GENÈTICA
MOLECULAR
 DUPLICACIÓ DE L’ADN

 MUTACIONS
“Dogma central de la biologia”
BIOSÍNTESI DE L’ADN

La replicació de l’ADN en
eucariotes es fa en la fase
S del cicle cel·lular i cada
cromosoma es replica a
partir de molts orígens de
replicació (replicons)

La duplicació de l’ADN és un
procés multienzimàtic on les
dues cadenes es separen i es
sintetitzen dues de noves.
En un principi existien tres
hipòtesis de treball:
Replicació conservativa
Replicació dispersativa
Replicació semiconservativa
Experiment de Meselson i Stahl (1957)

Treballant amb marcadors radioactius es va demostrar que la duplicació de l’ADN seguia el
model semiconservatiu

Van cultivar el bacteri Escherichia
coli en un medi amb nitrogen no
radioactiu (isòtop pesant).

Seguidament van transferir els
bacteris a un medi amb nitrogen
lleuger i els van deixar reproduir
una vegada. Llavors van extreure
l’ADN i el van ultracentrifugar

Si es feia el mateix procediment
amb la segona generació (deixant
que es reproduïssin dues vegades
en nitrogen lleuger), apareixien
dues bandes (semipesant i lleuger)

Això demostrà que la replicació era
semiconservativa. Si fos
conservativa, la F1 haurien de
sortir 2 bandes (lleugera i pesant) i
si fos dispersativa hauria de sortir
ADN en tota la franja des de la
banda lleugera fins la pesada
REPLICACIÓ SEMICONSERVATIVA


                              Els estudis es van realitzar
                              primerament sobre
                              procariotes. Posteriorment,
                              es va veure que els resultats
                              observats en procariotes
                              eren molt semblants als
                              observats en eucariotes.

                              Segons aquest model, cada
                              nou fragment d’ADN conté
                              una cadena “original” i una
                              cadena “nova”

                              Per tal que es pugui fer la
                              replicació, les dues cadenes
                              s’han de desenrotllar i obrir,
                              de manera que es formaran
                              bombolles de replicació
La duplicació de l’ADN segueix sempre la mateixa direcció:
ELS ENZIMS QUE DUPLIQUEN l’ADN LLEGEIXEN AQUEST DE L’EXTREM 3’ CAP
A L’EXTREM 5’ PERÒ POSEN ELS NUCLEÒTIDS COMPLEMENTARIS NOUS A
L’INREVÉS, DE L’EXTREM 5’ CAP AL 3’




      De fet, tots els enzims que llegeixen l’ADN ho fan de la mateixa manera:
      llegeixen de l’extrem 3’ cap al 5’ i copien del 5’ cap al 3’
REPLICACIÓ EN PROCARIOTES

Els estudis fets sobre procariotes van demostrar que
la duplicació de l’ADN era semiconservativa (cada
doble cadena està formada per una cadena nova i una
altra original), seqüencial (sense interrupcions) i
bidireccional (sempre en la mateixa direcció: lectura 3’
a 5’ i copia de 5’ a 3’).
REPLICACIÓ SEMICONSERVATIVA
Diferenciem 3 passos:                 (EN EUCARIOTES)
1. Desenrotllament i obertura de la cadena:
        1.1. La cadena perd la seva estructura secundària gràcies a enzims com
        helicases, girases, topoisomerases,etc...
        1.2. Es formen bombolles de replicació. Les cadenes s’han d’obrir (en un únic
        punt en les procariotes però en molts en eucariotes) per poder fer la
        duplicació. Aquestes bombolles s’obren més i donen lloc a les forquetes de
        replicació. D’aquesta manera es permet que els enzims que han de llegir l’ADN
        ho puguin fer
2. Síntesis de les noves cadenes d’ADN
L’enzim encarregat de seleccionar i posar els nucleòtids complementaris és l’ADN
polimerasa. Aquest enzim, però, necessita una petita seqüència de nucleòtids ja feta
(“primer”),sintetitzat per una primasa. El primer és una petita seqüència de nucleòtids
d’ARN complementaria a la cadena d’ADN i que serveix com a base per a que l’ADN
polimerasa pugui realitzar la seva funció. Més endavant, aquest primer s’hidrolitzarà per
acció d’una nucleasa i els nucleòtids seran substituïts per nucleòtids d’ADN
Mentre l’ADN polimerasa posa nucleòtids, la forqueta de replicació es desplaça en la
mateixa direcció que la duplicació (de l’extrem 3’ cap al 5’). Això fa que mentre una de
les dues cadenes es sintetitza de manera continua, l’altra no es pot sintetitzar
(la cadena orientada de 5’ a 3’)
Davant d’aquest problema el 1968 Reiji Okazaki proposà que la cadena 5’ a 3’ es duplicava
 “a salts”. Aquests salts feien aparèixer fragments nous d’ADN denominats fragments
 d’Okazaki
 A mesura que la forqueta de replicació avança, la cadena 5’ a 3’ resta sense duplicar.
 Quant aquesta part es prou llarga, es sintetitza un primer en sentit contrari a l’obertura
 de la forqueta de manera que una ADN polimerasa pot duplicar el fragment. Com que el
 procés és continu (obertura de la forqueta i duplicació), a mesura que la forqueta de
 duplicació avança es creen noves parts que es duplicaran “a salts”


A mesura que el procés
avança, els primers són
hidrolitzats per les
nucleases i substituïts
per nucleòtids d’ADN.
Més endavant, els
fragments s’uneixen
gràcies a ligases


 Distingim llavors entre
 la cadena continua i la
 cadena retardada
La replicació de l’ADN lineal (com la dels cromosomes eucariòtics)
planteja un problema amb els extrems de l’ADN.
En cada replicació queda un encebador de ARN en l’extrem del
filament retardat que no pot ser substituït per nucleòtids d’ADN,
ja que l’ADN polimerasa necessita un encebador, i no hi ha lloc per
sintetitzar-lo (“la cadena s’ha acabat”)


Com a resultat d’això, cada replicació faria que l’ADN s’anés
escurçant.

En els cromosomes eucariòtics aquest problema es presenta en
els extrems, els anomenats telòmers.
En els telòmers la seqüència de bases és especial i està
controlada per l’activitat d’un enzim anomenat telomerasa, que
afegeix els nucleòtids d’ADN que falten
3. Correcció d’errors
Els errors que es corregeixen són errors d’aparellaments entre bases.

  Existeixen dos mecanismes de correcció.

        El primer mecanisme es troba en la pròpia ADN polimerasa. Aquest enzim pot
        actuar com a exonucleasa, reconeixent els errors que pot fer durant la
        duplicació. L’ADN polimerasa, abans de posar un nou nucleòtid, comprova si el
        nucleòtid anterior és correcte, rectificant-lo si és necessari.

        Tot i així, hi ha errors. Aproximadament la freqüència d’errors és
        de.... 1/10·106 bases.............És molt ???

       Complexes multienzimàtics:. Un cop sintetitzada un fragment d’ADN, aquests
       complexes recorren les noves cadenes detectant els errors d’aparellament i
       corregint-los
                              I com es reconeixen les bases que són errònies???


        ...I Tot i així, encara hi ha errors. Menys que abans, això si !!
        El sistema no és infalible!! (Això és bo ????)
        La freqüència d’errors baixa fins a.... 1/10 000·106 bases
COMPARACIÓ DE LA REPLICACIÓ ENTRE
             PROCARIOTES I EUCARIOTES



       PROCARIOTES                                 EUCARIOTES
L’ADN no està enrotllat formant            L’ADN està enrotllat i forma
nucleosomes i per tant no necessita        nucleosomes per la qual cosa s’ha de
desenrotllar-se per ser llegit             desenrrotllar
                                           Hi ha moltes bombolles de replicació
Només hi ha una bombolla de replicació
                                           (replicons) (a Drosophila hi ha 3 500)
Els fragments d’Okazaki tenen de 1 000 a   Els fragments tenen entre 100 i 200
2 000 nucleòtids                           nucleòtids

Hi ha 3 ADN polimerases                    Hi ha 5 ADN polimerases

Tema 14 duplicacio adn

  • 1.
  • 2.
    “Dogma central dela biologia”
  • 3.
    BIOSÍNTESI DE L’ADN Lareplicació de l’ADN en eucariotes es fa en la fase S del cicle cel·lular i cada cromosoma es replica a partir de molts orígens de replicació (replicons) La duplicació de l’ADN és un procés multienzimàtic on les dues cadenes es separen i es sintetitzen dues de noves. En un principi existien tres hipòtesis de treball: Replicació conservativa Replicació dispersativa Replicació semiconservativa
  • 4.
    Experiment de Meselsoni Stahl (1957) Treballant amb marcadors radioactius es va demostrar que la duplicació de l’ADN seguia el model semiconservatiu Van cultivar el bacteri Escherichia coli en un medi amb nitrogen no radioactiu (isòtop pesant). Seguidament van transferir els bacteris a un medi amb nitrogen lleuger i els van deixar reproduir una vegada. Llavors van extreure l’ADN i el van ultracentrifugar Si es feia el mateix procediment amb la segona generació (deixant que es reproduïssin dues vegades en nitrogen lleuger), apareixien dues bandes (semipesant i lleuger) Això demostrà que la replicació era semiconservativa. Si fos conservativa, la F1 haurien de sortir 2 bandes (lleugera i pesant) i si fos dispersativa hauria de sortir ADN en tota la franja des de la banda lleugera fins la pesada
  • 5.
    REPLICACIÓ SEMICONSERVATIVA Els estudis es van realitzar primerament sobre procariotes. Posteriorment, es va veure que els resultats observats en procariotes eren molt semblants als observats en eucariotes. Segons aquest model, cada nou fragment d’ADN conté una cadena “original” i una cadena “nova” Per tal que es pugui fer la replicació, les dues cadenes s’han de desenrotllar i obrir, de manera que es formaran bombolles de replicació
  • 6.
    La duplicació del’ADN segueix sempre la mateixa direcció: ELS ENZIMS QUE DUPLIQUEN l’ADN LLEGEIXEN AQUEST DE L’EXTREM 3’ CAP A L’EXTREM 5’ PERÒ POSEN ELS NUCLEÒTIDS COMPLEMENTARIS NOUS A L’INREVÉS, DE L’EXTREM 5’ CAP AL 3’ De fet, tots els enzims que llegeixen l’ADN ho fan de la mateixa manera: llegeixen de l’extrem 3’ cap al 5’ i copien del 5’ cap al 3’
  • 7.
    REPLICACIÓ EN PROCARIOTES Elsestudis fets sobre procariotes van demostrar que la duplicació de l’ADN era semiconservativa (cada doble cadena està formada per una cadena nova i una altra original), seqüencial (sense interrupcions) i bidireccional (sempre en la mateixa direcció: lectura 3’ a 5’ i copia de 5’ a 3’).
  • 8.
    REPLICACIÓ SEMICONSERVATIVA Diferenciem 3passos: (EN EUCARIOTES) 1. Desenrotllament i obertura de la cadena: 1.1. La cadena perd la seva estructura secundària gràcies a enzims com helicases, girases, topoisomerases,etc... 1.2. Es formen bombolles de replicació. Les cadenes s’han d’obrir (en un únic punt en les procariotes però en molts en eucariotes) per poder fer la duplicació. Aquestes bombolles s’obren més i donen lloc a les forquetes de replicació. D’aquesta manera es permet que els enzims que han de llegir l’ADN ho puguin fer
  • 9.
    2. Síntesis deles noves cadenes d’ADN L’enzim encarregat de seleccionar i posar els nucleòtids complementaris és l’ADN polimerasa. Aquest enzim, però, necessita una petita seqüència de nucleòtids ja feta (“primer”),sintetitzat per una primasa. El primer és una petita seqüència de nucleòtids d’ARN complementaria a la cadena d’ADN i que serveix com a base per a que l’ADN polimerasa pugui realitzar la seva funció. Més endavant, aquest primer s’hidrolitzarà per acció d’una nucleasa i els nucleòtids seran substituïts per nucleòtids d’ADN
  • 10.
    Mentre l’ADN polimerasaposa nucleòtids, la forqueta de replicació es desplaça en la mateixa direcció que la duplicació (de l’extrem 3’ cap al 5’). Això fa que mentre una de les dues cadenes es sintetitza de manera continua, l’altra no es pot sintetitzar (la cadena orientada de 5’ a 3’)
  • 11.
    Davant d’aquest problemael 1968 Reiji Okazaki proposà que la cadena 5’ a 3’ es duplicava “a salts”. Aquests salts feien aparèixer fragments nous d’ADN denominats fragments d’Okazaki A mesura que la forqueta de replicació avança, la cadena 5’ a 3’ resta sense duplicar. Quant aquesta part es prou llarga, es sintetitza un primer en sentit contrari a l’obertura de la forqueta de manera que una ADN polimerasa pot duplicar el fragment. Com que el procés és continu (obertura de la forqueta i duplicació), a mesura que la forqueta de duplicació avança es creen noves parts que es duplicaran “a salts” A mesura que el procés avança, els primers són hidrolitzats per les nucleases i substituïts per nucleòtids d’ADN. Més endavant, els fragments s’uneixen gràcies a ligases Distingim llavors entre la cadena continua i la cadena retardada
  • 13.
    La replicació del’ADN lineal (com la dels cromosomes eucariòtics) planteja un problema amb els extrems de l’ADN. En cada replicació queda un encebador de ARN en l’extrem del filament retardat que no pot ser substituït per nucleòtids d’ADN, ja que l’ADN polimerasa necessita un encebador, i no hi ha lloc per sintetitzar-lo (“la cadena s’ha acabat”) Com a resultat d’això, cada replicació faria que l’ADN s’anés escurçant. En els cromosomes eucariòtics aquest problema es presenta en els extrems, els anomenats telòmers. En els telòmers la seqüència de bases és especial i està controlada per l’activitat d’un enzim anomenat telomerasa, que afegeix els nucleòtids d’ADN que falten
  • 14.
    3. Correcció d’errors Elserrors que es corregeixen són errors d’aparellaments entre bases. Existeixen dos mecanismes de correcció. El primer mecanisme es troba en la pròpia ADN polimerasa. Aquest enzim pot actuar com a exonucleasa, reconeixent els errors que pot fer durant la duplicació. L’ADN polimerasa, abans de posar un nou nucleòtid, comprova si el nucleòtid anterior és correcte, rectificant-lo si és necessari. Tot i així, hi ha errors. Aproximadament la freqüència d’errors és de.... 1/10·106 bases.............És molt ??? Complexes multienzimàtics:. Un cop sintetitzada un fragment d’ADN, aquests complexes recorren les noves cadenes detectant els errors d’aparellament i corregint-los I com es reconeixen les bases que són errònies??? ...I Tot i així, encara hi ha errors. Menys que abans, això si !! El sistema no és infalible!! (Això és bo ????) La freqüència d’errors baixa fins a.... 1/10 000·106 bases
  • 15.
    COMPARACIÓ DE LAREPLICACIÓ ENTRE PROCARIOTES I EUCARIOTES PROCARIOTES EUCARIOTES L’ADN no està enrotllat formant L’ADN està enrotllat i forma nucleosomes i per tant no necessita nucleosomes per la qual cosa s’ha de desenrotllar-se per ser llegit desenrrotllar Hi ha moltes bombolles de replicació Només hi ha una bombolla de replicació (replicons) (a Drosophila hi ha 3 500) Els fragments d’Okazaki tenen de 1 000 a Els fragments tenen entre 100 i 200 2 000 nucleòtids nucleòtids Hi ha 3 ADN polimerases Hi ha 5 ADN polimerases