SlideShare a Scribd company logo
1 of 2
Download to read offline
FLIRT - Lineáris regisztráció referencia képhez,
                     atlasz templáthoz.
Cél: Beteg képének (pl. DTI - FA) illesztése egy standard térben lévő templáthoz.

               1                                    1: Módszer: beteg képének referenciához történő
                                                    illesztése.
                                     2
                                                    2. A referencia, templát kép. FIGYELEM! Az FSL
                                 3                  feltelepitett változátában számos templát
                                            4       megtalálható.. (T1-súlyozott MNI152, agy-maszkolt
                                                    és teljes változat, FMRIB58 FA kép, ami szintén
                                            5       MNI152 térben van)

                                6                   3. Regisztráció tipusa. Rigid (9) vagy affine (12)
                                                    ajánlott.

                                                    4. A regisztrálandó képfile, pl a beteg FA képe vagy
                                                    nagyfelbontású, bet-elt T1 képe.

                                                    5. Kimeneti könyvtár.

                                                    6. Az igy megkapott transzformációval több képet is
                                                    tud transzformálni, ez praktikus pl. DTI esetén, ahol
                                                    az FA - standard regisztrációval meghatározott
                                                    transzformációval az ADC képet is illesztjük.

                                                    EREDMÉNY:
                                                    1. REGISZTRÁLT KÉP
                                                    2. TRANSZFORMÁCIÓS MÁTRIX, .mat formátumban.


    FSL TEMPLÁTOK: /fsl/data/standard/




MNI152-brain                                    FMRIB58-FA-brain
Flirt

More Related Content

Viewers also liked

Nemiszervek anatómiája - OLKD hallgatók részére
Nemiszervek anatómiája - OLKD hallgatók részéreNemiszervek anatómiája - OLKD hallgatók részére
Nemiszervek anatómiája - OLKD hallgatók részéreDr. Jakab András
 
Matematika csapatverseny
Matematika csapatversenyMatematika csapatverseny
Matematika csapatversenyeosztalyos
 
05 - Légzőszervek anatómiája OLKDAsoknak
05 - Légzőszervek anatómiája OLKDAsoknak05 - Légzőszervek anatómiája OLKDAsoknak
05 - Légzőszervek anatómiája OLKDAsoknakDr. Jakab András
 
A gerincvelő funkcionális anatómiája - OLKDA
A gerincvelő funkcionális anatómiája - OLKDAA gerincvelő funkcionális anatómiája - OLKDA
A gerincvelő funkcionális anatómiája - OLKDADr. Jakab András
 
Központi idegrendszer anatómiája OLKD-soknak, 2012
Központi idegrendszer anatómiája OLKD-soknak, 2012Központi idegrendszer anatómiája OLKD-soknak, 2012
Központi idegrendszer anatómiája OLKD-soknak, 2012Dr. Jakab András
 
Week 1. Basics of multimodal imaging and image processing. Functional magneti...
Week 1. Basics of multimodal imaging and image processing. Functional magneti...Week 1. Basics of multimodal imaging and image processing. Functional magneti...
Week 1. Basics of multimodal imaging and image processing. Functional magneti...Dr. Jakab András
 
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 2. A gerinc anatómiája
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 2. A gerinc anatómiájaFejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 2. A gerinc anatómiája
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 2. A gerinc anatómiájaDr. Jakab András
 
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 6. A kismedence és nemi szervek ana...
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 6. A kismedence és nemi szervek ana...Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 6. A kismedence és nemi szervek ana...
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 6. A kismedence és nemi szervek ana...Dr. Jakab András
 
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 1. A központi idegrendszer anatómiája
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 1. A központi idegrendszer anatómiájaFejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 1. A központi idegrendszer anatómiája
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 1. A központi idegrendszer anatómiájaDr. Jakab András
 
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 3. Fej-nyak régió, gége, garat
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 3. Fej-nyak régió, gége, garatFejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 3. Fej-nyak régió, gége, garat
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 3. Fej-nyak régió, gége, garatDr. Jakab András
 
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 5. A hasüreg és zsigerek anatómiája
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 5. A hasüreg és zsigerek anatómiájaFejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 5. A hasüreg és zsigerek anatómiája
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 5. A hasüreg és zsigerek anatómiájaDr. Jakab András
 
02 - Funkcionális Anatómia (OLKD, I. évf.): Izomtan, ízületek
02 - Funkcionális Anatómia (OLKD, I. évf.): Izomtan, ízületek02 - Funkcionális Anatómia (OLKD, I. évf.): Izomtan, ízületek
02 - Funkcionális Anatómia (OLKD, I. évf.): Izomtan, ízületekDr. Jakab András
 
Week 3. Neurosurgical planning with multimodal imaging
Week 3. Neurosurgical planning with multimodal imagingWeek 3. Neurosurgical planning with multimodal imaging
Week 3. Neurosurgical planning with multimodal imagingDr. Jakab András
 
01 - Funkcionális Anatómia (OLKD, I. évf.): Bevezetés
01 - Funkcionális Anatómia (OLKD, I. évf.): Bevezetés01 - Funkcionális Anatómia (OLKD, I. évf.): Bevezetés
01 - Funkcionális Anatómia (OLKD, I. évf.): BevezetésDr. Jakab András
 
Week 2. Diffusion magnetic resonance imaging, tractography, mapping the brain...
Week 2. Diffusion magnetic resonance imaging, tractography, mapping the brain...Week 2. Diffusion magnetic resonance imaging, tractography, mapping the brain...
Week 2. Diffusion magnetic resonance imaging, tractography, mapping the brain...Dr. Jakab András
 
Week 5. Basics and clinical uses of MR spectroscopy.
Week 5. Basics and clinical uses of MR spectroscopy.Week 5. Basics and clinical uses of MR spectroscopy.
Week 5. Basics and clinical uses of MR spectroscopy.Dr. Jakab András
 

Viewers also liked (16)

Nemiszervek anatómiája - OLKD hallgatók részére
Nemiszervek anatómiája - OLKD hallgatók részéreNemiszervek anatómiája - OLKD hallgatók részére
Nemiszervek anatómiája - OLKD hallgatók részére
 
Matematika csapatverseny
Matematika csapatversenyMatematika csapatverseny
Matematika csapatverseny
 
05 - Légzőszervek anatómiája OLKDAsoknak
05 - Légzőszervek anatómiája OLKDAsoknak05 - Légzőszervek anatómiája OLKDAsoknak
05 - Légzőszervek anatómiája OLKDAsoknak
 
A gerincvelő funkcionális anatómiája - OLKDA
A gerincvelő funkcionális anatómiája - OLKDAA gerincvelő funkcionális anatómiája - OLKDA
A gerincvelő funkcionális anatómiája - OLKDA
 
Központi idegrendszer anatómiája OLKD-soknak, 2012
Központi idegrendszer anatómiája OLKD-soknak, 2012Központi idegrendszer anatómiája OLKD-soknak, 2012
Központi idegrendszer anatómiája OLKD-soknak, 2012
 
Week 1. Basics of multimodal imaging and image processing. Functional magneti...
Week 1. Basics of multimodal imaging and image processing. Functional magneti...Week 1. Basics of multimodal imaging and image processing. Functional magneti...
Week 1. Basics of multimodal imaging and image processing. Functional magneti...
 
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 2. A gerinc anatómiája
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 2. A gerinc anatómiájaFejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 2. A gerinc anatómiája
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 2. A gerinc anatómiája
 
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 6. A kismedence és nemi szervek ana...
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 6. A kismedence és nemi szervek ana...Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 6. A kismedence és nemi szervek ana...
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 6. A kismedence és nemi szervek ana...
 
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 1. A központi idegrendszer anatómiája
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 1. A központi idegrendszer anatómiájaFejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 1. A központi idegrendszer anatómiája
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 1. A központi idegrendszer anatómiája
 
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 3. Fej-nyak régió, gége, garat
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 3. Fej-nyak régió, gége, garatFejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 3. Fej-nyak régió, gége, garat
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 3. Fej-nyak régió, gége, garat
 
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 5. A hasüreg és zsigerek anatómiája
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 5. A hasüreg és zsigerek anatómiájaFejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 5. A hasüreg és zsigerek anatómiája
Fejezetek a keresztmetszeti anatómiából - 5. A hasüreg és zsigerek anatómiája
 
02 - Funkcionális Anatómia (OLKD, I. évf.): Izomtan, ízületek
02 - Funkcionális Anatómia (OLKD, I. évf.): Izomtan, ízületek02 - Funkcionális Anatómia (OLKD, I. évf.): Izomtan, ízületek
02 - Funkcionális Anatómia (OLKD, I. évf.): Izomtan, ízületek
 
Week 3. Neurosurgical planning with multimodal imaging
Week 3. Neurosurgical planning with multimodal imagingWeek 3. Neurosurgical planning with multimodal imaging
Week 3. Neurosurgical planning with multimodal imaging
 
01 - Funkcionális Anatómia (OLKD, I. évf.): Bevezetés
01 - Funkcionális Anatómia (OLKD, I. évf.): Bevezetés01 - Funkcionális Anatómia (OLKD, I. évf.): Bevezetés
01 - Funkcionális Anatómia (OLKD, I. évf.): Bevezetés
 
Week 2. Diffusion magnetic resonance imaging, tractography, mapping the brain...
Week 2. Diffusion magnetic resonance imaging, tractography, mapping the brain...Week 2. Diffusion magnetic resonance imaging, tractography, mapping the brain...
Week 2. Diffusion magnetic resonance imaging, tractography, mapping the brain...
 
Week 5. Basics and clinical uses of MR spectroscopy.
Week 5. Basics and clinical uses of MR spectroscopy.Week 5. Basics and clinical uses of MR spectroscopy.
Week 5. Basics and clinical uses of MR spectroscopy.
 

More from Dr. Jakab András

Agykutatás hete 2012 - Dr. Jakab András - "Digitális agykutatás a III. évezre...
Agykutatás hete 2012 - Dr. Jakab András - "Digitális agykutatás a III. évezre...Agykutatás hete 2012 - Dr. Jakab András - "Digitális agykutatás a III. évezre...
Agykutatás hete 2012 - Dr. Jakab András - "Digitális agykutatás a III. évezre...Dr. Jakab András
 
Charting the human thalamus - basic contepts and recent developments
Charting the human thalamus - basic contepts and recent developmentsCharting the human thalamus - basic contepts and recent developments
Charting the human thalamus - basic contepts and recent developmentsDr. Jakab András
 
Connectivity-augmented Surgical Targeting: Individualization of a 3D Atlas of...
Connectivity-augmented Surgical Targeting: Individualization of a 3D Atlas of...Connectivity-augmented Surgical Targeting: Individualization of a 3D Atlas of...
Connectivity-augmented Surgical Targeting: Individualization of a 3D Atlas of...Dr. Jakab András
 

More from Dr. Jakab András (10)

Agykutatás hete 2012 - Dr. Jakab András - "Digitális agykutatás a III. évezre...
Agykutatás hete 2012 - Dr. Jakab András - "Digitális agykutatás a III. évezre...Agykutatás hete 2012 - Dr. Jakab András - "Digitális agykutatás a III. évezre...
Agykutatás hete 2012 - Dr. Jakab András - "Digitális agykutatás a III. évezre...
 
Neuroplasticity
NeuroplasticityNeuroplasticity
Neuroplasticity
 
Charting the human thalamus - basic contepts and recent developments
Charting the human thalamus - basic contepts and recent developmentsCharting the human thalamus - basic contepts and recent developments
Charting the human thalamus - basic contepts and recent developments
 
Connectivity-augmented Surgical Targeting: Individualization of a 3D Atlas of...
Connectivity-augmented Surgical Targeting: Individualization of a 3D Atlas of...Connectivity-augmented Surgical Targeting: Individualization of a 3D Atlas of...
Connectivity-augmented Surgical Targeting: Individualization of a 3D Atlas of...
 
Dtifit
DtifitDtifit
Dtifit
 
Fdt2
Fdt2Fdt2
Fdt2
 
Fdt1
Fdt1Fdt1
Fdt1
 
Bet2
Bet2Bet2
Bet2
 
Telemedicina
TelemedicinaTelemedicina
Telemedicina
 
Telemedicina
TelemedicinaTelemedicina
Telemedicina
 

Flirt

  • 1. FLIRT - Lineáris regisztráció referencia képhez, atlasz templáthoz. Cél: Beteg képének (pl. DTI - FA) illesztése egy standard térben lévő templáthoz. 1 1: Módszer: beteg képének referenciához történő illesztése. 2 2. A referencia, templát kép. FIGYELEM! Az FSL 3 feltelepitett változátában számos templát 4 megtalálható.. (T1-súlyozott MNI152, agy-maszkolt és teljes változat, FMRIB58 FA kép, ami szintén 5 MNI152 térben van) 6 3. Regisztráció tipusa. Rigid (9) vagy affine (12) ajánlott. 4. A regisztrálandó képfile, pl a beteg FA képe vagy nagyfelbontású, bet-elt T1 képe. 5. Kimeneti könyvtár. 6. Az igy megkapott transzformációval több képet is tud transzformálni, ez praktikus pl. DTI esetén, ahol az FA - standard regisztrációval meghatározott transzformációval az ADC képet is illesztjük. EREDMÉNY: 1. REGISZTRÁLT KÉP 2. TRANSZFORMÁCIÓS MÁTRIX, .mat formátumban. FSL TEMPLÁTOK: /fsl/data/standard/ MNI152-brain FMRIB58-FA-brain