SlideShare a Scribd company logo
1 of 10
Download to read offline
66 “Оптический журнал”, 78, 1, 2011
ЦИФРОВАЯ МИКРОСКОПИЯ,
ОБРАБОТКА ИЗОБРАЖЕНИЙ
Введение
В настоящее время основные производите-
ли поставляют на рынок комплексы микро-
скопии с моторизованными элементами и с
программным обеспечением, автоматизирую-
щим рутинные операции микроскопии, такие
как производство цифровых копий препарата
(виртуальные слайды), автофокус, съемка поля
зрения в различных режимах и т. п. Ряд фирм
производит оборудование моторизации для
дооснащения обычных микроскопов, широко
представлено ПО анализа изображений различ-
ной природы. Современный уровень развития
автоматизации и информатизации микроско-
пии создает все условия для включения в состав
микроскопа последнего интеллектуального эле-
мента – программы автоматического анализа с
определением заданных параметров препара-
та – превращающего комплекс автоматизиро-
ванный микроскопии (КАМ) в автоматический
анализатор. Тем не менее, если говорить о био-
материалах и особенно об анализах медицин-
ского класса, создание успешных автоматиче-
ских микроскопических анализаторов (АМА)
все еще относится к категории единичных слу-
чаев. Причины этого связаны с методическими
трудностями разработки и испытаний АМА.
Из-за высокой изменчивости свойства объектов
анализа описываются в качественных терми-
нах, что заставляет оценивать АМА в аналогич-
ных терминах как роботизированное устрой-
ство. Необходимая для разработки и испытаний
модель внешней среды, основанная на фиксиро-
ванной выборке реальных препаратов, проана-
лизированных врачами, оказывается весьма
дорогостоящей и фактически непредставитель-
ной из-за огромного разнообразия вариантов
пробоподготовки и патологий, влияющих на
свойства объектов анализа. В результате ком-
плекс, созданный с использованием такой огра-
ниченной модели, может быть неэффективен в
отличающихся условиях множества реальных
контингентов больных и лабораторий. В статье
УДК 681.3.01
РАЗРАБОТКА И ИСПЫТАНИЕ
АВТОМАТИЗИРОВАННОГО КОМПЛЕКСА МИКРОСКОПИИ
© 2011 г. В. C. Медовый, доктор техн. наук; А. М. Пятницкий, канд. физ.-мат. наук;
Б. З. Соколинский, канд. мед. наук; В. В. Маркеллов; Д. С. Федорова; И. В. Федоров
ЗАО “Медицинские компьютерные системы (МЕКОС)”, Москва
E-mail: medovyy@mecos.ru
Высокая вариабельность препаратов и объектов анализа создает проблемы как
для формирования как представительной модели внешней среды, так и устойчивых
алгоритмов автоматического микроскопического анализа биоматериалов. При раз-
работке и сопровождении анализатора МЕКОС-Ц2 для пополнения модели внешней
среды использована технология формируемых при участии потребителей референсных
виртуальных слайдов, поступающих в процессе эксплуатации из лабораторий в сервис-
ный центр. Настроенная на применение виртуальных слайдов структура МЕКОС-Ц2
позволяет в значительной степени автоматизировать разработку новых версий про-
граммного обеспечения с учетом новых данных о внешней среде. Другим ключевым
принципомразработкиявляетсяиспользованиеробастных,адаптирующихсякданному
препарату, алгоритмов анализа. Сочетание указанных принципов позволило создать
автоматический анализатор МЕКОС-Ц2 медицинского класса, пригодный для анализа
мазков крови в рядовой лаборатории.
Ключевые слова: цифровая микроскопия, виртуальные слайды, автоматический
микроскопический анализатор, обработка изображений.
Коды OCIS: 100.0100, 180.0180, 170.0170
Поступила в редакцию 04.05.2010
67“Оптический журнал”, 78, 1, 2011
представлена уточненная (по сравнению с [1])
методика разработки и медицинских испыта-
ний АМА с применением виртуальных слайдов,
превращающая процесс эксплуатации в процесс
развития МЕКОС-Ц2. Указанная кооперация
потребителей и разработчиков представляет-
ся новым шагом в развитии роботизированных
комплексов микроскопии. Даны некоторые де-
тали алгоритмов АМА МЕКОС-Ц2, обеспечива-
ющие робастность и адаптацию к конкретному
препарату в условиях априорной неопределен-
ности его свойств.
1. Проблемы
медицинских испытаний АМА
В состав комплекса МЕКОС-Ц2 [2], как и в
состав любого АМА, входят: моторизованный
микроскоп, видеокамера, компьютер и про-
граммное обеспечение. Возможны различные
комплектации оборудования и ПО, обеспечи-
вающие различный состав анализов, уровень
автоматизации, производительности и стоимо-
сти. Одним из наиболее автоматизированных
приложений МЕКОС-Ц2 является анализ маз-
ков крови, включая сбор выборки и сортировку
лейкоцитов, эритроцитов, тромбоцитов, рети-
кулоцитов.
В процессе разработки и испытаний ПО
МЕКОС-Ц2 мы столкнулись с трудностями
сбора представительной выборки препаратов.
Такая выборка должна включать многие сотни
примеров различных патологий, возрастных
групп, различных модификаций пробоподго-
товки. Например, цвет и форма лейкоцитов и
эритроцитов в препаратах с различными пато-
логиями могут значительно изменяться в одних
и тех же условиях пробоподготовки. Обычная
схема медицинских испытаний АМА состоит в
проведении испытаний в небольшом числе ме-
дицинских учреждений в течение ограничен-
ного времени [3]. Такие испытания являются
весьма затратными, поскольку в соответствии
с существующим стандартом испытаний [4]
в качестве референсной методики используется
ручная микроскопия, выполняемая опытными
врачами. Характер референсной методики свя-
зан с качественными определениями объектов
анализа. Трудности сбора коллекции слайдов,
особенно с представительным составом редких
объектов, и высокая трудоемкость ручной ми-
кроскопии ограничивают реально достижимую
представительность базы испытаний. Каждая
новая версия программ (их может быть несколь-
ко в год) требует, вообще говоря, новой полно-
ценной проверки.
Вместе с тем современные информационные
технологии автоматизированной микроскопии,
предназначенные для задач визуального анали-
за биоматериалов, могли бы быть использованы
при проведении медицинских испытаний авто-
матического анализатора. Одной из таких тех-
нологий является технология использования
“виртуальных слайдов” (ВС).
Автоматически формируемый КАМ вирту-
альный слайд – это “черепичное” панорамное,
сфокусированное поле зрения прямоугольной
формы, состоящее из множества соседних, ча-
стично перекрывающихся первичных полей
зрения видеокамеры без потери информации на
стыках. ВС площадью до нескольких кв. см. мо-
жет быть просмотрен на удаленном компьютере
с имитацией любого увеличения. ВС широко
применяются в телемедицине [5]. Врач имеет
возможность получить аналогичные результа-
ты анализа, используя микроскопию реального
препарата через окуляры, либо наблюдая ВС на
экране компьютера.
2. Применение информационных
технологий в методике испытаний
МЕКОС-Ц2
МЕКОС-Ц2 располагает группой функций
для локального анализа препарата и группой
функций для удаленного доступа к препаратам
и результатам их анализа. Вторая группа яв-
ляется группой средств телемедицины, форми-
рующей ВС. Первоначально ВС использовались
нами в составе средств контроля МЕКОС-Ц2
для оценки службой сервиса правильности ра-
боты изделия в конкретной ситуации. Если бы
результаты тестирования содержали также
результаты визуального анализа ВС (или визу-
альные оценки качества автоматического ана-
лиза), сделанные потребителем – квалифици-
рованным врачом-экспертом, мы получили бы
возможность дистанционно собирать и базу дан-
ных медицинских испытаний автоматического
анализатора. Результаты визуального анализа
ВС, сделанного потребителем, рассматривают-
ся в этих условиях как консультация по каче-
ству автоматического анализатора. Были раз-
работаны специальные диалоговые средства
поддержки производства таких “референсных”
ВС (РВС). Эти средства ускоряют формирова-
ние врачом результатов визуального анализа
за счет использования результатов автоматиче-
68 “Оптический журнал”, 78, 1, 2011
ского анализа в качестве подсказок, при этом
время создания РВС становится сравнимым со
временем прямого микроскопического анализа.
Сеанс производства РВС может рассматривать-
ся как рутинный этап контроля качества анали-
затора в лаборатории.
В настоящее время группа функций удален-
ного доступа поддерживает два потока рефе-
ренсных сообщений. Первый поток является
потоком телепатологии: ВС из удаленной лабо-
ратории, оснащенной комплексом МЕКОС-Ц2,
поступает в консультационный центр, в ко-
тором эксперт анализирует ВС на своем ком-
пьютере, делает референсные диагностические
оценки ВС, то есть прямо или косвенно фор-
мирует РВС, и отправляет РВС в качестве кон-
сультации обратно в периферийную лаборато-
рию. Второй поток РВС поступает в обратном
направлении: ВС из удаленной лаборатории,
оснащенной комплексом МЕКОС-Ц2, поступает
в центральную референсную лабораторию или
в сервисный центр МЕКОС вместе с оценками
автоматического анализа (или с результатами
визуального анализа), сделанными местным
врачом. Центральные учреждения могут ис-
пользовать такие РВС для создания представи-
тельных архивов препаратов по определенным
типам патологий, для аттестации местных вра-
чей или для создания представительной базы
данных медицинских испытаний автоматиче-
ской методики анализа. Рассмотренный подход
позволяет выполнять испытания не только в
ограниченном числе медицинских учреждений
в специальный период времени, но и на посто-
янной основе во время эксплуатации во мно-
гих учреждениях с использованием различных
условий пробоподготовки и различных контин-
гентов больных. Аналогичная технология мо-
жет применяться при разработке и испытани-
ях других типов автоматических анализаторов
изображений.
3. Соответствие структуры
МЕКОС-Ц2 технологии РВС
Эффективность применения РВС в процессе
разработки и испытаний зависит от структу-
ры АМА. Помимо информационного аспекта,
связанного с созданием электронного архива
реалистичных моделей внешней среды, приме-
нение РВС может дать значительный дополни-
тельный эффект, если методику автоматическо-
го анализа разбить на последовательные этапы,
каждый из которых соответствует естествен-
ной, с точки зрения врача, задаче микроскопи-
ческого анализа. Если при этом на каждом эта-
пе комплекс автоматически формирует выход-
ной ВС, отвечающий специфике задачи этапа,
то качество решения автоматическим анализа-
тором задачи каждого этапа может быть оцене-
но с помощью соответствующей данному этапу
представительной выборки РВС. Введение эта-
пов приводит к необходимости обеспечить каче-
ство работы каждого этапа на уровне, не усту-
пающем качеству выполнения аналогичной
функции врачом. Это означает, что различия
в результатах автоматического и визуального
анализа должны находиться в пределах стати-
стической ошибки, связанной только с объе-
мом выборки объектов анализа. Если каждому
этапу соответствует своя подсистема ПО АМА,
то благодаря этапности при разработке новых
версий появляется возможность не проводить
дорогостоящие повторные испытания ранее ат-
тестованных (испытанных с положительным
результатом) подсистем.
Большинство известных методик медицин-
ского микроскопического анализа может быть
представлено в качестве последовательности
выполнения следующих этапов:
формирование изображения поля зрения;–
навигация (реализация маршрута просмо-–
тра препарата);
сбор выборки объектов анализа;–
контроль качества приготовления препа-–
рата;
сортировка объектов анализа с использо-–
ванием качественных критериев;
количественные измерения отдельных–
объектов анализа и выборки в целом.
В ряде методик некоторые из указанных
этапов могут отсутствовать или выполняться
параллельно. В последнем случае необходимо
применение одного и того же типа РВС для от-
ражения и оценки результатов работы всех па-
раллельных процессов.
В соответствии со сказанным ПО МЕКОС-Ц2
разработано как функционирующая в общей
среде группа из шести подсистем: виртуальный
микроскоп; навигация; сбор выборки; контроль
качества; сортировка; измерение (рис. 1, 2).
Подсистемы для каждого конкретного типа
анализа располагают специализированными
модулями и настройками, но во всех случаях
аттестуются в указанном порядке. Исключение
составляет подсистема измерений, которая в
связи с трудоемкостью и неточностью ручных
измерений испытывается с применением спе-
69“Оптический журнал”, 78, 1, 2011
циальных эталонов и фактически не участвует
в медицинских испытаниях (аттестуется на эта-
пе технических испытаний).
4. ВС, РВС и испытания подсистем
4.1. Подсистема
“виртуальный микроскоп (ПВМ)”
Подсистема предназначена для формиро-
вания виртуальных слайдов, то есть для пере-
мещения процесса микроскопии на экран ком-
пьютера, как в реальном времени, так и через
базу данных. Качество подсистемы зависит от
ее эргономики, разрешения изображений, ско-
рости, контроля условий наблюдения. Подси-
стема управляет моторизованным микроскопом
(объективы, освещение, фильтры, скорость и
величина перемещений) и видеокамерой (экс-
позиция, форматы). ПВМ использует стандарт-
ные алгоритмы автофокуса или мультифокуса,
стандартные траектории для формирования
прямоугольных ВС с применением стандартной
технологии “черепицы” [5]. Текущим полем
зрения при просмотре ВС является прямоуголь-
ный фрагмент ВС, соответствующий окну про-
смотра на экране монитора. На максимальном
разрешении максимально возможный размер
окна соответствует вписанному в поле зрения
микроскопа прямоугольнику. Могут форми-
роваться и “линейные” ВС, соответствующие
только одному вертикальному или горизонталь-
ному ряду соседних полей зрения микроскопа.
Линейные ВС (ЛВС) могут использоваться под-
системой навигации в качестве фрагментов при
формировании нестандартного ВС более слож-
ной формы, учитывающей распределение био-
материала по площади препарата.
Современный уровень оборудования и стан-
дартных программных решений позволяет по-
лучить на экране компьютера приемлемое по
качеству изображение, не уступающее изобра-
жению в окулярах микроскопа. Ряд стандарт-
ных автоматических функций виртуальной
микроскопии (автофокус, мультифокус, непре-
рывное масштабирование, проекции) создают
дополнительные возможности, улучшающие
визуальный анализ. Фактически качество ПВМ
зависит от правильности выбора комплекта
оборудования КАМ и от правильности выбора
настроек оборудования для конкретного вида
анализа. Поэтому медицинские испытания
ПВМ могут выполняться как нетрудоемкие
рутинные проверки, не требующие статистиче-
ских оценок и значительных выборок препара-
тов. Например, для методики автоматической
сортировки лейкоцитов мазка крови проверка
ПВМ может выполняться с использованием
нескольких аттестованных по качеству приго-
товления мазков лейкозной крови, как содер-
жащих наиболее сложные объекты. Критерием
применимости ПВМ может являться 100% ви-
зуальная различимость морфологических осо-
бенностей всех представленных в ВС клеток.
Отдельно должно проверяться качество линей-
ных ВС, включая проверку качества стыков
соседних ЛВС. Полноценные референсные ВС
в случае ПВМ не используются.
4.2. Подсистема навигации (ПН)
Задачей ПН является автоматическое фор-
мирование специфических для данного типа
препарата маршрутов просмотра с выбором об-
ластей препарата, способных содержать пред-
ставительную выборку объектов анализа. В слу-
чае мазков крови это области с определенной
толщиной слоя эритроцитов и с их определен-
ным положением относительно границ мазка.
ПН формирует маршрут, анализируя изобра-
жение в текущем окне и используя технику
формирования линейных ВС. В частности, ре-
шение присоединить текущее поле зрения к те-
кущему ЛВС, то есть удлинить текущий ЛВС,
или начать новый ЛВС в другом направлении,
специализированный модуль ПН для анализа
мазка крови принимает на основе измерений
толщины слоя эритроцитов вдоль пройденного
маршрута [6]. В результате форма автомати-
чески формируемого выходного ВС подсистемы
навигации (ВСПН) для неравномерного маз-
ка может значительно отличаться от прямо-
угольной, адаптируясь к распределению слоя
эритроцитов в мазке (рис. 3). Если условием
окончания просмотра является сбор выборки
объектов анализа заданного объема (напри-
мер, сбор 100–200 клеток для определения
лейкоцитарной формулы), то подсистемы на-
вигации и сбора выборки должны работать па-
раллельно, с передачей в ПН данных о текущем
размере выборки. В этом случае в качестве вы-
ходного ВС используется один и тот же слайд
ВСПН обеими подсистемами навигации и сбора
выборки.
В соответствии с имеющимися инструкция-
ми [7] траектория скрининга препарата долж-
на формироваться и оцениваться на макро- и
микроуровне. Поэтому результат работы ПН
Рис. 1. Архитектура МЕКОС-Ц2: структура вложенных функциональных оболочек – этапов анализа;
фиксация виртуальных слайдов для контроля качества автоматических функций потребителем с
помощью РВС.
Рис. 2. Испытания оболочек на базе представительных выборок РВС.
Рис. 3. Окно живого видео и
траектория скрининга мазка крови
(справа) подсистемы навигации
МЕКОС-Ц2.
Рис. 4. Окно формирования рефе-
ренсного виртуального слайда под-
системы сбора выборки.
Рис. 5. Окна просмотра и контроля галерей подсистемы сортировки.
70 “Оптический журнал”, 78, 1, 2011
дополнительно к ВСПН (микроуровень) пред-
ставлен также отдельным изображением тра-
ектории автоматического просмотра препарата
(ТПН). Масштаб ТПН (траектория показана на
рис. 3 справа) соответствует макроуровню (т. е.
без увеличения в микроскопе). Кроме формы
области просмотра ТВСПН содержит также
карту толщины препарата в области просмо-
тра. Врач оценивает форму, размеры и толщину
слоя биоматериала области просмотра, исполь-
зуя представленную в окне просмотра шкалу.
Отметим, что при ручной микроскопии пра-
вильность траектории просмотра практически
не контролируется, хотя, как известно, непра-
вильный выбор траектории может привести к
ошибочным результатам подсчета лейкоцитар-
ной формулы [7].
Траектория считается “правильной”, если
она признается таковой как самой подсистемой
ПН, так и врачом, который визуально оценива-
ет форму ТПН, представленной в результатах
анализа. ПН может автоматически оценивать
качество сформированной траектории по ее то-
пологии и по гистограмме распределения тол-
щины слоя биоматериала вдоль траектории.
Оценки траектории дописываются в ВСПН,
образуя РВСПН. Отметим, что “неправильная
траектория” может быть сформирована не толь-
ко из-за ошибочной работы подсистемы нави-
гации, но и из-за неудовлетворительного каче-
ства препарата (например, отсутствие тонкого
слоя). Качество препарата оценивается врачом
по ВСПН, если ПН удается собрать заданную
выборку объектов анализа. В противном случае
считается, что ПН отказывается от обслужива-
ния препарата. Критерием применимости ПН
является близкий к нулю уровень “ложнопра-
вильных” траекторий при скрининге принятых
ПН к обслуживанию препаратов (таких, что
референсной оценкой является “неправильная
траектория” и “нормальное” качество препара-
та). В случаях отказа ПН от обслуживания не-
обходима дополнительная ручная микроскопия
или формирование стандартного прямоугольно-
го ВС для выявления истинного качества пре-
парата экспертом. Приемлемым можно считать
уровень до 5% отказов ПН на нормальных по
качеству препаратах.
4.3. Подсистема сбора выборки (ПСВ)
Задачей ПСВ является обнаружение в вы-
ходном виртуальном слайде подсистемы на-
вигации объектов заданных типов и подсчет
текущего объема собранной выборки. Выход-
ным автоматически формируемым ВС подси-
стемы сбора выборки (ВСПСВ) является ВСпн,
дополненный отметками автоматического об-
наружения (рис. 4), а также галерея портретов
(прямоугольных фрагментов, содержащих изо-
бражения объектов) обнаруженных объектов
(ВСГАЛ), объем которой обычно на несколько
порядков меньше объема ВСпн.
Референсная оценка пропусков (“ложно-
отрицательных”) и ложных обнаружений
(“ложноположительных”) выполняется при
просмотре врачом ВСПН с помощью специ-
альной программы, которая облегчает работу,
выделяя на изображении автоматически об-
наруженные объекты. Врач может согласить-
ся с подсказкой (объект остается в РВСПСВ
и РВСГАЛ), отвергнуть ее (вычеркивается из
РВСПСВ и РВСГАЛ) или выделить на экра-
не с помощью диалоговых средств объект, не
обнаруженный автоматически (добавляется
в РВСПСВ и РВСГАЛ).
Критерием применимости ПСВ являются
проценты пропусков и ложных обнаружений,
которые должны быть не хуже заданных. Для
разных типов клеток могут быть заданы разные
требуемые вероятности пропусков в зависимо-
сти от средних концентраций и видов анализа.
В частности, при анализе лейкоцитов могут
быть заданы разные вероятности пропуска нор-
мальных, юных и патологических форм. Мазок
крови обычно содержит значительно больше
клеток (более чем в 10 раз), чем требуется для
подсчета формулы нормальных типов лейко-
цитов. Поэтому при этом анализе требуемые
вероятности пропусков могут быть не слишком
жесткими (в соответствии с моделью Пуассона
для редких событий вероятность пропуска мо-
жет быть снижена за счет увеличения области
просмотра). Это достигается автоматически при
использовании фиксированного размера фак-
тически собираемой выборки. Однако при зна-
чительном количестве пропусков (более 1%)
следует убедиться в том, что объекты различ-
ных типов пропускаются с одинаковой вероят-
ностью.
Доля ложных обнаружений имеет значение
при автоматизированном режиме эксплуата-
ции, когда врач имеет возможность откорректи-
ровать результаты автоматической сортировки
(см. ниже). Для существенного повышения про-
изводительности труда по сравнению с ручной
микроскопией эта доля не должна превышать
10–20%.
71“Оптический журнал”, 78, 1, 2011
4.4. Подсистема контроля качества
препарата (ПКК)
Референсная оценка качества препарата,
предназначенная для сравнения с оценкой ка-
чества, автоматически сформированной под-
системой контроля качества (ПКК), может вы-
полняться при просмотре врачом виртуального
слайда подсистемы навигации. Соответствую-
щие оценки врача с помощью средств ПКК до-
писываются в ВСПН, формируя РВСПКК.
В МЕКОС-Ц2 модули ПКК и ПСВ, предназна-
ченные для автоматического анализатора маз-
ков крови, работают как единое целое, поэтому
автоматические и референсные оценки качества
препарата представлены в ВС и РВС подсисте-
мы сбора выборки. Оцениваются доли “ложно-
качественных” (автоматическая оценка – нор-
мальное качество, референсная оценка – ненор-
мальное качество) и “ложнонекачественных”
препаратов (автоматическая оценка – ненор-
мальное качество, референсная оценка – нор-
мальное качество). В связи с расплывчатостью
существующих рекомендаций по требуемому
качеству препаратов результаты испытаний
данной подсистемы носят справочный харак-
тер. Доля ложноотрицательных препаратов,
как и доля ложноотрицательных траекторий,
характеризует процент препаратов, ошибочно
взятых системой на обслуживание. Суммарно
эти доли не должны превышать 10–15%, чтобы
не увеличивать существенно долю отказов от об-
служивания. Фактически ПКК предназначена
для обеспечения заданных характеристик ПСВ
и может предъявлять более жесткие требования
к качеству препарата, чем это обычно делается
при ручной микроскопии. Результаты данного
тестирования могут помочь сотрудникам лабо-
ратории добиться более высокой эффективно-
сти работы автоматической методики за счет
улучшения качества пробоподготовки.
4.5. Подсистема сортировки (ПС)
Результаты автоматической сортировки объ-
ектов, находящихся в галерее ВСгал, представ-
лены галереями ВСсорт изображений клеток
каждого типа, а также галереей изображений
автоматически обнаруженных объектов, не от-
несенных подсистемой сортировки (ПС) ни к
одному из заданных типов (рис. 5). В связи с
тем, что этап испытаний данной подсистемы
возможен только при условии удовлетвори-
тельной работы подсистемы сбора выборки, то
есть при достижении заданных вероятностей
правильности сбора выборки, референсная со-
ртировка может выполняться интерактивным
перераспределением врачом изображений кле-
ток галерей. Подсистема сортировки таким
образом становится единственной подсисте-
мой, которую необходимо оценивать в полном
объеме стандарта медицинских испытаний [4].
Оцениваются доли ложноположительных, лож-
ноотрицательных анализов, а также чувстви-
тельность и специфичность ПС. Отметим, что в
стандарте [4] ничего не говорится о требуемых
значениях оценок результатов испытаний. Эти
значения могут быть различны для разных ре-
жимов эксплуатации КАМ. В полностью ав-
томатическом режиме выполнения анализа
необходимы высокие характеристики работы
ПС. В автоматизированном режиме “support”,
аналогичном режиму референсной проверки
подсистемы сортировки, точность автоматиче-
ской сортировки может быть существенно ниже
чем при ручной микроскопии, более того, оцен-
ки ошибок сортировки по типам могут быть
заменены оценкой среднего процента правок
врачом всех галерей сортировки. Приемлемым
с точки зрения трудозатрат врача по сравне-
нию с ручной микроскопией является процент
правок до 10%. В настоящее время основным
режимом работы комплексов МЕКОС-Ц2 яв-
ляется режим “support”. Накапливая в этом
режиме архив РВСсорт, мы получаем возмож-
ность разрабатывать новые версии ПС, при-
ближающие ее характеристики к необходимым
характеристикам полностью автоматического
анализатора. Отметим, что достижение высо-
ких характеристик ПС является весьма важной
задачей, при решении которой высококвали-
фицированный врач может быть полностью ис-
ключен из процесса анализа основного потока
препаратов.
5. Трудоемкость поэтапной схемы
медицинских испытаний
Как было отмечено выше, объем испытаний
подсистемы виртуального микроскопа может
быть однократным и ограниченным ввиду стан-
дартного характера его средств. Основные тру-
дозатраты врача-эксперта связаны с необходи-
мостью просмотра виртуального слайда, форми-
руемого подсистемой навигации. Оценивается
изображение траектории просмотра, бегло про-
сматривается слайд для оценки приемлемости
биоматериала в выбранной области просмотра.
72 “Оптический журнал”, 78, 1, 2011
Трудозатраты врача при этом составляют менее
50% от затрат на анализ мазка при прямой ми-
кроскопии. Проверка сбора выборки примерно
соответствует трудозатратам при прямой руч-
ной микроскопии. Трудозатраты проверки со-
ртировки невелики и соответствуют примерно
10% затрат прямой микроскопии. Испытания
подсистемы измерений фактически относятся
к этапу технических испытаний и могут прово-
диться без участия врачей.
Таким образом, при гораздо более полном
и всестороннем исследовании качества функ-
ционирования автоматического анализатора,
дополненном формированием реалистичных
моделей внешней среды, пригодных для много-
кратного использования, суммарные трудоза-
траты врачей при выполнении первичных ис-
пытаний примерно в полтора раза превышают
трудозатраты традиционной схемы испытаний.
Вторичные испытания наиболее проблемных
подсистем сбора выборки, контроля качества и
сортировки, выполняемые на базе референсных
виртуальных слайдов, могут выполняться в
полностью автоматическом режиме без участия
врачей.
6. Робастность и адаптация
Для медицинских микроскопических изо-
бражений характерна чрезвычайно высокая
вариабельность практически всех признаков,
связанная с биологической индивидуальной из-
менчивостью и неконтролируемыми параметра-
ми процесса пробоподготовки, в частности:
заранее неизвестно количество однород-–
ных зон, присутствующих на изображении, и
число типов объектов, присутствующих в пре-
парате;
заранее неизвестно, по каким именно при-–
знакам окажется возможным разделение. Это
касается как задач сегментации (выделения од-
нородных областей), так и задач классификации
(распределения выделенных объектов по типам).
Поэтому попытки применить обычную стати-
стику и получить пороги для оценки параметров
объектов анализа оказываются неудачными.
Для решения задачи анализа изображений
рассматриваемого типа, по нашему мнению,
следует применять адаптивные и устойчивые
методы. В комплексе МЕКОС-Ц2 используются
следующие идеи.
1. Задачи сегментации изображения, клас-
сификации объектов на однородные группы ре-
шаются методами кластеризации без учителя.
2. Значимость полученных кластеров оцени-
вается с помощью специально подобранных ста-
тистических критериев.
3. Используется механизм высказывания
гипотез и их последующей проверки. Эти ги-
потезы связаны с количеством областей на изо-
бражении, количеством типов объектов в пре-
парате, положением границ, разделяющих эти
группы.
4. Классификация может осуществляться
после кластеризации с предварительным выде-
лением группы однородных объектов.
5. При классификации группы объектов
учитывается ее относительное положение в
пространстве признаков относительно других
групп.
Рассмотренные идеи реализованы в алгорит-
мах подсистемы сбора выборки. Технология
РВС позволяет вести их постоянное и полно-
ценное тестирование.
Заключение
Преимуществом схемы РВС является воз-
можность накапливать представительную базу
разработки и испытаний в процессе эксплуа-
тации анализаторов во многих лабораториях в
течение длительного времени, используя сеанс
формирования РВС как рутинный этап кон-
троля качества прибора в лаборатории. Потре-
бители, участвующие в пополнении базы РВС
МЕКОС-Ц2, систематически получают бесплат-
но новые версии, благодаря чему их комплексы
микроскопии находятся в постоянном разви-
тии. Хотя технология РВС нарушает один из
постулатов классической методики испытаний
изделий медицинского назначения – незави-
симость этапа тестирования от эксплуатации –
сам процесс формирования РВС как этап кон-
троля качества и наличие режима “support”
позволяют избежать возможных негативных
медицинских последствий применения новых
версий. Адаптируемость и устойчивость ал-
горитмов позволяют применять обычные до-
ступные в реальной практике методики пробо-
подготовки и сравнительно недорогое обору-
дование.
Результаты медицинских испытаний
МЕКОС-Ц2, выполненных в соответствии со
стандартом NCCLS H20 и по технологии
РВС, представлены в [8, 9]. При применении
МЕКОС-Ц2 значительно улучшаются точность
анализов, условия труда врача, контроль ка-
чества, обучение персонала. Это подтверждено
73“Оптический журнал”, 78, 1, 2011
практикой применения МЕКОС-Ц2 в более чем
ста лабораториях.
ЛИТЕРАТУРА
1. Медовый В.С., Парпара А.А., Пятницкий А.М.,
Соколинский Б.З., Демьянов В.Л. Структура си-
стемы автоматической микроскопии МЕКОС-Ц2
и методики ее испытаний // Медицинская техни-
ка. 2006. № 4. С. 36–41.
2. Медовый В.С., Парпара А.А., Соколинский Б.З.,
Демьянов В.Л. Комплектации оборудования и
системная платформа комплексов автоматизиро-
ванной микроскопии // Медицинская техника.
2007. № 2. С. 29–36.
3. Swolin B., Simonsson P. et al. Differential counting
of blood leukocytes using automated microscopy and
a decision support system based on artificial neural
networks – evaluation of DiffMaster Octavia. Clin
Lab Haematol. 2003 Jun; 25(3). Р. 139–147.
4. National Committee for Clinical Laboratory Stan-
dards (1992). Reference Leukocyte Differential
Count and Evaluation of Instrumental Methods: Ap-
proved Standards. NCCLS H20-A Villanova, PA.
5. Lundin M., Lundin J., Isola J. Virtual micros-
copy // Journal of Clinical Pathology. 2004. № 57.
Р. 1250–1251.
6. Парпара А.А., Пятницкий А.М., Соколинский Б.З.,
Медовый В.С., Демьянов В.Л. Навигация по мазку
крови при автоматическом подсчете лейкоци-
тарной формулы и эритроцитометрии // Здраво-
охранение и медицинская техника. 2005. № 7(21).
С. 37–38.
7. Wintrobe’s Clinical Hematology 11th
Ed. Lippincot
Williams&Wilkins Publisher, 11th
edition (Decem-
ber 2003).
8. Плясунова С.А., Балугян Р.Ш., Хмельницкий К.Е.,
Медовый В.С, Парпара А.А., Пятницкий А.М.,
Соколинский Б.З., Демьянов В.Л., Николаенко Д.С.
Автоматизированные методики микроскопиче-
ских анализов мазков крови – медицинские ис-
пытания комплекса МЕКОС-Ц2 // Клиническая
лабораторная диагностика. 2006. № 10. С. 22–24,
33–39.
9. Медовый В.C., Николаенко Д.С., Парпара А.А.,
Пятницкий А.М., Соколинский Б.З., Демья-
нов В.Л., Журкина Т.В., Пальчунова И.Б. Авто-
матизация микроскопических анализов мазков
крови и контроль качества с применением рефе-
ренсных виртуальных слайдов // Клиническая
лабораторная диагностика. 2008. № 6. С. 46–50.

More Related Content

Similar to Разработка и испытание автоматизированного комплекса микроскопии

Описание задач «Научного Хакатона»
Описание задач «Научного Хакатона»Описание задач «Научного Хакатона»
Описание задач «Научного Хакатона»Sciencehit.by
 
ЦИФРОВАЯ МИКРОСКОПИЯ ОТ НАНО ДО МАКРО С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ СИСТЕМЫ АНАЛИЗА ИЗОБРА...
ЦИФРОВАЯ МИКРОСКОПИЯ ОТ НАНО ДО МАКРО С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ СИСТЕМЫ АНАЛИЗА ИЗОБРА...ЦИФРОВАЯ МИКРОСКОПИЯ ОТ НАНО ДО МАКРО С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ СИСТЕМЫ АНАЛИЗА ИЗОБРА...
ЦИФРОВАЯ МИКРОСКОПИЯ ОТ НАНО ДО МАКРО С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ СИСТЕМЫ АНАЛИЗА ИЗОБРА...ITMO University
 
Amphora bio med_presentation
Amphora bio med_presentationAmphora bio med_presentation
Amphora bio med_presentationPavel Ignatyev
 
11.хранитель public-rus
11.хранитель public-rus11.хранитель public-rus
11.хранитель public-rusSkolkovoMD
 
Савюк Л.А. (ITEA-2013)
Савюк Л.А. (ITEA-2013)Савюк Л.А. (ITEA-2013)
Савюк Л.А. (ITEA-2013)ITEA Conferences
 
Цифровой госпиталь Сколково.. за 100 часов
Цифровой госпиталь Сколково.. за 100 часовЦифровой госпиталь Сколково.. за 100 часов
Цифровой госпиталь Сколково.. за 100 часовSerge Dobridnjuk
 
Проект White-box моделирование
Проект White-box моделированиеПроект White-box моделирование
Проект White-box моделированиеkulibin
 
Esdipitchstartupvillage 130530064724-phpapp01
Esdipitchstartupvillage 130530064724-phpapp01Esdipitchstartupvillage 130530064724-phpapp01
Esdipitchstartupvillage 130530064724-phpapp01AnnaStrizhkina
 
Esdi pitch startup village
Esdi pitch startup villageEsdi pitch startup village
Esdi pitch startup villageAnnaStrizhkina
 
Esdi pitch startup village
Esdi pitch startup villageEsdi pitch startup village
Esdi pitch startup villageAnnaStrizhkina
 
466.основы микропроцессорной техники учебное пособие
466.основы микропроцессорной техники  учебное пособие466.основы микропроцессорной техники  учебное пособие
466.основы микропроцессорной техники учебное пособиеivanov15548
 
Stankevich m biv123
Stankevich m biv123Stankevich m biv123
Stankevich m biv123Maxstan
 
ООО"Бикан"
ООО"Бикан"ООО"Бикан"
ООО"Бикан"ooobikan
 
датчики диагностики
датчики диагностики датчики диагностики
датчики диагностики AnnaStrizhkina
 
Biosystems a25
Biosystems a25Biosystems a25
Biosystems a25modchip
 

Similar to Разработка и испытание автоматизированного комплекса микроскопии (20)

Описание задач «Научного Хакатона»
Описание задач «Научного Хакатона»Описание задач «Научного Хакатона»
Описание задач «Научного Хакатона»
 
ЦИФРОВАЯ МИКРОСКОПИЯ ОТ НАНО ДО МАКРО С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ СИСТЕМЫ АНАЛИЗА ИЗОБРА...
ЦИФРОВАЯ МИКРОСКОПИЯ ОТ НАНО ДО МАКРО С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ СИСТЕМЫ АНАЛИЗА ИЗОБРА...ЦИФРОВАЯ МИКРОСКОПИЯ ОТ НАНО ДО МАКРО С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ СИСТЕМЫ АНАЛИЗА ИЗОБРА...
ЦИФРОВАЯ МИКРОСКОПИЯ ОТ НАНО ДО МАКРО С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ СИСТЕМЫ АНАЛИЗА ИЗОБРА...
 
Amphora bio med_presentation
Amphora bio med_presentationAmphora bio med_presentation
Amphora bio med_presentation
 
qLIS
qLISqLIS
qLIS
 
11.хранитель public-rus
11.хранитель public-rus11.хранитель public-rus
11.хранитель public-rus
 
Savyuk (ITEA-2013)
Savyuk (ITEA-2013)Savyuk (ITEA-2013)
Savyuk (ITEA-2013)
 
Савюк Л.А. (ITEA-2013)
Савюк Л.А. (ITEA-2013)Савюк Л.А. (ITEA-2013)
Савюк Л.А. (ITEA-2013)
 
Flerov
FlerovFlerov
Flerov
 
Цифровой госпиталь Сколково.. за 100 часов
Цифровой госпиталь Сколково.. за 100 часовЦифровой госпиталь Сколково.. за 100 часов
Цифровой госпиталь Сколково.. за 100 часов
 
Проект White-box моделирование
Проект White-box моделированиеПроект White-box моделирование
Проект White-box моделирование
 
Esdipitchstartupvillage 130530064724-phpapp01
Esdipitchstartupvillage 130530064724-phpapp01Esdipitchstartupvillage 130530064724-phpapp01
Esdipitchstartupvillage 130530064724-phpapp01
 
Esdi pitch startup village
Esdi pitch startup villageEsdi pitch startup village
Esdi pitch startup village
 
Esdi pitch startup village
Esdi pitch startup villageEsdi pitch startup village
Esdi pitch startup village
 
466.основы микропроцессорной техники учебное пособие
466.основы микропроцессорной техники  учебное пособие466.основы микропроцессорной техники  учебное пособие
466.основы микропроцессорной техники учебное пособие
 
Stankevich m biv123
Stankevich m biv123Stankevich m biv123
Stankevich m biv123
 
Энзимус
ЭнзимусЭнзимус
Энзимус
 
ООО"Бикан"
ООО"Бикан"ООО"Бикан"
ООО"Бикан"
 
датчики диагностики
датчики диагностики датчики диагностики
датчики диагностики
 
Biosystems a25
Biosystems a25Biosystems a25
Biosystems a25
 
Лаборатория Инвиво
Лаборатория ИнвивоЛаборатория Инвиво
Лаборатория Инвиво
 

More from ITMO University

МЕТОД ПОВЫШЕНИЯ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ ВОЛОКОННО-ОПТИЧЕСКОГО ГИДРОФОНА
МЕТОД ПОВЫШЕНИЯ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ  ВОЛОКОННО-ОПТИЧЕСКОГО ГИДРОФОНАМЕТОД ПОВЫШЕНИЯ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ  ВОЛОКОННО-ОПТИЧЕСКОГО ГИДРОФОНА
МЕТОД ПОВЫШЕНИЯ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ ВОЛОКОННО-ОПТИЧЕСКОГО ГИДРОФОНАITMO University
 
МЕТОДЫ ПОЛУЧЕНИЯ И СВОЙСТВА СЛОЕВ НА ОСНОВЕ АМОРФНОГО УГЛЕРОДА, ОРИЕНТИРУЮЩИ...
МЕТОДЫ ПОЛУЧЕНИЯ И СВОЙСТВА СЛОЕВ НА ОСНОВЕ  АМОРФНОГО УГЛЕРОДА, ОРИЕНТИРУЮЩИ...МЕТОДЫ ПОЛУЧЕНИЯ И СВОЙСТВА СЛОЕВ НА ОСНОВЕ  АМОРФНОГО УГЛЕРОДА, ОРИЕНТИРУЮЩИ...
МЕТОДЫ ПОЛУЧЕНИЯ И СВОЙСТВА СЛОЕВ НА ОСНОВЕ АМОРФНОГО УГЛЕРОДА, ОРИЕНТИРУЮЩИ...ITMO University
 
ПРИМЕНЕНИЕ ДИСКРЕТНОГО КОСИНУСНОГО ПРЕОБРАЗОВАНИЯ ДЛЯ ПОСТРОЕНИЯ ГОЛОГРАММЫ ...
ПРИМЕНЕНИЕ ДИСКРЕТНОГО КОСИНУСНОГО ПРЕОБРАЗОВАНИЯ  ДЛЯ ПОСТРОЕНИЯ ГОЛОГРАММЫ ...ПРИМЕНЕНИЕ ДИСКРЕТНОГО КОСИНУСНОГО ПРЕОБРАЗОВАНИЯ  ДЛЯ ПОСТРОЕНИЯ ГОЛОГРАММЫ ...
ПРИМЕНЕНИЕ ДИСКРЕТНОГО КОСИНУСНОГО ПРЕОБРАЗОВАНИЯ ДЛЯ ПОСТРОЕНИЯ ГОЛОГРАММЫ ...ITMO University
 
ПОГРЕШНОСТИ ИЗГОТОВЛЕНИЯ И УСТАНОВКИ ОТРАЖАТЕЛЬНЫХ ПРИЗМ
ПОГРЕШНОСТИ ИЗГОТОВЛЕНИЯ И УСТАНОВКИ ОТРАЖАТЕЛЬНЫХ ПРИЗМПОГРЕШНОСТИ ИЗГОТОВЛЕНИЯ И УСТАНОВКИ ОТРАЖАТЕЛЬНЫХ ПРИЗМ
ПОГРЕШНОСТИ ИЗГОТОВЛЕНИЯ И УСТАНОВКИ ОТРАЖАТЕЛЬНЫХ ПРИЗМITMO University
 
СПЕКТРОСКОПИЧЕСКОЕ И ТЕРМОДИНАМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ ТЯЖЕЛОЙ ВОДЫ
СПЕКТРОСКОПИЧЕСКОЕ И ТЕРМОДИНАМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ  ТЯЖЕЛОЙ ВОДЫСПЕКТРОСКОПИЧЕСКОЕ И ТЕРМОДИНАМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ  ТЯЖЕЛОЙ ВОДЫ
СПЕКТРОСКОПИЧЕСКОЕ И ТЕРМОДИНАМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ ТЯЖЕЛОЙ ВОДЫITMO University
 
МЕТРОЛОГИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ В СОЦИАЛЬНЫХ СЕТЯХ
МЕТРОЛОГИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ В СОЦИАЛЬНЫХ СЕТЯХМЕТРОЛОГИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ В СОЦИАЛЬНЫХ СЕТЯХ
МЕТРОЛОГИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ В СОЦИАЛЬНЫХ СЕТЯХITMO University
 
ПЕРСПЕКТИВЫ РАЗВИТИЯ ОПТИКИ ТОНКИХ ПЛЕНОК
ПЕРСПЕКТИВЫ РАЗВИТИЯ ОПТИКИ ТОНКИХ ПЛЕНОКПЕРСПЕКТИВЫ РАЗВИТИЯ ОПТИКИ ТОНКИХ ПЛЕНОК
ПЕРСПЕКТИВЫ РАЗВИТИЯ ОПТИКИ ТОНКИХ ПЛЕНОКITMO University
 
ИССЛЕДОВАНИЕ ПРОЦЕССОВ ФОРМИРОВАНИЯ ПОЛИМЕРНОГО МИКРОЭЛЕМЕНТА НА ТОРЦЕ ОПТИЧЕ...
ИССЛЕДОВАНИЕ ПРОЦЕССОВ ФОРМИРОВАНИЯ ПОЛИМЕРНОГО МИКРОЭЛЕМЕНТА НА ТОРЦЕ ОПТИЧЕ...ИССЛЕДОВАНИЕ ПРОЦЕССОВ ФОРМИРОВАНИЯ ПОЛИМЕРНОГО МИКРОЭЛЕМЕНТА НА ТОРЦЕ ОПТИЧЕ...
ИССЛЕДОВАНИЕ ПРОЦЕССОВ ФОРМИРОВАНИЯ ПОЛИМЕРНОГО МИКРОЭЛЕМЕНТА НА ТОРЦЕ ОПТИЧЕ...ITMO University
 
МЕТОД ДИАГНОСТИКИ ФУНКЦИОНАЛЬНОЙ АКТИВНОСТИ ТКАНЕЙ И ОРГАНОВ БИООБЪЕКТОВ
МЕТОД ДИАГНОСТИКИ ФУНКЦИОНАЛЬНОЙ АКТИВНОСТИ ТКАНЕЙ И ОРГАНОВ БИООБЪЕКТОВМЕТОД ДИАГНОСТИКИ ФУНКЦИОНАЛЬНОЙ АКТИВНОСТИ ТКАНЕЙ И ОРГАНОВ БИООБЪЕКТОВ
МЕТОД ДИАГНОСТИКИ ФУНКЦИОНАЛЬНОЙ АКТИВНОСТИ ТКАНЕЙ И ОРГАНОВ БИООБЪЕКТОВITMO University
 
КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ОЦЕНКА КАЧЕСТВА ИЗОБРАЖЕНИЙ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТОДОВ НЕЧЕТКОЙ ...
КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ОЦЕНКА КАЧЕСТВА ИЗОБРАЖЕНИЙ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТОДОВ НЕЧЕТКОЙ ...КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ОЦЕНКА КАЧЕСТВА ИЗОБРАЖЕНИЙ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТОДОВ НЕЧЕТКОЙ ...
КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ОЦЕНКА КАЧЕСТВА ИЗОБРАЖЕНИЙ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТОДОВ НЕЧЕТКОЙ ...ITMO University
 
АЛГЕБРАИЧЕСКИЙ МЕТОД ОПРЕДЕЛЕНИЯ ПОЛНОГО МНОЖЕСТВА ПРОСТЫХ РАЗРЕЗОВ В ДВУХПОЛ...
АЛГЕБРАИЧЕСКИЙ МЕТОД ОПРЕДЕЛЕНИЯ ПОЛНОГО МНОЖЕСТВА ПРОСТЫХ РАЗРЕЗОВ В ДВУХПОЛ...АЛГЕБРАИЧЕСКИЙ МЕТОД ОПРЕДЕЛЕНИЯ ПОЛНОГО МНОЖЕСТВА ПРОСТЫХ РАЗРЕЗОВ В ДВУХПОЛ...
АЛГЕБРАИЧЕСКИЙ МЕТОД ОПРЕДЕЛЕНИЯ ПОЛНОГО МНОЖЕСТВА ПРОСТЫХ РАЗРЕЗОВ В ДВУХПОЛ...ITMO University
 
РЕКУРРЕНТНОЕ СИСТЕМАТИЧЕСКОЕ ПОМЕХОЗАЩИТНОЕ ПРЕОБРАЗОВАНИЕ КОДОВ: ВОЗМОЖНОСТИ...
РЕКУРРЕНТНОЕ СИСТЕМАТИЧЕСКОЕ ПОМЕХОЗАЩИТНОЕ ПРЕОБРАЗОВАНИЕ КОДОВ: ВОЗМОЖНОСТИ...РЕКУРРЕНТНОЕ СИСТЕМАТИЧЕСКОЕ ПОМЕХОЗАЩИТНОЕ ПРЕОБРАЗОВАНИЕ КОДОВ: ВОЗМОЖНОСТИ...
РЕКУРРЕНТНОЕ СИСТЕМАТИЧЕСКОЕ ПОМЕХОЗАЩИТНОЕ ПРЕОБРАЗОВАНИЕ КОДОВ: ВОЗМОЖНОСТИ...ITMO University
 
Информационная система «Забота о каждом»
Информационная система  «Забота о каждом» Информационная система  «Забота о каждом»
Информационная система «Забота о каждом» ITMO University
 
Проект "Я рядом"
Проект "Я рядом"Проект "Я рядом"
Проект "Я рядом"ITMO University
 
Проект «Театральный мост»
Проект «Театральный мост»Проект «Театральный мост»
Проект «Театральный мост»ITMO University
 
Студенческие инициативы в развитии ИКТ для старшего поколения
Студенческие инициативы в  развитии ИКТ для старшего  поколения Студенческие инициативы в  развитии ИКТ для старшего  поколения
Студенческие инициативы в развитии ИКТ для старшего поколения ITMO University
 
СОХРАНЁННОЕ РАДИО
СОХРАНЁННОЕ  РАДИОСОХРАНЁННОЕ  РАДИО
СОХРАНЁННОЕ РАДИОITMO University
 
Проект: «Разработка Системы Оценки и учёта Добровольческой Деятельности «СО...
Проект: «Разработка Системы Оценки и учёта  Добровольческой Деятельности  «СО...Проект: «Разработка Системы Оценки и учёта  Добровольческой Деятельности  «СО...
Проект: «Разработка Системы Оценки и учёта Добровольческой Деятельности «СО...ITMO University
 
«Нет преграды патриотам!»
«Нет преграды патриотам!»«Нет преграды патриотам!»
«Нет преграды патриотам!»ITMO University
 
Проект «Наш любимый детский сад»
Проект «Наш любимый детский сад»Проект «Наш любимый детский сад»
Проект «Наш любимый детский сад»ITMO University
 

More from ITMO University (20)

МЕТОД ПОВЫШЕНИЯ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ ВОЛОКОННО-ОПТИЧЕСКОГО ГИДРОФОНА
МЕТОД ПОВЫШЕНИЯ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ  ВОЛОКОННО-ОПТИЧЕСКОГО ГИДРОФОНАМЕТОД ПОВЫШЕНИЯ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ  ВОЛОКОННО-ОПТИЧЕСКОГО ГИДРОФОНА
МЕТОД ПОВЫШЕНИЯ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ ВОЛОКОННО-ОПТИЧЕСКОГО ГИДРОФОНА
 
МЕТОДЫ ПОЛУЧЕНИЯ И СВОЙСТВА СЛОЕВ НА ОСНОВЕ АМОРФНОГО УГЛЕРОДА, ОРИЕНТИРУЮЩИ...
МЕТОДЫ ПОЛУЧЕНИЯ И СВОЙСТВА СЛОЕВ НА ОСНОВЕ  АМОРФНОГО УГЛЕРОДА, ОРИЕНТИРУЮЩИ...МЕТОДЫ ПОЛУЧЕНИЯ И СВОЙСТВА СЛОЕВ НА ОСНОВЕ  АМОРФНОГО УГЛЕРОДА, ОРИЕНТИРУЮЩИ...
МЕТОДЫ ПОЛУЧЕНИЯ И СВОЙСТВА СЛОЕВ НА ОСНОВЕ АМОРФНОГО УГЛЕРОДА, ОРИЕНТИРУЮЩИ...
 
ПРИМЕНЕНИЕ ДИСКРЕТНОГО КОСИНУСНОГО ПРЕОБРАЗОВАНИЯ ДЛЯ ПОСТРОЕНИЯ ГОЛОГРАММЫ ...
ПРИМЕНЕНИЕ ДИСКРЕТНОГО КОСИНУСНОГО ПРЕОБРАЗОВАНИЯ  ДЛЯ ПОСТРОЕНИЯ ГОЛОГРАММЫ ...ПРИМЕНЕНИЕ ДИСКРЕТНОГО КОСИНУСНОГО ПРЕОБРАЗОВАНИЯ  ДЛЯ ПОСТРОЕНИЯ ГОЛОГРАММЫ ...
ПРИМЕНЕНИЕ ДИСКРЕТНОГО КОСИНУСНОГО ПРЕОБРАЗОВАНИЯ ДЛЯ ПОСТРОЕНИЯ ГОЛОГРАММЫ ...
 
ПОГРЕШНОСТИ ИЗГОТОВЛЕНИЯ И УСТАНОВКИ ОТРАЖАТЕЛЬНЫХ ПРИЗМ
ПОГРЕШНОСТИ ИЗГОТОВЛЕНИЯ И УСТАНОВКИ ОТРАЖАТЕЛЬНЫХ ПРИЗМПОГРЕШНОСТИ ИЗГОТОВЛЕНИЯ И УСТАНОВКИ ОТРАЖАТЕЛЬНЫХ ПРИЗМ
ПОГРЕШНОСТИ ИЗГОТОВЛЕНИЯ И УСТАНОВКИ ОТРАЖАТЕЛЬНЫХ ПРИЗМ
 
СПЕКТРОСКОПИЧЕСКОЕ И ТЕРМОДИНАМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ ТЯЖЕЛОЙ ВОДЫ
СПЕКТРОСКОПИЧЕСКОЕ И ТЕРМОДИНАМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ  ТЯЖЕЛОЙ ВОДЫСПЕКТРОСКОПИЧЕСКОЕ И ТЕРМОДИНАМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ  ТЯЖЕЛОЙ ВОДЫ
СПЕКТРОСКОПИЧЕСКОЕ И ТЕРМОДИНАМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ ТЯЖЕЛОЙ ВОДЫ
 
МЕТРОЛОГИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ В СОЦИАЛЬНЫХ СЕТЯХ
МЕТРОЛОГИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ В СОЦИАЛЬНЫХ СЕТЯХМЕТРОЛОГИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ В СОЦИАЛЬНЫХ СЕТЯХ
МЕТРОЛОГИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ В СОЦИАЛЬНЫХ СЕТЯХ
 
ПЕРСПЕКТИВЫ РАЗВИТИЯ ОПТИКИ ТОНКИХ ПЛЕНОК
ПЕРСПЕКТИВЫ РАЗВИТИЯ ОПТИКИ ТОНКИХ ПЛЕНОКПЕРСПЕКТИВЫ РАЗВИТИЯ ОПТИКИ ТОНКИХ ПЛЕНОК
ПЕРСПЕКТИВЫ РАЗВИТИЯ ОПТИКИ ТОНКИХ ПЛЕНОК
 
ИССЛЕДОВАНИЕ ПРОЦЕССОВ ФОРМИРОВАНИЯ ПОЛИМЕРНОГО МИКРОЭЛЕМЕНТА НА ТОРЦЕ ОПТИЧЕ...
ИССЛЕДОВАНИЕ ПРОЦЕССОВ ФОРМИРОВАНИЯ ПОЛИМЕРНОГО МИКРОЭЛЕМЕНТА НА ТОРЦЕ ОПТИЧЕ...ИССЛЕДОВАНИЕ ПРОЦЕССОВ ФОРМИРОВАНИЯ ПОЛИМЕРНОГО МИКРОЭЛЕМЕНТА НА ТОРЦЕ ОПТИЧЕ...
ИССЛЕДОВАНИЕ ПРОЦЕССОВ ФОРМИРОВАНИЯ ПОЛИМЕРНОГО МИКРОЭЛЕМЕНТА НА ТОРЦЕ ОПТИЧЕ...
 
МЕТОД ДИАГНОСТИКИ ФУНКЦИОНАЛЬНОЙ АКТИВНОСТИ ТКАНЕЙ И ОРГАНОВ БИООБЪЕКТОВ
МЕТОД ДИАГНОСТИКИ ФУНКЦИОНАЛЬНОЙ АКТИВНОСТИ ТКАНЕЙ И ОРГАНОВ БИООБЪЕКТОВМЕТОД ДИАГНОСТИКИ ФУНКЦИОНАЛЬНОЙ АКТИВНОСТИ ТКАНЕЙ И ОРГАНОВ БИООБЪЕКТОВ
МЕТОД ДИАГНОСТИКИ ФУНКЦИОНАЛЬНОЙ АКТИВНОСТИ ТКАНЕЙ И ОРГАНОВ БИООБЪЕКТОВ
 
КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ОЦЕНКА КАЧЕСТВА ИЗОБРАЖЕНИЙ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТОДОВ НЕЧЕТКОЙ ...
КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ОЦЕНКА КАЧЕСТВА ИЗОБРАЖЕНИЙ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТОДОВ НЕЧЕТКОЙ ...КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ОЦЕНКА КАЧЕСТВА ИЗОБРАЖЕНИЙ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТОДОВ НЕЧЕТКОЙ ...
КОЛИЧЕСТВЕННАЯ ОЦЕНКА КАЧЕСТВА ИЗОБРАЖЕНИЙ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТОДОВ НЕЧЕТКОЙ ...
 
АЛГЕБРАИЧЕСКИЙ МЕТОД ОПРЕДЕЛЕНИЯ ПОЛНОГО МНОЖЕСТВА ПРОСТЫХ РАЗРЕЗОВ В ДВУХПОЛ...
АЛГЕБРАИЧЕСКИЙ МЕТОД ОПРЕДЕЛЕНИЯ ПОЛНОГО МНОЖЕСТВА ПРОСТЫХ РАЗРЕЗОВ В ДВУХПОЛ...АЛГЕБРАИЧЕСКИЙ МЕТОД ОПРЕДЕЛЕНИЯ ПОЛНОГО МНОЖЕСТВА ПРОСТЫХ РАЗРЕЗОВ В ДВУХПОЛ...
АЛГЕБРАИЧЕСКИЙ МЕТОД ОПРЕДЕЛЕНИЯ ПОЛНОГО МНОЖЕСТВА ПРОСТЫХ РАЗРЕЗОВ В ДВУХПОЛ...
 
РЕКУРРЕНТНОЕ СИСТЕМАТИЧЕСКОЕ ПОМЕХОЗАЩИТНОЕ ПРЕОБРАЗОВАНИЕ КОДОВ: ВОЗМОЖНОСТИ...
РЕКУРРЕНТНОЕ СИСТЕМАТИЧЕСКОЕ ПОМЕХОЗАЩИТНОЕ ПРЕОБРАЗОВАНИЕ КОДОВ: ВОЗМОЖНОСТИ...РЕКУРРЕНТНОЕ СИСТЕМАТИЧЕСКОЕ ПОМЕХОЗАЩИТНОЕ ПРЕОБРАЗОВАНИЕ КОДОВ: ВОЗМОЖНОСТИ...
РЕКУРРЕНТНОЕ СИСТЕМАТИЧЕСКОЕ ПОМЕХОЗАЩИТНОЕ ПРЕОБРАЗОВАНИЕ КОДОВ: ВОЗМОЖНОСТИ...
 
Информационная система «Забота о каждом»
Информационная система  «Забота о каждом» Информационная система  «Забота о каждом»
Информационная система «Забота о каждом»
 
Проект "Я рядом"
Проект "Я рядом"Проект "Я рядом"
Проект "Я рядом"
 
Проект «Театральный мост»
Проект «Театральный мост»Проект «Театральный мост»
Проект «Театральный мост»
 
Студенческие инициативы в развитии ИКТ для старшего поколения
Студенческие инициативы в  развитии ИКТ для старшего  поколения Студенческие инициативы в  развитии ИКТ для старшего  поколения
Студенческие инициативы в развитии ИКТ для старшего поколения
 
СОХРАНЁННОЕ РАДИО
СОХРАНЁННОЕ  РАДИОСОХРАНЁННОЕ  РАДИО
СОХРАНЁННОЕ РАДИО
 
Проект: «Разработка Системы Оценки и учёта Добровольческой Деятельности «СО...
Проект: «Разработка Системы Оценки и учёта  Добровольческой Деятельности  «СО...Проект: «Разработка Системы Оценки и учёта  Добровольческой Деятельности  «СО...
Проект: «Разработка Системы Оценки и учёта Добровольческой Деятельности «СО...
 
«Нет преграды патриотам!»
«Нет преграды патриотам!»«Нет преграды патриотам!»
«Нет преграды патриотам!»
 
Проект «Наш любимый детский сад»
Проект «Наш любимый детский сад»Проект «Наш любимый детский сад»
Проект «Наш любимый детский сад»
 

Разработка и испытание автоматизированного комплекса микроскопии

  • 1. 66 “Оптический журнал”, 78, 1, 2011 ЦИФРОВАЯ МИКРОСКОПИЯ, ОБРАБОТКА ИЗОБРАЖЕНИЙ Введение В настоящее время основные производите- ли поставляют на рынок комплексы микро- скопии с моторизованными элементами и с программным обеспечением, автоматизирую- щим рутинные операции микроскопии, такие как производство цифровых копий препарата (виртуальные слайды), автофокус, съемка поля зрения в различных режимах и т. п. Ряд фирм производит оборудование моторизации для дооснащения обычных микроскопов, широко представлено ПО анализа изображений различ- ной природы. Современный уровень развития автоматизации и информатизации микроско- пии создает все условия для включения в состав микроскопа последнего интеллектуального эле- мента – программы автоматического анализа с определением заданных параметров препара- та – превращающего комплекс автоматизиро- ванный микроскопии (КАМ) в автоматический анализатор. Тем не менее, если говорить о био- материалах и особенно об анализах медицин- ского класса, создание успешных автоматиче- ских микроскопических анализаторов (АМА) все еще относится к категории единичных слу- чаев. Причины этого связаны с методическими трудностями разработки и испытаний АМА. Из-за высокой изменчивости свойства объектов анализа описываются в качественных терми- нах, что заставляет оценивать АМА в аналогич- ных терминах как роботизированное устрой- ство. Необходимая для разработки и испытаний модель внешней среды, основанная на фиксиро- ванной выборке реальных препаратов, проана- лизированных врачами, оказывается весьма дорогостоящей и фактически непредставитель- ной из-за огромного разнообразия вариантов пробоподготовки и патологий, влияющих на свойства объектов анализа. В результате ком- плекс, созданный с использованием такой огра- ниченной модели, может быть неэффективен в отличающихся условиях множества реальных контингентов больных и лабораторий. В статье УДК 681.3.01 РАЗРАБОТКА И ИСПЫТАНИЕ АВТОМАТИЗИРОВАННОГО КОМПЛЕКСА МИКРОСКОПИИ © 2011 г. В. C. Медовый, доктор техн. наук; А. М. Пятницкий, канд. физ.-мат. наук; Б. З. Соколинский, канд. мед. наук; В. В. Маркеллов; Д. С. Федорова; И. В. Федоров ЗАО “Медицинские компьютерные системы (МЕКОС)”, Москва E-mail: medovyy@mecos.ru Высокая вариабельность препаратов и объектов анализа создает проблемы как для формирования как представительной модели внешней среды, так и устойчивых алгоритмов автоматического микроскопического анализа биоматериалов. При раз- работке и сопровождении анализатора МЕКОС-Ц2 для пополнения модели внешней среды использована технология формируемых при участии потребителей референсных виртуальных слайдов, поступающих в процессе эксплуатации из лабораторий в сервис- ный центр. Настроенная на применение виртуальных слайдов структура МЕКОС-Ц2 позволяет в значительной степени автоматизировать разработку новых версий про- граммного обеспечения с учетом новых данных о внешней среде. Другим ключевым принципомразработкиявляетсяиспользованиеробастных,адаптирующихсякданному препарату, алгоритмов анализа. Сочетание указанных принципов позволило создать автоматический анализатор МЕКОС-Ц2 медицинского класса, пригодный для анализа мазков крови в рядовой лаборатории. Ключевые слова: цифровая микроскопия, виртуальные слайды, автоматический микроскопический анализатор, обработка изображений. Коды OCIS: 100.0100, 180.0180, 170.0170 Поступила в редакцию 04.05.2010
  • 2. 67“Оптический журнал”, 78, 1, 2011 представлена уточненная (по сравнению с [1]) методика разработки и медицинских испыта- ний АМА с применением виртуальных слайдов, превращающая процесс эксплуатации в процесс развития МЕКОС-Ц2. Указанная кооперация потребителей и разработчиков представляет- ся новым шагом в развитии роботизированных комплексов микроскопии. Даны некоторые де- тали алгоритмов АМА МЕКОС-Ц2, обеспечива- ющие робастность и адаптацию к конкретному препарату в условиях априорной неопределен- ности его свойств. 1. Проблемы медицинских испытаний АМА В состав комплекса МЕКОС-Ц2 [2], как и в состав любого АМА, входят: моторизованный микроскоп, видеокамера, компьютер и про- граммное обеспечение. Возможны различные комплектации оборудования и ПО, обеспечи- вающие различный состав анализов, уровень автоматизации, производительности и стоимо- сти. Одним из наиболее автоматизированных приложений МЕКОС-Ц2 является анализ маз- ков крови, включая сбор выборки и сортировку лейкоцитов, эритроцитов, тромбоцитов, рети- кулоцитов. В процессе разработки и испытаний ПО МЕКОС-Ц2 мы столкнулись с трудностями сбора представительной выборки препаратов. Такая выборка должна включать многие сотни примеров различных патологий, возрастных групп, различных модификаций пробоподго- товки. Например, цвет и форма лейкоцитов и эритроцитов в препаратах с различными пато- логиями могут значительно изменяться в одних и тех же условиях пробоподготовки. Обычная схема медицинских испытаний АМА состоит в проведении испытаний в небольшом числе ме- дицинских учреждений в течение ограничен- ного времени [3]. Такие испытания являются весьма затратными, поскольку в соответствии с существующим стандартом испытаний [4] в качестве референсной методики используется ручная микроскопия, выполняемая опытными врачами. Характер референсной методики свя- зан с качественными определениями объектов анализа. Трудности сбора коллекции слайдов, особенно с представительным составом редких объектов, и высокая трудоемкость ручной ми- кроскопии ограничивают реально достижимую представительность базы испытаний. Каждая новая версия программ (их может быть несколь- ко в год) требует, вообще говоря, новой полно- ценной проверки. Вместе с тем современные информационные технологии автоматизированной микроскопии, предназначенные для задач визуального анали- за биоматериалов, могли бы быть использованы при проведении медицинских испытаний авто- матического анализатора. Одной из таких тех- нологий является технология использования “виртуальных слайдов” (ВС). Автоматически формируемый КАМ вирту- альный слайд – это “черепичное” панорамное, сфокусированное поле зрения прямоугольной формы, состоящее из множества соседних, ча- стично перекрывающихся первичных полей зрения видеокамеры без потери информации на стыках. ВС площадью до нескольких кв. см. мо- жет быть просмотрен на удаленном компьютере с имитацией любого увеличения. ВС широко применяются в телемедицине [5]. Врач имеет возможность получить аналогичные результа- ты анализа, используя микроскопию реального препарата через окуляры, либо наблюдая ВС на экране компьютера. 2. Применение информационных технологий в методике испытаний МЕКОС-Ц2 МЕКОС-Ц2 располагает группой функций для локального анализа препарата и группой функций для удаленного доступа к препаратам и результатам их анализа. Вторая группа яв- ляется группой средств телемедицины, форми- рующей ВС. Первоначально ВС использовались нами в составе средств контроля МЕКОС-Ц2 для оценки службой сервиса правильности ра- боты изделия в конкретной ситуации. Если бы результаты тестирования содержали также результаты визуального анализа ВС (или визу- альные оценки качества автоматического ана- лиза), сделанные потребителем – квалифици- рованным врачом-экспертом, мы получили бы возможность дистанционно собирать и базу дан- ных медицинских испытаний автоматического анализатора. Результаты визуального анализа ВС, сделанного потребителем, рассматривают- ся в этих условиях как консультация по каче- ству автоматического анализатора. Были раз- работаны специальные диалоговые средства поддержки производства таких “референсных” ВС (РВС). Эти средства ускоряют формирова- ние врачом результатов визуального анализа за счет использования результатов автоматиче-
  • 3. 68 “Оптический журнал”, 78, 1, 2011 ского анализа в качестве подсказок, при этом время создания РВС становится сравнимым со временем прямого микроскопического анализа. Сеанс производства РВС может рассматривать- ся как рутинный этап контроля качества анали- затора в лаборатории. В настоящее время группа функций удален- ного доступа поддерживает два потока рефе- ренсных сообщений. Первый поток является потоком телепатологии: ВС из удаленной лабо- ратории, оснащенной комплексом МЕКОС-Ц2, поступает в консультационный центр, в ко- тором эксперт анализирует ВС на своем ком- пьютере, делает референсные диагностические оценки ВС, то есть прямо или косвенно фор- мирует РВС, и отправляет РВС в качестве кон- сультации обратно в периферийную лаборато- рию. Второй поток РВС поступает в обратном направлении: ВС из удаленной лаборатории, оснащенной комплексом МЕКОС-Ц2, поступает в центральную референсную лабораторию или в сервисный центр МЕКОС вместе с оценками автоматического анализа (или с результатами визуального анализа), сделанными местным врачом. Центральные учреждения могут ис- пользовать такие РВС для создания представи- тельных архивов препаратов по определенным типам патологий, для аттестации местных вра- чей или для создания представительной базы данных медицинских испытаний автоматиче- ской методики анализа. Рассмотренный подход позволяет выполнять испытания не только в ограниченном числе медицинских учреждений в специальный период времени, но и на посто- янной основе во время эксплуатации во мно- гих учреждениях с использованием различных условий пробоподготовки и различных контин- гентов больных. Аналогичная технология мо- жет применяться при разработке и испытани- ях других типов автоматических анализаторов изображений. 3. Соответствие структуры МЕКОС-Ц2 технологии РВС Эффективность применения РВС в процессе разработки и испытаний зависит от структу- ры АМА. Помимо информационного аспекта, связанного с созданием электронного архива реалистичных моделей внешней среды, приме- нение РВС может дать значительный дополни- тельный эффект, если методику автоматическо- го анализа разбить на последовательные этапы, каждый из которых соответствует естествен- ной, с точки зрения врача, задаче микроскопи- ческого анализа. Если при этом на каждом эта- пе комплекс автоматически формирует выход- ной ВС, отвечающий специфике задачи этапа, то качество решения автоматическим анализа- тором задачи каждого этапа может быть оцене- но с помощью соответствующей данному этапу представительной выборки РВС. Введение эта- пов приводит к необходимости обеспечить каче- ство работы каждого этапа на уровне, не усту- пающем качеству выполнения аналогичной функции врачом. Это означает, что различия в результатах автоматического и визуального анализа должны находиться в пределах стати- стической ошибки, связанной только с объе- мом выборки объектов анализа. Если каждому этапу соответствует своя подсистема ПО АМА, то благодаря этапности при разработке новых версий появляется возможность не проводить дорогостоящие повторные испытания ранее ат- тестованных (испытанных с положительным результатом) подсистем. Большинство известных методик медицин- ского микроскопического анализа может быть представлено в качестве последовательности выполнения следующих этапов: формирование изображения поля зрения;– навигация (реализация маршрута просмо-– тра препарата); сбор выборки объектов анализа;– контроль качества приготовления препа-– рата; сортировка объектов анализа с использо-– ванием качественных критериев; количественные измерения отдельных– объектов анализа и выборки в целом. В ряде методик некоторые из указанных этапов могут отсутствовать или выполняться параллельно. В последнем случае необходимо применение одного и того же типа РВС для от- ражения и оценки результатов работы всех па- раллельных процессов. В соответствии со сказанным ПО МЕКОС-Ц2 разработано как функционирующая в общей среде группа из шести подсистем: виртуальный микроскоп; навигация; сбор выборки; контроль качества; сортировка; измерение (рис. 1, 2). Подсистемы для каждого конкретного типа анализа располагают специализированными модулями и настройками, но во всех случаях аттестуются в указанном порядке. Исключение составляет подсистема измерений, которая в связи с трудоемкостью и неточностью ручных измерений испытывается с применением спе-
  • 4. 69“Оптический журнал”, 78, 1, 2011 циальных эталонов и фактически не участвует в медицинских испытаниях (аттестуется на эта- пе технических испытаний). 4. ВС, РВС и испытания подсистем 4.1. Подсистема “виртуальный микроскоп (ПВМ)” Подсистема предназначена для формиро- вания виртуальных слайдов, то есть для пере- мещения процесса микроскопии на экран ком- пьютера, как в реальном времени, так и через базу данных. Качество подсистемы зависит от ее эргономики, разрешения изображений, ско- рости, контроля условий наблюдения. Подси- стема управляет моторизованным микроскопом (объективы, освещение, фильтры, скорость и величина перемещений) и видеокамерой (экс- позиция, форматы). ПВМ использует стандарт- ные алгоритмы автофокуса или мультифокуса, стандартные траектории для формирования прямоугольных ВС с применением стандартной технологии “черепицы” [5]. Текущим полем зрения при просмотре ВС является прямоуголь- ный фрагмент ВС, соответствующий окну про- смотра на экране монитора. На максимальном разрешении максимально возможный размер окна соответствует вписанному в поле зрения микроскопа прямоугольнику. Могут форми- роваться и “линейные” ВС, соответствующие только одному вертикальному или горизонталь- ному ряду соседних полей зрения микроскопа. Линейные ВС (ЛВС) могут использоваться под- системой навигации в качестве фрагментов при формировании нестандартного ВС более слож- ной формы, учитывающей распределение био- материала по площади препарата. Современный уровень оборудования и стан- дартных программных решений позволяет по- лучить на экране компьютера приемлемое по качеству изображение, не уступающее изобра- жению в окулярах микроскопа. Ряд стандарт- ных автоматических функций виртуальной микроскопии (автофокус, мультифокус, непре- рывное масштабирование, проекции) создают дополнительные возможности, улучшающие визуальный анализ. Фактически качество ПВМ зависит от правильности выбора комплекта оборудования КАМ и от правильности выбора настроек оборудования для конкретного вида анализа. Поэтому медицинские испытания ПВМ могут выполняться как нетрудоемкие рутинные проверки, не требующие статистиче- ских оценок и значительных выборок препара- тов. Например, для методики автоматической сортировки лейкоцитов мазка крови проверка ПВМ может выполняться с использованием нескольких аттестованных по качеству приго- товления мазков лейкозной крови, как содер- жащих наиболее сложные объекты. Критерием применимости ПВМ может являться 100% ви- зуальная различимость морфологических осо- бенностей всех представленных в ВС клеток. Отдельно должно проверяться качество линей- ных ВС, включая проверку качества стыков соседних ЛВС. Полноценные референсные ВС в случае ПВМ не используются. 4.2. Подсистема навигации (ПН) Задачей ПН является автоматическое фор- мирование специфических для данного типа препарата маршрутов просмотра с выбором об- ластей препарата, способных содержать пред- ставительную выборку объектов анализа. В слу- чае мазков крови это области с определенной толщиной слоя эритроцитов и с их определен- ным положением относительно границ мазка. ПН формирует маршрут, анализируя изобра- жение в текущем окне и используя технику формирования линейных ВС. В частности, ре- шение присоединить текущее поле зрения к те- кущему ЛВС, то есть удлинить текущий ЛВС, или начать новый ЛВС в другом направлении, специализированный модуль ПН для анализа мазка крови принимает на основе измерений толщины слоя эритроцитов вдоль пройденного маршрута [6]. В результате форма автомати- чески формируемого выходного ВС подсистемы навигации (ВСПН) для неравномерного маз- ка может значительно отличаться от прямо- угольной, адаптируясь к распределению слоя эритроцитов в мазке (рис. 3). Если условием окончания просмотра является сбор выборки объектов анализа заданного объема (напри- мер, сбор 100–200 клеток для определения лейкоцитарной формулы), то подсистемы на- вигации и сбора выборки должны работать па- раллельно, с передачей в ПН данных о текущем размере выборки. В этом случае в качестве вы- ходного ВС используется один и тот же слайд ВСПН обеими подсистемами навигации и сбора выборки. В соответствии с имеющимися инструкция- ми [7] траектория скрининга препарата долж- на формироваться и оцениваться на макро- и микроуровне. Поэтому результат работы ПН
  • 5. Рис. 1. Архитектура МЕКОС-Ц2: структура вложенных функциональных оболочек – этапов анализа; фиксация виртуальных слайдов для контроля качества автоматических функций потребителем с помощью РВС. Рис. 2. Испытания оболочек на базе представительных выборок РВС.
  • 6. Рис. 3. Окно живого видео и траектория скрининга мазка крови (справа) подсистемы навигации МЕКОС-Ц2. Рис. 4. Окно формирования рефе- ренсного виртуального слайда под- системы сбора выборки. Рис. 5. Окна просмотра и контроля галерей подсистемы сортировки.
  • 7. 70 “Оптический журнал”, 78, 1, 2011 дополнительно к ВСПН (микроуровень) пред- ставлен также отдельным изображением тра- ектории автоматического просмотра препарата (ТПН). Масштаб ТПН (траектория показана на рис. 3 справа) соответствует макроуровню (т. е. без увеличения в микроскопе). Кроме формы области просмотра ТВСПН содержит также карту толщины препарата в области просмо- тра. Врач оценивает форму, размеры и толщину слоя биоматериала области просмотра, исполь- зуя представленную в окне просмотра шкалу. Отметим, что при ручной микроскопии пра- вильность траектории просмотра практически не контролируется, хотя, как известно, непра- вильный выбор траектории может привести к ошибочным результатам подсчета лейкоцитар- ной формулы [7]. Траектория считается “правильной”, если она признается таковой как самой подсистемой ПН, так и врачом, который визуально оценива- ет форму ТПН, представленной в результатах анализа. ПН может автоматически оценивать качество сформированной траектории по ее то- пологии и по гистограмме распределения тол- щины слоя биоматериала вдоль траектории. Оценки траектории дописываются в ВСПН, образуя РВСПН. Отметим, что “неправильная траектория” может быть сформирована не толь- ко из-за ошибочной работы подсистемы нави- гации, но и из-за неудовлетворительного каче- ства препарата (например, отсутствие тонкого слоя). Качество препарата оценивается врачом по ВСПН, если ПН удается собрать заданную выборку объектов анализа. В противном случае считается, что ПН отказывается от обслужива- ния препарата. Критерием применимости ПН является близкий к нулю уровень “ложнопра- вильных” траекторий при скрининге принятых ПН к обслуживанию препаратов (таких, что референсной оценкой является “неправильная траектория” и “нормальное” качество препара- та). В случаях отказа ПН от обслуживания не- обходима дополнительная ручная микроскопия или формирование стандартного прямоугольно- го ВС для выявления истинного качества пре- парата экспертом. Приемлемым можно считать уровень до 5% отказов ПН на нормальных по качеству препаратах. 4.3. Подсистема сбора выборки (ПСВ) Задачей ПСВ является обнаружение в вы- ходном виртуальном слайде подсистемы на- вигации объектов заданных типов и подсчет текущего объема собранной выборки. Выход- ным автоматически формируемым ВС подси- стемы сбора выборки (ВСПСВ) является ВСпн, дополненный отметками автоматического об- наружения (рис. 4), а также галерея портретов (прямоугольных фрагментов, содержащих изо- бражения объектов) обнаруженных объектов (ВСГАЛ), объем которой обычно на несколько порядков меньше объема ВСпн. Референсная оценка пропусков (“ложно- отрицательных”) и ложных обнаружений (“ложноположительных”) выполняется при просмотре врачом ВСПН с помощью специ- альной программы, которая облегчает работу, выделяя на изображении автоматически об- наруженные объекты. Врач может согласить- ся с подсказкой (объект остается в РВСПСВ и РВСГАЛ), отвергнуть ее (вычеркивается из РВСПСВ и РВСГАЛ) или выделить на экра- не с помощью диалоговых средств объект, не обнаруженный автоматически (добавляется в РВСПСВ и РВСГАЛ). Критерием применимости ПСВ являются проценты пропусков и ложных обнаружений, которые должны быть не хуже заданных. Для разных типов клеток могут быть заданы разные требуемые вероятности пропусков в зависимо- сти от средних концентраций и видов анализа. В частности, при анализе лейкоцитов могут быть заданы разные вероятности пропуска нор- мальных, юных и патологических форм. Мазок крови обычно содержит значительно больше клеток (более чем в 10 раз), чем требуется для подсчета формулы нормальных типов лейко- цитов. Поэтому при этом анализе требуемые вероятности пропусков могут быть не слишком жесткими (в соответствии с моделью Пуассона для редких событий вероятность пропуска мо- жет быть снижена за счет увеличения области просмотра). Это достигается автоматически при использовании фиксированного размера фак- тически собираемой выборки. Однако при зна- чительном количестве пропусков (более 1%) следует убедиться в том, что объекты различ- ных типов пропускаются с одинаковой вероят- ностью. Доля ложных обнаружений имеет значение при автоматизированном режиме эксплуата- ции, когда врач имеет возможность откорректи- ровать результаты автоматической сортировки (см. ниже). Для существенного повышения про- изводительности труда по сравнению с ручной микроскопией эта доля не должна превышать 10–20%.
  • 8. 71“Оптический журнал”, 78, 1, 2011 4.4. Подсистема контроля качества препарата (ПКК) Референсная оценка качества препарата, предназначенная для сравнения с оценкой ка- чества, автоматически сформированной под- системой контроля качества (ПКК), может вы- полняться при просмотре врачом виртуального слайда подсистемы навигации. Соответствую- щие оценки врача с помощью средств ПКК до- писываются в ВСПН, формируя РВСПКК. В МЕКОС-Ц2 модули ПКК и ПСВ, предназна- ченные для автоматического анализатора маз- ков крови, работают как единое целое, поэтому автоматические и референсные оценки качества препарата представлены в ВС и РВС подсисте- мы сбора выборки. Оцениваются доли “ложно- качественных” (автоматическая оценка – нор- мальное качество, референсная оценка – ненор- мальное качество) и “ложнонекачественных” препаратов (автоматическая оценка – ненор- мальное качество, референсная оценка – нор- мальное качество). В связи с расплывчатостью существующих рекомендаций по требуемому качеству препаратов результаты испытаний данной подсистемы носят справочный харак- тер. Доля ложноотрицательных препаратов, как и доля ложноотрицательных траекторий, характеризует процент препаратов, ошибочно взятых системой на обслуживание. Суммарно эти доли не должны превышать 10–15%, чтобы не увеличивать существенно долю отказов от об- служивания. Фактически ПКК предназначена для обеспечения заданных характеристик ПСВ и может предъявлять более жесткие требования к качеству препарата, чем это обычно делается при ручной микроскопии. Результаты данного тестирования могут помочь сотрудникам лабо- ратории добиться более высокой эффективно- сти работы автоматической методики за счет улучшения качества пробоподготовки. 4.5. Подсистема сортировки (ПС) Результаты автоматической сортировки объ- ектов, находящихся в галерее ВСгал, представ- лены галереями ВСсорт изображений клеток каждого типа, а также галереей изображений автоматически обнаруженных объектов, не от- несенных подсистемой сортировки (ПС) ни к одному из заданных типов (рис. 5). В связи с тем, что этап испытаний данной подсистемы возможен только при условии удовлетвори- тельной работы подсистемы сбора выборки, то есть при достижении заданных вероятностей правильности сбора выборки, референсная со- ртировка может выполняться интерактивным перераспределением врачом изображений кле- ток галерей. Подсистема сортировки таким образом становится единственной подсисте- мой, которую необходимо оценивать в полном объеме стандарта медицинских испытаний [4]. Оцениваются доли ложноположительных, лож- ноотрицательных анализов, а также чувстви- тельность и специфичность ПС. Отметим, что в стандарте [4] ничего не говорится о требуемых значениях оценок результатов испытаний. Эти значения могут быть различны для разных ре- жимов эксплуатации КАМ. В полностью ав- томатическом режиме выполнения анализа необходимы высокие характеристики работы ПС. В автоматизированном режиме “support”, аналогичном режиму референсной проверки подсистемы сортировки, точность автоматиче- ской сортировки может быть существенно ниже чем при ручной микроскопии, более того, оцен- ки ошибок сортировки по типам могут быть заменены оценкой среднего процента правок врачом всех галерей сортировки. Приемлемым с точки зрения трудозатрат врача по сравне- нию с ручной микроскопией является процент правок до 10%. В настоящее время основным режимом работы комплексов МЕКОС-Ц2 яв- ляется режим “support”. Накапливая в этом режиме архив РВСсорт, мы получаем возмож- ность разрабатывать новые версии ПС, при- ближающие ее характеристики к необходимым характеристикам полностью автоматического анализатора. Отметим, что достижение высо- ких характеристик ПС является весьма важной задачей, при решении которой высококвали- фицированный врач может быть полностью ис- ключен из процесса анализа основного потока препаратов. 5. Трудоемкость поэтапной схемы медицинских испытаний Как было отмечено выше, объем испытаний подсистемы виртуального микроскопа может быть однократным и ограниченным ввиду стан- дартного характера его средств. Основные тру- дозатраты врача-эксперта связаны с необходи- мостью просмотра виртуального слайда, форми- руемого подсистемой навигации. Оценивается изображение траектории просмотра, бегло про- сматривается слайд для оценки приемлемости биоматериала в выбранной области просмотра.
  • 9. 72 “Оптический журнал”, 78, 1, 2011 Трудозатраты врача при этом составляют менее 50% от затрат на анализ мазка при прямой ми- кроскопии. Проверка сбора выборки примерно соответствует трудозатратам при прямой руч- ной микроскопии. Трудозатраты проверки со- ртировки невелики и соответствуют примерно 10% затрат прямой микроскопии. Испытания подсистемы измерений фактически относятся к этапу технических испытаний и могут прово- диться без участия врачей. Таким образом, при гораздо более полном и всестороннем исследовании качества функ- ционирования автоматического анализатора, дополненном формированием реалистичных моделей внешней среды, пригодных для много- кратного использования, суммарные трудоза- траты врачей при выполнении первичных ис- пытаний примерно в полтора раза превышают трудозатраты традиционной схемы испытаний. Вторичные испытания наиболее проблемных подсистем сбора выборки, контроля качества и сортировки, выполняемые на базе референсных виртуальных слайдов, могут выполняться в полностью автоматическом режиме без участия врачей. 6. Робастность и адаптация Для медицинских микроскопических изо- бражений характерна чрезвычайно высокая вариабельность практически всех признаков, связанная с биологической индивидуальной из- менчивостью и неконтролируемыми параметра- ми процесса пробоподготовки, в частности: заранее неизвестно количество однород-– ных зон, присутствующих на изображении, и число типов объектов, присутствующих в пре- парате; заранее неизвестно, по каким именно при-– знакам окажется возможным разделение. Это касается как задач сегментации (выделения од- нородных областей), так и задач классификации (распределения выделенных объектов по типам). Поэтому попытки применить обычную стати- стику и получить пороги для оценки параметров объектов анализа оказываются неудачными. Для решения задачи анализа изображений рассматриваемого типа, по нашему мнению, следует применять адаптивные и устойчивые методы. В комплексе МЕКОС-Ц2 используются следующие идеи. 1. Задачи сегментации изображения, клас- сификации объектов на однородные группы ре- шаются методами кластеризации без учителя. 2. Значимость полученных кластеров оцени- вается с помощью специально подобранных ста- тистических критериев. 3. Используется механизм высказывания гипотез и их последующей проверки. Эти ги- потезы связаны с количеством областей на изо- бражении, количеством типов объектов в пре- парате, положением границ, разделяющих эти группы. 4. Классификация может осуществляться после кластеризации с предварительным выде- лением группы однородных объектов. 5. При классификации группы объектов учитывается ее относительное положение в пространстве признаков относительно других групп. Рассмотренные идеи реализованы в алгорит- мах подсистемы сбора выборки. Технология РВС позволяет вести их постоянное и полно- ценное тестирование. Заключение Преимуществом схемы РВС является воз- можность накапливать представительную базу разработки и испытаний в процессе эксплуа- тации анализаторов во многих лабораториях в течение длительного времени, используя сеанс формирования РВС как рутинный этап кон- троля качества прибора в лаборатории. Потре- бители, участвующие в пополнении базы РВС МЕКОС-Ц2, систематически получают бесплат- но новые версии, благодаря чему их комплексы микроскопии находятся в постоянном разви- тии. Хотя технология РВС нарушает один из постулатов классической методики испытаний изделий медицинского назначения – незави- симость этапа тестирования от эксплуатации – сам процесс формирования РВС как этап кон- троля качества и наличие режима “support” позволяют избежать возможных негативных медицинских последствий применения новых версий. Адаптируемость и устойчивость ал- горитмов позволяют применять обычные до- ступные в реальной практике методики пробо- подготовки и сравнительно недорогое обору- дование. Результаты медицинских испытаний МЕКОС-Ц2, выполненных в соответствии со стандартом NCCLS H20 и по технологии РВС, представлены в [8, 9]. При применении МЕКОС-Ц2 значительно улучшаются точность анализов, условия труда врача, контроль ка- чества, обучение персонала. Это подтверждено
  • 10. 73“Оптический журнал”, 78, 1, 2011 практикой применения МЕКОС-Ц2 в более чем ста лабораториях. ЛИТЕРАТУРА 1. Медовый В.С., Парпара А.А., Пятницкий А.М., Соколинский Б.З., Демьянов В.Л. Структура си- стемы автоматической микроскопии МЕКОС-Ц2 и методики ее испытаний // Медицинская техни- ка. 2006. № 4. С. 36–41. 2. Медовый В.С., Парпара А.А., Соколинский Б.З., Демьянов В.Л. Комплектации оборудования и системная платформа комплексов автоматизиро- ванной микроскопии // Медицинская техника. 2007. № 2. С. 29–36. 3. Swolin B., Simonsson P. et al. Differential counting of blood leukocytes using automated microscopy and a decision support system based on artificial neural networks – evaluation of DiffMaster Octavia. Clin Lab Haematol. 2003 Jun; 25(3). Р. 139–147. 4. National Committee for Clinical Laboratory Stan- dards (1992). Reference Leukocyte Differential Count and Evaluation of Instrumental Methods: Ap- proved Standards. NCCLS H20-A Villanova, PA. 5. Lundin M., Lundin J., Isola J. Virtual micros- copy // Journal of Clinical Pathology. 2004. № 57. Р. 1250–1251. 6. Парпара А.А., Пятницкий А.М., Соколинский Б.З., Медовый В.С., Демьянов В.Л. Навигация по мазку крови при автоматическом подсчете лейкоци- тарной формулы и эритроцитометрии // Здраво- охранение и медицинская техника. 2005. № 7(21). С. 37–38. 7. Wintrobe’s Clinical Hematology 11th Ed. Lippincot Williams&Wilkins Publisher, 11th edition (Decem- ber 2003). 8. Плясунова С.А., Балугян Р.Ш., Хмельницкий К.Е., Медовый В.С, Парпара А.А., Пятницкий А.М., Соколинский Б.З., Демьянов В.Л., Николаенко Д.С. Автоматизированные методики микроскопиче- ских анализов мазков крови – медицинские ис- пытания комплекса МЕКОС-Ц2 // Клиническая лабораторная диагностика. 2006. № 10. С. 22–24, 33–39. 9. Медовый В.C., Николаенко Д.С., Парпара А.А., Пятницкий А.М., Соколинский Б.З., Демья- нов В.Л., Журкина Т.В., Пальчунова И.Б. Авто- матизация микроскопических анализов мазков крови и контроль качества с применением рефе- ренсных виртуальных слайдов // Клиническая лабораторная диагностика. 2008. № 6. С. 46–50.