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Detection of clarithromycin-resistance Helicobacter Pylori strains in a dyspeptic patient population in Sri Lanka
- 1. Manuela Guzmán Castañeda Jesús Sebastián Gómez
- 2. INTRODUCTION The research article was realized in Sri Lanka, where has been reported a high prevalence of infection of Helicobacter Pylori. Scientist made a study to identify clarithromycin resistance of H. pylori strands. Clarithromycin resistance is increasing, results in the use of empirical antibiotics for treatment.
- 3. HELICOBACTER PYLORI Member of Campylobacter genus Helicobacter genus 1989. Gram-negative spiral-shape bacteria. Infects up the 50% of human population. Leading cause of peptic ulcers and gastric cancer. Urease activity
- 6. SYMPTOMS OF H. PYLORI INFECTION Epigastric pain with burning sensation. Pain get worse with empty stomach Poor appetite Weight loss Dyspepsia Vomiting Heart burn
- 7. CLARITHROMYCIN Clarithromycin binds to the subunit 23S Bacteria ribosome The bacteria cytoskeleton collapse
- 9. PCR METHOD Polymerase Chain Reaction Kary Mullis Simple test to multiply DNA Millions of copies
- 10. PCR METHOD Know partial sequence of the región of DNA Enzymatic in vitro amplification Increase the number of copies Cycle 3 stages
- 11. RFLP Restriction Fragment Long Polymorphism Restriction enzymes
- 12. H. Pylori Gastric ulcere Epigastric pain Illness Clarithromycin It binds to 23S H. Pylori dies Gastric mucose in perfect conditions
- 13. OBJECTIVE “Investigate the proportion of common claritromycin-resistance mutation types present in the 23S rRNA gene of H. pylori strains in Sri Lanka.”
- 14. METODOLOGÍA Hospital de atención terciaria en Sri Lanka Departamento de microbiología y de patología de la Universidad del estado de Sri Lanka. Se realizó en 76 pacientes. Aprobación ética por comité ético de la universidad del estado.
- 15. METODOLOGÍA
- 16. METODOLOGÍA Endoscopia 2 Biopsias gástricas Prueba de ureasa Extracción de ADN Amplificación con PCR glmM – 23S rRNA Confirmación con histopatología
- 18. MÉTODOS 2. Alineamiento: glmM1-F - glmM2-R Cla18 - Cla21
- 20. MÉTODOS
- 21. MÉTODOS RFLP MboII A2142G Bsa I A2143G
- 22. ¿PARA QUE LA PCR? Clonar fragmentos de ADN. Detectar secuencias Establecer polimorfismos Rastreo de mutaciones. Tipificación de DNA para trasplantes.
- 23. ¿PARA QUÉ LA RFLP? Detectar mutaciones genéticas
- 24. RESULTADOS
- 27. DISCUSIÓN
- 28. AUTHOR WHAT HE SAID ¿YES OR NO? RAYMOND J. (France) Raymond et al.[20] in 2007 had found a 90% prevalence of A2143G mutation Yes ABDOHALLI H. (Iran) Abdollahi et al.,[18] in 2011 had shown a 55% prevalence of A2142G mutation Yes
- 29. AUTHOR WHAT HE SAID ¿YES OR NO? KIM KS. Kim KS et al.[19] in 2002 had reported 100% mutation in A2143G or T2182C sites in Korea Yes FRANCESCVO VD. Published studies showed that although A2142G mutation is present it sometimes may not be phenotypically expressed.[14] Yes
- 30. CONCLUSIONS • Indiscriminated use of antibiotics increase emerging infections. • Use of PCR is really important for the diagnostic of several patologies • We concluded that the study of the molecular biology is now leading the investigations in Health sciences as a indispensable tool for the diagnosis and treatment of diseases. • We recognize the importance of read and study in english even more in fields of science such as the Human Health knowing that the latest developments are published in this lenguaje.
- 33. BIBLIOGRAFÍA Yamamoto, Yoshimasa. Friedman, Herman. Hoffman, Paul. Helicobacter pylori Infection and Immunity. David Martínez, Julían. Consuelo Henao, Sandra. Iván Lizarazo, Jorge. Resistencia antibiótica del Helicobacter pylori en América Latina y el Caribe. Revista Colombiana de gastroenterología. Vol.29 no.3 Bogotá Sept. 2014 Martínez Sánchez, Lina María. Vargad Grisales, Natalia. Osorio Ospina, Felipe. Ramírez Pulgarín, Sergio. Biología molecular. Octava edición. Universidad Pontificia Bolivariana.
Editor's Notes
- 23s 5s –50s 16s– 30s
- MACROLIDE: ACT BY BINDING TO BACTERIAL RIBOSOMES Toda la presentación debe ir con el mismo tamaño de letra, eso lina lo mira mucho
- INHIBE LA TRADUCCIÓN – The polipeptic chain cant grow PRIMASA FORMA PRIMERS EN PCR TODOS SON ADN
- GANO NOBEL EN 1993 – LOW CONCENTRATIONS PROCARIOTAS TRANSCRIPCION Y TRADUCCION MISMO TIEMPO
- OBJETIVE OF THE TECHNIQUE – PARTICULE DNA SEQUENCE- USUALLY BETWEEN 20 TO 40 CYCLES- Denaturation, alignment, synthesis
- ARE USED TO CLEAVE SPECIFIC DNA REGIONS
- Dale justificar al texto para que se vea mejor presentado
- Dispépticos 43 m 33h Lesiones por ulcera Duodenitis Gastritis antral Te propongo que en vez de tener texto aquí la metodología la hagan como en un esquema, pues como cuadritos con continuidad o alguno de los SmartArt de power point, lina ama todo lo que sean graficos
- se calienta para separar las 2 hebras de DNA. Gen glmM 93°C Gen 23S rRNA94°C
- hibridación de las hebras con los primer´s. 37° a 65° Combinación de dos cadenas de acidos nucleicos antiparalelas. secuencias sintéticas de oligonucleótidos que son utilizadas para reconocer por apareamiento complementario secuencias blanco en ADN de plantilla (en inglés DNA template), que consiste generalmente en ADN genómico. Comúnmente un par de iniciadores son usados en PCR para definir los extremos del producto que se desea amplificar, y a partir de ellos la DNA polimerasa utilizada inicia la polimeración en dirección 5' - 3'.
- amplificación que hace la Taq polimerasa- elonga los primer´s usando las hebras originales. Amplicon es un pedazito o seucencia de ADN producto de PCR.
- La resistencia a claritromicina se presenta por mutaciones puntuales en el gen rrn 23S que codifica para el ARNr 23S. Las mutaciones responsables de 90% de los casos de resistencia se producen por sustitución de la adenina por citosina o guanina en la posición 2142 (A2142C o 2142G) o de una adenina por una guanina en posición 2143 (A2143G), otras mutaciones son menos frecuentes como la A2143G.
- Diagnostico prenatal de enfermedades genéticas. Medicina forense Detección de microorganismos infecciosos Detección de células tumorales