My presentation at the 2014 MetaCenter symposium in Eugene, OR entitled "High-throughput annotation of metagenomes reveals community physiological variation in the mammalian microbiome"
My presentation at the 2014 MetaCenter symposium in Eugene, OR entitled "High-throughput annotation of metagenomes reveals community physiological variation in the mammalian microbiome"
iHT² Health IT Summit New York - Cancer Care Ontario Presentation "Transforming Data into Meaningful Information to Support Improved Patient Care"
Presentation "Transforming Data into Meaningful Information to Support Improved Patient Care"
Learning Objectives:
∙ Understand the information imperative for Cancer Care Ontario (CCO), one of the largest provincial health organizations in Canada, as it supports
population-based care co-ordination and administration for 3 clinical domains in the province of Ontario: cancer care, renal care, and access to
care
∙ Learn how the organization built the Informatics Centre of Excellence to better enable the acquisition, management, reporting, and analysis of one
of the broadest and richest data sets in the country
∙ Discuss concrete examples of how CCO has used leading-edge analytic techniques to drive health system performance.
Vickie Welch
Director, Informatics Centre of Excellence
Cancer Care Ontario
Hakim Lakhani
Director, Reporting and Analytics, Informatics Centre of Excellence
Cancer Care Ontario
iHT² Health IT Summit New York - Cancer Care Ontario Presentation "Transforming Data into Meaningful Information to Support Improved Patient Care"
Presentation "Transforming Data into Meaningful Information to Support Improved Patient Care"
Learning Objectives:
∙ Understand the information imperative for Cancer Care Ontario (CCO), one of the largest provincial health organizations in Canada, as it supports
population-based care co-ordination and administration for 3 clinical domains in the province of Ontario: cancer care, renal care, and access to
care
∙ Learn how the organization built the Informatics Centre of Excellence to better enable the acquisition, management, reporting, and analysis of one
of the broadest and richest data sets in the country
∙ Discuss concrete examples of how CCO has used leading-edge analytic techniques to drive health system performance.
Vickie Welch
Director, Informatics Centre of Excellence
Cancer Care Ontario
Hakim Lakhani
Director, Reporting and Analytics, Informatics Centre of Excellence
Cancer Care Ontario
Гостевая лекция Института биоинформатики. Подробнее: http://bioinformaticsinstitute.ru/lectures/1218
Несмотря на несерьезное название, на лекции разговор пойдет о важной проблеме в работе биоинформатика, почти любая реальная задача которого связана с обработкой и анализом больших данных. И решить задачу нужно не только правильно, но и эффективно. Процесс решения можно условно разделить на две части: «придумать», как решать, и «обучить» этому компьютер. И на лекции речь пойдет именно об эффективном «обучении».
Наивно реализованные алгоритмы работают неприемлемо долго, когда дело доходит до гигабайтов реальных данных. От биоинформатика уже требуются не просто базовые навыки программирования, но и знание технических нюансов. И даже у профессионального программиста уйдет немало времени, например, чтобы выгодно использовать возможности Hadoop при работе с Big Data. Так можно ли современному ученому обойтись без тщательного изучения кучи языков, библиотек и фреймворков и сосредоточиться именно на решении?
Ядерный век прошел, и становится все понятнее, что в фокусе науки 21-го века будут живые системы, медицина, и человек во всех его проявлениях. Здесь осуществляются самые масштабные финансовые вливания, и на эту отрасль человечество возлагает самые большие надежды. Все чаще слышатся предметные обсуждения тем, казавшихся еще недавно научной фантастикой: сможет ли человечество победить старение, рак, и другие смертельные заболевания? Сможет ли менять свой геном по собственному желанию? Будем ли мы хозяевами своим телам в той же мере, как мы хозяйничаем на Земле?
Многие десятилетия биология и медицина развивались как описательные науки. Однако по мере созревания и накопления информации, любая наука рано или поздно переходит на более точный язык - язык математики. Проект "Геном человека" обеспечил технологический прорыв, который будет питать науку о живом еще много лет - но который также поставил много новых глобальных вопросов перед современными учеными.
http://bioinformaticsinstitute.ru/guests
В пятницу 10 октября в 19.00 Мария Шутова (ИоГЕН РАН) выступала в Институте биоинформатики с открытой лекцией, посвященной изучению рака.
Рак -- одна из наиболее распространенных причин смерти по всему миру. В лекции рассматривается, как знания об эволюции, работе генома, репрограммировании, а также использование биоинформатических методов помогли лучше понять, как развивается раковая опухоль и предложить новые методы лечения разнообразных типов рака. Рассмотрены мышиные модели развития рака и интересные результаты, которые были получены с их помощью.
http://bioinformaticsinstitute.ru/lectures
Гостевая лекция Института биоинформатики, 9 октября 2014. Лектор -- Мария Шутова (ИоГЕН РАН).
За последние десять лет плюрипонтентные клетки стали героями двух Нобелевских премий и многих тысяч научных и научно-популярных статей. Их уникальная возможность превращаться в любую клетку взрослого организма до сих пор дает пищу для ума как биологам развития, так и ученым, ищущим способы лечения генетических заболеваний. В лекции будет рассказано о двух типах плюрипотентных клеток: "естественных" (эмбриональные стволовые клетки) и "искусственных" (индуцированные плюрипотентные стволовые клетки). Отдельно мы остановимся на том, как знания о работе транскрипционных факторов помогли репрограммировать клетки, и как эти "искусственные" плюрипотентные клетки можно использовать в медицине.
В своей лекции Андрей Афанасьев рассказал о стартапах в биотехе и биоинформатике и своем биоинформатическом проекте iBinom, разобрал несколько биотехнологических проектов глазами инноваторов и инвесторов, а также коснулся вопроса поиска инвестиций и поделился личным опытом взаимодействия с венчурными фондами и институтами развития.
2. Bioinformatics
• Bio + Informatics
• Application of computer technology to the
management and analysis of biological data.
• The result is that computers are being used to
gather, store, analyse and merge biological data.
• Also known as
Computational Molecular Biology
System Biology
суббота, 15 сентября 12 г.
3. Today
• Molecular Biology: DNA, RNA, Proteins
• Genomics and Sequencing
• Proteomics
суббота, 15 сентября 12 г.