This presentation gives basic knowledge about 2 groups of big viruses which has been discovered recently. includes shape of them , their classification , members , genome , replication , .... at the end it has tables which compares Megaviruses, Mimiviruse and Mamaviruses . Note that this is a Persian presentations. It was done as a medical student presentation for Qazvin university of medical sciences .

1. ‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

2. ‫فهرست‬
•‫تعریف‬mimivirus
•‫شماتیک‬ ‫شکل‬
•‫تاریخچه‬
•‫ای‬ ‫ستاره‬ ‫شکل‬
•‫ساختار‬mimivirus‫ها‬
•‫محتویات‬mimivirus‫ها‬
•‫ژنوم‬mimivirus‫ها‬
•‫رونویسی‬mimivirus
•‫پاتوژنز‬mimivirus
•‫ها‬ ‫ویروس‬ ‫مگا‬
•‫الکترونی‬ ‫میکروسکوپ‬ ‫شکل‬
•species‫ویروس‬ ‫مگا‬ ‫های‬
•‫تاریخچه‬ ‫و‬ ‫کشف‬
•‫ها‬ ‫مگاویروس‬ ‫بندی‬ ‫دسته‬
•‫ها‬ ‫مگاویروس‬ ‫ساختار‬
•‫ها‬ ‫مگاویروس‬ ‫رپلیکیشن‬
•‫ای‬ ‫مقایسه‬ ‫جداول‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬
‫فهرست‬‫پایان‬

3. ‫تعریف‬Mimivirus
•‫خانواده‬ ‫به‬ ‫متعلق‬ ‫ها‬ ‫ویروس‬ ‫میمی‬Mimiviridae
•dsDNA‫قطعه‬ ‫قطعه‬ ‫غیر‬ ، ‫خطی‬
•‫کپسید‬20‫وجهی‬
•‫بدون‬envelope
•‫نام‬:‫شده‬ ‫کوتاه‬mimicking microbe
•‫میکروبی‬ ‫مقلدهای‬
^ "Viral Zone". ExPASy. Retrieved 15 June 2015.
^ ICTV. "Virus Taxonomy: 2014 Release". Retrieved 15 June 2015.
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

4. •‫دارد‬ ‫بزرگ‬ ‫و‬ ‫پیچیده‬ ‫ژنوم‬
•‫ر‬ ‫کپسید‬ ‫قطر‬ ‫بزرگترین‬ ‫ها‬ ‫ویروس‬ ‫مگا‬ ‫کشف‬ ‫از‬ ‫پیش‬ ‫تا‬‫داشت‬ ‫ا‬
^ "Viral Zone". ExPASy. Retrieved 15 June 2015.
^ ICTV. "Virus Taxonomy: 2014 Release". Retrieved 15 June 2015.
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

5. ‫ها‬ ‫ویروس‬ ‫میمی‬ ‫شماتیک‬ ‫شکل‬
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

6. species‫ویروسها‬ ‫میمی‬ ‫های‬
•Acanthamoeba polyphaga mimivirus (APMV)
• Chrysochromulina Ericina Virus (CeV )
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

7. ‫و‬ ‫تاریخچه‬APMV
•‫در‬ ‫تصادفی‬ ‫طور‬ ‫به‬1992‫در‬amoeba Acanthamoeba polyphaga‫تحقیق‬ ‫هنگام‬
‫شد‬ ‫کشف‬ ‫ها‬ ‫لژیونال‬ ‫روی‬
•‫گرم‬ ‫ای‬ ‫باکتری‬ ‫که‬ ‫کردند‬ ‫فکر‬ ‫اشتباهن‬+‫عه‬
‫دلیل‬ ‫همین‬ ‫به‬Bradfordcoccus‫شد‬ ‫نامیده‬
Richard Birtles; TJ Rowbotham; C Storey; TJ Marrie; Didier Raoult (29 Mar 1997). "Chlamydia-like obligate parasite of free-living
amoebae". The Lancet. 349: 925–926. doi:10.1016/S0140-6736(05)62701-8. PMID 9093261.
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

8. ‫و‬ ‫تاریخچه‬APMV
•‫سال‬2003‫معرف‬ ‫ویروس‬ ‫عنوان‬ ‫به‬ ‫ارگانیسم‬ ‫میکرو‬ ‫این‬ ‫علمی‬ ‫مقاله‬ ‫در‬ ‫فرانسه‬ ‫در‬‫شد‬ ‫ی‬
‫نام‬ ‫و‬mimivirus‫گرفت‬ ‫را‬
•Mimicking microbe
•‫کردند‬ ‫کشف‬ ‫هم‬ ‫را‬ ‫ها‬ ‫ماماویروس‬ ‫بعدن‬ ‫گروه‬ ‫این‬.
‫فهرست‬‫پایان‬
1.Richard Birtles; TJ Rowbotham; C Storey; TJ Marrie; Didier Raoult (29 Mar 1997). "Chlamydia-like obligate parasite of free-living
amoebae". The Lancet. 349: 925–926. doi:10.1016/S0140-6736(05)62701-8. PMID 9093261.
2.Bernard La Scola; Stéphane Audic; Catherine Robert; Liang Jungang; Xavier de Lamballerie; Michel Drancourt; Richard Birtles;
Jean-Michel Claverie; Didier Raoult. (2003). "A giant virus in amoebae". Science. 299 (5615): 2033. doi:10.1126/science.1081867.
PMID 12663918.
3.Nature: "'Virophage' suggests viruses are alive" by Helen Pearson 2008‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

9. Cryoelectron microscopy of the Giant Mimivirus
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬
‫فهرست‬‫پایان‬

10. ‫ساختار‬mimivirus‫ها‬
•‫بعد‬ ‫که‬ ‫بزرگه‬ ‫ویروس‬ ‫چهارمین‬Megavirus chilensis,
Pandoravirus‫و‬Pithovirus‫میگیره‬ ‫قرار‬
•‫قطر‬ ‫با‬ ‫کپسید‬400‫داره‬ ‫نانومتر‬
•‫طول‬ ‫با‬ ‫ویریون‬400‫تا‬800‫نانومتر‬
•‫نیست‬ ‫فیلترابل‬ ‫دیگه‬
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

11. •‫میکروسکوپ‬ ‫زیر‬ ‫کپسیدش‬20‫میشود‬ ‫دیده‬ ‫وجهی‬
•‫که‬ ‫نمیاد‬ ‫نظر‬ ‫به‬envelope‫میکن‬ ‫پیشنهاد‬ ‫این‬ ‫و‬ ‫باشه‬ ‫داشته‬‫ه‬
‫نمیشود‬ ‫خارج‬ ‫اگزوسیتوز‬ ‫با‬ ‫سلول‬ ‫از‬ ‫ویروس‬ ‫که‬
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

12. ‫شکل‬
A) CryoEM image of a starfish-shaped
Mimivirus feature
B) CryoEM image of a defibered Mimivirus
that has lost its starfish-shaped feature
C) CryoEM image of a Mimivirus showing a
gap between five fibered faces
(less density represented by lighter gray
shading)
D) AFM image of DNA ejected from
Mimivirus
‫فهرست‬‫پایان‬‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

13. ‫شکل‬
A) AFM image of several surface fibers
attached to a common central feature
B) AFM image of two detached surface fibers
of Mimivirus
C) CryoEM image of a whole Mimivirus
D) AFM image of internal fibers of Mimivirus
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

14. ‫ها‬ ‫ویروس‬ ‫میمی‬ ‫محتویات‬
• Several mRNA transcripts can be recovered from
purified virions. Like other NCLDVs, transcripts for
DNA polymerase, a capsid protein and a TFII-like
transcription factor were found
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

15. ‫ها‬ ‫ویروس‬ ‫میمی‬ ‫ژنوم‬
•DNA‫ای‬ ‫رشته‬ ‫دو‬
•‫خطی‬
•1,181,404 base pairs
•979 protein-coding genes
•4 genes required
•‫مثل‬ ‫ندارند‬ ‫ویروسها‬ ‫بقیه‬ ‫که‬ ‫دارد‬ ‫ژنهایی‬ ‫داده‬ ‫نشان‬ ‫ژنومش‬ ‫آنالیز‬aminoacyl tRNA
synthetases
•mimivirus contains several genes for sugar, lipid and amino acid metabolism
1."Acanthamoeba polyphaga mimivirus, complete genome". NCBI.
2.Claverie, Jean-Michel; et al. (2006). "Mimivirus and the emerging concept of 'giant' virus". Virus Research. 117 (1): 133–
144. doi:10.1016/j.virusres.2006.01.008. PMID 16469402.
3.Prescott, Lansing M. (1993). 2nd edition, ed. Microbiology. Dubuque, IA: Wm. C. Brown Publishers. ISBN 0-697-01372-3.
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

16. ‫ویروسها‬ ‫میمی‬ ‫ژنوم‬:
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬
https://microbewiki.kenyon.edu/index.php/File:Mimigenome.jpg

17. Replication‫ها‬ ‫ویروس‬ ‫میمی‬
•‫نیست‬ ‫شده‬ ‫شناخته‬ ‫کاملن‬
•‫به‬ ‫که‬ ‫مشخصه‬ ‫فقط‬chemical receptor‫سطح‬ ‫های‬amoeba‫میره‬ ‫داخل‬ ‫و‬ ‫میچسبه‬
•‫میشه‬ ‫شروع‬ ‫اکلیپس‬ ‫فاز‬ ‫میشه‬ ‫وارد‬ ‫وقتی‬
•‫تقریبن‬8‫میشوند‬ ‫نمایان‬ ‫سلول‬ ‫داخل‬ ‫ویریونها‬ ‫از‬ ‫زیادی‬ ‫تعداد‬ ‫بعد‬ ‫ساعت‬
•‫حدود‬24‫میترکه‬ ‫سلول‬ ‫ورود‬ ‫از‬ ‫بعد‬ ‫ساعت‬
•‫محل‬ ‫و‬ ‫عه‬ ‫سیتوپالسم‬ ‫رونویسی‬ ‫محل‬assembling‫میباشد‬ ‫هسته‬.
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

18. La Scola B, Marrie T, Auffray J, Raoult D (2005). "Mimivirus in pneumonia patients". Emerg Infect Dis. 11 (3): 449–52. doi:10.3201/eid1103.040538. PMC 3298252 .
PMID 15757563.
Jump up
^ Marrie TJ, Durant H, Yates L (1989). "Community-Acquired Pneumonia Requiring Hospitalization: 5-Year Prospective Study". Reviews of Infectious Diseases. 11 (4):
586–99. doi:10.1093/clinids/11.4.586. PMID 2772465.
Jump up
^ Saadi, H, Pagnier, I; Colson, P; Cherif, JK; Beji, M; Boughalmi, M; Azza, S; Armstrong, N; Robert, C; Fournous, G; La Scola, B; Raoult, D (Jun 21, 2013). "First Isolation
of Mimivirus in a Patient With Pneumonia.". Clinical Infectious Diseases. 57 (4): e127–34. doi:10.1093/cid/cit354. PMID 23709652.
‫ها‬ ‫ویروس‬ ‫میمی‬ ‫پاتوژنز‬
•Causative agent‫نمونیا‬ ‫های‬ ‫فرم‬ ‫برخی‬
•‫داشت‬ ‫نمونیا‬ ‫که‬ ‫اشخاصی‬ ‫های‬ ‫بادی‬ ‫آنتی‬ ‫از‬ ‫مستقیم‬ ‫غیر‬ ‫طور‬ ‫به‬‫ند‬
‫شدند‬ ‫متوجه‬.
•‫هست‬ ‫باره‬ ‫این‬ ‫در‬ ‫کمی‬ ‫بسیار‬ ‫مقاالت‬
•‫کردن‬ ‫جدا‬ ‫نمونیا‬ ‫به‬ ‫مبتال‬ ‫تانزانیای‬ ‫زنی‬ ‫بدن‬ ‫از‬ ‫را‬ ‫ویروس‬ ‫خود‬ ‫ولی‬‫د‬.
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

19. ^a b Arslan, D.; Legendre, M.; Seltzer, V.; Abergel, C.; Claverie, J.-M. (2011). "Distant Mimivirus relative with a larger genome highlights the fundamental features of Megaviridae". Proceedings
of the National Academy of Sciences. 108 (42): 17486–91. doi:10.1073/pnas.1110889108. PMC 3198346 . PMID 21987820.
^a b Raoult, D.; Audic, S; Robert, C; Abergel, C; Renesto, P; Ogata, H; La Scola, B; Suzan, M; Claverie, JM (2004). "The 1.2-Megabase Genome Sequence of Mimivirus". Science. 306 (5700): ^
Rowbotham, T J (1983). "Isolation of Legionella pneumophila from clinical specimens via amoebae, and the interaction of those and other isolates with amoebae". Journal of Clinical
Pathology. 36 (9): 978–86. doi:10.1136/jcp.36.9.978. PMC 498455 . PMID 6350372.
‫ها‬ ‫ویروس‬ ‫مگا‬
•‫خانواده‬ ‫به‬ ‫متعلق‬ ‫ها‬ ‫ویروس‬ ‫مگا‬Megaviridae
•‫ژنوم‬:dsDNA
•‫کشف‬ ‫زمان‬ ‫تا‬pandoraviruses‫سال‬ ‫در‬2003‫بزرگترین‬ ،
‫داشت‬ ‫را‬ ‫کپسید‬
•‫را‬ ‫ژنوم‬ ‫ترین‬ ‫وپیچیده‬ ‫بزرگترین‬ ‫طور‬ ‫همین‬ ‫و‬
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

20. ‫ها‬ ‫مگاویروس‬ ‫از‬ ‫الکترونی‬ ‫میکروسکوپ‬ ‫شکل‬
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

21. species‫ویروس‬ ‫مگا‬ ‫های‬
‫فقط‬
•Megavirus chilensis (MGVC)
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

22. ‫تاریخچه‬ ‫و‬ ‫کشف‬
•‫توسط‬Prof. Jean-Michel Claverie‫و‬Dr. Chantal Abergel
•‫سال‬ ‫در‬2010‫در‬ ‫شد؛‬ ‫جدا‬ ‫شیلی‬ ‫سواحل‬ ‫از‬ ‫آبی‬ ‫نمونه‬ ‫از‬Las Cruces
•‫درگیر‬ ‫قبلن‬ ‫که‬ ‫شد‬ ‫کشف‬ ‫آزمایشگاهی‬ ‫در‬mimivirus‫بودند‬ ‫ها‬.
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

23. ‫و‬ ‫بندی‬ ‫دسته‬classification
•‫توسط‬ ‫هنوز‬ICTV‫اند‬ ‫نشده‬ ‫بندی‬ ‫دسته‬.
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

24. Pandora & Megavirus
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

25. ‫ها‬ ‫ویروس‬ ‫مگا‬ ‫ساختار‬
•‫قطر‬ ‫با‬ ‫کپسیدی‬ ‫دارای‬440‫است‬ ‫نانومتر‬
•‫تا‬ ‫کپسولش‬ ‫دور‬75‫دارد‬ ‫باکتریایی‬ ‫مانند‬ ‫کپسولی‬ ‫ای‬ ‫ماده‬ ‫نانومتر‬
•‫تقارن‬ ‫کپسید‬20‫وجود‬ ‫بخاطر‬ ‫ولی‬ ‫دارد‬ ‫وجهی‬stargate‫کاملن‬ ‫ها‬20‫دیده‬ ‫وجهی‬
‫نمیشه‬
•‫بزرگترند‬ ‫هم‬ ‫ها‬ ‫باکتری‬ ‫برخی‬ ‫از‬ ‫ویروس‬ ‫مگا‬
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

26. Megavirus
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

27. Replication‫ها‬ ‫مگاویروس‬
•‫ها‬ ‫ویروس‬ ‫میمی‬ ‫همانند‬
•‫میشود‬ ‫اکلیپس‬ ‫دوره‬ ‫وارد‬ ‫و‬ ‫میشود‬ ‫وارد‬ ‫فاگوسیتوز‬ ‫با‬
•‫دقیقتر‬ ‫های‬ ‫بررسی‬seed‫میدهد‬ ‫نشان‬ ‫را‬ ‫سیتوپالسمی‬ ‫های‬
•‫بعد‬ ‫ها‬ ‫سید‬ ‫این‬14‫میشوند‬ ‫درخشان‬ ‫و‬ ‫کامل‬ ‫ویریون‬ ‫ساعت‬
•17‫بشه‬ ‫تکمیل‬ ‫فرایند‬ ‫تا‬ ‫میکشه‬ ‫طول‬ ‫ساعت‬
•‫حدود‬500‫میشه‬ ‫آزاد‬ ‫تا‬
•DNA‫ندارد‬ ‫دخالتی‬ ‫فرایند‬ ‫درطول‬ ‫سلولی‬
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

28. Largest giant viruses with complete
sequenced genomes
Giant virus name Genome Length Genes Capsid diameter Hair cover
Megavirus chilensis 1,259,197
1120 proteins
(predicted)
440 nm 75 nm
Mamavirus 1,191,693
1023 proteins
(predicted)
390 nm 120 nm
Mimivirus 1,181,549
979 proteins (39
non-coding)
390 nm 120 nm
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

29. Specific common features among giant viruses
Giant virus
name
Aminoacyl-tRNA
synthetase
Octocoral-like
MutS
Stargate
Known
virophage
Cytoplasmic
virion factory
Host
Megavirus
chilensis
7 (Tyr, Arg, Met,
Cys, Trp, Asn, Ile)
Yes Yes No Yes
Acanthamoeba
(Unikonta,
Amoebozoa)
Mamavirus
4 (Tyr, Arg, Met,
Cys)
Yes Yes Yes Yes
Acanthamoeba
(Unikonta,
Amoebozoa)
Mimivirus
4 (Tyr, Arg, Met,
Cys)
Yes Yes Yes Yes
Acanthamoeba
(Unikonta,
Amoebozoa)
‫فهرست‬‫پایان‬
‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬

30. ‫بخشی‬ ‫سارا‬-‫مهر‬ ‫اصالنی‬ ‫دکتر‬