SlideShare a Scribd company logo
1 of 35
Download to read offline
Miksi Suomi tarvitsee
genomistrategian?
Espoo, Hanasaari,
Tammikuun 12, 2015
Aarno Palotie M.D., Ph.D.
Muutos teknologiavetoinen
Dramatic increase in scale
22,8
153,8
302,8
362,4
706
2000
0
500
1000
1500
2000
2009 2010 2011 2012 2013 2014
TB(1012bases)
Year
In October, we produced 1,350 human genomes (213 Tb total)!
One human genome every 32 minutes
Muutos on väistämätön
• Tarjoaa Suomelle poikkeuksellisia mahdollisuuksia
• Mahdollisuus täsmällisempään diagnostiikkaan ja
hoitoon (henkilöity lääketiede)
• Mahdollisuus kustannustehokkaampiin
hoitoratkaisuihin
• Mahdollisuus uudenlaiseen liiketoimintaympäristöön
Terveydenhuolto ei pelkkä kustannuserä
vaan mahdollisuus
Terveydenhuollon
kasvustrategia
Suomen talouskriisin luonne ja kasvun
edellytykset
Bengt Holmström, Sixten Korkman ja Matti Pohjola 21.2.2014
“Maamme tietokannat ovat arvokkaita johtuen Suomen
kattavista rekisteripohjaisista tiedostoista.
Esimerkiksi terveysalan tietokannat ovat
lääketieteellisessä tutkimuksessa maailmanlaajuisesti
kiinnostavia. Niiden jalostamista ja kaupallistamista
olisi valtion syytä edistää”.
Reference database
Metabolomics
DNA and RNA sequencing
Imaging
Functional imaging
Metabolome
Lifestyle database
Family history
The opportunity
• An explosion of genomic information from individuals with
known clinical characteristics and disease outcomes
• Learning from these data, we should accelerate progress
in:
• Understanding the basis of inherited disease
• Cancer outcomes and targeted therapy
• Identifying targets for drug development
• Infectious disease
• Clinical interpretation of individual genome sequences
David Altshuler, Global Alliance
The challenge: we can write down genomes,
but we don’t yet know how to read them
12/01/2015
9
Yksittäisellä geenimuutoksella pieni
vaikutus
Referenssitietokanta
Vrt
viitearvot
Genomitieto ja muut trendit
“Genomilääketieteen internet”
Tiedon jakaminen maailmanlaajuisesti
Yhteiset tietoformaatit
Lukuisten toimijoiden yhdistäminen
150 “jäsentä” (mm. THL)
Matchmake
r Exchange
Gene
Matcher
DECIPH
ER
LOVD
Café
Variome
Undiag.
Diseases
Program
Gene
Yenta
Phenom
e Central
GEM.ap
p
ClinGen
Patient-to-
Patient
Matching
Matchmaker
Participants
Support
Monarch
Project
Uusi näkökulma tutkimusetiikkaan,
siirtyminen 2. maailmansodan varjosta seuraavaan
vaiheeseen
• In particular, it highlights, and is guided by, Article 27 of
the 1948 Universal Declaration of Human Rights. Article
27 guarantees the rights of every individual in the world
“to share in scientific advancement and its benefits”
(including to freely engage in responsible scientific
inquiry), and at the same time “to the protection of the
moral and material interests resulting from any
scientific…production of which [a person] is the author”.
Joint appointments
Research
collaborations
Joint appointments
Research collaborations
Sequencing
Bioinformatics
Sanger
Center
Hinxton,
UK
Broad
Institute
/MIT
Boston,
USA
UK USA
Lund
University
Karoliska
Institute
SWE SWE
FiDiPro
Researach
collaborations
FiDiPro
Researach
collaborations
Biopankit
Genomi
Soveltaminen
terveydenhuoltoon
SISu
Sequencing Initiative Suomi
Suomalainen genomistrategia
STM ja Sitra
Biopankki
Genomitieto
Genomitieto
terveydenhoidossa
Biopankki
Genomitieto
✓
Genomitieto
terveydenhoidossa
SITRA-pilotti
Biopankki
Genomitieto
Genomitieto
terveydenhoidossa
Liiketoiminta-
mahdollisuudet
Populaatioisolaatti
Pullonkaulavaikutus
200K
SISU-projekti
Sequencing Initiative Suomi
Kansallinen
Biopankki
Kansalliset
rekisterit
Genomisekvenssi
4% populaatiosta
Kansallinen
genomitiedosto
Viitetiedosto
200 000
kansalaista
Koko perimän tai kaikkien
geenien sekvenssi nyt olemssa
> 16 000
Koko perimän geeniharava
70 000
Genomitieto
Tuotanto
Varastointi
Käyttö
SISU-projekti
Sequencing Initiative Suomi
Kansallinen
Biopankki
Kansalliset
rekisterit
Genomisekvenssi
4% populaatiosta
Kansallinen
genomitiedosto
Viitetiedosto
200 000
kansalaista
Koko perimän tai kaikkien
geenien sekvenssi nyt olemssa
> 16 000 € 31 milj
Koko perimän geeniharava
70 000 € 35 milj
Genomitieto
Tuotanto
Varastointi
Käyttö
€
1/12/2015
2
Bioinformatiivisen tiedon määrä lisääntyy eksponentiaalisesti
http://www.ebi.ac.uk/sites/ebi.ac.uk/files/shared/documents/EMBL_EBI_ASR_201
2_lo-rez.pdf
Genomitiedon säilytys ja käsittely Suomen erityisetuja
Populaatioisolaatti
Pullonkaulavaikutus
Human gene knockouts
Need for human models
Mitä kiireellisimmin tarvitaan?
• Toteuttamissuunnitelma referenssitietokannan
luomiseksi
• Kiirellinen ratkaisu genomitiedon varastomiseksi
• “Säädösviidakon” toiminnallinen selkeytys
(biopankkilaki loistava perusta) ✓
Mitä tarvitaan piakkoin
• Strategia genomitiedon
tietohallintajärjestelyiksi
• Laajaa koulutusta terveydenhuollon
henkilökunnalle
• Kansalaisten tietämyksen lisäämistä
• Uusien tasapainoisten eettisten käytäntöjen
soveltamista (eettisten toimikuntien
opastaminen)
Mitä pitää varoa?
• Epärealistiset odotukset ja katteettomat
lupaukset
• Soveltamista ilman, että perusteet ovat
kunnossa
• Eri toimijoiden siiloutumista – se voi
tuhota koko hankkeen….
Professori Aarno Palotie: Miksi Suomi tarvitsee genomistrategian?

More Related Content

Similar to Professori Aarno Palotie: Miksi Suomi tarvitsee genomistrategian?

Tulevaisuuden hyvinvointi
Tulevaisuuden hyvinvointiTulevaisuuden hyvinvointi
Tulevaisuuden hyvinvointi
Jyrki Kasvi
 

Similar to Professori Aarno Palotie: Miksi Suomi tarvitsee genomistrategian? (20)

Miten tähän on tultu ja miten tästä eteenpäin?
Miten tähän on tultu ja miten tästä eteenpäin?Miten tähän on tultu ja miten tästä eteenpäin?
Miten tähän on tultu ja miten tästä eteenpäin?
 
Leif Schulman – Avaussanat
Leif Schulman – AvaussanatLeif Schulman – Avaussanat
Leif Schulman – Avaussanat
 
Liisa-Maria Voipio-Pulkki: Genomikeskus + syöpäkeskus + neurokeskus + biopank...
Liisa-Maria Voipio-Pulkki: Genomikeskus + syöpäkeskus + neurokeskus + biopank...Liisa-Maria Voipio-Pulkki: Genomikeskus + syöpäkeskus + neurokeskus + biopank...
Liisa-Maria Voipio-Pulkki: Genomikeskus + syöpäkeskus + neurokeskus + biopank...
 
Riikka Saarimaa 15.3.2016 ”paikallisen ruoan tulevaisuus”
Riikka Saarimaa 15.3.2016 ”paikallisen ruoan tulevaisuus”Riikka Saarimaa 15.3.2016 ”paikallisen ruoan tulevaisuus”
Riikka Saarimaa 15.3.2016 ”paikallisen ruoan tulevaisuus”
 
Pohjois-Karjalan biotalousfoorumi Liisa Saarenmaa
Pohjois-Karjalan biotalousfoorumi Liisa SaarenmaaPohjois-Karjalan biotalousfoorumi Liisa Saarenmaa
Pohjois-Karjalan biotalousfoorumi Liisa Saarenmaa
 
Biopankkien liiketoimintamahdollisuudet - Minna Hendolin, Tekes
Biopankkien liiketoimintamahdollisuudet - Minna Hendolin, TekesBiopankkien liiketoimintamahdollisuudet - Minna Hendolin, Tekes
Biopankkien liiketoimintamahdollisuudet - Minna Hendolin, Tekes
 
Tulevaisuuden hyvinvointi
Tulevaisuuden hyvinvointiTulevaisuuden hyvinvointi
Tulevaisuuden hyvinvointi
 
Kimmo Pitkänen esitys 170518 Biopankkilain uudistus ja siinä huomioitavat eet...
Kimmo Pitkänen esitys 170518 Biopankkilain uudistus ja siinä huomioitavat eet...Kimmo Pitkänen esitys 170518 Biopankkilain uudistus ja siinä huomioitavat eet...
Kimmo Pitkänen esitys 170518 Biopankkilain uudistus ja siinä huomioitavat eet...
 
Terveyttä biteistä -ohjelman esittely
Terveyttä biteistä -ohjelman esittelyTerveyttä biteistä -ohjelman esittely
Terveyttä biteistä -ohjelman esittely
 
Tervesos webinaari: Antti Eskelinen: Kuinka yksityisen sairaalan tiedot saati...
Tervesos webinaari: Antti Eskelinen: Kuinka yksityisen sairaalan tiedot saati...Tervesos webinaari: Antti Eskelinen: Kuinka yksityisen sairaalan tiedot saati...
Tervesos webinaari: Antti Eskelinen: Kuinka yksityisen sairaalan tiedot saati...
 
Potilaan ja asiakkaan turvallisuus - kuuluuko se minulle?
Potilaan ja asiakkaan turvallisuus - kuuluuko se minulle?Potilaan ja asiakkaan turvallisuus - kuuluuko se minulle?
Potilaan ja asiakkaan turvallisuus - kuuluuko se minulle?
 
Tulevaisuuden työnteko ja työhyvinvointi - teknologisten ratkaisujen hyödyntä...
Tulevaisuuden työnteko ja työhyvinvointi - teknologisten ratkaisujen hyödyntä...Tulevaisuuden työnteko ja työhyvinvointi - teknologisten ratkaisujen hyödyntä...
Tulevaisuuden työnteko ja työhyvinvointi - teknologisten ratkaisujen hyödyntä...
 
VTT Visions 6: Tiekartta Suomen proteiiniomavaraisuuden parantamiseksi
VTT Visions 6: Tiekartta Suomen proteiiniomavaraisuuden parantamiseksiVTT Visions 6: Tiekartta Suomen proteiiniomavaraisuuden parantamiseksi
VTT Visions 6: Tiekartta Suomen proteiiniomavaraisuuden parantamiseksi
 
Suomen ruokatutkimuksen ja innovoinnin strategia, Johanna Vilkki
Suomen ruokatutkimuksen ja innovoinnin strategia, Johanna Vilkki Suomen ruokatutkimuksen ja innovoinnin strategia, Johanna Vilkki
Suomen ruokatutkimuksen ja innovoinnin strategia, Johanna Vilkki
 
Häme oske elintarvike
Häme oske elintarvikeHäme oske elintarvike
Häme oske elintarvike
 
BioIT-esittely (TKK)
BioIT-esittely (TKK)BioIT-esittely (TKK)
BioIT-esittely (TKK)
 
Kestävää kasvua biotaloudesta manninen
Kestävää kasvua biotaloudesta manninenKestävää kasvua biotaloudesta manninen
Kestävää kasvua biotaloudesta manninen
 
Liisa-Maria Voipio-Pulkki & Kristiina Aittomäki: Mihin suomi tarvitsee kansal...
Liisa-Maria Voipio-Pulkki & Kristiina Aittomäki: Mihin suomi tarvitsee kansal...Liisa-Maria Voipio-Pulkki & Kristiina Aittomäki: Mihin suomi tarvitsee kansal...
Liisa-Maria Voipio-Pulkki & Kristiina Aittomäki: Mihin suomi tarvitsee kansal...
 
Heli Salminen-Mankonen, Auria Biopankki: Kansalaisen tärkein talletus
Heli Salminen-Mankonen, Auria Biopankki: Kansalaisen tärkein talletusHeli Salminen-Mankonen, Auria Biopankki: Kansalaisen tärkein talletus
Heli Salminen-Mankonen, Auria Biopankki: Kansalaisen tärkein talletus
 
Minttu Jaakkola, Nesslingin säätiö
Minttu Jaakkola, Nesslingin säätiöMinttu Jaakkola, Nesslingin säätiö
Minttu Jaakkola, Nesslingin säätiö
 

More from Sitra / Hyvinvointi

More from Sitra / Hyvinvointi (20)

Gaia-X and how to accelerate growth – pathway to EU funding webinar 10 March ...
Gaia-X and how to accelerate growth – pathway to EU funding webinar 10 March ...Gaia-X and how to accelerate growth – pathway to EU funding webinar 10 March ...
Gaia-X and how to accelerate growth – pathway to EU funding webinar 10 March ...
 
Gaia-X Finland – Learning and Sharing Experiences 8.12.2021
Gaia-X Finland – Learning and Sharing Experiences 8.12.2021Gaia-X Finland – Learning and Sharing Experiences 8.12.2021
Gaia-X Finland – Learning and Sharing Experiences 8.12.2021
 
Gaia-X for Finland – Hub launch 17 June 2021
Gaia-X for Finland – Hub launch 17 June 2021Gaia-X for Finland – Hub launch 17 June 2021
Gaia-X for Finland – Hub launch 17 June 2021
 
Pirkka frosti dli ihan testbed rise of the pilots 25.3.2021 print
Pirkka frosti dli ihan testbed rise of the pilots 25.3.2021 printPirkka frosti dli ihan testbed rise of the pilots 25.3.2021 print
Pirkka frosti dli ihan testbed rise of the pilots 25.3.2021 print
 
Sitra seb 20210325_harri rantanen
Sitra seb 20210325_harri rantanenSitra seb 20210325_harri rantanen
Sitra seb 20210325_harri rantanen
 
Sitra rise of the pilots janne enberg
Sitra rise of the pilots janne enbergSitra rise of the pilots janne enberg
Sitra rise of the pilots janne enberg
 
Rise of the pilots 25032021 jaana sinipuro
Rise of the pilots 25032021 jaana sinipuroRise of the pilots 25032021 jaana sinipuro
Rise of the pilots 25032021 jaana sinipuro
 
Reilu datatalouden kypsyysmalli yrityksille -kehittämistyöpaja 23.3.2021
Reilu datatalouden kypsyysmalli yrityksille -kehittämistyöpaja 23.3.2021Reilu datatalouden kypsyysmalli yrityksille -kehittämistyöpaja 23.3.2021
Reilu datatalouden kypsyysmalli yrityksille -kehittämistyöpaja 23.3.2021
 
Building blocks for fair digital society
Building blocks for fair digital societyBuilding blocks for fair digital society
Building blocks for fair digital society
 
Europe rules – making the fair data economy flourish
Europe rules – making the fair data economy flourishEurope rules – making the fair data economy flourish
Europe rules – making the fair data economy flourish
 
Data balance sheet
Data balance sheet Data balance sheet
Data balance sheet
 
04022021 Miapetra Kumpula-Natri: A Human-centric Data strategy and sustainabl...
04022021 Miapetra Kumpula-Natri: A Human-centric Data strategy and sustainabl...04022021 Miapetra Kumpula-Natri: A Human-centric Data strategy and sustainabl...
04022021 Miapetra Kumpula-Natri: A Human-centric Data strategy and sustainabl...
 
Yksilön oikeudet, yrityksen toiminta ja reilu datatalous -kehittämistyöpaja 1...
Yksilön oikeudet, yrityksen toiminta ja reilu datatalous -kehittämistyöpaja 1...Yksilön oikeudet, yrityksen toiminta ja reilu datatalous -kehittämistyöpaja 1...
Yksilön oikeudet, yrityksen toiminta ja reilu datatalous -kehittämistyöpaja 1...
 
Trusted! Quest for data-driven and fair health solutions
Trusted! Quest for data-driven and fair health solutions Trusted! Quest for data-driven and fair health solutions
Trusted! Quest for data-driven and fair health solutions
 
GAIA-X – Lupauksista kohti konkretiaa
GAIA-X – Lupauksista kohti konkretiaaGAIA-X – Lupauksista kohti konkretiaa
GAIA-X – Lupauksista kohti konkretiaa
 
Notes sensotrend sustainable use-of-data
Notes sensotrend sustainable use-of-dataNotes sensotrend sustainable use-of-data
Notes sensotrend sustainable use-of-data
 
Fair data economy score intro
Fair data economy score introFair data economy score intro
Fair data economy score intro
 
Pres parikka 040221
Pres parikka 040221Pres parikka 040221
Pres parikka 040221
 
Sitra data strategy
Sitra data strategySitra data strategy
Sitra data strategy
 
2020 11-03 kriisista yhteiseksi paaomaksi gote nyman
2020 11-03 kriisista yhteiseksi paaomaksi gote nyman2020 11-03 kriisista yhteiseksi paaomaksi gote nyman
2020 11-03 kriisista yhteiseksi paaomaksi gote nyman
 

Professori Aarno Palotie: Miksi Suomi tarvitsee genomistrategian?