2;KLF2;EOMES;AKAP13;HSPD1;BATF;IL13RA1;BANP;ASCL2;
ORMDL3;CXCL8;MYC;DTX1;SHQ1;TNFSF11;NTF3;SEMA3B;IL24;GATA2;GJB2;KRT81;RAG1;FOS;IL18RA
P;BCAS3;IL18R1;MIR573;TMPRSS3;FOXC1;NOD2;HTRA4;RCAN1;CHUK;CCR1;IFIT3;IL1RL1;CSF1;NOTC
H1;CYP2C19;HDAC9;STAT4;WNT11;ITM2A;ITGB1;IL12B;MMP9;CHST2;ENTPD1;SATB1;FOXP3;SLC6A2
;FSCN1;CYBB;CD5;DAB2;TIE1;TLR4;IL10;SNAI2;VWF;IL7R;SOD2;CCL2;TEK;CCR5;CD86;CD3D;CD70;CD
4;RARRES3;CCL5;TNFSF9;ICOS;CSF1R;IL12RB2;FGFR1;OPRM1;ZEB2;NANOG;TBX21;ECM1;CD80;ESR1;
RORC;CXCR6;CX3CL1;TREM1;BCL11B;THY1;CCR2;IL6;ARNT2;TRPS1;NFATC1;KIT;CD163;IL12RB1;MM
P2;THBS2;VCAM1
SIGIRR 2.1380899
35
2.1279
7E-05
21 17
IL18;IL13;CD40;TNFSF13B;RELA;CXCL8;HMGB1;TNF;IL33;NOS2;IL1B;CCL2;CCL5;IL6;BCL2;IRF4;PTGD
S
NR4A2 2.1371868
35
1.4348
5E-05
94 75
FOXA2;TMEFF2;DDC;PITX3;TH;POMC;PRL;ARG1;ZNF461;SYN2;AGRP;HSD3B1;PTPRU;POU5F1;RARB;C
DKN1C;VIP;SMAD3;KCNIP4;GSK3B;MMP1;BGLAP;IL13;SIRT1;CDKN1A;CDKN1B;TNFSF10;TYRP1;OXT;C
HRNB1;CYP19A1;TOP2B;SNCA;SMAD6;CCND1;HSD3B2;GATA3;RELA;MMP3;GRIK5;ENO3;SPP1;GCH1;C
XCL8;CTNNB1;HIF1A;BAX;NFKB2;CD36;NRP1;TNF;DUSP1;NEDD9;BDNF;UCHL1;SLC2A4;MMP9;SMN1;I
KBKE;AXIN2;SLC18A2;FOXP3;NOS2;SYN1;IL1B;CCL2;ICAM1;IL6;CCL3;COL1A1;THBS1;FABP5;NR4A1;N
R4A3;HGF
Anti-
inflammat
ory
Cytokines
2.1213203
44
2.5819
4E-10
84 63
HLA-
G;F2RL1;NPPC;SCGB3A2;ARG1;NPPB;HSD17B14;FAM132A;SLC6A4;CCL20;GANAB;TNFRSF11B;TFRC;C
D55;F3;NGF;CSNK2A1;ELAVL1;KLF6;CYP19A1;P2RY12;CXCL8;PTX3;ABCA1;TNFSF11;JAK2;CXCL2;CTSS
;TNF;LY96;CSF1;IL1RN;LTB4R;IL18BP;PLA2G2A;IL12B;MMP9;ANPEP;FAS;GNLY;NOS2;PTGS2;TNFAIP6
;IL1B;CCL2;CD86;CCL5;SELE;TIMP1;VIM;SOD3;TBX21;CD80;TREM1;PDCD1;IL6;FCGR2B;CCL3;CXCL10;
CIITA;TGFBI;CD69;CD163
C4A 2.1213203
44
6.9506
E-06
11 8
TNF;MMP9;CCL2;C3;IL6;ACTA2;MMP2;CD68
SOD3 2.0816659
99
5.4748
3E-06
63 55
GSTA2;CYCS;PPARGC1B;CASP3;CDH2;GGT7;CD44;SOX9;HPSE;WWTR1;CXCL1;CDKN1A;CASP9;SDC1;UC
P2;CD40;COL2A1;VEGFA;PDE5A;ADIPOQ;HBEGF;SELP;CXCL8;CTNNB1;PYCARD;HIF1A;SOD1;BAX;FBXO
32;ADAP2;CXCL2;TNF;CYBA;ARHGDIB;TGFB1;ITGAX;EGR1;AXIN2;CASP1;CDH5;IL1B;SOD2;CCL2;CD86;
SELE;RGS4;ICAM1;TLR2;VIM;ARHGAP9;CD80;IL6;CIITA;BCL2;VCAM1
SERPINA1 2.0655911
18
1.6505
5E-09
98 87
ALB;IGF2;CDH1;DDIT3;CDSN;TNFRSF11A;RAC1;BPIFA1;NR3C1;ATF4;TFRC;ENPP1;BIRC2;DSG1;CXCL1;
BGLAP;DCSTAMP;F3;OCLN;MTA1;TJP1;HAMP;JUN;HMOX1;SCARB1;RARA;CCND1;EIF2AK3;TNFSF13B;S
MAD2;DDX58;VEGFA;TGFBR2;CRP;FTH1;IFIT1;IFIH1;SELP;CXCL8;ACTB;TIMP2;GMPS;TNFRSF1A;CXCR
4;LDLR;FABP4;FOS;RGS16;CD36;MMP12;CXCL2;TNF;CXCR1;CD9;CTSK;IL1RN;NOTCH1;CTSB;TGFB1;FL
T1;NOS3;NOS2;FN1;TLR4;IL10;PTGS2;ANGPTL4;IL1B;CCL2;CCR5;CD86;CD4;CCL5;ICAM1;TLR2;VIM;PT
PRC;IL6;CCL3;ACTA2;COL1A1;CD14;BCL2;ITGB3;HGF;MMP2;MUC5B

12. HOXD10 2.0647416
05
8.0269
E-07
38 34
SHH;HOXD9;ALDH1A2;CDH1;AMOT;CDH2;RHOC;REN;CDKN1A;TJP1;TBX5;VEGFA;PXN;PLAUR;IGFBP3;
GABBR1;NME1;ITGB1;CDH11;MMP9;CLDN5;FLT4;MMP14;FGF2;NOS3;CDH5;CCL2;TEK;LIF;VIM;ITGB3;
MMP2;THBS2;CXCL12
C-peptide 2.0579830
22
3.2865
9E-05
62 51
IGF2;CDH1;SLC2A2;ATP1A1;IGFBP1;SYP;COL4A5;CUL5;INSR;AGER;RXRB;MAPK8;CXCL1;DNM1L;NGF;A
NXA1;FIS1;SREBF1;NFKBIA;CCND1;SHBG;SELP;CXCL8;MYC;TNFSF11;COL4A3;FOS;CD36;TP53;NAMPT;
TGFB1;GPNMB;COL4A4;TGFBR1;NOS3;NOS2;FN1;ANGPT1;PTGS2;IL1B;PDGFRB;ICAM1;VIM;COL4A2;C
OL4A1;IL6;CCL3;IGF1;BCL2;HGF;VCAM1
GLI3 2 1.7733
4E-05
79 61
SOX2;FOXA2;NKX2-1;HLA-
G;SHOX2;TERT;BMP2;PAX9;SHH;MYCN;MYOG;FOXA1;FGF10;DLX5;PVR;ZNF503;BIRC5;CDK6;IGFBP1;H
CN3;EMX1;SP7;MUC5AC;ISL2;SOX5;CDKN1B;OXSR1;PTCH1;EMX2;GLI1;IL6ST;TNFRSF10A;BMP4;BOK;
PRDM1;VMP1;WNT7A;CYP11A1;SPP1;CTNNB1;MYC;HIP1;FOS;PTHLH;TMEM26;PITRM1;SOX8;PTH1R;
WNT11;FOXL1;FOXF1;WNT2;RELN;WNT5A;HSD11B1;TYMP;KIT;IGF1;COL10A1;BCL2;HAS2
DUSP1 1.9867985
36
5.6954
6E-10
108 94
SLPI;CEBPA;MYOG;PRL;CDH1;CCNE1;CALCR;PPARG;LHB;MYL2;CIDEC;TGFB2;CCNB1;S100A12;MUC5A
C;MAPK6;IL23A;SRF;CXCL1;BGLAP;RGS2;DCSTAMP;CDKN1B;DUSP6;ANXA1;FANK1;PDGFA;ZFP36;JUN;
CEBPB;PARP1;PTEN;STAT3;NFKBIA;HTT;CCND1;PDGFB;VEGFA;MMP3;SIK1;ATF3;MMP7;CXCL8;CTNN
B1;TSC22D3;HIF1A;TNFSF11;STAR;IL27RA;CXCR4;PDE4D;ABCB1;FOS;HMGB1;CXCL2;ADGRL3;TNF;IL1
RN;STAT4;MGP;ITGB1;IL12B;PTGES;IRF1;EGR1;CYBB;NOS2;TLR4;IL10;PTGS2;SH2D2A;SOD2;CCL2;SEL
E;VEGFC;G6PC;DUSP2;TLR2;VDR;IL6;CCL3;NFATC1;ACTA2;THBS1;CIITA;NR4A1;COL10A1;CD14;PLAU;
BCL2;SERPINE1;MMP2;VCAM1;CCL4
MIR495 1.9756583
22
2.2025
8E-05
50 45
ONECUT2;ONECUT1;IL18;MKI67;MAT1A;CASP3;CLOCK;CCNB1;CDH2;TNFRSF11B;SOCS1;CASP9;RB1;C
OL2A1;ABCG2;VEGFA;ANXA5;CXCL8;CTNNB1;TIMP2;TNFSF11;ERCC1;COL9A2;BAX;CXCL3;RUNX2;TP5
3INP1;ZEB1;NOD2;TNF;ATM;TGFB1;MMP9;SATB1;NOS2;CASP1;PTGS2;IL1B;TIMP1;VIM;IL6;ACTA2;BC
L2;COL3A1;MMP2
MIR145 1.9528336
65
3.9084
7E-05
127 97
LIN28B;IGF2;PRDM16;GATA4;PROM1;CEBPA;CDH1;FGF10;KRT1;CCNE1;UCA1;RIOK1;KRT3;IGFBP1;ID
2;BCL2L1;NCAPG;TUG1;AGO2;MELK;PPARA;PPARD;BUB1;MAPK1;MMP1;SPOP;E2F2;CASP8;LIN28A;CD
K1;ATG5;MTOR;HDAC2;IL13;SIRT1;CDKN1A;PCNA;S100A8;BCL2L11;CREBBP;PIK3CA;TYRP1;SDC1;JUN
;AGO1;GJA1;COL2A1;BMPR2;TP63;STAT2;LOX;MMP7;HSPB1;SQSTM1;SPP1;HIF1A;TNFSF11;COL9A2;B
AX;IGFBP5;RUNX2;PIK3C3;TNF;S100B;CD28;MMP9;COL11A2;PODXL;COMP;FN1;MITF;IL10;PECAM1;S
LC8A1;SPARC;CCL5;INHBA;HLA-
DRA;PDGFRB;VIM;CNN1;LTBP2;TNFSF13;C3;IL6;CXCL10;NFATC1;ACTA2;COL1A1;CACNA1C;TAGLN;CO
L5A1;MYH11;SERPINE1;MMP2;CFB;COL11A1
PAX5 1.9466570
54
2.4701
5E-05
109 83
FOXP4-
AS1;TERT;MYCN;CDH1;ATP1B1;FOXP4;POU2F1;HOXB9;MET;WNT1;G6PD;POU5F1;BCAR3;SLC9A8;BCL
2L1;BRCA2;TCF7L2;NR3C1;TXNIP;BCL6;INSR;SP7;SLC2A1;SRC;UNG;PRDX6;BGLAP;CDKN1A;CDKN1B;S
DC1;TPO;PTEN;POU2F2;PRDM1;GATA3;PXN;BLNK;KLF2;EBF1;XBP1;PTK2;SARAF;MYC;DTX1;TIMP2;M
CM3AP;TNFSF11;GATA2;FDPS;F10;SLC2A6;CSF2RA;BLK;TP53;IFI16;SPI1;NEDD9;ETS1;ZBTB20;NOTC
H1;NR1I2;MICAL3;CD19;JUNB;LEF1;FLT3;BACH2;PTGS2;IRF8;CD86;RARRES3;CD72;CD79A;CSF1R;PIM
2;IKZF3;DKK3;CD80;CIITA;IRF4;JCHAIN;POU2AF1;IFI30
CLU 1.9466570
54
3.6236
3E-05
59 55
DAB1;DKK1;ATP7B;POMC;CDH1;NPPB;BIRC5;CASP3;BCL2L1;CCL20;BRCA1;HSPA5;MUC5AC;NFE2L2;A
CACA;MESD;LRPAP1;TJP1;PPP2CA;PTTG1;MBP;HMOX1;GADD45A;SREBF1;NFKBIA;AGTR1;LIMK1;APP;
CXCL8;CXCR4;FDPS;ABCB1;COMMD1;FOS;IGFBP6;TNF;MMP9;FAS;CYBB;NOS3;FN1;TLR4;CCL2;S100A4;
ICAM1;CX3CL1;IL6;NCF1;CD14;BCL2;HGF;SERPINE1;MMP2;VCAM1;CCL4
DUSP4 1.9414506
87
5.3969
3E-08
32 24
CDH1;ARG1;JUN;SMAD2;MMP3;CYP11A1;CTNNB1;BAX;ZEB1;TNF;DUSP1;SNAI1;CLEC10A;NOS3;NOS2;I
L10;PTGS2;CCL2;ICOS;G6PC;NOX4;IL6;CACNA1C;ITGA2
SIRPA 1.9414506
87
1.6645
E-06
28 23
EPX;PPARG;PSMD10;UCP2;CCND1;TGFBR2;CXCL8;CTNNB1;TNFSF11;TNF;CCL19;ANPEP;CYBB;NOS2;T
LR4;IL10;LYN;PTGS2;CD86;ITGB2;CCL21;CD80;IL6
HDAC5 1.9379255
8
2.5211
7E-07
88 70
ZIC1;POU3F2;NOX1;MLXIPL;CEBPA;MYCN;MYOG;TH;POMC;NPPB;HIPK2;CNR1;AURKA;BIRC5;NR2F1;K
LF4;NR3C1;CCND3;NR5A1;NR1D2;TNNI3;BGLAP;CDKN1A;MEF2A;CTNNA1;SP1;CCNC;SMPD3;HMOX1;S
REBF1;PTBP1;MMP7;KLF2;CA9;CTNNB1;HIF1A;TNFSF11;BMP7;CXCR4;FBXO32;RUNX2;PAX6;GAP43;N
UCB2;DLL4;BDNF;NOTCH1;SLC2A4;SLC1A3;MEF2C;AR;FOXP3;NOS3;NOS2;CREM;SLC8A1;CPT1B;LIF;T
WIST1;CXCL9;HLA-DRA;G6PC;ESR1;NEDD4;CXCL10;ACTA2;NR4A1;MEG3;SERPINE1;VCAM1
PDCD1 1.9379255
8
5.3574
E-06
91 69
ARG1;SKP2;POU5F1;HK2;BCL2L1;CCL20;CDC25A;SMAD3;IL23R;STAT6;CPT1A;SLC2A1;SOCS1;CISH;IL1
3;SIRT1;BCL2L11;IFNAR1;LEP;PTEN;CD40;VSIR;FGL2;IRF7;GATA3;RELA;DUSP4;STAT1;EOMES;BATF;
NT5E;LAMP1;CTNNB1;MYC;CDKN2A;RUNX2;ABCB1;CXCL2;TNF;SPN;SPI1;TGFB1;ITGB1;ENTPD1;FOXP
3;PRF1;NOS2;ITGAL;IL10;PECAM1;IL7R;CXCR3;IL1B;CCL2;CD86;CCL5;HAVCR2;ICOS;FASLG;CD80;IL21
R;CD274;RORC;IL6;CCL3;CXCL13;NR4A1;CD69;CCL4
SFRP1 1.9148542
16
3.1737
9E-07
57 50
SOX2;PROM1;CD24;CDH1;PPARG;DVL1;TGFB2;SOX9;MMP1;MPZ;BACE1;BGLAP;CASP9;MBP;BMP4;COL
2A1;CCND1;VEGFA;MMP3;DNMT1;APP;RUNX1;CXCL8;CTNNB1;MYC;BFSP1;BAX;RUNX2;TNF;LY96;NA
MPT;MMP9;EGR2;SFRP2;TIE1;IL10;PECAM1;CCL2;TIMP1;VIM;ZEB2;NANOG;DKK3;IL6;COL10A1;CXCL5
;BCL2;ITGB3;SERPINE1;MMP2
VDR 1.9090909
09
3.4106
8E-09
354 289
SLC30A10;ELOVL3;SLCO1A2;ABCC2;TMPRSS4;SLC34A2;SULT2A1;CA2;FGB;CDH17;TERT;ALOX12;CYP2
C9;BMP2;SHH;CEBPA;AGT;MYOG;TH;NPHS1;HOXA10;F2RL1;KRT10;HNF1A;ENPP3;PRL;NR1H4;CDH1;
MSTN;ARG1;MAOA;DLX3;NPPB;ABCB11;DKKL1;APOL1;PPARG;DDIT3;ATP2B1;CYP3A5;PLD1;KRT16;M
SX2;THEM4;ABCC3;MEPE;UCP3;SREBF2;APOA1;G6PD;SULT2B1;SLC13A1;CYP1A1;KCNH1;TBL1X;CASR
;NCSTN;ID1;RARB;DGAT2;LRP2;LRP5;PPARGC1B;PNPLA2;UGT2B15;BNIP3;CCNG2;SLC46A1;IBSP;TGFB
2;BRCA1;CCNB1;HSP90AB1;COMT;TCF7L2;PPARA;FOXM1;IVL;HDAC11;CCND3;KPNA4;KL;PPARD;DEP
TOR;INSR;INSIG2;SP7;CAMP;TNFRSF11B;CD44;CLDN12;SOCS1;HPSE;KRT15;ENPP1;CDKN2D;CDK1;W
NT4;EGFR;TPT1;MTOR;TFPI;BGLAP;GPRC5A;SULT1C2;REN;LPL;CDKN1A;CASP9;FOXO1;HDAC6;CDKN1
B;S100A8;F3;NGF;OCLN;PHEX;TRPV5;CERK;REL;SP1;ABCC4;PDGFA;TJP1;BBC3;SLC10A2;HAMP;LEP;AX
IN1;CEBPB;CLDN2;CYP3A7;LPIN1;GLI1;ADAM17;ATG16L1;GADD45A;CYP19A1;MDM2;PTEN;STAT3;GJ
A1;UCP2;CD40;SREBF1;RARA;NFKBIA;TP63;ABCG2;CCND1;DUSP10;CYP27B1;SMAD2;VEGFA;MMP3;TG
FBR2;ANGPT2;ABCG1;AGTR1;PTRH2;OGN;CCR10;IER3;PLIN2;GPX1;MYH3;SUFU;CYP11A1;SPP1;NFKB1
;CXCL8;ALPL;CTNNB1;MYC;PLCG1;LYZ;ABCG5;HIF1A;CTSL;TNFSF11;ALOX5;SLC11A1;SERPINC1;LRP1;
LMNA;SEMA3B;TRPC6;CXCR4;ATP6AP2;HSPA1A;DNM3OS;RUNX2;ABCB1;NINJ1;KDR;DPT;UPP1;CALB1
;CD36;PTHLH;ERG;CUBN;SLC6A6;LTA;NOD2;RCAN1;TP53BP1;TNF;DUSP1;CYP27A1;TNFSF4;ADAMTS1
;TRPV6;KSR1;DDIT4;BMP3;SLC19A1;SP100;NR0B2;PTH1R;CD1D;HLA-
DRB1;CSF1;IGFBP3;RAD50;STAT4;RELB;GFRA1;HRH1;PIN1;ITGB1;IL12B;PODXL;TLR10;DYSF;SLC18A2
;THBD;CYBB;NOS3;NOS2;FN1;MITF;TLR4;IL10;SLC8A1;PTGS2;ANGPTL4;IRF8;IL1B;CCL2;CD86;CCL5;S
ELE;HTRA1;INHBA;POSTN;ITGB2;CTGF;ITGAM;FGFR1;TIMP1;TLR2;FHL2;MSR1;DCN;LILRB4;ECM1;CC
ND2;CD80;ESR1;SELPLG;TREM1;PDLIM2;IL6;CORO1A;CXCL10;GZMA;ACTA2;COL1A1;FGF19;COL10A1;
CD14;BCL2;HGF;SERPINE1;MMP2;IRF4;CXCL12;KCNMA1
GPX4 1.8973665
96
1.2180
7E-05
19 17
CDH1;GPX2;TXNRD1;VEGFA;GSC;GPX1;SELENOP;GPX3;BAX;CHRD;PTGS2;SOD2;PDGFRB;ICAM1;IL6;TH
BS1;VCAM1
protein-
tyrosine-
phosphata
1.8898223
65
2.1749
4E-05
62 53
TH;PPARG;DDIT3;PTPRU;CCNA2;IBSP;PDCD4;RAB3D;DBH;IL13;CDKN1A;CAT;CDKN1B;F3;AREG;SREBF
1;CCND1;IL4R;CBLB;DHFR;ANXA2;TNFRSF10B;ACSL4;CXCL8;MYC;ABCA1;PLAUR;HBB;FOS;FOSL1;IL11
;TP53;DUSP1;SNAI1;NCF2;SLC2A4;PFKFB3;MMP9;SOCS3;EGR1;CYBB;NOS2;IL10;PTGS2;CCL2;CD86;G6
PC;ICAM1;OSM;IL6;NCF1;PLAU;CD69

13. se
TGFi 1.8856180
83
9.3823
9E-06
32 30
CDH1;DLX3;TFAP2A;BIRC5;SP7;SLC26A6;BGLAP;SMAD2;GATA3;ADIPOQ;NR4A2;TNFSF11;GATA2;STA
B2;RUNX2;CFTR;SERPINH1;TGFB1;AR;FN1;TWIST1;VAV1;CTGF;NANOG;COL4A1;CD274;BMP6;FCGR2B
;ACTA2;FAP
HDAC4 1.8599622
2
1.5415
5E-07
152 122
SOX2;IHH;PRDM16;GATA4;VEGFD;HNF4A;GNAI1;BMP2;MYOG;CDH1;ARG1;HOXB13;NPPB;CCNE1;TRIB
3;PPARG;DDIT3;NR3C1;ATF4;HDAC11;MIR200A;NR5A1;ATF6;CPT1A;SOX9;MMP1;CDK1;MUSK;PLK1;E
GFR;MTOR;BGLAP;HDAC2;SIRT1;ACHE;CDKN1A;PCNA;RAI1;HDAC6;ACADM;BCL2L11;BCLAF1;CREB1;
HDAC1;MEF2A;CTNNA1;ZBTB16;CDK2;TGIF2;JUN;SMPD3;FTSJ1;KLF6;GADD45A;PTEN;SMAD4;COL2A1
;CCND1;VEGFA;LOX;MMP3;KLF2;FBXO30;SLC9A6;CA9;MRTFA;HDAC8;CTNNB1;MIR200B;FGF1;HDAC1
0;HIF1A;TGIF1;TNFSF11;ATG3;NTF3;CDKN2A;IL24;FBXO32;DACH1;RUNX2;ABCB1;FOS;NUCB2;HMGB1
;COX4I1;TP53;TAL1;IL1RL1;BDNF;HDAC9;SLC2A4;MMP9;PTGES;SLC1A3;ADAMTS5;MEF2C;EGR1;AR;T
HBD;CYBB;RECK;SLC8A1;PTGS2;IL1B;TRPV1;HIC1;HLA-
DRA;G6PC;WNT5A;VIM;NANOG;GPR132;IL6;ACTA2;CIITA;NR4A1;COL10A1;BCL2;MMP2;VCAM1;ADAM
TS4
EHMT2 1.8382900
6
4.4486
6E-09
116 100
SOX2;MAGEA2;S100A14;NPY;PKIB;PROM1;TERT;CEBPA;MYOG;IL12A;CDH1;TNMD;PPARG;CDKN2B;H2
AFX;HMGA1;POU5F1;BIRC5;RARB;EPCAM;RAC1;BRCA1;KL;YY1;CD44;CDKN3;SOCS1;IL23A;CDK5;CXCL
16;PLK1;FH;TFPI;ERBB2;MAT2A;CDKN1A;BBC3;SIAH1;TNFSF10;UNC5C;OXT;PTEN;MESP1;CCND1;DDX
58;VEGFA;MME;DHFR;KCNJ10;PDK4;HSPD1;MAP1LC3B;CXCL8;HIF1A;RASSF8;BAX;WIPI1;RASSF1;NOT
CH4;KDR;HBB;JAK2;TNF;IFIT3;BDNF;RELB;LMO2;CASP1;GREB1;PTGS2;ANGPTL4;IGFBP4;PGR;IL1B;FO
SB;HEPH;RARRES3;RSAD2;CCR7;RUNX3;ZEB2;NANOG;ROBO4;NEDD4;CD8B;WNT10A;IL6;CCL3;CXCL1
0;ACTA2;COL1A1;CD209;CIITA;CD8A;ITGB3;VCAM1;CCL4;COL1A2;CXCL12;IFI27
PROC 1.8382900
6
3.4439
9E-08
94 83
F2;ACE2;PRKAR2B;SOCS7;DDIT3;F11R;CYCS;FGA;ADAMTS13;EDN1;HSPA5;TNFAIP1;BID;EGFR;NFE2L
1;CDKN1A;BCL2L11;F3;OCLN;ANXA1;PDGFA;TJP1;ZFP36;TNFSF10;MBP;YBX1;ADAM10;EIF2S1;FGL2;V
EGFA;RELA;CDC42;SHC1;ARRB2;STAT1;PROCR;APP;GCH1;CXCL8;HIF1A;SOD1;BAX;F10;BCL2A1;KDR;N
FKB2;CXCR2;GAPDH;TP53;ACE;TNF;F2R;TGFB1;TNFAIP3;PLA2G2A;LTF;IL12B;MMP9;EGR1;EDNRA;FO
XP3;NOS3;NOS2;ANGPT1;TLR4;IL10;PTGS2;IL1B;CCL2;CCL5;SELE;ICAM1;WNT5A;SPOCK1;SERPINF1;C
X3CL1;IL6;THBS1;PLAU;BCL2;MMP2;VCAM1;MIF
HDL 1.8367993
29
4.6101
4E-13
187 159
DHCR24;TERT;CEBPA;CD24;F2;HNF1A;NPPC;ARG1;DLX5;APOC3;DLX3;RTN4R;CCNE1;PPARG;DDIT3;M
SX2;APOA1;SULT2B1;BIRC5;CCNA2;CASP3;BCL2L1;SIAH2;TRIM2;TGFB2;EDN1;TNFAIP1;EIF4EBP1;MA
P1LC3A;DICER1;MMP1;DDAH2;CXCL1;TFPI;BGLAP;APOM;CREBRF;SIRT1;PCNA;ACADM;F3;ANXA1;FAS
N;SIAH1;APOA4;HNRNPAB;MYD88;NR2C2;SMAD7;HMOX1;IL6ST;SCD;SCARB1;SREBF1;PON1;CCND1;P
RDM1;BSG;VEGFA;S1PR1;LOX;MMP3;MME;CTSD;ABCG1;ADIPOQ;AGTR1;ATF3;CDC42;ABCC1;HSPB1;E
RN1;CRP;CAV1;NCEH1;XBP1;CX3CR1;ACVR1;NR4A2;APP;SELP;CXCL8;MYC;PTX3;CD63;ABCA1;HIF1A;A
LOX5;BECN1;SERPINC1;STAR;OLR1;ABCB1;LDLR;KDR;HBB;FOS;CD36;CH25H;ESAM;TNF;DUSP1;ADAM
TS1;HSPG2;BDNF;IL1RN;STAT4;TGFB1;MIR221;CFLAR;PLA2G2A;IL12B;MMP9;OSBPL6;EGR1;MMP14;F
AS;FGF2;THBD;ENG;NOS3;CLEC5A;NOS2;FN1;TLR4;ACVRL1;IL10;MT1X;VWF;PTGS2;MT2A;IL1B;CCL2;
TEK;CCL5;CCR7;SELE;ITGAM;NTRK2;PDGFRB;F13A1;ICAM1;TLR2;COL8A1;CX3CL1;C3;CCR2;IL6;PLAT;
ACTA2;THBS1;CD14;BCL2;MRC1;CD163;SERPINE1;ACTG2;VCAM1;APOC2
DKK1 1.8182745
8
7.6591
7E-07
201 162
PRG4;FOXA2;NKX2-
1;GATA4;PDX1;BMP2;SHH;HOXD1;NPHS1;F2RL1;HNF1A;CDH1;GJB6;CER1;FGF10;ATOH1;IRX3;NEURO
D1;DLX2;PPARG;WNT3;ALDH1A1;CYP3A5;MLPH;AP1M2;MKI67;LHX2;TEF;POU5F1;BIRC5;ID1;CXXC5;
EPCAM;FGFR2;CASP3;CCNB2;HDGF;PRKCA;SMAD3;KLHL20;FOXM1;BTRC;PPARD;GSK3B;LRP6;TNFRSF
11B;CD44;MEIS2;DPAGT1;SOX9;MMP1;ROMO1;GDF5;TULP3;WNT4;BACE1;IRS1;TNNI3;RAF1;WDR5;B
GLAP;IL13;ACHE;LPL;CDKN1A;PCNA;F3;GLUL;WT1;STX5;MLANA;LPIN1;GLI1;LPIN3;MDM2;PTEN;COL
2A1;EGF;LTBP1;CCND1;SMAD2;GATA3;MMP3;ANGPT2;MMP7;DMRT1;BMI1;GRHL3;HDAC4;LBH;SPP1;
ALPL;CTNNB1;MYC;NOTCH2;FGF1;SLC5A1;P4HA2;HIF1A;TNFSF11;CDKN2A;BAX;CXCR4;TNNT2;OLR1;
H2AFY;RUNX2;PAX6;ABCB1;PCBP2;HBB;CD36;FGF20;TP53;FRZB;IRS2;CSF1;NES;SLC27A1;UCHL1;TGF
B1;MGP;SOX11;MMP9;ADAMTS5;AXIN2;FOXP3;ACTN1;MIXL1;THBD;LEF1;FN1;MITF;TLR4;IL10;PTGS2
;CCL2;TLR9;GLI3;PRKCB;VEGFC;CTGF;WNT5A;DLG4;SELPLG;BMP6;VDR;IL6;ACTA2;COL1A1;IGF1;COL1
0A1;CXCL5;BCL2;COL3A1;SERPINE1;VCAN;MMP2;ACTG2;VCAM1;COL1A2;GREM1
SLPI 1.8 2.5194
5E-07
42 38
PI3;F2RL1;CDH1;NFKBIB;CCL20;IBSP;MMP1;GRB2;ELK1;CCND1;SMAD2;LOX;PXN;NFKB1;CXCL8;HMGB
1;CXCL2;CTSS;TNF;IL33;IGFBP3;TGFB1;TRAF1;MMP9;MMP14;NOS2;TLR4;IL10;SPARC;CCL2;SELE;ICA
M1;TIMP1;TLR2;IL6;HGF;MMP2;VCAM1
DNMT3B 1.7614096
92
3.5231
1E-06
129 102
SOX2;FOXA2;WIF1;SCNN1A;ITPKA;FGFR3;PTPRR;GATA4;FOXD3;PROM1;PDX1;SHH;CDH1;ARG1;MUC4;
HOXB13;PPARG;HOXA5;WNT1;ZSCAN4;GPAM;POU5F1;CITED2;SNCG;RARB;AGGF1;ALOX15;JUP;PHLPP
1;BRCA1;FURIN;BRMS1;ATRX;FOXM1;DNMT3A;KL;PER2;NR5A1;CASP8;MTSS1;E2F6;CDKN1A;PTCH1;C
REB1;MAGEA11;CHEK2;PSIP1;FOXF2;MBD1;CEBPD;GLI1;BAG1;CYP27B1;VEGFA;RELA;MLH1;PTPN6;S
HC1;SUN2;APP;PYCARD;HIF1A;CDKN2A;BAX;CXCR4;NLRC4;RASSF1;PAX6;PSTPIP2;TCF3;PINK1;NOTC
H1;DLC1;SLC2A4;SETD7;TRAF1;MMP9;FAS;CLEC10A;SEMA4A;FOXP3;NOS2;RECK;SNAI2;PECAM1;IL2R
G;PTGS2;PGR;IRF8;CXCR3;CDH13;TNFSF9;RUNX3;NANOG;ESR1;ACTA2;MRC1;MEG3;TAGLN;MMP2;HA
S2;CXCL12
COL4A2 1.7320508
08
3.4372
9E-06
13 13
VEGFA;HIF1A;KDR;CFLAR;FLT1;FLT4;FAS;ANGPT1;ELN;PTGS2;TEK;VEGFC;FASLG
NFKBIA 1.7218920
64
3.7593
3E-09
117 106
NOX1;HOXB7;TRIB3;HES1;PPARG;PLD1;GCLC;XIAP;BIRC5;CDK6;NFKBIB;BCL2L1;CCL20;HDAC5;EDN1;
BRCA2;CTCF;CAPN1;LCN2;TNFAIP1;MUC5AC;SOX9;MAPK8;BIRC2;CXCL1;XRCC6;F3;GRK5;HDAC1;RB1;
NFKBIE;BCL3;HMOX1;CYP19A1;PTEN;CCND1;IRF7;PDGFB;TRPC1;VEGFA;MMP3;ATF3;IER3;TNFRSF10
B;COPS5;P2RY2;CXCL8;MIR200B;HIF1A;BECN1;TRPC6;CXCR4;ANKH;BIRC3;BCL2A1;HERC5;ZEB1;NOD
2;SOX18;TP53;TNF;DUSP1;DLL4;SAT1;CYBA;NCF2;CFLAR;TNFAIP3;ITGB1;IL12B;MMP9;PTGES;SOCS3;I
L15;MMP14;FAS;NOS2;FN1;IL10;PTGS2;IL1B;SOD2;CCL2;CCR5;ITGA5;CCL5;SELE;CXCL9;RGS4;ICAM1;
DCN;CX3CL1;TREM1;IL6;CXCL10;NFATC1;NCF1;NR4A3;PLAU;BCL2;MMP2;IL32;VCAM1;IRF4;MIF;PDE4
B
ghrelin 1.7095765
36
2.9997
3E-08
327 257
HTR2C;NPY;KISS1;SLC5A12;RBP4;NOX1;PDX1;BMP2;LCT;CEBPA;KITLG;TH;IL12A;POMC;PRL;IL18;E2F
1;KRT19;NPPB;SLC2A2;PLIN1;PPARG;AGRP;LHB;DDIT3;UCP3;MKI67;H2AFX;CNR1;CYCS;CDK6;IGFBP1;
DGAT2;SYP;PRKAA1;GPT;CCNA2;SLC6A4;CDKN1C;CASP3;BCL2L1;GLP1R;NQO1;SOAT1;SCN2A;EDN1;C
CNB1;SMAD3;NR1H3;PRKAA2;PROS1;MAOB;NR3C1;PPARA;ATF4;KCNJ11;PPARD;PER2;IGF1R;GSK3B;I
NSR;TNFRSF11B;CD46;CPT1A;CAB39;MAPK1;LCN2;SLC2A1;MAPK14;NFE2L2;NRF1;SOX9;TRPM4;CDK
1;ATG5;ACACA;UCN;CXCL1;IRS1;DBH;TNNI3;BGLAP;PRKCE;GNRH1;IL13;SIRT1;PRKCD;LPL;PCNA;FOX
O1;CAT;CDKN1B;NGF;CREB1;FASN;GRB2;TJP1;CDK2;LEP;JUN;GPR3;ESR2;TSC2;OXT;PRKAG1;SLC1A2;T
PO;PARP1;SMAD7;HMOX1;CYP19A1;SCD;TG;GJA1;UCP2;SMAD6;SREBF1;AKT1;COL2A1;RARA;FOXO3;N
FKBIA;CCND1;CASP12;VEGFA;RELA;MMP3;TGFBR2;ABCG1;HOXB4;OGT;ADIPOQ;AGTR1;MMP7;CDC42;
GHRL;OPRD1;PDK4;BMP8B;CYP11A1;NT5E;ANXA5;SPP1;CACNA1D;CXCL8;CTNNB1;MYC;IL1R1;ALDOA
;ABCA1;HIF1A;ATG7;TNFSF11;APLN;STAR;BAX;PER1;TGFB3;FBXO32;PRKN;ACAT1;PDK2;HSPA1A;RUN
X2;RAG1;KDR;FOS;NFKB2;MLYCD;CD36;SLC16A3;HMGB1;CXCL2;RAPGEF3;COX4I1;NOD2;TP53;CCR1;T
NF;CAMKK1;CYBA;ATM;BDNF;IL1RN;HDC;S100B;CCL19;AQP7;TGFB1;PRCP;SLC2A4;CPT1C;MIR221;FL
T1;ITGB1;PTPRN2;IL12B;ITGAX;MMP9;STRADA;SOCS3;IL15;SLC1A3;ADAMTS5;CLDN5;IRF1;EGR1;FAS;
AR;LEPR;NOS3;NOS2;FN1;TLR4;CASP1;IL10;PECAM1;VWF;PTGS2;CDH5;PGR;IL1B;SOD2;CCL2;CCR5;TR
PV1;CCL5;CCR7;S100A4;G6PC;ICAM1;OPRM1;TIMP1;WNT5A;VIM;NOX4;CX3CL1;CCR2;IL6;CCL3;MYLK;
ACTA2;COL1A1;KIT;IGF1;BCL2;MRC1;COL3A1;SERPINE1;MMP2;ACTG2;F2RL3;VCAM1;CCL4;COL1A2;M
IF;ADAMTS4
GLO1 1.7056057
31
2.1409
2E-05
25 25
CD24;AGER;CDKN1A;PDLIM5;RELA;PFKL;ANGPT2;ERN1;STAT1;MYC;CST3;CDKN2A;BAX;CXCR4;HSPA1
A;HMGB1;TP53;CTGF;LUM;ICAM1;TNC;IL6;BCL2;VCAM1;CXCL12

14. ADM2 1.6774842
74
9.5860
1E-10
65 59
PRDM16;HLA-
G;VEGFD;TH;NPPB;DDIT3;CASP3;HSP90B1;EDN1;HSPA5;MAP1LC3A;NGF;MUC1;OXT;PTEN;GJA1;CCND
1;PRDM1;CASP12;VEGFA;ANGPT2;CRP;SELP;ABCA1;TNFSF11;BECN1;BAX;GAP43;KDR;FOS;PGF;CD36;
TP53;TNF;LILRB3;HLA-DRB1;CSF1;TGFB1;MMP9;HLA-A;TLR4;CD82;CDH5;IL1B;CCL2;ICAM1;HLA-
DOA;MSR1;HLA-DMA;CCND2;NOX4;HLA-DQB1;CCR2;CD74;IL6;ACTA2;CIITA;BCL2;MMP2
NR2F2 1.6644794
39
1.9899
5E-05
160 132
SOX2;OPN1SW;FGFR3;APOB;GATA4;HNF4A;HNF1B;TERT;PDX1;NTS;CEBPA;MYOG;HNF1A;CDH1;NPAS
1;E2F1;APOC3;TFAP2A;CCNE1;PPARG;LHB;PROX1;MYL2;UCP3;APOA1;SOX6;POU5F1;RBP2;CENPF;IGF
BP1;RARB;EFNB2;CDH6;GLP1R;MYL4;ACOX1;IL1RAP;PPARA;NEK2;FOXM1;HEY1;ANG;CD44;SOX9;WN
T4;STPG4;WDR5;BGLAP;CETP;REN;CDKN1A;GCK;NDN;SLC9A1;RXRA;WT1;RHEB;REL;TJP1;CDK2;OXT;
CEBPB;SMAD7;EPHB4;INSL3;CYP19A1;SMAD6;FABP1;CCND1;TBX5;VEGFA;RELA;SHBG;TAT;ANGPT2;
MPC1;LDHA;PEA15;LBH;CYP17A1;CACNA1D;NFKB1;CXCL8;KCNK2;LIPC;STAR;CXCR4;WNT10B;EYA1;P
AX6;KDR;HEY2;CFTR;ZEB1;FABP2;NRP1;FOXC1;TP53;DLL4;BDNF;APOA2;SNAI1;IL1RN;NRP2;KCNJ5;N
OTCH1;RELB;GDNF;SLC2A4;TNFAIP3;FLT1;CDH11;FLT4;EGR1;AXIN2;AR;ANGPT1;LYVE1;PTGS2;PGR;A
2M;VEGFC;COL7A1;ICAM1;VIM;ZEB2;IL6;ACTA2;CACNA1C;IGF1;PLAU;PDPN
CNR2 1.6124515
5
1.0025
3E-14
134 113
SOX2;APOB;TH;NPHS1;POMC;IL18;ARG1;PLIN1;PPARG;CDC25C;APOA1;MKI67;TNFRSF11A;CNR1;CYCS
;CASP3;CCNB1;DAGLA;CPT1A;MAP1LC3A;MMP1;IL23A;DAGLB;BACE1;VASP;RPS6KB1;GRK5;CREB1;DU
SP6;MBP;HMOX1;SLC12A5;ADAM17;STAT3;ESM1;CD40;CCND1;VEGFA;LOX;MMP3;CDC42;ARRB2;P2R
Y12;RUNX1;CXCL8;CTNNB1;TIMP2;IL1R1;HIF1A;TNFSF11;ALOX5;BECN1;ABCB1;PGF;MMP12;DYNLT1;
ENO2;HMGB1;CXCL2;RAPGEF3;CCR1;TNF;DUSP1;HTR2A;BDNF;NES;IL1RN;RAC2;S100B;TGFB1;ANGPT
L1;ITGB1;IL12B;MMP9;IRF1;EGR1;NOS3;NOS2;FN1;TLR4;CREM;IL10;PTGS2;IL1B;CCL2;CD86;TRPV1;C
D4;CCL5;HAVCR2;ITGAM;PDGFRB;ICAM1;OPRM1;TIMP1;NCAM1;DLG4;TNC;CCR2;P2RY13;IL6;CCL3;CX
CL10;ACTA2;KIT;NCF1;CXCL5;BCL2;MRC1;COL3A1;VCAM1;CCL4;CXCL12
FRNK 1.6059101
37
3.4780
1E-05
23 22
CCL26;CDH1;SKP2;GATA6;BIRC5;CDKN1A;JUN;VEGFA;PXN;FADD;TIMP2;TGFB1;MMP9;CCL2;IL6;ACTA
2;PLAU;BCL2;TAGLN;MYH11;MMP2;VCAM1
CTLA4 1.6045149
06
1.8607
2E-07
97 80
CD160;IL18;CDH1;ARG1;ALDH1A1;MKI67;CDK6;EZH2;BCL10;BCL2L1;PDCD4;CCND3;CD44;SLC2A1;YA
P1;BGLAP;IL13;FOXO1;CDKN1B;BCL2L11;IDUA;REL;NFATC2;PTEN;CBL;STAT3;FOXO3;CD83;CDK4;PR
DM1;GATA3;MMP3;TGFBR2;IL4R;CBLB;STAT1;EOMES;BATF;NT5E;MAP1LC3B;CXCL8;MYC;TNFRSF1A;
WNT10B;RUNX2;FOS;TNF;TGFB1;CD28;CFLAR;ITGAX;COL11A2;FAS;ENTPD1;FOXP3;ALDH2;NOS2;TLR
4;IL10;PTGS2;IL1B;SOD2;CCR5;CD86;CCL5;CCR7;ICOS;FASLG;TBX21;CCND2;CD80;CD274;PDCD1;IL6;C
CL3;BCL2;CD69;IL16;CD38;ALDH1A3
NS1 1.5756771
94
1.6032
7E-08
106 90
IL18;MMP10;DNMT3B;CCL20;NEU1;IFNL1;BTRC;MOV10;PAF1;THRA;CD44;SOCS1;HPSE;CXCL16;TBK1;
IL13;PIAS4;CDKN1A;IFNAR1;ANXA1;IRF3;HMOX1;KLF6;MDM2;PTPN1;MMP8;CD83;IRF7;PRDM1;SMA
D2;DDX58;TRAF3;STAT2;NUP98;XBP1;OASL;IFIT1;IFIH1;PTPN2;CXCL8;PSMB8;ACTB;MYC;HIF1A;ISG1
5;HSPA1A;EIF4B;PPIA;TP53;TNF;DDIT4;CCL19;TGFB1;IFITM3;ITGB1;IRF5;MMP9;SOCS3;PIAS2;IRF1;M
MP14;FAS;PARP10;NOS2;HLA-
A;PSMB10;LYVE1;IL10;PTGS2;CDH5;IL1B;SOD2;CCL2;CD86;CCL5;RSAD2;MX1;FASLG;ICAM1;CD80;BST
2;IL6;CCL3;CXCL10;CTHRC1;PLAU;MMP2;IL32;CXCL12;CD38
CYLD 1.5689290
81
1.1711
1E-05
47 43
IL18;BIRC5;NFKBIB;NQO1;SMAD3;CDH2;BIRC7;NFE2L2;MMP1;JUN;CCND1;MAP2K3;DDX58;RELA;MM
P3;IFIH1;CXCL8;JAG2;MYC;PYCARD;BAX;GSDMD;FOS;CYBB;NOS2;FN1;CASP1;PTGS2;CCL2;RARRES3;CC
L5;SELE;ICOS;ICAM1;VIM;CX3CL1;IL6;CXCL10;BCL2;COL3A1;HGF;SERPINE1;VCAM1
UCP2 1.5212776
59
6.0518
4E-07
57 55
NPY;CEBPA;AGRP;DDIT3;SLC25A27;UCP3;CDK6;TNRC6A;MFN2;BNIP3;EDN1;AGO2;SLC2A1;CXCL16;CD
KN1A;DNM1L;HNRNPA2B1;VEGFA;ANGPT2;PKM;CAV1;CYP11A1;SLC25A14;CTNNB1;CCL24;HIF1A;BA
X;ACE;PINK1;CSF1;TNFAIP3;IRF5;FAS;FGF2;CYBB;NOS3;NOS2;IL10;PTGS2;IL1B;SOD2;CCL2;CPT1B;ITG
B2;ICAM1;SOD3;CX3CL1;IL6;CXCL10;SELL;THBS1;BCL2;SERPINE1;MMP2;VCAM1
MMP14 1.5118578
92
3.4288
1E-05
55 50
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PCNA;F3;JUN;MBP;SREBF1;VEGFA;MMP3;TAT;SPRY4;APP;SELP;CXCL8;TNFSF11;TGM2;LDLR;FOS;ZEB
1;ITGB1;MMP9;COL11A2;FLT4;ENG;NOS2;FN1;IGFBP7;CCL2;TEK;VEGFC;G6PC;PDGFRB;VIM;DKK3;FBN
1;ACTA2;SERPINE1;MMP2
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97
3.2080
7E-07
88 80
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PD1;SIRT1;CDKN1A;PCNA;WT1;BBC3;LEP;CYP1B1;CLU;JUN;ITGB4;SMAD7;MKNK2;SFRP5;COL2A1;CCN
D1;GATA3;VEGFA;RELA;ADIPOQ;STAT1;SPP1;CXCL8;BAX;IGFBP5;FBXO32;RUNX2;TIMP3;TNFRSF1B;F
OS;CFTR;ZEB1;HMGB1;IGFBP6;SDC2;SNAI1;NOTCH1;MMP9;SOCS3;EGR1;MMP14;FAS;FGF2;CD34;CHR
D;ANGPT1;CDH5;IGFBP4;CCL2;SPHK1;INHBA;ICAM1;ZEB2;FGF7;CNN1;NOX4;PLAT;COL1A1;IGF1;PLAU
;BCL2;SERPINE1;MMP2;VCAM1;CD38
KL 1.4757295
75
1.3920
9E-05
143 123
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MAG;TYRO3;EDN1;SMAD3;CDH2;TXNIP;AGER;TNFRSF11B;LCN2;HSPA5;NFE2L2;SOCS1;MAP1LC3A;SO
X9;MMP1;MPZ;GAD1;GNRH1;ESD;SIRT1;PRDX1;REN;CDKN1A;CASP9;PCNA;CAT;TRPV5;HCN4;CAST;M
BP;CEBPB;CEBPD;PRDX3;HMOX1;EDNRB;SCD;SNCA;MERTK;NFKBIA;CCND1;IRF7;CYP27B1;CASP12;VE
GFA;RELA;SLC20A2;MMP3;AGTR1;MMP7;ORAI3;STC1;SPP1;CXCL8;STIM1;CTNNB1;MYC;PRDX2;HIF1A;
KCNH2;KCNQ1;SOD1;STC2;BAX;TRPC6;PLP1;RUNX2;DNM2;FABP4;SERPINH1;TP53;SFRP4;ACE;TNF;SN
AI1;TGFB1;DNM3;MMP9;SOCS3;EGR1;CLDN11;GHR;CYBB;NOS3;NOS2;FN1;MITF;P2RX7;TLR4;PTGS2;I
L1B;SOD2;CCL2;CCL5;CTGF;ICAM1;WNT5A;VIM;NOX4;PDLIM2;IL6;ACTA2;COL1A1;COL10A1;BCL2;MM
P2;ACTG2;VCAM1;ILK
MIR146B 1.4605934
87
4.0394
8E-05
56 48
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3;TG;ETS2;CCND1;ADIPOQ;STAT1;KEAP1;CXCL8;MYC;BAX;CXCR4;HSPA1A;TIMP3;FZD6;NOD2;TNF;UH
RF1;BDNF;CCL19;MMP9;PTGES;HSPE1;TLR4;CCL5;TWIST1;NTRK2;VIM;RORC;IL6;CCL3;CXCL10;KIT;BC
L2
APOE 1.4269353
8
1.2898
E-05
192 172
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1;MKI67;PON2;CALM3;NFYA;CYCS;SLC17A7;SYP;VEGFB;CCNA2;CASP3;AGRN;RNLS;TGFB2;ADNP;CCNB
1;SMAD3;ACADS;ATF4;LPAR1;KL;SP7;CD44;CPT1A;SLC2A1;CLDN7;PSEN1;NFE2L2;HSPA9;TOMM40;CA
MK2D;YAP1;BACE1;EGFR;CXCL1;MESD;COX5A;APOD;BGLAP;PRKCE;IL13;SIRT1;MADD;SYNJ1;DCSTAM
P;LRPAP1;PPP2R5E;NPC1;MEF2A;COMMD6;CLDN15;CLU;IDE;CLDN2;HMOX1;ADAM10;BMP4;SCD;SIRT
2;SCARB1;CD40;SCARB2;FABP1;ABCG2;CCND1;PDGFB;CALM2;VEGFA;FKBP4;LOX;BIN1;MME;ADIPOQ;I
GF2R;MMP7;ABCC1;PFN1;CRP;SERPINB2;HDAC4;CA9;CYP11A1;APP;FKBP5;CYP17A1;CXCL8;APOC1;SL
C5A1;ABCA1;NOG;BAX;PLAUR;CXCR4;OLR1;TGFB3;ACAT1;PLA2G7;RUNX2;ABCB1;GAP43;FABP4;KDR;
FOS;CALB1;MAPT;LTA;IGFBP6;ACE;TNF;HTR2A;CTSK;HSPG2;M6PR;SPI1;BDNF;ATP6V1B2;IL1RN;SLC2
7A1;CTSB;LRP8;PIN1;MMP9;SOCS3;OSCAR;CLDN5;EGR1;MAFB;AR;SIRPB1;CYBB;NOS2;FN1;TLR4;IL10;
PTGS2;IL1B;SLC27A5;CCL2;ICAM1;TIMP1;TLR2;EEF1A1;DLG4;TBX21;NOX4;RORC;COL8A1;CCR2;SAA1;
IL6;CCL3;NFATC1;ACTA2;PLAU;BCL2;VCAN;MMP2;VCAM1
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9
1.4656
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3;NEUROD1;TPH1;GABRB2;SLC2A2;KISS1R;PPARG;NEUROG3;AGRP;SKP2;DDIT3;MGAT3;DUOX1;UCP3;
APOA1;PAX4;POU5F1;NR2F2;IGFBP1;SYP;GSR;CASP3;BCL2L1;MFN2;PNPLA2;BNIP3;CTRB2;FNDC5;PR
KAA2;TRPC5;NR3C1;PPARA;ATF4;TXNIP;KCNJ11;CCND3;MAPK8IP1;ADIPOR1;NKX6-
1;IGF1R;AGER;ARRB1;TNFRSF11B;ATF6;CPT1A;SLC2A1;HSPA5;MAPK14;PSEN1;APEX1;NFE2L2;GIPR;S
IRT3;WNT4;BACE1;EGFR;KLF15;MTOR;DBH;ADRB1;BGLAP;IL13;SIRT1;RGS2;LPL;CDKN1A;HDAC6;CAT
;GCK;NGF;OCLN;LIPE;FASN;DUSP14;LEP;APOA4;JUN;IDE;SIRT6;SLC1A2;CEBPB;PARP1;HMOX1;EDNRB;
SCD;PASK;UCP2;SMAD6;SREBF1;AKT1;CCND1;ATP2A2;CASP12;VEGFA;ABCG1;ADIPOQ;AGTR1;PRMT1;
GPX1;XBP1;APP;GCH1;CXCL8;STK11;TSC22D3;CCL24;MAPK12;ABCA1;BAK1;BAX;ACAT1;HSPA1A;BIRC
3;RUNX2;ATP5F1A;TBX2;KDR;FOS;CD36;SSTR2;MAPT;IKBKB;HMGB1;TP53;TNF;BTC;HTR2A;BHLHE40
;CYBA;IRS2;NAMPT;BDNF;PTPRN;NOTCH1;IL33;GDNF;AQP7;TGFB1;SLC2A4;BTG2;FLT1;MMP9;CLDN5;
FAS;JUNB;MAFB;CYBB;NOS3;NOS2;FN1;ELN;TLR4;CREM;IL10;PTGS2;CDH5;IL1B;SOD2;CCL2;TRPV1;CT
GF;G6PC;ITGAM;ICAM1;TIMP1;NANOG;SOD3;DLG4;CCND2;NOX4;IL6;TXNDC5;ACTA2;COL1A1;KIT;NCF
1;IGF1;NR4A1;BCL2;CD69;COL3A1;SERPINE1;MMP2;VCAM1
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IA;PPARG;SKP2;PTPN13;MKI67;CDKN2B;LHX2;CDK6;DNMT3B;KLF4;BCL2L1;EFNA3;PNPLA2;TLE1;SC
RIB;PHLPP1;NQO1;IBSP;CCNB1;NR1H3;PROS1;HEY1;HDAC11;MIR200A;BCAT2;PER2;DLG1;TNFRSF11

15. 62 9E-08
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EBPD;PARP1;HMOX1;ADAM10;PTEN;VANGL2;TBX5;GATA3;VEGFA;MMP3;ABCG1;ADIPOQ;LSS;DEFB1;
KLF2;DNMT1;GSC;NPTN-
IT1;CA9;NR4A2;STC1;HDAC8;SPP1;CXCL8;CTNNB1;MIR200B;FGF1;CRY1;TSC22D3;ABCA1;ALOX5;BAK
1;TEAD4;CDKN2A;BAX;GATA2;CXCR4;PER1;NCR3LG1;HSPA1A;GDF11;BIRC3;ABCB1;LDLR;KCNN4;HBB
;FOS;CXCL2;ANO1;ARNTL;TNF;DUSP5;CTSK;AKAP12;NAMPT;BDNF;NOTCH1;SMARCA2;LGALS9;TGFB1;
SGK1;CFLAR;IL12B;MMP9;SOCS3;AMPD3;EGR1;AXIN2;AQP3;FAS;FOXP3;FSCN1;NOS2;P2RX7;TLR4;IL1
0;PECAM1;VWF;PTGS2;CDH5;IL1B;CCL2;ITGA5;ADAM12;TNFSF9;TIMP1;EEF1A1;SOD3;ENPP2;ESR1;C
D274;NOX4;IGFBP2;VDR;CCR2;IL6;CCL3;CXCL10;KIT;NR4A1;NR4A3;MEG3;SERPINE1;MMP2;VCAM1;C
CL4;ADAMTS4
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62
2.8405
7E-06
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;MMP9;SOCS3;NOS2;IL10;CDH5;IL1B;CD86;CCL5;TLR2;INPP5D;CD80;CD274;IL6;ACTA2;MMP2;ADAMT
S4
interleukin
-35
1.4055638
57
1.6769
7E-11
63 50
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CL8;CCL24;TNFSF11;IGFBP5;CXCR4;TGFB3;KDR;TNF;CD1D;TGFB1;FLT1;TRAF1;MMP9;SOCS3;FGF2;EN
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91
4.0417
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5.2029
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1;EPAS1;ANXA1;BBC3;F7;LEP;SMURF2;BMP4;CD83;CCND1;SMAD2;NDRG2;ADIPOQ;MT1F;BATF;CXCL8
;MYC;HIF1A;TNFSF11;RUNX2;FOS;RPS6KA2;DUSP1;SPI1;BDNF;SGK1;FAS;FOXP3;NOS2;IL10;PTGS2;CC
L2;CD86;INHBA;FASLG;ICAM1;TLR2;LILRB4;CD80;CD274;CX3CL1;IL6;CCL3;CXCL10;BCL2;SERPINE1
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E-06
63 51
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TR;IGFBP1;SLC25A1;SLC25A13;CCL20;IFNL1;SLC2A1;MUC5AC;CDX2;CYP2C8;CEBPB;CEBPD;CYP3A7;T
F;STAT2;TAT;IFIT1;CCL24;CASP4;SLC28A2;GAPDH;FRZB;CYP2C19;IL33;IKBKE;IRF1;CASP1;TLR3;G6PC
;SERPINA1;ESR1;NOX4;IRF9;IGF1;COL10A1;PDGFRA;MUC5B
GHRL 1.3471506
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8E-06
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;ACTB;SOD1;IGFBP5;PER1;FBXO32;FOS;CALB1;GAPDH;ARNTL;ACE;TNF;DUSP1;SLC2A4;EGR1;FAS;LEP
R;GHR;PTGS2;IL1B;CCL2;SOD3;VDR;IL6;IGF1;MIF
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4E-06
14 11
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ZBTB16 1.2977713
69
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1E-05
102 73
FGFR3;GATA4;SHH;CEBPA;PPARG;ASCL1;ID2;NCOR1;ATG14;CCNA2;PBX1;CEBPE;CDH2;PIK3C2A;SP7;L
CN2;SOX9;PIK3R1;LIN28A;BGLAP;CDKN1A;MXD1;ABCE1;IL3RA;PARP1;LRIG1;COL2A1;IK;SIN3A;PCGF
6;MCL1;CRTC1;IL4R;ADIPOQ;ILF3;STAT1;STC1;MYC;IFIT2;CXCR4;PLSCR1;CD7;ATP6AP2;AURKC;RUNX
2;FABP4;ZEB1;CSF3R;TP53;DDIT4;GFI1;FBXW7;MIR221;EGR1;FCER1G;LEF1;BACH2;IL7R;EPHB3;HOX
B2;RSAD2;G6PC;VIM;CCND2;NOX4;RORC;KLRK1;CXCL10;ACTA2;COL1A1;KIT;COL10A1;NR4A3
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49
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1E-09
43 41
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CTNNB1;MYC;RUNX2;ZEB1;CTSK;CMD1F;KCNJ8;MYOCD;CDH11;FOXC2;FOXF1;SPON1;SNAI2;SPARC;AB
CC9;CCL5;SMAD1;TWIST1;POSTN;PDGFRB;WNT5A;VIM;ZEB2;ACTA2;ITGB3;PDGFRA;ITGBL1
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49
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6E-06
39 35
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NOG;IL6;IGF1;BCL2;MEIS3;VCAM1
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09
1.2556
4E-14
404 348
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1;CDH1;TXNRD1;ARG1;CYP8B1;JAZF1;APOC3;RTN4R;SLC2A2;SLC38A4;USP2;GPLD1;HES1;PPARG;TXN
2;AGRP;CFD;HSD3B1;MMP10;UCP3;SREBF2;APOA1;PID1;SLC25A4;BIRC5;CDK6;IGFBP1;DNMT3B;PRK
AA1;RAB5B;GPT;PPARGC1B;CASP3;BCL2L1;MFN2;VLDLR;PNPLA2;CCL20;FABP3;PRDX5;NQO1;PAK1;H
MGCR;PRKCA;ACADSB;IBSP;LRP1B;PDCD4;ACADS;NR1H3;ULK1;ARNT;PPARA;CERS2;ADIPOR1;KL;SLC
27A4;IGF1R;GPR17;TRAF6;AGER;SP7;TNFRSF11B;CD44;CPT1A;LCN2;SLC2A1;TNFAIP1;NFE2L2;P4HA1
;SOCS1;MAP1LC3A;SOX9;MMP1;ATG5;BIRC2;MAP3K14;MTOR;CXCL1;IRS1;TFPI;TNNI3;IL13;CREBRF;C
S;LPL;CDKN1A;CASP9;PCNA;CAT;CDKN1B;BAMBI;ABHD5;F3;ITGAV;APPL1;DEGS1;SLC38A2;OCLN;GRK
2;FASN;FOXO4;TRAF3IP2;TXN;TNFSF10;F7;LEP;MIR29B1;ROR1;TYRP1;SDC1;JUN;MYD88;ESR2;IRAK1;
PRDX3;BCL3;HMOX1;SLC2A8;BMP4;CYP19A1;PTEN;SCD;PTPN1;GJA1;UCP2;ESM1;RPL13;CD40;SREBF1
;PON1;AKT1;KDM6B;COL2A1;EGF;MERTK;PTGIS;FOXO3;NFKBIA;SOGA1;NR2C1;ZFP36L1;ADIPOR2;STE
AP4;CCND1;EIF2AK3;VCL;CAMKK2;PCK2;VEGFA;RELA;PPM1K;SHBG;MMP3;SMARCA4;ABCG1;BAD;CCN
E2;BCKDK;HBEGF;SHC1;PRKAB1;CERS4;CRP;CAV1;HNRNPK;PDK4;SQSTM1;RTN4;CYP11A1;CYP17A1;
MAP1LC3B;SELP;SPP1;CXCL8;CCRL2;NISCH;CTNNB1;MYC;STK11;SELENOP;TIMP2;LYZ;ABCB4;PTX3;C
CL24;IL1R1;ABCA1;TNFSF11;SOD1;BECN1;LRP1;STAR;CDKN2A;GAS6;BMP7;BAX;CXCR4;OLR1;FBXO32
;ACOT9;PRKN;ACAT1;CXCL3;RUNX2;LDLR;TIMP3;FABP4;KDR;FOS;CD36;ACP5;MMP12;PTHLH;IL11;W
NT9A;CXCL2;COX4I1;TP53;CHUK;TNF;DUSP1;AOX1;CYSLTR2;UHRF1;PITRM1;CTSK;ASGR1;CYBA;IRS2;
PINK1;BDNF;APOA2;IL1RN;SLC27A1;NOTCH1;TGFB1;SLC2A4;ITGB1;IL12B;TRAF1;ADAMTS9;MMP9;P
TGES;SOCS3;CLDN5;FOXC2;EGR1;AXIN2;AQP3;MMP14;FAS;FGF2;CLEC10A;FOXP3;CMKLR1;CYBB;IRAK
3;NOS3;NOS2;FN1;MITF;ELN;TLR4;ITGAL;WNT2;CASP1;IL10;PECAM1;VWF;PTGS2;SIGLEC10;PGR;IL1B
;SOD2;SPARC;CCL2;CCR5;C3AR1;CD86;CPT1B;CD4;CCL5;CDH13;SELE;VEGFC;CXCL9;CTGF;G6PC;SLC2A
3;NTRK2;FASLG;ANXA6;ICAM1;TIMP1;TLR2;VIM;MSR1;DCN;FGF7;TBX21;PTPRC;CD80;ESR1;CD274;OS
M;NOX4;IGFBP2;RORC;C3;CCR2;IL6;CCL3;TXNDC5;CXCL10;NFATC1;ACTA2;COL1A1;FABP5;COL10A1;C
D14;BCL2;CD69;MRC1;RARRES2;COL3A1;SERPINE1;VCAN;MMP2;ACTG2;HAS2;VCAM1;IRF4;COL1A2
C1QTNF6 1.2649110
64
2.2223
5E-06
12 12
VEGFA;CXCL8;TNF;ITGAX;NOS3;IL10;IL1B;CTGF;IL6;ACTA2;TAGLN;COL3A1
ERAP1 1.2649110
64
2.5861
8E-05
20 13
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immunogl
obulin
1.2602520
76
2.04E-
13
122 100
GCNT4;GJB1;FTL;IL18;CDH1;E2F1;ALOX15;BTG1;GPT;CASP3;BCL2L1;CCL20;CD44;TFRC;TFF3;C2;PRX;
MAP4K2;SIRT1;F3;RUBCN;ETV4;THYN1;TJP1;TXN;HAMP;CLU;JUN;MYD88;MBP;NFKBIA;CD83;TNFSF1
3B;CX3CR1;IL13RA1;PTPN2;LAMP1;CXCL8;JAG2;MYC;ID3;TNFRSF1A;BAX;PLP1;RAG1;FCER1A;NFKB2;
MMP12;HMGB1;CXCL2;LTA;TNF;TNFSF4;CMD1F;CSF1;IL1RN;UCHL1;IL33;CCL19;TGFB1;BTG2;MMP9;E
GR1;EGR2;KLRB1;CD5;NOS3;TLR4;CASP1;IL10;PTGS2;IL1B;CCL2;CD86;CCL5;SELE;CTGF;ITGAM;CCL21
;ICAM1;TLR2;PTPRC;CD80;RORC;IL6;FCGR2B;PLAT;CCL3;MYLK;CXCL13;TLR8;NR4A1;CD14;BCL2;CD6
9;IL16;EGR3;MMP2;VCAM1;CCL4
HHEX 1.2247448 1.4166 46 41
FOXE1;ONECUT1;HNF4A;PDX1;SLC10A1;PROX1;NR2F2;CDK6;CASP3;TLE4;ITGAV;CDK2;JUN;MYH10;B
MP4;CDX1;TG;ESM1;VEGFA;ADCY6;NPR3;EOMES;SLC39A14;APLN;KDR;NRP1;GAPDH;SOX18;TP53;FLT
1;FLT4;FGF2;TIE1;TEK;VEGFC;IL6;ACTA2;CACNA1C;BCL2;TAGLN;MYH11

16. 71 9E-05
beta-
endorphin
1.2247448
71
3.0756
3E-05
43 33
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BDNF;PRCP;MMP9;ADCY7;PRF1;NOS3;NOS2;IL10;IL1B;CCL5;ITGAM;OPRM1;IL6;NR4A3;IL16;MMP2;MI
F
MIR126 1.1795356
49
6.4045
5E-06
93 84
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RAC1;ROCK1;IL23R;PPARA;NKX6-
1;KL;SOCS1;TOMM40;CASP8;PCNA;CAT;F3;HOXB3;ZNF286B;ABCE1;PTEN;STAT3;SMAD4;CDK4;CCND1
;IRF7;GATA3;ABCC1;EBF1;KRT6A;CXCL8;CTNNB1;FGF1;CDKN2A;BAX;TGFB3;F10;JAK2;IKBKB;TCF3;PA
X5;CHUK;S1PR2;TNF;DLL4;MYB;NRP2;RAC2;MYOCD;SLC2A4;MMP9;F8;FGF2;FOXP3;NOS3;ITGAL;IL10;
PECAM1;VWF;IL1B;SOD2;CRYAB;CD70;SELE;TLR3;G6PC;ICAM1;NANOG;IL6;ACTA2;IGF1;TAGLN;PDGF
RA;MMP2;POU2AF1
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38
5.3201
3E-10
97 78
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P;TNFSF10;DAG1;TRMU;CBL;AKT1;COL2A1;PFN2;PTBP1;TBX5;MCL1;PTK2;IFIT1;ALPL;PSMB8;MYC;IFI
T2;BECN1;GTPBP3;RUNX2;PAX6;CAMTA1;MTO1;GALNT4;NPR1;IL11;TP53;NES;SNAI1;FLNA;TP73;CLD
N14;IRF5;MMP9;IRF1;FLT4;FSTL1;AR;NOS3;PSMB10;SYN1;ASS1;CASP1;IL10;CDH5;IL7R;IL1B;CCL5;GL
I3;SYTL4;TIMP1;VIM;DLG4;IFI44L;LILRB2;ACTA2;COL1A1;BCL2;CD69;MMP2;ACTG2;IFI27
chymotryp
sin
1.1547005
38
2.4834
2E-05
19 15
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PPAR 1.0999438
82
1.1065
2E-08
460 391
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SLC16A7;PRODH;ABCA12;ALDH1A2;GPAT3;PCSK9;BCO1;CREB3L3;NPHS1;HOXA10;PRL;IL18;CDH1;AC
E2;MSTN;ARG1;THRB;HPGD;MOGAT1;APOC3;NEUROD1;KRT1;NPPB;SLC2A2;TRIB3;PLIN1;PPARG;AKR
1C2;LHB;OIP5;DGAT1;PANK1;UCP3;APOA1;MGLL;PEX11A;GSTP1;AKAP1;CIDEC;ACSS2;ALDH3A2;SULT
2B1;CNR1;CYP1A1;RBP2;NR2F2;CYCS;HK2;SNCG;IGFBP1;GDF15;CYP4B1;LRP2;NCOR1;GPT;PPARGC1B;
CCNA2;NFKBIB;KLF4;MFN2;VLDLR;PNPLA2;GLP1R;AGPAT2;FABP3;PLA2G16;GPD1;NR1D1;HMGCR;AK
R1C3;IBSP;EDN1;ERO1A;GPD2;PDCD4;SNAP25;XDH;NR1H3;ACOX1;TFAM;PPARA;TXNIP;KCNJ11;IVL;K
YAT3;KL;PPARD;SLC22A1;SLC27A4;INSIG1;INSIG2;PLA2G6;NR1D2;AGER;TNFRSF11B;ESRRA;CPT1A;L
CN2;SLC2A1;MT1H;NFE2L2;PIK3R1;MMP1;SLC16A1;PC;HILPDA;BACE1;EGFR;GLS;KLF15;ACACA;DDA
H2;RHOC;MT1G;IRS1;TNIP1;BGLAP;CETP;APOM;IL13;SIRT1;ELOVL5;REN;MTHFR;LPL;CDKN1A;FOXO1
;CAT;TTPA;ACADM;GCK;YWHAB;F3;RXRA;TSC22D1;EPAS1;LIPE;CYP2A6;NPC1;FASN;MUC1;RIDA;TXN;
TNFSF10;LEP;TYRP1;SDC1;TGM1;IDE;MYD88;ESR2;TFEB;OXT;SLC1A2;HSD11B2;HMOX1;EDNRB;CALR
;PLIN4;ADAM10;CYP26B1;STS;STARD3;CYP19A1;SELENBP1;TF;GYG1;ACOT2;PTEN;SCD;CBL;STAT3;GJ
A1;UCP2;SCARB1;CD40;SCARB2;SREBF1;PON1;COL2A1;MERTK;FABP1;NFKBIA;KYAT1;RGS5;ADIPOR2;
GABPA;ABCG2;CCND1;LPCAT3;PLTP;BSG;GATA3;VEGFA;S1PR1;CRAT;SHBG;SORBS1;MMP3;MME;GRN;
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BMP8B;SCP2;IFIT1;GSTK1;ASCL2;SLC22A4;APP;TREM2;SELP;SPP1;CXCL8;ACSL1;CTNNB1;NPC2;MYC;
NPC1L1;FGF1;TIMP2;ABCB4;GPRASP1;ABCA1;TNFSF11;SOD1;CPT2;GPX3;UGT2B4;APLN;LRP1;APOBR;
CDKN2A;GBA;BAX;GATA2;IGFBP5;CXCR4;OLR1;PLA2G7;ACADVL;FFAR4;TGM2;APOE;ABCB1;LIPG;LDL
R;FABP4;KDR;FOS;NUCB2;PRKACA;GK;CD36;HSPA6;MMP12;CUBN;HMGB1;CALD1;FABP2;GAPDH;ARN
TL;ACE;CCR1;TNF;DUSP1;CYP27A1;ADAMTS1;SEMA6B;SAT1;NR0B2;IRS2;IL1RL1;NAMPT;NES;APOA2;
IL1RN;SLC27A1;IL33;TSPO;NR1I2;VNN1;AQP7;TGFB1;SLC2A4;PLA2G2A;FLT1;MMP9;SOCS3;GPIHBP1;
MIR142;EGR1;AQP3;FAS;AR;FOXP3;G0S2;LEPR;GHR;THBD;ALDH2;CYBB;NOS3;NOS2;FN1;MITF;RBP1;T
LR4;ASS1;IL10;MT1L;MT1X;PECAM1;PTGS2;ANGPTL4;CXCR3;IL1B;SOD2;CCL2;PTGS1;ITGA5;CPT1B;CC
L5;SELE;MFGE8;CXCL9;AXL;CTGF;VNN2;G6PC;SLC2A3;ICAM1;HAS1;UGT1A1;MSR1;TBX21;CCND2;CES
3;ESR1;TBXAS1;NOX4;IGFBP2;C1QA;RORC;VDR;CCR2;TBXA2R;TUBA1B;IL6;CXCL10;ACTA2;THBS1;FAB
P5;CD14;BCL2;HGF;SERPINE1;PDGFRA;MMP2;ACTG2;HAS2;VCAM1;FADS2
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7
3.3993
6E-10
48 38
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L22;TGFB1;IL12B;ITGAX;FOXP3;NOS2;TLR4;IL10;PTGS2;IL1B;CD86;CCL5;CCR7;ITGB2;ITGAM;CCL21;V
IM;IL6;CCL3;CD209;CD69;MMP2;ACTG2
TNFAIP6 1.0425720
7
1.7316
9E-05
30 27
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P9;ADAMTS5;FAS;NOS2;PTGS2;CCL2;FASLG;ICAM1;IL6;COL3A1;MMP2;VCAM1;ADAMTS4
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11
9.5456
9E-08
212 169
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MIR483;BCL6;ANG;MUC5AC;RXRB;SOCS1;TCERG1;LIN28A;GAD1;MGAT5;WDR5;FXN;FEN1;RGS2;HCFC
1R1;CDKN1A;SBSN;DUSP6;WT1;STMN2;RBL2;ZBTB16;BBC3;IPO13;CSNK2A1;NAPRT;JUN;RB1;JAG1;H
MOX1;MRPS30;ADAM17;EIF2S3;KDM6B;IFNGR1;PARD3;RPS3;HTT;HNRNPD;FMR1;ATXN7;NF1;CCND1
;KDM5C;PRDM1;VEGFA;MLH1;RPH3AL;WRAP53;SIGIRR;TNFAIP2;GTF2I;CAV1;APP;ORMDL3;RUNX1;S
AMD4A;MYC;LYZ;RASGRF1;D2HGDH;KCNQ1;NOTCH3;NTF3;CDKN2A;BAX;IRAK2;ISG15;CDKN2B-
AS1;RASSF1;DMPK;PCDHGB7;RUNX2;PAX6;HBB;CFTR;MUC6;IER2;TP53;TAL1;TNF;MYB;SPI1;PVT1;BD
NF;HLA-
DRB1;SUSD3;LHX6;WNT11;RAMP3;H19;IFITM3;RUBCNL;IL12B;COL11A2;LMO2;RCN1;EGR1;FSTL1;FO
XP3;CD34;KCNQ5;FADS1;RARRES1;PTGS2;ANGPTL4;CCL2;CD86;CCR7;HLA-
DRA;DUSP2;NANOG;PTPRC;CD80;RORC;AUTS2;PDCD1;IL6;HLA-
DQA1;CIITA;CTCFL;MEG3;RNASE4;PDGFRA;XAF1;RPL18A;IFI27;SNRPN;GREM1
ENG 1.0289915
11
2.9732
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61 56
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LEP;NTHL1;SMAD4;COL2A1;CPA5;NBN;CCND1;VEGFA;ANGPT2;CTNNB1;MYC;BECN1;KDR;SIRPA;CYR6
1;ITGB1;ANPEP;EGR1;NOS3;NOS2;FN1;PTGS2;IL1B;CCL2;LAMA2;SELE;CTGF;LUM;VIM;SOD3;IL6;ACTA
2;PSTPIP1;ITGA11;PLAU;ITGB3;SERPINE1;MMP2;ACTG2;VCAM1;CXCL12
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16
4.6280
7E-06
110 99
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MAFA;SMAD3;MAP3K5;NAPB;AGER;SLC2A1;MMP1;RIPK1;EGFR;CXCL1;IL13;CDKN1A;CASP9;CDKN1B;
ACADM;PON3;FOXO4;TRAF2;CYP1B1;PARP1;SMAD7;HMOX1;NEFM;TG;KCNC1;CD40;NFKBIA;CCND1;C
ASP12;VEGFA;RIPK3;ERN1;CXCL8;CTNNB1;ACTB;MYC;LZTS2;SKIL;DCBLD2;HIF1A;BAX;OLR1;CXCL3;A
POE;ABCB1;FOS;MMP12;CXCL2;TP53;TNF;DUSP1;SAT1;CYBA;AKAP12;BDNF;IL1RN;IGFBP3;GDNF;CYB
B;NOS2;ASS1;IL10;CDH5;PGR;IL1B;SOD2;CCL2;CD86;CPT1B;CDH13;S100A4;FASLG;ICAM1;ESR1;IL6;CC
L3;SELL;COL1A1;CD14;BCL2;MRC1;VCAM1;MIF
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3E-05
15 15
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28
2.2485
1E-36
510 412
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G;NOX1;ALOX12;BMP2;MYOG;NPHS1;IL12A;F2;DDAH1;POMC;CHIT1;IL18;SCGB3A2;CDH1;CYP4F3;SLC
7A2;ARG1;HPGD;EZR;FUT3;PRLR;DSG2;MKI67;TNFRSF11A;COL17A1;H2AFX;IL13RA2;S100A9;XIAP;FA
AH;BIRC5;GRIN2A;HSD17B14;LRP2;EPOR;ULBP1;SCN8A;MICB;NFKBIB;CASP3;BCL2L1;EP300;CCL20;H
MGCR;RC3H1;TGFB2;NTN1;EDN1;GANAB;SMAD3;HSP90AB1;CPOX;NR3C1;SLC40A1;DNMT3A;PPBP;US
P18;KPNA4;BCL6;NFKBIZ;SP7;TNFRSF11B;CD44;TFRC;MICA;CIP2A;KRT18;LCN2;SLC2A1;HSPA5;CD55;
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17. BGLAP;CD59;IL13;AIP;PRDX1;CDKN1B;S100A8;BCL2L11;F3;HSP90AA1;NGF;OCLN;ULBP2;ARG2;CD1C;
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BCL3;HMOX1;RHOA;ETV3;IL6ST;ADAM17;TNFRSF10A;BMP4;CYP19A1;STAT3;CBFB;CD40;SREBF1;COL
2A1;MERTK;SCN3A;RPS3;NFKBIA;CD83;ETS2;SLC11A2;TNFSF13B;LAMP3;CCL18;AHSG;SMAD2;MCL1;
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1;IL1R2;FTH1;SERPINB2;HRH4;XBP1;CX3CR1;CD200R1;IL13RA1;PROCR;BATF2;IFIT1;C1QBP;TREM2;S
ELP;PTPN2;LAMP1;CXCL8;PSMB8;HYAL3;SELENOP;FER;TSC22D3;PTX3;CCL24;IL1R1;P4HA2;ITGAE;AB
CA1;IFIT2;TNFSF11;SOD1;TNFRSF1A;CST3;BAK1;NTF3;STAR;IL24;GAS6;BAX;PLAUR;CXCR4;MKNK1;O
LR1;HYAL1;LY75;ACAT1;B3GAT1;CXCL3;BCL7C;RUNX2;ABCB1;GAP43;LDLR;PIK3C3;TNFRSF1B;BCL2A
1;LTC4S;NDEL1;FOS;CXCR2;CD36;MMP12;SERPINH1;CXCL2;LTA;TNFSF14;NGFR;CTSS;PAX5;CHUK;ESA
M;PRNP;ACE;CCR1;TNF;DUSP1;MS4A1;SOCS2;CCL22;IFIT3;PITRM1;AQP1;HYAL2;SBNO2;LY96;MARCH
1;LILRB3;CSF1;TAP2;PLA2G2D;IL1RN;TAP1;CTSB;PILRA;LTB4R;SIRPA;OAS1;GDNF;TGFB1;SLC2A4;CHI
3L1;CCL16;CFLAR;TNFRSF13B;PLA2G2A;FLT1;GPNMB;CDH11;IL12B;MMP9;ANPEP;COL11A2;DSG3;SO
CS3;CLDN5;F8;SIGLEC1;IRF1;EGR1;B2M;MMP14;FAS;FGF2;MAFB;ENTPD1;COMP;FOXP3;THBD;CYBB;D
AB2;PRF1;NOS3;FYN;PSMB9;CLEC5A;NOS2;FN1;HLA-
A;MITF;P2RX7;ELN;CASP1;PECAM1;PTGS2;MT2A;MIR155HG;TNFAIP6;IRF8;CXCR3;IL1B;SOD2;CCL2;T
EK;CCR5;PTGS1;C3AR1;CD86;CLEC1A;CD70;CCL5;CCR7;RUNX3;S100A4;SELE;SPHK1;GPR183;CSF1R;LI
F;VEGFC;CXCL9;SLAMF1;IL12RB2;AXL;ITGAM;FASLG;ICAM1;OPRM1;TIMP1;HAS1;WNT5A;VIM;UGT1A
1;HSD11B1;FHL2;MSR1;DCN;LILRB4;PTPRC;INPP5D;CD80;LILRA5;LILRB2;TLR1;CD274;BST2;SELPLG;
RORC;FCGR3A;FCGR3B;TREM1;ADAM19;BMP6;C3;THY1;CR1;VSIG4;CCR2;IL10RA;IL6;KLRK1;ITGA4;FC
GR2B;CCL3;CEMIP;CXCL10;NFATC1;ACTA2;SELL;COL1A1;KIT;THBS1;CXCL13;CIITA;DISC1;COL10A1;C
D14;WISP1;CXCL5;BCL2;CD69;MRC1;CD163;CKLF;COL3A1;SERPINE1;IL12RB1;CD27;MMP2;ACTG2;FA
P;THBS2;HAS2;VCAM1;CCL4;MRC2;CXCL12;KLRD1;CD38;ADAMTS4;FCGR2A;PTGDS;JCHAIN;PDE4B;CD
68
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27
8.208E
-06
66 52
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;NFATC2;AQP5;CYP19A1;GJA1;VEGFA;ADCY9;MMP3;APP;SELP;SPP1;CXCL8;CCL24;TNFSF11;CYLD;STA
R;PDE7B;TNF;DUSP1;BDNF;TGFB1;AR;NOS2;MITF;CREM;IL10;PTGS2;C5AR1;PGR;IL1B;CCL2;CCL5;SEL
E;ITGAM;ICAM1;PLAT;CCL3;COL1A1;ACTG2;VCAM1
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49
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5E-05
45 35
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DIPOQ;CTNNB1;BAX;PLAUR;FOS;TNF;BDNF;TGFB1;SLC2A4;MMP9;EGR1;NOS2;IL10;PTGS2;IL1B;TIMP
1;IL6;COL1A1;MMP2
TBX2 0.9622504
49
3.0794
4E-05
56 46
LMOD2;SHH;MYCN;MYOG;FLRT3;CDH1;FGF10;RHOU;TBX1;ACTA1;TGFB2;FOXM1;HEY1;SRF;CDKN1A;
TYRP1;ADAM10;BMP4;PTEN;GJA1;CCND1;TBX5;VEGFA;NDRG2;OCA2;SCN5A;COL4A3;CDKN2A;BMP7;
NDRG4;GJC1;GAPDH;NOTCH1;WNT11;EGR2;FLRT2;GJA5;SHISA2;PML;POSTN;TBX3;COL1A1;HAS2;COL
1A2;CXCL12;GREM1
DCN 0.9615239
48
1.6724
1E-06
89 81
TERT;MYOG;CDH1;SEMA3A;MET;MSX2;PTPRZ1;BCAN;NCAN;CDKN1C;RAC1;PDCD4;INSR;HS2ST1;KER
A;MAP1LC3A;SOX9;MMP1;CASP8;EGFR;IRS1;ERBB2;ADAM9;CDKN1A;CDKN1B;SDC1;BMP4;CBL;SMAD
6;MMP8;COL2A1;CCND1;VCL;VEGFA;MMP3;TGFBR2;TCHP;CXCL8;CTNNB1;TPI1;TIMP2;HIF1A;BECN1;
WNT10B;TIMP3;RGS16;TP53;DUSP1;BDNF;COL6A1;TGFB1;ITGB1;CDH11;MMP9;BGN;MMP14;FOXP3;P
EG3;CSPG4;CASP1;IL10;CDH5;SPARC;CCL2;VEGFC;LUM;ICAM1;TIMP1;FBN1;NOX4;FMOD;CXCL10;ACT
A2;THBS1;COL3A1;PDGFRA;VCAN;MMP2;ACTG2;THBS2;VCAM1
plasmin 0.9486832
98
5.6679
6E-08
78 74
HABP2;GRIN1;F2;ENPP3;GRIN2A;IGFBP1;FGA;CCL20;LAMC1;EDN1;CDCP1;TNFRSF11B;ENO1;EGFR;TF
PI;BGLAP;VTN;CDKN1A;BCL2L11;F3;OCLN;PDGFC;IDE;JAG1;TF;CD40;LTBP1;VEGFA;MME;HSPB1;APP;S
ELP;CXCL8;KCNH2;ALOX5;TGFB3;FOS;CD36;IGFBP6;PRNP;TNF;HSPG2;IGFBP3;CYR61;TGFB1;MGP;MM
P9;COL11A2;EGR1;NOS2;FN1;ELN;VWF;PTGS2;PTN;IGFBP4;IL1B;CCL2;CTGF;RELN;ICAM1;SERPING1;F
GF7;SERPINF1;IGFBP2;TNC;IL6;ACTA2;COL1A1;THBS1;SERPINE1;VCAN;ACTG2;COL1A2
NOS2 0.9058216
27
3.8207
9E-08
174 147
VTCN1;PRDM16;DKK1;OTX1;PDX1;CLDN1;MYOG;CDH1;ARG1;GYS2;EZR;DDIT3;CYP3A5;MMP10;SESN2
;UCP3;SULT2B1;BIRC5;IGFBP1;CCNA2;GSR;BNIP3;MAFA;HSP90B1;KCNJ11;IGF1R;TFRC;CNOT1;LCN2;S
LC2A1;HSPA5;TNFAIP1;SRC;MMP1;CASP8;SIRT3;MED1;BACE1;CXCL1;VASP;OPA1;IRS1;APOM;PRDX1;
MTHFR;LPL;CDKN1A;CASP9;BCL2L11;GRK2;FASN;TGFA;CYP2C8;TIMM22;IREB2;HMOX1;RHOA;ADH5;
GJA1;UCP2;SCARB1;CCND1;IRF7;TNFSF13B;PDGFB;BSG;VEGFA;TGFBR2;ANGPT2;ABCC1;HSPB1;CDC25
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;CASP4;STAR;BMP7;BAX;PLAUR;PDK1;ABCB1;GAP43;KDR;CD36;ZEB1;CXCL2;TSPYL2;FRZB;TNF;DDIT4
;SPI1;IRS2;NOTCH1;IGFBP3;NR1I2;MMP9;BGN;HSPE1;FAS;PDE1A;PRF1;NOS3;PSMB9;FN1;ELN;ASS1;P
ECAM1;PTGS2;SPARC;PYHIN1;CCR7;SELE;CTGF;ITGAM;ICAM1;VIM;SOD3;ALOX5AP;TNFSF13;NOX4;RH
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6.2154
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;NEUROD1;TBX6;PPARG;WNT1;MSX2;FGF18;CDH2;NKX6-
1;CAMP;SFRP1;SOX9;CDKN2D;FOXP1;BGLAP;GNRH1;LPL;CDKN1A;PTCH1;SDC1;JAG1;BMP4;GJA1;SREB
F1;COL2A1;CCND1;PRDM1;TLE2;GSC;ACVR1;MYC;FGF1;NOTCH3;HSPA1B;RUNX2;PAX6;ZHX2;ZEB1;CA
LD1;FOXC1;MYB;TCF15;ETS1;NOTCH1;FOXC2;EDNRA;SFRP2;LEF1;CHRD;MITF;SNAI2;TWIST1;ICAM1;
WNT5A;VDR;ACTA2;BCL2;TAGLN;VCAM1
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E-16
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1;CES1;AGR2;ANGPTL3;PRDM16;KLB;APOB;CHGA;CEBPG;SLC3A1;DKK1;PRKG2;RBP4;PROM1;NOX1;O
STN;HCAR1;TERT;PDX1;ALOX12;KLF5;CLDN1;VIL1;LCT;ADTRP;CEBPA;AGT;MYCN;ALOXE3;GCLM;MYO
G;CLDN3;ABCA12;ALDH1A2;CXCL14;FOXA1;SCNN1G;GPAT3;PCSK9;PPP1R14A;BCO1;TH;NPHS1;HOXA
10;ERP44;CPM;POMC;NPPC;SLC27A2;NR1H4;IL18;CDH1;ACE2;EGLN3;ELOVL7;ATOH1;ARG1;ELF3;HPG
D;MOGAT1;E2F1;APOC3;NEUROD1;MAOA;GYS2;SLC2A2;TMEM120A;CCNE1;GPA33;ABCB11;PLIN1;PO
U2F1;AGRP;SKP2;CFD;MET;HSD3B1;ACTA1;CERS3;DGAT1;RDH10;IL20RB;ALPP;UCP3;SREBF2;GCLC;A
POA1;ORM1;PEX11A;HMMR;PON2;TNFRSF11A;GPAM;H2AFX;AKAP1;CIDEC;ACSS2;GADD45G;XIAP;SUL
T2B1;DBT;POU5F1;CNR1;CYP1A1;RBP2;FAAH;BIRC5;AKR1D1;CITED2;HK2;SNCG;IGFBP1;RARB;DGAT2
;LRP2;EDA;FAM13A;ABHD15;MEST;PPARGC1B;FAM132A;CDKN1C;NFKBIB;KLF4;CASP3;BCL2L1;LGAL
S12;DHRS3;GLO1;VLDLR;PNPLA2;CLOCK;EP300;AGPAT2;CCL20;PLA2G16;SORT1;CAV2;GPD1;KRT13;S
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B;RETSAT;GOT1;PEX16;PPARA;MAF;TXNIP;DNMT3A;IVL;SLC22A5;MIR200A;ADIPOR1;BCL6;NKX6-
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R;SP7;CAMP;APOL2;FLOT2;CD44;S100A12;ESRRA;NAT1;CPT1A;MICA;BCKDHB;SLC5A5;DIO2;REST;AR
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L16;EGFR;PTGER3;ACACA;DDAH2;CYP2D6;IRS1;TNIP1;SCAP;TFPI;SRSF3;ELOVL4;BGLAP;APOM;FXN;M
EF2D;CREBRF;KLF11;SIRT1;MAT2A;NR1H2;REN;LPL;CDKN1A;CASP9;PCNA;CYP4V2;FLOT1;CAT;EPHX
1;CDKN1B;ACADM;GCK;S100A8;F3;SLC9A1;NGF;ITGAV;MCM6;EPAS1;OCLN;LIPE;CYP2A6;KRT20;NPC1;
MUC1;PPP2R1A;SP1;CCNC;FOXO4;FAM57B;GLB1;MTA3;TRAF2;CDK2;SLC10A2;TNFSF10;MCM7;LEP;SD
C1;PFKFB4;TGM1;APOA4;ALDH3A1;PPP2CA;IDE;SIRT6;PTTG1;MYD88;HSPA8;HSF1;MBP;SLC1A2;CEBP
B;NR2C2;HSD11B2;ADAM28;CYP3A7;PARP1;LPIN1;SMAD7;HMOX1;EDNRB;CALR;PLIN4;FIS1;SLMAP;C
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;PTPN11;SCARB1;CD40;SREBF1;PON1;COL2A1;MERTK;FABP1;BMPR2;NFKBIA;KMT5A;CD83;HTT;PTP
RJ;TP63;ADIPOR2;HAS3;ABCG2;STEAP4;CCND1;AIFM1;MAL;CADM1;PDGFB;WDR35;ATP2A2;AHSG;RP
TOR;SMAD2;BSG;MCL1;GATA3;PCK2;TRPC1;VEGFA;RELA;S1PR1;FGF13;CRAT;SHBG;NOD1;SORBS1;AD
CY6;DUSP4;ANGPT2;MME;DOK1;ABCG1;PLIN5;ADIPOQ;AGTR1;DBI;ADAM8;PKM;EPHX2;GCM1;SYNPO;
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7006);DNMT1;DHRS9;PDPK1;PLPP1;CRP;CAV1;PLIN2;FZD1;STAT1;TNFRSF10B;GPAT4;KCNMB3;PDK4
;GPX1;SELENOS;UBE2I;ACAA2;CX3CR1;PEA15;CD200R1;TLE3;ACLY;GSTK1;PLIN3;CYP11A1;COPS5;SLC
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R;CDKN2A;BMP7;BAX;GATA2;PLAUR;ACADL;TRPC6;CXCR4;TNNT2;OLR1;TGFB3;PDK1;ACAT1;PDK2;P
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EL;ARNTL;ACE;CCR1;TNF;CYP27A1;TNFSF4;ADAMTS1;SOCS2;SEMA6B;SAT1;NR0B2;HSPG2;IFI16;SKP
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;CPT1C;ADORA2A;ACKR3;SGK1;CFLAR;NME1;PTAFR;PLA2G2A;FLT1;FBLN5;IL12B;MMP9;PTGES;COL1
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DRA;VAV1;TLR3;ITGB2;AXL;G6PC;ITGAM;RGS4;SLC2A3;NTRK2;FASLG;PDGFRB;SARM1;ANGPTL2;HAS
1;TLR2;VIM;NANOG;HSD11B1;DLG4;MSR1;PARVB;TBX21;MAP2;CAPN3;PTPRC;CD80;CES3;ESR1;TBXA
S1;CD274;NOX4;C1QA;RORC;RHBDF2;CX3CL1;PTGER2;BMP6;CCR2;TBXA2R;IL10RA;PLAT;CCL3;CLEC7
A;CXCL10;NFATC1;ACTA2;COL1A1;NCF1;IGF1;CD209;CIITA;FABP5;COL10A1;CD14;BCL2;CD69;MRC1;C
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1.7241
1E-07
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serine
protease
0.8219949
37
5.5187
2E-07
77 61
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1H1B
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41
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3E-05
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3;CXCL8;MYC;STK11;HIF1A;LRP1;SIGLEC14;ASIC2;HSPA1A;RUNX2;NFATC3;CFTR;MAPT;POLB;TCF3;T
NF;NES;TGFB1;SGK1;MMP9;AR;IL1B;CRYAB;CCL2;CCR5;ICAM1;IL6;MMP2;CD38
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3E-09
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PT;ETS1;CYR61;TGFB1;ITGAX;MMP9;AQP3;MMP14;FAS;FGF2;NOS3;NOS2;FN1;CASP1;IL10;PTGS2;DIA
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A1;GFPT1;EEPD1;SLC51B;DHCR7;GSTP1;GPAM;CIDEC;ACSS2;S100A9;SULT2B1;AKR1D1;NCOR1;CCNA
2;MICB;BCL2L1;VLDLR;SERPINA7;NR1D1;CDC25A;HMGCR;AKR1C3;ELOVL6;CSAD;EDN1;CCNB1;SMAD
3;XDH;IL23R;NR1H3;ACOX1;ATRX;NR3C1;PPARA;SLC51A;FOXM1;SLC40A1;IVL;ADIPOR1;PPARD;MID1
IP1;INSIG1;INSIG2;ACSL3;NR5A1;TRAF6;FLOT2;CPT1A;MICA;DIO2;SLC2A1;FBP1;NFE2L2;ENO1;ZDHH
C5;AHR;E2F2;ELOVL1;SIRT3;MAPK8;PC;MPZ;SERBP1;BACE1;NCOA2;GOT2;EGFR;ACACA;JUND;IRAK4;A
POD;ELOVL4;GNRH1;CETP;APOM;SULT1C2;NR1H2;REN;LPL;CDKN1B;TTPA;GCK;ABHD5;PTGES2;BCL2
L11;F3;MCM6;ARG2;LIPE;NPC1;FASN;SP1;ENHO;USP14;LEP;RBM3;TGM1;APOA4;CLU;IDE;MYD88;IQSE
C1;AKR1C4;PARP1;STS;TNFRSF10A;BMP4;STARD3;SCD;PTPN1;UCP2;SNCA;SCARB1;CD40;SREBF1;PON
1;MERTK;RARA;LNPEP;HSD17B13;SRD5A1;ADIPOR2;PFKFB2;CCND1;LPCAT3;TNFSF13B;PLTP;PCYT1
A;VEGFA;PFKL;MME;ABCG1;LBP;OGT;ADIPOQ;AGTR1;ATF3;MMP7;GCM1;ABCC1;ILF3;CRP;CAV1;PLIN2
;OGA;PDK4;NCEH1;ABCA7;XBP1;ABCA2;NCOR2;ACLY;IFIT1;CYP11A1;APP;SELP;SLC25A14;PNPLA3;AN
XA5;SPP1;CXCL8;CTNNB1;NPC2;MYC;NPC1L1;CSNK2B;APOC1;CCL24;ABCG5;ABCA1;TNFSF11;LRP1;SU
LT1E1;STAR;EHHADH;GBA;GAS6;BMP7;FDFT1;WNT10B;FDPS;ACAT1;PLP1;ATP6AP2;TGM2;ACOT1;AP
OE;ABCB1;LIPG;CD244;LDLR;TIMP3;FABP4;FOS;CFTR;FOSL1;CD36;JAK2;CXCL2;GAPDH;CH25H;TP53;S
1PR2;TNF;DUSP1;CYP27A1;BHLHE40;NR0B2;AQP1;ATM;NAMPT;APOA2;SNAI1;AIF1;HP;ABCA13;LRP8
;TGFB1;SLC2A4;IL18BP;PMP22;PFKFB3;CYP51A1;IL12B;ITGAX;MMP9;PTGES;FHL1;ARL4C;SOCS3;OSB
PL6;AQP3;MMP14;FAS;MAFB;FSCN1;THBD;CYP46A1;ENG;CYBB;NOS3;NOS2;FADS1;TLR4;CASP1;IL10;
PTGS2;IRF8;IL1B;CCL2;CD86;CCL5;CCR7;SELE;FMO3;AXL;G6PC;FASLG;ICAM1;TIMP1;WNT5A;VIM;HSD
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28
1.7636
4E-05
315 260
GSTA1;GSTA2;FOXA2;AFP;FETUB;SLCO1A2;ANGPTL3;KLB;APOB;ABCC2;SULT2A1;FGB;HNF4A;MLXIPL;
PDX1;CEBPA;GCLM;PCSK9;FGFR4;DDAH1;GSTA4;SLC10A1;PPL;CDH1;ARG1;CYP8B1;APOC3;NEUROD1;
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RARB;LRP2;NCOR1;KLF4;VLDLR;KRT13;UGT2B15;CCNG2;MAFA;HMGCR;FNDC5;CSAD;EDN1;SMAD3;N
R1H3;ACOX1;ALAS1;ULK1;CDH2;NR3C1;PPARA;TXNIP;SLC51A;FOXM1;NAGS;HHEX;UGT2B17;ANG;IGF
1R;CCNG1;INSIG2;CAMP;ABCC11;CPT1A;FBP1;MAP1LC3A;UGT2B7;CDX2;PDIA5;GLS;ACACA;DDAH2;M
TOR;CGNL1;CYP2D6;IRS1;CISH;DGKQ;ERBB2;CETP;APOM;KLF11;SIRT1;PSMD10;SLC1A5;PRDX1;ABCA
11P;CDKN1A;SPTLC2;CDKN1B;GCK;S100A8;NGF;RXRA;HDAC1;FASN;ABCC4;SLC10A2;SDC1;APOA4;TF
EB;SMPD3;PRDX3;CYP3A7;BHMT;STS;CYP19A1;PTEN;SCD;UCP2;SCARB1;SREBF1;PON1;NFKBIA;ZFP36
L1;SLCO1B3;ABCG2;CCND1;PLTP;HSD3B2;KDM1A;VIPR1;ABCG1;NDRG2;ADIPOQ;MMP7;DEFB1;PTPN6
;HSPB1;KLF2;ERN1;CRP;CAV1;PLIN2;LIPA;PDK4;GPX1;XBP1;SQSTM1;AKAP13;SCP2;GSTK1;CYP17A1;
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G5;ABCA1;UGT2B4;SULT1E1;CDKN2A;GBA;SDHC;APOE;RUNX2;ABCB1;LDLR;FOS;CFTR;CD36;TP53;S1P
R2;TNF;CYP27A1;SOCS2;NR0B2;CMD1F;NAMPT;BDNF;LILRB3;SNAI1;NR1I2;TGFB1;SLC2A4;CYP51A1;
BAAT;ITGAX;MMP9;SOCS3;IRF1;FAS;GPBAR1;ADH1B;THBD;NOS3;GSTM1;NOS2;TLR4;IL10;RECK;PTGS
2;GPR27;IL1B;SLC27A5;CCL2;FMO4;FMO3;G6PC;ITGAM;ICAM1;TIMP1;VIM;SOD3;DCN;CYP7B1;C3;IL6;
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2L2;MMP1;TFE3;CXCL1;TFPI;IL13;CDKN1B;ACADM;ELANE;CREB1;DUSP6;STMN1;CDK2;LEP;TYRP1;XP
C;RB1;CEBPB;BNIP3L;HMOX1;STAT3;CD40;MMP8;COL2A1;NFKBIA;SRD5A1;VEGFA;RELA;OGG1;MMP3;
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;TAP2;TGFB1;MMP9;SOCS3;EGR1;B2M;AQP3;FAS;FOXP3;SLC9A3;NOS3;NOS2;HLA-
A;MITF;IL10;PTGS2;IL1B;SOD2;CCL2;CD86;TMSB4X;SELE;CTGF;FASLG;ICAM1;OPRM1;TLR2;NOX4;IL6;
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6;CD69;CXCL12
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81
1.1506
6E-06
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AK4;IL13;CDKN1A;MUC1;PDGFA;MYD88;IRAK1;CEBPB;GADD45A;SREBF1;COL2A1;NFKBIA;CCND1;TN
FSF13B;VCL;MCL1;ZNF133;KLF2;IFIT1;CYP11A1;CXCL8;STAR;APOE;RUNX2;CXCL2;TNF;HBA1;NKX3-
2;MMP9;FAS;AR;FOXP3;LEF1;NOS3;NOS2;PTGS2;PGR;PML;IRF8;IL1B;CXCL9;ICAM1;WNT5A;CCND2;ES
R1;IL6;CXCL10;ACTA2;THBS1;BCL2;TAGLN
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FSF12;TNF;AQP1;GDNF;AQP7;SLC1A3;CLDN5;IL10;IL1B;CD4;SPHK1;ITGAM;OPRM1;VIM;TNC;IL6;CACN
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HOXD1;MYOG;ALDH1A2;TH;CDH1;CER1;ZIC2;ARG1;SIX3;DLX5;HOXC4;ATOH7;TFAP2A;TBX6;PPARG;E
N2;NEUROG3;FOXN1;CFD;WNT1;MSX2;HAND1;LHX2;TNFRSF11A;ASCL1;ID1;EFNB2;MAG;HOXC13;SYP
;ID2;KLF4;BCL2L1;ROCK1;SMAD5;IBSP;TGFB2;FNDC5;IVL;ZBTB33;NKX6-
1;SP7;MUC5AC;MAP1LC3A;SOX9;FZD7;CDX2;EN1;WDR5;BGLAP;SIRT1;LPL;CDKN1A;BAMBI;F3;OXSR1;
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SX1;TBX5;SCX;TRPC1;VEGFA;LAMP2;FBXO30;GSC;RHOB;ACVR1;CYP11A1;CYP17A1;RUNX1;SPP1;CXCL
8;MYC;ID3;TNFSF11;BECN1;GATA2;TRPC6;TGFB3;HSPA1A;RUNX2;PAX6;GAP43;TBX2;KDR;FOS;PTHLH
;WNT9A;NRP1;NGFR;TNF;IRS2;NES;IL1RN;MYOCD;ADAMTSL2;AR;SOX17;ACTN1;LGR5;LEF1;MITF;IL1
0;SNAI2;PTGS2;DPYSL2;IL1B;SPARC;CCL2;CD86;EPYC;KCND3;MCAM;SMAD1;GLI3;INHBA;POSTN;ICAM
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N;VCAM1;CXCL12
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1.8493
1E-09
43 40
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8;HSPA1A;APOE;HMGB1;CXCL2;CTSS;ACE;IL33;TGFB1;CLDN5;FN1;CPA3;IL1B;SELE;F13A1;DCN;SIGLE
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1;SMO;KDM5A;NFE2L2;ENO1;CDK1;RAPGEF2;HK1;STT3A;KAT2A;BGLAP;ERBB2;RACGAP1;REN;CDKN
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L1;GATA3;LFNG;PKM;MMP7;BMI1;CRP;PTK2;BATF;NCOR2;RUNX1;NFKB1;ALPL;MYC;DTX1;NOTCH2;P
LCG2;GATA2;HERPUD1;CXCR4;RUNX2;PAX6;BCL2A1;KDR;FOS;NFKB2;HEY2;CD36;IKBKB;TCF3;NGFR;
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2;HIF1A;CTSL;ASAH1;PRKN;PAX6;LDLR;CD36;MMP12;LTA;TP53;CHUK;ACE;TNF;DDIT4;IRS2;TGFB1;C
FLAR;NME1;MMP9;PRF1;NOS3;FN1;ELN;CASP1;IL1B;CCL2;HLA-
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2;ARRB1;SLC2A1;HSPA5;MPST;MUC5AC;NRF1;HPSE;IRS1;SIRT1;PCNA;F3;LIPE;WT1;TJP1;TXN;HSD11B
2;HMOX1;CALR;GJA1;SLC38A1;NFKBIA;IRF7;VEGFA;RELA;ANGPT2;ATF3;NPR3;SLC7A1;APP;SELP;GCH
1;CXCL8;NFAT5;MYC;SOD1;BAK1;CXCR4;WNT9B;RUNX2;LDLR;TIMP3;MAPT;TP53;DDIT4;IRS2;BDNF;N
ES;SNAI1;FDXR;IL12B;MMP9;FAS;EDNRA;NOS2;FN1;WNT2;VWF;GJA5;PTGS2;SOD2;CCL2;ABCC9;SELE;
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2
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;ITGA2
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5.1893
2E-07
43 40
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9
4.3695
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AP1;MAP1LC3B;SPP1;CXCL8;MYC;RUNX2;CFTR;ZEB1;TNF;NR0B2;TP73;ITGB1;SOCS3;AXIN2;NOS3;NOS
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E-05
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H;OPA1;ERBB2;FXN;CDKN1A;PCNA;CAT;GCK;DNM1L;GLUL;NCOA4;JUN;MYD88;GPX4;PRDX3;NEFM;GA
DD45A;SLC11A2;VEGFA;OGG1;CERS4;IL1R2;GPX1;APP;CXCL8;IL1R1;MT1A;HIF1A;YWHAZ;SLC11A1;CD
KN2A;BAX;PLAUR;BCL2A1;FABP4;FOS;IKBKB;APOBEC3A;CXCR1;SAT1;AQP1;NES;SNAI1;MIR221;PIN1;
MMP9;ANPEP;CYBB;NOS3;NOS2;ELN;PTGS2;CCL2;RYR1;CD4;CCL5;SELE;FASLG;NOX4;CCL3;CXCL10;AC
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ANG 0.3922322
7
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R;AGER;MAP1LC3A;MPZ;TFPI;PRKCE;CDKN1A;F3;ITGAV;OCLN;LIPE;DUSP6;PDGFA;JUN;AXIN1;HMOX1;
CYP19A1;SCARB1;MMP8;LNPEP;SMAD2;RELA;S1PR1;ABCG1;NCL;GPX1;TCF12;APP;LAMP1;CTNNB1;M
YC;SERPINI1;ABCA1;SOD1;TNFRSF1A;S1PR3;BAX;PLAUR;WNT10B;F10;CD36;PPIA;TNF;DUSP1;SLC2A4
;MMP11;ITGB1;ITGAX;MMP9;CLDN5;F8;MMP14;NOS2;FN1;VWF;PTGS2;IL1B;CCL2;CCR5;CCR7;HTRA1;
SLC2A3;SERPINA1;WNT5A;VIM;ITGA1;SERPINF1;TNC;IL6;PLAT;CCL3;ACTA2;PLAU;BCL2;COL3A1;COL
15A1;MMP2;THBS2;MRC2;COL11A1
GDF11 0.3086067 2.7130
7E-05
63 53
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KN1B;CDK2;HAMP;SMAD7;HMOX1;UCP2;SMAD6;EGF;CDK4;CCND1;ATP2A2;VEGFA;ANGPT2;HIF1A;BE
CN1;BAX;RUNX2;PAX6;FABP4;TP53;TNF;AIF1;GDNF;HOXA4;FAS;NOS2;ACVRL1;CASP1;PECAM1;PTGS2
;IL1B;POSTN;FASLG;VIM;CCND2;NOX4;IL6;ACTA2;COL1A1
PRDX6 0.3015113
45
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57
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G;DKK1;HNF4A;HMGN3;PRKG2;ELF5;ID4;ALOX12;KLF5;BMP2;SHH;SOX4;SCNN1G;TH;HOXA10;PRL;CD
H1;SPINK1;FGF10;MMP15;ATP1B1;HPGD;DLX3;FOLR1;AKR1C1;HSD17B2;SCT;EZR;PPARG;HOXB9;LHB
;PRLR;PLD1;MMP10;MSX2;PROX1;CDC25C;ZFHX3;G6PD;CNR1;CDT1;IGFBP1;LRP2;MAG;RRM2;KLF4;B
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;SNAI2;PECAM1;VWF;CDH5;EPHB3;CCL5;S100A4;TWIST1;VIM;ZEB2;NANOG;GLI2;CCND2;ESR1;VDR;P
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family
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RB1;ANKRD1;SLC2A1;MMP1;IL23A;AGTRAP;MTOR;BGLAP;RGS2;LGALS3;CDKN1A;BCL2L11;OXSR1;EL
ANE;ZBTB16;RGCC;CEBPD;COL2A1;CCND1;GATA3;EBF1;EOMES;SLC22A4;HAPLN1;RUNX1;SPP1;CTNN
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e
peroxidase
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F;PTK6;TGFB1;SLC2A4;HRH1;CFLAR;SOX11;IL12B;MMP9;SOCS3;ITIH5;MEF2C;EGR1;TPM1;FSTL1;ADA
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92 81
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C27A3;VEGFA;ANGPT2;MMP7;GCM1;ANXA2;SPP1;CXCL8;TNFSF11;BAK1;BAX;BIRC3;KCNN4;KDR;FOS;
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WF;C5AR1;CDH5;IL1B;CCL2;TEK;CCR5;SELE;VEGFC;CTGF;FGFR1;ICAM1;VIM;NOX4;TBXA2R;CXCL10;B
CL2;HGF;CBS;VCAM1

22. TNFRSF11
B
0.1458649
91
1.9425
E-07
75 71
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;MMP2;ACTG2;VCAM1;EIF4A1;CD68
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54
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non-
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