Система Proteon - оптический биосенсор, основанный на технологии поверхностного плазмонного резонанса
для оценки силы, динамики, продолжительности взаимодействия между молекулами.
Система Proteon - оптический биосенсор, основанный на технологии поверхностного плазмонного резонанса
для оценки силы, динамики, продолжительности взаимодействия между молекулами.
Nanostructured materials: Belarus - Russia - Ukraine. Collection of Plenary Reports IV International scientific conference. Minsk. 7-10 October 2014. Pp.68-80.
Plenary Talk
Nanoclusters as superatoms and supermolecules
http://physics.by/e107_files/public/nano2014_sbornik_tesdokladov.pdf
A.M. Ilyanok1, I.A. Timoshchenko2
1 CC “Nanobiology”, Minsk, Belarus
2 Belarusian State University, Minsk, Belarus
For the first time the opportunity of transfer functions of the human cerebral cortex in silicon neurochip of 10 cm^3 with 3D nanojet printer is shows. This is due to the fact that in the last 10 years a new direction in nanotechnology has appeared - the creation of organic and inorganic nanoclusters of certain size, called superatoms, which exhibit the unique properties of elementary atoms and can formally establish a new "periodic table". The development of an entirely new field of science opens the possibility to use cheaper isoelectronic analogues instead of expensive items.
In 1998, we proposed an electronic model of superatoms of helium in orthophaze and paraphase. These superatoms are formed from metal oxides and semiconductors. On this base we developed a new class of single-electron devices with unique physical properties. For example, one can create a computer with 10^16 transactions per second while consuming only a few joules of energy, which is close to the thermodynamic limit 3,4∙10^20 operations/joule. The computer can be grown in a 3D topology by jet nanolithography. Neuroprocessor with performance close to the one of the human cortex takes volume of few cubic centimeters. To demonstrate the formation conditions of superatoms we have developed a new model of an electron with energy of 0.1-0.2 eV, namely «cold» ring electron with radius of 7.25 nm. From the standpoint of superatoms we can consider the physical and chemical properties of proteins like supermolecules formed from superatoms. For example, the protein tubulin which forms nerve fibers and nuclear scaffolds and cells shows unique physical properties. It forms nanotubes with a diameter of 14.5 nm.
The developed technology of jet nanolithography allows us to grow inorganic artificial neurons, while watching their growth using the methods of nanophotonics. Back in 2005, we have patented scanning nanojet microscope, working in real time to monitor the living cell and its dynamics. In 2015 the Nobel Prize has been obtained for similar work on methods of fluorescence microscopy with a priority in 2006. However, the practical importance and potential of our development is much broader than that of the Nobel laureates. We can see at once to build nano-objects, but they only see, and not in real time.
Proposed electronic model of superatoms greatly simplifies the task of atomic-molecular engineering.
#nanoclusters #superatom #supermolecule #nanoelectronics #nanophotonics, #3D nanoprinter #jet nanolithography #neurocomputer #immortality #Nobel Prize
Доклад Главного врача МЦ "Новомедицина» доктора медицинских наук, профессор а САРВИЛИНой Ирины Владиславовны на III съезде токсикологов России, Москва, 1-5 декабря 2008 года
EdCrunch 2018 - Skyeng - EdTech product scaling: How to influence key growth ...Michael Karpov
Skyeng company case:
"EdTech product scaling: How to influence key growth indicators and achieve rapid progress. Product VS Marketing look"
Global conference for technology in education #EdCrunch
https://2018.edcrunch.ru/en/
Movement to business goals: Data, Team, Users (4C Conference)Michael Karpov
In this talk Mikhail Karpov discuss the methods used to move to business goals faster on example of VK.com processes, including teams flexible structure and feedback loop from service audience
Nanostructured materials: Belarus - Russia - Ukraine. Collection of Plenary Reports IV International scientific conference. Minsk. 7-10 October 2014. Pp.68-80.
Plenary Talk
Nanoclusters as superatoms and supermolecules
http://physics.by/e107_files/public/nano2014_sbornik_tesdokladov.pdf
A.M. Ilyanok1, I.A. Timoshchenko2
1 CC “Nanobiology”, Minsk, Belarus
2 Belarusian State University, Minsk, Belarus
For the first time the opportunity of transfer functions of the human cerebral cortex in silicon neurochip of 10 cm^3 with 3D nanojet printer is shows. This is due to the fact that in the last 10 years a new direction in nanotechnology has appeared - the creation of organic and inorganic nanoclusters of certain size, called superatoms, which exhibit the unique properties of elementary atoms and can formally establish a new "periodic table". The development of an entirely new field of science opens the possibility to use cheaper isoelectronic analogues instead of expensive items.
In 1998, we proposed an electronic model of superatoms of helium in orthophaze and paraphase. These superatoms are formed from metal oxides and semiconductors. On this base we developed a new class of single-electron devices with unique physical properties. For example, one can create a computer with 10^16 transactions per second while consuming only a few joules of energy, which is close to the thermodynamic limit 3,4∙10^20 operations/joule. The computer can be grown in a 3D topology by jet nanolithography. Neuroprocessor with performance close to the one of the human cortex takes volume of few cubic centimeters. To demonstrate the formation conditions of superatoms we have developed a new model of an electron with energy of 0.1-0.2 eV, namely «cold» ring electron with radius of 7.25 nm. From the standpoint of superatoms we can consider the physical and chemical properties of proteins like supermolecules formed from superatoms. For example, the protein tubulin which forms nerve fibers and nuclear scaffolds and cells shows unique physical properties. It forms nanotubes with a diameter of 14.5 nm.
The developed technology of jet nanolithography allows us to grow inorganic artificial neurons, while watching their growth using the methods of nanophotonics. Back in 2005, we have patented scanning nanojet microscope, working in real time to monitor the living cell and its dynamics. In 2015 the Nobel Prize has been obtained for similar work on methods of fluorescence microscopy with a priority in 2006. However, the practical importance and potential of our development is much broader than that of the Nobel laureates. We can see at once to build nano-objects, but they only see, and not in real time.
Proposed electronic model of superatoms greatly simplifies the task of atomic-molecular engineering.
#nanoclusters #superatom #supermolecule #nanoelectronics #nanophotonics, #3D nanoprinter #jet nanolithography #neurocomputer #immortality #Nobel Prize
Доклад Главного врача МЦ "Новомедицина» доктора медицинских наук, профессор а САРВИЛИНой Ирины Владиславовны на III съезде токсикологов России, Москва, 1-5 декабря 2008 года
EdCrunch 2018 - Skyeng - EdTech product scaling: How to influence key growth ...Michael Karpov
Skyeng company case:
"EdTech product scaling: How to influence key growth indicators and achieve rapid progress. Product VS Marketing look"
Global conference for technology in education #EdCrunch
https://2018.edcrunch.ru/en/
Movement to business goals: Data, Team, Users (4C Conference)Michael Karpov
In this talk Mikhail Karpov discuss the methods used to move to business goals faster on example of VK.com processes, including teams flexible structure and feedback loop from service audience
"Пользователи: сигнал из космоса". CodeFest mini 2012Michael Karpov
О способах получения обратной связи от пользователей в российских и иностранных интернет-компаниях.
Также, на основе различных жизненных кейсов рассмотрим их полезность и применимость.
Михаил рассмотрит основные случаи и всякие примеры применения на основе Яндекса и нескольких других российских и иностранных компаний.
Как сделать команде приятное - Михаил Карпов (Яндекс)Michael Karpov
Команде приятное можно сделать разными способами.
Этот доклад о том, как это сделать с помощью вашего процесса.
Многие понимают то, что важно вовлекать команду в продукт, но также важно вовлекать команду в ваш процесс.
Для этого ваш процесс должен коротко и доходчиво отвечать на вопросы команды.
О них и поговорим.
сбор требований с помощью Innovation gamesMichael Karpov
За основу были взяты бизнес-игры от Люка Хоммана: innovationgames.com
Они представлены ниже в презентации: "Начни новый день", "Product Box", "Воспоминания о будущем", "Удиви клиента", "Катер", "Паутина".
Практическое занятие было не лишено соревновательного характера:
в первой части команды "разработчиков" собирали неявные знания с "пользователей", а во второй части должны были предложить им каждый свой продукт.
Естественно, что пользователи выбирают наиболее понравившийся (то есть наиболее удовлетворяющий их потребностям) и команда, предложившая данный продукт, побеждает.
Зачем нам Это? или Как продать agile командеMichael Karpov
Мы все сталкиваемся с ситуациями когда сложно работать с Заказчиком по Agile и уговорить его на подобный способ коммуникации.
Также, часто команде сложно уговорить своего менеджера.
Но!
Бывает и иначе: менеджер предлагает внедрять Agile, а команда "не до конца уверена"...
Именно о такой ситуации и рассказывает этот доклад!
8. Одно соединение становится разрешенным лекарством 250 Кандидатов в доклинические испытания 5,000 to 10 0 ,000 соединений - перебор in vitro, in vivo in silico или Стадии разработки нового лекарства 7-15 Лет ! $ 600- $ 700 M Клинические испытания - 80% проходят фазу I - 30% проходят фазу II - 80% проходят фазу III 5 кандидатов – клинические испытания Начальная стадия 0 2 4 6 8 10 12 14 16 III открытие ключевого вещества II I
9. 10-15 лет 50% времени затрачивается на разработку ингибиторов: экспериментально методом проб и ошибок Разработка базового соединения Lead compound Доклинические испытания базового соединения на животных Клинические испытания на людях Ключевой Самый дешевый этап Начальный этап Всё больше средств в R&D – все меньше новых лекарств ↓
10.
11.
12.
13.
14.
15. белок : тысячи атомов docking Слабые межмолекулярные взаимодействия Scoring – правильная оценка энергии связывания белок-лиганд Ключевые программы для дизайна лекарств лиганды : Десятки атомов Высокая точность :~ 1 kcal/mol ~ 0.05 eV Связывание происходит в воде Взаимодействие лиганда с водой Взаимодействие лиганда с белком Взаимодействие белка с водой WATER SOLVENT
16.
17. Докинг: безусловный поиск глобального минимума энергии Оригинальная программа докинга SOL Взаимодействие лиганда со всеми атомами белка записывается в виде набора сеток потенциалов в кубе: 22 Х 22 Х 22 Ангстрема 1 лиганд 1 CPU: 1-10 часов Пространство ≤ 21 измерений
18.
19. Что такое квантовая химия? P.A.M.Dirac Erwin Schr ö dinger Werner Heisenberg В.А. Фок
20.
21.
22.
23.
24.
25. Mulliken,1966 - применение метода МО к строению молекул Fukui, 1981 - применение метода МО к химическим реакциям Hoffmann, 1981 - применение метода МО к химическим реакциям Pople, 1998 – за разработку компьютерных методов в квантовой химии Kohn, 1998 – за разработку теории функционала плотности Нобелевские лауреаты в области компьютерной химии
26.
27. Молекулярные орбитали (МО) ψ i ( r ) – одноэлектронная волновая функция dr 3 0 │ ψ i ( r ) │ 2 dr - вероятность обнаружить электрон в малом объеме dr вблизи точки r Для описания электрона надо определить еще его спин . Полный набор функций, описывающих спин: α ( σ ) β ( σ ) σ – спиновая переменная, σ – это проекция спина на ось 0 z, σ z Для электрона σ = -1 /2 и σ = +1 /2 < α │ β > = < β │α > = 0, < α│α > = < β│β > = 1 ψ * i ( r ) ψ j ( r ) dr = δ ij ∫
28. Молекулярные спин-орбитали χ ( r, σ ) = χ ( x ) волновая функция электрона, описывающая его пространственное распределение и спин χ i ( r, σ ) = { ψ i ( r ) α ( σ ) ψ i ( r ) β ( σ ) χ i * ( x ) χ j ( x )= δ ij ∫ ∑ σ =±1/2
29. Метод Хартри-Фока Задача: как найти набор спин-орбиталей такой, чтобы при образовании из них многоэлектронной волновой функции в виде одного детерминанта Слэтера получить наилучшую аппроксимацию для основного состояния системы N электронов, которая описывается гамильтонианом: Считаем ядра атомов неподвижными – Адиабатическое Приближение.
30. МЕТОД ХАРТРИ-ФОКА: уравнение Рутана ( Roothaan ) Используя разложение орбиталей по базисным функциям: получаем выражение для плотности заряда: - матрица плотности Используя матрицу плотности переписываем матрицу Фока в виде: где
31. МЕТОД ХАРТРИ-ФОКА: уравнение Рутана ( Roothaan ) Это уравнение решается итерациями. Надо вычислить большое количество двух электронных интегралов. В разложении орбиталей по базису - число базисных функций. Если базисные функции вещественные, то При число разных интегралов=12 753 775
32.
33.
34. Конфигурационное взаимодействие (CI) Предел Хартри-Фока Full CI Точный результат Б А З И С Количество конфигураций – детерминантов Слэтера
37. PRIRODA vs PC GAMESS: fullerene C 60 N – количество шагов оптимизации Задание: оптимизация геометрии Метод: DFT-BLYP Базис: cc-pVDZ Количество атомов: 60 Количество процессоров: 64 275 6 -2285,592405 GAMESS 2 4 -2285,592412 PRIRODA Время , мин N Энергия, а.е.
38. PRIRODA vs PC GAMESS: олигопептид M – количество итераций SCF Задание: расчет энергии в точке Метод: HF Базис: cc-pVDZ Количество атомов: 148 Количество процессоров: 1 381 18 -3513 , 656019 GAMESS 27 17 -3513,656019 PRIRODA Время , мин M Энергия, а.е.