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ゲノム編集技術に関する特許動向
1
2018.10.25
Revised
日本弁理士会 バイオ・ライフサイエンス委員
平成30年度 副委員長
辻丸国際特許事務所
弁理士・博士(生命科学)南野 研人
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2
3種類のシステム+α
ゲノム編集技術の種類1
権利主体の明確な第1・2世代
ゲノム編集技術の特許2
5者+1者の争い
CRISPR-Cas9システムの基本特許の状況3
本日のTopics
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1.ゲノム編集技術の種類
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ゲノム編集技術:
「予め定義した配列を有する特定のゲノムDNA領域を切断し、編集する技術」
(日本ゲノム編集学会)
ゲノムDNAの損傷(切断、架橋、ニック等)が生じると、損傷の種類に応じて、
DNAの修復機構が活性化
この際に、切断前には存在しなかった塩基の挿入、欠失等が生じたり、相同
的な配列を有する核酸分子が存在すると、相同性組換えが発生
→ゲノム編集技術は、故意にゲノムDNAの損傷を生じさせ、その際に生じる
DNA修復機構を利用して塩基配列を編集する
1.1 ゲノム編集技術とは
Wikipedia 「ゲノム編集」より抜粋
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開発済のゲノム編集技術は、主に3種類
1.第1世代:ZFN (Zinc Finger Nuclease)
DNA結合タンパク質のモチーフであるZinc Fingerを用いたゲノム編集技術。
2.第2世代:TALEN®(Transcription Activator-Like Effector Nuclease)
転写因子TALEタンパク質由来を用いたゲノム編集技術。
3.第3世代:CRISPR-Cas9(clustered regularly interspaced short palindromic repeats / CRISPR associated proteins)
古細菌等の原核生物に存在する獲得免疫系を利用したゲノム編集技術
・第1世代及び第2世代のゲノム編集技術では、ターゲットの核酸はタンパク質
により認識
・他方、第3世代のゲノム編集技術では、ターゲットの核酸は核酸により認識
→第1及び第2世代はタンパク質の設計自体が面倒であったが、第3世代により
圧倒的に簡便に
1.2 ゲノム編集技術の種類
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6
• 第1世代(ZFN)
DNA結合ドメインとしてZincフィンガーを結合させたヌクレアーゼ(Fok1)を利用
ターゲット配列を含む二重鎖のセンス鎖・アンチセンス鎖に対応する2種類
ZFNを準備し、それぞれで、片鎖を切断
SIGMA-ALDRICH社のHPより抜粋
1.3 第1世代:ZFN
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7
• 第2世代(TALEN)
植物細菌キサントモナスの転写因子TALEタンパク質由来の結合ドメインを結
合させたヌクレアーゼ(Fok1)を利用
設計思想は、ZFNと同様。
TALEN自体はターゲット配列に制限がかかるため、任意の部位を認識できる
ように改変されたものも(例えば、Platinum TALEN、GeneArt® Precision TALs)
Thermo Fisher Scientific社のHPより抜粋
1.4 第2世代:TALEN
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Single guide RNA chimera
(sgRNA)
人工型
crRNA-tracrRNA
天然型
Nature Reviews Rheumatology
13, 205–216 (2017)から抜粋
• 第3世代(CRISPR-Cas9)
原核生物等の獲得免疫系であるCRISPR-Cas9を真核生物に転用してゲノム情報
を編集
Cas9タンパク質の由来により、切断末端の隣接領域の配列(PAM)が限定される
原核生物が利用している系(天然型)と、改良型(人工型)の二種類
1.5 第3世代:CRISPR-Cas9
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91.6 Cas9のPAM
菌種 PAM配列
S. pyogenes 5'-NGG*1
S. solfataricus 5'-CCN
S. solfataricus 5'-TCN
H. walsbyi 5'-TTC
E. coli 5'-AWG
E. coli 5'-CC
P. aeruginosa 5'-CC
S. Thermophilus 5'-NNAGAA
S. agalactiae 5'-NGG
*1 PAM配列を-NGGから、-NGN(-NGA、-NGT、-NGG、-NGC)、すなわち、-NGに拡張可能
Hiroshi Nishimasu et.al. “Engineered CRISPR-Cas9 nuclease with expanded targeting space”, 2018, Science
細菌種とPAM配列
・市販のベクター等で用いられているCas9は、S. pyogenes由来が大半
・小型化、PAMの拡張も、S. pyogenesで試みられている
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1.7 技術的な違い
ZFN TALEN CRISPR-Cas9
配列の選択性 低 中 高*1
編集効率 中 中 高
特異性 高 高 中*2
簡便性 低 低 高
*1 Cas9の由来の変更および認識するPAMの改変により対応可能(前述)
*2 ニッカーゼ型Cas9(D10A)の利用で向上可能
第1~第3世代のゲノム編集技術の技術的な差異
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11
主流の第1~第3世代の技術以外に、 RNA依存性ヌクレアーゼまたは新たな
DNA結合タンパク質が異なる下記技術もある
その他、人工型ヌクレアーゼ(メガヌクレアーゼ)等も存在
• CRISPR/Cpf1
CRISPR-Cas9と類似するがヌクレアーゼが異なる (Cas9→Cpf1)
ガイド鎖(短鎖RNA)と、Cpf1ヌクレアーゼとを利用
(Cpf1がガイド鎖を切り出すメリットあり)
出願人はBroad研究所らのみであり、権利関係がややこしくないため、分野に
よってはこちらの利用も検討する動きも
• PPR(PentatricoPeptide Repeat) タンパク質
九大・名大が開発した植物オルガネラ由来のpentatricopeptide
Repeatが複数結合したタンパク質であり、DNA・RNAに結合
技術思想は、第1および第2世代と同様であり、ヌクレアーゼと組合せることで
ZFN、TALENのように使用することを想定
エディットフォースが加齢黄斑変性治療等への適用を目指して開発中
1.8 その他関連技術
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2.ゲノム編集技術の特許
(ZFNおよびTALENを中心に)
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第1~第3世代のゲノム編集技術は、開発年代が異なり、それぞれにより特許
の状況はかなり異なる。
1.第1世代:ZFN (1990年代後半)
最初期のゲノム編集技術であり、文献による開示は1996年
初期段階がSangamoが精力的にライセンスインを行なう
2.第2世代:TALEN (2000年代後半)
ミネソタ大学、アイオワ大学らのグループが発表
3.第3世代:CRISPR-Cas9 (2010年代前半)
2012年にUC BerkeleyらのグループによりScience誌に掲載、その後、真核
細胞等に対する適用について、Broadらのグループにより公表
2.1 ゲノム編集技術の特許の概要
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・第1世代:ZFN
基本特許および必須特許の権利者(または独占ライセンス先)は、集約済み
(参考資料1および2参照)
・権利者:
Sangamo社:US6013453等(優先日:1994年8月20日)
MITら:US5789538等(優先日:1997年4月18日)
・独占的ライセンス先
臨床開発~製品化:Sangamo Therapeutics社、研究用:Sigma-Aldrich社
最先の出願が1995年であるため、基本特許、必須特許の特許権の存続期
間が続々と満了を迎え、自由実施できる領域が増えていく予定
ただし、Sangamoは継続して、改良発明を出願しているため、実施時には注
意が必要
2.2 第1世代:ZFN
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・第2世代:TALEN(Transcription Activator-Like Effector Nuclease)
基本特許および必須特許の権利者は、集約済み(参考資料2参照)
・権利者:
Bonas Ullaら:US8,470,973B等(優先日:2009年1月12日)
ミネソタ大学、アイオワ大学ら:US8,586,363等(優先日:2009年12月10日)
・独占的ライセンス先
治療用途:Cellectis社、それ以外:Thermo Fisher Scientific社
TALENを用いる場合においても、ヌクレアーゼ(Fok1)の構造によっては、
Sangamoの特許に抵触する場合があるため、注意が必要
・第3世代:CRISPR-Cas9
→後述するが、一部の基本特許の権利者は固まりつつあるが、権利関係は依
然として錯綜
2.3 第2世代:TALEN
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3.CRISPR-Cas9システムの基本特許の状況
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Broad, MIT, Harvard
(米)
Berkeley, Vienna(米)
Toolgen(韓) Vilnius(立)
・基本特許候補:12件
・Feng Zhangのグループ
・関連出願:89件のファミリー
・基本特許候補:1件
・J. Doudna、E. Charpentierら
・関連出願:20件のファミリー
・人工型・天然型 ・人工型がメイン(天然型含)
その他
SIGMA:RNA依存性ヌクレアーゼについて出願(US14/649777)
・天然型がメイン・人工型・天然型
・基本特許候補:1件
・関連出願:2件
・基本特許候補:1件
・関連出願:1件
Cellectis:ゲノム編集技術を包括的にカバーする特許を独占的にライ
センスイン(US9458439B)
5者+αと考えられるが、米国では他にも出てくるか…?
3.1 基本特許の権利者候補
基本特許の権利者の候補
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(参考情報) 調査対象
• Vilnius:USP61/613,373を基礎出願とする出願
• Berkeley:USP61/652,086を基礎出願とする出願
• Toolgen:USP61/717,324を基礎出願とする出願
• Sigma:USP61/734,256を基礎出願とする出願
• Broad:USP61/736,527を基礎出願とする出願
• 弁理士会での調査(~2017/12/31)+2018年10月1日に追加調査
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Vilnius
Berkeley
Toolgen
Broad
Published in Science by Dr. J. Doudna et.al.
8/17(AOP:6/28)
2012 2013
・論文公開前の優先日確保は、VilniusおよびBerkeley(先願主義では重要)
・USは先願主義に移行前、すなわち、先発明主義
・Broadは候補群のうちの一例
主要5者の出願タイムライン
1st Pro
3/20
2nd Pro
4/17
PCT
3/20
1st Pro
5/25
2nd Pro
10/19
3nd Pro
1/28
4th Pro
2/15
PCT
3/15
Sigma
1st Pro
10/23
1st Pro
12/6
2nd Pro
3/20
3rd Pro
6/20
PCT
10/23
1st Pro
12/12
2nd Pro
1/30
3rd Pro
2/5
PCT
12/5
2nd Pro
1/2
4th Pro
3/15
3rd Pro
3/15
4th Pro
6/17
5th Pro
7/2
PCT
12/12
3.2 出願のタイムライン
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203.3 日本の概況
人工型
天然型
Vilnius Berkeley Toolgen Broad
概念をカバー
in vitro
長さの限定
1件 2件 3件
2件
出願:
特許権:
5’端にGG付加
真核生物
18件
日本の状況
II型Cas9
NLS付加等
・Broadの特許が2件成立、いずれも要素技術に関する
・Berkeleyの出願により、人工型の概念はカバーされている
・9月28日にVilniusに対して特許査定が送達
登録
係属中
1件
SaCas9
sgRNA単独含
分割多数
Sigma
2件
ニッカーゼ型
Cas9×2
II型Cas9
NLS付加
ドナー核酸
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日本の特許の関係
21
Berkeley
Broad
人工型天然型
3.4 日本の特許の関係
・Berkeleyが人工型の特許を取得し、Broadの特許群は、Berkeleyに包含される
・天然型については、Vilniusの特許が成立予定
Vilnius
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5月末についに特許成立
sgRNAの新たな構造が開発されない限り、現状回避が困難
• 特許第6343605号
sgRNA + Cas9タンパク質
sgRNAの構造のみの限定
クレーム:修飾方法、組成物、sgRNA、核酸(ベクター系)、キット、真核細
胞
【請求項45】
単一分子DNA標的化RNA、または前記単一分子DNA標的化RNAをコードするDNAポリヌクレオチドで
あって、該単一分子DNA標的化RNAが
(a)標的DNA内の標的配列に対して相補的なヌクレオチド配列を含む、DNA標的化セグメント、および
(b)Cas9タンパク質と相互作用するタンパク質結合セグメントであって、該タンパク質結合セグメントは、ハイ
ブリダイズして二本鎖RNA(dsRNA)を形成する2つの相補的な一続きのヌクレオチドを含み、前記dsRNA
は、tracrRNAおよびCRISPR RNA(crRNA)の相補的なヌクレオチドを含み、前記2つの相補的な一続き
のヌクレオチドは、介在ヌクレオチドによって共有結合的に連結されている、タンパク質結合セグメントを含み、
前記DNA標的化セグメント、前記crRNAのヌクレオチド、前記介在ヌクレオチド、前記tracrRNAのヌクレオ
チドは、この順に5’側から3’側に配置されている、
前記単一分子DNA標的化RNA、または前記単一分子DNA標的化RNAをコードするDNAポリヌクレオチド。
223.5 Berkeley特許(JP)の概要
Berkeley特許(JP)
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2件の特許に対して、今のところいずれも異議申立無し。
2つ目の特許は、異議申立期間経過前
• 特許第6203879号
sgRNA + II型Cas9タンパク質
Cas9タンパク質はNLSを保有
標的配列へのハイブリダイズするガイド配列と、tracrRNAとの長さを限定
クレーム:ベクター系、ベクター系の使用、TGの製造方法
• 特許第6395765号
sgRNA + Cas9タンパク質
黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)由来Cas9タンパク質
クレーム:組成物、ベクター系を含む組成物、ex vivoまたはin vitroの細胞
系、非動物に対する使用、ex vivoまたはゲノム編集における使用
233.6 Broad特許(JP)の概要
Broad特許(JP)
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243.7 米国の状況の概要
人工型
天然型
Vilnius Berkeley Toolgen Broad
CAFC判決
概念をカバー
in vitro
5件 23件 3件
15件
出願:
特許権:
真核生物
57件
米国の状況
・人工型及び天然型に関して、Broadが真核細胞を対象とする特許を取得
・Berkeleyが概念をカバーする出願をするも、CAFC判決に対する判断待ち
・Vilniusは、天然型に関して、in vitroで二重鎖を分解する方法を権利化
要素技術諸々
Cas9の菌種
5’端に
NGG付加
(NLS付加等)
NLS付加
1件
二重鎖分解
分解
その他出願有り
sgRNA内
のアニール
長限定
1件
Sigma
14件
II型Cas9
ニッカーゼ型
Cas9×2
II型Cas9
NLS付加
ドナー核酸
登録
係属中
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米国の特許の関係
25
Berkeley
Broad
人工型天然型
3.8 米国の特許の関係
・Broadが人工型を真核細胞を対象とする特許を取得し、さらに要素技術も取得
・CAFC判決が確定すると、人工型のBroadの特許群は、Berkeley特許に包含される
・天然型については、Broad、Vilniusの特許が成立しているが、概念は包含せず
Vilnius
Broad
成立すれば
Berkeley
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6月末についに特許成立
• 米国特許第10,000,772号
sgRNA + Cas9タンパク質
sgRNAにおいてdsRNAを形成する領域の長さを限定
クレーム:修飾方法
263.9 Berkeley特許(US)の概要
Berkeley特許(US)
• 米国出願13/842,859
CAFC判決に対する対応待ち
sgRNA+Cas9タンパク質
成立すれば、概念をカバーする方法ク
レームと組成物クレームが成立
日欧と異なり、sgRNAは含まず
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・既に15件の特許が既に成立
US8697359; US8993233; US8771945; US8889356; US8795965;
US8865406; US8999641; US8945839; US8932814; US8871445;
US8906616; US8895308; US8889418; US9840713; US9822372
• 米国特許第8697359号(最先の特許)
guideRNA + II型Cas9タンパク質
クレーム:遺伝子発現の変更方法、ベクター系、組成物
• Berkeleyとのインターフェアレンスの対象
Patent:
US8697359; US8771945; US8795965; US8865406; US8871445;
US8889356; US8895308; US8906616; US8932814; US8945839;
US8993233; US8999641
Application: 14/704,551
273.10 Broad特許(US)の概要
Broad特許(US)
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283.11 欧州の状況の概要
人工型
天然型
Vilnius Berkeley Toolgen Broad
概念をカバー
in vitro
1件 2件 1件
10件(全件異議)
出願:
特許権:
33件
欧州の状況
要素技術諸々
2件(全件異議)
ほ乳類
NLS付加
真核細胞
NLS付加
・人工型に関しては、Berkeleyが全体をカバーし、Broadが真核細胞に
対象を限定していた特許を取得していたが、後者は取消
・活性抑制型Cas9との組合せで、Berkeleyが天然型の一部をカバー
・BroadがsgRNAの要素技術を細かく取得
登録
係属中
取消
sgRNA単独含
活性抑制型
(ニッカーゼ型)
Cas9
Sigma
10件
1件(全件異議)
ニッカーゼ型
Cas9×2
II型Cas9
NLS付加
ドナー核酸
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欧州の特許の関係
29
Berkeley
人工型天然型
3.12 欧州の特許の関係
・人工型および天然型の両者についてBerkeleyが特許を取得
・Broadの真核生物を対象とする人工型に関する特許は取消後、審判へ
・天然型において、Sigmaが、真核細胞を対象としドナー核酸を有する形態を保有
Sigma
Berkeley
Broad
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2017年5月についに特許成立
sgRNAの新たな構造が開発されない限り、現状回避が困難
• 欧州特許第2800811号
sgRNA + Cas9タンパク質
sgRNAの構造のみの限定であり、ほぼ日本と同様
クレーム:修飾方法、組成物、sgRNA、核酸(ベクター系)、キット
14. A single-molecule DNA-targeting RNA, or a DNA polynucleotide encoding said
DNA-targeting RNA, wherein the single-molecule DNA-targeting RNA comprises:
(a) a DNA-targeting segment comprising a nucleotide sequence that is
complementary to a target sequence in a target DNA, and
(b) a protein-binding segment that interacts with a Cas9 protein,
wherein the protein-binding segment comprises two complementary stretches of
nucleotides that hybridize to form a double stranded RNA (dsRNA) duplex, and
wherein said two complementary stretches of nucleotides are covalently
linked by intervening nucleotides.
303.13 Berkeley特許(EP)の概要
Berkeley特許(EP)
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1件の特許が成立し、現在異議申立中
• 欧州特許第EP3138910号
sgRNA + II型Cas9タンパク質
修復時に組込まれるドナー核酸の共存下で実施することがポイント
クレーム:外部由来配列の導入方法、ex vivoまたはin vitroにおける外部
由来配列の導入方法
313.14 Sigma特許(EP)の概要
Sigma特許(EP)
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・既に10件の特許が既に成立、ただし、全て異議申立の対象
EP2764103; EP2771468; EP2784162; EP2825654; EP2840140; EP2931892;
EP2931897; EP2898075; EP2931898; EP2931898
• 欧州特許第2771468号(取消)
sgRNA + II型Cas9タンパク質
標的配列へのハイブリダイズするガイド配列と、tracrRNAとの長さを限定
クレーム:組成物、ベクター、組成物またはベクターの使用
異議申立争点:優先権の有効性(それに伴う、新規性および進歩性)
取消理由:優先権無効、一部の引例に基づく新規性欠如
・Broadの他の特許群も、争点は同様のため、一部の特許については取り消
される可能性有り。
323.15 Broad特許(EP)の概要
Broad特許(EP)
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333.16 CRISPR-Cas9の基本特許のまとめ
• 人工型CRISPR-Cas9
日米欧のいずれにおいても、人工型のCRISPR-Cas9システムについ
ては、Berkeleyが基本特許を確保する情勢になりつつある。
→人工型CRISPR-Cas9を利用したいのであれば、Berkeleyからのライ
センスは現状不可欠
• 天然型CRISPR-Cas9
現状、概念をカバーするような基本特許を取得可能な出願人は見
当たらない。
* 天然型のCRISPR-Cas9システムのベースとなる最先の出願をVilnius
が行なっている。Vilniusは、Cas9+crRNAを用いたDNAの切断に関する
技術について最先の基礎出願で出願している。
Cas9タンパク質+crRNAを含む組成物等で権利化できた場合、大化
けする可能性あり。
基本特許のまとめ
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343.17 閑話休題:Cellectis社特許
• Cellectis社が米国で基本特許の独占ライセンスを取得したとプレスリリース
権利者: Institut Pasteur Children s Medical Center Corp
優先日:1999年2月3日
1. A method for attenuating or inactivating an endogenous gene of interest in a cell in vitro comprising:
inducing in the cell double stranded cleavage of chromosomal DNA at a genomic site of interest in
the specific sequence to be modified,
wherein the inducing comprises contacting the genomic site of interest with a chimeric restriction
endonuclease, said chimeric restriction endonuclease comprising a DNA binding sequence and a DNA cleavage
domain, and said restriction endonuclease recognizing a DNA sequence of at least 12 bp,
wherein said restriction endonuclease is introduced as a protein or is encoded by a nucleic acid
vector that is expressed, thereby inducing a cellular repair mechanism which leads to highly efficient
recombinational events at said genomic site of interest,
wherein said recombinational events introduce a mutation into said genomic site of interest,
thereby modifying the specific sequence in the chromosomal DNA of the cell and thereby attenuating or
inactivating an endogenous gene of interest in said cell.
Cellectis社から詳細なアナウンスはないが、キメラ制限エンドヌクレアーゼがCas9
を包含すると主張したいのであると推定。
ただし、存続期間を考慮すると、ほとんど影響はない。
Cellectis社特許
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353.18 閑話休題:派生技術
• CRISPR-Cas9システムを用いた遺伝子治療用途医薬への応用を考えると
現状のシステムをそのまま転用するのが難しい。
(1)Cas9タンパク質のサイズはかなりでかく、核酸でのデリバリーが難しい
SaCas9:1053a.a.(約3kbp)
SpCas9:1368a.a.(約4kbp)
⇔AAVベクターにのせられる塩基長は、その他のパーツを除けば、約3.5kbp
→小型化や、複数パーツへの分割が試みられている
(2)PAMによるターゲットの配列の制限
SpCas9のPAMは、-NGGであり、改良型でも-NGである。
点変異などにより遺伝性疾患が生じることも考慮すると、任意の位置が編集
できるようにPAMを変更するニーズがある
→PAM認識部位に変異を導入し、PAMの拡張が試みられている
• 派生技術の出願も行なわれているため、これらの経過観察も必要
必須技術になり得る派生技術
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363.19 ライセンス関係(Berkeley)
Berkeley特許
・ E. Charpentier所有特許の独占ライセンス先
医療用ヒト細胞および遺伝子治療:CRISPR Therapeutics
その他:ERS Genomics
・Berkeley所有特許の独占ライセンス先
医療用ヒト細胞および遺伝子治療:Intellia Therapeutics
その他:Caribou Biosciences
特許出願技術動向調査
「ゲノム編集及び遺伝子治療関連技術」
より抜粋及び改変
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37
特許出願技術動向調査
「ゲノム編集及び遺伝子治療関連技術」
より抜粋及び改変
・ 医療用途:Editas Medicineに独占ライセンス
・CAR-T用途:Juno Therapeuticsに独占ライセンス(Celegeneにより買収)
Broad特許
3.22 ライセンス関係(Broad)
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38
特許出願技術動向調査
「ゲノム編集及び遺伝子治療関連技術」
より抜粋及び改変
・Toolgenは、試薬関係についてKeyGeneにライセンス
・農業分野では、基本特許のライセンスがDupontに集約しつつある
・医療分野以外にでは、パテントプールを形成する動きも…(MPEG LA社)
・医療分野については、現状集約の動きなし
VilniusおよびToolgen特許
3.23 ライセンス関係(Vilnius、Toogen)
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393.24 ライセンス料
• プレスリリースがされているライセンス料は、既にかなり高額。
(1) Intellia Therapeutics社(UC Berkeley系)& Regeneron社
一時金7500万ドル(約85億円)+マイルストーン(不明)+ロイヤリティ(不明)
Intellia Therapeutics社の次回の資金調達時に5000万ドル(約56億円)の投資
(2) CRISPR Therapeutics社(UC Berkeley系)& VERTEX社
一時金1億500万ドル(約119億円)+開発段階毎のマイルストーン4200万ドル(約
48億円)+ロイヤリティ(不明)
(3) Editas Medicine社(Broad系)& Juno Therapeutics社
一時金2500万ドル(約28億円)+マイルストーン2億3000万ドル×3(約260億円
×3)+ロイヤリティ(不明)
(参考) EdiGene社(東大)& Fuji Film社
一時金4億7000万円+マイルストーン(不明)+ロイヤリティ(不明)
ライセンス料
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ライセンス関連のまとめ
・各者のライセンス先は多種多様であり、用途別に独占ライセンスを行うケース多
医薬系に関しては、発明者がFounderのベンチャーに(独占)ライセンスを供与
するケース多
→現状、基本特許および必須特許が複数者に分属し、ライセンスインがかなり面倒
・一括ライセンスインができる状況にすぐになるとは考え難い。例外が農業分野
医療分野:集約の動き無し
(高い収益を得るには、一人で基本特許および必須特許を握る必要がある)
農業分野:初期からDupont Pioneerがライセンス関係の整理に動き、既に
Dupont Pioneer から一括でライセンス取得可能
その他分野:パテントプールを形成する動きもがあるが(MPEG LA社)、Broad
以外は消極的
(権利数を考慮すれば、Broad以外は条件が不利になる可能性大)
・医薬関係のライセンス料は既に高額
3.25 ライセンス関連のまとめ

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  • 1. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 ゲノム編集技術に関する特許動向 1 2018.10.25 Revised 日本弁理士会 バイオ・ライフサイエンス委員 平成30年度 副委員長 辻丸国際特許事務所 弁理士・博士(生命科学)南野 研人
  • 2. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 2 3種類のシステム+α ゲノム編集技術の種類1 権利主体の明確な第1・2世代 ゲノム編集技術の特許2 5者+1者の争い CRISPR-Cas9システムの基本特許の状況3 本日のTopics
  • 3. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 1.ゲノム編集技術の種類
  • 4. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 ゲノム編集技術: 「予め定義した配列を有する特定のゲノムDNA領域を切断し、編集する技術」 (日本ゲノム編集学会) ゲノムDNAの損傷(切断、架橋、ニック等)が生じると、損傷の種類に応じて、 DNAの修復機構が活性化 この際に、切断前には存在しなかった塩基の挿入、欠失等が生じたり、相同 的な配列を有する核酸分子が存在すると、相同性組換えが発生 →ゲノム編集技術は、故意にゲノムDNAの損傷を生じさせ、その際に生じる DNA修復機構を利用して塩基配列を編集する 1.1 ゲノム編集技術とは Wikipedia 「ゲノム編集」より抜粋
  • 5. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 開発済のゲノム編集技術は、主に3種類 1.第1世代:ZFN (Zinc Finger Nuclease) DNA結合タンパク質のモチーフであるZinc Fingerを用いたゲノム編集技術。 2.第2世代:TALEN®(Transcription Activator-Like Effector Nuclease) 転写因子TALEタンパク質由来を用いたゲノム編集技術。 3.第3世代:CRISPR-Cas9(clustered regularly interspaced short palindromic repeats / CRISPR associated proteins) 古細菌等の原核生物に存在する獲得免疫系を利用したゲノム編集技術 ・第1世代及び第2世代のゲノム編集技術では、ターゲットの核酸はタンパク質 により認識 ・他方、第3世代のゲノム編集技術では、ターゲットの核酸は核酸により認識 →第1及び第2世代はタンパク質の設計自体が面倒であったが、第3世代により 圧倒的に簡便に 1.2 ゲノム編集技術の種類
  • 6. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 6 • 第1世代(ZFN) DNA結合ドメインとしてZincフィンガーを結合させたヌクレアーゼ(Fok1)を利用 ターゲット配列を含む二重鎖のセンス鎖・アンチセンス鎖に対応する2種類 ZFNを準備し、それぞれで、片鎖を切断 SIGMA-ALDRICH社のHPより抜粋 1.3 第1世代:ZFN
  • 7. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 7 • 第2世代(TALEN) 植物細菌キサントモナスの転写因子TALEタンパク質由来の結合ドメインを結 合させたヌクレアーゼ(Fok1)を利用 設計思想は、ZFNと同様。 TALEN自体はターゲット配列に制限がかかるため、任意の部位を認識できる ように改変されたものも(例えば、Platinum TALEN、GeneArt® Precision TALs) Thermo Fisher Scientific社のHPより抜粋 1.4 第2世代:TALEN
  • 8. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 Single guide RNA chimera (sgRNA) 人工型 crRNA-tracrRNA 天然型 Nature Reviews Rheumatology 13, 205–216 (2017)から抜粋 • 第3世代(CRISPR-Cas9) 原核生物等の獲得免疫系であるCRISPR-Cas9を真核生物に転用してゲノム情報 を編集 Cas9タンパク質の由来により、切断末端の隣接領域の配列(PAM)が限定される 原核生物が利用している系(天然型)と、改良型(人工型)の二種類 1.5 第3世代:CRISPR-Cas9
  • 9. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 91.6 Cas9のPAM 菌種 PAM配列 S. pyogenes 5'-NGG*1 S. solfataricus 5'-CCN S. solfataricus 5'-TCN H. walsbyi 5'-TTC E. coli 5'-AWG E. coli 5'-CC P. aeruginosa 5'-CC S. Thermophilus 5'-NNAGAA S. agalactiae 5'-NGG *1 PAM配列を-NGGから、-NGN(-NGA、-NGT、-NGG、-NGC)、すなわち、-NGに拡張可能 Hiroshi Nishimasu et.al. “Engineered CRISPR-Cas9 nuclease with expanded targeting space”, 2018, Science 細菌種とPAM配列 ・市販のベクター等で用いられているCas9は、S. pyogenes由来が大半 ・小型化、PAMの拡張も、S. pyogenesで試みられている
  • 10. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 1.7 技術的な違い ZFN TALEN CRISPR-Cas9 配列の選択性 低 中 高*1 編集効率 中 中 高 特異性 高 高 中*2 簡便性 低 低 高 *1 Cas9の由来の変更および認識するPAMの改変により対応可能(前述) *2 ニッカーゼ型Cas9(D10A)の利用で向上可能 第1~第3世代のゲノム編集技術の技術的な差異
  • 11. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 11 主流の第1~第3世代の技術以外に、 RNA依存性ヌクレアーゼまたは新たな DNA結合タンパク質が異なる下記技術もある その他、人工型ヌクレアーゼ(メガヌクレアーゼ)等も存在 • CRISPR/Cpf1 CRISPR-Cas9と類似するがヌクレアーゼが異なる (Cas9→Cpf1) ガイド鎖(短鎖RNA)と、Cpf1ヌクレアーゼとを利用 (Cpf1がガイド鎖を切り出すメリットあり) 出願人はBroad研究所らのみであり、権利関係がややこしくないため、分野に よってはこちらの利用も検討する動きも • PPR(PentatricoPeptide Repeat) タンパク質 九大・名大が開発した植物オルガネラ由来のpentatricopeptide Repeatが複数結合したタンパク質であり、DNA・RNAに結合 技術思想は、第1および第2世代と同様であり、ヌクレアーゼと組合せることで ZFN、TALENのように使用することを想定 エディットフォースが加齢黄斑変性治療等への適用を目指して開発中 1.8 その他関連技術
  • 12. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 2.ゲノム編集技術の特許 (ZFNおよびTALENを中心に)
  • 13. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 第1~第3世代のゲノム編集技術は、開発年代が異なり、それぞれにより特許 の状況はかなり異なる。 1.第1世代:ZFN (1990年代後半) 最初期のゲノム編集技術であり、文献による開示は1996年 初期段階がSangamoが精力的にライセンスインを行なう 2.第2世代:TALEN (2000年代後半) ミネソタ大学、アイオワ大学らのグループが発表 3.第3世代:CRISPR-Cas9 (2010年代前半) 2012年にUC BerkeleyらのグループによりScience誌に掲載、その後、真核 細胞等に対する適用について、Broadらのグループにより公表 2.1 ゲノム編集技術の特許の概要
  • 14. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 ・第1世代:ZFN 基本特許および必須特許の権利者(または独占ライセンス先)は、集約済み (参考資料1および2参照) ・権利者: Sangamo社:US6013453等(優先日:1994年8月20日) MITら:US5789538等(優先日:1997年4月18日) ・独占的ライセンス先 臨床開発~製品化:Sangamo Therapeutics社、研究用:Sigma-Aldrich社 最先の出願が1995年であるため、基本特許、必須特許の特許権の存続期 間が続々と満了を迎え、自由実施できる領域が増えていく予定 ただし、Sangamoは継続して、改良発明を出願しているため、実施時には注 意が必要 2.2 第1世代:ZFN
  • 15. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 ・第2世代:TALEN(Transcription Activator-Like Effector Nuclease) 基本特許および必須特許の権利者は、集約済み(参考資料2参照) ・権利者: Bonas Ullaら:US8,470,973B等(優先日:2009年1月12日) ミネソタ大学、アイオワ大学ら:US8,586,363等(優先日:2009年12月10日) ・独占的ライセンス先 治療用途:Cellectis社、それ以外:Thermo Fisher Scientific社 TALENを用いる場合においても、ヌクレアーゼ(Fok1)の構造によっては、 Sangamoの特許に抵触する場合があるため、注意が必要 ・第3世代:CRISPR-Cas9 →後述するが、一部の基本特許の権利者は固まりつつあるが、権利関係は依 然として錯綜 2.3 第2世代:TALEN
  • 16. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 3.CRISPR-Cas9システムの基本特許の状況
  • 17. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 Broad, MIT, Harvard (米) Berkeley, Vienna(米) Toolgen(韓) Vilnius(立) ・基本特許候補:12件 ・Feng Zhangのグループ ・関連出願:89件のファミリー ・基本特許候補:1件 ・J. Doudna、E. Charpentierら ・関連出願:20件のファミリー ・人工型・天然型 ・人工型がメイン(天然型含) その他 SIGMA:RNA依存性ヌクレアーゼについて出願(US14/649777) ・天然型がメイン・人工型・天然型 ・基本特許候補:1件 ・関連出願:2件 ・基本特許候補:1件 ・関連出願:1件 Cellectis:ゲノム編集技術を包括的にカバーする特許を独占的にライ センスイン(US9458439B) 5者+αと考えられるが、米国では他にも出てくるか…? 3.1 基本特許の権利者候補 基本特許の権利者の候補
  • 18. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 (参考情報) 調査対象 • Vilnius:USP61/613,373を基礎出願とする出願 • Berkeley:USP61/652,086を基礎出願とする出願 • Toolgen:USP61/717,324を基礎出願とする出願 • Sigma:USP61/734,256を基礎出願とする出願 • Broad:USP61/736,527を基礎出願とする出願 • 弁理士会での調査(~2017/12/31)+2018年10月1日に追加調査
  • 19. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 Vilnius Berkeley Toolgen Broad Published in Science by Dr. J. Doudna et.al. 8/17(AOP:6/28) 2012 2013 ・論文公開前の優先日確保は、VilniusおよびBerkeley(先願主義では重要) ・USは先願主義に移行前、すなわち、先発明主義 ・Broadは候補群のうちの一例 主要5者の出願タイムライン 1st Pro 3/20 2nd Pro 4/17 PCT 3/20 1st Pro 5/25 2nd Pro 10/19 3nd Pro 1/28 4th Pro 2/15 PCT 3/15 Sigma 1st Pro 10/23 1st Pro 12/6 2nd Pro 3/20 3rd Pro 6/20 PCT 10/23 1st Pro 12/12 2nd Pro 1/30 3rd Pro 2/5 PCT 12/5 2nd Pro 1/2 4th Pro 3/15 3rd Pro 3/15 4th Pro 6/17 5th Pro 7/2 PCT 12/12 3.2 出願のタイムライン
  • 20. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 203.3 日本の概況 人工型 天然型 Vilnius Berkeley Toolgen Broad 概念をカバー in vitro 長さの限定 1件 2件 3件 2件 出願: 特許権: 5’端にGG付加 真核生物 18件 日本の状況 II型Cas9 NLS付加等 ・Broadの特許が2件成立、いずれも要素技術に関する ・Berkeleyの出願により、人工型の概念はカバーされている ・9月28日にVilniusに対して特許査定が送達 登録 係属中 1件 SaCas9 sgRNA単独含 分割多数 Sigma 2件 ニッカーゼ型 Cas9×2 II型Cas9 NLS付加 ドナー核酸
  • 21. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 日本の特許の関係 21 Berkeley Broad 人工型天然型 3.4 日本の特許の関係 ・Berkeleyが人工型の特許を取得し、Broadの特許群は、Berkeleyに包含される ・天然型については、Vilniusの特許が成立予定 Vilnius
  • 22. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 5月末についに特許成立 sgRNAの新たな構造が開発されない限り、現状回避が困難 • 特許第6343605号 sgRNA + Cas9タンパク質 sgRNAの構造のみの限定 クレーム:修飾方法、組成物、sgRNA、核酸(ベクター系)、キット、真核細 胞 【請求項45】 単一分子DNA標的化RNA、または前記単一分子DNA標的化RNAをコードするDNAポリヌクレオチドで あって、該単一分子DNA標的化RNAが (a)標的DNA内の標的配列に対して相補的なヌクレオチド配列を含む、DNA標的化セグメント、および (b)Cas9タンパク質と相互作用するタンパク質結合セグメントであって、該タンパク質結合セグメントは、ハイ ブリダイズして二本鎖RNA(dsRNA)を形成する2つの相補的な一続きのヌクレオチドを含み、前記dsRNA は、tracrRNAおよびCRISPR RNA(crRNA)の相補的なヌクレオチドを含み、前記2つの相補的な一続き のヌクレオチドは、介在ヌクレオチドによって共有結合的に連結されている、タンパク質結合セグメントを含み、 前記DNA標的化セグメント、前記crRNAのヌクレオチド、前記介在ヌクレオチド、前記tracrRNAのヌクレオ チドは、この順に5’側から3’側に配置されている、 前記単一分子DNA標的化RNA、または前記単一分子DNA標的化RNAをコードするDNAポリヌクレオチド。 223.5 Berkeley特許(JP)の概要 Berkeley特許(JP)
  • 23. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 2件の特許に対して、今のところいずれも異議申立無し。 2つ目の特許は、異議申立期間経過前 • 特許第6203879号 sgRNA + II型Cas9タンパク質 Cas9タンパク質はNLSを保有 標的配列へのハイブリダイズするガイド配列と、tracrRNAとの長さを限定 クレーム:ベクター系、ベクター系の使用、TGの製造方法 • 特許第6395765号 sgRNA + Cas9タンパク質 黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)由来Cas9タンパク質 クレーム:組成物、ベクター系を含む組成物、ex vivoまたはin vitroの細胞 系、非動物に対する使用、ex vivoまたはゲノム編集における使用 233.6 Broad特許(JP)の概要 Broad特許(JP)
  • 24. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 243.7 米国の状況の概要 人工型 天然型 Vilnius Berkeley Toolgen Broad CAFC判決 概念をカバー in vitro 5件 23件 3件 15件 出願: 特許権: 真核生物 57件 米国の状況 ・人工型及び天然型に関して、Broadが真核細胞を対象とする特許を取得 ・Berkeleyが概念をカバーする出願をするも、CAFC判決に対する判断待ち ・Vilniusは、天然型に関して、in vitroで二重鎖を分解する方法を権利化 要素技術諸々 Cas9の菌種 5’端に NGG付加 (NLS付加等) NLS付加 1件 二重鎖分解 分解 その他出願有り sgRNA内 のアニール 長限定 1件 Sigma 14件 II型Cas9 ニッカーゼ型 Cas9×2 II型Cas9 NLS付加 ドナー核酸 登録 係属中
  • 25. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 米国の特許の関係 25 Berkeley Broad 人工型天然型 3.8 米国の特許の関係 ・Broadが人工型を真核細胞を対象とする特許を取得し、さらに要素技術も取得 ・CAFC判決が確定すると、人工型のBroadの特許群は、Berkeley特許に包含される ・天然型については、Broad、Vilniusの特許が成立しているが、概念は包含せず Vilnius Broad 成立すれば Berkeley
  • 26. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 6月末についに特許成立 • 米国特許第10,000,772号 sgRNA + Cas9タンパク質 sgRNAにおいてdsRNAを形成する領域の長さを限定 クレーム:修飾方法 263.9 Berkeley特許(US)の概要 Berkeley特許(US) • 米国出願13/842,859 CAFC判決に対する対応待ち sgRNA+Cas9タンパク質 成立すれば、概念をカバーする方法ク レームと組成物クレームが成立 日欧と異なり、sgRNAは含まず
  • 27. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 ・既に15件の特許が既に成立 US8697359; US8993233; US8771945; US8889356; US8795965; US8865406; US8999641; US8945839; US8932814; US8871445; US8906616; US8895308; US8889418; US9840713; US9822372 • 米国特許第8697359号(最先の特許) guideRNA + II型Cas9タンパク質 クレーム:遺伝子発現の変更方法、ベクター系、組成物 • Berkeleyとのインターフェアレンスの対象 Patent: US8697359; US8771945; US8795965; US8865406; US8871445; US8889356; US8895308; US8906616; US8932814; US8945839; US8993233; US8999641 Application: 14/704,551 273.10 Broad特許(US)の概要 Broad特許(US)
  • 28. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 283.11 欧州の状況の概要 人工型 天然型 Vilnius Berkeley Toolgen Broad 概念をカバー in vitro 1件 2件 1件 10件(全件異議) 出願: 特許権: 33件 欧州の状況 要素技術諸々 2件(全件異議) ほ乳類 NLS付加 真核細胞 NLS付加 ・人工型に関しては、Berkeleyが全体をカバーし、Broadが真核細胞に 対象を限定していた特許を取得していたが、後者は取消 ・活性抑制型Cas9との組合せで、Berkeleyが天然型の一部をカバー ・BroadがsgRNAの要素技術を細かく取得 登録 係属中 取消 sgRNA単独含 活性抑制型 (ニッカーゼ型) Cas9 Sigma 10件 1件(全件異議) ニッカーゼ型 Cas9×2 II型Cas9 NLS付加 ドナー核酸
  • 29. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 欧州の特許の関係 29 Berkeley 人工型天然型 3.12 欧州の特許の関係 ・人工型および天然型の両者についてBerkeleyが特許を取得 ・Broadの真核生物を対象とする人工型に関する特許は取消後、審判へ ・天然型において、Sigmaが、真核細胞を対象としドナー核酸を有する形態を保有 Sigma Berkeley Broad
  • 30. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 2017年5月についに特許成立 sgRNAの新たな構造が開発されない限り、現状回避が困難 • 欧州特許第2800811号 sgRNA + Cas9タンパク質 sgRNAの構造のみの限定であり、ほぼ日本と同様 クレーム:修飾方法、組成物、sgRNA、核酸(ベクター系)、キット 14. A single-molecule DNA-targeting RNA, or a DNA polynucleotide encoding said DNA-targeting RNA, wherein the single-molecule DNA-targeting RNA comprises: (a) a DNA-targeting segment comprising a nucleotide sequence that is complementary to a target sequence in a target DNA, and (b) a protein-binding segment that interacts with a Cas9 protein, wherein the protein-binding segment comprises two complementary stretches of nucleotides that hybridize to form a double stranded RNA (dsRNA) duplex, and wherein said two complementary stretches of nucleotides are covalently linked by intervening nucleotides. 303.13 Berkeley特許(EP)の概要 Berkeley特許(EP)
  • 31. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 1件の特許が成立し、現在異議申立中 • 欧州特許第EP3138910号 sgRNA + II型Cas9タンパク質 修復時に組込まれるドナー核酸の共存下で実施することがポイント クレーム:外部由来配列の導入方法、ex vivoまたはin vitroにおける外部 由来配列の導入方法 313.14 Sigma特許(EP)の概要 Sigma特許(EP)
  • 32. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 ・既に10件の特許が既に成立、ただし、全て異議申立の対象 EP2764103; EP2771468; EP2784162; EP2825654; EP2840140; EP2931892; EP2931897; EP2898075; EP2931898; EP2931898 • 欧州特許第2771468号(取消) sgRNA + II型Cas9タンパク質 標的配列へのハイブリダイズするガイド配列と、tracrRNAとの長さを限定 クレーム:組成物、ベクター、組成物またはベクターの使用 異議申立争点:優先権の有効性(それに伴う、新規性および進歩性) 取消理由:優先権無効、一部の引例に基づく新規性欠如 ・Broadの他の特許群も、争点は同様のため、一部の特許については取り消 される可能性有り。 323.15 Broad特許(EP)の概要 Broad特許(EP)
  • 33. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 333.16 CRISPR-Cas9の基本特許のまとめ • 人工型CRISPR-Cas9 日米欧のいずれにおいても、人工型のCRISPR-Cas9システムについ ては、Berkeleyが基本特許を確保する情勢になりつつある。 →人工型CRISPR-Cas9を利用したいのであれば、Berkeleyからのライ センスは現状不可欠 • 天然型CRISPR-Cas9 現状、概念をカバーするような基本特許を取得可能な出願人は見 当たらない。 * 天然型のCRISPR-Cas9システムのベースとなる最先の出願をVilnius が行なっている。Vilniusは、Cas9+crRNAを用いたDNAの切断に関する 技術について最先の基礎出願で出願している。 Cas9タンパク質+crRNAを含む組成物等で権利化できた場合、大化 けする可能性あり。 基本特許のまとめ
  • 34. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 343.17 閑話休題:Cellectis社特許 • Cellectis社が米国で基本特許の独占ライセンスを取得したとプレスリリース 権利者: Institut Pasteur Children s Medical Center Corp 優先日:1999年2月3日 1. A method for attenuating or inactivating an endogenous gene of interest in a cell in vitro comprising: inducing in the cell double stranded cleavage of chromosomal DNA at a genomic site of interest in the specific sequence to be modified, wherein the inducing comprises contacting the genomic site of interest with a chimeric restriction endonuclease, said chimeric restriction endonuclease comprising a DNA binding sequence and a DNA cleavage domain, and said restriction endonuclease recognizing a DNA sequence of at least 12 bp, wherein said restriction endonuclease is introduced as a protein or is encoded by a nucleic acid vector that is expressed, thereby inducing a cellular repair mechanism which leads to highly efficient recombinational events at said genomic site of interest, wherein said recombinational events introduce a mutation into said genomic site of interest, thereby modifying the specific sequence in the chromosomal DNA of the cell and thereby attenuating or inactivating an endogenous gene of interest in said cell. Cellectis社から詳細なアナウンスはないが、キメラ制限エンドヌクレアーゼがCas9 を包含すると主張したいのであると推定。 ただし、存続期間を考慮すると、ほとんど影響はない。 Cellectis社特許
  • 35. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 353.18 閑話休題:派生技術 • CRISPR-Cas9システムを用いた遺伝子治療用途医薬への応用を考えると 現状のシステムをそのまま転用するのが難しい。 (1)Cas9タンパク質のサイズはかなりでかく、核酸でのデリバリーが難しい SaCas9:1053a.a.(約3kbp) SpCas9:1368a.a.(約4kbp) ⇔AAVベクターにのせられる塩基長は、その他のパーツを除けば、約3.5kbp →小型化や、複数パーツへの分割が試みられている (2)PAMによるターゲットの配列の制限 SpCas9のPAMは、-NGGであり、改良型でも-NGである。 点変異などにより遺伝性疾患が生じることも考慮すると、任意の位置が編集 できるようにPAMを変更するニーズがある →PAM認識部位に変異を導入し、PAMの拡張が試みられている • 派生技術の出願も行なわれているため、これらの経過観察も必要 必須技術になり得る派生技術
  • 36. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 363.19 ライセンス関係(Berkeley) Berkeley特許 ・ E. Charpentier所有特許の独占ライセンス先 医療用ヒト細胞および遺伝子治療:CRISPR Therapeutics その他:ERS Genomics ・Berkeley所有特許の独占ライセンス先 医療用ヒト細胞および遺伝子治療:Intellia Therapeutics その他:Caribou Biosciences 特許出願技術動向調査 「ゲノム編集及び遺伝子治療関連技術」 より抜粋及び改変
  • 37. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 37 特許出願技術動向調査 「ゲノム編集及び遺伝子治療関連技術」 より抜粋及び改変 ・ 医療用途:Editas Medicineに独占ライセンス ・CAR-T用途:Juno Therapeuticsに独占ライセンス(Celegeneにより買収) Broad特許 3.22 ライセンス関係(Broad)
  • 38. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 38 特許出願技術動向調査 「ゲノム編集及び遺伝子治療関連技術」 より抜粋及び改変 ・Toolgenは、試薬関係についてKeyGeneにライセンス ・農業分野では、基本特許のライセンスがDupontに集約しつつある ・医療分野以外にでは、パテントプールを形成する動きも…(MPEG LA社) ・医療分野については、現状集約の動きなし VilniusおよびToolgen特許 3.23 ライセンス関係(Vilnius、Toogen)
  • 39. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 393.24 ライセンス料 • プレスリリースがされているライセンス料は、既にかなり高額。 (1) Intellia Therapeutics社(UC Berkeley系)& Regeneron社 一時金7500万ドル(約85億円)+マイルストーン(不明)+ロイヤリティ(不明) Intellia Therapeutics社の次回の資金調達時に5000万ドル(約56億円)の投資 (2) CRISPR Therapeutics社(UC Berkeley系)& VERTEX社 一時金1億500万ドル(約119億円)+開発段階毎のマイルストーン4200万ドル(約 48億円)+ロイヤリティ(不明) (3) Editas Medicine社(Broad系)& Juno Therapeutics社 一時金2500万ドル(約28億円)+マイルストーン2億3000万ドル×3(約260億円 ×3)+ロイヤリティ(不明) (参考) EdiGene社(東大)& Fuji Film社 一時金4億7000万円+マイルストーン(不明)+ロイヤリティ(不明) ライセンス料
  • 40. Copyright © Tsujimaru International Patent Office. All rights reserved. 辻丸国際特許事務所 ライセンス関連のまとめ ・各者のライセンス先は多種多様であり、用途別に独占ライセンスを行うケース多 医薬系に関しては、発明者がFounderのベンチャーに(独占)ライセンスを供与 するケース多 →現状、基本特許および必須特許が複数者に分属し、ライセンスインがかなり面倒 ・一括ライセンスインができる状況にすぐになるとは考え難い。例外が農業分野 医療分野:集約の動き無し (高い収益を得るには、一人で基本特許および必須特許を握る必要がある) 農業分野:初期からDupont Pioneerがライセンス関係の整理に動き、既に Dupont Pioneer から一括でライセンス取得可能 その他分野:パテントプールを形成する動きもがあるが(MPEG LA社)、Broad 以外は消極的 (権利数を考慮すれば、Broad以外は条件が不利になる可能性大) ・医薬関係のライセンス料は既に高額 3.25 ライセンス関連のまとめ