SlideShare a Scribd company logo
1 of 10
Bio(logia) Helsingissä:

    Biotieteiden laitos
    
        Biologia
    
        Molekyylibiotieteet

    Ympäristötieteiden laitos
    
        Ympäristömuutos ja -politiikka
    
        Akvaattiset tieteet
    
        Ympäristöekologia

    Muut
    
        HY: Lääkis, eläinlääkis, maa-metsis, farmasia,
        bioinformatiikka
    
        Aalto: bioinformaatioteknologia, ympäristöteknologia
Biologian pääaineet Helsingissä

    Ekologia ja evoluutiobiologia

    Fysiologia ja neurotiede

    Kasvibiologia

    Perinnöllisyystiede

    Yleinen mikrobiologia
Hiirimakit – maailman söpöimmät eläimet





    Puoliapinoita

    N. 45 grammaa

    Yöaktiivisia

    Madagaskarin itärannikko

    Pitkäaikaisseuranta
    vuodesta 2004

    Yli 400 tunnettua
    yksilöä

    Lisääntymiskaudella
    joka yö ansat

    3 kilometriä linjastoa

    Sukkulamatolajiston
    selvittäminen

    Geneettisin
    menetelmin
    ulosteesta

    Ensimmäinen
    pitkäaikaisseuranta
    vapaana elävällä
    eläimellä!

    Iän, sukupuolen yms.
    vaikutus loislajistoon

    Matojen tunnistaminen pienen ribosomaalisen
    yksikön sekvenssin perusteella (n. 1000 bp)

    DNA eristetään madoista, 18S monistetaan
    PCR:llä ja näytteet sekvenoidaan

    Seuraavan sukupolven sekvenointi tuottaa
    yhdestä näytteestä n. 2000 sekvenssiä
→ lopullinen data 400 näytettä kertaa 2000
 sekvenssiä kertaa 1000 nukleotidia

    Ihmisen lisäksi ainoa Alzheimerin taudista
    kärsivä eläin

    Vanhenee vankeudessa – ei luonnossa

    Tavoite sekvenoida 1000 yksilöä
Biologiakilpailu

    Suomen karsinta
    kansainvälisiin biologiaolympialaisiin – 45
    kysymystä lukio-oppimäärästä ja sen
    ulkopuolelta

    Seuraava vaihe joukkueen karsiminen –
    yleensä valmennuskurssilla

    Nelihenkinen joukkue

    Tänä vuonna olympialaiset Bernissä, Sveitsissä
Lisätietoja:

    Nämä slaidit:

    Minä:
    
        tuomas.aivelo@helsinki.fi
    
        http://twitter.com/aivelo
    
        http://www.biocenter.helsinki.fi/bi/evodevo/group_Jernva
Kiitokset

More Related Content

Viewers also liked

Biologia14
Biologia14Biologia14
Biologia14
Bego008
 
Giving the boot to Mendel!
Giving the boot to Mendel!Giving the boot to Mendel!
Giving the boot to Mendel!
Tuomas Aivelo
 
Biologia14
Biologia14Biologia14
Biologia14
Bego008
 
Gilla Jobbet - Ny standard för arbetsmiljöindikatorer
Gilla Jobbet - Ny standard för arbetsmiljöindikatorerGilla Jobbet - Ny standard för arbetsmiljöindikatorer
Gilla Jobbet - Ny standard för arbetsmiljöindikatorer
Tina Bohlin
 
J.C.D2012セミナーまとめ
J.C.D2012セミナーまとめJ.C.D2012セミナーまとめ
J.C.D2012セミナーまとめ
Yusuke Amano
 
Riskhantering och revidering iso 9001 (140515)
Riskhantering och revidering iso 9001 (140515)Riskhantering och revidering iso 9001 (140515)
Riskhantering och revidering iso 9001 (140515)
Tina Bohlin
 

Viewers also liked (20)

Mishra's Birthday PPT
Mishra's Birthday PPTMishra's Birthday PPT
Mishra's Birthday PPT
 
Teste
TesteTeste
Teste
 
(Terrestrial) Malagasy mammals & Parasitism - a force that shapes the world
(Terrestrial) Malagasy mammals & Parasitism - a force that shapes the world(Terrestrial) Malagasy mammals & Parasitism - a force that shapes the world
(Terrestrial) Malagasy mammals & Parasitism - a force that shapes the world
 
Etude de cas e-réputation - groupe 5
Etude de cas e-réputation - groupe 5Etude de cas e-réputation - groupe 5
Etude de cas e-réputation - groupe 5
 
Biologia14
Biologia14Biologia14
Biologia14
 
Genetiikanopetuksesta seminaari110313
Genetiikanopetuksesta seminaari110313Genetiikanopetuksesta seminaari110313
Genetiikanopetuksesta seminaari110313
 
Comunicac..
Comunicac..Comunicac..
Comunicac..
 
Giving the boot to Mendel!
Giving the boot to Mendel!Giving the boot to Mendel!
Giving the boot to Mendel!
 
Uroksen biologiaa
Uroksen biologiaaUroksen biologiaa
Uroksen biologiaa
 
Portfolio Project For B 100
Portfolio Project For B 100Portfolio Project For B 100
Portfolio Project For B 100
 
Etude de cas e-réputation - Groupe 2
Etude de cas e-réputation - Groupe 2Etude de cas e-réputation - Groupe 2
Etude de cas e-réputation - Groupe 2
 
IDG TechNetwork Consumer Audience Survey Snapshot
IDG TechNetwork Consumer Audience Survey SnapshotIDG TechNetwork Consumer Audience Survey Snapshot
IDG TechNetwork Consumer Audience Survey Snapshot
 
Biologia14
Biologia14Biologia14
Biologia14
 
Engl 3120 final project
Engl 3120   final projectEngl 3120   final project
Engl 3120 final project
 
Gilla Jobbet - Ny standard för arbetsmiljöindikatorer
Gilla Jobbet - Ny standard för arbetsmiljöindikatorerGilla Jobbet - Ny standard för arbetsmiljöindikatorer
Gilla Jobbet - Ny standard för arbetsmiljöindikatorer
 
Etude de cas e-réputation - groupe 5
Etude de cas e-réputation - groupe 5Etude de cas e-réputation - groupe 5
Etude de cas e-réputation - groupe 5
 
J.C.D2012セミナーまとめ
J.C.D2012セミナーまとめJ.C.D2012セミナーまとめ
J.C.D2012セミナーまとめ
 
Etude de cas e-réputation - groupe 3
Etude de cas e-réputation - groupe 3Etude de cas e-réputation - groupe 3
Etude de cas e-réputation - groupe 3
 
Riskhantering och revidering iso 9001 (140515)
Riskhantering och revidering iso 9001 (140515)Riskhantering och revidering iso 9001 (140515)
Riskhantering och revidering iso 9001 (140515)
 
Upper secondary school students, their teachers and textbooks - understanding...
Upper secondary school students, their teachers and textbooks - understanding...Upper secondary school students, their teachers and textbooks - understanding...
Upper secondary school students, their teachers and textbooks - understanding...
 

More from Tuomas Aivelo

More from Tuomas Aivelo (20)

Oppikirjavalinnat ja opettajan opetuspainotukset korreloivat vahvasti genetii...
Oppikirjavalinnat ja opettajan opetuspainotukset korreloivat vahvasti genetii...Oppikirjavalinnat ja opettajan opetuspainotukset korreloivat vahvasti genetii...
Oppikirjavalinnat ja opettajan opetuspainotukset korreloivat vahvasti genetii...
 
Choosing course contents - Teachers' approaches to genetics teaching mirror i...
Choosing course contents - Teachers' approaches to genetics teaching mirror i...Choosing course contents - Teachers' approaches to genetics teaching mirror i...
Choosing course contents - Teachers' approaches to genetics teaching mirror i...
 
High-throughput sequencing and latent variable modelling of within-host paras...
High-throughput sequencing and latent variable modelling of within-host paras...High-throughput sequencing and latent variable modelling of within-host paras...
High-throughput sequencing and latent variable modelling of within-host paras...
 
Humans, rats and microbes sharing the urban landscape - A multidisciplinary r...
Humans, rats and microbes sharing the urban landscape - A multidisciplinary r...Humans, rats and microbes sharing the urban landscape - A multidisciplinary r...
Humans, rats and microbes sharing the urban landscape - A multidisciplinary r...
 
Genetics contents and societal issues - what are the approaches the secondary...
Genetics contents and societal issues - what are the approaches the secondary...Genetics contents and societal issues - what are the approaches the secondary...
Genetics contents and societal issues - what are the approaches the secondary...
 
Urban rats in helsinki
Urban rats in helsinkiUrban rats in helsinki
Urban rats in helsinki
 
Mitä geeni tarkoittaa? Kompastuskiviä biologian sisällä ja oppiaineiden välillä
Mitä geeni tarkoittaa? Kompastuskiviä biologian sisällä ja oppiaineiden välilläMitä geeni tarkoittaa? Kompastuskiviä biologian sisällä ja oppiaineiden välillä
Mitä geeni tarkoittaa? Kompastuskiviä biologian sisällä ja oppiaineiden välillä
 
Ruskohiirimakien sisäinen maailma: loisten ja mikrobiotan dynamiikka
Ruskohiirimakien sisäinen maailma: loisten ja mikrobiotan dynamiikkaRuskohiirimakien sisäinen maailma: loisten ja mikrobiotan dynamiikka
Ruskohiirimakien sisäinen maailma: loisten ja mikrobiotan dynamiikka
 
Associations between parasites and microbiota in intestinal communities of wi...
Associations between parasites and microbiota in intestinal communities of wi...Associations between parasites and microbiota in intestinal communities of wi...
Associations between parasites and microbiota in intestinal communities of wi...
 
A case study of augmented reality location-based game for learning conceptual...
A case study of augmented reality location-based game for learning conceptual...A case study of augmented reality location-based game for learning conceptual...
A case study of augmented reality location-based game for learning conceptual...
 
Lukiolaisten, heidän opettajiensa ja oppikirjojen käsitykset geenien toiminnasta
Lukiolaisten, heidän opettajiensa ja oppikirjojen käsitykset geenien toiminnastaLukiolaisten, heidän opettajiensa ja oppikirjojen käsitykset geenien toiminnasta
Lukiolaisten, heidän opettajiensa ja oppikirjojen käsitykset geenien toiminnasta
 
Pikkunisäkkään suolistoloisyhteisön seuranta
Pikkunisäkkään suolistoloisyhteisön seurantaPikkunisäkkään suolistoloisyhteisön seuranta
Pikkunisäkkään suolistoloisyhteisön seuranta
 
Tracking year-to-year changes in intestinal nematode communities of rufous mo...
Tracking year-to-year changes in intestinal nematode communities of rufous mo...Tracking year-to-year changes in intestinal nematode communities of rufous mo...
Tracking year-to-year changes in intestinal nematode communities of rufous mo...
 
Rapid turnover in micro- and macrobiome of free-ranging primate
Rapid turnover in micro- and macrobiome of free-ranging primateRapid turnover in micro- and macrobiome of free-ranging primate
Rapid turnover in micro- and macrobiome of free-ranging primate
 
Lectio Praecursoria - Tuomas Aivelo - 20.11.2015
Lectio Praecursoria - Tuomas Aivelo - 20.11.2015Lectio Praecursoria - Tuomas Aivelo - 20.11.2015
Lectio Praecursoria - Tuomas Aivelo - 20.11.2015
 
Finnish upper secondary school biology textbooks have outdated gene models
Finnish upper secondary school biology textbooks have outdated gene modelsFinnish upper secondary school biology textbooks have outdated gene models
Finnish upper secondary school biology textbooks have outdated gene models
 
Mobiilioppiminen luonnontieteissä / biologiassa
Mobiilioppiminen luonnontieteissä / biologiassaMobiilioppiminen luonnontieteissä / biologiassa
Mobiilioppiminen luonnontieteissä / biologiassa
 
Genetiikan opetus suomalaisessa lukiossa - oppikirjat ja lukiolaisten käsityk...
Genetiikan opetus suomalaisessa lukiossa - oppikirjat ja lukiolaisten käsityk...Genetiikan opetus suomalaisessa lukiossa - oppikirjat ja lukiolaisten käsityk...
Genetiikan opetus suomalaisessa lukiossa - oppikirjat ja lukiolaisten käsityk...
 
Kaiken takana on loinen
Kaiken takana on loinenKaiken takana on loinen
Kaiken takana on loinen
 
Hiirimakien suolistoloiset söpöjä eläimiä ja metagenomiikkaa
Hiirimakien suolistoloiset   söpöjä eläimiä ja metagenomiikkaaHiirimakien suolistoloiset   söpöjä eläimiä ja metagenomiikkaa
Hiirimakien suolistoloiset söpöjä eläimiä ja metagenomiikkaa
 

Biologia, Madagaskar ja IBO

  • 1. Bio(logia) Helsingissä:  Biotieteiden laitos  Biologia  Molekyylibiotieteet  Ympäristötieteiden laitos  Ympäristömuutos ja -politiikka  Akvaattiset tieteet  Ympäristöekologia  Muut  HY: Lääkis, eläinlääkis, maa-metsis, farmasia, bioinformatiikka  Aalto: bioinformaatioteknologia, ympäristöteknologia
  • 2. Biologian pääaineet Helsingissä  Ekologia ja evoluutiobiologia  Fysiologia ja neurotiede  Kasvibiologia  Perinnöllisyystiede  Yleinen mikrobiologia
  • 3. Hiirimakit – maailman söpöimmät eläimet  Puoliapinoita  N. 45 grammaa  Yöaktiivisia  Madagaskarin itärannikko
  • 4. Pitkäaikaisseuranta vuodesta 2004  Yli 400 tunnettua yksilöä  Lisääntymiskaudella joka yö ansat  3 kilometriä linjastoa
  • 5. Sukkulamatolajiston selvittäminen  Geneettisin menetelmin ulosteesta  Ensimmäinen pitkäaikaisseuranta vapaana elävällä eläimellä!  Iän, sukupuolen yms. vaikutus loislajistoon
  • 6. Matojen tunnistaminen pienen ribosomaalisen yksikön sekvenssin perusteella (n. 1000 bp)  DNA eristetään madoista, 18S monistetaan PCR:llä ja näytteet sekvenoidaan  Seuraavan sukupolven sekvenointi tuottaa yhdestä näytteestä n. 2000 sekvenssiä → lopullinen data 400 näytettä kertaa 2000 sekvenssiä kertaa 1000 nukleotidia
  • 7. Ihmisen lisäksi ainoa Alzheimerin taudista kärsivä eläin  Vanhenee vankeudessa – ei luonnossa  Tavoite sekvenoida 1000 yksilöä
  • 8. Biologiakilpailu  Suomen karsinta kansainvälisiin biologiaolympialaisiin – 45 kysymystä lukio-oppimäärästä ja sen ulkopuolelta  Seuraava vaihe joukkueen karsiminen – yleensä valmennuskurssilla  Nelihenkinen joukkue  Tänä vuonna olympialaiset Bernissä, Sveitsissä
  • 9. Lisätietoja:  Nämä slaidit:  Minä:  tuomas.aivelo@helsinki.fi  http://twitter.com/aivelo  http://www.biocenter.helsinki.fi/bi/evodevo/group_Jernva