Pengurusan sisa klinikal melibatkan proses pelupusan sisa dari institusi perubatan melalui pengasingan, pengendalian, dan penyimpanan, serta mematuhi garis panduan yang ditetapkan. Terdapat kategori sisa klinikal yang meliputi sisa dari rawatan, makmal, dan farmasi yang mempunyai risiko pekerjaan dan persekitaran. Di Malaysia, pengurusan sisa klinikal perlu mematuhi peraturan keselamatan dan dokumentasi untuk mengelakkan pencemaran dan kemalangan.