2. • Ang pamahalaang kolonyal ay itinatag sa pamamagitan ng
pagtutulungan ng Kaharian at Simbahan, sa doktrinang patronato
real.
• Magkahati ang kapangyarihan sa pamamahala sa Pilipinas sa
pagitan ng mga opisyal ng pamahalaang kolonyal at mga pinuno ng
Simbahan.
• Maaaring makialam ang mga opisyal ng pamahalaan sa mga
usaping panrelihiyon tulad ng pagtatalaga ng mga pari sa mga
parokya at pag-eendorso sa Santo Papa ng mga manunungkulang
pinuno ng Simbahan.
• Nagsilbi ang mga pari sa pamahalaang lokal bilang tagatala ng
sensus ng populasyon, opisyal pangkalusugan, tagasuri ng mga
paaralan, at iba pa.
• Pangunahing tungkulin pa rin ng mga pari at opisyal ng Simbahan
ang pagpapalaganap ng Kristiyanismo at pagpapahalaga sa mga
pangangailangan ng mga katutubo.