Successfully reported this slideshow.
We use your LinkedIn profile and activity data to personalize ads and to show you more relevant ads. You can change your ad preferences anytime.
Kaiken takana on loinen
Tuomas Aivelo
Biotekniikan instituutti,
Helsingin yliopisto
Dyna-miitti 2.10.2013
Kaikilla maailman eliöillä on loisia.
Yli puolet maailman eliöistä on loisia.
Mitä on loiset?
Läheisyys
+
Mutualismi
Kommensalismi
Symbioosi
Saalistus /
laidunnus
Parasitoidismi
Ulkoloiset Sisäloiset
Loiselämä
Ongelma:
Loisen pitäisi käyttää niin
paljon isäntää hyödyksi
kuin pystyy vaarantamatta
omaa lisääntymiskykyä.
TR...
Virulenssi
• Kuinka suurta haittaa
kelpoisuudelle tauti aiheuttaa?
• Trade-off: Jos tapat uhrisi
nopeasti, sinun pitää myö...
Tautien eri taktiikat
• Sukupuoliteitse
• Vektorin välityksellä
• Pisaratartunta
• Yms.
Miksei taudeista päästä koskaan
eroon?
John Tenniel
http://www.mpg.de/19341/Computational_di
sease_models?page=3
Monista taudeista on päästy eroon!
• Isorokko
– > rokotukset
• Guineamato
– > hygienia
• Malaria Suomessa
– > elintason no...
Monet taudit ovat vaikeita
• Zoonoosit:
– Uusia tauteja koti- tai villieläimiltä
• Viimeaikaisia mm. HIV, Ebola, influenss...
Madagaskar

Madagaskar
eristyneenä
viimeiset n. 85
miljoonaa vuotta

Ihmisasutus
vakiintui n. 1500
vuotta sitten

Merki...
Ranomafanan
kansallispuisto
• Itäisen Madagaskarin
vuoristosademetsä
• Perustettu 1990
• Kansainvälisen tason
tutkimusasem...
Madagaskarin eläimistö
• Neljä endeemistä nisäkäsryhmää:
– Makit, puoliapinoita
– Tanrekit, afrikkalaisia hyönteissyöjiä
–...
• Puoliapinoita
• Pitkäikäisiä, jopa 10
vuotta luonnossa
• Pieniä
• Suhteellisen
pysyvät reviirit
• Monenlaisissa
elinympä...
Makit
• Puoliapinoita
• Yleisesti naarasdominantteja
• Mallieläin Alzheimerin taudille?
• Vanhenevat vankeudessa, eivät luonnossa
• Horrostavat, naarasdominantteja, yöaktiivis...
Kenttätyö
• Syyskuulta joulukuulle
• Ansat öisin silmien
korkeudelle
• Sisälle banaania
Punkit ja täit:
Ulkoloisten määrä
Mikrosiru
 yksilöt
Karvanäyte
 genetiikka
Morfometriikka
-Paino
-Hännän, hauiksen
ja r...
Opportunistista ulosteenkeräystä

Ansoihin tulee monenlaisia muitakin eläimiä

Isoja makeja voi seurata ja kerätä uloste...
Sukkulamadot
• Prevalenssi lähes 100%
• Helppo eristää
• Paljon tutkittuja, mutta…
Pyrosekvensointi
• Lajintunnistaminen 18S-geenisekvenssin
(ribosomin pieni yksikkö) perusteella
• Yhdessä näytteessä 0-150...
Mitä tehdä miljoonan 700 emäksen
sekvenssin kanssa?
Alustavia tuloksia
• Mustarotilla ja koirilla samaa lajistoa, joka
eroaa hiirimakeista
• Hiirimakien loisia myös mustaroti...
Kysymyksiä?
Lisätietoja
http://twitter.com/aivelo
http://www.biocenter.helsinki.fi/bi/evodevo/group_Jernvall.shtml
http://fifi.voima.f...
Kaiken takana on loinen
Kaiken takana on loinen
Kaiken takana on loinen
Kaiken takana on loinen
Upcoming SlideShare
Loading in …5
×

Kaiken takana on loinen

705 views

Published on

Esitys lukiolaisille LUMA-keskuksen Dyna-miittiin. 2.10.2013

Published in: Education
  • Login to see the comments

  • Be the first to like this

Kaiken takana on loinen

  1. 1. Kaiken takana on loinen Tuomas Aivelo Biotekniikan instituutti, Helsingin yliopisto Dyna-miitti 2.10.2013
  2. 2. Kaikilla maailman eliöillä on loisia. Yli puolet maailman eliöistä on loisia.
  3. 3. Mitä on loiset? Läheisyys + Mutualismi Kommensalismi Symbioosi Saalistus / laidunnus Parasitoidismi Ulkoloiset Sisäloiset
  4. 4. Loiselämä Ongelma: Loisen pitäisi käyttää niin paljon isäntää hyödyksi kuin pystyy vaarantamatta omaa lisääntymiskykyä. TRAGEDY OF COMMONS!
  5. 5. Virulenssi • Kuinka suurta haittaa kelpoisuudelle tauti aiheuttaa? • Trade-off: Jos tapat uhrisi nopeasti, sinun pitää myös siirtyä seuraavaan uhriin nopeasti. ?
  6. 6. Tautien eri taktiikat • Sukupuoliteitse • Vektorin välityksellä • Pisaratartunta • Yms.
  7. 7. Miksei taudeista päästä koskaan eroon? John Tenniel
  8. 8. http://www.mpg.de/19341/Computational_di sease_models?page=3
  9. 9. Monista taudeista on päästy eroon! • Isorokko – > rokotukset • Guineamato – > hygienia • Malaria Suomessa – > elintason nousu
  10. 10. Monet taudit ovat vaikeita • Zoonoosit: – Uusia tauteja koti- tai villieläimiltä • Viimeaikaisia mm. HIV, Ebola, influenssat – Taudit liikkuvat enemmän toiseen suuntaan! • Antibioottiresistenssiä: – Sairaalabakteerit: MRSA, VRE jne. – Malarialoisiot
  11. 11. Madagaskar  Madagaskar eristyneenä viimeiset n. 85 miljoonaa vuotta  Ihmisasutus vakiintui n. 1500 vuotta sitten  Merkittävä määrä eläimiä kuollut sukupuuttoon viimeisen 1000 vuoden aikana  Alkuperäisestä metsäalasta jäljellä noin 15 prosenttia
  12. 12. Ranomafanan kansallispuisto • Itäisen Madagaskarin vuoristosademetsä • Perustettu 1990 • Kansainvälisen tason tutkimusasema, Centre Valbio
  13. 13. Madagaskarin eläimistö • Neljä endeemistä nisäkäsryhmää: – Makit, puoliapinoita – Tanrekit, afrikkalaisia hyönteissyöjiä – Madagaskarinrotat, jyrsijöitä – Falanukit, kissamaisia • Tulokaslajeja: – Mustarotta, hiiri – Koira, kissa – Ihminen, zebu
  14. 14. • Puoliapinoita • Pitkäikäisiä, jopa 10 vuotta luonnossa • Pieniä • Suhteellisen pysyvät reviirit • Monenlaisissa elinympäristöissä • Aktiivisimmillaan lokakuussa (tää on vaan bonus) Hiirimakit
  15. 15. Makit • Puoliapinoita • Yleisesti naarasdominantteja
  16. 16. • Mallieläin Alzheimerin taudille? • Vanhenevat vankeudessa, eivät luonnossa • Horrostavat, naarasdominantteja, yöaktiivisia • Tulevaisuuden suunnitelmat sekvenoida
  17. 17. Kenttätyö • Syyskuulta joulukuulle • Ansat öisin silmien korkeudelle • Sisälle banaania
  18. 18. Punkit ja täit: Ulkoloisten määrä Mikrosiru  yksilöt Karvanäyte  genetiikka Morfometriikka -Paino -Hännän, hauiksen ja reiden ympärysmitta Ulostenäyte: -Hormoonit -Sisäloiset -Ruokavalio Vaginan ja kivesten koko Lisääntymistila Sukupuoli Hammasvalos  ikä Persoonallisuus Ansan sijainti ja aika
  19. 19. Opportunistista ulosteenkeräystä  Ansoihin tulee monenlaisia muitakin eläimiä  Isoja makeja voi seurata ja kerätä ulosteet
  20. 20. Sukkulamadot • Prevalenssi lähes 100% • Helppo eristää • Paljon tutkittuja, mutta…
  21. 21. Pyrosekvensointi • Lajintunnistaminen 18S-geenisekvenssin (ribosomin pieni yksikkö) perusteella • Yhdessä näytteessä 0-1500 toukkamuotoa
  22. 22. Mitä tehdä miljoonan 700 emäksen sekvenssin kanssa?
  23. 23. Alustavia tuloksia • Mustarotilla ja koirilla samaa lajistoa, joka eroaa hiirimakeista • Hiirimakien loisia myös mustarotilla – > tulokaslaji lisää loistaakkaa? • Horrostaminen tappaa sukkulamadot suolesta
  24. 24. Kysymyksiä?
  25. 25. Lisätietoja http://twitter.com/aivelo http://www.biocenter.helsinki.fi/bi/evodevo/group_Jernvall.shtml http://fifi.voima.fi/blogit/tekija/tuomas-aivelo http://blogs.helsinki.fi/t-retki/author/aivelo/ https://peda.net/oppimateriaalit/e-oppi/lukio/biologia/symbioosi2/1pje/haastattelu http://oppiminen.yle.fi/solubiologia/bioteknologia/hiirimakien-loisten-tutkimus-perustuu-dnan- sekvensointiin http://oppiminen.yle.fi/solubiologia/perinnollisyys/tutkijan-kommentti-perinnollisyyden-opetus- kaipaa-paivittamista

×