SlideShare a Scribd company logo
1 of 45
‫ندگی‬‫ز‬ ‫ا‬‫ر‬ ‫ـــا‬‫م‬ ‫نکه‬‫آ‬ ‫انم‬ ‫به‬‫داد‬
‫د‬ ‫ندگی‬‫ی‬‫پا‬ ‫مژده‬ ‫پس‬ ‫وزان‬‫اد‬
1
2
3
‫بعدی‬ ‫نسل‬ ‫روشهای‬ ‫انواع‬
‫یابی‬ ‫توالی‬DNA
4
5
‫درس‬:‫مولکولی‬ ‫نشانگرهای‬
‫استاد‬:‫رحیمی‬ ‫دکتر‬ ‫جناب‬
‫دهنده‬ ‫ارائه‬:‫یوسفی‬ ‫بابک‬
‫ماه‬ ‫دی‬1394
‫یابی‬ ‫توالی‬(DNA sequencing) DNA‫زمان‬ ‫از‬ ‫را‬ ‫درازی‬ ‫راه‬
‫دهه‬ ‫در‬ ‫دوبعدی‬ ‫کروماتوگرافی‬1970‫است‬ ‫کرده‬ ‫طی‬ ‫تاکنون‬.
‫ی‬ ‫ه‬ ‫ا‬‫ا‬‫وس‬ ‫اه‬‫ا‬‫ب‬ ‫اابی‬‫ا‬‫ی‬ ‫اوالی‬‫ا‬‫ت‬ ‫روا‬ ‫دو‬ ‫اور‬‫ا‬‫وه‬ ‫اا‬‫ا‬‫ب‬Sanger‫و‬ ‫ااران‬‫ا‬‫همک‬ ‫و‬
MaxamGilbert &‫اا‬‫ا‬‫س‬ ‫در‬1977‫ات‬‫ا‬‫زیس‬ ‫اا‬‫ا‬‫ب‬ ‫ارتا‬‫ا‬‫م‬ ‫اوم‬‫ا‬ ‫ع‬ ،
‫شدند‬ ‫ادینی‬ ‫بن‬ ‫و‬ ‫بزرگ‬ ‫تحوالت‬ ‫دچار‬ ‫شناسی‬.
‫روا‬ ،‫گرف،اه‬ ‫شاکل‬ ‫روا‬ ‫دو‬ ‫اان‬ ‫م‬ ‫از‬Sanger‫در‬ ‫ساهولت‬ ‫ات‬ ‫ع‬ ‫باه‬
‫ااات‬‫ا‬‫الع‬ ‫م‬ ‫در‬ ‫ااره‬‫ا‬‫روزم‬ ‫و‬ ‫ااه‬‫ا‬‫م‬ ‫ع‬ ‫ااورد‬‫ا‬‫م‬ ‫روا‬ ‫ااال‬‫ا‬‫ی‬ ‫ااوان‬‫ا‬‫عن‬ ‫ااه‬‫ا‬‫ب‬ ،‫ااام‬‫ا‬‫انج‬
‫اد‬‫ا‬‫گردی‬ ‫ادیل‬‫ا‬‫تا‬ ‫اولی‬‫ا‬‫مولک‬.‫ی‬ ‫ه‬ ‫ارو‬‫ا‬ ،‫روا‬ ‫اژ‬‫ا‬‫ای‬ ‫اش‬‫ا‬ ‫ل‬ ‫اه‬‫ا‬‫ب‬ ‫اه‬‫ا‬‫اینک‬ ‫اا‬‫ا‬‫ت‬‫اوم‬‫ا‬‫ن‬
‫سا‬ ‫در‬ ‫که‬ ‫انسان‬1990‫ساا‬ ‫در‬ ‫ر‬ ‫باود‬ ‫شاده‬ ‫شاروع‬2003‫باا‬ ‫دی‬ ‫ما‬
‫د‬ ‫رس‬ ‫ایان‬ ‫به‬ ‫ت‬ ‫موفق‬.
6
‫کمپانی‬Applied Biosystems‫یاابی‬ ‫تاوالی‬ ‫دودکاار‬ ‫دسا،هاه‬ ‫ژ‬ ‫اولا‬
‫نهی‬ ‫اااااااوی‬‫ا‬‫م‬ ‫اااااااورز‬‫ا‬‫الک،روف‬ ‫روا‬ ‫اااااااا‬‫ا‬‫اس‬ ‫ااااااار‬‫ا‬‫ب‬(Capillary
Electrophoresis ) CE‫کرد‬ ‫معرفی‬ ‫را‬.AB370‫ساا‬ ‫در‬1987
‫و‬AB3730xl‫سا‬ ‫در‬1998‫طار‬ ‫در‬ ‫کاه‬ ‫بودناد‬ ‫هاایی‬ ‫دس،هاه‬ ‫ژ‬ ‫اول‬
‫گرف،ند‬ ‫مرار‬ ‫اس،فاده‬ ‫مورد‬ ‫انسان‬ ‫نوم‬ ‫ه‬ ‫رو‬.
7
،‫شارف‬ ‫هاای‬ ‫ی‬ ‫تکنولاو‬ ‫باه‬ ‫از‬ ‫ن‬ ‫و‬ ‫بشری‬ ‫دانش‬ ‫شرفت‬ ‫با‬‫از‬ ‫اسا،فاده‬ ‫ه‬
‫تاا‬ ،‫نااود‬ ‫ژ‬ ‫محققا‬ ‫رشاد‬ ‫به‬ ‫رو‬ ‫ازهای‬ ‫ن‬ ‫گوی‬ ‫جواب‬ ،‫موجود‬ ‫های‬ ‫روا‬
‫سا‬ ‫در‬ ‫اینکه‬2004‫باه‬ ‫بااال‬ ‫مجام‬ ‫باا‬ ‫زماان‬ ‫هم‬ ‫یابی‬ ‫توالی‬ ‫روا‬ ‫ژ‬ ‫اول‬
‫شد‬ ‫رونمایی‬ ‫تجاری‬ ‫صورت‬.
‫یاابی‬ ‫توالی‬ ‫روا‬ ‫از‬ ‫س‬ ‫جدید‬ ‫ی‬ ‫تکنولو‬ ‫ری‬ ‫گ‬ ‫شکل‬ ‫ت‬ ‫ع‬ ‫به‬‫ساانهر‬
،‫عناوان‬ ‫با‬ ‫ی‬ ‫تکنولو‬ ‫ایژ‬Next Generarion Sequencing
(NGS)‫اد‬‫ا‬‫گردی‬ ‫ای‬‫ا‬‫معرف‬.‫از‬ ‫ش‬ ‫ا‬‫ا‬‫ب‬ ‫ات‬‫ا‬‫گبش‬ ‫از‬ ‫اس‬‫ا‬ ‫اون‬‫ا‬‫اکن‬10‫از‬ ‫اا‬‫ا‬‫س‬
‫کاربردهای‬ ‫ژ‬ ‫اول‬NGS‫تاا‬ ‫ی‬ ‫دهناده‬ ‫نشان‬ ‫ر‬ ‫اد‬ ‫می‬ ‫ع‬ ‫های‬ ‫یاف،ه‬ ،‫ر‬
‫باشد‬ ‫می‬ ‫ال‬ ،‫ن‬ ‫م‬ ‫ع‬ ‫بر‬ ‫ی‬ ‫تکنولو‬ ‫ایژ‬ ‫ق‬ ‫عم‬.
8
‫ت‬ ‫یاا‬ ‫ناوم‬ ‫کال‬ ‫تاوالی‬ ‫تاوان‬ ‫مای‬ ‫ی‬ ‫تکنولاو‬ ‫ایاژ‬ ‫ی‬ ‫ه‬ ‫وسا‬ ‫به‬ ‫امروزه‬‫نهاا‬
‫ممکا‬ ‫زماان‬ ‫کم،ریژ‬ ‫در‬ ‫و‬ ‫باال‬ ‫ار‬ ‫بس‬ ‫دمت‬ ‫با‬ ‫را‬ ‫آن‬ ‫از‬ ‫محدودی‬ ‫مسمت‬‫ژ‬
‫داد‬ ‫مرار‬ ‫آزمایش‬ ‫و‬ ‫بررسی‬ ‫مورد‬ ‫مناسب‬ ‫ار‬ ‫بس‬ ‫ای‬ ‫هزینه‬ ‫با‬ ‫و‬.
‫اااات‬‫ا‬‫الع‬ ‫م‬ ، ‫ی‬ ‫اااو‬‫ا‬‫تکنول‬ ‫اااسژ‬‫ا‬‫ایسس‬ ‫از‬ ‫ااا،فاده‬‫ا‬‫اس‬ ‫اااسا‬‫ا‬‫ب‬DNA‫ااا،انی‬‫ا‬‫باس‬ ‫ی‬
(ancient DNA)‫است‬ ‫داش،ه‬ ‫دوبی‬ ‫های‬ ‫فت‬ ‫شر‬.
9
‫اااده‬‫ا‬‫ش‬ ‫اااناد،ه‬‫ا‬‫ش‬ ‫اااا‬‫ا‬‫ه‬ ‫اااوم‬‫ا‬‫ن‬ ‫ااادد‬‫ا‬‫مج‬ ‫اااابب‬‫ا‬‫ی‬ ‫اااوالب‬‫ا‬‫ت‬Resequencing))
‫رایج‬ ‫كاربسسسسسردها‬ ‫از‬ ‫یكب‬ ‫آن‬ ‫از‬ ‫بخشی‬ ‫یا‬ ‫نوم‬ ‫كل‬NGS‫كاه‬ ‫اسات‬
‫اسایب‬‫ا‬‫شنسسساسسس‬ ‫ارا‬‫ا‬‫ب‬SNP، ‫اا‬‫ا‬‫ه‬((Insertion / deletion‫اداد‬‫ا‬‫تع‬ ،
‫است‬ ‫اس،فاده‬ ‫مابل‬ ‫ساد،ار‬ ‫رات‬ ‫تغ‬ ‫و‬ ‫نب‬ ‫ها‬ ‫نسخه‬.
‫اا‬‫ا‬‫س‬ ‫در‬ ‫اوم‬‫ا‬‫ن‬ ‫ادد‬‫ا‬‫مج‬ ‫اابب‬‫ا‬‫ی‬ ‫اوالب‬‫ا‬‫ت‬ ‫ه‬ ‫ارو‬‫ا‬ ‫ژ‬ ‫ا‬‫ا‬‫اول‬2005‫ار‬‫ا‬‫ب‬ ‫و‬
‫تكنولاو‬ ‫از‬ ‫اسا،فاده‬ ‫باا‬ ‫واتسون‬ ‫دك،ر‬ ‫دون‬ ‫نمونه‬ ‫رو‬454
‫است‬ ‫گرف،ه‬ ‫انجام‬.
10
‫زماان‬ ‫در‬ ‫كاه‬ ‫اناد‬ ‫شاده‬ ‫ابداع‬ ‫جدید‬ ‫ها‬ ‫ا‬ ‫رو‬ ،‫ها‬ ‫هزینه‬ ‫كاهش‬ ‫برا‬
‫كنناد‬ ‫ماب‬ ‫توالب‬ ‫ژ‬ ‫تع‬ ‫را‬ ‫ها‬ ‫نمونه‬ ‫از‬ ‫بزرگب‬ ‫طو‬ ،‫تر‬ ‫كوتاه‬.‫با‬‫طاور‬ ‫ه‬
‫عاات‬ ‫م‬ ‫یابب‬ ‫توالب‬ ‫ب‬ ‫ك‬DNA‫تاوالب‬ ‫جدیاد‬ ‫هاا‬ ‫اا‬ ‫تكن‬ ‫از‬ ‫اسا،فاده‬ ‫باا‬
‫ا‬‫ا‬‫همس‬ ‫ال‬‫ا‬‫مرام‬ ‫اه‬‫ا‬‫ب‬ ‫ااز‬‫ا‬ ‫ن‬ ‫انهر‬‫ا‬‫س‬ ‫روا‬ ‫اا‬‫ا‬‫ب‬ ‫اابب‬‫ا‬‫ی‬ ‫اوالب‬‫ا‬‫ت‬ ‫ا‬ ‫ارد‬‫ا‬‫ب‬ ،‫اابب‬‫ا‬‫ی‬‫انه‬
‫كااه‬ ‫شادت‬ ‫باه‬ ‫را‬ ‫یاابب‬ ‫تاوالب‬ ‫هزینه‬ ‫و‬ ‫زمان‬ ‫ه‬ ‫مسئ‬ ‫ایژ‬ ،‫ندارد‬ ‫ساز‬‫ش‬
‫است‬ ‫داده‬.
‫م‬ ‫چندیژ‬ ‫د‬ ‫تول‬ ،‫یابب‬ ‫توالب‬ ‫نوع‬ ‫ایژ‬ ‫دیهر‬ ‫توجه‬ ‫مابل‬ ‫مزیت‬‫تاوالب‬ ‫اون‬
،‫اسا‬ ‫مورد‬ ‫س،م‬ ‫س‬ ‫نوع‬ ‫و‬ ‫نظر‬ ‫مورد‬ ‫هدا‬ ‫به‬ ‫بس،ه‬ ‫م،وس‬ ‫طو‬ ‫به‬، ‫فاده‬
‫باشاد‬ ‫ماب‬ ‫بااال‬ ‫صحت‬ ‫و‬ ‫دمت‬ ‫با‬ ‫روز‬ ‫چند‬ ‫یا‬ ‫ساعت‬ ‫چند‬ ‫طب‬ ‫در‬ ‫تنها‬‫کاه‬
‫باشد‬ ‫می‬ ‫ع‬ ‫وس‬ ‫ا‬ ‫مق‬ ‫در‬ ‫یابب‬ ‫توالب‬ ‫ژ‬ ‫ما‬.
11
‫ااو‬‫ا‬‫تكنول‬ ‫ااژ‬‫ا‬‫ای‬ ‫ااا‬‫ا‬‫ت‬ ‫ااد‬‫ا‬‫ش‬ ‫اااب‬‫ا‬‫س‬ ، ‫آن‬ ‫ااازی‬‫ا‬‫س‬ ‫اااری‬‫ا‬‫وتج‬ ‫ااا‬‫ا‬‫ه‬ ‫ااب‬‫ا‬‫گ‬ ‫وی‬ ‫ااژ‬‫ا‬‫ای‬
‫ب‬ ‫هاا‬ ‫آزمایشاهاه‬ ‫اب‬ ‫ا‬ ‫و‬ ‫شاده‬ ‫ساانهر‬ ‫یاابب‬ ‫توالب‬ ‫روا‬ ‫جایهزیژ‬‫،وانناد‬
‫ااره‬‫ا‬‫به‬ ‫آن‬ ‫از‬ ‫اازرگ‬‫ا‬‫ب‬ ‫ااومب‬‫ا‬‫ن‬ ‫ااابب‬‫ا‬‫ی‬ ‫ااوالب‬‫ا‬‫ت‬ ‫ااز‬‫ا‬‫مراك‬ ‫از‬ ‫اا،قل‬‫ا‬‫مس‬ ‫ااور‬‫ا‬‫ط‬ ‫ااه‬‫ا‬‫ب‬
‫كنند‬ ‫بردار‬.
‫ا‬ ‫تكن‬ ‫ارزشمند‬ ‫مزایا‬ ‫كنار‬ ‫در‬ ‫كه‬ ‫است‬ ‫ذكر‬ ‫به‬ ‫الزم‬�NGS،‫ز‬ ‫آنال‬
‫ایااژ‬ ‫در‬ ‫چااالش‬ ‫بزرگ،ااریژ‬ ، ‫یااابب‬ ‫تااوالب‬ ‫ز‬ ‫ا‬ ‫ماصاال‬ ‫م‬ ‫عظاا‬ ‫هااا‬ ‫داده‬
‫افزار‬ ‫ناارم‬ ،‫شاارف،ه‬ ‫وترهااا‬ ‫كامپ‬ ‫ازمنااد‬ ‫ن‬ ‫كااه‬ ‫باشااد‬ ‫مااب‬ ‫نااه‬ ‫زم‬‫هااا‬
‫است‬ ‫كافب‬ ‫تخصص‬ ‫و‬ ‫دانش‬ ‫ژ‬ ‫همچن‬ ‫و‬ ‫ها‬ ‫داده‬ ‫ز‬ ‫آنال‬ ‫برا‬ ‫داص‬.
‫افزارهاای‬ ‫نارم‬ ،‫فاون‬ ‫ماوارد‬ ‫رفاع‬ ‫به‬ ‫از‬ ‫ن‬ ‫امسا‬ ‫با‬ ‫و‬ ‫ماضر‬ ‫ما‬ ‫در‬
‫ر‬ ‫تفس‬ ‫و‬ ‫ل‬ ‫تح‬ ‫و‬ ‫تجزیه‬ ‫تخصصی‬NGS‫است‬ ‫شده‬ ‫طرامی‬.
12
‫چ‬ ،‫اال‬ ،‫ن‬ ‫ی‬ ‫ناه‬ ‫زم‬ ‫در‬ ‫بازرگ‬ ‫شرفت‬ ‫ایژ‬ ‫با‬ ‫ه‬ ‫راب‬ ‫در‬ ‫امروزه‬‫نادیژ‬
‫ااوت‬‫ا‬‫م،ف‬ ‫ااری‬‫ا‬‫تج‬ ‫روا‬NGS‫ای‬‫ا‬‫ک‬ ،‫ن‬ ‫اات‬‫ا‬‫ع‬ ‫اط‬ ‫اه‬‫ا‬‫ب‬ ‫اابی‬‫ا‬‫ی‬ ‫ات‬‫ا‬‫دس‬ ‫ات‬‫ا‬‫جه‬
‫ار‬ ‫گ‬ ‫مای‬ ‫مرار‬ ‫اس،فاده‬ ‫مورد‬ ‫ش‬ ،‫مخ‬ ‫ها‬ ‫شركت‬ ‫توس‬ ،‫ش،ر‬ ‫ب‬‫در‬ ‫کاه‬ ‫د‬
‫ردازیم‬ ‫می‬ ‫آنها‬ ‫شر‬ ‫به‬ ‫ذیل‬:
13
‫سااا‬ ‫در‬ ‫تجاااری‬ ‫ااور‬ ‫ب‬ ‫کااه‬ ‫مااورد‬ ‫ژ‬ ‫اولاا‬2004‫دساا،هاه‬ ،‫شااد‬ ‫معرفاای‬
Roche/454FLX Pyrosequencer‫بود‬.
‫ااااااااای‬‫ا‬‫مرارت‬ ‫اااااااااوالب‬‫ا‬‫ت‬ ‫ژ‬ ‫ااااااااا‬‫ا‬ ‫تع‬ ‫روا‬ ‫از‬ ‫ااااااااا،هاه‬‫ا‬‫دس‬ ‫اااااااااژ‬‫ا‬‫ای‬
(Pyrosequencing)‫اركت‬‫ا‬‫ش‬ ‫ا‬‫ا‬‫توس‬ ‫اه‬‫ا‬‫ک‬ ،‫ارد‬‫ا‬‫ک‬ ‫ای‬‫ا‬‫م‬ ‫ا،فاده‬‫ا‬‫اس‬Life
Sciences‫شاااركت‬ ‫توسااا‬ ‫هاااا‬ ‫بعاااد‬ ‫روا‬ ‫ایاااژ‬ ‫و‬ ‫شااانهاد‬ ‫امریکاااا‬
Roche‫شد‬ ‫دریدار‬ ‫س‬ ‫سوی‬.
‫ااا‬‫ا‬‫ب‬ ‫ااراه‬‫ا‬‫هم‬ ‫اای‬‫ا‬‫رونق‬ ‫اات‬‫ا‬‫اس‬ ‫اار‬‫ا‬‫ذک‬ ‫اال‬‫ا‬‫ماب‬‫ااایرن‬‫ا‬‫ن‬ ‫ااا‬‫ا‬‫روا‬ ‫اارع‬‫ا‬،‫مخ‬‫اارو‬‫ا‬
‫ن‬ ‫سکونسااا‬‫یاااابی‬‫توالی‬ ‫بااارای‬DNA‫اسااات‬.‫ارشاااد‬ ‫معااااون‬ ‫رونقااای‬
‫شرکت‬‫ایلومینا‬‫دارد‬ ‫م،عددی‬ ‫مقاالت‬ ‫و‬ ‫اد،راعات‬ ‫و‬ ‫بوده‬.
14
‫عاااات‬ ‫م‬ ‫روا‬ ‫ایاااژ‬ ‫در‬DNA‫محااا‬ ‫یاااا‬ ‫در‬ ‫آب‬ ‫ااارات‬ ‫م‬ ‫دادااال‬ ‫در‬
‫ناب‬ ‫رو‬(‫ون‬ ‫امولسا‬PCR)‫اود‬‫ا‬‫ش‬ ‫ماب‬ ‫ار‬‫ا‬ ‫تكث‬.‫ار‬‫ا‬ ‫م‬ ‫ایاژ‬ ‫از‬ ‫ادام‬‫ا‬‫ك‬ ‫هار‬ ‫در‬
‫او‬‫ا‬‫اله‬ ‫اا‬‫ا‬‫ی‬ ‫آب‬ ‫ات‬DNA‫اب‬‫ا‬‫م‬ ‫ال‬‫ا‬‫م،ص‬ ‫اازگر‬‫ا‬ ‫آ‬ ‫اا‬‫ا‬‫ی‬ ‫اه‬‫ا‬‫ب‬ ‫اه‬‫ا‬‫ك‬ ‫دارد‬ ‫ارار‬‫ا‬‫م‬
‫شا‬ ‫ماب‬ ‫ایجااد‬ ‫فشارده‬ ‫اونب‬ ‫ك‬ ‫یاا‬ ‫آن‬ ‫ار‬ ‫تكث‬ ‫ار‬ ‫ا‬ ‫بار‬ ‫نهایات‬ ‫در‬ ‫و‬ ‫شود‬‫ود‬.
‫كاول‬ ‫ماد‬ ‫در‬ ‫مجام‬ ‫با‬ ‫چاها‬ ‫زیاد‬ ‫تعداد‬ ‫ماو‬ ‫دوان‬ ‫توالب‬ ‫دس،هاه‬‫،ر‬
‫مخصاوص‬ ‫آنازیم‬ ‫و‬ ‫داناه‬ ‫یاا‬ ‫مااو‬ ‫هاا‬ ‫چاهاا‬ ‫ایژ‬ ‫از‬ ‫كدام‬ ‫هر‬ ‫كه‬ ‫است‬
‫اسات‬ ‫تاوالب‬ ‫ژ‬ ‫ا‬ ‫تع‬.‫فراز‬ ‫لوسا‬ ‫آنازیم‬ ‫از‬ ، ‫سا،م‬ ‫س‬ ‫ایاژ‬(Luciferase
Enzyme)‫اد‬ ‫ئوت‬ ‫نوك‬ ‫هار‬ ‫ص‬ ‫تشخ‬ ‫برا‬ ‫كند‬ ‫مب‬ ‫نور‬ ‫د‬ ‫تول‬ ‫كه‬‫باه‬ ‫كاه‬
‫رش،ه‬DNA‫كند‬ ‫مب‬ ‫اس،فاده‬ ‫شود‬ ‫مب‬ ‫افزوده‬ ‫شده‬ ‫ل‬ ‫تشك‬ ‫تازه‬.
‫ی‬ ‫تکنولو‬ ‫شرفت‬ ‫با‬Roche‫هاای‬ ‫مولکاو‬ ‫تاوان‬ ‫مای‬DNA‫او‬ ‫ب‬
‫تا‬1000‫کرد‬ ‫یابی‬ ‫توالی‬ ‫را‬ ‫باز‬ ‫جفت‬.
15
16
‫نمونه‬ ‫سازي‬ ‫آماده‬ ‫مراحل‬DNA((A‫تكثیر‬ ،(B )‫تكنولوژي‬ ‫با‬ ‫توالي‬ ‫تعیین‬ ‫و‬(C) 454
17
Roche GS-Junior
18
Roche GS-FLX
19
The Roche-454 GS-FLX Pyrosequencer
‫كمپانب‬Solexa‫ساا‬ ‫در‬ ‫كه‬٢٠٠٦‫دسا،هاه‬Genome Analyzer
‫اا‬‫ا‬‫س‬ ‫در‬ ‫ارد‬‫ا‬‫ك‬ ‫اه‬‫ا‬‫ارار‬ ‫اازار‬‫ا‬‫ب‬ ‫اه‬‫ا‬‫ب‬ ‫را‬٢٠٠٧‫اانب‬‫ا‬‫كمپ‬ ‫ا‬‫ا‬‫توس‬Illumina
‫اام‬‫ا‬‫ن‬ ‫اا‬‫ا‬‫ب‬ ‫بعاد‬ ‫اه‬‫ا‬‫ب‬ ‫اان‬‫ا‬‫زم‬ ‫آن‬ ‫از‬ ‫و‬ ‫اد‬‫ا‬‫ش‬ ‫دریادار‬Illumina / Solexa
‫شود‬ ‫مب‬ ‫شناد،ه‬.
‫سا‬ ‫اوایل‬ ‫در‬2010Illumina،‫سا،م‬ ‫س‬Hiseq‫اراراه‬ ‫باازار‬ ‫باه‬ ‫را‬
‫م‬ ‫اس،فاده‬ ‫توالب‬ ‫ژ‬ ‫تع‬ ‫برا‬ ‫البکر‬ ‫فون‬ ‫اس،رات‬ ‫از‬ ‫كه‬ ‫كرد‬‫كند‬ ‫ب‬.‫اماا‬
‫است‬ ‫ش،ر‬ ‫ب‬ ‫ار‬ ‫بس‬ ‫ب‬ ‫ما‬ ‫نسخه‬ ‫با‬ ‫مقایسه‬ ‫در‬ ‫آن‬ ‫دروجب‬.
20
‫ب‬ ‫ولاب‬ ‫دهناده‬ ‫ایاان‬ ‫هاا‬ ‫رن‬ ‫ت‬ ‫داص‬ ‫از‬ ‫اس،فاده‬ ‫با‬ ‫توالب‬ ‫ژ‬ ‫تع‬ ‫روا‬ ‫ایژ‬‫رگشات‬
‫ابیر‬(Reversible Dye-Terminators)‫اسات‬ ‫شاده‬ ‫طراماب‬.‫عاات‬ ‫م‬ ‫اب،ادا‬
‫مولكو‬ ‫شده‬ ‫شكس،ه‬DNA‫تكث‬ ‫ساپس‬ ‫و‬ ‫وصال‬ ‫ید‬ ‫اسا‬ ‫به‬ ‫م،صل‬ ‫ازگرها‬ ‫آ‬ ‫به‬‫ار‬
‫اود‬‫ا‬‫ش‬ ‫اب‬‫ا‬‫م‬(Bridge Amplification)‫اد‬‫ا‬‫ده‬ ‫اب‬‫ا‬‫م‬ ‫ل‬ ‫اك‬‫ا‬‫تش‬.‫ااز‬‫ا‬‫ب‬ ‫اوع‬‫ا‬‫ن‬ ‫اار‬‫ا‬‫چه‬ ‫اپس‬‫ا‬‫س‬
‫ابیر‬ ‫برگشت‬ ‫ولب‬ ‫دهنده‬ ‫ایان‬ ‫ها‬ ‫رن‬ ‫به‬ ‫م،صل‬(RT-bases)‫ماب‬ ‫واكانش‬ ‫باه‬
‫با‬ ،‫باشد‬ ‫داش،ه‬ ‫وجود‬ ‫اتصا‬ ‫برا‬ ‫مناساب‬ ‫محل‬ ‫كه‬ ‫صورتب‬ ‫در‬ ‫باز‬ ‫هر‬ ‫و‬ ‫شود‬‫آن‬ ‫ه‬
‫وا‬ ‫محا‬ ‫از‬ ‫و‬ ‫شاده‬ ‫شسا،ه‬ ‫آزاد‬ ‫هاا‬ ‫اد‬ ‫ئوت‬ ‫نوك‬ ‫ساپس‬ ‫و‬ ‫شود‬ ‫مب‬ ‫م،صل‬ ‫ه‬ ‫نام‬‫كانش‬
‫به‬ ‫ه‬ ‫مرم‬ ‫هر‬ ‫در‬ ‫د‬ ‫ئوت‬ ‫نوك‬ ‫یا‬ ‫تنها‬ ‫و‬ ،‫شود‬ ‫مب‬ ‫مبا‬DNA‫شاود‬ ‫ماب‬ ‫اضاافه‬.‫در‬
‫تصاوی‬ ‫ورسانت‬ ‫ف‬ ‫باا‬ ‫شاده‬ ‫نشااندار‬ ‫هاا‬ ‫اد‬ ‫ئوت‬ ‫نوك‬ ‫از‬ ‫ناب‬ ‫دورب‬ ‫لحظاه‬ ‫ایژ‬‫باردار‬ ‫ر‬
‫اد‬‫ا‬‫نمای‬ ‫اب‬‫ا‬‫م‬.‫اد‬‫ا‬‫رش‬ ‫اده‬‫ا‬‫كنن‬ ‫اش‬‫ا‬‫م،وم‬ ‫اان‬‫ا‬‫ای‬ ‫در‬DNA‫ار‬‫ا‬‫س‬ ‫از‬'3‫اا‬‫ا‬‫ه‬ ‫انش‬‫ا‬‫واك‬ ‫ا‬‫ا‬‫توس‬
‫شود‬ ‫مب‬ ‫از‬ ‫آ‬ ‫بعد‬ ‫چرده‬ ‫و‬ ‫شود‬ ‫مب‬ ‫جدا‬ ‫ایب‬ ‫م‬ ‫ش‬.
21
22
Illumina/Solexa Genome AnalyzerTM
23
Illumina S-L 1600
24
Illumina MiSeq
25
Illumina HiSeq
26
illumina_nextseq500
‫اانب‬‫ا‬‫كمپ‬SOLiD‫اا‬‫ا‬‫س‬ ‫در‬٢٠٠٦‫اق‬‫ا‬‫طری‬ ‫از‬ ‫اابب‬‫ا‬‫ی‬ ‫اوالب‬‫ا‬‫ت‬ ‫او‬‫ا‬‫تكنول‬
‫اتصا‬(Sequencing- by-ligation)‫و‬ ‫كرد‬ ‫معرفب‬ ‫بازار‬ ‫به‬ ‫را‬
‫اركت‬‫ا‬‫ش‬ ‫ا‬‫ا‬‫توس‬ ‫از‬‫ا‬ ‫ن‬ ‫اا‬‫ا‬‫س‬ ‫ژ‬ ‫ا‬‫ا‬‫هم‬ ‫در‬(Applied Biosystems -
ABI)‫شد‬ ‫دریدار‬.
‫اماره‬‫ا‬‫ش‬ ‫اای‬‫ا‬‫ه‬ ‫اال‬‫ا‬ ‫تکن‬ ‫اد‬‫ا‬‫همانن‬ ‫از‬‫ا‬ ‫ن‬ ‫روا‬ ‫اژ‬‫ا‬‫ای‬1‫و‬2‫اای‬‫ا‬‫ه‬ ‫اه‬‫ا‬‫ک،ابخان‬ ‫از‬ ،
‫گ‬ ‫می‬ ‫بهره‬ ‫یابی‬ ‫توالی‬ ‫جهت‬ ‫،ور‬ ‫آدا‬ ‫ی‬ ‫ه‬ ‫وس‬ ‫به‬ ‫گرف،ه‬ ‫شکل‬‫رد‬.
‫تاا‬ ‫دسا،هاه‬ ‫اجارا‬ ‫هر‬ ‫در‬ ‫اب،دا‬ ‫در‬Gb٣‫اماا‬ ،‫گردیاد‬ ‫ماب‬ ‫مرارات‬ ‫تاوالب‬
‫در‬٢٠٠٩‫اااوان‬‫ا‬‫عن‬ ‫ااات‬‫ا‬‫تح‬ ‫اااد‬‫ا‬،‫م‬ ‫اااژ‬‫ا‬‫ای‬ ‫از‬ ‫اااد‬‫ا‬‫جدی‬ ‫نساااخه‬ ،Plus 3
™SOLiD‫از‬ ‫ش‬ ‫با‬ ‫اجارا‬ ‫هار‬ ‫در‬ ‫است‬ ‫مادر‬ ‫كه‬ ‫شد‬ ‫معرفب‬٦٠Gb
‫كند‬ ‫مرارت‬ ‫توالب‬.
27
،‫ااوالی‬‫ا‬‫ت‬ ‫ژ‬ ‫اا‬‫ا‬ ‫تع‬ ‫از‬ ‫ش‬ ‫اا‬‫ا‬ ‫روا‬ ‫ااژ‬‫ا‬‫ای‬ ‫در‬DNA‫از‬ ‫ده‬ ‫اا‬‫ا‬‫وش‬ ‫ااا‬‫ا‬‫ه‬ ‫ااه‬‫ا‬‫دان‬ ‫اا‬‫ا‬‫توس‬
‫ناب‬ ‫رو‬ ‫هاا‬ ‫ماااب‬ ‫در‬ ‫ازگر‬ ‫آ‬Aqueous droplets within an oil
phase ))‫شود‬ ‫مب‬ ‫ر‬ ‫تكث‬(Emulsion PCR).‫هاا‬ ‫مااب‬ ‫ایژ‬ ‫از‬ ‫كدام‬ ‫هر‬
‫هاا‬ ‫مولكاو‬ ‫از‬ ‫نسخه‬ ‫یا‬ ‫ماو‬DNA‫ید‬ ‫اسا‬ ‫ي‬ ‫سا‬ ‫بار‬ ‫كاه‬ ‫اسات‬ ‫مشاابه‬
‫دارد‬ ‫مرار‬ ‫ا‬ ‫شه‬ ‫ش‬.
‫جایه‬ ‫كه‬ ‫صورتب‬ ‫در‬ ‫و‬ ‫شود‬ ‫مب‬ ‫باز‬ ‫ا‬ ‫رش،ه‬ ‫دو‬ ‫ها‬ ‫د‬ ‫ئوت‬ ‫هونوك‬ ‫ال‬‫ها‬ ‫اه‬
‫شاود‬ ‫ماب‬ ‫م،صال‬ ‫آن‬ ‫باه‬ ‫كند‬ ‫دا‬ ‫اتصا‬ ‫برا‬ ‫مشابه‬.‫اسات‬ ‫ذكار‬ ‫باه‬ ‫الزم‬‫كاه‬
‫مقا‬ ‫ال‬‫ا‬‫ماب‬ ،‫روا‬ ‫اژ‬‫ا‬‫ای‬ ‫در‬ ‫اات‬‫ا‬‫ع‬ ‫م‬ ‫او‬‫ا‬‫ط‬ ‫و‬ ‫ات‬‫ا‬ ‫ف‬ ‫ك‬ ،‫اوالب‬‫ا‬‫ت‬ ‫ژ‬ ‫ا‬‫ا‬ ‫تع‬ ‫اه‬‫ا‬‫ج‬ ،‫ن‬‫اا‬‫ا‬‫ب‬ ‫اه‬‫ا‬‫یس‬
‫است‬ ‫نا‬ ‫وم‬ ‫ای‬ ‫روا‬.
‫آنازیم‬ ‫از‬ ‫اسا،فاده‬ ‫روا‬ ‫ایژ‬ ‫بارز‬ ‫ت‬ ‫دصوص‬ligase‫هاای‬ ‫اروب‬ ‫و‬ ‫هااز‬ ‫ل‬
‫اس‬ ‫داده‬ ‫افزایش‬ ‫زیادی‬ ‫ار‬ ‫بس‬ ‫زان‬ ‫م‬ ‫به‬ ‫را‬ ‫روا‬ ‫دمت‬ ‫که‬ ‫است‬ ‫دار‬ ‫نشان‬‫ت‬.
28
29
‫توالب‬ ‫ژ‬ ‫تع‬ ‫روا‬DNA‫تكنولو‬ ‫از‬ ‫اس،فاده‬ ‫با‬ABI / SOLiD
30
5500 SOLiD™ System
‫شااید‬ ‫کاه‬ ‫ب‬ ،‫آنهاا‬ ‫ناکارآمادی‬ ‫ال‬ ‫دل‬ ‫به‬ ‫نه‬ ‫روشها‬ ‫ایژ‬ ‫کم،ر‬ ‫کاربرد‬‫شا،ر‬ ‫ب‬
‫و‬ ‫دسا،هاهها‬ ‫فاروا‬ ‫در‬ ‫مربوطاه‬ ‫های‬ ‫کمپانی‬ ‫کم،ر‬ ‫ت‬ ‫فعال‬ ‫برای‬‫داناش‬
‫باشد‬ ‫مربوطه‬.‫است‬ ‫شده‬ ‫اورده‬ ‫زیر‬ ‫در‬ ‫روشها‬ ‫ایژ‬ ‫از‬ ‫تعدادی‬:
31
‫شركت‬Pacific Bioscience‫تاوا‬ ‫و‬‫ژ‬ ‫ا‬ ‫تع‬ ‫روا‬ ‫كنناده‬ ‫اباداع‬ ‫کانادا‬‫لب‬
(Single Molecular Real Time) SMRT‫اسات‬.‫روا‬ ‫ایاژ‬‫بار‬
‫ساز‬ ‫همانند‬ ‫عب‬ ‫طا‬ ‫فرآیند‬ ‫و‬ ‫اسا‬DNA‫كاارآیب‬ ‫از‬ ‫كاه‬ ‫شاده‬ ‫طرامب‬
‫ات‬‫ا‬‫اس‬ ‫اوردار‬‫ا‬‫برد‬ ‫ااالیب‬‫ا‬‫ب‬ ‫ا،ب‬‫ا‬‫درس‬ ‫و‬.‫ااوری‬‫ا‬‫فن‬SMRT‫ان،ز‬‫ا‬‫س‬ ‫ااهده‬‫ا‬‫مش‬
DNA‫سازد‬ ‫مب‬ ‫بیر‬ ‫امكان‬ ‫وموع‬ ‫زمان‬ ‫همان‬ ‫در‬ ‫را‬.
32
‫ا‬ ‫تع‬ ‫جدیاد‬ ‫نسل‬ ‫برا‬ ‫شنهاد‬ ‫ها‬ ‫روا‬ ‫ژ‬ ‫اول‬ ‫از‬ ‫دیهر‬ ‫یكب‬‫تاوالب‬ ‫ژ‬
‫روا‬ ‫اه‬‫ا‬‫ب‬ ‫اوالب‬‫ا‬‫ت‬ ‫ژ‬ ‫ا‬‫ا‬ ‫تع‬ ،‫اا‬‫ا‬‫ه‬Polony‫در‬ ‫ااروارد‬‫ا‬‫ه‬ ‫اهاه‬‫ا‬‫دانش‬ ‫در‬ ‫اه‬‫ا‬‫ك‬ ‫اود‬‫ا‬‫ب‬
‫اا‬‫ا‬‫س‬2005‫اد‬‫ا‬‫ش‬ ‫اداع‬‫ا‬‫اب‬ ‫اوم‬‫ا‬‫ن‬ ‫ال‬‫ا‬‫كام‬ ‫اوالب‬‫ا‬‫ت‬ ‫ژ‬ ‫ا‬‫ا‬ ‫تع‬ ‫ارا‬‫ا‬‫ب‬.‫روا‬ ‫اا‬‫ا‬‫ی‬ ‫اژ‬‫ا‬‫ای‬
‫بود‬ ‫روا‬ ‫چند‬ ‫از‬ ‫اب‬ ‫ترك‬.‫شاركت‬ ‫توسا‬ ‫ور‬ ‫فنسا‬ ‫ایژ‬ABI(‫آمریكاا‬)
‫شد‬ ‫دریدار‬.
33
‫تااااوالب‬ ‫ژ‬ ‫اااا‬ ‫تع‬ ‫روا‬Massively Parallel Signature
Sequencing - MPSS‫ساا‬ ‫در‬ ‫باار‬ ‫ژ‬ ‫اولا‬ ‫بارا‬1992‫شانهاد‬
‫شد‬.‫هم‬ ‫بیرشاهرها‬ ‫انفصا‬ ‫و‬ ‫اتصا‬ ‫مانا‬ ‫بر‬ ‫روا‬ ‫ایژ‬ ‫اسا‬‫زماان‬
‫است‬ ‫د‬ ‫ئوت‬ ‫نوك‬ ‫چهار‬ ‫افزایش‬ ‫با‬.
‫تن‬ ‫و‬ ‫نشاد‬ ‫ارایاه‬ ‫باازار‬ ‫باه‬ ‫روا‬ ‫ایاژ‬ ،‫سام‬ ‫مكان‬ ‫ادگب‬ ‫چ‬ ‫دااطر‬ ‫به‬‫در‬ ‫هاا‬
‫ردادات‬ ‫دهاب‬ ‫سارویس‬ ‫باه‬ ‫روا‬ ‫ایاژ‬ ‫كنناده‬ ‫شانهاد‬ ‫آزمایشهاه‬ ‫همان‬.
‫اا‬‫ا‬‫س‬ ‫در‬2004‫اركت‬‫ا‬‫ش‬ ‫ا‬‫ا‬‫توس‬ ‫روا‬ ‫اژ‬‫ا‬‫ای‬Selectra‫اد‬‫ا‬‫ش‬ ‫اده‬‫ا‬‫دری‬.‫اه‬‫ا‬‫ک‬
‫اب‬‫ا‬‫مناس‬ ‫ااربرد‬‫ا‬‫ك‬ ‫روا‬ ‫اا‬‫ا‬‫ی‬ ‫اورت‬‫ا‬‫ص‬ ‫اه‬‫ا‬‫ب‬ ‫را‬ ‫آن‬ ،‫اردن‬‫ا‬‫ك‬ ‫اه‬‫ا‬‫ن‬ ‫به‬ ‫از‬ ‫اس‬‫ا‬
‫داد‬ ‫ارایه‬ ‫سن،ز‬ ‫با‬ ‫همزمان‬ ‫توالب‬ ‫ژ‬ ‫تع‬ ‫برا‬.
34
‫باه‬ ‫یاابب‬ ‫تاوالب‬ ‫سا،م‬ ‫س‬ ‫جدیادتریژ‬ ‫ماضار‬ ‫ماا‬ ‫در‬‫یل‬ ‫تلوالي‬ ‫سلوت‬ ‫نسلل‬‫ابي‬
“Next-Next-Generation Sequencing"‫است‬ ‫معروا‬.
‫تا‬ ‫دوم‬ ‫نسال‬ ‫هاا‬ ‫اا‬ ‫تكن‬ ‫باا‬ ‫مقایساه‬ ‫در‬ ‫تكنولو‬ ‫ایژ‬ ‫مم،از‬ ‫ها‬ ‫گب‬ ‫وی‬‫والب‬
‫یابب‬NGS))‫ار‬ ‫تكث‬ ‫باه‬ ‫ااز‬ ‫ن‬ ‫عادم‬ ،DNA‫واكانش‬ ‫باا‬PCR‫كاه‬ ‫باشاد‬ ‫ماب‬
‫است‬ ‫شده‬ ‫یابب‬ ‫توالب‬ ‫برا‬ ‫الزم‬ ‫زمان‬ ‫كاهش‬ ‫و‬ ‫دمت‬ ‫افزایش‬ ‫باعث‬.
‫سا،م‬ ‫س‬ ‫ایاژ‬ ‫توسا‬ ‫شاده‬ ‫مرارات‬ ‫ها‬ ‫توالب‬ ‫م،وس‬ ‫طو‬ ‫ژ‬ ‫همچن‬١٣٠٠bp
‫دوم‬ ‫نسال‬ ‫هاا‬ ‫دسا،هاه‬ ‫تماام‬ ‫توسا‬ ‫شاده‬ ‫دوانده‬ ‫ها‬ ‫توالب‬ ‫طو‬ ‫از‬ ‫كه‬ ‫است‬
‫است‬ ‫ش،ر‬ ‫ب‬.
35
‫اانب‬‫ا‬‫كمپ‬ ‫ا‬‫ا‬‫توس‬ ‫اار‬‫ا‬‫ب‬ ‫ژ‬ ‫ا‬‫ا‬‫اول‬Helicos Bioscience‫اام‬‫ا‬‫ن‬ ‫اا‬‫ا‬‫ب‬ ‫و‬ ‫اب‬‫ا‬‫معرف‬
‫تجااری‬The Helicos Heliscope‫تاوالب‬ ‫باه‬ ‫ماادر‬ ‫و‬ ‫شاد‬ ‫عرضاه‬
‫باشد‬ ‫مب‬ ‫منفرد‬ ‫مولكو‬ ‫یا‬ ‫یابب‬.
‫کنا‬ ‫مای‬ ‫اسا،فاده‬ ‫سان،ز‬ ‫ژ‬ ‫ما‬ ‫یابی‬ ‫توالی‬ ‫اصو‬ ‫از‬ ‫ز‬ ‫ن‬ ‫روا‬ ‫ایژ‬‫ایاژ‬ ‫باا‬ ‫د‬
‫ک،ابخانا‬ ‫ایجااد‬ ‫باه‬ ‫اازی‬ ‫ن‬ ‫یاابی‬ ‫تاوالی‬ ‫انجاام‬ ‫از‬ ‫ش‬ ‫که‬ ‫تفاوت‬‫ار‬ ‫تکث‬ ‫و‬ ‫ه‬
‫ندارد‬ ‫وجود‬ ‫الهو‬ ‫های‬ ‫رش،ه‬.
‫دوانش‬ ‫هر‬ ‫در‬ ‫تواند‬ ‫مب‬ ‫دس،هاه‬ ‫ایژ‬55‫بخواند‬ ‫را‬ ‫باز‬.
36
37
Helicos Heliscope
‫كمپاانب‬Ion Torrent‫ساا‬ ‫اوادار‬ ‫در‬٢٠١٠‫باه‬ ‫موساوم‬ ‫دسا،هاهب‬
Machine Ion Personal Genome (Ion PGM)‫رواناه‬ ‫را‬
‫یابب‬ ‫توالب‬ ‫سوم‬ ‫نسل‬ ‫ها‬ ‫دس،هاه‬ ‫از‬ ‫دیهر‬ ‫نوع‬ ‫كه‬ ‫كرد‬ ‫بازار‬‫است‬.
‫سا‬ ‫س‬ ‫ساایر‬ ‫در‬ ‫كاه‬ ‫ناور‬ ‫روا‬ ‫ا‬ ‫د‬ ‫بر‬ ‫توالب‬ ‫ژ‬ ‫تع‬ ‫روا‬ ‫ایژ‬‫هاا‬ ‫،م‬
‫ااام‬‫ا‬‫هنه‬ ‫در‬ ‫ااه‬‫ا‬‫ك‬ ‫ن‬ ‫اادرو‬‫ا‬ ‫ه‬ ‫ااا‬‫ا‬‫ه‬ ‫ااون‬‫ا‬‫ی‬ ‫ااایب‬‫ا‬‫شناس‬ ‫از‬ ،‫ااود‬‫ا‬‫ش‬ ‫ااب‬‫ا‬‫م‬ ‫اا،فاده‬‫ا‬‫اس‬
‫شاادن‬ ‫مریاازه‬DNA‫و‬ ‫نمااوده‬ ‫اساا،فاده‬ ،‫شااود‬ ‫مااب‬ ‫آزاد‬pH‫محاا‬
‫ار‬ ‫تغ‬ ‫اب‬ ‫ترت‬ ‫ایاژ‬ ‫باه‬ ،‫كناد‬ ‫ماب‬ ‫ار‬ ‫تغ‬ ‫واكانش‬pH‫كاه‬ ‫دهاد‬ ‫ماب‬ ‫نشاان‬
‫ر‬ ‫د‬ ‫یا‬ ‫است‬ ‫شده‬ ‫اضافه‬ ‫جدید‬ ‫د‬ ‫ئوت‬ ‫نوك‬.
38
39
Ion Torrent
Refrence
40
41
# Advanced sequencing technologies and their wider
impact in microbiology
Neil Hall
The Journal of Experimental Biology 209, 1518-1525
# Applications of next-generation sequencing
technologies in functional genomics
Olena Morozova, Marco A. Marra
Genomics - Volume 92, Issue 5, November 2008, Pages
255–264
42
# A tale of three next generation sequencing
Michael A Quail , Miriam Smith, Paul Coupland, Thomas
D Otto, Simon R Harris, Thomas R Connor, Anna Bertoni,
Harold P Swerdlow and Yong Gu
BMC Genomics 2012, 13:341
# Buyer’s Guide:
Next-Generation Sequencing Systems
This buyer’s resource is presented to you by Illumina Inc.
# Next-generation DNA sequencing - Jay Shendure &
Hanlee Ji, naturebiotechnology / volume 26. naumber
10. OCTOBER 2008
43
# Sequencing Methods Review
A review of publications featuring Illumina®
Technology
Pub No. 073-2014-001 Current as of 29 May 2014
# The advantages of SMRT sequencing
Richard J Roberts, Mauricio OCarneiro and Michael
C Schatz - Genome Biology 2013, 14:405
44
# 6th Next Generation Sequencing Conference
12th and 13th August 2014
Dunedin Art Gallery
The Octagon, Dunedin, New Zealand
# www.illumina.com/
# www.ngsleaders.org/
# www.thermofisher.com/
‫بابت‬ ‫حیمی‬‫ر‬‫دکتر‬‫جناب‬ ‫محترم‬‫استاد‬ ‫از‬ ‫تا‬ ‫دانم‬ ‫می‬ ‫واجب‬ ‫خود‬ ‫بر‬ ‫پایان‬ ‫در‬
‫نمایم‬ ‫دانی‬‫ر‬‫قد‬ ‫و‬ ‫تشکر‬ ، ‫ایشان‬ ‫از‬ ‫هایم‬ ‫آموخته‬.
‫ن‬ ‫انقدر‬‫ر‬‫گ‬ ‫های‬ ‫ی‬ ‫همکالس‬ ‫حوصله‬ ‫و‬ ‫صبر‬ ‫از‬ ‫دانم‬ ‫می‬ ‫واجب‬ ‫خود‬ ‫بر‬ ‫همچنین‬‫یز‬
‫باشم‬ ‫داشته‬ ‫خاص‬ ‫ی‬‫تشکر‬.
‫ماندگار‬ ‫و‬ ‫باشید‬‫ـا‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ن‬‫ـا‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫م‬
45

More Related Content

Viewers also liked (8)

Multiple regression presentation
Multiple regression presentationMultiple regression presentation
Multiple regression presentation
 
POLYMERASE CHAIN REACTION
POLYMERASE CHAIN REACTIONPOLYMERASE CHAIN REACTION
POLYMERASE CHAIN REACTION
 
PCR
PCRPCR
PCR
 
Principle of PCR
Principle of PCR Principle of PCR
Principle of PCR
 
Vectors
Vectors Vectors
Vectors
 
Polymerase chain reaction
Polymerase chain reactionPolymerase chain reaction
Polymerase chain reaction
 
A Guide to SlideShare Analytics - Excerpts from Hubspot's Step by Step Guide ...
A Guide to SlideShare Analytics - Excerpts from Hubspot's Step by Step Guide ...A Guide to SlideShare Analytics - Excerpts from Hubspot's Step by Step Guide ...
A Guide to SlideShare Analytics - Excerpts from Hubspot's Step by Step Guide ...
 
How to Make Awesome SlideShares: Tips & Tricks
How to Make Awesome SlideShares: Tips & TricksHow to Make Awesome SlideShares: Tips & Tricks
How to Make Awesome SlideShares: Tips & Tricks
 

Similar to Ngs

فولاد کورتن چیست؟
فولاد کورتن چیست؟فولاد کورتن چیست؟
فولاد کورتن چیست؟
bahareq
 
فلسفه وجودی مرد از آثار منتشر نشده استاد علی اکبر خانجانی
فلسفه وجودی مرد از آثار منتشر نشده استاد علی اکبر خانجانیفلسفه وجودی مرد از آثار منتشر نشده استاد علی اکبر خانجانی
فلسفه وجودی مرد از آثار منتشر نشده استاد علی اکبر خانجانی
alireza behbahani
 
erp چیست - what is ERP system
erp چیست - what is ERP systemerp چیست - what is ERP system
erp چیست - what is ERP system
samankohnepushi2022
 

Similar to Ngs (20)

Tasirertebat
TasirertebatTasirertebat
Tasirertebat
 
آموزش تحلیل نیرو در خرپا
آموزش تحلیل نیرو در خرپاآموزش تحلیل نیرو در خرپا
آموزش تحلیل نیرو در خرپا
 
Mas
MasMas
Mas
 
Identification of linear dynamic systems operating in a networked environment
Identification of linear dynamic systems operating in a networked environment Identification of linear dynamic systems operating in a networked environment
Identification of linear dynamic systems operating in a networked environment
 
Karkardhyeertbati
KarkardhyeertbatiKarkardhyeertbati
Karkardhyeertbati
 
مهاجرت از تاخوگراف آنالوگ به دیجیتال نمونه اروپایی مشابه پروژه سپهتن
مهاجرت از تاخوگراف آنالوگ به دیجیتال نمونه اروپایی مشابه پروژه سپهتنمهاجرت از تاخوگراف آنالوگ به دیجیتال نمونه اروپایی مشابه پروژه سپهتن
مهاجرت از تاخوگراف آنالوگ به دیجیتال نمونه اروپایی مشابه پروژه سپهتن
 
فولاد کورتن چیست؟
فولاد کورتن چیست؟فولاد کورتن چیست؟
فولاد کورتن چیست؟
 
Hall marks of cancer
Hall marks of cancerHall marks of cancer
Hall marks of cancer
 
دنیای شگفت انگیز قارچ ها
دنیای شگفت انگیز قارچ ها دنیای شگفت انگیز قارچ ها
دنیای شگفت انگیز قارچ ها
 
آرماتوربندی استخر
آرماتوربندی استخرآرماتوربندی استخر
آرماتوربندی استخر
 
پاور پوینت حوادث ناشی از کار
پاور پوینت حوادث ناشی از کارپاور پوینت حوادث ناشی از کار
پاور پوینت حوادث ناشی از کار
 
Umrah Guide | Urdu | Dr. Moeen ud Din
Umrah Guide | Urdu | Dr. Moeen ud DinUmrah Guide | Urdu | Dr. Moeen ud Din
Umrah Guide | Urdu | Dr. Moeen ud Din
 
تشخیص چهره از طریق بیومتریک عنبیه چشم
تشخیص چهره از طریق بیومتریک عنبیه چشمتشخیص چهره از طریق بیومتریک عنبیه چشم
تشخیص چهره از طریق بیومتریک عنبیه چشم
 
Echo lecture 1 Akhtar Totakhail.pdf
Echo lecture 1 Akhtar Totakhail.pdfEcho lecture 1 Akhtar Totakhail.pdf
Echo lecture 1 Akhtar Totakhail.pdf
 
Aet
AetAet
Aet
 
فلسفه وجودی مرد از آثار منتشر نشده استاد علی اکبر خانجانی
فلسفه وجودی مرد از آثار منتشر نشده استاد علی اکبر خانجانیفلسفه وجودی مرد از آثار منتشر نشده استاد علی اکبر خانجانی
فلسفه وجودی مرد از آثار منتشر نشده استاد علی اکبر خانجانی
 
Children Empowerment Manual - IRSP
Children Empowerment Manual - IRSP Children Empowerment Manual - IRSP
Children Empowerment Manual - IRSP
 
Persian 021912 email tounitedstatescongress
Persian   021912 email tounitedstatescongressPersian   021912 email tounitedstatescongress
Persian 021912 email tounitedstatescongress
 
آریتمی دهلیزی
آریتمی دهلیزیآریتمی دهلیزی
آریتمی دهلیزی
 
erp چیست - what is ERP system
erp چیست - what is ERP systemerp چیست - what is ERP system
erp چیست - what is ERP system
 

Ngs

  • 1. ‫ندگی‬‫ز‬ ‫ا‬‫ر‬ ‫ـــا‬‫م‬ ‫نکه‬‫آ‬ ‫انم‬ ‫به‬‫داد‬ ‫د‬ ‫ندگی‬‫ی‬‫پا‬ ‫مژده‬ ‫پس‬ ‫وزان‬‫اد‬ 1
  • 2. 2
  • 3. 3
  • 4. ‫بعدی‬ ‫نسل‬ ‫روشهای‬ ‫انواع‬ ‫یابی‬ ‫توالی‬DNA 4
  • 5. 5 ‫درس‬:‫مولکولی‬ ‫نشانگرهای‬ ‫استاد‬:‫رحیمی‬ ‫دکتر‬ ‫جناب‬ ‫دهنده‬ ‫ارائه‬:‫یوسفی‬ ‫بابک‬ ‫ماه‬ ‫دی‬1394
  • 6. ‫یابی‬ ‫توالی‬(DNA sequencing) DNA‫زمان‬ ‫از‬ ‫را‬ ‫درازی‬ ‫راه‬ ‫دهه‬ ‫در‬ ‫دوبعدی‬ ‫کروماتوگرافی‬1970‫است‬ ‫کرده‬ ‫طی‬ ‫تاکنون‬. ‫ی‬ ‫ه‬ ‫ا‬‫ا‬‫وس‬ ‫اه‬‫ا‬‫ب‬ ‫اابی‬‫ا‬‫ی‬ ‫اوالی‬‫ا‬‫ت‬ ‫روا‬ ‫دو‬ ‫اور‬‫ا‬‫وه‬ ‫اا‬‫ا‬‫ب‬Sanger‫و‬ ‫ااران‬‫ا‬‫همک‬ ‫و‬ MaxamGilbert &‫اا‬‫ا‬‫س‬ ‫در‬1977‫ات‬‫ا‬‫زیس‬ ‫اا‬‫ا‬‫ب‬ ‫ارتا‬‫ا‬‫م‬ ‫اوم‬‫ا‬ ‫ع‬ ، ‫شدند‬ ‫ادینی‬ ‫بن‬ ‫و‬ ‫بزرگ‬ ‫تحوالت‬ ‫دچار‬ ‫شناسی‬. ‫روا‬ ،‫گرف،اه‬ ‫شاکل‬ ‫روا‬ ‫دو‬ ‫اان‬ ‫م‬ ‫از‬Sanger‫در‬ ‫ساهولت‬ ‫ات‬ ‫ع‬ ‫باه‬ ‫ااات‬‫ا‬‫الع‬ ‫م‬ ‫در‬ ‫ااره‬‫ا‬‫روزم‬ ‫و‬ ‫ااه‬‫ا‬‫م‬ ‫ع‬ ‫ااورد‬‫ا‬‫م‬ ‫روا‬ ‫ااال‬‫ا‬‫ی‬ ‫ااوان‬‫ا‬‫عن‬ ‫ااه‬‫ا‬‫ب‬ ،‫ااام‬‫ا‬‫انج‬ ‫اد‬‫ا‬‫گردی‬ ‫ادیل‬‫ا‬‫تا‬ ‫اولی‬‫ا‬‫مولک‬.‫ی‬ ‫ه‬ ‫ارو‬‫ا‬ ،‫روا‬ ‫اژ‬‫ا‬‫ای‬ ‫اش‬‫ا‬ ‫ل‬ ‫اه‬‫ا‬‫ب‬ ‫اه‬‫ا‬‫اینک‬ ‫اا‬‫ا‬‫ت‬‫اوم‬‫ا‬‫ن‬ ‫سا‬ ‫در‬ ‫که‬ ‫انسان‬1990‫ساا‬ ‫در‬ ‫ر‬ ‫باود‬ ‫شاده‬ ‫شاروع‬2003‫باا‬ ‫دی‬ ‫ما‬ ‫د‬ ‫رس‬ ‫ایان‬ ‫به‬ ‫ت‬ ‫موفق‬. 6
  • 7. ‫کمپانی‬Applied Biosystems‫یاابی‬ ‫تاوالی‬ ‫دودکاار‬ ‫دسا،هاه‬ ‫ژ‬ ‫اولا‬ ‫نهی‬ ‫اااااااوی‬‫ا‬‫م‬ ‫اااااااورز‬‫ا‬‫الک،روف‬ ‫روا‬ ‫اااااااا‬‫ا‬‫اس‬ ‫ااااااار‬‫ا‬‫ب‬(Capillary Electrophoresis ) CE‫کرد‬ ‫معرفی‬ ‫را‬.AB370‫ساا‬ ‫در‬1987 ‫و‬AB3730xl‫سا‬ ‫در‬1998‫طار‬ ‫در‬ ‫کاه‬ ‫بودناد‬ ‫هاایی‬ ‫دس،هاه‬ ‫ژ‬ ‫اول‬ ‫گرف،ند‬ ‫مرار‬ ‫اس،فاده‬ ‫مورد‬ ‫انسان‬ ‫نوم‬ ‫ه‬ ‫رو‬. 7
  • 8. ،‫شارف‬ ‫هاای‬ ‫ی‬ ‫تکنولاو‬ ‫باه‬ ‫از‬ ‫ن‬ ‫و‬ ‫بشری‬ ‫دانش‬ ‫شرفت‬ ‫با‬‫از‬ ‫اسا،فاده‬ ‫ه‬ ‫تاا‬ ،‫نااود‬ ‫ژ‬ ‫محققا‬ ‫رشاد‬ ‫به‬ ‫رو‬ ‫ازهای‬ ‫ن‬ ‫گوی‬ ‫جواب‬ ،‫موجود‬ ‫های‬ ‫روا‬ ‫سا‬ ‫در‬ ‫اینکه‬2004‫باه‬ ‫بااال‬ ‫مجام‬ ‫باا‬ ‫زماان‬ ‫هم‬ ‫یابی‬ ‫توالی‬ ‫روا‬ ‫ژ‬ ‫اول‬ ‫شد‬ ‫رونمایی‬ ‫تجاری‬ ‫صورت‬. ‫یاابی‬ ‫توالی‬ ‫روا‬ ‫از‬ ‫س‬ ‫جدید‬ ‫ی‬ ‫تکنولو‬ ‫ری‬ ‫گ‬ ‫شکل‬ ‫ت‬ ‫ع‬ ‫به‬‫ساانهر‬ ،‫عناوان‬ ‫با‬ ‫ی‬ ‫تکنولو‬ ‫ایژ‬Next Generarion Sequencing (NGS)‫اد‬‫ا‬‫گردی‬ ‫ای‬‫ا‬‫معرف‬.‫از‬ ‫ش‬ ‫ا‬‫ا‬‫ب‬ ‫ات‬‫ا‬‫گبش‬ ‫از‬ ‫اس‬‫ا‬ ‫اون‬‫ا‬‫اکن‬10‫از‬ ‫اا‬‫ا‬‫س‬ ‫کاربردهای‬ ‫ژ‬ ‫اول‬NGS‫تاا‬ ‫ی‬ ‫دهناده‬ ‫نشان‬ ‫ر‬ ‫اد‬ ‫می‬ ‫ع‬ ‫های‬ ‫یاف،ه‬ ،‫ر‬ ‫باشد‬ ‫می‬ ‫ال‬ ،‫ن‬ ‫م‬ ‫ع‬ ‫بر‬ ‫ی‬ ‫تکنولو‬ ‫ایژ‬ ‫ق‬ ‫عم‬. 8
  • 9. ‫ت‬ ‫یاا‬ ‫ناوم‬ ‫کال‬ ‫تاوالی‬ ‫تاوان‬ ‫مای‬ ‫ی‬ ‫تکنولاو‬ ‫ایاژ‬ ‫ی‬ ‫ه‬ ‫وسا‬ ‫به‬ ‫امروزه‬‫نهاا‬ ‫ممکا‬ ‫زماان‬ ‫کم،ریژ‬ ‫در‬ ‫و‬ ‫باال‬ ‫ار‬ ‫بس‬ ‫دمت‬ ‫با‬ ‫را‬ ‫آن‬ ‫از‬ ‫محدودی‬ ‫مسمت‬‫ژ‬ ‫داد‬ ‫مرار‬ ‫آزمایش‬ ‫و‬ ‫بررسی‬ ‫مورد‬ ‫مناسب‬ ‫ار‬ ‫بس‬ ‫ای‬ ‫هزینه‬ ‫با‬ ‫و‬. ‫اااات‬‫ا‬‫الع‬ ‫م‬ ، ‫ی‬ ‫اااو‬‫ا‬‫تکنول‬ ‫اااسژ‬‫ا‬‫ایسس‬ ‫از‬ ‫ااا،فاده‬‫ا‬‫اس‬ ‫اااسا‬‫ا‬‫ب‬DNA‫ااا،انی‬‫ا‬‫باس‬ ‫ی‬ (ancient DNA)‫است‬ ‫داش،ه‬ ‫دوبی‬ ‫های‬ ‫فت‬ ‫شر‬. 9
  • 10. ‫اااده‬‫ا‬‫ش‬ ‫اااناد،ه‬‫ا‬‫ش‬ ‫اااا‬‫ا‬‫ه‬ ‫اااوم‬‫ا‬‫ن‬ ‫ااادد‬‫ا‬‫مج‬ ‫اااابب‬‫ا‬‫ی‬ ‫اااوالب‬‫ا‬‫ت‬Resequencing)) ‫رایج‬ ‫كاربسسسسسردها‬ ‫از‬ ‫یكب‬ ‫آن‬ ‫از‬ ‫بخشی‬ ‫یا‬ ‫نوم‬ ‫كل‬NGS‫كاه‬ ‫اسات‬ ‫اسایب‬‫ا‬‫شنسسساسسس‬ ‫ارا‬‫ا‬‫ب‬SNP، ‫اا‬‫ا‬‫ه‬((Insertion / deletion‫اداد‬‫ا‬‫تع‬ ، ‫است‬ ‫اس،فاده‬ ‫مابل‬ ‫ساد،ار‬ ‫رات‬ ‫تغ‬ ‫و‬ ‫نب‬ ‫ها‬ ‫نسخه‬. ‫اا‬‫ا‬‫س‬ ‫در‬ ‫اوم‬‫ا‬‫ن‬ ‫ادد‬‫ا‬‫مج‬ ‫اابب‬‫ا‬‫ی‬ ‫اوالب‬‫ا‬‫ت‬ ‫ه‬ ‫ارو‬‫ا‬ ‫ژ‬ ‫ا‬‫ا‬‫اول‬2005‫ار‬‫ا‬‫ب‬ ‫و‬ ‫تكنولاو‬ ‫از‬ ‫اسا،فاده‬ ‫باا‬ ‫واتسون‬ ‫دك،ر‬ ‫دون‬ ‫نمونه‬ ‫رو‬454 ‫است‬ ‫گرف،ه‬ ‫انجام‬. 10
  • 11. ‫زماان‬ ‫در‬ ‫كاه‬ ‫اناد‬ ‫شاده‬ ‫ابداع‬ ‫جدید‬ ‫ها‬ ‫ا‬ ‫رو‬ ،‫ها‬ ‫هزینه‬ ‫كاهش‬ ‫برا‬ ‫كنناد‬ ‫ماب‬ ‫توالب‬ ‫ژ‬ ‫تع‬ ‫را‬ ‫ها‬ ‫نمونه‬ ‫از‬ ‫بزرگب‬ ‫طو‬ ،‫تر‬ ‫كوتاه‬.‫با‬‫طاور‬ ‫ه‬ ‫عاات‬ ‫م‬ ‫یابب‬ ‫توالب‬ ‫ب‬ ‫ك‬DNA‫تاوالب‬ ‫جدیاد‬ ‫هاا‬ ‫اا‬ ‫تكن‬ ‫از‬ ‫اسا،فاده‬ ‫باا‬ ‫ا‬‫ا‬‫همس‬ ‫ال‬‫ا‬‫مرام‬ ‫اه‬‫ا‬‫ب‬ ‫ااز‬‫ا‬ ‫ن‬ ‫انهر‬‫ا‬‫س‬ ‫روا‬ ‫اا‬‫ا‬‫ب‬ ‫اابب‬‫ا‬‫ی‬ ‫اوالب‬‫ا‬‫ت‬ ‫ا‬ ‫ارد‬‫ا‬‫ب‬ ،‫اابب‬‫ا‬‫ی‬‫انه‬ ‫كااه‬ ‫شادت‬ ‫باه‬ ‫را‬ ‫یاابب‬ ‫تاوالب‬ ‫هزینه‬ ‫و‬ ‫زمان‬ ‫ه‬ ‫مسئ‬ ‫ایژ‬ ،‫ندارد‬ ‫ساز‬‫ش‬ ‫است‬ ‫داده‬. ‫م‬ ‫چندیژ‬ ‫د‬ ‫تول‬ ،‫یابب‬ ‫توالب‬ ‫نوع‬ ‫ایژ‬ ‫دیهر‬ ‫توجه‬ ‫مابل‬ ‫مزیت‬‫تاوالب‬ ‫اون‬ ،‫اسا‬ ‫مورد‬ ‫س،م‬ ‫س‬ ‫نوع‬ ‫و‬ ‫نظر‬ ‫مورد‬ ‫هدا‬ ‫به‬ ‫بس،ه‬ ‫م،وس‬ ‫طو‬ ‫به‬، ‫فاده‬ ‫باشاد‬ ‫ماب‬ ‫بااال‬ ‫صحت‬ ‫و‬ ‫دمت‬ ‫با‬ ‫روز‬ ‫چند‬ ‫یا‬ ‫ساعت‬ ‫چند‬ ‫طب‬ ‫در‬ ‫تنها‬‫کاه‬ ‫باشد‬ ‫می‬ ‫ع‬ ‫وس‬ ‫ا‬ ‫مق‬ ‫در‬ ‫یابب‬ ‫توالب‬ ‫ژ‬ ‫ما‬. 11
  • 12. ‫ااو‬‫ا‬‫تكنول‬ ‫ااژ‬‫ا‬‫ای‬ ‫ااا‬‫ا‬‫ت‬ ‫ااد‬‫ا‬‫ش‬ ‫اااب‬‫ا‬‫س‬ ، ‫آن‬ ‫ااازی‬‫ا‬‫س‬ ‫اااری‬‫ا‬‫وتج‬ ‫ااا‬‫ا‬‫ه‬ ‫ااب‬‫ا‬‫گ‬ ‫وی‬ ‫ااژ‬‫ا‬‫ای‬ ‫ب‬ ‫هاا‬ ‫آزمایشاهاه‬ ‫اب‬ ‫ا‬ ‫و‬ ‫شاده‬ ‫ساانهر‬ ‫یاابب‬ ‫توالب‬ ‫روا‬ ‫جایهزیژ‬‫،وانناد‬ ‫ااره‬‫ا‬‫به‬ ‫آن‬ ‫از‬ ‫اازرگ‬‫ا‬‫ب‬ ‫ااومب‬‫ا‬‫ن‬ ‫ااابب‬‫ا‬‫ی‬ ‫ااوالب‬‫ا‬‫ت‬ ‫ااز‬‫ا‬‫مراك‬ ‫از‬ ‫اا،قل‬‫ا‬‫مس‬ ‫ااور‬‫ا‬‫ط‬ ‫ااه‬‫ا‬‫ب‬ ‫كنند‬ ‫بردار‬. ‫ا‬ ‫تكن‬ ‫ارزشمند‬ ‫مزایا‬ ‫كنار‬ ‫در‬ ‫كه‬ ‫است‬ ‫ذكر‬ ‫به‬ ‫الزم‬�NGS،‫ز‬ ‫آنال‬ ‫ایااژ‬ ‫در‬ ‫چااالش‬ ‫بزرگ،ااریژ‬ ، ‫یااابب‬ ‫تااوالب‬ ‫ز‬ ‫ا‬ ‫ماصاال‬ ‫م‬ ‫عظاا‬ ‫هااا‬ ‫داده‬ ‫افزار‬ ‫ناارم‬ ،‫شاارف،ه‬ ‫وترهااا‬ ‫كامپ‬ ‫ازمنااد‬ ‫ن‬ ‫كااه‬ ‫باشااد‬ ‫مااب‬ ‫نااه‬ ‫زم‬‫هااا‬ ‫است‬ ‫كافب‬ ‫تخصص‬ ‫و‬ ‫دانش‬ ‫ژ‬ ‫همچن‬ ‫و‬ ‫ها‬ ‫داده‬ ‫ز‬ ‫آنال‬ ‫برا‬ ‫داص‬. ‫افزارهاای‬ ‫نارم‬ ،‫فاون‬ ‫ماوارد‬ ‫رفاع‬ ‫به‬ ‫از‬ ‫ن‬ ‫امسا‬ ‫با‬ ‫و‬ ‫ماضر‬ ‫ما‬ ‫در‬ ‫ر‬ ‫تفس‬ ‫و‬ ‫ل‬ ‫تح‬ ‫و‬ ‫تجزیه‬ ‫تخصصی‬NGS‫است‬ ‫شده‬ ‫طرامی‬. 12
  • 13. ‫چ‬ ،‫اال‬ ،‫ن‬ ‫ی‬ ‫ناه‬ ‫زم‬ ‫در‬ ‫بازرگ‬ ‫شرفت‬ ‫ایژ‬ ‫با‬ ‫ه‬ ‫راب‬ ‫در‬ ‫امروزه‬‫نادیژ‬ ‫ااوت‬‫ا‬‫م،ف‬ ‫ااری‬‫ا‬‫تج‬ ‫روا‬NGS‫ای‬‫ا‬‫ک‬ ،‫ن‬ ‫اات‬‫ا‬‫ع‬ ‫اط‬ ‫اه‬‫ا‬‫ب‬ ‫اابی‬‫ا‬‫ی‬ ‫ات‬‫ا‬‫دس‬ ‫ات‬‫ا‬‫جه‬ ‫ار‬ ‫گ‬ ‫مای‬ ‫مرار‬ ‫اس،فاده‬ ‫مورد‬ ‫ش‬ ،‫مخ‬ ‫ها‬ ‫شركت‬ ‫توس‬ ،‫ش،ر‬ ‫ب‬‫در‬ ‫کاه‬ ‫د‬ ‫ردازیم‬ ‫می‬ ‫آنها‬ ‫شر‬ ‫به‬ ‫ذیل‬: 13
  • 14. ‫سااا‬ ‫در‬ ‫تجاااری‬ ‫ااور‬ ‫ب‬ ‫کااه‬ ‫مااورد‬ ‫ژ‬ ‫اولاا‬2004‫دساا،هاه‬ ،‫شااد‬ ‫معرفاای‬ Roche/454FLX Pyrosequencer‫بود‬. ‫ااااااااای‬‫ا‬‫مرارت‬ ‫اااااااااوالب‬‫ا‬‫ت‬ ‫ژ‬ ‫ااااااااا‬‫ا‬ ‫تع‬ ‫روا‬ ‫از‬ ‫ااااااااا،هاه‬‫ا‬‫دس‬ ‫اااااااااژ‬‫ا‬‫ای‬ (Pyrosequencing)‫اركت‬‫ا‬‫ش‬ ‫ا‬‫ا‬‫توس‬ ‫اه‬‫ا‬‫ک‬ ،‫ارد‬‫ا‬‫ک‬ ‫ای‬‫ا‬‫م‬ ‫ا،فاده‬‫ا‬‫اس‬Life Sciences‫شاااركت‬ ‫توسااا‬ ‫هاااا‬ ‫بعاااد‬ ‫روا‬ ‫ایاااژ‬ ‫و‬ ‫شااانهاد‬ ‫امریکاااا‬ Roche‫شد‬ ‫دریدار‬ ‫س‬ ‫سوی‬. ‫ااا‬‫ا‬‫ب‬ ‫ااراه‬‫ا‬‫هم‬ ‫اای‬‫ا‬‫رونق‬ ‫اات‬‫ا‬‫اس‬ ‫اار‬‫ا‬‫ذک‬ ‫اال‬‫ا‬‫ماب‬‫ااایرن‬‫ا‬‫ن‬ ‫ااا‬‫ا‬‫روا‬ ‫اارع‬‫ا‬،‫مخ‬‫اارو‬‫ا‬ ‫ن‬ ‫سکونسااا‬‫یاااابی‬‫توالی‬ ‫بااارای‬DNA‫اسااات‬.‫ارشاااد‬ ‫معااااون‬ ‫رونقااای‬ ‫شرکت‬‫ایلومینا‬‫دارد‬ ‫م،عددی‬ ‫مقاالت‬ ‫و‬ ‫اد،راعات‬ ‫و‬ ‫بوده‬. 14
  • 15. ‫عاااات‬ ‫م‬ ‫روا‬ ‫ایاااژ‬ ‫در‬DNA‫محااا‬ ‫یاااا‬ ‫در‬ ‫آب‬ ‫ااارات‬ ‫م‬ ‫دادااال‬ ‫در‬ ‫ناب‬ ‫رو‬(‫ون‬ ‫امولسا‬PCR)‫اود‬‫ا‬‫ش‬ ‫ماب‬ ‫ار‬‫ا‬ ‫تكث‬.‫ار‬‫ا‬ ‫م‬ ‫ایاژ‬ ‫از‬ ‫ادام‬‫ا‬‫ك‬ ‫هار‬ ‫در‬ ‫او‬‫ا‬‫اله‬ ‫اا‬‫ا‬‫ی‬ ‫آب‬ ‫ات‬DNA‫اب‬‫ا‬‫م‬ ‫ال‬‫ا‬‫م،ص‬ ‫اازگر‬‫ا‬ ‫آ‬ ‫اا‬‫ا‬‫ی‬ ‫اه‬‫ا‬‫ب‬ ‫اه‬‫ا‬‫ك‬ ‫دارد‬ ‫ارار‬‫ا‬‫م‬ ‫شا‬ ‫ماب‬ ‫ایجااد‬ ‫فشارده‬ ‫اونب‬ ‫ك‬ ‫یاا‬ ‫آن‬ ‫ار‬ ‫تكث‬ ‫ار‬ ‫ا‬ ‫بار‬ ‫نهایات‬ ‫در‬ ‫و‬ ‫شود‬‫ود‬. ‫كاول‬ ‫ماد‬ ‫در‬ ‫مجام‬ ‫با‬ ‫چاها‬ ‫زیاد‬ ‫تعداد‬ ‫ماو‬ ‫دوان‬ ‫توالب‬ ‫دس،هاه‬‫،ر‬ ‫مخصاوص‬ ‫آنازیم‬ ‫و‬ ‫داناه‬ ‫یاا‬ ‫مااو‬ ‫هاا‬ ‫چاهاا‬ ‫ایژ‬ ‫از‬ ‫كدام‬ ‫هر‬ ‫كه‬ ‫است‬ ‫اسات‬ ‫تاوالب‬ ‫ژ‬ ‫ا‬ ‫تع‬.‫فراز‬ ‫لوسا‬ ‫آنازیم‬ ‫از‬ ، ‫سا،م‬ ‫س‬ ‫ایاژ‬(Luciferase Enzyme)‫اد‬ ‫ئوت‬ ‫نوك‬ ‫هار‬ ‫ص‬ ‫تشخ‬ ‫برا‬ ‫كند‬ ‫مب‬ ‫نور‬ ‫د‬ ‫تول‬ ‫كه‬‫باه‬ ‫كاه‬ ‫رش،ه‬DNA‫كند‬ ‫مب‬ ‫اس،فاده‬ ‫شود‬ ‫مب‬ ‫افزوده‬ ‫شده‬ ‫ل‬ ‫تشك‬ ‫تازه‬. ‫ی‬ ‫تکنولو‬ ‫شرفت‬ ‫با‬Roche‫هاای‬ ‫مولکاو‬ ‫تاوان‬ ‫مای‬DNA‫او‬ ‫ب‬ ‫تا‬1000‫کرد‬ ‫یابی‬ ‫توالی‬ ‫را‬ ‫باز‬ ‫جفت‬. 15
  • 16. 16 ‫نمونه‬ ‫سازي‬ ‫آماده‬ ‫مراحل‬DNA((A‫تكثیر‬ ،(B )‫تكنولوژي‬ ‫با‬ ‫توالي‬ ‫تعیین‬ ‫و‬(C) 454
  • 19. 19 The Roche-454 GS-FLX Pyrosequencer
  • 20. ‫كمپانب‬Solexa‫ساا‬ ‫در‬ ‫كه‬٢٠٠٦‫دسا،هاه‬Genome Analyzer ‫اا‬‫ا‬‫س‬ ‫در‬ ‫ارد‬‫ا‬‫ك‬ ‫اه‬‫ا‬‫ارار‬ ‫اازار‬‫ا‬‫ب‬ ‫اه‬‫ا‬‫ب‬ ‫را‬٢٠٠٧‫اانب‬‫ا‬‫كمپ‬ ‫ا‬‫ا‬‫توس‬Illumina ‫اام‬‫ا‬‫ن‬ ‫اا‬‫ا‬‫ب‬ ‫بعاد‬ ‫اه‬‫ا‬‫ب‬ ‫اان‬‫ا‬‫زم‬ ‫آن‬ ‫از‬ ‫و‬ ‫اد‬‫ا‬‫ش‬ ‫دریادار‬Illumina / Solexa ‫شود‬ ‫مب‬ ‫شناد،ه‬. ‫سا‬ ‫اوایل‬ ‫در‬2010Illumina،‫سا،م‬ ‫س‬Hiseq‫اراراه‬ ‫باازار‬ ‫باه‬ ‫را‬ ‫م‬ ‫اس،فاده‬ ‫توالب‬ ‫ژ‬ ‫تع‬ ‫برا‬ ‫البکر‬ ‫فون‬ ‫اس،رات‬ ‫از‬ ‫كه‬ ‫كرد‬‫كند‬ ‫ب‬.‫اماا‬ ‫است‬ ‫ش،ر‬ ‫ب‬ ‫ار‬ ‫بس‬ ‫ب‬ ‫ما‬ ‫نسخه‬ ‫با‬ ‫مقایسه‬ ‫در‬ ‫آن‬ ‫دروجب‬. 20
  • 21. ‫ب‬ ‫ولاب‬ ‫دهناده‬ ‫ایاان‬ ‫هاا‬ ‫رن‬ ‫ت‬ ‫داص‬ ‫از‬ ‫اس،فاده‬ ‫با‬ ‫توالب‬ ‫ژ‬ ‫تع‬ ‫روا‬ ‫ایژ‬‫رگشات‬ ‫ابیر‬(Reversible Dye-Terminators)‫اسات‬ ‫شاده‬ ‫طراماب‬.‫عاات‬ ‫م‬ ‫اب،ادا‬ ‫مولكو‬ ‫شده‬ ‫شكس،ه‬DNA‫تكث‬ ‫ساپس‬ ‫و‬ ‫وصال‬ ‫ید‬ ‫اسا‬ ‫به‬ ‫م،صل‬ ‫ازگرها‬ ‫آ‬ ‫به‬‫ار‬ ‫اود‬‫ا‬‫ش‬ ‫اب‬‫ا‬‫م‬(Bridge Amplification)‫اد‬‫ا‬‫ده‬ ‫اب‬‫ا‬‫م‬ ‫ل‬ ‫اك‬‫ا‬‫تش‬.‫ااز‬‫ا‬‫ب‬ ‫اوع‬‫ا‬‫ن‬ ‫اار‬‫ا‬‫چه‬ ‫اپس‬‫ا‬‫س‬ ‫ابیر‬ ‫برگشت‬ ‫ولب‬ ‫دهنده‬ ‫ایان‬ ‫ها‬ ‫رن‬ ‫به‬ ‫م،صل‬(RT-bases)‫ماب‬ ‫واكانش‬ ‫باه‬ ‫با‬ ،‫باشد‬ ‫داش،ه‬ ‫وجود‬ ‫اتصا‬ ‫برا‬ ‫مناساب‬ ‫محل‬ ‫كه‬ ‫صورتب‬ ‫در‬ ‫باز‬ ‫هر‬ ‫و‬ ‫شود‬‫آن‬ ‫ه‬ ‫وا‬ ‫محا‬ ‫از‬ ‫و‬ ‫شاده‬ ‫شسا،ه‬ ‫آزاد‬ ‫هاا‬ ‫اد‬ ‫ئوت‬ ‫نوك‬ ‫ساپس‬ ‫و‬ ‫شود‬ ‫مب‬ ‫م،صل‬ ‫ه‬ ‫نام‬‫كانش‬ ‫به‬ ‫ه‬ ‫مرم‬ ‫هر‬ ‫در‬ ‫د‬ ‫ئوت‬ ‫نوك‬ ‫یا‬ ‫تنها‬ ‫و‬ ،‫شود‬ ‫مب‬ ‫مبا‬DNA‫شاود‬ ‫ماب‬ ‫اضاافه‬.‫در‬ ‫تصاوی‬ ‫ورسانت‬ ‫ف‬ ‫باا‬ ‫شاده‬ ‫نشااندار‬ ‫هاا‬ ‫اد‬ ‫ئوت‬ ‫نوك‬ ‫از‬ ‫ناب‬ ‫دورب‬ ‫لحظاه‬ ‫ایژ‬‫باردار‬ ‫ر‬ ‫اد‬‫ا‬‫نمای‬ ‫اب‬‫ا‬‫م‬.‫اد‬‫ا‬‫رش‬ ‫اده‬‫ا‬‫كنن‬ ‫اش‬‫ا‬‫م،وم‬ ‫اان‬‫ا‬‫ای‬ ‫در‬DNA‫ار‬‫ا‬‫س‬ ‫از‬'3‫اا‬‫ا‬‫ه‬ ‫انش‬‫ا‬‫واك‬ ‫ا‬‫ا‬‫توس‬ ‫شود‬ ‫مب‬ ‫از‬ ‫آ‬ ‫بعد‬ ‫چرده‬ ‫و‬ ‫شود‬ ‫مب‬ ‫جدا‬ ‫ایب‬ ‫م‬ ‫ش‬. 21
  • 27. ‫اانب‬‫ا‬‫كمپ‬SOLiD‫اا‬‫ا‬‫س‬ ‫در‬٢٠٠٦‫اق‬‫ا‬‫طری‬ ‫از‬ ‫اابب‬‫ا‬‫ی‬ ‫اوالب‬‫ا‬‫ت‬ ‫او‬‫ا‬‫تكنول‬ ‫اتصا‬(Sequencing- by-ligation)‫و‬ ‫كرد‬ ‫معرفب‬ ‫بازار‬ ‫به‬ ‫را‬ ‫اركت‬‫ا‬‫ش‬ ‫ا‬‫ا‬‫توس‬ ‫از‬‫ا‬ ‫ن‬ ‫اا‬‫ا‬‫س‬ ‫ژ‬ ‫ا‬‫ا‬‫هم‬ ‫در‬(Applied Biosystems - ABI)‫شد‬ ‫دریدار‬. ‫اماره‬‫ا‬‫ش‬ ‫اای‬‫ا‬‫ه‬ ‫اال‬‫ا‬ ‫تکن‬ ‫اد‬‫ا‬‫همانن‬ ‫از‬‫ا‬ ‫ن‬ ‫روا‬ ‫اژ‬‫ا‬‫ای‬1‫و‬2‫اای‬‫ا‬‫ه‬ ‫اه‬‫ا‬‫ک،ابخان‬ ‫از‬ ، ‫گ‬ ‫می‬ ‫بهره‬ ‫یابی‬ ‫توالی‬ ‫جهت‬ ‫،ور‬ ‫آدا‬ ‫ی‬ ‫ه‬ ‫وس‬ ‫به‬ ‫گرف،ه‬ ‫شکل‬‫رد‬. ‫تاا‬ ‫دسا،هاه‬ ‫اجارا‬ ‫هر‬ ‫در‬ ‫اب،دا‬ ‫در‬Gb٣‫اماا‬ ،‫گردیاد‬ ‫ماب‬ ‫مرارات‬ ‫تاوالب‬ ‫در‬٢٠٠٩‫اااوان‬‫ا‬‫عن‬ ‫ااات‬‫ا‬‫تح‬ ‫اااد‬‫ا‬،‫م‬ ‫اااژ‬‫ا‬‫ای‬ ‫از‬ ‫اااد‬‫ا‬‫جدی‬ ‫نساااخه‬ ،Plus 3 ™SOLiD‫از‬ ‫ش‬ ‫با‬ ‫اجارا‬ ‫هار‬ ‫در‬ ‫است‬ ‫مادر‬ ‫كه‬ ‫شد‬ ‫معرفب‬٦٠Gb ‫كند‬ ‫مرارت‬ ‫توالب‬. 27
  • 28. ،‫ااوالی‬‫ا‬‫ت‬ ‫ژ‬ ‫اا‬‫ا‬ ‫تع‬ ‫از‬ ‫ش‬ ‫اا‬‫ا‬ ‫روا‬ ‫ااژ‬‫ا‬‫ای‬ ‫در‬DNA‫از‬ ‫ده‬ ‫اا‬‫ا‬‫وش‬ ‫ااا‬‫ا‬‫ه‬ ‫ااه‬‫ا‬‫دان‬ ‫اا‬‫ا‬‫توس‬ ‫ناب‬ ‫رو‬ ‫هاا‬ ‫ماااب‬ ‫در‬ ‫ازگر‬ ‫آ‬Aqueous droplets within an oil phase ))‫شود‬ ‫مب‬ ‫ر‬ ‫تكث‬(Emulsion PCR).‫هاا‬ ‫مااب‬ ‫ایژ‬ ‫از‬ ‫كدام‬ ‫هر‬ ‫هاا‬ ‫مولكاو‬ ‫از‬ ‫نسخه‬ ‫یا‬ ‫ماو‬DNA‫ید‬ ‫اسا‬ ‫ي‬ ‫سا‬ ‫بار‬ ‫كاه‬ ‫اسات‬ ‫مشاابه‬ ‫دارد‬ ‫مرار‬ ‫ا‬ ‫شه‬ ‫ش‬. ‫جایه‬ ‫كه‬ ‫صورتب‬ ‫در‬ ‫و‬ ‫شود‬ ‫مب‬ ‫باز‬ ‫ا‬ ‫رش،ه‬ ‫دو‬ ‫ها‬ ‫د‬ ‫ئوت‬ ‫هونوك‬ ‫ال‬‫ها‬ ‫اه‬ ‫شاود‬ ‫ماب‬ ‫م،صال‬ ‫آن‬ ‫باه‬ ‫كند‬ ‫دا‬ ‫اتصا‬ ‫برا‬ ‫مشابه‬.‫اسات‬ ‫ذكار‬ ‫باه‬ ‫الزم‬‫كاه‬ ‫مقا‬ ‫ال‬‫ا‬‫ماب‬ ،‫روا‬ ‫اژ‬‫ا‬‫ای‬ ‫در‬ ‫اات‬‫ا‬‫ع‬ ‫م‬ ‫او‬‫ا‬‫ط‬ ‫و‬ ‫ات‬‫ا‬ ‫ف‬ ‫ك‬ ،‫اوالب‬‫ا‬‫ت‬ ‫ژ‬ ‫ا‬‫ا‬ ‫تع‬ ‫اه‬‫ا‬‫ج‬ ،‫ن‬‫اا‬‫ا‬‫ب‬ ‫اه‬‫ا‬‫یس‬ ‫است‬ ‫نا‬ ‫وم‬ ‫ای‬ ‫روا‬. ‫آنازیم‬ ‫از‬ ‫اسا،فاده‬ ‫روا‬ ‫ایژ‬ ‫بارز‬ ‫ت‬ ‫دصوص‬ligase‫هاای‬ ‫اروب‬ ‫و‬ ‫هااز‬ ‫ل‬ ‫اس‬ ‫داده‬ ‫افزایش‬ ‫زیادی‬ ‫ار‬ ‫بس‬ ‫زان‬ ‫م‬ ‫به‬ ‫را‬ ‫روا‬ ‫دمت‬ ‫که‬ ‫است‬ ‫دار‬ ‫نشان‬‫ت‬. 28
  • 29. 29 ‫توالب‬ ‫ژ‬ ‫تع‬ ‫روا‬DNA‫تكنولو‬ ‫از‬ ‫اس،فاده‬ ‫با‬ABI / SOLiD
  • 31. ‫شااید‬ ‫کاه‬ ‫ب‬ ،‫آنهاا‬ ‫ناکارآمادی‬ ‫ال‬ ‫دل‬ ‫به‬ ‫نه‬ ‫روشها‬ ‫ایژ‬ ‫کم،ر‬ ‫کاربرد‬‫شا،ر‬ ‫ب‬ ‫و‬ ‫دسا،هاهها‬ ‫فاروا‬ ‫در‬ ‫مربوطاه‬ ‫های‬ ‫کمپانی‬ ‫کم،ر‬ ‫ت‬ ‫فعال‬ ‫برای‬‫داناش‬ ‫باشد‬ ‫مربوطه‬.‫است‬ ‫شده‬ ‫اورده‬ ‫زیر‬ ‫در‬ ‫روشها‬ ‫ایژ‬ ‫از‬ ‫تعدادی‬: 31
  • 32. ‫شركت‬Pacific Bioscience‫تاوا‬ ‫و‬‫ژ‬ ‫ا‬ ‫تع‬ ‫روا‬ ‫كنناده‬ ‫اباداع‬ ‫کانادا‬‫لب‬ (Single Molecular Real Time) SMRT‫اسات‬.‫روا‬ ‫ایاژ‬‫بار‬ ‫ساز‬ ‫همانند‬ ‫عب‬ ‫طا‬ ‫فرآیند‬ ‫و‬ ‫اسا‬DNA‫كاارآیب‬ ‫از‬ ‫كاه‬ ‫شاده‬ ‫طرامب‬ ‫ات‬‫ا‬‫اس‬ ‫اوردار‬‫ا‬‫برد‬ ‫ااالیب‬‫ا‬‫ب‬ ‫ا،ب‬‫ا‬‫درس‬ ‫و‬.‫ااوری‬‫ا‬‫فن‬SMRT‫ان،ز‬‫ا‬‫س‬ ‫ااهده‬‫ا‬‫مش‬ DNA‫سازد‬ ‫مب‬ ‫بیر‬ ‫امكان‬ ‫وموع‬ ‫زمان‬ ‫همان‬ ‫در‬ ‫را‬. 32
  • 33. ‫ا‬ ‫تع‬ ‫جدیاد‬ ‫نسل‬ ‫برا‬ ‫شنهاد‬ ‫ها‬ ‫روا‬ ‫ژ‬ ‫اول‬ ‫از‬ ‫دیهر‬ ‫یكب‬‫تاوالب‬ ‫ژ‬ ‫روا‬ ‫اه‬‫ا‬‫ب‬ ‫اوالب‬‫ا‬‫ت‬ ‫ژ‬ ‫ا‬‫ا‬ ‫تع‬ ،‫اا‬‫ا‬‫ه‬Polony‫در‬ ‫ااروارد‬‫ا‬‫ه‬ ‫اهاه‬‫ا‬‫دانش‬ ‫در‬ ‫اه‬‫ا‬‫ك‬ ‫اود‬‫ا‬‫ب‬ ‫اا‬‫ا‬‫س‬2005‫اد‬‫ا‬‫ش‬ ‫اداع‬‫ا‬‫اب‬ ‫اوم‬‫ا‬‫ن‬ ‫ال‬‫ا‬‫كام‬ ‫اوالب‬‫ا‬‫ت‬ ‫ژ‬ ‫ا‬‫ا‬ ‫تع‬ ‫ارا‬‫ا‬‫ب‬.‫روا‬ ‫اا‬‫ا‬‫ی‬ ‫اژ‬‫ا‬‫ای‬ ‫بود‬ ‫روا‬ ‫چند‬ ‫از‬ ‫اب‬ ‫ترك‬.‫شاركت‬ ‫توسا‬ ‫ور‬ ‫فنسا‬ ‫ایژ‬ABI(‫آمریكاا‬) ‫شد‬ ‫دریدار‬. 33
  • 34. ‫تااااوالب‬ ‫ژ‬ ‫اااا‬ ‫تع‬ ‫روا‬Massively Parallel Signature Sequencing - MPSS‫ساا‬ ‫در‬ ‫باار‬ ‫ژ‬ ‫اولا‬ ‫بارا‬1992‫شانهاد‬ ‫شد‬.‫هم‬ ‫بیرشاهرها‬ ‫انفصا‬ ‫و‬ ‫اتصا‬ ‫مانا‬ ‫بر‬ ‫روا‬ ‫ایژ‬ ‫اسا‬‫زماان‬ ‫است‬ ‫د‬ ‫ئوت‬ ‫نوك‬ ‫چهار‬ ‫افزایش‬ ‫با‬. ‫تن‬ ‫و‬ ‫نشاد‬ ‫ارایاه‬ ‫باازار‬ ‫باه‬ ‫روا‬ ‫ایاژ‬ ،‫سام‬ ‫مكان‬ ‫ادگب‬ ‫چ‬ ‫دااطر‬ ‫به‬‫در‬ ‫هاا‬ ‫ردادات‬ ‫دهاب‬ ‫سارویس‬ ‫باه‬ ‫روا‬ ‫ایاژ‬ ‫كنناده‬ ‫شانهاد‬ ‫آزمایشهاه‬ ‫همان‬. ‫اا‬‫ا‬‫س‬ ‫در‬2004‫اركت‬‫ا‬‫ش‬ ‫ا‬‫ا‬‫توس‬ ‫روا‬ ‫اژ‬‫ا‬‫ای‬Selectra‫اد‬‫ا‬‫ش‬ ‫اده‬‫ا‬‫دری‬.‫اه‬‫ا‬‫ک‬ ‫اب‬‫ا‬‫مناس‬ ‫ااربرد‬‫ا‬‫ك‬ ‫روا‬ ‫اا‬‫ا‬‫ی‬ ‫اورت‬‫ا‬‫ص‬ ‫اه‬‫ا‬‫ب‬ ‫را‬ ‫آن‬ ،‫اردن‬‫ا‬‫ك‬ ‫اه‬‫ا‬‫ن‬ ‫به‬ ‫از‬ ‫اس‬‫ا‬ ‫داد‬ ‫ارایه‬ ‫سن،ز‬ ‫با‬ ‫همزمان‬ ‫توالب‬ ‫ژ‬ ‫تع‬ ‫برا‬. 34
  • 35. ‫باه‬ ‫یاابب‬ ‫تاوالب‬ ‫سا،م‬ ‫س‬ ‫جدیادتریژ‬ ‫ماضار‬ ‫ماا‬ ‫در‬‫یل‬ ‫تلوالي‬ ‫سلوت‬ ‫نسلل‬‫ابي‬ “Next-Next-Generation Sequencing"‫است‬ ‫معروا‬. ‫تا‬ ‫دوم‬ ‫نسال‬ ‫هاا‬ ‫اا‬ ‫تكن‬ ‫باا‬ ‫مقایساه‬ ‫در‬ ‫تكنولو‬ ‫ایژ‬ ‫مم،از‬ ‫ها‬ ‫گب‬ ‫وی‬‫والب‬ ‫یابب‬NGS))‫ار‬ ‫تكث‬ ‫باه‬ ‫ااز‬ ‫ن‬ ‫عادم‬ ،DNA‫واكانش‬ ‫باا‬PCR‫كاه‬ ‫باشاد‬ ‫ماب‬ ‫است‬ ‫شده‬ ‫یابب‬ ‫توالب‬ ‫برا‬ ‫الزم‬ ‫زمان‬ ‫كاهش‬ ‫و‬ ‫دمت‬ ‫افزایش‬ ‫باعث‬. ‫سا،م‬ ‫س‬ ‫ایاژ‬ ‫توسا‬ ‫شاده‬ ‫مرارات‬ ‫ها‬ ‫توالب‬ ‫م،وس‬ ‫طو‬ ‫ژ‬ ‫همچن‬١٣٠٠bp ‫دوم‬ ‫نسال‬ ‫هاا‬ ‫دسا،هاه‬ ‫تماام‬ ‫توسا‬ ‫شاده‬ ‫دوانده‬ ‫ها‬ ‫توالب‬ ‫طو‬ ‫از‬ ‫كه‬ ‫است‬ ‫است‬ ‫ش،ر‬ ‫ب‬. 35
  • 36. ‫اانب‬‫ا‬‫كمپ‬ ‫ا‬‫ا‬‫توس‬ ‫اار‬‫ا‬‫ب‬ ‫ژ‬ ‫ا‬‫ا‬‫اول‬Helicos Bioscience‫اام‬‫ا‬‫ن‬ ‫اا‬‫ا‬‫ب‬ ‫و‬ ‫اب‬‫ا‬‫معرف‬ ‫تجااری‬The Helicos Heliscope‫تاوالب‬ ‫باه‬ ‫ماادر‬ ‫و‬ ‫شاد‬ ‫عرضاه‬ ‫باشد‬ ‫مب‬ ‫منفرد‬ ‫مولكو‬ ‫یا‬ ‫یابب‬. ‫کنا‬ ‫مای‬ ‫اسا،فاده‬ ‫سان،ز‬ ‫ژ‬ ‫ما‬ ‫یابی‬ ‫توالی‬ ‫اصو‬ ‫از‬ ‫ز‬ ‫ن‬ ‫روا‬ ‫ایژ‬‫ایاژ‬ ‫باا‬ ‫د‬ ‫ک،ابخانا‬ ‫ایجااد‬ ‫باه‬ ‫اازی‬ ‫ن‬ ‫یاابی‬ ‫تاوالی‬ ‫انجاام‬ ‫از‬ ‫ش‬ ‫که‬ ‫تفاوت‬‫ار‬ ‫تکث‬ ‫و‬ ‫ه‬ ‫ندارد‬ ‫وجود‬ ‫الهو‬ ‫های‬ ‫رش،ه‬. ‫دوانش‬ ‫هر‬ ‫در‬ ‫تواند‬ ‫مب‬ ‫دس،هاه‬ ‫ایژ‬55‫بخواند‬ ‫را‬ ‫باز‬. 36
  • 38. ‫كمپاانب‬Ion Torrent‫ساا‬ ‫اوادار‬ ‫در‬٢٠١٠‫باه‬ ‫موساوم‬ ‫دسا،هاهب‬ Machine Ion Personal Genome (Ion PGM)‫رواناه‬ ‫را‬ ‫یابب‬ ‫توالب‬ ‫سوم‬ ‫نسل‬ ‫ها‬ ‫دس،هاه‬ ‫از‬ ‫دیهر‬ ‫نوع‬ ‫كه‬ ‫كرد‬ ‫بازار‬‫است‬. ‫سا‬ ‫س‬ ‫ساایر‬ ‫در‬ ‫كاه‬ ‫ناور‬ ‫روا‬ ‫ا‬ ‫د‬ ‫بر‬ ‫توالب‬ ‫ژ‬ ‫تع‬ ‫روا‬ ‫ایژ‬‫هاا‬ ‫،م‬ ‫ااام‬‫ا‬‫هنه‬ ‫در‬ ‫ااه‬‫ا‬‫ك‬ ‫ن‬ ‫اادرو‬‫ا‬ ‫ه‬ ‫ااا‬‫ا‬‫ه‬ ‫ااون‬‫ا‬‫ی‬ ‫ااایب‬‫ا‬‫شناس‬ ‫از‬ ،‫ااود‬‫ا‬‫ش‬ ‫ااب‬‫ا‬‫م‬ ‫اا،فاده‬‫ا‬‫اس‬ ‫شاادن‬ ‫مریاازه‬DNA‫و‬ ‫نمااوده‬ ‫اساا،فاده‬ ،‫شااود‬ ‫مااب‬ ‫آزاد‬pH‫محاا‬ ‫ار‬ ‫تغ‬ ‫اب‬ ‫ترت‬ ‫ایاژ‬ ‫باه‬ ،‫كناد‬ ‫ماب‬ ‫ار‬ ‫تغ‬ ‫واكانش‬pH‫كاه‬ ‫دهاد‬ ‫ماب‬ ‫نشاان‬ ‫ر‬ ‫د‬ ‫یا‬ ‫است‬ ‫شده‬ ‫اضافه‬ ‫جدید‬ ‫د‬ ‫ئوت‬ ‫نوك‬. 38
  • 41. 41 # Advanced sequencing technologies and their wider impact in microbiology Neil Hall The Journal of Experimental Biology 209, 1518-1525 # Applications of next-generation sequencing technologies in functional genomics Olena Morozova, Marco A. Marra Genomics - Volume 92, Issue 5, November 2008, Pages 255–264
  • 42. 42 # A tale of three next generation sequencing Michael A Quail , Miriam Smith, Paul Coupland, Thomas D Otto, Simon R Harris, Thomas R Connor, Anna Bertoni, Harold P Swerdlow and Yong Gu BMC Genomics 2012, 13:341 # Buyer’s Guide: Next-Generation Sequencing Systems This buyer’s resource is presented to you by Illumina Inc. # Next-generation DNA sequencing - Jay Shendure & Hanlee Ji, naturebiotechnology / volume 26. naumber 10. OCTOBER 2008
  • 43. 43 # Sequencing Methods Review A review of publications featuring Illumina® Technology Pub No. 073-2014-001 Current as of 29 May 2014 # The advantages of SMRT sequencing Richard J Roberts, Mauricio OCarneiro and Michael C Schatz - Genome Biology 2013, 14:405
  • 44. 44 # 6th Next Generation Sequencing Conference 12th and 13th August 2014 Dunedin Art Gallery The Octagon, Dunedin, New Zealand # www.illumina.com/ # www.ngsleaders.org/ # www.thermofisher.com/
  • 45. ‫بابت‬ ‫حیمی‬‫ر‬‫دکتر‬‫جناب‬ ‫محترم‬‫استاد‬ ‫از‬ ‫تا‬ ‫دانم‬ ‫می‬ ‫واجب‬ ‫خود‬ ‫بر‬ ‫پایان‬ ‫در‬ ‫نمایم‬ ‫دانی‬‫ر‬‫قد‬ ‫و‬ ‫تشکر‬ ، ‫ایشان‬ ‫از‬ ‫هایم‬ ‫آموخته‬. ‫ن‬ ‫انقدر‬‫ر‬‫گ‬ ‫های‬ ‫ی‬ ‫همکالس‬ ‫حوصله‬ ‫و‬ ‫صبر‬ ‫از‬ ‫دانم‬ ‫می‬ ‫واجب‬ ‫خود‬ ‫بر‬ ‫همچنین‬‫یز‬ ‫باشم‬ ‫داشته‬ ‫خاص‬ ‫ی‬‫تشکر‬. ‫ماندگار‬ ‫و‬ ‫باشید‬‫ـا‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫ن‬‫ـا‬‫ـ‬‫ـ‬‫ـ‬‫م‬ 45