Bago dumating ang mga organisadong relihiyon, ang relihiyon ng mga katutubo sa Timog Silangang Asya ay animismo, kung saan naniniwala ang mga tao na ang mga espiritu ay nananahan sa kalikasan. Ang mga espiritu, tinatawag na anito o diwata, ay dapat alayan at dasalan upang makuha ang kanilang proteksyon at biyaya, habang ang mga kalamidad ay itinuturing na galit ng mga ito. Kasama rin sa kanilang paniniwala ang mga ninuno bilang mga espiritu na nagbibigay ng patnubay at proteksyon.