Эпигенетика
II Что такое эпигенетика ?  Эпи – над (по гречески) Наследственные изменения в генах без изменения последовательности ДНК Сайленсинг генов. Многие гены в организме человека – постоянно выключены. Но иногда гены могут выключены в результате какой-то патологии.
II Что такое эпигенетика  ?  События от оплодотворенной зиготы до взрослого организма Конечный результат
II Что такое эпигенетика  ?  Изучение феномена Не последовательность ДНК Влияет на функцию генов Наследуемые изменения
II Последовательность ДНК не меняется Модификация ДНК – метиляция цитозина, с последующим  связываниям  специфических белков, связывающихся с метилированной ДНК Модификация белков хроматина - гистонов Приводит к супеконденсированному состоянию хроматина, делая ДНК недоступной для ферментов транскрипции
II Последовательность ДНК одинакова во всех соматических клетках !!! Исключение – транспозоны, ….
II Немного истории
Ацетилирование – деацетилирование гистонов специальными ферментами II
II Два основных компонента эпигенетических изменений
II Метилирование ДНК в так называемых островках  CpG   (расположенных в промоторах многих генов) Модификация белков хроматина   гистон ацетил-трансферазами и деацетилазами Эти 2 механизма связаны, и вызывают: Импринтинг Инактивацию Х-хромосомы Образование гетерохроматина Сайленсинг повторяющихся последовательностей в ДНК
II
II Взаимосвязь метилирования и деацетилирования в подавлении транскрипции
II Взаимосвязь метилирования и деацетилирования в подавлении транскрипции
II Процесс метилирования в процессе эмбриогенеза
Гетерохроматин
Гетерохроматин вызывает бэндинг хромосом
II Открытия феномена в 1964 г.
II Промоторы
II de novo  метиляция  Чужеродной ДНК, интегрированной в эукариотический геном Вирусная ДНК Измененная нативная последовательность В случае манипуляции генома человеком В процессе эмбриогенеза Фермент – ДНК метил-трансфераза
II de novo  метиляция чужеродной ДНК
II Метиляция повторяющихся последовательностей ДНК Обычно сильно метилированы Одна из функций метиляции – подавляет возможные перемещения транспозонов В процессе эволюции часто происходила дупликация генов, что приводит к созданию семейств генов, кодирующих белки с близкими функциями, но часто лишние копии должны быть инактивированы
Figure 7.13  Genomes 3  (© Garland Science 2007)
Figure 7.15  Genomes 3  (© Garland Science 2007)
II Пример метилированной вирусной ДНК   Вирус Эпштейн-Барра -   Human herpesvirus 4  (HHV-4),  - вызывает мононуклеоз, но часто не вызывает никаких симптомов Интегрированные последовательности ДНК – метилированы. Свободная вирусная ДНК остается неметилированной Если впоследствии произойдет патологическое деметилирование и активация вирусной ДНК, это может привести к раковым заболеваниям – например – лимфоме
II Онко-факторы Мутации Точечные мутации Делеции Инсерции Хромосомные нарушения Полиплоидия Утрата или приобретение Транслокация   Инверсия Эпигенетика Метиляция ДНК
II Возможные последствия метиляции SAM
II pointmutation: Gene silencing: DNA  Methylationpattern: Activation of Protooncogenes: C m T C C m Chromosomal Instability C m C Эпигенетические механизмы
II Возможные последствия метиляции и нарушений метиляции
II Таким образом, мы можем унаследовать что-то кроме последовательности ДНК….
Геномный импринтинг Генный импринтинг — эпигенетический процесс, при котором экспрессия определенных генов осуществляется в зависимости от того, от какого родителя поступила аллель гена. Однако у млекопитающих менее одного процента генов импринтированы, то есть экспрессируется только одна аллель. Какая аллель будет экспрессироваться, зависит от пола родительского организма, предоставившего аллель. Например, для гена IGF2 (Инсулино-подобного фактора роста) экспрессируется только аллель, наследуемая от отца
Примеры Делеция импринтированного участка хромосомы может вызвать два разных заболевания  Синдром Прадера-Вилли  –  делеция в отцовской аллели Синдром Ангельмана – делеция в материнской аллели
Прадер-Вилли и Ангельман http://www.pwsausa.org/ http://www.angelman.org/ Импринтинг выключает одну из аллелей, в данном случае – материнскую, так что потеря отцовской алелли приводит к более серьезным последствиям (синдром Ангельмана), чем потеря материнской аллели – синдром Прадера-Вилли
Прадер-Вилли Умеренное отставание умственного развития Повышенный аппетит, приводящий к ожирению Характерные черты  Делеция  15q 11-13
Ангельман Походка «марионетки» Проблемы с моторикой и балансом Смех без причины Серьезное отставание в умственном развитии, особенно в использовании языка
Мозаицизм Один пример – случайное инактивирование Х-хромосомы в раннем эмбриогенезе Образуются разные группы клеток, в которых инактивированы разные Х-хромосомы Любая мутация, происходящая на ранних стадиях развития на уровне многоклеточного эмбриона, может привести к мозаицизму

Molbiol 2011-08-epigenetics

  • 1.
  • 2.
    II Что такоеэпигенетика ? Эпи – над (по гречески) Наследственные изменения в генах без изменения последовательности ДНК Сайленсинг генов. Многие гены в организме человека – постоянно выключены. Но иногда гены могут выключены в результате какой-то патологии.
  • 3.
    II Что такоеэпигенетика ? События от оплодотворенной зиготы до взрослого организма Конечный результат
  • 4.
    II Что такоеэпигенетика ? Изучение феномена Не последовательность ДНК Влияет на функцию генов Наследуемые изменения
  • 5.
    II Последовательность ДНКне меняется Модификация ДНК – метиляция цитозина, с последующим связываниям специфических белков, связывающихся с метилированной ДНК Модификация белков хроматина - гистонов Приводит к супеконденсированному состоянию хроматина, делая ДНК недоступной для ферментов транскрипции
  • 6.
    II Последовательность ДНКодинакова во всех соматических клетках !!! Исключение – транспозоны, ….
  • 7.
  • 8.
    Ацетилирование – деацетилированиегистонов специальными ферментами II
  • 9.
    II Два основныхкомпонента эпигенетических изменений
  • 10.
    II Метилирование ДНКв так называемых островках CpG (расположенных в промоторах многих генов) Модификация белков хроматина гистон ацетил-трансферазами и деацетилазами Эти 2 механизма связаны, и вызывают: Импринтинг Инактивацию Х-хромосомы Образование гетерохроматина Сайленсинг повторяющихся последовательностей в ДНК
  • 11.
  • 12.
    II Взаимосвязь метилированияи деацетилирования в подавлении транскрипции
  • 13.
    II Взаимосвязь метилированияи деацетилирования в подавлении транскрипции
  • 14.
    II Процесс метилированияв процессе эмбриогенеза
  • 15.
  • 16.
  • 17.
  • 18.
  • 19.
    II de novo метиляция Чужеродной ДНК, интегрированной в эукариотический геном Вирусная ДНК Измененная нативная последовательность В случае манипуляции генома человеком В процессе эмбриогенеза Фермент – ДНК метил-трансфераза
  • 20.
    II de novo метиляция чужеродной ДНК
  • 21.
    II Метиляция повторяющихсяпоследовательностей ДНК Обычно сильно метилированы Одна из функций метиляции – подавляет возможные перемещения транспозонов В процессе эволюции часто происходила дупликация генов, что приводит к созданию семейств генов, кодирующих белки с близкими функциями, но часто лишние копии должны быть инактивированы
  • 22.
    Figure 7.13 Genomes 3 (© Garland Science 2007)
  • 23.
    Figure 7.15 Genomes 3 (© Garland Science 2007)
  • 24.
    II Пример метилированнойвирусной ДНК Вирус Эпштейн-Барра - Human herpesvirus 4 (HHV-4), - вызывает мононуклеоз, но часто не вызывает никаких симптомов Интегрированные последовательности ДНК – метилированы. Свободная вирусная ДНК остается неметилированной Если впоследствии произойдет патологическое деметилирование и активация вирусной ДНК, это может привести к раковым заболеваниям – например – лимфоме
  • 25.
    II Онко-факторы МутацииТочечные мутации Делеции Инсерции Хромосомные нарушения Полиплоидия Утрата или приобретение Транслокация Инверсия Эпигенетика Метиляция ДНК
  • 26.
  • 27.
    II pointmutation: Genesilencing: DNA Methylationpattern: Activation of Protooncogenes: C m T C C m Chromosomal Instability C m C Эпигенетические механизмы
  • 28.
    II Возможные последствияметиляции и нарушений метиляции
  • 29.
    II Таким образом,мы можем унаследовать что-то кроме последовательности ДНК….
  • 30.
    Геномный импринтинг Генныйимпринтинг — эпигенетический процесс, при котором экспрессия определенных генов осуществляется в зависимости от того, от какого родителя поступила аллель гена. Однако у млекопитающих менее одного процента генов импринтированы, то есть экспрессируется только одна аллель. Какая аллель будет экспрессироваться, зависит от пола родительского организма, предоставившего аллель. Например, для гена IGF2 (Инсулино-подобного фактора роста) экспрессируется только аллель, наследуемая от отца
  • 31.
    Примеры Делеция импринтированногоучастка хромосомы может вызвать два разных заболевания Синдром Прадера-Вилли – делеция в отцовской аллели Синдром Ангельмана – делеция в материнской аллели
  • 32.
    Прадер-Вилли и Ангельманhttp://www.pwsausa.org/ http://www.angelman.org/ Импринтинг выключает одну из аллелей, в данном случае – материнскую, так что потеря отцовской алелли приводит к более серьезным последствиям (синдром Ангельмана), чем потеря материнской аллели – синдром Прадера-Вилли
  • 33.
    Прадер-Вилли Умеренное отставаниеумственного развития Повышенный аппетит, приводящий к ожирению Характерные черты Делеция 15q 11-13
  • 34.
    Ангельман Походка «марионетки»Проблемы с моторикой и балансом Смех без причины Серьезное отставание в умственном развитии, особенно в использовании языка
  • 35.
    Мозаицизм Один пример– случайное инактивирование Х-хромосомы в раннем эмбриогенезе Образуются разные группы клеток, в которых инактивированы разные Х-хромосомы Любая мутация, происходящая на ранних стадиях развития на уровне многоклеточного эмбриона, может привести к мозаицизму