الفرق بين البكتيريا الهوائية واللاهوائية يكمن في قدرتها على استخدام الأكسجين في توليد الطاقة، حيث تنتج البكتيريا الهوائية طاقة أكثر مقارنةً باللاهوائية. البكتيريا اللاهوائية تستهلك مواد كيميائية بديلة مثل النترات والكبريتات بدلًا من الأكسجين، ويمكن تصنيفها إلى لا هوائية اختيارية وإلزامية حسب قدرتها على العيش في وجود الأكسجين. وجود البكتيريا اللاهوائية في الجسم قد يؤدي إلى التهاب في حالات محددة مثل الإصابات أو العمليات الجراحية، مما يشير إلى أهمية دراستها في الطب وعلاج الأمراض.