Piero Larizza – “La Robotica nella Bioinformatica”
Eusoft scegliere un LIMS per la ricerca NGS
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PER LA RICERCA NGS
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Stefano D’Ascoli - Amministratore Unico
EUSOFT Srl
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1° BiP Day, 5 dicembre 2013
2. CONTENUTI
1.
EVOLUZIONE DELLE ESIGENZE INFORMATIVE DEI LABORATORI NGS
2.
IL LIMS – LABORATORY INFORMATION MANAGEMENT SYSTEM
3.
FLUSSO INFORMATIVO SEMPLIFICATO DI UN LABORATORIO NGS
4.
IL LIMS PER NGS: SFIDE
5.
L’AZIENDA EUSOFT
Nome progetto
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3. EVOLUZIONE NELLE ESIGENZE
INFORMATIVE DEI LABORATORI NGS
Raccolta e
memorizzazione
dei dati generati
dagli strumenti
Utilizzo
contemporaneo dei
dati relativi a
campioni e progetti
Elaborare le analisi
a valle e alimentare
i punti di decisione
Per dare un senso ai dati al fine di utilizzarli per prendere decisioni
sono necessari strumenti per interrogare rapidamente e in modo intelligente
l’enorme quantità di dati e recuperare le informazioni associate ai campioni.
Nome progetto
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4. IL LIMS
Il L.I.M.S.(Laboratory Information Management System)
è un sistema informatico in grado di gestire le fasi
di Acquisizione - Elaborazione - Archiviazione
di tutti i dati generati dai laboratori e/o processi.
Un sistema L.I.M.S. consente di automatizzare tutti i processi di un laboratorio rendendo possibile l’accesso e
l’interpretazione dei dati archiviati.
Rende possibile la rintracciabilità di ogni campione processato, in conformità alle normative di riferimento (tra
cui UNI/ISO EN 17025, FDA 21 CFR Part 11).
Può essere utilizzato nei laboratori:
• pubblici (es. settore ambientale come ARPA)
• interni ad aziende di produzione per supporto alle
attività di controllo di qualità e R&D
• centri di ricerca
• conto terzi in tutti i settori merceologici
(ambiente, alimenti, acque, chimica, ecc.)
Nome progetto
5. FLUSSO INFORMATIVO SEMPLIFICATO
DI UN LABORATORIO NGS
A MONTE: APPLICAZIONI
INTERFACCIA STRUMENTI
INTERFACCIA UTENTE
SOFTWARE LIMS
Il LIMS invia la sequenza per lo strumento
Lo strumento invia i risultati al LIMS
Nome progetto
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A VALLE: APPLICAZIONI E ANALISI
6. IL LIMS PER NGS: SFIDE
La complessità e la variabilità associate alla ricerca NGS
rappresentano sfide senza precedenti per i LIMS tradizionali,
ormai maturi negli altri settori
I LIMS per i laboratori NGS devono poter offrire i seguenti vantaggi:
• tracciabilità del campione end-to-end;
• scalabilità in modo che i laboratori possano avviarsi e produrre
risultati rapidamente;
• adattabilità per aiutare i laboratori ad attuare cambiamenti nelle
tecnologie e nelle metodologie;
• gestione del workflow e strumenti di reporting operativo che
permettano di lavorare in modo efficiente e collaborativo.
Nome progetto
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7. EUSOFT Srl
• azienda informatica con sede a Bari e a Milano
• specializzata da 16 anni nella produzione, delivery,
manutenzione, assistenza di Eusoft.Lab LIMS
• oltre 200 clienti distribuiti sull’intero territorio italiano appartenenti ai settori: public
and utility (acquedotti ed energia), contractors, quality control (nei settori food &
beverage, petrolchemical) e R&D
• Ha avviato nel 2013 una collaborazione
• con ITB – Istituto Tecnologie Biomediche del CNR di Bari,
• accettando la sfida…
Nome progetto
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