Indonesia masih menghadapi masalah malaria karena memiliki banyak tempat yang cocok untuk perindukan nyamuk. Pada tahun 2007, 80% dari 495 kabupaten/kota di Indonesia adalah endemi malaria. Tingkat kematian akibat malaria masih berfluktuasi antara 0,26% pada 2000 hingga 0,49% pada 2003 meskipun telah turun menjadi 0,056% pada 2007 walaupun masih di atas target nasional 0,04%. Beberapa daerah belum menerbitkan