Kashiwa.R#7で発表に用いたスライドです． 「そもそもRってなに？」というあたりをまとめています． 参考URL https://sites.google.com/site/kashiwar7wetrabozhiyuanhui/home http://www14.atwiki.jp/kashiwar/pages/19.html http://d.hatena.ne.jp/tsutatsutatsuta/20130318/1363577733

1. 第7回 Kashiwa.R バイオ実験系ラボ支援回 1
http://www14.atwiki.jp/kashiwar/pages/19.html
Kashiwa.Rについて
~#7へのイントロダクション~
東京大学大学院
2013-03-19 新領域創成科学研究科
Kashiwa.R#7
蔦谷匠

2. 自己紹介 2
蔦谷 匠 (つたや たくみ)
東京大学・新領域・先端生命・D1
生物学 → 会社員 → 人類学
同位体分析, 子供, 古人骨
連絡先:
– @tsutatsuta
– tsutayatakumi[at]gmail.com
http://tsutatsuta.net/

3. 内容 3
◯ Rとはなにか
– 統計解析・図示に優れたプログラミング言語
– 近年, 利用例が急増している
◯ Rを使うと良いことがある
– Excelと比較してみる
– リソースも潤沢
◯ Kashiwa.Rについて
– 有志によるRの勉強会のうちのひとつ
そもそも R ってなに？
なぜ R を使うとハッピーになれるのか

4. R言語とは 4
統計解析・図示に優れたフリーのプログラミング言語
比較的簡単な操作で, 実に多様な統計解析機能
オープンソースのフリーソフトウェア
多彩で美しい図の作成が可能
Bioconductor: ゲノムデータの解析に特化した環境
http://www.r-project.org/

5. 近年, Rの利用例は増加 5
年度ごとの言及論文数の推移 (Google Scholarを利用して調査, 概算値)
Log言及論文数 (×10 n)
年
検索キーワード R: “R Development Core Team”, Bioconductor: “Bioconductor”, SPSS: “SPSS”, Excel: “Excel”

6. 企業や行政での利用も 6
Google
Microsoft
IBM
Amazon
http://www.atmarkit.co.jp/fcoding/articles/stat/01/stat01a.html
姫路市
http://www.city.himeji.lg.jp/lib/_23238.html

7. Excelなどとの違い 7
学習が必要だが, 慣れると生産性向上
コマンドライン (プログラムを書く必要がある)
– “コピペ” ができる (図の作成などでも)
– どんな処理をしたか記録が残る
さまざまな統計処理の手法をサポート
– パッケージによりさらに拡充可能
– 自分で関数を作成できる
フリーウェア, OSを選ばない
– RStudioという統合開発環境も
http://www.rstudio.com/

8. 学習に役立つさまざまなリソース 8
日本語のものも増えてきた
RjpWikiやブログなどWeb上のドキュメント
各地で開催されている勉強会
書籍
http://www.okada.jp.org/RWiki/
http://www.japanr.org/
Tokyo.R
Tsukuba.R
Nagoya.R
Osaka.R
Shiga.R
Hirosima.R
Okinawa.R ...

9. Kashiwa.R 9
Rの勉強会のひとつ http://www14.atwiki.jp/kashiwar/
2011年11月より千葉県柏市周辺で活動 (今回で７回目)
情報生命・生命科学系のユーザが多い
参加者・発表者募集中です！！
開催情報はML (メーリングリスト) にて配信しています

10. 謝辞・諸連絡 10
謝辞
東京理科大学総合教育研究機構情報教育センター
バイオインフォマティクス教育部門のみなさま, 宮崎先生
貴重な機会を提供してくださいましてありがとうございます．
諸連絡
ハッシュタグ: #KashiwaR
発表中でもハッシュタグを付けて質問すると, たぶん誰かが答えてくれます.
発表スライド, 利用されたプログラムは以下からダウンロードできます．
https://sites.google.com/site/kashiwar7wetrabozhiyuanhui/home