Recommended
More Related Content
Viewers also liked
Viewers also liked (20)
More from BioinformaticsInstitute
More from BioinformaticsInstitute (20)
Bioinformatics 2012-01
- 1. Bioinformatics 101 NikolayVyahhi vyahhi@bioinf.spbau.ru Algorithmic Biology Lab суббота, 15 сентября 12 г.
- 2. Bioinformatics • Bio + Informatics • Application of computer technology to the management and analysis of biological data. • The result is that computers are being used to gather, store, analyse and merge biological data. • Also known as Computational Molecular Biology System Biology суббота, 15 сентября 12 г.
- 3. Today • Molecular Biology: DNA, RNA, Proteins • Genomics and Sequencing • Proteomics суббота, 15 сентября 12 г.
- 4. Molecular Biology • DNA • RNA • Proteins суббота, 15 сентября 12 г.
- 5. DNA • Recipe Book • Double Helix • Nucleotide (base): • A — T • C — G суббота, 15 сентября 12 г.
- 6. DNA Replication • Replication: DNA → 2 * DNA суббота, 15 сентября 12 г.
- 7. RNA • Recipe Sheet • Carries Information from DNA • Letters:A, C, G, U суббота, 15 сентября 12 г.
- 8. Transcription • Transcription DNA → RNA суббота, 15 сентября 12 г.
- 9. Types of RNA • mRNA (genes) • non-coding RNA: • miRNA / siRNA • tRNA суббота, 15 сентября 12 г.
- 10. Proteins • Dish • Functions: • Structure • Catalyze (Enzyme) • Signalling • Transport суббота, 15 сентября 12 г.
- 11. Translation • Amino Acids 20 letters — ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY • Translation RNA → Protein 3bp (codon) → 1aa суббота, 15 сентября 12 г.
- 12. Protein Structures • Primary (aa sequence) • Secondary (sheet, helix) • Tertiary (3D) • Quaternary (complex) суббота, 15 сентября 12 г.
- 13. Central Dogma суббота, 15 сентября 12 г.
- 14. Definitions • Genome — entire organism's DNA • Transcriptome — entire organism's RNA • Proteome — entire organism's proteins • суббота, 15 сентября 12 г.
- 15. Genomics суббота, 15 сентября 12 г.
- 17. Meaning суббота, 15 сентября 12 г.
- 18. Genomics суббота, 15 сентября 12 г.
- 19. Mammalian Genomes суббота, 15 сентября 12 г.
- 20. Genomics суббота, 15 сентября 12 г.
- 21. Genome Sequencing суббота, 15 сентября 12 г.
- 22. Genomics • 1000genomes.org (done) • genome10k.org (mammalian) • Sequencing in 2011: • SNPs 1M ($99, 23andme.com) • Exome 50M ($999, 23andme.com) • Full Genome: 3G ($5000, Illumina) суббота, 15 сентября 12 г.
- 23. Genome Assembly • Genome assembly in silico: • de novo (Bacteria etc.) • by reference (Human etc.) суббота, 15 сентября 12 г.
- 24. Proteomics суббота, 15 сентября 12 г.
- 25. 2D & 3D Structures суббота, 15 сентября 12 г.
- 26. Mass Spectrometry суббота, 15 сентября 12 г.
- 27. Networks / Pathways суббота, 15 сентября 12 г.
- 28. Databases • Sequences DNA, RNA, Proteins • Ontologies • Tools (BLAST) • Major DB: NCBI / EBI суббота, 15 сентября 12 г.
- 29. Evolution суббота, 15 сентября 12 г.
- 30. Today • Molecular Biology: DNA, RNA, Proteins • Genomics and Sequencing • Proteomics суббота, 15 сентября 12 г.