異分野融合型の科学データ公開サイトLink data.org

異分野融合型の科学データ公開サイト
LinkData.org
http://linkdata.org/
（独）理化学研究所下山紗代子, 豊田哲郎
2012/5/24 第3回LinkedData勉強会

RDF公開プラットフォームの必要性

 RDF (Resource Description Framework)
はWeb上でデータを共有するための標準形式

 幅広い分野で活躍する研究者や多くの人々が
RDFでデータを公開していける場が必要

 そのためにLinkDataでは、
誰でも簡単に使えるRDF変換ツールを提供
サーバを持たない人にRDF公開の場を提供
Web上でRDF教育の場を提供
RDFとは何かを分かりやすく学べる
自分のデータに最適なRDFモデルをデザインできる
2012/5/24 第3回LinkedData勉強会 2

データをRDF作品として公開できる

データ簡単に公開！

第3回LinkedData勉強会
2012/5/24 3

3ステップでRDFを公開できる

テーブルデータ RDF形式へ
作成変換

ステップステップステップ

テーブルデータのステップ1で作成した公開されたRDF作品を
ひな形ファイルを作成テーブルデータのダウンロード
ファイルをアップロード

ひな形ファイルに世界中の人が利用し、
あなたのデータを入力あなたの貢献を高く
評価

入力形式は扱いやすいテーブルで

データモデル RDFモデルテーブルモデル

• 人が直感的に理解し
• データ間の関係をリ
やすい
ンクで明確に表現で
メリットきる
• 行単位でテキスト処
理できて簡単に扱え
• webとの相性が良い
る
• データ間の関係を表
• 人がデータ構造の全
すための意味論が不
体像を把握しにくい
明確になりやすい
デメリット
• 扱うには専門知識が
• 機械的に解釈させに
必要
くい

Property Property
モデルの図示 Subject Object
Subject Object


テーブルデータとRDFの対応例

元のテーブ電話番号電話番号
045-111-
中央図書館
ルデータ 1111
中央図書館 045-111-1111

電話番号 045-111-
電話番号蔵書数 1111
列を追加中央図書館
中央図書館 045-111-1111 154,265 154,265
蔵書数

行を追加電話番号 045-111-
電話番号蔵書数 1111
中央図書館
154,265
蔵書数
中央図書館 045-111-1111 154,265
電話番号 045-222-
2222
西区図書館
65,489
西区図書館 045-222-2222 65,489 蔵書数

電話番号 045-333-
3333
南区図書館 045-333-3333 98,548 南区図書館
98,548
2012/5/24 蔵書数 6

異分野融合型プラットフォーム

地域、行政、学術、経済等、様々な分野のデータ
→ サイエンス分野以外にも広がる利用と教育
7

分野融合的であることの重要性

 分野融合的な研究者の交流を促進

 新しい融合研究領域の創造

 科学データを扱う技術を科学以外の分野へと波及

 Linked dataに関する教育効果
 分野を制限せず、好きなデータでRDF技術を学べる


LinkData の機能一覧

1. スキーマ定義の支援機能
2. 標準プロパティのサジェスト機能
3. URIの自動生成機能
4. テーブルとRDFの対比機能
5. RDFへの変換・公開機能
6. データのつながりの可視化機能
7. アプリケーション開発者支援機能


1. スキーマ定義の支援機能

スキーマ定義のGUI
 スキーマ定義（入力データ
のひな形）を簡単に作成で
きる
 すでに公開されているRDF
作品からスキーマ定義を再
利用できる

入力データのひな形
（Excelファイル）


2. 標準プロパティのサジェスト機能

 使用するプロパティをリスト
（全385件）から選択できる
 Dublin Core等の汎用的に用
いられるプロパティに加えて、
OBO (Open Biomedical
Ontologies) 等のライフサイ
エンス分野で用いられるプロ
パティも登録されている


3. URIの自動生成機能

 サブジェクト・プロパティを
URLではなく、文字列で入力す
ることが可能

 アップロード後に自動でLink
DataオリジナルのURIに変換

URIの形式 URIの生成例
s1
http://linkdata.org
subject /resource/ http://linkdata.or
[作品ID]#[文字列] g/resource/
rdf1s1i#s1
p1
http://linkdata.org
property /property/ http://linkdata.or
[作品ID]#[文字列] g/property/
rdf1s1i#p1

4. RDFへの変換・公開機能

 アップロード形式： Excel, Text
 ダウンロード形式： Excel, Text, Turtle
@prefix rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> .
@prefix rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> .
@prefix cc: <http://creativecommons.org/ns#> .
@prefix xsd: <http://www.w3.org/2001/XMLSchema#> .
<>
cc:attributionName "Sayoko_Shimoyama"@ja ;
cc:attributionURL <http://linkdata.org/user/Sayoko_Shimoyama> ;
cc:license <http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/> .

<http://linkdata.org/property/rdf1s1i#phone_number>
rdf:type rdf:Property ;
rdfs:label "phone_number"@ja .

<http://linkdata.org/resource/rdf1s1i#central_library>
<http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#label> "central_library"@ja, "中央図書館"@ja ;
<http://xmlns.com/foaf/0.1/homepage> <http://library.jp/central> ;
<http://linkdata.org/property/rdf1s1i#phone_number> "045-111-1111"@ja .

<http://linkdata.org/resource/rdf1s1i#west_library>
<http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#label> "west_library"@ja, "西区図書館"@ja ;
<http://xmlns.com/foaf/0.1/homepage> <http://lib.com/west> ;

<http://linkdata.org/resource/rdf1s1i#south_library>
<http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#label> "south_library"@ja, "南区図書館"@ja ;
<http://xmlns.com/foaf/0.1/homepage> <http://libraries/city/south> ;


5. テーブルとRDFの対比機能

 W3C RDF Validation Serviceに投
げてグラフモデルで可視化

自分のテーブル
データと対比さ
せることで、
RDFについて理
解を深められる
ようサポート


6. データのつながりの可視化機能

 グリーン： LODクラウドとして可視化
RDF作品

 ブルー：
外部ドメイン

 RDF作品の各ファ
イル中のsubject,
property, object
に使われている
URIのドメインと
つなげている

2012/5/24 15

7. アプリケーション開発者支援機能

 データ取得用APIを提供（LinkData側）

 外部アプリ
（http://fukuno.jig.jp/2012/jp02）


2012年3月：アプリ部門最優秀賞

Linked Open Data チャレンジ Japan 2011


2012年4月：WWW2012に出展

LinkDataブースは大盛況！
5日間で200人を超える訪問者が！

TBL卿が LinkData を評価

Tim-Barners-Lee 卿

LinkDataのシンプル性
に対して ”Excellent!!”
とのお言葉が！

2012/5/24
※ Tim-Barners-Lee 卿はWebの発明者として世界的な権威 19

国際的なネットワーク作りに成功

ローカルオーガナイザー：
LinkDataサイトを翻訳して、
その言語のコンテンツを管
理してくれる協力者

17カ国からローカルオーガナイザーへのオファー
日本を核に国際連携がスタート！！

LinkDataでアプリ開発

LinkDataのデー
Sequence_test タセットと連携し
てアプリを作れる
サイトを構築中

データ連携

2012/5/24 21

公開と利用のサイクルが回る

データからアプリを作る

アプリからデータを作る

LinkDataでゲノム設計

LinkDataのアプリ開発機能
を使って、プログラムでゲ
ノムを設計するコンテスト
「GenoCon」第２回大会を
本年開催予定


異分野のコミュニティを融合

GenoCon community LOD community

Linked Data links Communities!

皆様のご参加をお待ちしております

ご清聴ありがとうございました！

@Link_Data

https://www.facebook.com/LinkData


異分野融合型の科学データ公開サイトLink data.org

Recommended

Recommended

More Related Content

Similar to 異分野融合型の科学データ公開サイトLink data.org

Similar to 異分野融合型の科学データ公開サイトLink data.org (20)

More from Sayoko Shimoyama

More from Sayoko Shimoyama (20)

Recently uploaded

Recently uploaded (9)

異分野融合型の科学データ公開サイトLink data.org