Download free for 30 days
Sign in
Upload
Language (EN)
Support
Business
Mobile
Social Media
Marketing
Technology
Art & Photos
Career
Design
Education
Presentations & Public Speaking
Government & Nonprofit
Healthcare
Internet
Law
Leadership & Management
Automotive
Engineering
Software
Recruiting & HR
Retail
Sales
Services
Science
Small Business & Entrepreneurship
Food
Environment
Economy & Finance
Data & Analytics
Investor Relations
Sports
Spiritual
News & Politics
Travel
Self Improvement
Real Estate
Entertainment & Humor
Health & Medicine
Devices & Hardware
Lifestyle
Change Language
Language
English
Español
Português
Français
Deutsche
Cancel
Save
Submit search
EN
Uploaded by
samacoba1983
PPTX, PDF
52,253 views
Chainerを使って細胞を数えてみた
Chainer meetup #03の発表資料です。 http://chainer.connpass.com/event/32917/
Technology
◦
Read more
9
Save
Share
Embed
Embed presentation
Download
Downloaded 49 times
1
/ 18
2
/ 18
3
/ 18
4
/ 18
5
/ 18
6
/ 18
7
/ 18
8
/ 18
9
/ 18
10
/ 18
11
/ 18
12
/ 18
13
/ 18
14
/ 18
15
/ 18
16
/ 18
17
/ 18
18
/ 18
More Related Content
PDF
Chainer Update v1.8.0 -> v1.10.0+
by
Seiya Tokui
PDF
ヤフー音声認識サービスでのディープラーニングとGPU利用事例
by
Yahoo!デベロッパーネットワーク
PDF
Chainer, Cupy入門
by
Yuya Unno
PDF
NVIDIA 更新情報: Tesla P100 PCIe/cuDNN 5.1
by
NVIDIA Japan
PDF
A yet another brief introduction to neural networks
by
Yuta Kikuchi
PDF
On the benchmark of Chainer
by
Kenta Oono
PDF
深層学習ライブラリの環境問題Chainer Meetup2016 07-02
by
Yuta Kashino
PDF
俺のtensorが全然flowしないのでみんなchainer使おう by DEEPstation
by
Yusuke HIDESHIMA
Chainer Update v1.8.0 -> v1.10.0+
by
Seiya Tokui
ヤフー音声認識サービスでのディープラーニングとGPU利用事例
by
Yahoo!デベロッパーネットワーク
Chainer, Cupy入門
by
Yuya Unno
NVIDIA 更新情報: Tesla P100 PCIe/cuDNN 5.1
by
NVIDIA Japan
A yet another brief introduction to neural networks
by
Yuta Kikuchi
On the benchmark of Chainer
by
Kenta Oono
深層学習ライブラリの環境問題Chainer Meetup2016 07-02
by
Yuta Kashino
俺のtensorが全然flowしないのでみんなchainer使おう by DEEPstation
by
Yusuke HIDESHIMA
Viewers also liked
PPTX
Deep parking
by
Shintaro Shiba
PPTX
ディープラーニングにおける学習の高速化の重要性とその手法
by
Yuko Fujiyama
PPTX
Chainer Meetup LT (Alpaca)
by
Jun-ya Norimatsu
PDF
深層学習ライブラリのプログラミングモデル
by
Yuta Kashino
PPTX
Chainer meetup
by
kikusu
PDF
CuPy解説
by
Ryosuke Okuta
PDF
マシンパーセプション研究におけるChainer活用事例
by
nlab_utokyo
PDF
Chainer入門と最近の機能
by
Yuya Unno
PDF
Chainer Contribution Guide
by
Kenta Oono
PDF
Chainer meetup lt
by
Ace12358
PDF
ボケるRNNを学習したい (Chainer meetup 01)
by
Motoki Sato
PDF
Chainer meetup20151014
by
Jiro Nishitoba
PDF
LT@Chainer Meetup
by
Shunta Saito
PPTX
Capitalicoでのchainer 1.1 → 1.5 バージョンアップ事例
by
Jun-ya Norimatsu
PDF
A Chainer MeetUp Talk
by
Yusuke Oda
PDF
Lighting talk chainer hands on
by
Ogushi Masaya
PDF
Introduction to DEEPstation the GUI Deep learning environment for chainer
by
Ryo Shimizu
PDF
Towards Chainer v1.5
by
Seiya Tokui
PDF
PFN Spring Internship Final Report: Autonomous Drive by Deep RL
by
Naoto Yoshida
PDF
Chainer Development Plan 2015/12
by
Seiya Tokui
Deep parking
by
Shintaro Shiba
ディープラーニングにおける学習の高速化の重要性とその手法
by
Yuko Fujiyama
Chainer Meetup LT (Alpaca)
by
Jun-ya Norimatsu
深層学習ライブラリのプログラミングモデル
by
Yuta Kashino
Chainer meetup
by
kikusu
CuPy解説
by
Ryosuke Okuta
マシンパーセプション研究におけるChainer活用事例
by
nlab_utokyo
Chainer入門と最近の機能
by
Yuya Unno
Chainer Contribution Guide
by
Kenta Oono
Chainer meetup lt
by
Ace12358
ボケるRNNを学習したい (Chainer meetup 01)
by
Motoki Sato
Chainer meetup20151014
by
Jiro Nishitoba
LT@Chainer Meetup
by
Shunta Saito
Capitalicoでのchainer 1.1 → 1.5 バージョンアップ事例
by
Jun-ya Norimatsu
A Chainer MeetUp Talk
by
Yusuke Oda
Lighting talk chainer hands on
by
Ogushi Masaya
Introduction to DEEPstation the GUI Deep learning environment for chainer
by
Ryo Shimizu
Towards Chainer v1.5
by
Seiya Tokui
PFN Spring Internship Final Report: Autonomous Drive by Deep RL
by
Naoto Yoshida
Chainer Development Plan 2015/12
by
Seiya Tokui
Similar to Chainerを使って細胞を数えてみた
PPTX
NIPS2015読み会: Ladder Networks
by
Eiichi Matsumoto
PPTX
Chainerで学ぶdeep learning
by
Retrieva inc.
PDF
Chainerの使い方と自然言語処理への応用
by
Seiya Tokui
PDF
Chainerの使い方と自然言語処理への応用
by
Yuya Unno
PDF
Chainerチュートリアル -v1.5向け- ViEW2015
by
Ryosuke Okuta
PPTX
Deep learning for quantification
by
Yuki Mochizuki
PDF
NINと画像分類 for 人工知能LT祭
by
t dev
PDF
[AI08] 深層学習フレームワーク Chainer × Microsoft で広がる応用
by
de:code 2017
PPTX
ChainerでDeep Learningを試す為に必要なこと
by
Jiro Nishitoba
PDF
機械学習フレームワーク横断、Chainer, Keras
by
Teppei Murakami
PDF
Introduction to Chainer (LL Ring Recursive)
by
Kenta Oono
PDF
深層学習フレームワークChainerとその進化
by
Yuya Unno
PPTX
Chainerを使って博士研究はじめました
by
samacoba1983
PDF
「深層学習」勉強会LT資料 "Chainer使ってみた"
by
Ken'ichi Matsui
PDF
【2016年度】勉強会資料_Chainer
by
Ryosuke Tanno
PDF
深層学習フレームワークChainerの紹介とFPGAへの期待
by
Seiya Tokui
NIPS2015読み会: Ladder Networks
by
Eiichi Matsumoto
Chainerで学ぶdeep learning
by
Retrieva inc.
Chainerの使い方と自然言語処理への応用
by
Seiya Tokui
Chainerの使い方と自然言語処理への応用
by
Yuya Unno
Chainerチュートリアル -v1.5向け- ViEW2015
by
Ryosuke Okuta
Deep learning for quantification
by
Yuki Mochizuki
NINと画像分類 for 人工知能LT祭
by
t dev
[AI08] 深層学習フレームワーク Chainer × Microsoft で広がる応用
by
de:code 2017
ChainerでDeep Learningを試す為に必要なこと
by
Jiro Nishitoba
機械学習フレームワーク横断、Chainer, Keras
by
Teppei Murakami
Introduction to Chainer (LL Ring Recursive)
by
Kenta Oono
深層学習フレームワークChainerとその進化
by
Yuya Unno
Chainerを使って博士研究はじめました
by
samacoba1983
「深層学習」勉強会LT資料 "Chainer使ってみた"
by
Ken'ichi Matsui
【2016年度】勉強会資料_Chainer
by
Ryosuke Tanno
深層学習フレームワークChainerの紹介とFPGAへの期待
by
Seiya Tokui
Chainerを使って細胞を数えてみた
1.
Chainer を使って細胞を数えてみた 2016.7.2 samacoba Chainer Meetup
#03 1
2.
細胞カウント 試薬は細胞にダメージを与える ⇒細胞画像から細胞を数えたい ・細胞を数えることは培養の基本作業 B:核画像 C:合成画像A:細胞画像 カウントが難しい カウントが容易 試薬が必要 2
3.
Convolution 当初のモデル案 正解T=102個出力Y=88個 loss= Mean squared error(Y,T)fully connect T-Yの差を縮めるよう学習させる 教師となる情報は「数情報」のみ、「位置情報」は入ってない X:細胞画像 B:核画像 数える 教師に正解の「数」を与える 3
4.
核位置の推定 X:細胞画像 ⇒ Y:核「推定」画像に変換後、 カウントする 核の場所を推定 カウント DNN Y:核推定画像 T:核画像(教師) X:細胞画像 教師に「核画像」を与える 画像
⇒ 画像の変換方法は? ⇒「位置情報」が与えられる 4
5.
Chainerで顔イラストの自動生成 Deconvolution2Dを使って画像を合成 5
6.
12 34 29 94
28 44 67 58 33 1 0 0 0 1 0 0 0 1 * 12 0 0 0 28 0 0 0 33 = sum 77 1 0 0 0 1 0 0 0 1 * 30 0 0 0 30 0 0 0 30 =30 畳込みconvolution 逆畳込みDeconvolution 画像を小さくできる 画像を大きくできる Convolution-Deconvolution Convolution Deconvolution 元画像サイズへの画像変換が可能 6
7.
convolution 前半はconvolution、後半はdeconvolution deconvolution X:細胞画像 Y:核推定画像 学習モデル T:核画像(教師) Loss =
Mean squared error(Y,T) 核の位置を推定させるように学習させる 7
8.
Y’: 極大位置Y:核推定画像 maxpooling など使って 極大値の位置を抽出 位置の抽出とカウント 0
0 10 0 0 0 10 30 10 0 10 30 50 30 10 0 10 30 10 0 0 0 10 0 0 10 30 30 30 10 30 50 50 50 30 30 50 50 50 30 30 50 50 50 30 10 30 30 30 10 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 A B A*(A==B) 3×3 maxpooling 8 極大値抽出例 ポイントの数を カウント 8個
9.
0 200 400 600 800 1000 1200 1400 1600 pic_2 pic_4 pic_6
pic_8 pic_10 細胞個数 T:正解数 Y:推定数 カウント結果 精度はまずまず ただし、異なる状態だと精度は出ない 9
10.
おまけ 10
11.
クリックしたら○が付き、位置が出力される ・100円ショップの☆型の飾り ・通常のデジカメで撮影 ☆を数えてみた 11 手動教師データ作成ソフト(javascript)
12.
入力 出力 Y:位置推定画像 convolution-deconvolution 学習流れ T:位置教師画像 クリックして位置を出す(88個) X:元写真 Backpropagation 12 トレーニング(元画像1枚 TAITAN
X 10分程度)
13.
Y:位置推定画像 Yより位置抽出 学習結果 1枚(88クリック)の画像から、別画像での推定が可能 13 ・トレーニング画像と別画像にて推定
14.
従来の画像処理 エッジ抽出 2値化 ヒストグラム フィルタ選択 照明の均一化 数分間クリックするだけでOK しきい値設定 ディープラニング 専門知識が必要 だれでも使える ハレーション画素数 露光時間 従来の画像処理とディープラニング 14
15.
別の特徴の抽出 星の「角」の教師にして、同様にトレーニング 15
16.
Y:位置推定画像 Yより位置抽出 教師の与え方で、別の特徴をとらえてくれる 学習結果 16 ・トレーニング画像と別画像にて推定
17.
・花粉を数える ・菌を数える ・部品を数える ・角を数える ・車を数える ・人を数える 応用先 ・集団の動きをトレースする Ex.蟻の集団行動の研究 17 位置を抽出カウント
18.
18 ご清聴ありがとうございました 最後に昨年よりchainerを使ってきて、 ・WEBでの解説の投稿者の皆さま ・Chainer開発チームの皆さま いつもありがとうございます
Download