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Master in Giornalismo e comunicazione
istituzionale della scienza,
Università di Ferrara
PubMed/medline e il reperimento delle
informazioni evidence-based
Eugenio Santoro
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Laboratorio di Informatica Medica
Istituto di Ricerche Farmacologiche “Mario Negri”

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Esempi di banche dati
bibliografiche
- Medline
- specializzata in informazioni di tipo medico

- Embase
- specializzata in informazioni di tipo medico

- Cochrane Library
- specializzata in revisioni sistematiche in medicina;

- CINAHL
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- PsycINFO
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- TOXNET
- insieme di banche dati di tossicologia.

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Medline
• MEDlars onLine
• Sviluppata dalla National Library of
Medicine
• Discende dall’Index Medicus (1879)
• Gratuita via web attraverso PubMed (1997)
• >20 milioni di citazioni
• >6000 riviste biomediche internazionali
(52% USA)
• Articoli pubblicati dal 1935
• 76% articoli con abstract
• 70 paesi e 40 lingue
• 88% articoli in inglese
E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
Struttura di un record di Medline 1

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PubMed
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• Versione gratuita sul web di Medline
• Sviluppata nel 1997 dalla National Library
of Medicine – National Center for
Biotechnology Information
• Offre strumenti di ricerca attraverso parole
chiavi su più campi (autore, titolo, termine
MeSH, abstract)
• Uso di operatori logici
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La ricerca avanzata
• La ricerca di un termine può essere forzata
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• I termini ricercati nei vari campi possono
essere combinati con gli operatori logici
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Vocabolari controllati –
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• I thesauri sono vocabolari di termini
• Ogni parola ha un solo significato
• Ogni concetto è rappresentato sempre e solo
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• Limitano problemi linguistici causati da:
- sinonimia: (esempio cancer, neoplasm);
- omonimia: (AIDS come malattia, ma
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- diverse ortografie (come hemophilia e
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- singolari e plurali (cancer/cancers)
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Vocabolari controllati –
Thesauri (2)
• L’elemento base del Thesaurus di
Medline è il termine MeSH (Medical
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• Include
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Mini guida all'impiego di PubMed e Medline

  • 1. Master in Giornalismo e comunicazione istituzionale della scienza, Università di Ferrara PubMed/medline e il reperimento delle informazioni evidence-based Eugenio Santoro eugenio.santoro@marionegri.it www.slideshare.net/eugeniosantoro www.twitter.com/eugeniosantoro Laboratorio di Informatica Medica Istituto di Ricerche Farmacologiche “Mario Negri” E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 2. Esempi di banche dati bibliografiche - Medline - specializzata in informazioni di tipo medico - Embase - specializzata in informazioni di tipo medico - Cochrane Library - specializzata in revisioni sistematiche in medicina; - CINAHL - specializzata in informazioni di tipo infermieristico; - PsycINFO - specializzata in informazioni di tipo psichiatrico; - TOXNET - insieme di banche dati di tossicologia. E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 3. Medline • MEDlars onLine • Sviluppata dalla National Library of Medicine • Discende dall’Index Medicus (1879) • Gratuita via web attraverso PubMed (1997) • >20 milioni di citazioni • >6000 riviste biomediche internazionali (52% USA) • Articoli pubblicati dal 1935 • 76% articoli con abstract • 70 paesi e 40 lingue • 88% articoli in inglese E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 4. Struttura di un record di Medline 1 E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 5. Struttura di un record di Medline 2 E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 6. PubMed http://www.pubmed.gov • Versione gratuita sul web di Medline • Sviluppata nel 1997 dalla National Library of Medicine – National Center for Biotechnology Information • Offre strumenti di ricerca attraverso parole chiavi su più campi (autore, titolo, termine MeSH, abstract) • Uso di operatori logici • Modalità di ricerca libera/MeSH E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 7. Ricerca semplice E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 8. La ricerca del termine diabetes è eseguita su tutti i campi del DB E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 9. E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 10. Dove destinare i risultati E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 11. Combinazione di operatori logici E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 12. La ricerca avanzata • La ricerca di un termine può essere forzata su un campo specifico • I termini ricercati nei vari campi possono essere combinati con gli operatori logici • Utile per eseguire ricerche per: - Autore - Rivista E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 13. E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 14. Advanced Search - Search history E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 15. Come filtrare una ricerca Il comando “Filtri” • Se una ricerca risulta troppo ampia (troppi risultati) si può restringere usando alcune possibilità che questo comando offre, ad es. per: - gruppi d’età - data di pubblicazione dell’articolo - lingua di pubblicazione - tipo di pubblicazione E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 16. I principali filtri che possono essere attivati. Cliccare su Show additional filters per vedere gli altri “more” permette di selezionare altri filtri appartenenti alla stessa categoria Per attivare un filtro è sufficiente cliccare sul corrispondente nome E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 17. Il vocabolario controllato E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 18. Vocabolari controllati – Thesauri (1) • I thesauri sono vocabolari di termini • Ogni parola ha un solo significato • Ogni concetto è rappresentato sempre e solo dalla stessa parola • Limitano problemi linguistici causati da: - sinonimia: (esempio cancer, neoplasm); - omonimia: (AIDS come malattia, ma anche, in inglese, aiuti, strumenti); - diverse ortografie (come hemophilia e haemophilia); - singolari e plurali (cancer/cancers) E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 19. Vocabolari controllati – Thesauri (2) • L’elemento base del Thesaurus di Medline è il termine MeSH (Medical Subject Headings) • Include - 40.000 descrittori - 175.000 sinonimi E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 20. La ricerca tramite i termini MeSH E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 21. E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 22. E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 23. (1) (2) E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 24. Cenni di MyNCBI E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 25. E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 26. E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 27. E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 28. E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 29. Ricezione dei risultati attraverso la posta elettronica E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013
  • 30. Grazie per l’attenzione Testi di approfondimento www.pensiero.it E. Santoro, Ferrara 4 ottobre 2013