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本間善夫(ecosci.jp / サイエンスカフェにいがた)
電気通信大学 平成29年度『サイエンス・コミュニケーション演習』(2017/09/07)
http://www.ecosci.jp/
化学コミュニケーション賞
第1回(2011) 第2回(2012) 第3回(2013)
佐藤 健太郎さん 山口 潤一郎さん 本間 善夫
2017/10/21 一般公開イベント
(熊本市) 講演
http://www.chem.kumamo
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化学コミュニケーション賞
第1回(2011) 第2回(2012) 第3回(2013)
佐藤 健太郎さん 山口 潤一郎さん 本間 善夫
◆リアルとバーチャルでカガクをツタエル 自己紹介と
して
http://www.chem.kumamoto-u...
化学コミュニケーション賞2013
http://www.ecosci.jp/
今後はエコサイと読んでいただければ…
化学コミュニケーション賞2013
これまでecosci.jpのURL・コンテンツや著書などが紹介された
書籍例(共著書含む) リアルとバーチャ
ル
http://www.fuzambo-
intl.com/index.php?main_page=page&id=239
https://www.chart.co.jp/goods/item/
rika/23303.php
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◆ビッグヒストリー;コレクティブ・ラーニング #学生
の力
日本コンピュータ化学会@サイエンスアゴラ(2011~)
日本コンピュータ化学会 科学コミュニケーション室 http://www.ecosci.jp/sccj_sc/
サイエンスセミナー...
化学コミュニケーション賞2013
2006
2007
2008
2009
2010
2011
2012
2013
サイエンスアゴラ出展
これ以降は http://www.ecosci.jp/sccj_sc/ 参照
リアルとバーチャル ※“手法”...
化学コミュニケーション賞2013
2008
2009
2010
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2007
2013
運営を協力してい
る公民館カフェ記
事
2017
2014
リアルとバーチャル ※“手法”と“場”
化学コミュニケーション賞2013
2008
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2007
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運営を協力してい
る公民館カフェ記
事
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https://scienceportal.jst.go.jp/events/events...
化学コミュニケーション賞2013
2008
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2010
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2007
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運営を協力してい
る公民館カフェ記
事
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http://jaxa-sf.jp/
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化学コミュニケーション賞2013
迅速性
協調・連携・双方向性
継続性
今後はエコサイと読んでいただければ…
サイエンス・コミュニケーション演習
科学コミュニケーションは狭い業界
ネットワーク 機能するのは1/20 ?
…個人活動の場合
リアルとバーチャル ※“手法”と“場”
裏方と表方(演じ手)
書き手と描き手 ※テキストと画像/動画
彼...
https://www.youtube.com/
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http://skplan.main.jp/sunnyday/
2017/05/12/post-9225/
◆ネット上の発信の場の選択 継続性
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◆目に見えない原子・分子をどうツタエル?
http://www.ecosci.jp/BigHistory/
http://stw.mext.go.jp/series.html
書き手と描き手 ※テキストと画像/動画
http://www.eco...
◆目に見えない原子・分子をどうツタエル?
http://www.ecosci.jp/BigHistory/
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http://www.ecosci.jp/
原子・分子には色がある?...
「ビッグヒストリー」本 p.83・332にペ
ニシリン
なぜ高校「化学」で官能基を学ぶの
か?
有機概念図簡易計算アプリ
http://www.ecosci.jp/ocd-app/
https://www.amazon.co.jp/
dp/41...
「ビッグヒストリー」本 p.83・332にペ
ニシリン
なぜ高校「化学」で官能基を学ぶの
か?
有機概念図簡易計算アプリ
http://www.ecosci.jp/ocd-app/
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dp/41...
“水と油”で見る20種類のアミノ酸
アミノ酸
特性基 R hydropathy
極性 log P
酸性・
塩基性
極性・非極性 Cleftの分類 等電点
O I I/O index
Ile I イソロイシン 80 0 0 4.5 5.2 -1....
ヒト
約60兆個の細胞
“動物細胞には約1万種類,数にして約
100億個のタンパク質分子が存在し,…”
http://www.newtonpress.co.jp/
other/cell.html p.695
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サイエンス・コミュニケーション...
◆生命誕生
http://stw.mext.go.jp/series.html
http://www.ecosci.jp/s/bm_all_j.html
伝える/動かす/包む
サイエンス・コミュニケーション演習
※生体分子の構造決定に用いる機器の例(X線回折法)
…日本コンピュータ化学会年会2007秋季年会で見学し
たSPring-8で撮影
◆生命誕生 《DNA》
「ビッグヒストリー」本 p.71ほか
にDNA
タンパク質の1次構造から高次構造までを参...
◆生命誕生;生物と無生物 #物化生地
「ビッグヒストリー」本 p.64“生命
とは?”
「ビッグヒストリー」本 p.76の『最
初の細胞はどこでどのように誕生した
のか?』にはブラックスモーカー。
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◆生命を支えるエネルギーと元素
http://www.ecosci.jp/s/Mo_W.html
http://www.sankyoshuppan.
co.jp/products/detail.php?pr
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画期的分子模型;ヒトヘモグロビン
PDB 2HHB(4量体)
http://www.ecosci.jp/pdb/hemoglobin_s.html
高校化学・生物でタンパク質の1次構造~4次構造を
説明する際に,4次構造で例示されるのが通例ヘモ...
◆タンパク質の1次構造~4次構造
RCSB PDB
http://www.pdb.org/pdb/
http://www.youtube.com/watch?
v=qBRFIMcxZNM
http://www.chart.co.jp/softw...
◆生命誕生;チューブワーム #深海
チューブワーム由来ヘモグロビン(24量体)とヒトのヘモグロビン(4量体)の
比較http://www.ecosci.jp/s/bm_tubeworm.html
http://www.ecosci.jp/pdb...
◆ヘモグロビンで見る分子系統学
http://www.ecosci.jp/pdb/
hemoglobin_s.html
Genetics/生命の連続性 - データベース高度利用者養成
http://togodb.sel.is.ocha.ac.j...
https://www.jstage.jst.go.jp/article/
biophys/55/2/55_104/_pdf
㊙スタジオミダス提供の
分子模型製作中の写真
サイエンス・コミュニケーション演習
◆ 研究・教育分野でも広がる3Dプリ...
◆生命を支えるエネルギーと元素
http://www.ecosci.jp/
chem13/topics15d.ht
ml#08
●ニック・レーン 著,斉藤隆央 訳,「生命、
エネルギー、進化」,みすず書房(2016)
http://www.ms...
◆生命を支えるエネルギーと元素
http://www.ecosci.jp/s/bm_m_ps.html
http://www.ecosci.jp/s/bm_m_SF4.html
●「見てわかる構造生命科学」(化学同人)
フルカラー図版・アニメー...
◆生命を支えるエネルギーと元素
http://www.ecosci.jp/s/bm_m_ps.html
http://www.ecosci.jp/s/bm_m_SF4.html
●「見てわかる構造生命科学」(化学同人)
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◆生命を支えるエネルギーと元素
#深海 #物化生地
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●「見てわかる構造生命科学」(化学同人)
フル...
◆生命を支えるエネルギーと元素
#カガク #哲学 #生命 & 統合学
http://www.ecosci.jp/chem13/
topics16a.html#03
●池田善昭・福岡伸一,「福岡伸一、西田哲学を読む
生命をめぐる思索の旅 動的平衡...
http://www.ecosci.jp/s/bm_m_ps2.html
光合成光化学系IIに関与する巨大なタ
ンパク質の中にある光化学反応中心の
Mn4CaO5クラスターを含む1つのタン
パク質だけを作成したもの。同クラス
ターの“歪んだ椅子...
http://www.hayakawa-
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◆生体分子の使い回し例 GPCR
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◆分子と環境問題 “アントロポシーン”
#生物 #環境 #国際
http://www.gizmodo.jp/2017/01/weight-
of-humanitys-footprint.html
環境問題はp.314ほか多数
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画期的分子模型;
Oct1/Sox2/DNA複合体
PDB 1GT0
http://www.ecosci.jp/pdb/iPS_1gt0.html
DNAを含むデータとして選んだのが,iPS細胞の山中4
因子(Oct3/4・Sox2・Klf4・...
サイエンス・コミュニケーション演習
科学コミュニケーションは狭い業界
ネットワーク 機能するのは1/20 ?
…個人活動の場合
リアルとバーチャル ※“手法”と“場”
裏方と表方(演じ手)
書き手と描き手 ※テキストと画像/動画
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リアルとバーチャルでカガクをツタエル(電気通信大学 平成29年度『サイエンス・コミュニケーション演習』,2017/09/07)

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リアルとバーチャルでカガクをツタエル(電気通信大学 平成29年度『サイエンス・コミュニケーション演習』,2017/09/07)
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リアルとバーチャルでカガクをツタエル(電気通信大学 平成29年度『サイエンス・コミュニケーション演習』,2017/09/07)

  1. 1. 本間善夫(ecosci.jp / サイエンスカフェにいがた) 電気通信大学 平成29年度『サイエンス・コミュニケーション演習』(2017/09/07) http://www.ecosci.jp/
  2. 2. 化学コミュニケーション賞 第1回(2011) 第2回(2012) 第3回(2013) 佐藤 健太郎さん 山口 潤一郎さん 本間 善夫 2017/10/21 一般公開イベント (熊本市) 講演 http://www.chem.kumamo to-u.ac.jp/~sccj2017/ 2017/11/26 日本コンピュータ 化学会@サイエンスアゴラ 2017(お台場) トーク セッション http://www.ecosci.jp/sccj_ sa2017/ 2017/11/26 日本コンピュータ 化学会@サイエンスアゴラ 2017(お台場) ブース展 示 http://www.ecosci.jp/sccj_ sa2017/ ◆リアルとバーチャルでカガクをツタエル 自己紹介と して 裏方と表方(演じ 手)
  3. 3. 化学コミュニケーション賞 第1回(2011) 第2回(2012) 第3回(2013) 佐藤 健太郎さん 山口 潤一郎さん 本間 善夫 ◆リアルとバーチャルでカガクをツタエル 自己紹介と して http://www.chem.kumamoto-u.ac.jp/~sccj2017/ http://www.ecosci.jp/sccj_sa2017/ http://www.shiminkagaku.org/ 30101020170903_honma/
  4. 4. 化学コミュニケーション賞2013 http://www.ecosci.jp/ 今後はエコサイと読んでいただければ…
  5. 5. 化学コミュニケーション賞2013 これまでecosci.jpのURL・コンテンツや著書などが紹介された 書籍例(共著書含む) リアルとバーチャ ル
  6. 6. http://www.fuzambo- intl.com/index.php?main_page=page&id=239 https://www.chart.co.jp/goods/item/ rika/23303.php http://www.jst.go.jp/csc/scienceagora/ reports/2015/program/booth/aa_051/ 化学コミュニケーション賞2013 リアルとバーチャ ル
  7. 7. ◆ビッグヒストリー;コレクティブ・ラーニング #学生 の力 日本コンピュータ化学会@サイエンスアゴラ(2011~) 日本コンピュータ化学会 科学コミュニケーション室 http://www.ecosci.jp/sccj_sc/ サイエンスセミナー in 江戸川大学(2013~) http://www.edogawa- u.ac.jp/news/20160613_2.html 日本コンピュータ化学会@サイエンスアゴ ラ http://www.ecosci.jp/sccj_sa2016/ 化学コミュニケーション賞2013 リアルとバーチャル ※“手法”と“場” サイエンスカフェにいがた@と やのがたグリーン・フェスタ 2013http://www.ecosci.jp/ n-cafe/gw2013.html
  8. 8. 化学コミュニケーション賞2013 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 サイエンスアゴラ出展 これ以降は http://www.ecosci.jp/sccj_sc/ 参照 リアルとバーチャル ※“手法”と“場”
  9. 9. 化学コミュニケーション賞2013 2008 2009 2010 2011 2007 2013 運営を協力してい る公民館カフェ記 事 2017 2014 リアルとバーチャル ※“手法”と“場”
  10. 10. 化学コミュニケーション賞2013 2008 2009 2010 2011 2007 2013 運営を協力してい る公民館カフェ記 事 2017 2014 https://scienceportal.jst.go.jp/events/events.php http://cafesci-portal.seesaa.net/ http://www.ecosci.jp/n-cafe/ リアルとバーチャル ※“手法”と“場” http://honz.jp/articles/-/43409
  11. 11. 化学コミュニケーション賞2013 2008 2009 2010 2011 2007 2013 運営を協力してい る公民館カフェ記 事 2017 2014 http://jaxa-sf.jp/ https://www.yodosha.co.jp/jikkenigaku/ interview/9784758100502_01/ http://www.ecosci.jp/n-cafe/ リアルとバーチャル ※“手法”と“場” http://honz.jp/articles/-/43409https://www.amazon.co.jp/dp/4782800541
  12. 12. 化学コミュニケーション賞2013 迅速性 協調・連携・双方向性 継続性 今後はエコサイと読んでいただければ…
  13. 13. サイエンス・コミュニケーション演習 科学コミュニケーションは狭い業界 ネットワーク 機能するのは1/20 ? …個人活動の場合 リアルとバーチャル ※“手法”と“場” 裏方と表方(演じ手) 書き手と描き手 ※テキストと画像/動画 彼我の差 今後はエコサイと読んでいただければ… Ugokimawaru Enryoshinai Communication
  14. 14. https://www.youtube.com/ watch?v=BZ0XHr-EI28 http://skplan.main.jp/sunnyday/ 2017/05/12/post-9225/ ◆ネット上の発信の場の選択 継続性 https://www.amazon.co.jp/ dp/4757102453 …2008刊 リアルとバーチャル ※“手法”と“場” https://en.wikipedia.org/ …日本語版が無い場合も サイエンス・コミュニケーション演習
  15. 15. ◆目に見えない原子・分子をどうツタエル? http://www.ecosci.jp/BigHistory/ http://stw.mext.go.jp/series.html 書き手と描き手 ※テキストと画像/動画 http://www.ecosci.jp/ 原子・分子には色がある? サイエンス・コミュニケーション演習
  16. 16. ◆目に見えない原子・分子をどうツタエル? http://www.ecosci.jp/BigHistory/ http://stw.mext.go.jp/series.html http://www.ecosci.jp/ 原子・分子には色がある? サイエンス・コミュニケーション演習 リアルとバーチャル ※“手法”と“場” http://www.ecosci.jp/m/
  17. 17. 「ビッグヒストリー」本 p.83・332にペ ニシリン なぜ高校「化学」で官能基を学ぶの か? 有機概念図簡易計算アプリ http://www.ecosci.jp/ocd-app/ https://www.amazon.co.jp/ dp/4167138182 サイエンス・コミュニケーション演習 ◆目に見えない原子・分子をどうツタエル? 有機概念図を生物界のルールとして利用する
  18. 18. 「ビッグヒストリー」本 p.83・332にペ ニシリン なぜ高校「化学」で官能基を学ぶの か? 有機概念図簡易計算アプリ http://www.ecosci.jp/ocd-app/ https://www.amazon.co.jp/ dp/4167138182 サイエンス・コミュニケーション演習 ◆目に見えない原子・分子をどうツタエル? 有機概念図を生物界のルールとして利用する http://www.ecosci.jp/ocd/
  19. 19. “水と油”で見る20種類のアミノ酸 アミノ酸 特性基 R hydropathy 極性 log P 酸性・ 塩基性 極性・非極性 Cleftの分類 等電点 O I I/O index Ile I イソロイシン 80 0 0 4.5 5.2 -1.70 中性 非極性(疎水性) Aliphatic 6.02 Leu L ロイシン 70 0 0 3.8 4.9 -1.52 中性 非極性(疎水性) Aliphatic 5.98 Val V バリン 50 0 0 4.2 5.9 -2.26 中性 非極性(疎水性) Aliphatic 5.96 Ala A アラニン 20 0 0 1.8 8.1 -2.85 中性 非極性(疎水性) Aliphatic 6.00 Phe F フェニルアラニン 140 15 0.107 2.8 5.2 -1.38 中性 非極性(疎水性) Aromatic 5.48 Pro P プロリン 60 10 0.167 -1.6 8.0 -2.54 中性 非極性(疎水性) Pro & Gly 6.30 Met M メチオニン 100 20 0.200 1.9 5.7 -1.87 中性 非極性(疎水性) Aliphatic 5.74 Cys C システイン 60 20 0.333 2.5 5.5 -2.49 中性 極性(中性) Cysteine 5.07 Trp W トリプトファン 180 130 0.722 -0.9 5.4 -1.05 中性 非極性(疎水性) Aromatic 5.89 Tyr Y チロシン 140 115 0.821 -1.3 6.2 -2.26 中性 極性(中性) Aromatic 5.66 Lys K リシン 80 70 0.875 -3.9 11.3 -3.05 塩基性 極性(塩基性) Positive 9.74 Gly G グリシン 0 0 - -0.4 9.0 -3.21 中性 非極性(疎水性) Pro & Gly 5.97 His H ヒスチジン 80 152 1.900 -3.2 10.4 -3.32 塩基性 極性(塩基性) Positive 7.59 Arg R アルギニン 80 190 2.375 -4.5 10.5 -4.20 塩基性 極性(塩基性) Positive 10.76 Thr T トレオニン 40 100 2.500 -0.7 8.6 -2.94 中性 極性(中性) Neutral 6.16 Glu E グルタミン酸 60 150 2.500 -3.5 12.3 -3.69 酸性 極性(酸性) Negative 3.22 Gln Q グルタミン 60 200 3.333 -3.5 10.5 -3.64 中性 極性(中性) Neutral 5.65 Asp D アスパラギン酸 40 150 3.750 -3.5 13.0 -3.89 酸性 極性(酸性) Negative 2.77 Ser S セリン 20 100 5.000 -0.8 9.2 -3.07 中性 極性(中性) Neutral 5.68 Asn N アスパラギン 40 200 5.000 -3.5 11.6 -3.82 中性 極性(中性) Neutral 5.41 http://www.ecosci.jp/amino/amino2j.html
  20. 20. ヒト 約60兆個の細胞 “動物細胞には約1万種類,数にして約 100億個のタンパク質分子が存在し,…” http://www.newtonpress.co.jp/ other/cell.html p.695 37 サイエンス・コミュニケーション演習 ●お勧めYouTube動画集 https://www.youtube.com/playlist?list=PLRS zpxVn06du0CsLsW5-v2xZh4LX9DAkp
  21. 21. ◆生命誕生 http://stw.mext.go.jp/series.html http://www.ecosci.jp/s/bm_all_j.html 伝える/動かす/包む サイエンス・コミュニケーション演習
  22. 22. ※生体分子の構造決定に用いる機器の例(X線回折法) …日本コンピュータ化学会年会2007秋季年会で見学し たSPring-8で撮影 ◆生命誕生 《DNA》 「ビッグヒストリー」本 p.71ほか にDNA タンパク質の1次構造から高次構造までを参照できるサ イト例 http://themedicalbiochemistrypage.org/protein -structure.html ロザリンド・フランクリンら によるX線回折写真 Molecular Configuration in Sodium Thymonucleate Franklin R. and Gosling R.G. Nature 171, 740-741 (1953) サイエンス・コミュニケーション演習
  23. 23. ◆生命誕生;生物と無生物 #物化生地 「ビッグヒストリー」本 p.64“生命 とは?” 「ビッグヒストリー」本 p.76の『最 初の細胞はどこでどのように誕生した のか?』にはブラックスモーカー。 http://www.ecosci.jp/life/ https://www.bighistory project.com/chapters/3 #life-begins 長沼 毅「生命の始まりを 探して 僕は生物学者に なった」p.73に“硫化鉄 が黄鉄鉱になる過程で出 てくる化学エネルギーを 使って…” https://www.amazon. co.jp/dp/4309617018 http://www.ecosci.jp/km/ km_ligand.html サイエンス・コミュニケーション演習
  24. 24. ◆生命を支えるエネルギーと元素 http://www.ecosci.jp/s/Mo_W.html http://www.sankyoshuppan. co.jp/products/detail.php?pr oduct_id=637 http://www.ecosci.jp/N/ テトラピロールって? サイエンス・コミュニケーション演習
  25. 25. 画期的分子模型;ヒトヘモグロビン PDB 2HHB(4量体) http://www.ecosci.jp/pdb/hemoglobin_s.html 高校化学・生物でタンパク質の1次構造~4次構造を 説明する際に,4次構造で例示されるのが通例ヘモグ ロビンである。ヘムの鉄原子に酸素分子が結合して体 中に運ばれる。4量体でヘムも4分子あり,効率的に機 能している。写真のように4量体が磁石で接合できるの で,サイエンスアゴラや各地の一般公開イベントでこど も達にもパズル感覚で組立てを楽しんでもらっている。 新模型はまだ高価であるが,共同購入などで高校理科 室に一括で備えるようなことを企画すれば安くなる可能 性もあろう。 http://www.rcsb.org/pdb/101/static101.do?p=education_ discussion/educational_resources/ https://pdbj.org/mom/41 ◆生命誕生;ヘモグロビン サイエンス・コミュニケーション演習
  26. 26. ◆タンパク質の1次構造~4次構造 RCSB PDB http://www.pdb.org/pdb/ http://www.youtube.com/watch? v=qBRFIMcxZNM http://www.chart.co.jp/software/ tab/ipad/sample.html タンパク質結晶生成宇宙実験(JAXA) http://iss.jaxa.jp/kiboexp/theme /first/protein/ サイエンス・コミュニケーション演習
  27. 27. ◆生命誕生;チューブワーム #深海 チューブワーム由来ヘモグロビン(24量体)とヒトのヘモグロビン(4量体)の 比較http://www.ecosci.jp/s/bm_tubeworm.html http://www.ecosci.jp/pdb/hemoglobin_s.html https://www.youtube.com/watch?v= NUKX2zN77HA …2010/04/07公開 http://shinkai2017.jp/ PDBj 今月の分子 http://pdbj.org/mom?id=41 サイエンス・コミュニケーション演習 “スルメを見てイカがわかるか!?”
  28. 28. ◆ヘモグロビンで見る分子系統学 http://www.ecosci.jp/pdb/ hemoglobin_s.html Genetics/生命の連続性 - データベース高度利用者養成 http://togodb.sel.is.ocha.ac.jp/pukiwiki/Genetics/%C0%B8 %CC%BF%A4%CE%CF%A2%C2%B3%C0%AD.html サイエンス・コミュニケーション演習
  29. 29. https://www.jstage.jst.go.jp/article/ biophys/55/2/55_104/_pdf ㊙スタジオミダス提供の 分子模型製作中の写真 サイエンス・コミュニケーション演習 ◆ 研究・教育分野でも広がる3Dプリンタ利用 http://www.zcorp.com/jp/Products/3D-Printers/ZPrinter- 450/spage.aspx http://www.pict-lab.uec.ac.jp/jp/
  30. 30. ◆生命を支えるエネルギーと元素 http://www.ecosci.jp/ chem13/topics15d.ht ml#08 ●ニック・レーン 著,斉藤隆央 訳,「生命、 エネルギー、進化」,みすず書房(2016) http://www.msz.co.jp/book/detail/ 08534.html https://pdbj.org/mom/144 サイエンス・コミュニケーション演習 http://www.jst.go.jp/pr/announce/20170901/ http://www.ecosci.jp/n-cafe/yokoku100.html リアルとバーチャル ※“手法”と“場”
  31. 31. ◆生命を支えるエネルギーと元素 http://www.ecosci.jp/s/bm_m_ps.html http://www.ecosci.jp/s/bm_m_SF4.html ●「見てわかる構造生命科学」(化学同人) フルカラー図版・アニメーション動画 http://www.kagakudojin.co.jp/appen dices/c20092/ 生命活動に必要なエネルギーの確保:Mn4CaO5クラスター “歪んだ椅子”とFe-Sクラスター - 水(親水性)と油(疎水性) で考える サイエンス・コミュニケーション演習
  32. 32. ◆生命を支えるエネルギーと元素 http://www.ecosci.jp/s/bm_m_ps.html http://www.ecosci.jp/s/bm_m_SF4.html ●「見てわかる構造生命科学」(化学同人) フルカラー図版・アニメーション動画 http://www.kagakudojin.co.jp/appen dices/c20092/ 生命活動に必要なエネルギーの確保:Mn4CaO5クラスター “歪んだ椅子”とFe-Sクラスター - 水(親水性)と油(疎水性) で考える http://www.aist.go.jp/aist_j/press_release/ pr2017/pr20170425/pr20170425.html http://www.jamstec.go.jp/j/about/press_ release/20170428/ 長沼 毅「生命の始まりを探して 僕は 生物学者になった」p.73に“硫化鉄 が黄鉄鉱になる過程で出てくる化学 エネルギーを使って…” https://www.amazon.co.jp/dp /4309617018 サイエンス・コミュニケーション演習
  33. 33. ◆生命を支えるエネルギーと元素 #深海 #物化生地 http://www.ecosci.jp/s/bm_m_ps.html http://www.ecosci.jp/s/bm_m_SF4.html ●「見てわかる構造生命科学」(化学同人) フルカラー図版・アニメーション動画 http://www.kagakudojin.co.jp/appen dices/c20092/ 生命活動に必要なエネルギーの確保:Mn4CaO5クラスター “歪んだ椅子”とFe-Sクラスター - 水(親水性)と油(疎水性) で考える http://www.aist.go.jp/aist_j/press_release/ pr2017/pr20170425/pr20170425.html http://www.jamstec.go.jp/j/about/press_ release/20170428/ 長沼 毅「生命の始まりを探して 僕は 生物学者になった」p.73に“硫化鉄 が黄鉄鉱になる過程で出てくる化学 エネルギーを使って…” https://www.amazon.co.jp/dp /4309617018 http://www.spring8.or.jp/ja/news_ publications/press_release/2017/ 170715/ http://www.jamstec.go.jp/j/about/ press_release/20170428/ http://shinkai2017.jp/ サイエンス・コミュニケーション演習
  34. 34. ◆生命を支えるエネルギーと元素 #カガク #哲学 #生命 & 統合学 http://www.ecosci.jp/chem13/ topics16a.html#03 ●池田善昭・福岡伸一,「福岡伸一、西田哲学を読む 生命をめぐる思索の旅 動的平衡と絶対矛盾的自己同 一」,明石書店(2017) http://www.akashi.co.jp/book/b297749.html 動的平衡論 内と外 あいだ 先回り ピュシス https://www.chart.co.jp/goods/item/rika/24713.php サイエンス・コミュニケーション演習 http://logmi.jp/231876
  35. 35. http://www.ecosci.jp/s/bm_m_ps2.html 光合成光化学系IIに関与する巨大なタ ンパク質の中にある光化学反応中心の Mn4CaO5クラスターを含む1つのタン パク質だけを作成したもの。同クラス ターの“歪んだ椅子”型構造が解明され たことが米サイエンス誌の2011年10 大ニュースに選ばれ,関連人工光合成 研究が多数進められている。膜貫通タ ンパク質であり,膜通過部分の大部分 が緑色の疎水性アミノ酸であることも視 覚的に理解できる。 光化学系II 光化学系I ◆生命を支えるエネルギーと元素 画期的分子模型: 光合成に関係するPDB 3ARCのA鎖 サイエンス・コミュニケーション演習
  36. 36. http://www.hayakawa- online.co.jp/shop/shopdetail.html? brandcode=000000007817 http://www.ecosci.jp/topic/eye_j.html サイエンス・コミュニケーション演習 ※2012年ノーベル化学賞はGPCR http://www.ecosci.jp/GPCR/ http://www.ecosci.jp/moldic/ ◆生体分子の使い回し例 GPCR #視覚
  37. 37. ◆生体分子の使い回し例 GPCR http://www.hayakawa- online.co.jp/shop/shopdetail.html? brandcode=000000007817 http://www.ecosci.jp/topic/eye_j.html サイエンス・コミュニケーション演習 ※2012年ノーベル化学賞はGPCR http://www.ecosci.jp/GPCR/ http://www.ecosci.jp/moldic/ http://www.ecosci.jp/chem13/topics15e.html#05 その他多彩なGPCR(各種受容体など) http://gpcr.scripps.edu/
  38. 38. ◆分子と環境問題 “アントロポシーン” #生物 #環境 #国際 http://www.gizmodo.jp/2017/01/weight- of-humanitys-footprint.html 環境問題はp.314ほか多数 http://www.natureasia.com/ja- jp/research/highlight/10450/ http://www.ecosci.jp/chem13/ topics13e.html#10 有機水銀分解酵素(アルキル水銀リアーゼ, EC.4.99.1.2)MerB構造例PDB 3F0P http://www.ecosci.jp/chem11/pcb_deg.html https://www.chart.co.jp/goods/item/ rika/23303.php サイエンス・コミュニケーション演習
  39. 39. 画期的分子模型; Oct1/Sox2/DNA複合体 PDB 1GT0 http://www.ecosci.jp/pdb/iPS_1gt0.html DNAを含むデータとして選んだのが,iPS細胞の山中4 因子(Oct3/4・Sox2・Klf4・c-Myc)関連として, Sox2およびOct4類似のOct1タンパク質がDNAに結 合した構造である。なおOct4は2014年7月に Nature論文が撤回されたSTAP細胞研究でも登場す る。今回の発注ではDNAについてもタンパク同様,シリ コーン樹脂に球棒モデルで石膏構造を内包するよう特 注し,初の試みとして実現していただけた。これにより塩 基対などDNAの2重らせん構造を目の当たりにすること ができた。 ◆脳の発達を戦略としたヒト/人間の誕生 - DNA,iPS,ゲノム編集, Nh, … http://www.ecosci.jp/ CRISPR/ http://blog.miraikan.jst.go.jp/ event/20160824part-1.html サイエンス・コミュニケーション演習
  40. 40. サイエンス・コミュニケーション演習 科学コミュニケーションは狭い業界 ネットワーク 機能するのは1/20 ? …個人活動の場合 リアルとバーチャル ※“手法”と“場” 裏方と表方(演じ手) 書き手と描き手 ※テキストと画像/動画 彼我の差 今後はエコサイと読んでいただければ… Ugokimawaru Enryoshinai Communication

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