1. FDT probabilisztikus traktográfia 3.
Cél: SEED terület klasszifikációja TARGET régiók alapján. Olyan képek előállitása,
amelyek a TARGET-be való eljutás valószinüségét mutatják a SEED terület minden
voxelén. Lehetővé teszi a konnektivitás-alapú szegmentációt (find_the_biggest
parancs).
1: a már feldolgozott, BedpostX-
bedpostX könyvtár útvonala
2: SEED maszk. Esetünkben a Harvard-
1 Oxford atlasz egy régiója.
3: A "seed space is not diffusion"
kapcsoló beállitásával ÉS a NONLINEAR
2 bekapcsolása jelzi azt, hogy nemlináris
transzformáció történt (warp).
3 4: Két, ún. warp-field megadása
kötelező. Az egyik a referenciaképet
4 regisztrálja a diffúziós képhez, a másik
ennek inverze (invwarp parancs).
ref2diff-warp
diff2ref-warp
5 (javasolt nomenklatura)
5-6: Classification targets. Több
6 TARGET kijelölése, amelyekhez
egyenként kiszámolja a SEED
voxeleinek kapcsolati valószinüségét.
A TARGET maszkok listán történő
7 megadása is lehetséges, egy egyszerü
text file szerkesztésével.
7: Traktográfia kimenő könyvtára.
.
Eredmények
fdt_paths.nii.gz : MINDEN, a SEEDből
származó tract.
seeds_to_TARGET.nii.gz : minden egyes
TARGET-hez tartozó SEED valószinüségi
térkép.
targets.txt: a TARGETek neve.
waytotal.txt: összesitett részecskeszám
Egy "seeds_to_target" kép (thalamus - precentral gyrus kapcsolat)