Aeromonas spp are ubiquitous Gram negative bacilli, now a day classified within the Aeromonadaceae family. The species of this genus have long been known to cause different type of infections in fish, reptiles and amphibians, and some species mainly, A. hydrophila, A sobria and A. caviae have been described as emergent food borne pathogens implicated in human gastroenteritis ranging from mild diarrhea to chlora-like illness. Aeromonas have been reported in untreated and chlorinated drinking water, fresh food, seawater, milk, vegetable, ice cream, and several meats, including pork, beef and poultry
Proteus spp. are gram-negative, facultatively anaerobic, motile bacilli commonly found in the human intestinal tract. The two main species of medical importance are P. mirabilis and P. vulgaris. They can cause various infections opportunistically. Diagnostic tests include gram stain showing gram-negative rods, growth on blood agar showing swarming motility, and positive reactions in the TSI test and oxidase test. Identification of species involves examining reactions in IMViC tests and analyzing biochemical profiles using systems like API or Vitek.
Medical microbiology deals with microorganisms that cause disease in humans. It aims to characterize, prevent, and control infectious agents. Key techniques include preparing culture media, isolating microbes from clinical samples via serial dilution or plating methods, and characterizing microbes based on morphology, microscopy, biochemical tests, and antibiotic susceptibility. Common tests include Gram staining, IMViC, citrate utilization, catalase production, and disk diffusion for antibiotic testing. These techniques help identify unknown microbes and determine appropriate treatment.
1) Acinetobacter baumannii is a gram-negative bacterium that can cause a variety of healthcare-associated infections. It has emerged as an important nosocomial pathogen due to its ability to develop resistance to multiple antibiotics.
2) In Tanzania, studies have found A. baumannii among isolates from patients with urinary tract infections, surgical site infections, and burn wound infections. Isolates from Tanzanian hospitals have shown high levels of resistance to many front-line antibiotics.
3) The optimal treatment of multi-drug resistant A. baumannii infections is challenging due to its extensive antibiotic resistance. Active surveillance of patients and environmental surfaces is important to control the spread of this problematic
The document discusses the classification and identification of staphylococci and related organisms. It describes key characteristics used to differentiate staphylococci, micrococci, and rothia including their gram staining, morphology, oxygen requirements, catalase production, and salt tolerance. Identification of staphylococcus aureus specifically involves tests for coagulase, clumping factor, protein A, mannitol fermentation, and thermonuclease production. Definitive identification of S. aureus relies on results from multiple tests.
Viruses are non-living particles that can only replicate inside host cells. They contain genetic material surrounded by a protein coat. While viruses exhibit some properties of life, such as the ability to evolve, they cannot perform all biological functions or maintain homeostasis. Viruses come in a variety of shapes and sizes and infect organisms as diverse as plants, animals, bacteria and archaea. They are classified according to their nucleic acid composition and structure. Viruses either enter a dormant latent stage within the host cell or undergo lytic replication, which results in host cell death. Treatment options for viral diseases include vaccines containing weakened live or killed viruses, interferons, antiviral drugs that target specific virus functions, and genetic engineering of attenuated viruses
This document provides an overview of the genus Lactobacillus. It discusses the history of isolation of various Lactobacillus species from different sources. It covers the taxonomy, morphology, habitat, metabolism, roles in food production and as probiotics, pathogenesis, and cultural and biochemical characteristics of Lactobacillus. The document also includes images showing growth of Lactobacillus in different media and biochemical test results.
Este documento describe las características microscópicas, cultivo, hábitat natural, manifestaciones clínicas, enfermedades causadas y factores de virulencia de Enterococcus. Las células son esféricas u ovoides de 0,6 a 2,5 μm que forman cadenas o pares. Se cultivan de forma anaerobia facultativa y son catalasa-negativas. Forman parte de la flora intestinal y también se encuentran en la piel, vagina y tracto respiratorio superior. Pueden causar meningitis, bacteriemia, endocarditis,
Aeromonas spp are ubiquitous Gram negative bacilli, now a day classified within the Aeromonadaceae family. The species of this genus have long been known to cause different type of infections in fish, reptiles and amphibians, and some species mainly, A. hydrophila, A sobria and A. caviae have been described as emergent food borne pathogens implicated in human gastroenteritis ranging from mild diarrhea to chlora-like illness. Aeromonas have been reported in untreated and chlorinated drinking water, fresh food, seawater, milk, vegetable, ice cream, and several meats, including pork, beef and poultry
Proteus spp. are gram-negative, facultatively anaerobic, motile bacilli commonly found in the human intestinal tract. The two main species of medical importance are P. mirabilis and P. vulgaris. They can cause various infections opportunistically. Diagnostic tests include gram stain showing gram-negative rods, growth on blood agar showing swarming motility, and positive reactions in the TSI test and oxidase test. Identification of species involves examining reactions in IMViC tests and analyzing biochemical profiles using systems like API or Vitek.
Medical microbiology deals with microorganisms that cause disease in humans. It aims to characterize, prevent, and control infectious agents. Key techniques include preparing culture media, isolating microbes from clinical samples via serial dilution or plating methods, and characterizing microbes based on morphology, microscopy, biochemical tests, and antibiotic susceptibility. Common tests include Gram staining, IMViC, citrate utilization, catalase production, and disk diffusion for antibiotic testing. These techniques help identify unknown microbes and determine appropriate treatment.
1) Acinetobacter baumannii is a gram-negative bacterium that can cause a variety of healthcare-associated infections. It has emerged as an important nosocomial pathogen due to its ability to develop resistance to multiple antibiotics.
2) In Tanzania, studies have found A. baumannii among isolates from patients with urinary tract infections, surgical site infections, and burn wound infections. Isolates from Tanzanian hospitals have shown high levels of resistance to many front-line antibiotics.
3) The optimal treatment of multi-drug resistant A. baumannii infections is challenging due to its extensive antibiotic resistance. Active surveillance of patients and environmental surfaces is important to control the spread of this problematic
The document discusses the classification and identification of staphylococci and related organisms. It describes key characteristics used to differentiate staphylococci, micrococci, and rothia including their gram staining, morphology, oxygen requirements, catalase production, and salt tolerance. Identification of staphylococcus aureus specifically involves tests for coagulase, clumping factor, protein A, mannitol fermentation, and thermonuclease production. Definitive identification of S. aureus relies on results from multiple tests.
Viruses are non-living particles that can only replicate inside host cells. They contain genetic material surrounded by a protein coat. While viruses exhibit some properties of life, such as the ability to evolve, they cannot perform all biological functions or maintain homeostasis. Viruses come in a variety of shapes and sizes and infect organisms as diverse as plants, animals, bacteria and archaea. They are classified according to their nucleic acid composition and structure. Viruses either enter a dormant latent stage within the host cell or undergo lytic replication, which results in host cell death. Treatment options for viral diseases include vaccines containing weakened live or killed viruses, interferons, antiviral drugs that target specific virus functions, and genetic engineering of attenuated viruses
This document provides an overview of the genus Lactobacillus. It discusses the history of isolation of various Lactobacillus species from different sources. It covers the taxonomy, morphology, habitat, metabolism, roles in food production and as probiotics, pathogenesis, and cultural and biochemical characteristics of Lactobacillus. The document also includes images showing growth of Lactobacillus in different media and biochemical test results.
Este documento describe las características microscópicas, cultivo, hábitat natural, manifestaciones clínicas, enfermedades causadas y factores de virulencia de Enterococcus. Las células son esféricas u ovoides de 0,6 a 2,5 μm que forman cadenas o pares. Se cultivan de forma anaerobia facultativa y son catalasa-negativas. Forman parte de la flora intestinal y también se encuentran en la piel, vagina y tracto respiratorio superior. Pueden causar meningitis, bacteriemia, endocarditis,
This document discusses biochemical tests used to identify and differentiate streptococci species. It describes characteristics of streptococci and how they can be classified based on hemolytic patterns on blood agar and Lancefield grouping. Key differentiation tests discussed include the bacitracin test to identify Streptococcus pyogenes, the CAMP test for S. agalactiae, optochin susceptibility and bile solubility for S. pneumoniae versus viridans streptococci, and inulin fermentation. Biochemical reactions and test results are summarized to differentiate between common streptococci.
1) Aeromonas is a genus of bacteria commonly found in freshwater and brackish aquatic environments that can cause disease in humans and other animals. It includes 17 known species, with A. hydrophila, A. caviae, and A. veronii biovar sobria being the most common human pathogens.
2) Aeromonas bacteria typically cause two main types of infections - gastroenteritis and wound infections, sometimes with bacteremia. Gastroenteritis symptoms include diarrhea, abdominal pain, and vomiting. Wound infections range from mild cellulitis to severe myonecrosis.
3) Identification of Aeromonas involves culturing specimens on selective and general media, followed by biochemical and antimicrobial testing
Viral assays allow for quantifying the number of animal viruses. While bacterial viruses can easily be grown, growing animal viruses is more difficult and expensive, often requiring whole animals or embryonating eggs. When animal cells grow as monolayers, a plaque assay can be used to count viruses by serially diluting the virus in a liquid medium and adding it to separate plates with monolayers of tissue culture cells. After the viruses attach, a semi-solid medium is added to restrict virus movement and allow only adjacent cells to become infected, forming visible plaques that can be counted.
Curso de Microbiología - 14 - Neisseria y EnterobacteriasAntonio E. Serrano
Este documento resume las características de los géneros Neisseria y Enterobacterias. Describe las especies más importantes de Neisseria como N. meningitidis, N. gonorrhoeae y M. catarrhalis, así como sus factores de virulencia, cuadros clínicos, diagnóstico y tratamiento. También describe las características generales de las Enterobacterias, los principales géneros patógenos como Escherichia, Klebsiella y Salmonella, y los factores que determinan su patogenicidad.
The document discusses general principles for diagnosing infectious diseases, including:
1. Physical examination, clinical diagnosis, and epidemiological assessment help identify possible pathogens.
2. Laboratory tests are needed to confirm the causative agent, including microscopic examination, culture-based methods, and immunological or molecular detection techniques.
3. Proper specimen collection, transport, and timing are important for accurate diagnostic results.
Bacterial taxonomy consists of classification, nomenclature, and identification of bacteria. There are two main approaches to bacterial classification - phylogenetic and Adansonian classification. Phylogenetic classification is based on evolutionary relationships while Adansonian classification considers overall similarities between organisms. Identification of bacteria can be done through microscopy, growth characteristics, and biochemical and genetic analysis. Scientific names provide a standardized naming system for bacteria while common names are more casual. A variety of culture and non-culture techniques exist to definitively identify bacterial species.
Carolus Linnaeus established the scientific system of taxonomy in the 18th century, introducing binomial nomenclature and a hierarchical ranking system of taxa from species to kingdom. Over time, new classification systems were proposed based on emerging data from cell morphology, biochemistry, genetics, and molecular analysis. Modern bacterial taxonomy utilizes a polyphasic approach, integrating multiple lines of evidence from phenotypic and genotypic characterization to phylogenetically group and identify bacterial organisms.
Este documento trata sobre las bacterias Streptococcus pneumoniae y Streptococcus pyogenes. S. pneumoniae son cocos GRAM positivos que se presentan en forma de diplococos y producen cápsulas. Pueden causar enfermedades invasivas como neumonía, meningitis y bacteremia, así como enfermedades no invasivas como sinusitis y otitis media. S. pyogenes son cadenas de cocos GRAM positivos que producen hemolisis beta y causan enfermedades supurativas como impetigo y celulitis, así como no sup
DNA viruses and disease is a very important topic for pg entrance.....all important topics and questions have been discussed in detail....do make use of it......
This document summarizes key information about Group B and Group D streptococci. It discusses their classification, pathogenicity, laboratory identification tests like hemolytic patterns on blood agar, CAMP test, bacitracin sensitivity test, and characteristics that differentiate streptococcal species. Information provided includes diseases caused by Streptococcus agalactiae (Group B strep), Enterococcus faecalis, and the differences between enterococci and non-enterococcal Group D streptococci.
This document provides information about gram positive bacilli (rods), including Bacillus species. It discusses their characteristics such as being aerobic or facultatively anaerobic, producing endospores, and being catalase-positive. Key pathogens mentioned are B. anthracis which causes anthrax, and B. cereus which can cause food poisoning. The document then focuses on B. anthracis and B. cereus, describing their microscopy, culture characteristics, biochemical tests for identification, and advanced detection techniques for B. anthracis.
Spirillaceae is a family of bacteria in the phylum Spirochaetes. It includes the genus Spirillum. Spirillaceae bacteria have a rigid, spiral or helical shape. They are gram-negative, typically 5-250 micrometers long and 0.1-0.6 micrometers wide. Their flagella are located between the inner and outer membranes. They can move via twisting caused by their flagella and reproduce through binary fission. Some Spirillum species can cause diseases like rat-bite fever.
Staphylococci are gram positive cocci that commonly inhabit the skin and nasal passages. The most pathogenic species are Staphylococcus aureus and S. epidermidis. S. aureus can cause skin infections, pneumonia, toxic shock syndrome and food poisoning. Diagnosis involves gram staining, culturing on selective media like blood agar, and biochemical tests for catalase and coagulase production. Treatment depends on infection severity and involves drainage, fluid replacement, and antibiotics like methicillin or vancomycin for resistant strains. Prevention involves proper hygiene, wound care, isolation of infected patients, and sterilization of medical equipment.
This document discusses methods for detecting plasmid-mediated class C β-lactamases. It notes that class C β-lactamases have spread from chromosomal genes in some gram-negative species to plasmids, making bacteria resistant to most β-lactams including cephamycins. It reviews various screening and confirmatory tests for detecting these enzymes, including decreased susceptibility to certain antibiotics, inhibitor-based tests using substances like boronic acid or clavulanic acid, and genetic tests like multiplex PCR. No single test is both highly sensitive and specific, so a combination of techniques is recommended.
This document discusses DNA viruses and viral vectors. It begins by introducing viruses and their classification based on host, morphology, genome, and structures. It then describes the Baltimore classification system for viruses. Viral vectors are discussed as effective means of gene transfer that can be manipulated to express therapeutic genes. Several virus types being investigated for gene delivery are described, including retroviruses, adenoviruses, adeno-associated viruses, and herpes simplex viruses. Key properties of viral vectors like safety, toxicity, stability, and cell specificity are outlined. Specific types of viral vectors - retroviral, lentiviral, adenoviral, adeno-associated viral, and herpes simplex viral vectors - are then characterized.
Actinomycetes are a diverse group of filamentous, gram-positive bacteria. They are classified within the domain bacteria and phylum Actinobacteria. Actinomycetes live predominantly in soil where they help break down recalcitrant compounds. While most species are harmless, some can cause infections in humans called actinomycosis. Important genera include Actinomyces, Nocardia, and Streptomyces. Actinomycetes are distinguished from fungi by being prokaryotic, containing peptidoglycan in their cell walls rather than chitin, and having smaller filaments. Diagnosis of actinomycosis involves identifying the pathogen's sulfur granules in biopsy samples
Group A streptococci cause a variety of diseases including streptococcal pharyngitis, tonsillitis, impetigo, scarlet fever, pneumonia, and rarely necrotizing fasciitis and toxic shock syndrome. They are transmitted through respiratory droplets or direct contact. Complications can include acute glomerulonephritis, acute rheumatic fever, and rheumatic heart disease. Control involves proper diagnosis, antibiotic treatment, isolating infected individuals, and preventing transmission.
This document summarizes several Gram positive and Gram negative bacterial species. It describes their morphology, biochemical characteristics, pathogenicity and role in causing diseases like diphtheria, anthrax, listeriosis, plague and more. Identification of these bacteria involves examining their growth patterns, hemolytic properties, enzyme production and reactions on selective media.
Bacteria use quorum sensing to communicate through chemical signals called autoinducers. As the population density increases, the concentration of autoinducers increases to a threshold level that triggers changes in gene expression. This allows bacteria to coordinate behaviors that are advantageous for large populations, such as biofilm formation and virulence factor production. Quorum sensing involves autoinducer synthesis by enzymes like LuxI, detection of the signal by transcriptional regulators like LuxR, and changes in gene expression. While gram-negative bacteria rely mainly on acyl-homoserine lactone autoinducers, gram-positive bacteria use modified oligopeptides. Inhibiting quorum sensing is a potential strategy for treating biofilm and virulence-associated infections.
Este documento describe las características taxonómicas, factores de crecimiento y métodos de identificación de especies del género Haemophilus. Explica que son bacilos Gram negativos que requieren factores X e V para su crecimiento. Detalla los medios de aislamiento como el agar chocolate y pruebas como la de satelitismo para determinar los requerimientos nutricionales. También cubre métodos para identificar especies como H. influenzae mediante pruebas bioquímicas y determinar su sensibilidad a antibióticos.
This document discusses biochemical tests used to identify and differentiate streptococci species. It describes characteristics of streptococci and how they can be classified based on hemolytic patterns on blood agar and Lancefield grouping. Key differentiation tests discussed include the bacitracin test to identify Streptococcus pyogenes, the CAMP test for S. agalactiae, optochin susceptibility and bile solubility for S. pneumoniae versus viridans streptococci, and inulin fermentation. Biochemical reactions and test results are summarized to differentiate between common streptococci.
1) Aeromonas is a genus of bacteria commonly found in freshwater and brackish aquatic environments that can cause disease in humans and other animals. It includes 17 known species, with A. hydrophila, A. caviae, and A. veronii biovar sobria being the most common human pathogens.
2) Aeromonas bacteria typically cause two main types of infections - gastroenteritis and wound infections, sometimes with bacteremia. Gastroenteritis symptoms include diarrhea, abdominal pain, and vomiting. Wound infections range from mild cellulitis to severe myonecrosis.
3) Identification of Aeromonas involves culturing specimens on selective and general media, followed by biochemical and antimicrobial testing
Viral assays allow for quantifying the number of animal viruses. While bacterial viruses can easily be grown, growing animal viruses is more difficult and expensive, often requiring whole animals or embryonating eggs. When animal cells grow as monolayers, a plaque assay can be used to count viruses by serially diluting the virus in a liquid medium and adding it to separate plates with monolayers of tissue culture cells. After the viruses attach, a semi-solid medium is added to restrict virus movement and allow only adjacent cells to become infected, forming visible plaques that can be counted.
Curso de Microbiología - 14 - Neisseria y EnterobacteriasAntonio E. Serrano
Este documento resume las características de los géneros Neisseria y Enterobacterias. Describe las especies más importantes de Neisseria como N. meningitidis, N. gonorrhoeae y M. catarrhalis, así como sus factores de virulencia, cuadros clínicos, diagnóstico y tratamiento. También describe las características generales de las Enterobacterias, los principales géneros patógenos como Escherichia, Klebsiella y Salmonella, y los factores que determinan su patogenicidad.
The document discusses general principles for diagnosing infectious diseases, including:
1. Physical examination, clinical diagnosis, and epidemiological assessment help identify possible pathogens.
2. Laboratory tests are needed to confirm the causative agent, including microscopic examination, culture-based methods, and immunological or molecular detection techniques.
3. Proper specimen collection, transport, and timing are important for accurate diagnostic results.
Bacterial taxonomy consists of classification, nomenclature, and identification of bacteria. There are two main approaches to bacterial classification - phylogenetic and Adansonian classification. Phylogenetic classification is based on evolutionary relationships while Adansonian classification considers overall similarities between organisms. Identification of bacteria can be done through microscopy, growth characteristics, and biochemical and genetic analysis. Scientific names provide a standardized naming system for bacteria while common names are more casual. A variety of culture and non-culture techniques exist to definitively identify bacterial species.
Carolus Linnaeus established the scientific system of taxonomy in the 18th century, introducing binomial nomenclature and a hierarchical ranking system of taxa from species to kingdom. Over time, new classification systems were proposed based on emerging data from cell morphology, biochemistry, genetics, and molecular analysis. Modern bacterial taxonomy utilizes a polyphasic approach, integrating multiple lines of evidence from phenotypic and genotypic characterization to phylogenetically group and identify bacterial organisms.
Este documento trata sobre las bacterias Streptococcus pneumoniae y Streptococcus pyogenes. S. pneumoniae son cocos GRAM positivos que se presentan en forma de diplococos y producen cápsulas. Pueden causar enfermedades invasivas como neumonía, meningitis y bacteremia, así como enfermedades no invasivas como sinusitis y otitis media. S. pyogenes son cadenas de cocos GRAM positivos que producen hemolisis beta y causan enfermedades supurativas como impetigo y celulitis, así como no sup
DNA viruses and disease is a very important topic for pg entrance.....all important topics and questions have been discussed in detail....do make use of it......
This document summarizes key information about Group B and Group D streptococci. It discusses their classification, pathogenicity, laboratory identification tests like hemolytic patterns on blood agar, CAMP test, bacitracin sensitivity test, and characteristics that differentiate streptococcal species. Information provided includes diseases caused by Streptococcus agalactiae (Group B strep), Enterococcus faecalis, and the differences between enterococci and non-enterococcal Group D streptococci.
This document provides information about gram positive bacilli (rods), including Bacillus species. It discusses their characteristics such as being aerobic or facultatively anaerobic, producing endospores, and being catalase-positive. Key pathogens mentioned are B. anthracis which causes anthrax, and B. cereus which can cause food poisoning. The document then focuses on B. anthracis and B. cereus, describing their microscopy, culture characteristics, biochemical tests for identification, and advanced detection techniques for B. anthracis.
Spirillaceae is a family of bacteria in the phylum Spirochaetes. It includes the genus Spirillum. Spirillaceae bacteria have a rigid, spiral or helical shape. They are gram-negative, typically 5-250 micrometers long and 0.1-0.6 micrometers wide. Their flagella are located between the inner and outer membranes. They can move via twisting caused by their flagella and reproduce through binary fission. Some Spirillum species can cause diseases like rat-bite fever.
Staphylococci are gram positive cocci that commonly inhabit the skin and nasal passages. The most pathogenic species are Staphylococcus aureus and S. epidermidis. S. aureus can cause skin infections, pneumonia, toxic shock syndrome and food poisoning. Diagnosis involves gram staining, culturing on selective media like blood agar, and biochemical tests for catalase and coagulase production. Treatment depends on infection severity and involves drainage, fluid replacement, and antibiotics like methicillin or vancomycin for resistant strains. Prevention involves proper hygiene, wound care, isolation of infected patients, and sterilization of medical equipment.
This document discusses methods for detecting plasmid-mediated class C β-lactamases. It notes that class C β-lactamases have spread from chromosomal genes in some gram-negative species to plasmids, making bacteria resistant to most β-lactams including cephamycins. It reviews various screening and confirmatory tests for detecting these enzymes, including decreased susceptibility to certain antibiotics, inhibitor-based tests using substances like boronic acid or clavulanic acid, and genetic tests like multiplex PCR. No single test is both highly sensitive and specific, so a combination of techniques is recommended.
This document discusses DNA viruses and viral vectors. It begins by introducing viruses and their classification based on host, morphology, genome, and structures. It then describes the Baltimore classification system for viruses. Viral vectors are discussed as effective means of gene transfer that can be manipulated to express therapeutic genes. Several virus types being investigated for gene delivery are described, including retroviruses, adenoviruses, adeno-associated viruses, and herpes simplex viruses. Key properties of viral vectors like safety, toxicity, stability, and cell specificity are outlined. Specific types of viral vectors - retroviral, lentiviral, adenoviral, adeno-associated viral, and herpes simplex viral vectors - are then characterized.
Actinomycetes are a diverse group of filamentous, gram-positive bacteria. They are classified within the domain bacteria and phylum Actinobacteria. Actinomycetes live predominantly in soil where they help break down recalcitrant compounds. While most species are harmless, some can cause infections in humans called actinomycosis. Important genera include Actinomyces, Nocardia, and Streptomyces. Actinomycetes are distinguished from fungi by being prokaryotic, containing peptidoglycan in their cell walls rather than chitin, and having smaller filaments. Diagnosis of actinomycosis involves identifying the pathogen's sulfur granules in biopsy samples
Group A streptococci cause a variety of diseases including streptococcal pharyngitis, tonsillitis, impetigo, scarlet fever, pneumonia, and rarely necrotizing fasciitis and toxic shock syndrome. They are transmitted through respiratory droplets or direct contact. Complications can include acute glomerulonephritis, acute rheumatic fever, and rheumatic heart disease. Control involves proper diagnosis, antibiotic treatment, isolating infected individuals, and preventing transmission.
This document summarizes several Gram positive and Gram negative bacterial species. It describes their morphology, biochemical characteristics, pathogenicity and role in causing diseases like diphtheria, anthrax, listeriosis, plague and more. Identification of these bacteria involves examining their growth patterns, hemolytic properties, enzyme production and reactions on selective media.
Bacteria use quorum sensing to communicate through chemical signals called autoinducers. As the population density increases, the concentration of autoinducers increases to a threshold level that triggers changes in gene expression. This allows bacteria to coordinate behaviors that are advantageous for large populations, such as biofilm formation and virulence factor production. Quorum sensing involves autoinducer synthesis by enzymes like LuxI, detection of the signal by transcriptional regulators like LuxR, and changes in gene expression. While gram-negative bacteria rely mainly on acyl-homoserine lactone autoinducers, gram-positive bacteria use modified oligopeptides. Inhibiting quorum sensing is a potential strategy for treating biofilm and virulence-associated infections.
Este documento describe las características taxonómicas, factores de crecimiento y métodos de identificación de especies del género Haemophilus. Explica que son bacilos Gram negativos que requieren factores X e V para su crecimiento. Detalla los medios de aislamiento como el agar chocolate y pruebas como la de satelitismo para determinar los requerimientos nutricionales. También cubre métodos para identificar especies como H. influenzae mediante pruebas bioquímicas y determinar su sensibilidad a antibióticos.
Napisz ergonomiczne i wydajne aplikacje internetowe
* Poznaj metody komunikacji w technologii Ajax
* Wykorzystaj wzorce projektowe
* Stwórz komponenty i stosuj je w swoich projektach
Dynamiczny rozwój internetu, języka HTML, technologii serwerowych i multimedialnych sprawił, że witryny WWW stały się dziełami sztuki, wypełnionymi animacjami, grafiką i dźwiękiem. Nadal jednak po kliknięciu łącza lub przycisku nawigacyjnego musimy czekać na załadowanie się nowej treści z serwera. Bazując na języku JavaScript i jego możliwości stosowania asynchronicznych żądań HTTP służących do pobierania danych z serwera bez konieczności przeładowania strony WWW, opracowano technologię, która pozwala na wyeliminowanie tej niedogodności. Nosi nazwę Ajax, a po jej zastosowaniu witryny i aplikacje WWW pod względem obsługi coraz bardziej przypominają tradycyjne programy.
Książka "Ajax. Zaawansowane programowanie" opisuje możliwości technologii i sposoby tworzenia aplikacji internetowych z jej zastosowaniem. Czytając ją, dowiesz się, jak powstał Ajax i gdzie jest wykorzystywany. Zrozumiesz, na czym polega technika "ukrytej ramki" i pobierania danych w tle, a także poznasz wzorce projektowe dla aplikacji budowanych w oparciu o Ajax. Nauczysz się przetwarzać pliki XML, pobierać kanały RSS i tworzyć usługi sieciowe wykorzystujące protokół SOAP. Napiszesz przeglądarkę poczty i komponenty noszące nazwę widgetów, które będziesz mógł zastosować na innych witrynach WWW. Znajdziesz tu również informacje o najpopularniejszych frameworkach wspomagających pracę twórców aplikacji Ajax.
* Struktura aplikacji Ajax
* Komunikacja aplikacji Ajax z serwerem
* Wzorce projektowe
* Przetwarzanie plików XML
* Tworzenie usług WWW
* Korzystanie z JSON
* Tworzenie widgetów
* Frameworki dla Ajaksa
Zdobądź praktyczną wiedzę niezbędną do tworzenia aplikacji Ajax.
Wyniki badania „E- handel w polskich małych i średnich przedsiębiorstwach”, zrealizowanego przez IAB Polska we współpracy z Ministerstwem Gospodarki, ukazują kluczową rolę edukacji e-przedsiębiorców w dalszym rozwoju tego rynku.
1. Ogólny podział:
1. W zależności od składu i funkcji podłoża dzielimy na:
- proste
- wzbogacone
- specjalne
- wybiórcze (selektywne)
- różnicujące
- transportowe
- transportowo-wzrostowe
2. Ze względu na konsystencję pożywki:
- stałe (dodatek agaru; żelatyny; żelu krzemionkowego. Agar –dodany w
stężeniu – 0,5 – 1% = podłoże półpłynne; 1,5-3% = podłoże stałe)
- płynne
Najprostszym podłożem płynnym jest:
• bulion mięsny – wyciąg mięsny + 1% peptony + 0,5% NaCl
• bulion drożdżowy – wyciąg drożdżowy + pepton + NaCl
Podłoża wzbogacone: są to podłoża z dodatkiem krwi, surowicy lub innych składników,
zawierających dodatkowe czynniki wzrostowe, które umożliwiają hodowlę i rozwój
najbardziej wybrednych pod względem odżywczym bakterii
Podłoża specjalne: są to podłoża z dodatkiem węglowodanów lub innych specyficznych
substratów. Służą m.in. do określania cech hodowanych drobnoustrojów np. właściwości
fermentacyjnych danego drobnoustroju, lub do wytwarzania specyficznych produktów
metabolizmu takich jak: toksyny, antybiotyki itd. Przykładem podłoży specjalnych są
pożywki wchodzące w skład tzw. szeregów biochemicznych używanych do identyfikacji
bakterii – podłoże Kliglera, podłoże Stuarta (wykrywanie urezay)
Podłoża różnicujące: są to podłoża gdzie może rosnąć kilka lub kilkanaście gatunków
drobnoustrojów, ale każdy z nich wytwarza charakterystyczne, łatwe do zróżnicowania
kolonie, co pozwala na ich szybką i dalszą, już ukierunkowaną, szczegółowa identyfikację.
Stałe podłoża różnicujące często są jednocześnie wybiórczymi dla określonej grupy, rodzaju
drobnoustrojów i są nazywane wybiórczo-różnicującymi.
Podłoża wybiórczo-różnicujące: np.
• podłoża do hodowli bakterii z rodziny Enterobacteriaceae: MacConkey, Endo, SS,
Levina; podłoża do hodowli maczugowców: podłoże Clauberga z tulerynem potasu
• podłoże do hodowli gronkowców: podłoże Champamana
• podłoże do hodowli grzybów i pleśni: podłoże Saburoda
Podłoża wybiórcze: są to podłoża z dodatkiem takim substancji, które umożliwiają wzrost
tylko pewnych określonych gatunków bakteryjnych czy grzybiczych a jednocześnie hamują
wzrost innych gatunków. Podłoża te pozwalają na wyizolowanie jednego lub kilku gatunków
bakteryjnych czy grzybiczych z materiału, w którym znajduje się cała masa drobnoustrojów.
Np. podłoże z dodatkiem fioletu krystalicznego, które umożliwia wzrost tylko bakterii Gram-
ujemnych, podłoże do hodowli prądków – Löwenssteina-Jensena, różne podłoża selektywne
do hodowli bakterii z rodzaju Campylobacter, Yersinia, Vibrio, gatunków Listeria
monocytogenes, Helicobacter pylori, itd.; wiele z nich zawiera antybiotyki jako składnik
selekcjonujący drobnoustroje.
2. Do podłoży dodawane są barwniki (wskaźniki), które zmieniają swoje zabarwienie w
zależności od pH podłoża (często jest to błękit bromotymolowy, czerwień fenolowa, purpura
bromkokrezolowa i inne).
Przy podłożach wybiórczo-różnicujących zmiana zabarwienia w czasie wzrostu określonego
drobnoustroju informuje o określonej właściwości w zależności od danego substratu (np.
rozkład laktozy, manitolu itd.)
Hodowla drobnoustrojów może być prowadzona:
• w warunkach tlenowych – cieplarki 35°- 37° C lub 22°-30°C, 42°C
• w warunkach mikroaerofilnych (eksykatory i generatory wytwarzające gaz i/lub jego
mieszaniny o określonym stosunku ilościowym i/lub procentowym np. CO2; H2+CO2
• w warunkach beztlenowych – generatory z gotową
Czas inkubacji hodowli: 24h do 7 doby/ dla grzybów niedoskonałych - 14 dni
Metody hodowli drobnoustrojów, połączone z wyosobnieniem i identyfikacją, nazywane
metodami konwencjonalnymi (klasycznymi) pozostają do chwili obecnej referencyjne w
diagnostyce mikrobiologicznej.
Do hodowli bakterii i grzybów najczęściej wykorzystywane są podłoża stałe, rzadziej płynne.
Posiew materiałów oraz posiewy bakterii lub grzybów na podłoża stałe dokonywany jest przy
użyciu ezy: platynowe, z drutu Kanthalowego, plastikowe =jednorazowe
Najczęściej stosowana technika = technika posiewu redukcyjnego (technika posiewu z
izolacją).
Kolonia jest zbiór komórek wyrastających na podłożu stałym, widoczny gołym okiem.
Posiew redukcyjny
Izolacja
drobnoustrojów
Kolonia bakterii
i/lub grzyba
3. Przyjmuje się (w posiewach półilościowych i ilościowych), że jedna kolonia odpowiada
jednej komórce bakteryjnej lub grzybiczej.
Zamiast liczby komórek przypadających na g (gram) lub ml (mililitr), wprowadzono do badań
ilościowych określenie cfu (ang. colony forming units), czyli jednostki tworzące kolonie.
Przy opisie kolonii (osobnik I rzędu) = MORFOLOGIA KOLONII najczęściej bierze się
pod uwagę:
1. kształt – okrągły, owalny, nieregularny, postrzępiony, gwiazdkowaty, promienisty,
soczewkowaty, głowa meduzy i inne,
2. wielkość – średnica kolonii w mm,
3. brzeg – równy, falisty, zatokowaty, postrzępiony, poszarpany, ząbkowany i inny;
4. powierzchnia – gładka, szorstka, drobno- lub gruboziarnista, pomarszczona matowa,
błyszcząca, brodawkowata itp.;
5. struktura – bezkształtna, szorstka, nitkowata, ziarnista i inne;
6. wyniosłość ponad powierzchnię – brak, wypukła, płaska, stożkowata, o wyniosłym
brzegu i zapadłym środku, kopulasta ze środkiem wzniesionym w postaci guziczka,
itp.;
7. kolor – barwa w świetle odbitym i przepuszczalnym, zabarwienie samej kolonii,
zabarwienie podłoża (barwniki rozpuszczalne). Najczęstsze barwy – biała, żółta,
pomarańczowa, czerwona, czarna, zielona, niebieska, brązowa, i inne;
8. przejrzystość – przejrzysta, mętna, przeświecająca, opalizująca, nieprzejrzysta
9. konsystencja – masłowata, sucha, lepka, błoniasta, skórzasta, ciągła, śluzowata,
10. zapach – mdławy (np. Pseudomonas aeruginosa = kredki świecowe, jaśmin), kwaśne
= gronkowce, piwa, miodu, gliny itp.,
11. zawieszalność – zdolność do tworzenia jednolitej zawiesiny w roztworze soli
fizjologicznej – łatwa; niezawieszalna – grudkowa,
12. inne cechy, takie jak: typ hemolizy na podłożu z dodatkiem krwi:
- typ β – całkowita liza wokół kolonii
- typ α – częściowa liza, zazielenienie wokół kolonii
- typ γ – brak hemolizy
Typy wzrostu na podłożach płynnych, jako ocena morfologii niektórych drobnoustrojów,
wiążą się ściśle ze sposobem oddychania.
Drobnoustroje tlenowe rosną na powierzchni podłoża płynnego; względne beztlenowce
powodują zmętnienie całej pożywki, a beztlenowce tworzą osad na dnie próbówki – np.
wzrost drobnoustrojów na podłożu półpłynnym Schedlera.
4. Podłoża opis:
Agar MacConkey – podłoże wybiórczo-różnicujące; służy do izolacji pałeczek Gram-
ujemnych z materiałów klinicznych. Jest to podłoże diagnostyczne o słabej wybiórczości.
Zawartość soli żółci i fioletu krystalicznego hamuje wzrost bakterii Gram-dodatnich i Gram-
ujemnych, które mają duże wymagania odżywcze. Zawartość laktozy jako jedynego cukru
pozwala na odróżnienie pałeczek laktozo-dodatnich od laktozo-ujemnych. W obecności
zawartego w podłożu wskaźnika – czerwieni obojętnej, wskutek zależnego od rozkładu
laktozy zakwaszenia środowiska, kolonie bakterii rozkładających laktozę zabarwiają się na
kolor różowy. Kolonie, które aktywnie rozkładają laktozę (np. Escherichia coli), są ponadto
otoczone różową strefa wytrąconych soli kwasów żółciowych. Kolonie szczepów
rozkładających laktozę słabo lub z opóźnieniem (np. Citrobacter sp.) mogą pozostać
bezbarwne lub stają się lekko różowe dopiero po 48 godzinach hodowli. Pałeczki laktozo-
ujemne (np. Shigella sp.; Salmonella sp.; Pseudomonas sp.;) mają bezbarwne kolonie.
Podłoże hamuje mgławicowy (rozpełzliwy) wzrost bakterii z rodzaju Proteus np. Proteus
mirabilis.
5. 2.4.1. Identyfikacja i wykonanie antybiogramu dla pałeczki z rodziny
Enterobacteriaceae – Escherichia coli.
2.4.2. Wykonanie preparaty mikroskopowego z kolonii bakteryjnej barwionego metodą
Grama (Załacznik 1).
2.4.3. Wykonanie testu bibułowego – wykrywanie indolu.
2.4.4. Wykonanie krótkiego szeregu biochemicznego dla pałeczek z rodzaju
Enterobacteriaceae:
2.4.4.1. Podłoże Kliglera: jest to stałe podłoże diagnostyczne dla pałeczek
Gram-ujemnych o małych wymaganiach odżywczych, szczególnie
używane w diagnostyce Enterobacteriaceae. Pozwala ono zbadać zdolność
rozkładu glukozy, laktozy i wytwarzanie siarkowodoru. Przygotowane jest
w probówkach w postaci małych półskosów (rysunki 1, 2, 3,). Podłoże
wymaga starannego posiewu zarówno w części słupkowej (wkłucie), jak i
skośnej. Proporcja masy podłoża do posianego inokulum w obu częściach
Pałeczka Gram-ujemna
z rodziny
Enterobacteriaceae –
fermentująca laktozę
Escherichia coli
Wykonanie preparatu
met. Grama
Test bibułowy –
wykrywanie indolu
Rząd biochemiczny
lub identyfikacja
met. automatyczna
karty GNI+
Wykonanie
antybiogramu: met.
krążkowo-dyfuzyjna,
E-testy , met.
automatyczna
6. jest odwrotna – w części słupkowej przy małym inokulum jest dużo
podłoża, a w skośnej odwrotnie. Podłoże zawiera między innymi glukozę i
laktozę (w proporcji 1:10), tiosiarczan i jony żelaza, które są wskaźnikiem
wytwarzania H2S, oraz wskaźnik pH.
Rozkład glukozy przejawia się zakwaszeniem i zażółceniem wyjściowo
łososiowego podłoża. Zmiana postępuje szybciej w części skośnej, gdzie
wkrótce pojawia się powrót do barwy wyjściowej, z powodu wtórnej
alkalizacji będącej wynikiem rozkładu aminokwasów (skos łososiowy +
słupek żółty = rozkład glukozy – schemat III-3). Jeżeli będzie rozkładana
laktoza, żółte zabarwienie obu części utrzymuje się przez wiele godzin
(skos żółty + słupek żółty = rozkład laktozy – schemat III-2).
Brak rozkładu cukrów wiąże się z alkalizacją pożywki, która pogłębia
swoją wyjściową barwę – przyjmując kolor czerwony – schemat III -1.
Wytwarzanie w czasie fermentacji cukrów dużych ilości CO2 lub H2
uwidacznia się przez rozerwanie lub unoszenie podłoża.
Tworzenie się H2S z tiosiarczanu zachodzi powoli w kwaśnym środowisku
słupka i powoduje powstawanie nierozpuszczalnego czarnego strątu
siarczku żelaza. Ocena podłoża powinna być dokonana po 24 godzinach.
1. 2. 3.
Schemat III. Podłoże Kliglera i efekt fermentacji cukrów – 1. - brak frementacji cukrów; 2. -
rozkład laktozy; 3. – rozkład glukozy
2.4.4.2 . Rozkład mocznika (wytwarzanie ureazy) – najpopularniejsze
podłoże ubogie, podłoże Stuarta – w postaci płynnej. Podłoże to zawiera
między innymi mocznik (2%), tryptofan oraz wskaźnik pH – czerwień
fenolową . Bakterie posiewa się na podłoże i inkubuje przez 24 godziny w
temperaturze 37°C. Bakterie wytwarzające enzym ureazę rozkładają mocznik
do NH3 i CO2. Powstający w trakcie hodowli NH3 alkalizuje podłoże i
powoduje zmianę barwy z żółtej (schemat IV – 1) na różowoamarantową
(schemat IV – 2).
7. Dodanie do podłoża odczynnika Ehrlicha w skład, którego wchodzi : p-
dimetyloaminobenzaldehyd, alkohol amylowy i stężony kwas solny - w
przypadku reakcj dodatniej powoduje pojawienie się ciemnoamarantowej
obrączki na powierzchni podłoża (tryptofan zawarty w podłożu za
pośrednictwem tryptofanazy przekształcany jest w indol, skatol i kwas
pirogronianowy i NH3.
1. 2. 3.
Schemat IV. Podłoże – rozkład mocznika (wytwarzanie ureazy); 1- brak wytwarzania ureazy,
2-wytwarzanie ureazy, 3- wytwarzanie indolu.
Tabela 2. Wstępna identyfikacja pałeczek Gram-ujemnych z rodziny Enterobacteriaceae na
podstawie wyniku reakcji biochemicznych uzyskanych na podstawie krótkiego szeregu
biochemicznego.
Gatunek Glukoza Laktoza Gaz H2S Ureaza Indol
E. coli + + + (-) (-) +
Klebsiella sp. + + + (-) + +/-
Enterobacter sp. + + + (-) (-) (-)
Citrobacter sp. + + + + (-) +/-
Serratia marcescens + (-) (-) (-) (-) (-)
Proteus mirabilis + (-) + + + (-)
Proteus vulgaris + (-) +/- + + +
Morgalella morgani/Providentia
rettgeri
+ (-) (-) (-) + +
Salmonella sp. + (-) +/- + (-) (-)
Shigella sp. + (-) +/- (-) (-) +/-
8. Pałeczki Gram-ujemne niefermentujące:
Np. Pseudomonas aeruginosa
Wzrost kolonii
P.aeruginosa na
agarze MacConkey’u
Kolonie laktozo-
ujemne
Wzrost kolonii
P.aeruginosa na podłożu
Columbia agar + 5%
krwinek baranich
9. Opis testu API20N
Zestaw do identyfikacji niefermentujących pałeczek Gram-ujemnych nie należących do
rodziny Enterobacteriaceae - API 20NE (Nr kat. 20050 firmy, bioMérieux) jest
wystandaryzowaną mikrometodą do identyfikacji drobnoustrojów nie należących do
Enterobacteriaceae, takich jak: Psudomonas spp., Acinetobacter spp., Flavobacterium spp.,
Vibrio spp., Aeromonas spp. i inne.
Skład testu
Test API 20NE (bioMérieux) składa się z 20 mikrostudzienek zawierających
odwodnione substraty i podłoża tworzące szereg biochemiczny, w skład którego wchodzi 8
testów powszechnie stosowanych, takich jak: redukcja azotanów, wytwarzanie indolu,
fermentacja glukozy, dehydrolaza argininy, ureaza, hydroliza eskuliny, hydroliza żelatyny,
β-galaktozydaza oraz 12 testów asymilacyjnych takich jak: asymilacja glukozy, arabinozy,
mannozy, mannitolu, N–acetyloglukozaminy, maltozy, glukonianu, kaprynianu, adypinianu,
jabłczanu, cytrynianu, octanu fenylu, które umożliwiają określenie zdolności adaptacji
enzymatycznej badanych drobnoustrojów.
Materiały (firmy bioMérieux)
1. Test API 20NE (Nr kat. 20050) z Kartami Wyników
2. NaCL 0,85% Medium (2 ml) (Nr kat. 20070)
3. McFarland Standard (0,5) (Nr kat. 70900)
4. Jałowy olej mineralny (Nr kat. 70100)
5. Odczynniki Griessa do wykrywania azotynów – NIT 1 (Nr kat. 70440) oraz NIT 2
(Nr kat. 70450)
6. Odczynik JAMES do wykrywania indolu (Nr kat. 70540)
7. Odczynnik OX do wykrywania oksydazy (Nr kat. 70460)
8. Książka Kodów API 20 NE (Nr kat. 20090)
Wykonanie
Test API 20NE wykonano wg standardowej procedury podanej przez producenta w
następujących etapach:
9. Przygotowanie pasków testu API 20NE.
10. Przygotowanie badanej zawiesiny bakteryjnej.
11. Napełnienie pasków testu API 20NE sporządzoną zawiesiną bakteryjną.
10. 12. Inkubacja testów w temperaturze 30°C przez 48 godzin.
13. Odczyt szeregu biochemicznego po 24 godzinach zgodnie z Tabelą Odczytu
(Załącznik 1) oraz zapis wyników na Karcie Wyników.
14. Dalsza inkubacja testu API 20NE.
15. Ponowny odczyt wyników reakcji biochemicznych w celu uzyskania 7 - cyfrowego
kodu numerycznego, będącego ostateczną identyfikacją gatunkową pałeczek Gram-
ujemnych niefermentujących odczytaną z Książki Kodów.
12. Odczyt API20N po inkubacji w 30°C w warunkach tlenowych przez 24 godziny.
2.4.3. Wykonanie oznaczenia lekooporności:
2.4.3.1. Oznaczanie lekooporności metodą krążkowo-dyfuzyjną Kirby-Bauera
Metoda krążkowo-dyfuzyjna Kirby-Bauera jest oparta na dyfuzji antybiotyku
zawartego w krążku do podłoża. Antybiotyk dyfunduje promieniście przez agar, tworząc
gradient stężeń. Największa jego koncentracja występuje przy brzegach krążka i spada wraz z
odległością od krążka. Wielkość strefy zahamowania wzrostu bakterii jest wprost
proporcjonalna do stopnia wrażliwości bakterii na antybiotyk - im większa jest strefa
zahamowania, tym bakteria jest bardziej wrażliwa.
W zależności od wielkości strefy, bakterie określa się jako: wrażliwe, średnio wrażliwe lub
oporne na podstawie przyjętych standardów (M100-S10NCCLS, 2000). Metoda krążkowo-
dyfuzyjna jest najczęściej używaną metodą testowania lekooporności. Jest ona dobrze
wystandaryzowana, powtarzalna, relatywnie tania. Posiada jednak ograniczenia. Nie jest
wiarygodna w testowaniu wolno-rosnących organizmów, bezwzględnych bakterii
beztlenowych. Niektóre antybiotyki słabo dyfundują w agarze, przez co różnica w strefach
zahamowania dla bakterii wrażliwych i opornych jest niewielka, co może prowadzić do
nieprawidłowego określenia lekooporności (antybiotyki glikopeptydowe, polimyksyna B).
2.4.3.2. Materiały:
• podłoże agar Mulera- Hinton (MHA2)
• 1 ml jałowej 0,85% soli fizjologiczna (NaCl)
• krążki bibułowe z antybiotykiem – np. firma Oxoid
• zawiesina bakteryjna – w skali 0,5 McFarlanda
• wzorzec – 0,5 McFarlanda
• jałowe wymazówki
2.4.3.3. Procedura przygotowania inoculum i interpretacja wyników
Inoculum przygotować ze świeżej, osiemnastogodzinnej hodowli bakterii na podłożu
MHA2. Kilka kolonii bakterii zawiesić w jałowym fizjologicznym roztworze 0,85% NaCl,
13. celem uzyskania zawiesiny o gęstości 0,5 w skali McFarlanda, co w przybliżeniu odpowiada
liczbie od 1 × 108
do 2 × 108
c.f.u./ml. Gęstość zawiesiny oznaczyć nefelometrycznie przy
użyciu kolorymetru (Nr kat. V1210 firmy bioMérieux).
Gotową zawiesinę w ciągu 15 minut rozprowadzić na powierzchni podłoża MHA2 przy
użyciu jałowej wymazówki. Po 15 minutach na posiane podłoże nakłożyc krążki z
antybiotykami i chemioterapeutykami. Tak przygotowane płytki w ciągu następnych 15 minut
wstawić do cieplarki i inkubowć w warunkach tlenowych 16-18 godzin, w temperaturze
37°C.
Wyniki interpretować zgodnie z zaleceniami NCCLS, według średnicy uzyskanych stref
zahamowania wzrostu.
Fotografia. Lekwrażliwość krażkowo-dyfuzyjna podłoże Muller-Hinton - P.aeruginosa