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大学・公的機関における研究開発に
関するデータの整備と公開
-SciREXデータ・情報基盤構築の成果の紹介-
2013年11月2日
○伊神正貫, 小野寺夏生, 富澤宏之
(文科省・NISTEP)
1
研究・技術計画学会 第28回年次学術大会1I11
本発表の構成
• はじめに
• データ整備の内容を一部紹介
• データ公開
• おわりに
<本発表の構成>
2
はじめに
• 2011年度から、SciREXの一環として実施
• 研究開発の実態の把握・分析を、国、セクター、個別機関な
どの各レベルで行うための基礎データを構築
• 各種データのマイクロレベルでの接続
<はじめに>
3
基本的なスタンス
• 「NISTEP大学・公的機関名辞書」の整備
– 各種のデータを接続する際の基礎情報源
• 各種データと「NISTEP大学・公的機関名辞書」の対応付け
– エルゼビア・ジャパン株式会社 Scopus
– トムソン・ロイター・プロフェッショナル株式会社
Web of Science
– 科学技術研究調査など
• 整備されたデータの可能な範囲での公開
– 商用データベース
– 基幹統計、一般統計
• NISTEPの分析への活用
<はじめに>
4
NISTEP大学・公的機関名辞書の整備
(収録対象の機関)
• 研究開発を行っている国内の機関
– 全部で約12,000機関(下部組織や非現存機関を含む)
• 大学、公的機関を重点
• 地方公共団体の機関、企業、非営利法人等もできるだけ含めた
– それぞれの機関に、NISTEP独自の識別IDを付与
<データ整備の内容>
5
NISTEP大学・公的機関名辞書の整備(続き)
(収録情報)
• 機関の名称
– 和英の正式名称の他、英語名については、通称、略称もでき
るだけ収録
• 機関の下部組織
– 一部の大学については学部・研究科・付置研究所等
– 大学共同利用機関である機構に属する各研究所
• 機関の変遷情報
– 過去、15年ほどの間に統廃合、改組、名称変更等があって現
存しない機関についても、できるだけ収録
• <<所在地の情報(郵便番号)>>
6
<データ整備の内容>
機関名辞書のデータソース
(1) 論文を発表した機関
– 1996年から2010年までに発表された研究論文の著者が属する
国内の機関(Scopusを利用)
– 高等教育機関、研究を行う国の機関や独立行政法人について
は、この機関に論文発表がなくても網羅的に掲載
(2) 機関の名称
– 各機関のホームページ
– 官庁などのWebサイトにある機関リスト
– 『全国試験研究機関名鑑』(丸善)など
(3) 機関の廃止、統合、名称変更
– 各機関のホームページにある「沿革」や「歴史」の記述
7
<データ整備の内容>
セクターと属する機関数
セクター 機関数
国立大学 101
国立短大 26
国立高専 59
公立大学 94
公立短大 62
公立高専 6
私立大学 601
私立短大 515
私立高専 3
大学共同利用機関 5
国の機関 135
特殊法人・独立行政法人 133
地方公共団体の機関 696
会社 4,421
非営利団体 3,586
その他の機関 6
8注: 機関数には統廃合、改組、名称変更等で現存しない機関も含んでいる。
<データ整備の内容>
辞書に含まれている機関の地理的な分布
約12,000件の内、約6,000件が約11,000件の郵便番号情報も持つ
9谷謙二研究室(埼玉大学教育学部人文地理学)のウェブページを用いて可視化
<データ整備の内容>
全機関
10谷謙二研究室(埼玉大学教育学部人文地理学)のウェブページを用いて可視化。辞書に含まれる機関の内、郵便番号情報を持っているものの位置を示
した結果であり、日本の機関全ての位置を示したものではない。
<データ整備の内容>
大学等
11
<データ整備の内容>
谷謙二研究室(埼玉大学教育学部人文地理学)のウェブページを用いて可視化。辞書に含まれる機関の内、郵便番号情報を持っているものの位置を示
した結果であり、日本の大学等全ての位置を示したものではない。
公的機関
12
<データ整備の内容>
谷謙二研究室(埼玉大学教育学部人文地理学)のウェブページを用いて可視化。辞書に含まれる機関の内、郵便番号情報を持っているものの位置を示
した結果であり、日本の公的機関全ての位置を示したものではない。
非営利団体等
13
<データ整備の内容>
谷謙二研究室(埼玉大学教育学部人文地理学)のウェブページを用いて可視化。辞書に含まれる機関の内、郵便番号情報を持っているものの位置を示
した結果であり、日本の非営利民間等全ての位置を示したものではない。
会社
14
<データ整備の内容>
谷謙二研究室(埼玉大学教育学部人文地理学)のウェブページを用いて可視化。辞書に含まれる機関の内、郵便番号情報を持っているものの位置を示
した結果であり、日本の企業等全ての位置を示したものではない。
研究アウトプットデータにおける機関同定
• 対象としたデータ
– ScopusとWeb of Science
– 1996~2011年の期間に発表された日本の論文を抽出し、そこ
に含まれる機関を同定
– 全てのドキュメントのタイプを対象
15
<データ整備の内容>
何を行ったか?名寄せ、名寄せ、名寄せ!
機関同定の問題点
• 種々の通称や略称
• 正式ではない名称(Tokyo University)
• 機関名、部局名の一体化(Kyoto University School of
Medicineなど)
• 1つのアドレスデータレコードに2つの機関名
– 1人の著者が2つの機関に所属(特にJST)
– 異なる著者の所属機関が混在
– 共同実施制度
• 機関の英語名の変更
– Science University of Tokyo → Tokyo University of Science
• (Scopus) アドレスデータの中の所在地、機関名、下部組織
名の順序が一定しておらず、機関名の識別が困難
16
<データ整備の内容>
類似の名称の機関の存在
• 事例の分析を通じた試行錯誤
• 最長マッチングと類似性計算に基づき、NISTEP大学・公的機
関名辞書を用いて機関同定を行うアルゴリズムを開発
17
Fac Sci Univ Tokyo
東京大学理学部
東京理科大学
静岡大学(Shizuoka University)
静岡県立大学
(University of Shizuoka)
獨協大学(Dokkyo University)
獨協医科大学
(Dokkyo University School of
Medicine)
<データ整備の内容>
同定結果
18
Scopus Web of Science
対象レコード数 329万件 278万件
機関同定 91.9% 93.6%
セクター同定 1.6% 1.3%
サンプリング調査により、
同定の精度は98%以上であることを確認
<データ整備の内容>
データ公開
• 整備されたデータは、可能な範囲でNISTEPのWebサイトの
「データ・情報基盤」のページにおいて公開
• 2013年9月現在、次の3種のデータを、内容と利用法を説明し
たマニュアルや活用事例とともに公開
– NISTEP大学・公的機関名辞書
– 大学・公的機関名英語表記ゆれテーブ
– Scopus-NISTEP大学・公的機関名辞書対応テーブル
19
<データ公開>
問合せ用アドレス: data-infra@nistep.go.jp
現在公開中のデータ(その1)
• NISTEP大学・公的機関名辞書(ver.2012.1)
– 研究活動を行っている我が国の機関(約1万2千機関)を掲載
– 個別機関レベルの分析のための基礎情報源
• 大学・公的機関名英語表記ゆれテーブ(ver.2013.1)
– Scopusにおける日本の大学・公的機関の表記ゆれ
– Scopusに延べ1,000以上出現した205の大学と40の公的機関に
ついて、10回以上出現した表記バリエーション
– エルゼビア・ジャパン株式会社の了解を得て公表
20
<データ公開>
NISTEP大学・公的機関名辞書の例
21
<データ公開>
機関ID 機関名称
正式名称
確認フラグ
セクター
番号
代表機関フ
ラグ
代表機関ID 現存フラグ 移行年月日 継承機関ID
NID201200199399167 お茶の水女子大学 TRUE 1 TRUE TRUE
NID201200199399167
Ochanomizu
University
TRUE 1 TRUE TRUE
NID201200248230458 一橋大学 TRUE 1 TRUE TRUE
NID201200248230458
Hitotsubashi
University
TRUE 1 TRUE TRUE
NID201200532615372 宮崎医科大学 TRUE 1 TRUE FALSE 2003/10/1 NID201200253596213
NID201200532615372
Miyazaki Medical
College
TRUE 1 TRUE FALSE 2003/10/1 NID201200253596213
NID201200253596213 宮崎大学 TRUE 1 TRUE TRUE
NID201200253596213
University of
Miyazaki
TRUE 1 TRUE TRUE
NID201200790018667 京都大学 TRUE 1 TRUE TRUE
NID201200790018667 Kyoto University TRUE 1 TRUE TRUE
NID201200262823890
京都大学iPS細胞
研究所
TRUE 1 FALSE NID201200790018667 TRUE
NID201200262823890
Center for iPS Cell
Research and
Application Kyoto
University
TRUE 1 FALSE NID201200790018667 TRUE
注: 発表用にデータの一部を抜粋している。
大学・公的機関名英語表記ゆれテーブルの例
22
<データ公開>
機関名 表記バリエーション
英語正式
名
出現度数
筑波大学 University of Tsukuba ○ 31,794
筑波大学 Tsukuba University 822
筑波大学 Univ of Tsukuba 327
筑波大学 Univ. of Tsukuba 282
筑波大学 The University of Tsukuba 57
筑波大学 Univ. Tsukuba 18
筑波大学 Tsukuba Univ. 12
1,529件
注: 発表用にデータの一部を抜粋している。
現在公開中のデータ(その2)
• Scopus-NISTEP大学・公的機関名辞書対応テーブル
(ver.2013.1)
– Scopusの論文IDとNISTEP大学・公的機関名辞書の機関IDの
対応表
– エルゼビア・ジャパン株式会社の了解を得て公開
– 但し、大学、公的機関以外の機関については現状では同定の
精度がやや低いので、セクターのみを公表
23
<データ公開>
対応テーブルの例
match_level scopus_eid scopus_address_seq nid sector
I 2-s2.0-0001211811 0 NID201200918166078 国立大学
I 2-s2.0-0001211811 1 NID201200918166078 国立大学
I 2-s2.0-3743074834 0 NID201200944582170 国立大学
I 2-s2.0-3743074834 1 NID201200104971192 国立大学
I 2-s2.0-33750146162 0 NID201200268901613 国立大学
N 2-s2.0-0030294941 0
I 2-s2.0-0030294941 1 NID201200814643343
特殊法人・独立行政
法人
I 2-s2.0-0030294941 2 NID201200668065067 国立大学
N 2-s2.0-0030294941 3
I 2-s2.0-0030294944 5 NID201200686415426 国立大学
I 2-s2.0-0010280664 0 NID201200847416066 国立大学
I 2-s2.0-0030291871 0 NID201200962922998 国立大学
S 2-s2.0-0030291871 1 会社
I 2-s2.0-0029780194 0 NID201200082411747 国の機関
U 2-s2.0-0030031258 0 NID201200683521656 私立大学
24
<データ公開>
注: 発表用にデータの一部を抜粋している。
対応テーブルの活用
• Scopusで検索した論文データ集合における所属機関を、こ
のテーブルを用いて同定
• ある機関の論文の一括検索(その機関IDを持つScopus論文
データの集合をこのテーブルを用いて作成)
• 機関別又はセクター別の論文生産統計の作成と分析
25
<データ公開>
活用事例の紹介
26
<データ公開>
4
① Scopusからのデータのダウンロード
<①Scopusからのデータのダウンロード>
• 本資料では、以下の条件を用いて論文データの抽出を行っています。
• Scopusの論文データは常に更新されており、論文データの抽出を行った時期
によって結果が変化します。
• したがって、分析結果には、論文データの抽出を何時行ったかを明示するよう
にしてください。
• なお、本資料で用いる論文データの抽出を行ったのは2013年6月29日です。
• 詳細については、エルゼビア社が提供しているマニュアル等を参考にしてくだ
さい。
条件 内容
著者所属機関(国) Japan
出版年 2010年
分野 Chemistry, Chemical Engineering
Scopus-NISTEP大学・公的機関名辞書
対応テーブルの活用事例(その1)
2013年7月1日
科学技術・学術政策研究所
科学技術・学術基盤調査研究室
データ・情報基盤の活用事例
1
• 以下の3つのファイルをリレーショナルデータベースにインポートします。
– scopus.csv: Scopusからダウンロードした論文データ
– organization_dictionary_ver_2012_1.xlsx: NISTEP大学・公的機関名辞書
– Scopus_Table_of_the_NISTEP_Affiliation_Dictionary_ver_2013_1.tsv: Scopus-
NISTEP大学・公的機関名辞書対応テーブル
• ファイルのインポート方法については、リレーショナルデータベース
(Microsoft Access, MySQL, Microsoft SQL Serverなど)に依存しますので
、分析に用いるリレーショナルデータベースのマニュアルを参考にしてくだ
さい。
• Microsoft Accessを用いる場合のテーブルの定義を次ページ以降に示し
ます。
7
② リレーショナルデータベースへのデータのインポート
<②リレーショナルデータベースへのデータのインポート>
• ②で構築したデータベースを用いて分析を実施します。
• ここでは、以下の4つの分析について、分析用のクエリを示します。
– Scopus-NISTEP大学・公的機関名辞書対応テーブルとのマッチングが行われた論
文の確認
– マッチング精度ごとの論文数の集計
– セクターごとの論文数の整数カウント法による集計
– 大学・公的研究機関ごとの論文数の整数カウント法による集計
• Microsoft Accessのデータベースに、以下の3つのテーブルがインポートされ
ていることを前提としています。
– 論文データ
– Scopus-NISTEP大学・公的機関名辞書
– Scopus-NISTEP大学・公的機関名辞書対応テーブル
• また、テーブル名およびぞれぞれのテーブルのフィールド名は、②で示したも
のに合わせてください。
15
③分析の実施
<③分析の実施>
おわりに -今後の整備と公開の計画
• 過去2年間の成果の評価、データと手法の改善
– 機関同定及び異種データ間のミクロ接続の精度の向上
– 機関同定等のアルゴリズムの改善
– データ利用者のための補助情報(利用マニュアルやテーブル
定義情報)の整備
– データ整備を将来継続するための作業のマニュアル化
• データの公開
– Web of Scienceについてのデータ
– NISTEP大学・公的機関名辞書の更新
• 新たな機関登録
• 下部組織や機関変遷情報の拡充等
27
<おわりに>
おわりに -ポスト処理の限界
• 名寄せ作業はデータが更新されるたびに行う必要がある。
• 精度が100%になることはない(努力はするが)。
• 持続的なものにしないと意味がない。
• 論文への著者所属の記入方法の機関内での統一化
– 教員のみではなく、ポストドクターや学生にも理解してもらう。
• 謝辞情報についても同様
– 統一的なファンディング番号フォーマットの導入
28
<おわりに>
名寄せは「モグラたたき」のようなもの、
モグラが出てこないのが理想

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