Master in Giornalismo e comunicazione
istituzionale della scienza,
Università di Ferrara
PubMed/medline e il reperimento delle
informazioni evidence-based
Eugenio Santoro
eugenio.santoro@marionegri.it
www.slideshare.net/eugeniosantoro
www.twitter.com/eugeniosantoro
Laboratorio di Informatica Medica
Istituto di Ricerche Farmacologiche “Mario Negri”

E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
Esempi di banche dati
bibliografiche
- Medline
- specializzata in informazioni di tipo medico

- Embase
- specializzata in informazioni di tipo medico

- Cochrane Library
- specializzata in revisioni sistematiche in medicina;

- CINAHL
- specializzata in informazioni di tipo infermieristico;

- PsycINFO
- specializzata in informazioni di tipo psichiatrico;

- TOXNET
- insieme di banche dati di tossicologia.

E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
Medline
• MEDlars onLine
• Sviluppata dalla National Library of
Medicine
• Discende dall’Index Medicus (1879)
• Gratuita via web attraverso PubMed (1997)
• >20 milioni di citazioni
• >6000 riviste biomediche internazionali
(52% USA)
• Articoli pubblicati dal 1935
• 76% articoli con abstract
• 70 paesi e 40 lingue
• 88% articoli in inglese
E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
Struttura di un record di Medline 1

E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
Struttura di un record di Medline 2

E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
PubMed
http://www.pubmed.gov
• Versione gratuita sul web di Medline
• Sviluppata nel 1997 dalla National Library
of Medicine – National Center for
Biotechnology Information
• Offre strumenti di ricerca attraverso parole
chiavi su più campi (autore, titolo, termine
MeSH, abstract)
• Uso di operatori logici
• Modalità di ricerca libera/MeSH
E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
Ricerca semplice

E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
La ricerca del termine diabetes è
eseguita su tutti i campi del DB

E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
Dove destinare i risultati

E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
Combinazione di operatori logici

E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
La ricerca avanzata
• La ricerca di un termine può essere forzata
su un campo specifico
• I termini ricercati nei vari campi possono
essere combinati con gli operatori logici
• Utile per eseguire ricerche per:
- Autore
- Rivista

E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
Advanced Search - Search history

E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
Come filtrare una ricerca
Il comando “Filtri”
• Se una ricerca risulta troppo ampia
(troppi risultati) si può restringere
usando alcune possibilità che questo
comando offre, ad es. per:
- gruppi d’età
- data di pubblicazione dell’articolo
- lingua di pubblicazione
- tipo di pubblicazione
E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
I principali filtri che possono essere attivati.
Cliccare su Show additional filters per vedere gli altri

“more” permette di selezionare
altri filtri appartenenti
alla stessa categoria

Per attivare un filtro è sufficiente cliccare sul corrispondente nome
E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
Il vocabolario controllato

E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
Vocabolari controllati –
Thesauri (1)
• I thesauri sono vocabolari di termini
• Ogni parola ha un solo significato
• Ogni concetto è rappresentato sempre e solo
dalla stessa parola
• Limitano problemi linguistici causati da:
- sinonimia: (esempio cancer, neoplasm);
- omonimia: (AIDS come malattia, ma
anche, in inglese, aiuti, strumenti);
- diverse ortografie (come hemophilia e
haemophilia);
- singolari e plurali (cancer/cancers)
E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
Vocabolari controllati –
Thesauri (2)
• L’elemento base del Thesaurus di
Medline è il termine MeSH (Medical
Subject Headings)
• Include
- 40.000 descrittori
- 175.000 sinonimi

E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
La ricerca tramite i termini MeSH

E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
(1)
(2)

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Cenni di MyNCBI

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E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
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Ricezione dei risultati attraverso la posta elettronica

E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
Grazie per l’attenzione
Testi di approfondimento

www.pensiero.it
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Mini guida all'impiego di PubMed e Medline

  • 1.
    Master in Giornalismoe comunicazione istituzionale della scienza, Università di Ferrara PubMed/medline e il reperimento delle informazioni evidence-based Eugenio Santoro eugenio.santoro@marionegri.it www.slideshare.net/eugeniosantoro www.twitter.com/eugeniosantoro Laboratorio di Informatica Medica Istituto di Ricerche Farmacologiche “Mario Negri” E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 2.
    Esempi di banchedati bibliografiche - Medline - specializzata in informazioni di tipo medico - Embase - specializzata in informazioni di tipo medico - Cochrane Library - specializzata in revisioni sistematiche in medicina; - CINAHL - specializzata in informazioni di tipo infermieristico; - PsycINFO - specializzata in informazioni di tipo psichiatrico; - TOXNET - insieme di banche dati di tossicologia. E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 3.
    Medline • MEDlars onLine •Sviluppata dalla National Library of Medicine • Discende dall’Index Medicus (1879) • Gratuita via web attraverso PubMed (1997) • >20 milioni di citazioni • >6000 riviste biomediche internazionali (52% USA) • Articoli pubblicati dal 1935 • 76% articoli con abstract • 70 paesi e 40 lingue • 88% articoli in inglese E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 4.
    Struttura di unrecord di Medline 1 E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 5.
    Struttura di unrecord di Medline 2 E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 6.
    PubMed http://www.pubmed.gov • Versione gratuitasul web di Medline • Sviluppata nel 1997 dalla National Library of Medicine – National Center for Biotechnology Information • Offre strumenti di ricerca attraverso parole chiavi su più campi (autore, titolo, termine MeSH, abstract) • Uso di operatori logici • Modalità di ricerca libera/MeSH E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 7.
    Ricerca semplice E. Santoro,Ferrara 4 ottobre 2013
  • 8.
    La ricerca deltermine diabetes è eseguita su tutti i campi del DB E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 9.
    E. Santoro, Ferrara4 ottobre 2013
  • 10.
    Dove destinare irisultati E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 11.
    Combinazione di operatorilogici E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 12.
    La ricerca avanzata •La ricerca di un termine può essere forzata su un campo specifico • I termini ricercati nei vari campi possono essere combinati con gli operatori logici • Utile per eseguire ricerche per: - Autore - Rivista E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 13.
    E. Santoro, Ferrara4 ottobre 2013
  • 14.
    Advanced Search -Search history E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 15.
    Come filtrare unaricerca Il comando “Filtri” • Se una ricerca risulta troppo ampia (troppi risultati) si può restringere usando alcune possibilità che questo comando offre, ad es. per: - gruppi d’età - data di pubblicazione dell’articolo - lingua di pubblicazione - tipo di pubblicazione E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 16.
    I principali filtriche possono essere attivati. Cliccare su Show additional filters per vedere gli altri “more” permette di selezionare altri filtri appartenenti alla stessa categoria Per attivare un filtro è sufficiente cliccare sul corrispondente nome E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 17.
    Il vocabolario controllato E.Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 18.
    Vocabolari controllati – Thesauri(1) • I thesauri sono vocabolari di termini • Ogni parola ha un solo significato • Ogni concetto è rappresentato sempre e solo dalla stessa parola • Limitano problemi linguistici causati da: - sinonimia: (esempio cancer, neoplasm); - omonimia: (AIDS come malattia, ma anche, in inglese, aiuti, strumenti); - diverse ortografie (come hemophilia e haemophilia); - singolari e plurali (cancer/cancers) E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 19.
    Vocabolari controllati – Thesauri(2) • L’elemento base del Thesaurus di Medline è il termine MeSH (Medical Subject Headings) • Include - 40.000 descrittori - 175.000 sinonimi E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 20.
    La ricerca tramitei termini MeSH E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 21.
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  • 22.
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  • 23.
  • 24.
    Cenni di MyNCBI E.Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 25.
    E. Santoro, Ferrara4 ottobre 2013
  • 26.
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  • 27.
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  • 28.
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  • 29.
    Ricezione dei risultatiattraverso la posta elettronica E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 30.
    Grazie per l’attenzione Testidi approfondimento www.pensiero.it E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013