SlideShare a Scribd company logo
Строение гена
ГЕН
• 1909г Иогансен
Ген - определенные условия, основы и детерминанты,
присутствующие в гаметах, являющиеся уникальными и
самостоятельными, и поэтому независимыми путями
определяющие многие характеристики организма
• 1900-е
Ген – дискретная единица наследственности (законы
Менделя)
Один ген = один признак
НО!
Плейотропия – множественное действие гена
Взаимодействие генов
• 1910-е
Ген – отдельный локус
Хромосомная теория наследственности
Ген = единица рекомбинации
Ген = единица рекомбинации
(Рекон)
НО!
• 1940-е
Ген – чертеж белка
Один ген = один фермент → один ген = один полипептид
• 1950-е
Ген - физическая молекула
ДНК – носитель генетической информации
Цистрон - участок ДНК, отвечающий за единичную функцию (Benzer 1955)
• 1960-е
Ген – транскрибируемый код
Центральная догма молекулярной биологии
(F.Crick, 1958, 1970)
DNA
RNA Protein
Ген = единица транскрипции
• 1970-1980-е
Ген – открытая рамка считывания (open reading
frame – ORF) части последовательности.
Возможность предсказания генов
• 1990-2000-е
Ген – аннотированная структурная единица
генома, зарегистрированная в одной из баз
данных
Гены прокариот
Транскрипция прокариот
Бактериальный промотор
Регуляторные элементы
Регуляторные элементы
Регуляция инициации транскрипции у прокариот
гашение
Регуляторные элементы
Опероны бактерий
1. Промотор
2. Оператор
3. Структурные гены
4. Терминатор транскрипции
+ Ген-регулятор
Триптофановый оперон
х 70
Аттенюация trp оперона
Лактозный оперон
• lacZ кодирует фермент β-галактозидазу, которая расщепляет дисахарид
лактозу на глюкозу и галактозу.
• lacY кодирует β-галактозид пермеазу, мембранный транспортный белок,
который переносит лактозу внутрь клетки.
• lacA кодирует β-галактозид трансацетилазу, фермент, переносящий
ацетильную группу от ацетил-КoA на бета-галактозиды.
• lacI – репрессор
CAP (Catabolite Activator Protein) – активатор
Лактозный оперон
Геном бактерии Escherichia coli
Гены эукариот
Эукариотический ген и этапы экспрессии
Интрон-экзонная структура
Интроны
• В более развитых организмах встречаются чаще
• Чем более развит организм, тем:
– больше генов с интронами
– интроны больше по размеру
• Практически все гены человека содержат интроны
(гены гистонов без интронов)
Пример экспрессии гена
Размеры генов человека
Ген инсулина
- один из самых маленьких генов человека
Ген дистрофина
- самый большой ген человека
Один ген – более чем один белок
• ENCODE pilot project – 2608 транскриптов в 487
локусах
Механизмы
• Альтернативные промоторы
• Альтернативный сплайсинг
• Редактирование РНК
• Комплексные перестройки ДНК (созревание В
лимфоцитов)
• Посттрансляционные модификации белков
Альтернативный промотор
Как минимум половина генов млекопитающих имеют более одного промотора
ENCODE pilot project – 273 гена с альтернативными промоторами в 399 генах
Альтернативный промотры гена
дистрофина
С – cortical
M – muscle
P – Purkinje cells
R – retinal
CNS – central nervous system
S – Schwann cells
G - general
Альтернативный сплайсинг
Типы альтернативного сплайсинга
А – пропуск интрона
В – альтернативный донорный
сайт
С – альтернативный
акцепторный сайт
D – пропуск экзона
Е – альтернативный экзон
Альтернативный сплайсинг гена
NRXN3
2 альтернативных промотора
24 экзона
Экзоны:
3, 4, 5, 12 – могут быть включены в мРНК или пропущены
7 – два альтернативных акцепторных сайта, может быть пропущен
22 – два альтернативных донорных сайта
23 – два альтернативных акцепторных сайта с разными рамками считывания, в
одной из которых стоп-кодон
24 – три альтернативных акцепторных сайта
Более 1000 разных белков
Транссплайсинг
RNA editing
• C → U
• A → I
• U → C
ADAR
Инозин образует связь с тимином
Созревание В лимфоцитов
• VDJ рекомбинация (65 генов V, 27 генов D, 6 генов J)
• Переключение классов антител
Созревание
В лимфоцитов
Созревание В лимфоцитов
Посттрансляционные
модификации белков
Регуляторные элементы генов
эукариот
Cis-regulatory elements (CRE)
• CRE отвечают за экспрессию генов в определенных тканях и/или в
определенное время
• Новые CRE → новые функции гена
Промотор эукариот
Регуляторный
элемент
Последовательность
Общий
транскрипционный
фактор
BRE G/C G/C G/A C G C C TFIIB
TATA T A T A A/T A A/T TBP
INR C/T C/T A N T/A C/T C/T TFIID
DPE A/G G A/T C G T G TFIID
BRE - B recognition element
INR - initiator element
DPE - downstream promoter element
Энхансеры и сайленсеры
- участки связывания активаторов и репрессоров
•Энхансер + активатор = ативация транскрипции
Сайленсер + репрессор = подавление транскрипции
• Не зависят от ориентации
• Могут находиться на значительном расстоянии от
промотора
Регуляторная область гена
Инсуляторы
- ограничивают влияние энхансеров и сайленсеров на экспрессию
других генов
Петлевая модель
LCR – locus control region
MAR – matrix-attachment
region = инсулятор
Регуляция рецептора трансферрина
Ген эукариот
Некодирующая РНК (ncRNA)
• tRNA
• rRNA
• small RNA: snoRNA, miRNA, siRNA, snRNA,
piRNA…
• long ncRNA
Доля некодирующей ДНК в геноме
Гены вирусов
ГЕН
• 1900-е Ген – дискретная единица наследственности
(законы Менделя)
Один ген = один признак
1910-е Ген – отдельный локус (Хромосомная теория
наследственности)
• 1940-е Ген – чертеж белка
Один ген = один фермент → один ген = один полипептид
• 1950-е Ген – физическая молекула
1960-е Ген – транскрибируемый код
Центральная догма молекулярной биологии
• 1970-1980-е Ген – открытая рамка считывания (open
reading frame – ORF) части последовательности
• 1990-2000-е Ген – аннотированная структурная единица
генома, зарегистрированная в одной из баз данных
Ген – это совокупность геномных последовательностей,
кодирующих сцепленный набор потенциально
перекрывающихся функциональных продуктов
Biotechnology 2012-07

More Related Content

Similar to Biotechnology 2012-07

Особенности регуляции транскрипции у прокариот и эукариот
Особенности регуляции транскрипции у прокариот и эукариотОсобенности регуляции транскрипции у прокариот и эукариот
Особенности регуляции транскрипции у прокариот и эукариот
Ilya Klabukov
 
JetPoint meeting @JetBrains on bioinformatics
JetPoint meeting @JetBrains on bioinformaticsJetPoint meeting @JetBrains on bioinformatics
JetPoint meeting @JetBrains on bioinformatics
olegshpynov
 
Gene expression and regulation
Gene expression and regulationGene expression and regulation
Gene expression and regulation
Татьяна Древицкая
 
Reaviz sintez belka синтез белка2
Reaviz sintez belka синтез белка2Reaviz sintez belka синтез белка2
Reaviz sintez belka синтез белка2
Konstantin German
 
Molbiol 2011-05-dna-rna-protein
Molbiol 2011-05-dna-rna-proteinMolbiol 2011-05-dna-rna-protein
Molbiol 2011-05-dna-rna-proteinNikolay Vyahhi
 
Molbiol 2011-05-dna-rna-protein
Molbiol 2011-05-dna-rna-proteinMolbiol 2011-05-dna-rna-protein
Molbiol 2011-05-dna-rna-proteinNikolay Vyahhi
 
Опыт применения данных секвенирования на платформе Illumina в генетике растений
Опыт применения данных секвенирования на платформе Illumina в генетике растенийОпыт применения данных секвенирования на платформе Illumina в генетике растений
Опыт применения данных секвенирования на платформе Illumina в генетике растений
Ilya Klabukov
 
Биохимические основы хранения и передачи генетической информации
Биохимические основы хранения и передачи генетической информацииБиохимические основы хранения и передачи генетической информации
Биохимические основы хранения и передачи генетической информацииYuri Korenovsky
 
Геномы и эволюция геномов
Геномы и эволюция геномовГеномы и эволюция геномов
Геномы и эволюция геномов
tophisopam
 
Генетическая инженерия сегодня
Генетическая инженерия сегодняГенетическая инженерия сегодня
Генетическая инженерия сегодня
Ilya Klabukov
 
DNA RNA Structure Ru
DNA RNA Structure RuDNA RNA Structure Ru
DNA RNA Structure Ru
Marina Voloshina
 
Biotech 2011-10-methods
Biotech 2011-10-methodsBiotech 2011-10-methods
Biotech 2011-10-methodsNikolay Vyahhi
 
бх лекция 16 17
бх лекция 16 17бх лекция 16 17
бх лекция 16 17
uranzul nyamsuren
 

Similar to Biotechnology 2012-07 (18)

Особенности регуляции транскрипции у прокариот и эукариот
Особенности регуляции транскрипции у прокариот и эукариотОсобенности регуляции транскрипции у прокариот и эукариот
Особенности регуляции транскрипции у прокариот и эукариот
 
JetPoint meeting @JetBrains on bioinformatics
JetPoint meeting @JetBrains on bioinformaticsJetPoint meeting @JetBrains on bioinformatics
JetPoint meeting @JetBrains on bioinformatics
 
Biotechnology 2012-09 0
Biotechnology 2012-09 0Biotechnology 2012-09 0
Biotechnology 2012-09 0
 
Biotechnology 2012-09
Biotechnology 2012-09Biotechnology 2012-09
Biotechnology 2012-09
 
Gene expression and regulation
Gene expression and regulationGene expression and regulation
Gene expression and regulation
 
Reaviz sintez belka синтез белка2
Reaviz sintez belka синтез белка2Reaviz sintez belka синтез белка2
Reaviz sintez belka синтез белка2
 
MolBiol #4.1
MolBiol #4.1MolBiol #4.1
MolBiol #4.1
 
Molbiol 2011-05-dna-rna-protein
Molbiol 2011-05-dna-rna-proteinMolbiol 2011-05-dna-rna-protein
Molbiol 2011-05-dna-rna-protein
 
Molbiol 2011-05-dna-rna-protein
Molbiol 2011-05-dna-rna-proteinMolbiol 2011-05-dna-rna-protein
Molbiol 2011-05-dna-rna-protein
 
Biotech autumn2012-02-model organisms
Biotech autumn2012-02-model organismsBiotech autumn2012-02-model organisms
Biotech autumn2012-02-model organisms
 
Опыт применения данных секвенирования на платформе Illumina в генетике растений
Опыт применения данных секвенирования на платформе Illumina в генетике растенийОпыт применения данных секвенирования на платформе Illumina в генетике растений
Опыт применения данных секвенирования на платформе Illumina в генетике растений
 
Биохимические основы хранения и передачи генетической информации
Биохимические основы хранения и передачи генетической информацииБиохимические основы хранения и передачи генетической информации
Биохимические основы хранения и передачи генетической информации
 
Геномы и эволюция геномов
Геномы и эволюция геномовГеномы и эволюция геномов
Геномы и эволюция геномов
 
Генетическая инженерия сегодня
Генетическая инженерия сегодняГенетическая инженерия сегодня
Генетическая инженерия сегодня
 
Biotechnology 2012-10
Biotechnology 2012-10Biotechnology 2012-10
Biotechnology 2012-10
 
DNA RNA Structure Ru
DNA RNA Structure RuDNA RNA Structure Ru
DNA RNA Structure Ru
 
Biotech 2011-10-methods
Biotech 2011-10-methodsBiotech 2011-10-methods
Biotech 2011-10-methods
 
бх лекция 16 17
бх лекция 16 17бх лекция 16 17
бх лекция 16 17
 

More from BioinformaticsInstitute

Graph genome
Graph genome Graph genome
Nanopores sequencing
Nanopores sequencingNanopores sequencing
Nanopores sequencing
BioinformaticsInstitute
 
A superglue for string comparison
A superglue for string comparisonA superglue for string comparison
A superglue for string comparison
BioinformaticsInstitute
 
Comparative Genomics and de Bruijn graphs
Comparative Genomics and de Bruijn graphsComparative Genomics and de Bruijn graphs
Comparative Genomics and de Bruijn graphs
BioinformaticsInstitute
 
Биоинформатический анализ данных полноэкзомного секвенирования: анализ качес...
 Биоинформатический анализ данных полноэкзомного секвенирования: анализ качес... Биоинформатический анализ данных полноэкзомного секвенирования: анализ качес...
Биоинформатический анализ данных полноэкзомного секвенирования: анализ качес...BioinformaticsInstitute
 
Вперед в прошлое. Методы генетической диагностики древней днк
Вперед в прошлое. Методы генетической диагностики древней днкВперед в прошлое. Методы генетической диагностики древней днк
Вперед в прошлое. Методы генетической диагностики древней днк
BioinformaticsInstitute
 
Knime & bioinformatics
Knime & bioinformaticsKnime & bioinformatics
Knime & bioinformatics
BioinformaticsInstitute
 
"Зачем биологам суперкомпьютеры", Александр Предеус
"Зачем биологам суперкомпьютеры", Александр Предеус"Зачем биологам суперкомпьютеры", Александр Предеус
"Зачем биологам суперкомпьютеры", Александр Предеус
BioinformaticsInstitute
 
Иммунотерапия раковых опухолей: взгляд со стороны системной биологии. Максим ...
Иммунотерапия раковых опухолей: взгляд со стороны системной биологии. Максим ...Иммунотерапия раковых опухолей: взгляд со стороны системной биологии. Максим ...
Иммунотерапия раковых опухолей: взгляд со стороны системной биологии. Максим ...
BioinformaticsInstitute
 
Рак 101 (Мария Шутова, ИоГЕН РАН)
Рак 101 (Мария Шутова, ИоГЕН РАН)Рак 101 (Мария Шутова, ИоГЕН РАН)
Рак 101 (Мария Шутова, ИоГЕН РАН)
BioinformaticsInstitute
 
Плюрипотентность 101
Плюрипотентность 101Плюрипотентность 101
Плюрипотентность 101
BioinformaticsInstitute
 
Секвенирование как инструмент исследования сложных фенотипов человека: от ген...
Секвенирование как инструмент исследования сложных фенотипов человека: от ген...Секвенирование как инструмент исследования сложных фенотипов человека: от ген...
Секвенирование как инструмент исследования сложных фенотипов человека: от ген...
BioinformaticsInstitute
 
Инвестиции в биоинформатику и биотех (Андрей Афанасьев)
Инвестиции в биоинформатику и биотех (Андрей Афанасьев)Инвестиции в биоинформатику и биотех (Андрей Афанасьев)
Инвестиции в биоинформатику и биотех (Андрей Афанасьев)
BioinformaticsInstitute
 
Biodb 2011-05
Biodb 2011-05Biodb 2011-05

More from BioinformaticsInstitute (20)

Graph genome
Graph genome Graph genome
Graph genome
 
Nanopores sequencing
Nanopores sequencingNanopores sequencing
Nanopores sequencing
 
A superglue for string comparison
A superglue for string comparisonA superglue for string comparison
A superglue for string comparison
 
Comparative Genomics and de Bruijn graphs
Comparative Genomics and de Bruijn graphsComparative Genomics and de Bruijn graphs
Comparative Genomics and de Bruijn graphs
 
Биоинформатический анализ данных полноэкзомного секвенирования: анализ качес...
 Биоинформатический анализ данных полноэкзомного секвенирования: анализ качес... Биоинформатический анализ данных полноэкзомного секвенирования: анализ качес...
Биоинформатический анализ данных полноэкзомного секвенирования: анализ качес...
 
Вперед в прошлое. Методы генетической диагностики древней днк
Вперед в прошлое. Методы генетической диагностики древней днкВперед в прошлое. Методы генетической диагностики древней днк
Вперед в прошлое. Методы генетической диагностики древней днк
 
Knime & bioinformatics
Knime & bioinformaticsKnime & bioinformatics
Knime & bioinformatics
 
"Зачем биологам суперкомпьютеры", Александр Предеус
"Зачем биологам суперкомпьютеры", Александр Предеус"Зачем биологам суперкомпьютеры", Александр Предеус
"Зачем биологам суперкомпьютеры", Александр Предеус
 
Иммунотерапия раковых опухолей: взгляд со стороны системной биологии. Максим ...
Иммунотерапия раковых опухолей: взгляд со стороны системной биологии. Максим ...Иммунотерапия раковых опухолей: взгляд со стороны системной биологии. Максим ...
Иммунотерапия раковых опухолей: взгляд со стороны системной биологии. Максим ...
 
Рак 101 (Мария Шутова, ИоГЕН РАН)
Рак 101 (Мария Шутова, ИоГЕН РАН)Рак 101 (Мария Шутова, ИоГЕН РАН)
Рак 101 (Мария Шутова, ИоГЕН РАН)
 
Плюрипотентность 101
Плюрипотентность 101Плюрипотентность 101
Плюрипотентность 101
 
Секвенирование как инструмент исследования сложных фенотипов человека: от ген...
Секвенирование как инструмент исследования сложных фенотипов человека: от ген...Секвенирование как инструмент исследования сложных фенотипов человека: от ген...
Секвенирование как инструмент исследования сложных фенотипов человека: от ген...
 
Инвестиции в биоинформатику и биотех (Андрей Афанасьев)
Инвестиции в биоинформатику и биотех (Андрей Афанасьев)Инвестиции в биоинформатику и биотех (Андрей Афанасьев)
Инвестиции в биоинформатику и биотех (Андрей Афанасьев)
 
Biodb 2011-everything
Biodb 2011-everythingBiodb 2011-everything
Biodb 2011-everything
 
Biodb 2011-05
Biodb 2011-05Biodb 2011-05
Biodb 2011-05
 
Biodb 2011-04
Biodb 2011-04Biodb 2011-04
Biodb 2011-04
 
Biodb 2011-03
Biodb 2011-03Biodb 2011-03
Biodb 2011-03
 
Biodb 2011-01
Biodb 2011-01Biodb 2011-01
Biodb 2011-01
 
Biodb 2011-02
Biodb 2011-02Biodb 2011-02
Biodb 2011-02
 
Ngs 3 1
Ngs 3 1Ngs 3 1
Ngs 3 1
 

Biotechnology 2012-07