Sistem akuakultur dirancang untuk meningkatkan produksi ikan dalam volume air kecil dengan mengolah air untuk menghilangkan limbah beracun dan menggunakannya berulang kali, namun ini dapat menumpuk masalah nutrisi dan toksin. Limbah metabolik dapat disalurkan ke tanaman untuk memberi nilai ekonomi tambahan atau manfaat produksi primer.